groupmap.h

   1 #ifndef GROUPMAP_H
   2 #define GROUPMAP_H
   3 /*
   4  *  groupmap.h
   5  *  Dotur
   6  *
   7  *  Created by Sarah Westcott on 12/1/08.
   8  *  Copyright 2008 __MyCompanyName__. All rights reserved.
   9  *
  10  */
  11
  12 #include <Carbon/Carbon.h>
  13 #include <map>
  14 #include <string>
  15 #include <iostream>
  16 #include <fstream>
  17 #include "utilities.hpp"
  18
  19
  20 class GroupMap {
  21 public:
  22         GroupMap(string);
  23         ~GroupMap();
  24         void readMap();
  25         int getNumGroups();
  26         string getGroup(string);
  27         vector<string> namesOfGroups;
  28
  29
  30 private:
  31         ifstream fileHandle;
  32         string groupFileName;
  33         int numGroups;
  34         map<string, string>::iterator it;
  35         void setNamesOfGroups(string);
  36         map<string, string> groupmap; //sequence name and groupname
  37 };
  38
  39 #endif