commandoptionparser.cpp

   1 /*
   2  *  commandoptionparser.cpp
   3  *
   4  *
   5  *  Created by Pat Schloss on 10/23/08.
   6  *  Copyright 2008 Patrick D. Schloss. All rights reserved.
   7  *
   8  */
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  10 #include <string>
  11
  12 using namespace std;
  13
  14 #include "globaldata.hpp"
  15 #include "commandoptionparser.hpp"
  16 #include <exception>
  17 #include <iostream>
  18
  19 //**********************************************************************************************************************
  20 //This Function parses through the command line and pulls out the command then sends the options to  the parseGlobalData
  21 CommandOptionParser::CommandOptionParser(string input){
  22         try {
  23                 int openParen = input.find_first_of('(');
  24                 int closeParen = input.find_last_of(')');
  25                 string optionString = "";
  26                 commandString = "";
  27
  28                 if(openParen != -1 && closeParen != -1){
  29                         commandString = input.substr(0, openParen);   //commandString contains everything before "("
  30                         optionString = input.substr(openParen+1, closeParen-openParen-1); //optionString contains everything between "(" and ")".
  31                 }
  32
  33                 GlobalData* globaldata = GlobalData::getInstance();
  34                 globaldata->parseGlobalData(commandString, optionString);                       //parser to separate and check options
  35         }
  36         catch(exception& e) {
  37                 cout << "Standard Error: " << e.what() << " has occurred in the CommandOptionParser class Function CommandOptionParser. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
  38                 exit(1);
  39         }
  40         catch(...) {
  41                 cout << "An unknown error has occurred in the CommandOptionParser class function CommandOptionParser. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
  42                 exit(1);
  43         }
  44
  45 }
  46
  47 //**********************************************************************************************************************
  48
  49 string CommandOptionParser::getCommandString()  {       return commandString;   }
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  51 //**********************************************************************************************************************