bayesian.cpp

   1 /*
   2  *  bayesian.cpp
   3  *  Mothur
   4  *
   5  *  Created by westcott on 11/3/09.
   6  *  Copyright 2009 Schloss Lab. All rights reserved.
   7  *
   8  */
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  10 #include "bayesian.h"
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  12 /**************************************************************************************************/
  13 Bayesian::Bayesian(string tfile, string tempFile, string method, int kmerSize, int gapOpen, int gapExtend, int match, int misMatch) :
  14 Classify(tfile, tempFile, method, kmerSize, gapOpen, gapExtend, match, misMatch) {}
  15 /**************************************************************************************************/
  16 string Bayesian::getTaxonomy(Sequence* seq) {
  17         try {
  18                 string tax;
  19
  20
  21                 return tax;
  22         }
  23         catch(exception& e) {
  24                 errorOut(e, "Bayesian", "getTaxonomy");
  25                 exit(1);
  26         }
  27 }
  28 /**************************************************************************************************/
  29