uvest.h

   1 #ifndef UVEST_H
   2 #define UVEST_H
   3 /*
   4  *  uvest.h
   5  *  Dotur
   6  *
   7  *  Created by Sarah Westcott on 1/8/09.
   8  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
   9  *
  10  */
  11
  12 /* This class implements the UVEst estimator on two groups.
  13 It is used by sharedJAbund and SharedSorensonAbund. */
  14
  15
  16 using namespace std;
  17
  18 #include <Carbon/Carbon.h>
  19 #include <vector>
  20 #include <iostream>
  21 #include <fstream>
  22 #include "sharedrabundvector.h"
  23
  24 typedef vector<double> EstOutput;
  25
  26 /***********************************************************************/
  27 class UVEst {
  28         public:
  29                 EstOutput getUVest(SharedRAbundVector* shared1, SharedRAbundVector* shared2);
  30 };
  31 /***********************************************************************/
  32
  33 #endif