treecalculator.h

   1 #ifndef TREECALCULATOR_H
   2 #define TREECALCULATOR_H
   3
   4 /*
   5  *  treecalculator.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by Sarah Westcott on 1/26/09.
   9  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12
  13 #include "mothur.h"
  14 #include "tree.h"
  15
  16 /* The tree calculator class is the parent class for tree calculators in mothur. */
  17
  18 typedef vector<double> EstOutput;
  19
  20 /***********************************************************************/
  21
  22 class TreeCalculator {
  23
  24 public:
  25         TreeCalculator(){};
  26         TreeCalculator(string n) : name(n) {};
  27         virtual ~TreeCalculator(){};
  28         virtual EstOutput getValues(Tree*) = 0;
  29         virtual EstOutput getValues(Tree*, string, string) = 0;
  30
  31         virtual string getName()                {       return name;    }
  32
  33 protected:
  34         EstOutput data;
  35         string name;
  36
  37 };
  38
  39 /***********************************************************************/
  40
  41 #endif