jackknife.h

   1 #ifndef JACKKNIFE_H
   2 #define JACKKNIFE_H
   3
   4 /*
   5  *  jacknife.h
   6  *  Dotur
   7  *
   8  *  Created by Sarah Westcott on 1/7/09.
   9  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12
  13 #include <Carbon/Carbon.h>
  14 #include "calculator.h"
  15
  16 /* This class implements the JackKnife estimator on single group.
  17 It is a child of the calculator class. */
  18
  19 /***********************************************************************/
  20
  21 class Jackknife : public Calculator  {
  22
  23 public:
  24         Jackknife() : Calculator("Jackknife", 3) {      getAMatrix(); };
  25         EstOutput getValues(SAbundVector*);
  26         EstOutput getValues(SharedRAbundVector*, SharedRAbundVector*) {return data;};
  27
  28 private:
  29         static const int maxOrder = 30;
  30         vector<vector<double> > aMat;
  31
  32         void getAMatrix();
  33         double CN(double);
  34 };
  35
  36 /***********************************************************************/
  37
  38 #endif