dist.h

   1 #ifndef DIST_H
   2 #define DIST_H
   3 /*
   4  *  dist.h
   5  *  Mothur
   6  *
   7  *  Created by Sarah Westcott on 5/7/09.
   8  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
   9  *
  10  */
  11
  12 #include "mothur.h"
  13 #include "sequence.hpp"
  14
  15 /**************************************************************************************************/
  16
  17 class Dist {
  18
  19 public:
  20         Dist(){dist = 0; m = MothurOut::getInstance(); }
  21         virtual ~Dist() {}
  22         virtual void calcDist(Sequence, Sequence) = 0;
  23         double getDist()        {       return dist;    }
  24 protected:
  25         double dist;
  26         MothurOut* m;
  27 };
  28
  29 /**************************************************************************************************/
  30
  31 #endif