sobs.h

   1 #ifndef SOBS_H
   2 #define SOBS_H
   3 /*
   4  *  sobs.h
   5  *  Dotur
   6  *
   7  *  Created by Sarah Westcott on 1/7/09.
   8  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
   9  *
  10  */
  11
  12 /* This class implements the Sobs estimator on single group.
  13 It is a child of the calculator class. */
  14
  15
  16 #include <Carbon/Carbon.h>
  17 #include "calculator.h"
  18
  19 /***********************************************************************/
  20
  21 class Sobs : public Calculator {
  22
  23 public:
  24         Sobs() : Calculator("Sobs", 1) {};
  25         EstOutput getValues(SAbundVector* rank){
  26                 data.resize(1,0);
  27                 data[0] = (double)rank->getNumBins();
  28                 return data;
  29         }
  30         EstOutput getValues(SharedRAbundVector* shared1, SharedRAbundVector* shared2) {return data;};
  31 };
  32
  33 /***********************************************************************/
  34
  35 #endif