setdircommand.h

   1 #ifndef SETDIRCOMMAND_H
   2 #define SETDIRCOMMAND_H
   3
   4 /*
   5  *  setoutdircommand.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by westcott on 1/21/10.
   9  *  Copyright 2010 Schloss Lab. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12
  13 #include "command.hpp"
  14 #include "commandfactory.hpp"
  15 #include "globaldata.hpp"
  16
  17 /**********************************************************/
  18
  19 class SetDirectoryCommand : public Command {
  20
  21 public:
  22         SetDirectoryCommand(string);
  23         SetDirectoryCommand() {}
  24         ~SetDirectoryCommand();
  25         vector<string> getRequiredParameters();
  26         vector<string> getValidParameters();
  27         vector<string> getRequiredFiles();
  28         map<string, vector<string> > getOutputFiles() { return outputTypes; }
  29         int execute();
  30         void help();
  31
  32 private:
  33         CommandFactory* commandFactory;
  34         string output, input, tempdefault;
  35         bool abort;
  36         vector<string> outputNames;
  37         map<string, vector<string> > outputTypes;
  38
  39 };
  40
  41 /**********************************************************/
  42
  43 #endif
  44