Merge branch 'master' of git.debian.org:/git/pkg-exppsy/neurodebian

* 'master' of git.debian.org:/git/pkg-exppsy/neurodebian:
  debian/copyright - adjusted for dep5 v1.0. compliance
  testimonial from Dr. Walter
  Quotes from Alexander and Joseph, Thanks!

Update URL of the Magdeburg mirror

Redirects from the old one are in place, but new subscriptions should
use the new one.

debian/copyright - adjusted for dep5 v1.0. compliance

testimonial from Dr. Walter

Quotes from Alexander and Joseph, Thanks!

added nitrc id for bioimagesuite

Testimonial from Francisco Pereira

forgotten tags for Sebastian testimonial

testimonial from Sebastian

testimonial from Mathias Goldau

minor change from Nina

few more tags, moved Christian up into "institutions" due to his VP position ;-)

fixed up and extended derivatives

Merge remote-tracking branch 'gh-neurodebian/master'

* gh-neurodebian/master:
  Add information about NEST live media

fresh quotes from email and disqus (Nina)

crime -- modified generated file with quotes -- added "upstream" tag

Merge pull request #9 from zyv/master

Info about NEST live media

Looks good -- haven't tested if "builds fine" yet -- cron build will show ;)

Add information about NEST live media

removing  karmic, maverick and natty from build targets -- "upstream" support ended

added vowpal-wabbit (we probably do not want to cover all ml but we have a lot now)

Found a "source" for ndhackergotchi.png (shouldnt be rendered automatically atm)

ENH: added info/links for VM 6.999.b4.20121231

also moved more links into link_names

vm: purge dkms build dir, freepats, fix removing of apt lists

BF: list neurodebian as release, not unstable -- we haven't yet ever uploaded to Debian proper

Changelog for 0.30

BF: nd_build_testrdepends - pass distribution to build-rdeps

This makes it work with wheezy to overcome #695975

ENH: Install octave by installing qtoctave

then this would work for both squeeze (with backports) and wheezy VMs
without causing problems

BF: do not exit non-0 if lightdm.conf is not present (squeeze VM)

comment out using of -devel repo and manually build one for squeeze for testing

Merge remote branch 'alioth/master' into enh/wheezy-vm

* alioth/master:
  BF: move -u in nd_build down so we get sensible help
  exclude debian-devel from being wipedout upon upload-website

BF: move -u in nd_build down so we get sensible help

Build a new dev1 pkg

VM: depends on zenity, install ipython01x only for older ones, default XFCE4 pannel

ENH: install lightdm, default login for brain, urxvt (+tune ups) as default console

ENH: vm - while developing use also -devel nd repository

Merge branch 'master' into enh/wheezy-vm

* master: (32 commits)
  ENH: nd_build_testrdepends -- sign the temporary repository with the package (use apt-ftparchive)
  ENH: Make neurodebian.cfg also visible on the website so we could easily fetch up-to-date version if needed
  ENH: improved nd_querycfg a bit: query content of a section or list of sections
  Changes for Lin4Neuro from Kiyotaka Nemoto
  Thomas's suggested description for the mirror
  Remove umlaut's from de-m mirror name -- breaks the build
  Added de-m mirror (INCF G-Node), Thanks Thomas Wachtler
  alias for openvibe
  Adding ubuntu quantal (nd12.10) into "supported"
  little TODO in nd_createappliance on preseeding solution
  brochure -- very minor from native speakers
  more items and a bit of indentation -- printing now
  added rudimentary README.txt on how to build brochure
  updated VM page for 6.0.6 (with the date when VM was wrapped on 1st of Oct)
  add remake to give it a page
  changelog + nd-vmsetupwizard: Preparing 0.29 release of neurodebian for updated nd-vmsetupwizard
  Make ymax dynamic (5% above current max value), per each distribution + labels for every other month
  A slight overhaul of the brochure -- nothing radical but at least it is up to date now
  injected spykeview
  BF: added an alias for neo (python-neo)
  ...

Conflicts:
tools/nd-vmsetupwizard
vm/tools/nd_createappliance

exclude debian-devel from being wipedout upon upload-website

so we could have some additional repository for testing

ENH: tune up Tiziano's changes so we could process options from cmdline

templating/options handling could be greatly improved ;)

preseed.cfg becomes an .in for Python string interpolations

ENH: nd_build_testrdepends -- sign the temporary repository with the package (use apt-ftparchive)

ENH: Make neurodebian.cfg also visible on the website so we could easily fetch up-to-date version if needed

ENH: improved nd_querycfg a bit: query content of a section or list of sections

Changes for Lin4Neuro from Kiyotaka Nemoto

Thomas's suggested description for the mirror

Remove umlaut's from de-m mirror name -- breaks the build

Added de-m mirror (INCF G-Node), Thanks Thomas Wachtler

alias for openvibe

Adding ubuntu quantal (nd12.10) into "supported"

little TODO in nd_createappliance on preseeding solution

brochure -- very minor from native speakers

more items and a bit of indentation -- printing now

added rudimentary README.txt on how to build brochure

updated VM page for 6.0.6 (with the date when VM was wrapped on 1st of Oct)

add remake to give it a page

changelog + nd-vmsetupwizard: Preparing 0.29 release of neurodebian for updated nd-vmsetupwizard

* VM (6.0.6):
  - base on 6.0.6 Debian point release (finally version of NeuroDebian
    VM is in sync with the Debian release)
  - nd-vmsetupwizard:
    - robustify check/linking of $HOME/host
    - optional installations dialog:
      - set height of the dialog to 450 for to fit all list items
      - refactored "GIMP" section into "Graphics" which would install
        also inkscape, vym and svgtune
      - added sections for "PyMVPA tutorial", and different collections of
        Python modules (Neuroimaging, Electrophysiology, etc)
      - Python selections depend on ipython01x instead of older ipython
        to provide IPython notebooks facilities out-of-the-box

Make ymax dynamic (5% above current max value), per each distribution + labels for every other month

A slight overhaul of the brochure -- nothing radical but at least it is up to date now

injected spykeview

BF: added an alias for neo (python-neo)

DOC: Note the chrooting is no longer necessary for FSLView.

Yet another markup fix.

Small fix.

Add video link.

Add new talk.

WIP: clean up a bit the kernel installation and mirroring

WIP: work on locale and remove HTTP server

this should be factored out and become a command line option
to the create appliance scripts...

WIP: do not use external HTTP server

BF: use valentin's last name without umlaut

Added Valentin's mirror as [de-v] and [de] became [de-md]

added blends injection for patchclamp

trying to switch from gnome to more lightweight XFCE. TODOs are in the initial_setup script

fighting seeding keyboard for wheezy

added freeipmi to the list

BF: in fslview blogpost -- add export FSLDIR into the /usr/local/bin/fslview wrapper

since, as troubleshooted on the mailing list, users using recent fsl
version on their system might have it pointing to the versioned
path thus forbidding fslview to find atlases within the chroot

ENH: for full gnome3 "experience" add gnome-disk-utility network-manager-gnome

otherwise would puke error and fall into fallback mode (which is not
necessarily a bad thing). Altogether we might better be with XFCE anyways

ENH: nd-vmsetupwizard for wheezy -- robust link, meta-selections for R, PyMVPA; removed Sun java plugin

also extended list for Scientific python to include spyder and pandas

ENH: adjusted initial_setup and preseed.cfg for wheezy

BF: gues-additions -- autologin for both Gnome 2 and 3

Changelog entries to summarize changes for 0.28

neurodebian-guest-additions: in preparation for wheezy NeuroDebian VM appliance added option for gdm3

trying to find matching preseeding for keyboard + ship initial_setup from wheezy/ dir

copied squeeze d-i seeding into one for wheezy

Slight adjustment of the download stats range

no going to high, beause July is still changing.

Add talk reference.

ENH: nd_build_testrdepends to get names of all binary packages build-depends of which to test

ENH: link to the mirrors-status page

add guacamole to be listed on the website

BF: doh -- we do not care atm about return status of mirmon update and its grep

ENH: mask out mirmon failures due to missing timestamp: invalid date .DOCTYPE

BF: $$ for Makefile

ENH: reuse header/trailer of the main page as the wrap for mirrors-status.html

ENH: mirmon and refresh (the one to be called hourly from cron) Makefile rules

ENH: configuration file for mirmon

ENH: generate mirrors lists for mirmon

provide url for neurodebian G+

Mention the paper in all possible places and shorten other bits.

DOC: use direct frontiersin url instead of not-yet-active doi

DOC: minor consistent spacing

Merge branch 'master' of git://git.debian.org/pkg-exppsy/neurodebian

More robust against DB errors.