helpcommand.cpp

   1 /*
   2  *  helpcommand.cpp
   3  *  Dotur
   4  *
   5  *  Created by Sarah Westcott on 1/2/09.
   6  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
   7  *
   8  */
   9
  10 #include "helpcommand.h"
  11
  12 //**********************************************************************************************************************
  13 vector<string> HelpCommand::getValidParameters(){
  14         try {
  15
  16                 vector<string> myArray;
  17                 return myArray;
  18         }
  19         catch(exception& e) {
  20                 m->errorOut(e, "HelpCommand", "getValidParameters");
  21                 exit(1);
  22         }
  23 }
  24 //**********************************************************************************************************************
  25 vector<string> HelpCommand::getRequiredParameters(){
  26         try {
  27                 vector<string> myArray;
  28                 return myArray;
  29         }
  30         catch(exception& e) {
  31                 m->errorOut(e, "HelpCommand", "getRequiredParameters");
  32                 exit(1);
  33         }
  34 }
  35 //**********************************************************************************************************************
  36 vector<string> HelpCommand::getRequiredFiles(){
  37         try {
  38                 vector<string> myArray;
  39                 return myArray;
  40         }
  41         catch(exception& e) {
  42                 m->errorOut(e, "HelpCommand", "getRequiredFiles");
  43                 exit(1);
  44         }
  45 }
  46 //**********************************************************************************************************************
  47
  48 HelpCommand::HelpCommand(string option)  {
  49
  50         validCommands = CommandFactory::getInstance();
  51
  52 }
  53
  54 //**********************************************************************************************************************
  55
  56 HelpCommand::~HelpCommand(){}
  57
  58 //**********************************************************************************************************************
  59
  60 int HelpCommand::execute(){
  61         validCommands->printCommands(cout);
  62         m->mothurOut("For more information about a specific command type 'commandName(help)' i.e. 'read.dist(help)'"); m->mothurOutEndLine();
  63
  64         m->mothurOutEndLine(); m->mothurOut("For further assistance please refer to the Mothur manual on our wiki at http://www.mothur.org/wiki, or contact Pat Schloss at mothur.bugs@gmail.com.\n");
  65         return 0;
  66 }
  67
  68 //**********************************************************************************************************************/