emacs_el/configuration/don-configuration.org

   1 #+PROPERTY: header-args:emacs-lisp :tangle don-configuration.el
   2 * Load debugger
   3
   4 # if for some reason, things get pear-shaped, we want to be able to
   5 # enter the debugger by sending -USR2 to emacs
   6
   7 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
   8 (setq debug-on-event 'siguser2)
   9 #+END_SRC
  10 * Add library paths
  11
  12 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  13   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/")
  14   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/tiny")
  15   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/other")
  16   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/magit-annex")
  17 #+END_SRC
  18
  19 * Package management
  20 ** package repositories and package manager
  21 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  22   (require 'package)
  23   (setq package-archives '(("gnu" . "https://elpa.gnu.org/packages/")
  24                            ("melpa" . "https://melpa.org/packages/")
  25                            ("org" . "http://orgmode.org/elpa/") ))
  26 #+END_SRC
  27 ** [[https://github.com/jwiegley/use-package/][use-package]]
  28 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  29   (package-initialize)
  30   (require 'use-package)
  31 #+END_SRC
  32 ** Paradox
  33 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  34   (use-package paradox
  35     :ensure paradox
  36   )
  37 #+END_SRC
  38 * Disable custom-vars
  39 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  40   ;; Set the custom file to /dev/null and don't bother to load it
  41   (setq custom-file "/dev/null")
  42 #+END_SRC
  43 * Misc functions
  44 ** with-library
  45 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  46 ;; From http://www.emacswiki.org/emacs/LoadingLispFiles
  47 ;; execute conditional code when loading libraries
  48 (defmacro with-library (symbol &rest body)
  49   `(when (require ,symbol nil t)
  50      ,@body))
  51 (put 'with-library 'lisp-indent-function 1)
  52 #+END_SRC
  53
  54 * Variables
  55 ** Safe Local Variables
  56 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  57   (setq safe-local-variable-values
  58         (quote ((auto-save-default)
  59                 (make-backup-files)
  60                 (cperl-indent-level . 4)
  61                 (indent-level . 4)
  62                 (indent-tabs-mode . f)
  63                 )))
  64 #+END_SRC
  65 * Memory
  66 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  67   (setq global-mark-ring-max 128
  68         mark-ring-max 128
  69         kill-ring-max 128)
  70
  71   (defun don/minibuffer-setup-hook ()
  72     (setq gc-cons-threshold most-positive-fixnum))
  73
  74   (defun don/minibuffer-exit-hook ()
  75     (setq gc-cons-threshold 1048576))
  76
  77   (add-hook 'minibuffer-setup-hook #'don/minibuffer-setup-hook)
  78   (add-hook 'minibuffer-exit-hook #'don/minibuffer-exit-hook)
  79 #+END_SRC
  80 * Modules
  81 ** Flyspell 🐝
  82 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  83   (use-package flyspell
  84     :ensure t
  85     :diminish flyspell-mode 🐝
  86     :config
  87     (add-hook 'message-mode-hook 'turn-on-flyspell)
  88     (add-hook 'text-mode-hook 'turn-on-flyspell)
  89     (add-hook 'c-mode-common-hook 'flyspell-prog-mode)
  90     (add-hook 'cperl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
  91     (add-hook 'tcl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
  92     :init
  93     (setq ispell-program-name "ispell")
  94     )
  95
  96 #+END_SRC
  97 ** Winnermode
  98 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  99   (winner-mode 1)
 100 #+END_SRC
 101 ** Eyebrowse
 102
 103 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 104   ;; (use-package eyebrowse
 105   ;;   :ensure t
 106   ;;   :diminish eyebrowse-mode
 107   ;;   :init (setq eyebrowse-keymap-prefix (kbd "C-c C-\\"))
 108   ;;   :config (progn
 109   ;;             (setq eyebrowse-wrap-around t)
 110   ;;             (eyebrowse-mode t)
 111   ;;
 112   ;;             (defun my/eyebrowse-new-window-config ()
 113   ;;               (interactive)
 114   ;;               (let ((done nil))
 115   ;;                 (dotimes (i 10)
 116   ;;                   ;; start at 1 run till 0
 117   ;;                   (let ((j (mod (+ i 1) 10)))
 118   ;;                     (when (and (not done)
 119   ;;                                (not (eyebrowse--window-config-present-p j)))
 120   ;;                       (eyebrowse-switch-to-window-config j)
 121   ;;                       (call-interactively 'eyebrowse-rename-window-config2 j)
 122   ;;                       (setq done t)
 123   ;;                       ))
 124   ;;                   )))
 125   ;;
 126   ;;             ;; I don't use latex-preview-pane
 127   ;;             ;; (require 'latex-preview-pane)
 128   ;;             ;; (defun my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch ()
 129   ;;             ;;   ;; latex-preview-pane uses window-parameters which are
 130   ;;             ;;   ;; not preserved by eyebrowse, so we close the preview
 131   ;;             ;;   ;; pane before switching, it will be regenerated when we
 132   ;;             ;;   ;; edit the TeX file.
 133   ;;             ;;   (when (lpp/window-containing-preview)
 134   ;;             ;;     (delete-window (lpp/window-containing-preview))))
 135   ;;
 136   ;;             ;; (add-to-list 'eyebrowse-pre-window-switch-hook
 137   ;;             ;;              #'my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch)
 138   ;;
 139   ;;             ;; (my/set-menu-key "["  #'my/eyebrowse-new-window-config)
 140   ;;             ;; (my/set-menu-key ";"  #'eyebrowse-prev-window-config)
 141   ;;             ;; (my/set-menu-key "'"  #'eyebrowse-next-window-config)
 142   ;;             ;; (my/set-menu-key "]"  #'eyebrowse-close-window-config)
 143   ;;             ;; (my/set-menu-key "\\" #'eyebrowse-rename-window-config)
 144   ;;             )
 145   ;;   )
 146 #+END_SRC
 147
 148 ** Window handling
 149
 150 *** Splitting
 151 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 152   (defun my/vsplit-last-buffer ()
 153     "Split the window vertically and display the previous buffer."
 154     (interactive)
 155     (split-window-vertically)
 156     (other-window 1 nil)
 157     (switch-to-next-buffer))
 158
 159   (defun my/hsplit-last-buffer ()
 160     "Split the window horizontally and display the previous buffer."
 161     (interactive)
 162     (split-window-horizontally)
 163     (other-window 1 nil)
 164     (switch-to-next-buffer))
 165
 166   (bind-key "C-x 2" 'my/vsplit-last-buffer)
 167   (bind-key "C-x 3" 'my/hsplit-last-buffer)
 168
 169   (setq split-width-threshold  100)
 170   (setq split-height-threshold 60)
 171
 172   (defun my/split-window-prefer-vertically (window)
 173     "If there's only one window (excluding any possibly active
 174            minibuffer), then split the current window horizontally."
 175     (if (and (one-window-p t)
 176              (not (active-minibuffer-window))
 177              ( < (frame-width) (frame-height))
 178              )
 179         (let ((split-width-threshold nil))
 180           (split-window-sensibly window))
 181       (split-window-sensibly window)))
 182
 183   (setq split-window-preferred-function #'my/split-window-prefer-vertically)
 184   (setq window-combination-resize t)
 185 #+END_SRC
 186
 187 *** Compilation window
 188
 189 If there is no compilation window, open one at the bottom, spanning
 190 the complete width of the frame. Otherwise, reuse existing window. In
 191 the former case, if there was no error the window closes
 192 automatically.
 193
 194 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 195   (add-to-list 'display-buffer-alist
 196                `(,(rx bos "*compilation*" eos)
 197                  (display-buffer-reuse-window
 198                   display-buffer-in-side-window)
 199                  (reusable-frames . visible)
 200                  (side            . bottom)
 201                  (window-height   . 0.4)))
 202 #+END_SRC
 203
 204 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 205   (defun my/compilation-exit-autoclose (status code msg)
 206     ;; If M-x compile exists with a 0
 207     (when (and (eq status 'exit) (zerop code))
 208       ;; and delete the *compilation* window
 209       (let ((compilation-window (get-buffer-window (get-buffer "*compilation*"))))
 210         (when (and (not (window-at-side-p compilation-window 'top))
 211                    (window-at-side-p compilation-window 'left)
 212                    (window-at-side-p compilation-window 'right))
 213           (delete-window compilation-window))))
 214     ;; Always return the anticipated result of compilation-exit-message-function
 215     (cons msg code))
 216
 217   ;; Specify my function (maybe I should have done a lambda function)
 218   (setq compilation-exit-message-function #'my/compilation-exit-autoclose)
 219 #+END_SRC
 220
 221 If you change the variable ~compilation-scroll-output~ to a ~non-nil~
 222 value, the compilation buffer scrolls automatically to follow the
 223 output. If the value is ~first-error~, scrolling stops when the first
 224 error appears, leaving point at that error. For any other non-nil
 225 value, scrolling continues until there is no more output.
 226
 227 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 228   (setq compilation-scroll-output 'first-error)
 229 #+END_SRC
 230
 231 ** Mode line cleaning
 232 *** Diminish
 233 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 234   (use-package diminish
 235     :ensure t)
 236 #+END_SRC
 237
 238 *** Delight
 239 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 240   (use-package delight
 241     :ensure t)
 242 #+END_SRC
 243
 244 ** Jumping
 245 *** Avy
 246 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 247   (use-package avy
 248     :ensure t
 249     :bind (("C-c C-<SPC>" . avy-goto-word-or-subword-1)
 250            ("C-c j j" . avy-goto-word-or-subword-1)
 251            ("M-g g" . avy-goto-line))
 252     :config (progn (setq avy-background t))
 253     )
 254 #+END_SRC
 255 *** Ace-link (jumping to links)
 256 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 257   (use-package ace-link
 258     :ensure t
 259     ; bind o in most modes
 260     :config (ace-link-setup-default))
 261 #+END_SRC
 262 *** Jumping through edit points (goto-chg)
 263 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 264   (use-package goto-chg
 265     :ensure t
 266     :bind (("C-c j ," . goto-last-change)
 267            ("C-c j ." . goto-last-change-reverse))
 268     )
 269 #+END_SRC
 270 *** Jumping to bookmarks (visible bookmarks, bm)
 271 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 272   (use-package bm
 273     :ensure t
 274     :bind (("C-c j b ." . bm-next)
 275            ("C-c j b ," . bm-previous)
 276            ("C-c j b SPC" . bm-toggle)))
 277 #+END_SRC
 278
 279 ** Snippets
 280 *** Yasnippet
 281 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 282   (use-package yasnippet
 283     :ensure t
 284     :diminish yas-minor-mode
 285     :config (progn
 286               (yas-global-mode)
 287               (setq yas-verbosity 1)
 288               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<tab>") nil)
 289               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "TAB") nil)
 290               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<backtab>") 'yas-expand)
 291               (setq yas-snippet-dirs '("~/lib/emacs_el/snippets/"
 292                                        "~/lib/emacs_el/yasnippet-snippets/snippets/"))
 293               (add-to-list 'hippie-expand-try-functions-list
 294                                'yas-hippie-try-expand)
 295               )
 296     )
 297 #+END_SRC
 298 *** Auto-YASnippet
 299 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 300   (use-package auto-yasnippet
 301     :bind (("H-w" . aya-create)
 302            ("H-y" . aya-expand)
 303            )
 304     )
 305 #+END_SRC
 306 ** Tinyprocmail
 307
 308 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 309   ;; load tinyprocmail
 310   (use-package tinyprocmail
 311     :ensure f
 312     :config (with-library 'tinyprocmail
 313               ;; (setq tinyprocmail--procmail-version "v3.22")
 314               (add-hook 'tinyprocmail--load-hook 'tinyprocmail-install))
 315   )
 316 #+END_SRC
 317
 318 ** Magit
 319 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
 320   (use-package magit
 321     :ensure t
 322     :bind (("C-x g" . magit-status)
 323            ("C-x C-g" . magit-status))
 324     :config
 325     ;; don't verify where we are pushing
 326     (setq magit-push-always-verify nil)
 327     ;; refine diffs always (hilight words)
 328     (setq magit-diff-refine-hunk nil)
 329     ;; load magit-annex
 330     (setq load-path
 331           (append '("~/lib/emacs_el/magit-annex")
 332                   load-path))
 333     ;; load magit-vcsh
 334     (setq load-path
 335           (append '("~/lib/emacs_el/magit-vcsh")
 336                   load-path))
 337     )
 338   (use-package magit-annex
 339     :ensure t
 340   )
 341   (use-package magit-vcsh
 342     :ensure f ; currently not in melpa, so don't try to install
 343   )
 344 #+END_SRC
 345
 346 ** Perl
 347 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 348   (use-package cperl-mode
 349     :config
 350     (progn
 351       ;; Use c-mode for perl .xs files
 352       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.xs\\'" . c-mode))
 353       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\([pP][Llm]\\|al\\)\\'" . cperl-mode))
 354       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl" . cperl-mode))
 355       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl5" . cperl-mode))
 356       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("miniperl" . cperl-mode))
 357       (setq cperl-hairy t
 358             cperl-indent-level 4
 359             cperl-auto-newline nil
 360             cperl-auto-newline-after-colon nil
 361             cperl-continued-statement-offset 4
 362             cperl-brace-offset -1
 363             cperl-continued-brace-offset 0
 364             cperl-label-offset -4
 365             cperl-highlight-variables-indiscriminately t
 366             cperl-electric-lbrace-space nil
 367             cperl-indent-parens-as-block nil
 368             cperl-close-paren-offset -1
 369             cperl-tab-always-indent t)
 370       ;;(add-hook 'cperl-mode-hook (lambda () (cperl-set-style "PerlStyle")))
 371   ))
 372 #+END_SRC
 373
 374 ** Helm
 375 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 376   (use-package helm
 377     :ensure t
 378     :config
 379     (helm-mode 1)
 380     (define-key global-map [remap find-file] 'helm-find-files)
 381     (define-key global-map [remap occur] 'helm-occur)
 382     (define-key global-map [remap list-buffers] 'helm-buffers-list)
 383     (define-key global-map [remap dabbrev-expand] 'helm-dabbrev)
 384     (global-set-key (kbd "M-x") 'helm-M-x)
 385     (unless (boundp 'completion-in-region-function)
 386       (define-key lisp-interaction-mode-map [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point)
 387       (define-key emacs-lisp-mode-map       [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point))
 388     (add-hook 'kill-emacs-hook #'(lambda () (and (file-exists-p "$TMP") (delete-file "$TMP"))))
 389   )
 390 #+END_SRC
 391 *** Helm Flx
 392
 393  [[https://github.com/PythonNut/helm-flx][helm-flx]] implements intelligent helm fuzzy sorting, provided by [[https://github.com/lewang/flx][flx]].
 394
 395  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 396  (use-package helm-flx
 397    :ensure t
 398    :config (progn
 399              ;; these are helm configs, but they kind of fit here nicely
 400              (setq helm-M-x-fuzzy-match                  t
 401                    helm-bookmark-show-location           t
 402                    helm-buffers-fuzzy-matching           t
 403                    helm-completion-in-region-fuzzy-match t
 404                    helm-file-cache-fuzzy-match           t
 405                    helm-imenu-fuzzy-match                t
 406                    helm-mode-fuzzy-match                 t
 407                    helm-locate-fuzzy-match               nil
 408                    helm-quick-update                     t
 409                    helm-recentf-fuzzy-match              nil
 410                    helm-semantic-fuzzy-match             t)
 411              (helm-flx-mode +1)))
 412  #+END_SRC
 413 *** Helm Swoop
 414 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 415
 416   ;;; stolen from https://github.com/malb/emacs.d/blob/master/malb.org
 417   (defun malb/helm-swoop-pre-fill ()
 418     (thing-at-point 'symbol))
 419   (setq malb/helm-swoop-ignore-major-mode '(dired-mode
 420         paradox-menu-mode doc-view-mode pdf-view-mode
 421         mu4e-headers-mode org-mode markdown-mode latex-mode
 422         ein:notebook-multilang-mode))
 423
 424   (defun malb/swoop-or-search ()
 425     (interactive)
 426     (if (or (> (buffer-size) 1048576) ;; helm-swoop can be slow on big buffers
 427             (memq major-mode malb/helm-swoop-ignore-major-mode))
 428         (isearch-forward)
 429       (helm-swoop)))
 430
 431   (use-package helm-swoop
 432     :ensure t
 433     :bind (("C-c o" . helm-multi-swoop-org)
 434            ("C-s" . malb/swoop-or-search)
 435            ("C-M-s" . helm-multi-swoop-all))
 436     :config (progn
 437
 438               (setq helm-swoop-pre-input-function  #'malb/helm-swoop-pre-fill
 439                     helm-swoop-split-with-multiple-windows nil
 440                     helm-swoop-split-direction #'split-window-horizontally
 441                     helm-swoop-split-window-function 'helm-default-display-buffer
 442                     helm-swoop-speed-or-color t)
 443
 444               ;; https://emacs.stackexchange.com/questions/28790/helm-swoop-how-to-make-it-behave-more-like-isearch
 445               (defun malb/helm-swoop-C-s ()
 446                 (interactive)
 447                 (if (boundp 'helm-swoop-pattern)
 448                     (if (equal helm-swoop-pattern "")
 449                         (previous-history-element 1)
 450                       (helm-next-line))
 451                   (helm-next-line)))
 452
 453               (bind-key "C-S-s" #'helm-swoop-from-isearch isearch-mode-map)
 454               (bind-key "C-S-s" #'helm-multi-swoop-all-from-helm-swoop helm-swoop-map)
 455               (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-swoop-map)
 456               (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-swoop-map)
 457               (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-multi-swoop-map)
 458               (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-multi-swoop-map))
 459     )
 460
 461 #+END_SRC
 462 *** Helm Ag
 463 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 464 (use-package helm-ag
 465   :ensure t
 466   :config (setq helm-ag-base-command "ag --nocolor --nogroup"
 467                 helm-ag-command-option "--all-text"
 468                 helm-ag-insert-at-point 'symbol
 469                 helm-ag-fuzzy-match t
 470                 helm-ag-use-temp-buffer t
 471                 helm-ag-use-grep-ignore-list t
 472                 helm-ag-use-agignore t))
 473 #+END_SRC
 474 *** Helm Descbinds
 475 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 476   (use-package helm-descbinds
 477     :ensure t
 478     :bind ("C-h b" . helm-descbinds)
 479     :init (fset 'describe-bindings 'helm-descbinds))
 480 #+END_SRC
 481
 482 *** Helm YaSnippet
 483 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 484   (use-package helm-c-yasnippet
 485     :ensure t
 486     :bind ("C-c h y" .  helm-yas-complete)
 487     :config (progn
 488               (setq helm-yas-space-match-any-greedy t)))
 489 #+END_SRC
 490 *** Helm Org Rifle
 491 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 492   (use-package helm-org-rifle
 493     :ensure t
 494     :config (progn
 495               (defun malb/helm-org-rifle-agenda-files (arg)
 496                 (interactive "p")
 497                 (let ((current-prefix-arg nil))
 498                   (cond
 499                    ((equal arg 4) (call-interactively #'helm-org-rifle-agenda-files nil))
 500                    ((equal arg 16) (helm-org-rifle-occur-agenda-files))
 501                    (t (helm-org-agenda-files-headings)))))))
 502 #+END_SRC
 503
 504 ** Hydra
 505 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
 506 (require 'don-hydra)
 507 #+END_SRC
 508
 509 ** Tramp
 510 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 511   (add-to-list 'tramp-methods '("vcsh"
 512                                 (tramp-login-program "vcsh")
 513                                 (tramp-login-args
 514                                  (("enter")
 515                                   ("%h")))
 516                                 (tramp-remote-shell "/bin/sh")
 517                                 (tramp-remote-shell-args
 518                                  ("-c"))))
 519 #+END_SRC
 520 ** Reftex
 521 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 522   (use-package reftex
 523     :ensure t
 524     :config
 525     (setq-default reftex-default-bibliography
 526                     '("~/projects/research/references.bib")))
 527 #+END_SRC
 528 ** LaTeX
 529 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 530   (use-package tex
 531     :defer t
 532     :ensure auctex
 533     :config
 534     ; (add-to-list 'TeX-style-path '"/home/don/lib/emacs_el/auctex/style")
 535     ;; REFTEX (much enhanced management of cross-ref, labels, etc)
 536     ;; http://www.strw.leidenuniv.nl/~dominik/Tools/reftex/
 537     ; (autoload 'reftex-mode     "reftex" "RefTeX Minor Mode" t)
 538     ; (autoload 'turn-on-reftex  "reftex" "RefTeX Minor Mode" nil)
 539     ; (autoload 'reftex-citation "reftex-cite" "Make citation" nil)
 540     ; (autoload 'reftex-index-phrase-mode "reftex-index" "Phrase mode" t)
 541     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with AUCTeX LaTeX mode
 542     (add-hook 'latex-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with Emacs latex mode
 543     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with AUCTeX LaTeX mode
 544     (add-hook 'latex-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with Emacs latex mode
 545
 546     (setq-default reftex-plug-into-AUCTeX t)
 547     ;; support fake section headers
 548     (setq TeX-outline-extra
 549           '(("%chapter" 1)
 550             ("%section" 2)
 551             ("%subsection" 3)
 552             ("%subsubsection" 4)
 553             ("%paragraph" 5)))
 554     ;; add font locking to the headers
 555     (font-lock-add-keywords
 556      'latex-mode
 557      '(("^%\\(chapter\\|\\(sub\\|subsub\\)?section\\|paragraph\\)"
 558         0 'font-lock-keyword-face t)
 559        ("^%chapter{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-1-face t)
 560        ("^%section{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-2-face t)
 561        ("^%subsection{\\(.*\\)}"    1 'font-latex-sectioning-3-face t)
 562        ("^%subsubsection{\\(.*\\)}" 1 'font-latex-sectioning-4-face t)
 563        ("^%paragraph{\\(.*\\)}"     1 'font-latex-sectioning-5-face t)))
 564
 565     ;; use smart quotes by default instead of `` and ''
 566     ;; taken from http://kieranhealy.org/esk/kjhealy.html
 567     (setq TeX-open-quote "“")
 568     (setq TeX-close-quote "”")
 569
 570     ;; (TeX-add-style-hook
 571     ;;  "latex"
 572     ;;  (lambda ()
 573     ;;    (TeX-add-symbols
 574     ;;     '("DLA" 1))))
 575     ;; (custom-set-variables
 576     ;;  '(font-latex-user-keyword-classes
 577     ;;    '(("fixme"
 578     ;;       ("DLA" "RZ")
 579     ;;       font-lock-function-name-face 2 (command 1 t))))
 580     ;; )
 581     (setq-default TeX-parse-self t)
 582     (setq-default TeX-auto-save t)
 583     (setq-default TeX-master nil)
 584     (eval-after-load
 585         "latex"
 586       '(TeX-add-style-hook
 587         "cleveref"
 588         (lambda ()
 589           (if (boundp 'reftex-ref-style-alist)
 590               (add-to-list
 591                'reftex-ref-style-alist
 592                '("Cleveref" "cleveref"
 593                  (("\\cref" ?c) ("\\Cref" ?C) ("\\cpageref" ?d) ("\\Cpageref" ?D)))))
 594           (reftex-ref-style-activate "Cleveref")
 595           (TeX-add-symbols
 596            '("cref" TeX-arg-ref)
 597            '("Cref" TeX-arg-ref)
 598            '("cpageref" TeX-arg-ref)
 599            '("Cpageref" TeX-arg-ref)))))
 600     (eval-after-load
 601         "latex"
 602       '(add-to-list 'LaTeX-fill-excluded-macros
 603                     '("Sexpr")))
 604
 605     (use-package font-latex
 606       :config
 607       (setq font-latex-match-reference-keywords
 608             '(
 609               ("fref" "{")
 610               ("Fref" "{")
 611               ("citep" "{")
 612               ("citet" "{")
 613               ("acs" "{")
 614               ("acsp" "{")
 615               ("ac" "{")
 616               ("acp" "{")
 617               ("acl" "{")
 618               ("aclp" "{")
 619               ("acsu" "{")
 620               ("aclu" "{")
 621               ("acused" "{")
 622               ("DLA" "{")
 623               ("RZ" "{")
 624               ("OM" "{")
 625               ("DL" "{")
 626               ("fixme" "{"))
 627             )
 628       )
 629   )
 630
 631 #+END_SRC
 632 *** Org-Gcal
 633 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 634   (use-package calfw
 635     :ensure f
 636     )
 637   (use-package calfw-org
 638     :ensure f
 639     )
 640   (use-package org-gcal
 641     :ensure f
 642     :config '((if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
 643                   (load-file "~/.hide/org_gcal.el"))
 644               )
 645     )
 646 #+END_SRC
 647 ** ESS
 648 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 649   (use-package ess
 650     :ensure t
 651     :config
 652     (defun ess-change-directory (path)
 653       "Set the current working directory to PATH for both *R* and Emacs."
 654       (interactive "DDirectory to change to: ")
 655
 656       (when (file-exists-p path)
 657         (ess-command (concat "setwd(\"" path "\")\n"))
 658         ;; use file-name-as-directory to ensure it has trailing /
 659         (setq default-directory (file-name-as-directory path))))
 660     (add-hook 'ess-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 661     ;; outlining support for ess modes
 662     (add-hook
 663      'ess-mode-hook
 664      '(lambda ()
 665         (outline-minor-mode)
 666         (setq outline-regexp "\\(^#\\{4,5\\} \\)\\|\\(^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function\\)")
 667         (defun outline-level ()
 668           (cond ((looking-at "^##### ") 1)
 669                 ((looking-at "^#### ") 2)
 670                 ((looking-at "^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function(.*{") 3)
 671                 (t 1000)))
 672         ))
 673     (add-hook 'ess-mode-hook
 674               '(lambda ()
 675                  (local-set-key (kbd "C-c C-R")
 676                                 'dla/ess-region-remote-eval)))
 677
 678     ;; Don't restore history or save workspace image
 679     '(inferior-R-args "--no-restore-history --no-save")
 680     )
 681 #+END_SRC
 682
 683 ** Rainbowmode
 684 From http://julien.danjou.info/projects/emacs-packages#rainbow-mode, this colorizes color strings
 685
 686 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 687   (use-package rainbow-mode
 688     ;; add ess to the x major mode
 689     :config (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[S])
 690     (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[R])
 691   )
 692 #+END_SRC
 693
 694 ** Polymode
 695 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 696   (use-package polymode
 697     :config
 698     (use-package poly-R)
 699     (use-package poly-noweb)
 700     (use-package poly-markdown)
 701     :mode ("\\.Snw" . poly-noweb+r-mode)
 702     :mode ("\\.Rnw" . poly-noweb+r-mode)
 703     :mode ("\\.Rmd" . poly-markdown+r-mode)
 704     )
 705 #+END_SRC
 706
 707 ** Outlining
 708 *** Outline magic
 709 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 710   (use-package outline-magic)
 711 #+END_SRC
 712 ** Writeroom Mode
 713 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 714   (use-package writeroom-mode
 715     :config
 716     (defun my/writing-mode ()
 717       "Start my writing mode; enable visual-line-mode and auto-fill-mode"
 718       (interactive)
 719       (if writeroom-mode
 720           (progn
 721             (writeroom-mode -1)
 722             (visual-line-mode -1)
 723             (auto-fill-mode -1)
 724             (visual-fill-column-mode -1)
 725             )
 726         (visual-line-mode 1)
 727         (auto-fill-mode 1)
 728         (visual-fill-column-mode 1)
 729         (writeroom-mode 1))
 730       )
 731     )
 732 #+END_SRC
 733 ** GhostText/Atomic Chrome
 734 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 735   (use-package atomic-chrome
 736     :config (atomic-chrome-start-server)
 737     (setq atomic-chrome-buffer-open-style 'full)
 738     )
 739 #+END_SRC
 740 ** Multiple Cursors
 741    :PROPERTIES:
 742    :ID:       6fcf218b-a762-4c37-9339-a8202ddeb544
 743    :END:
 744 [[https://github.com/magnars/multiple-cursors.el][Multiple Cursors]]
 745 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 746   (use-package multiple-cursors
 747     :bind (("C-;" . mc/mark-all-dwim)
 748            ("C-<" . mc/mark-previous-like-this)
 749            ("C->" . mc/mark-next-like-this)
 750            ("C-S-c C-S-c" . mc/edit-lines))
 751     )
 752 #+END_SRC
 753 ** Web Mode
 754 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 755   (use-package web-mode
 756     :config
 757     (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.tmpl\\'" . web-mode))
 758     (setq web-mode-enable-engine-detection t)
 759     (setq web-mode-engines-alist
 760           '(("template-toolkit" . "\\.tmpl\\'")))
 761     )
 762 #+END_SRC
 763 * Org Mode
 764 ** Use-package and load things
 765 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 766
 767   (use-package org
 768     :config
 769
 770 #+END_SRC
 771 ** Agenda Configuration
 772 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 773   ;; The following lines are always needed. Choose your own keys.
 774   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\(org\\|org_archive\\|txt\\)$" . org-mode))
 775   (global-set-key "\C-cl" 'org-store-link)
 776   (global-set-key "\C-ca" 'org-agenda)
 777   (global-set-key "\C-cb" 'org-iswitchb)
 778   (setq-default org-log-done 'time)
 779   (setq-default org-agenda-ndays 5)
 780
 781   ;; agenda configuration
 782   ;; Do not dim blocked tasks
 783   (setq org-agenda-dim-blocked-tasks nil)
 784   (setq org-agenda-inhibit-startup t)
 785   (setq org-agenda-use-tag-inheritance nil)
 786
 787   ;; Compact the block agenda view
 788   (setq org-agenda-compact-blocks t)
 789
 790   ;; Custom agenda command definitions
 791   (setq org-agenda-custom-commands
 792         (quote (("N" "Notes" tags "NOTE"
 793                  ((org-agenda-overriding-header "Notes")
 794                   (org-tags-match-list-sublevels t)))
 795                 ("h" "Habits" tags-todo "STYLE=\"habit\""
 796                  ((org-agenda-overriding-header "Habits")
 797                   (org-agenda-sorting-strategy
 798                    '(todo-state-down effort-up category-keep))))
 799                 (" " "Agenda"
 800                  ((agenda "" nil)
 801                   (tags "REFILE"
 802                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Refile")
 803                          (org-tags-match-list-sublevels nil)))
 804                   (tags-todo "-CANCELLED/!"
 805                              ((org-agenda-overriding-header "Stuck Projects")
 806                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-stuck-projects)
 807                               (org-agenda-sorting-strategy
 808                                '(category-keep))))
 809                   (tags-todo "-HOLD-CANCELLED/!"
 810                              ((org-agenda-overriding-header "Projects")
 811                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-projects)
 812                               (org-tags-match-list-sublevels 'indented)
 813                               (org-agenda-sorting-strategy
 814                                '(category-keep))))
 815                   (tags-todo "-CANCELLED/!NEXT"
 816                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Next Tasks"
 817                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
 818                                                                         ""
 819                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
 820                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-projects-and-habits-and-single-tasks)
 821                               (org-tags-match-list-sublevels t)
 822                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 823                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 824                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 825                               (org-agenda-sorting-strategy
 826                                '(todo-state-down effort-up category-keep))))
 827                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
 828                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Subtasks"
 829                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
 830                                                                         ""
 831                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
 832                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-project-tasks)
 833                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 834                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 835                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 836                               (org-agenda-sorting-strategy
 837                                '(category-keep))))
 838                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
 839                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Standalone Tasks"
 840                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
 841                                                                         ""
 842                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
 843                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-project-tasks)
 844                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 845                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 846                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 847                               (org-agenda-sorting-strategy
 848                                '(category-keep))))
 849                   (tags-todo "-CANCELLED+WAITING|HOLD/!"
 850                              ((org-agenda-overriding-header "Waiting and Postponed Tasks")
 851                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-stuck-projects)
 852                               (org-tags-match-list-sublevels nil)
 853                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled t)
 854                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines t)))
 855                   (tags "-REFILE/"
 856                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Archive")
 857                          (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-archivable-tasks)
 858                          (org-tags-match-list-sublevels nil))))
 859                  nil))))
 860
 861   ; org mode agenda files
 862   (setq org-agenda-files
 863         (quote ("~/projects/org-notes/debbugs.org"
 864             "~/projects/org-notes/notes.org"
 865             "~/projects/org-notes/holidays.org"
 866             "~/projects/org-notes/refile.org"
 867             "~/projects/org-notes/diary.org"
 868             "~/projects/org-notes/ool.org"
 869             "~/projects/org-notes/sndservers.org"
 870             "~/projects/org-notes/chaim.org"
 871             "~/projects/org-notes/wildman.org"
 872             "~/projects/org-notes/uddin.org"
 873             "~/projects/org-notes/reviews.org"
 874             "~/projects/org-notes/hpcbio.org"
 875             "~/org-mode/from-mobile.org"
 876             "~/projects/org-notes/fh.org")))
 877
 878   (set-register ?n (cons 'file "~/projects/org-notes/notes.org"))
 879   (set-register ?r (cons 'file "~/projects/org-notes/refile.org"))
 880   (set-register ?o (cons 'file "~/projects/org-notes/ool.org"))
 881   (set-register ?s (cons 'file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
 882   (set-register ?c (cons 'file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
 883   (set-register ?w (cons 'file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
 884   (set-register ?u (cons 'file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
 885   (set-register ?R (cons 'file "~/projects/reviews/reviews.org"))
 886   (set-register ?d (cons 'file "~/projects/org-notes/diary.org"))
 887   ; from https://emacs.stackexchange.com/questions/909/how-can-i-have-an-agenda-timeline-view-of-multiple-files
 888   (defun org-agenda-timeline-all (&optional arg)
 889     (interactive "P")
 890     (with-temp-buffer
 891       (dolist (org-agenda-file org-agenda-files)
 892         (insert-file-contents org-agenda-file nil)
 893         (end-of-buffer)
 894         (newline))
 895       (write-file "/tmp/timeline.org")
 896       (org-agenda arg "L")))
 897   (define-key org-mode-map (kbd "C-c t") 'org-agenda-timeline-all)
 898   ;; add automatic reminders for appointments
 899   (defadvice  org-agenda-redo (after org-agenda-redo-add-appts)
 900     "Pressing `r' on the agenda will also add appointments."
 901     (progn
 902       (setq appt-time-msg-list nil)
 903       (org-agenda-to-appt)))
 904
 905 #+END_SRC
 906 ** General config
 907 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 908   (setq org-global-properties '(("Effort_ALL 0 0:10 0:30 1:00 2:00 3:00 4:00 5:00 6:00 7:00")))
 909   (setq org-columns-default-format "%40ITEM(Task) %6Effort{:} %CLOCKSUM %PRIORITY %TODO %13SCHEDULED %13DEADLINE %TAGS")
 910
 911   (setq org-default-notes-file "~/projects/org-notes/notes.org")
 912   (setq org-id-link-to-org-use-id t)
 913 #+END_SRC
 914 ** Capture Templates
 915 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 916   (setq org-capture-templates  ;; mail-specific note template, identified by "m"
 917         '(("m" "Mail" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 918            "* %?\n\n  Source: %u, [[%:link][%:description]]\n  %:initial")
 919           ("t" "todo" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 920            "* TODO %?\n  :PROPERTIES:\n  :END:\n  :LOGBOOK:\n  :END:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 921           ("r" "respond" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 922            "* NEXT Respond to %:from on %:subject\nSCHEDULED: %t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t :immediate-finish t)
 923           ("n" "note" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 924            "* %? :NOTE:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 925           ("s" "schedule" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 926            "* %? :cal:\n%^{scheduled:}t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 927           ("j" "Journal" entry (file+datetree "~/projects/org-notes/diary.org")
 928            "* %?\n%U\n" :clock-in t :clock-resume t)
 929           ("w" "org-protocol" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 930            "* TODO Review %c\n%U\n" :immediate-finish t)
 931           ("M" "Meeting" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 932            "* MEETING with %? :MEETING:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 933           ("S" "Seminar" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 934            "* SEMINAR notes %? :SEMINAR:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 935           ("P" "Paper to read" entry (file+headline "~/projects/research/papers_to_read.org" "Refile")
 936            "* TODO Get/Read %? \n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 937           ("p" "Phone call" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 938            "* PHONE %? :PHONE:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 939           ("J" "job" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 940            "* TODO Apply for %a%? :job:\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d 17:00-17:30>\")\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 941           ("h" "Habit" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 942            "* NEXT %?\n%U\n%a\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d .+1d/3d>\")\n:PROPERTIES:\n:STYLE: habit\n:REPEAT_TO_STATE: NEXT\n:END:\n%a\n")
 943           )
 944         )
 945
 946   ;; Remove empty LOGBOOK drawers on clock out
 947   (defun bh/remove-empty-drawer-on-clock-out ()
 948     (interactive)
 949     (save-excursion
 950       (beginning-of-line 0)
 951       (org-remove-empty-drawer-at (point))))
 952
 953   (defun my/org-add-id ()
 954     (interactive)
 955     (save-excursion
 956       (if (org-current-level)
 957           ()
 958         (forward-char 1)
 959         )
 960       (org-id-get-create)
 961       )
 962   )
 963
 964 #+END_SRC
 965 ** Org mode key bindings
 966 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 967   ; org mode configuration from http://doc.norang.ca/org-mode.html
 968   ;; Custom Key Bindings
 969   (global-set-key (kbd "<f12>") 'org-agenda)
 970   (global-set-key (kbd "<f5>") 'bh/org-todo)
 971   (global-set-key (kbd "<S-f5>") 'bh/widen)
 972   (global-set-key (kbd "<f7>") 'bh/set-truncate-lines)
 973   (global-set-key (kbd "<f8>") 'org-cycle-agenda-files)
 974   (global-set-key (kbd "<f9> <f9>") 'bh/show-org-agenda)
 975   (global-set-key (kbd "<f9> b") 'bbdb)
 976   (global-set-key (kbd "<f9> c") 'calendar)
 977   (global-set-key (kbd "<f9> f") 'boxquote-insert-file)
 978   (global-set-key (kbd "<f9> h") 'bh/hide-other)
 979   (global-set-key (kbd "<f9> n") 'bh/toggle-next-task-display)
 980   (global-set-key (kbd "<f9> w") 'widen)
 981
 982   ; change the outline mode prefix from C-c @ to C-c C-2
 983   (setq outline-minor-mode-prefix "C-c C-2")
 984   ;(add-hook 'outline-minor-mode-hook
 985   ;          (lambda () (local-set-key (kbd "C-c C-2")
 986   ;                                    outline-mode-prefix-map)))
 987
 988   (global-set-key (kbd "<f9> I") 'bh/punch-in)
 989   (global-set-key (kbd "<f9> O") 'bh/punch-out)
 990
 991   (global-set-key (kbd "<f9> o") 'bh/make-org-scratch)
 992
 993   (global-set-key (kbd "<f9> r") 'boxquote-region)
 994   (global-set-key (kbd "<f9> s") 'bh/switch-to-scratch)
 995
 996   (global-set-key (kbd "<f9> t") 'bh/insert-inactive-timestamp)
 997   (global-set-key (kbd "<f9> T") 'bh/toggle-insert-inactive-timestamp)
 998
 999   (global-set-key (kbd "<f9> v") 'visible-mode)
1000   (global-set-key (kbd "<f9> l") 'org-toggle-link-display)
1001   (global-set-key (kbd "<f9> SPC") 'bh/clock-in-last-task)
1002   (global-set-key (kbd "C-<f9>") 'previous-buffer)
1003   (global-set-key (kbd "M-<f9>") 'org-toggle-inline-images)
1004   (global-set-key (kbd "C-x n r") 'narrow-to-region)
1005   (global-set-key (kbd "C-<f10>") 'next-buffer)
1006   (global-set-key (kbd "<f11>") 'org-clock-goto)
1007   (global-set-key (kbd "C-<f11>") 'org-clock-in)
1008   (global-set-key (kbd "C-s-<f12>") 'bh/save-then-publish)
1009   (global-set-key (kbd "C-c c") 'org-capture)
1010
1011 #+END_SRC
1012 ** Utility Functions
1013 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1014   (defun bh/hide-other ()
1015     (interactive)
1016     (save-excursion
1017       (org-back-to-heading 'invisible-ok)
1018       (hide-other)
1019       (org-cycle)
1020       (org-cycle)
1021       (org-cycle)))
1022
1023   (defun bh/set-truncate-lines ()
1024     "Toggle value of truncate-lines and refresh window display."
1025     (interactive)
1026     (setq truncate-lines (not truncate-lines))
1027     ;; now refresh window display (an idiom from simple.el):
1028     (save-excursion
1029       (set-window-start (selected-window)
1030                         (window-start (selected-window)))))
1031
1032   (defun bh/make-org-scratch ()
1033     (interactive)
1034     (find-file "/tmp/publish/scratch.org")
1035     (gnus-make-directory "/tmp/publish"))
1036
1037   (defun bh/switch-to-scratch ()
1038     (interactive)
1039     (switch-to-buffer "*scratch*"))
1040
1041   (setq org-use-fast-todo-selection t)
1042   (setq org-treat-S-cursor-todo-selection-as-state-change nil)
1043
1044   ; create function to create headlines in file. This comes from
1045   ; http://stackoverflow.com/questions/13340616/assign-ids-to-every-entry-in-org-mode
1046   (defun my/org-add-ids-to-headlines-in-file ()
1047     "Add ID properties to all headlines in the current file which
1048   do not already have one."
1049     (interactive)
1050     (org-map-entries 'org-id-get-create))
1051   ; if we wanted to do this to every buffer, do the following:
1052   ; (add-hook 'org-mode-hook
1053   ;           (lambda ()
1054   ;             (add-hook 'before-save-hook 'my/org-add-ids-to-headlines-in-file nil 'local)))
1055 #+END_SRC
1056 ** Keywords (TODO)
1057 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1058   (setq org-todo-keywords
1059         (quote ((sequence "TODO(t)" "NEXT(n)" "|" "DONE(d)")
1060                 (sequence "WAITING(w@/!)" "HOLD(h@/!)" "|" "CANCELLED(c@/!)" "PHONE" "MEETING"))))
1061
1062   (setq org-todo-keyword-faces
1063         (quote (("TODO" :foreground "red" :weight bold)
1064                 ("NEXT" :foreground "blue" :weight bold)
1065                 ("DONE" :foreground "forest green" :weight bold)
1066                 ("WAITING" :foreground "orange" :weight bold)
1067                 ("HOLD" :foreground "magenta" :weight bold)
1068                 ("CANCELLED" :foreground "forest green" :weight bold)
1069                 ("MEETING" :foreground "forest green" :weight bold)
1070                 ("PHONE" :foreground "forest green" :weight bold))))
1071
1072   (setq org-todo-state-tags-triggers
1073         (quote (("CANCELLED" ("CANCELLED" . t))
1074                 ("WAITING" ("WAITING" . t))
1075                 ("HOLD" ("WAITING") ("HOLD" . t))
1076                 (done ("WAITING") ("HOLD"))
1077                 ("TODO" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1078                 ("NEXT" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1079                 ("DONE" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD")))))
1080
1081
1082
1083   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/remove-empty-drawer-on-clock-out 'append)
1084   ; add ids on creation of nodes
1085   (add-hook 'org-capture-prepare-finalize-hook 'my/org-add-id)
1086
1087
1088   ; resolve clocks after 10 minutes of idle; use xprintidle
1089   ; (setq org-clock-idle-time 10)
1090   ; (setq org-clock-x11idle-program-name "xprintidle")
1091
1092   ; this is from http://doc.norang.ca/org-mode.html#Capture
1093   ; use C-M-r for org mode capture
1094   (global-set-key (kbd "C-M-r") 'org-capture)
1095
1096   ; Targets include this file and any file contributing to the agenda - up to 9 levels deep
1097   (setq org-refile-targets (quote ((nil :maxlevel . 9)
1098                                    (org-agenda-files :maxlevel . 9))))
1099
1100   ; Use full outline paths for refile targets - we file directly with IDO
1101   (setq org-refile-use-outline-path t)
1102
1103   ; Targets complete directly with IDO
1104   (setq org-outline-path-complete-in-steps nil)
1105
1106   ; Allow refile to create parent tasks with confirmation
1107   (setq org-refile-allow-creating-parent-nodes (quote confirm))
1108
1109   ; ; Use IDO for both buffer and file completion and ido-everywhere to t
1110   ; (setq org-completion-use-ido t)
1111   ; (setq ido-everywhere t)
1112   ; (setq ido-max-directory-size 100000)
1113   ; (ido-mode (quote both))
1114   ; ; Use the current window when visiting files and buffers with ido
1115   ; (setq ido-default-file-method 'selected-window)
1116   ; (setq ido-default-buffer-method 'selected-window)
1117   ; ; Use the current window for indirect buffer display
1118   ; (setq org-indirect-buffer-display 'current-window)
1119
1120
1121   ;;;; Refile settings
1122   ; Exclude DONE state tasks from refile targets
1123   (defun bh/verify-refile-target ()
1124     "Exclude todo keywords with a done state from refile targets"
1125     (not (member (nth 2 (org-heading-components)) org-done-keywords)))
1126
1127   (setq org-refile-target-verify-function 'bh/verify-refile-target)
1128
1129   ;; ensure that emacsclient will show just the note to be edited when invoked
1130   ;; from Mutt, and that it will shut down emacsclient once finished;
1131   ;; fallback to legacy behavior when not invoked via org-protocol.
1132   (require 'org-protocol)
1133   ; (add-hook 'org-capture-mode-hook 'delete-other-windows)
1134   (setq my-org-protocol-flag nil)
1135   (defadvice org-capture-finalize (after delete-frame-at-end activate)
1136     "Delete frame at remember finalization"
1137     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1138            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1139   (defadvice org-capture-refile (around delete-frame-after-refile activate)
1140     "Delete frame at remember refile"
1141     (if my-org-protocol-flag
1142         (progn
1143           (setq my-org-protocol-flag nil)
1144           ad-do-it
1145           (delete-frame))
1146       ad-do-it)
1147     )
1148   (defadvice org-capture-kill (after delete-frame-at-end activate)
1149     "Delete frame at remember abort"
1150     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1151            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1152   (defadvice org-protocol-capture (before set-org-protocol-flag activate)
1153     (setq my-org-protocol-flag t))
1154
1155   (defadvice org-insert-todo-heading (after dla/create-id activate)
1156     (org-id-get-create)
1157     )
1158
1159   ;; org modules
1160   (add-to-list 'org-modules 'org-habit)
1161
1162   ; this comes from http://upsilon.cc/~zack/blog/posts/2010/02/integrating_Mutt_with_Org-mode/
1163   (defun open-mail-in-mutt (message)
1164     "Open a mail message in Mutt, using an external terminal.
1165
1166   Message can be specified either by a path pointing inside a
1167   Maildir, or by Message-ID."
1168     (interactive "MPath or Message-ID: ")
1169     (shell-command
1170      (format "faf xterm -e \"%s %s\""
1171          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/mutt_open") message)))
1172
1173   ;; add support for "mutt:ID" links
1174   (org-add-link-type "mutt" 'open-mail-in-mutt)
1175
1176   (defun my-org-mode-setup ()
1177     (load-library "reftex")
1178     (and (buffer-file-name)
1179          (file-exists-p (buffer-file-name))
1180          (progn
1181            (reftex-parse-all)
1182            (reftex-set-cite-format
1183             '((?b . "[[bib:%l][%l-bib]]")
1184               (?n . "[[notes:%l][%l-notes]]")
1185               (?c . "\\cite{%l}")
1186               (?h . "*** %t\n:PROPERTIES:\n:Custom_ID: %l\n:END:\n[[papers:%l][%l xoj]] [[papers-pdf:%l][pdf]]")))
1187            ))
1188     (define-key org-mode-map (kbd "C-c )") 'reftex-citation)
1189     (define-key org-mode-map (kbd "C-c [") 'reftex-citation)
1190     (define-key org-mode-map (kbd "C-c (") 'org-mode-reftex-search)
1191     (define-key org-mode-map (kbd "C-c 0") 'reftex-view-crossref)
1192     )
1193   (add-hook 'org-mode-hook 'my-org-mode-setup)
1194
1195   (defun org-mode-reftex-search ()
1196     (interactive)
1197     (org-open-link-from-string (format "[[notes:%s]]" (first (reftex-citation t)))))
1198
1199   (defun open-research-paper (bibtexkey)
1200     "Open a paper by bibtex key"
1201     (interactive "bibtex key: ")
1202     (shell-command
1203      (format "%s %s"
1204          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1205   (org-add-link-type "papers" 'open-research-paper)
1206   (defun open-research-paper-pdf (bibtexkey)
1207     "Open a paper pdf by bibtex key"
1208     (interactive "bibtex key: ")
1209     (shell-command
1210      (format "%s -p evince_annot %s"
1211          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1212   (org-add-link-type "papers-pdf" 'open-research-paper-pdf)
1213
1214   (add-to-list 'org-link-abbrev-alist
1215                '("notes" .
1216                  "~/projects/research/paper_notes.org::#%s"))
1217
1218   ; I pretty much always want hiearchical checkboxes
1219   (setq org-hierachical-checkbox-statistics nil)
1220
1221   ;; Add \begin{equation}\end{equation} templates to the org mode easy templates
1222   (add-to-list 'org-structure-template-alist
1223                '("E" "\\begin{equation}\n?\n\\end{equation}"))
1224
1225    ;; stolen from
1226   ;; http://www-public.it-sudparis.eu/~berger_o/weblog/2012/03/23/how-to-manage-and-export-bibliographic-notesrefs-in-org-mode/
1227   (defun my-rtcite-export-handler (path desc format)
1228     (message "my-rtcite-export-handler is called : path = %s, desc = %s, format = %s" path desc format)
1229     (let* ((search (when (string-match "::#?\\(.+\\)\\'" path)
1230                      (match-string 1 path)))
1231            (path (substring path 0 (match-beginning 0))))
1232       (cond ((eq format 'latex)
1233              (if (or (not desc)
1234                      (equal 0 (search "rtcite:" desc)))
1235                  (format "\\cite{%s}" search)
1236                (format "\\cite[%s]{%s}" desc search))))))
1237
1238   (org-add-link-type "rtcite"
1239                      'org-bibtex-open
1240                      'my-rtcite-export-handler)
1241
1242
1243 #+END_SRC
1244 ** Org Mobile Configuration
1245 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1246   (setq-default org-mobile-directory "/linnode.donarmstrong.com:/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/")
1247   (when (string= system-name "linnode")
1248     (setq-default org-mobile-directory "/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/"))
1249   (setq-default org-directory "/home/don/org-mode/")
1250   (setq-default org-mobile-inbox-for-pull "/home/don/org-mode/from-mobile.org")
1251
1252 #+END_SRC
1253 ** Org iCal Support
1254 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1255   ;; org mode ical export
1256   (setq org-icalendar-timezone "America/Los_Angeles")
1257   (setq org-icalendar-use-scheduled '(todo-start event-if-todo))
1258   ;; we already add the id manually
1259   ;; (setq org-icalendar-store-UID t)
1260
1261 #+END_SRC
1262 ** General Org Babel Configuration
1263 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1264   ;; org babel support
1265   (org-babel-do-load-languages
1266    'org-babel-load-languages
1267    '((emacs-lisp . t )
1268      (R . t)
1269      (latex . t)
1270      (ditaa . t)
1271      (dot . t)
1272      ))
1273   ;; use graphviz-dot for dot things
1274   (add-to-list 'org-src-lang-modes '("dot" . graphviz-dot))
1275   ;; org-babel-by-backend
1276   (defmacro org-babel-by-backend (&rest body)
1277      `(case (if (boundp 'backend)
1278                 (org-export-backend-name backend)
1279               nil) ,@body))
1280
1281   (defun my/fix-inline-images ()
1282     (when org-inline-image-overlays
1283       (org-redisplay-inline-images)))
1284
1285   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook
1286              'my/fix-inline-images)
1287
1288 #+END_SRC
1289 ** LaTeX configuration
1290    :PROPERTIES:
1291    :ID:       7135ba17-6a50-4eed-84ca-b90afa5b12f8
1292    :END:
1293 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1294   (require 'ox-latex)
1295   (add-to-list 'org-latex-classes
1296            '("memarticle"
1297          "\\documentclass[11pt,oneside,article]{memoir}\n"
1298          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1299          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1300          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1301          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1302          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1303
1304   (setq org-beamer-outline-frame-options "")
1305   (add-to-list 'org-latex-classes
1306            '("beamer"
1307          "\\documentclass[ignorenonframetext]{beamer}
1308   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1309   [PACKAGES]
1310   [EXTRA]"
1311          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1312          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1313          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1314          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1315          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1316
1317   (add-to-list 'org-latex-classes
1318            '("membook"
1319          "\\documentclass[11pt,oneside]{memoir}\n"
1320          ("\\chapter{%s}" . "\\chapter*{%s}")
1321          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1322          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1323          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")))
1324
1325   (add-to-list 'org-latex-classes
1326            '("letter"
1327          "\\documentclass[11pt]{letter}
1328   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1329   [PACKAGES]
1330   [EXTRA]"
1331      ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1332          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1333          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1334          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1335          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1336
1337   (add-to-list 'org-latex-classes
1338            '("dlacv"
1339          "\\documentclass{dlacv}
1340   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1341   [NO-PACKAGES]
1342   [NO-EXTRA]"
1343          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1344          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1345          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1346          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1347          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1348
1349
1350   (add-to-list 'org-latex-classes
1351            '("dlaresume"
1352          "\\documentclass{dlaresume}
1353   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1354   [NO-PACKAGES]
1355   [NO-EXTRA]"
1356          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1357          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1358          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1359          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1360          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1361
1362
1363   ;; Originally taken from Bruno Tavernier: http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/31150/focus=31432
1364   ;; but adapted to use latexmk 4.22 or higher.
1365   (setq org-latex-pdf-process '("latexmk -f -pdflatex=xelatex -bibtex -use-make -pdf %f"))
1366
1367   ;; Default packages included in /every/ tex file, latex, pdflatex or xelatex
1368   (setq org-latex-default-packages-alist
1369     '(("" "amsmath" t)
1370       ("" "unicode-math" t)
1371       ))
1372   (setq org-latex-packages-alist
1373     '(("" "graphicx" t)
1374       ("" "fontspec" t)
1375       ("" "xunicode" t)
1376       ("" "hyperref" t)
1377       ("" "url" t)
1378       ("" "rotating" t)
1379       ("" "longtable" nil)
1380       ("" "float" )))
1381
1382   ;; make equations larger
1383   (setq org-format-latex-options (plist-put org-format-latex-options :scale 2.0))
1384
1385   (defun org-create-formula--latex-header ()
1386     "Return LaTeX header appropriate for previewing a LaTeX snippet."
1387     (let ((info (org-combine-plists (org-export--get-global-options
1388              (org-export-get-backend 'latex))
1389             (org-export--get-inbuffer-options
1390              (org-export-get-backend 'latex)))))
1391       (org-latex-guess-babel-language
1392        (org-latex-guess-inputenc
1393     (org-splice-latex-header
1394      org-format-latex-header
1395      org-latex-default-packages-alist
1396      nil t
1397      (plist-get info :latex-header)))
1398        info)))
1399
1400
1401   ; support ignoring headers in org mode export to latex
1402   ; from http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/67692
1403   (defadvice org-latex-headline (around my-latex-skip-headlines
1404                     (headline contents info) activate)
1405     (if (member "ignoreheading" (org-element-property :tags headline))
1406     (setq ad-return-value contents)
1407       ad-do-it))
1408
1409   ;; keep latex logfiles
1410
1411   (setq org-latex-remove-logfiles nil)
1412
1413   ;; Resume clocking task when emacs is restarted
1414   (org-clock-persistence-insinuate)
1415   ;;
1416   ;; Show lot of clocking history so it's easy to pick items off the C-F11 list
1417   (setq org-clock-history-length 23)
1418   ;; Resume clocking task on clock-in if the clock is open
1419   (setq org-clock-in-resume t)
1420   ;; Change tasks to NEXT when clocking in; this avoids clocking in when
1421   ;; there are things like PHONE calls
1422   (setq org-clock-in-switch-to-state 'bh/clock-in-to-next)
1423   ;; Separate drawers for clocking and logs
1424   (setq org-drawers (quote ("PROPERTIES" "LOGBOOK")))
1425   ;; Save clock data and state changes and notes in the LOGBOOK drawer
1426   (setq org-clock-into-drawer t)
1427   (setq org-log-into-drawer t)
1428   ;; Sometimes I change tasks I'm clocking quickly - this removes clocked tasks with 0:00 duration
1429   (setq org-clock-out-remove-zero-time-clocks t)
1430   ;; Clock out when moving task to a done state
1431   (setq org-clock-out-when-done t)
1432   ;; Save the running clock and all clock history when exiting Emacs, load it on startup
1433   (setq org-clock-persist t)
1434   ;; Do not prompt to resume an active clock
1435   (setq org-clock-persist-query-resume nil)
1436   ;; Enable auto clock resolution for finding open clocks
1437   (setq org-clock-auto-clock-resolution (quote when-no-clock-is-running))
1438   ;; Include current clocking task in clock reports
1439   (setq org-clock-report-include-clocking-task t)
1440
1441   ;; the cache seems to be broken
1442   (setq org-element-use-cache nil)
1443
1444   (defvar bh/keep-clock-running nil)
1445
1446   (defun bh/is-task-p ()
1447     "Any task with a todo keyword and no subtask"
1448     (save-restriction
1449       (widen)
1450       (let ((has-subtask)
1451             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1452             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1453         (save-excursion
1454           (forward-line 1)
1455           (while (and (not has-subtask)
1456                       (< (point) subtree-end)
1457                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1458             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1459               (setq has-subtask t))))
1460         (and is-a-task (not has-subtask)))))
1461   (defun bh/is-project-p ()
1462     "Any task with a todo keyword subtask"
1463     (save-restriction
1464       (widen)
1465       (let ((has-subtask)
1466             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1467             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1468         (save-excursion
1469           (forward-line 1)
1470           (while (and (not has-subtask)
1471                       (< (point) subtree-end)
1472                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1473             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1474               (setq has-subtask t))))
1475         (and is-a-task has-subtask))))
1476
1477   (defun bh/is-subproject-p ()
1478     "Any task which is a subtask of another project"
1479     (let ((is-subproject)
1480           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1481       (save-excursion
1482         (while (and (not is-subproject) (org-up-heading-safe))
1483           (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1484             (setq is-subproject t))))
1485       (and is-a-task is-subproject)))
1486
1487
1488   (defun bh/clock-in-to-next (kw)
1489     "Switch a task from TODO to NEXT when clocking in.
1490   Skips capture tasks, projects, and subprojects.
1491   Switch projects and subprojects from NEXT back to TODO"
1492     (when (not (and (boundp 'org-capture-mode) org-capture-mode))
1493       (cond
1494        ((and (member (org-get-todo-state) (list "TODO"))
1495          (bh/is-task-p))
1496     "NEXT")
1497        ((and (member (org-get-todo-state) (list "NEXT"))
1498          (bh/is-project-p))
1499     "TODO"))))
1500
1501   (defun bh/punch-in (arg)
1502     "Start continuous clocking and set the default task to the
1503   selected task.  If no task is selected set the Organization task
1504   as the default task."
1505     (interactive "p")
1506     (setq bh/keep-clock-running t)
1507     (if (equal major-mode 'org-agenda-mode)
1508     ;;
1509     ;; We're in the agenda
1510     ;;
1511     (let* ((marker (org-get-at-bol 'org-hd-marker))
1512            (tags (org-with-point-at marker (org-get-tags-at))))
1513       (if (and (eq arg 4) tags)
1514           (org-agenda-clock-in '(16))
1515         (bh/clock-in-organization-task-as-default)))
1516       ;;
1517       ;; We are not in the agenda
1518       ;;
1519       (save-restriction
1520     (widen)
1521     ; Find the tags on the current task
1522     (if (and (equal major-mode 'org-mode) (not (org-before-first-heading-p)) (eq arg 4))
1523         (org-clock-in '(16))
1524       (bh/clock-in-organization-task-as-default)))))
1525
1526   (defun bh/punch-out ()
1527     (interactive)
1528     (setq bh/keep-clock-running nil)
1529     (when (org-clock-is-active)
1530       (org-clock-out))
1531     (org-agenda-remove-restriction-lock))
1532
1533   (defun bh/clock-in-default-task ()
1534     (save-excursion
1535       (org-with-point-at org-clock-default-task
1536     (org-clock-in))))
1537
1538   (defun bh/clock-in-parent-task ()
1539     "Move point to the parent (project) task if any and clock in"
1540     (let ((parent-task))
1541       (save-excursion
1542     (save-restriction
1543       (widen)
1544       (while (and (not parent-task) (org-up-heading-safe))
1545         (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1546           (setq parent-task (point))))
1547       (if parent-task
1548           (org-with-point-at parent-task
1549         (org-clock-in))
1550         (when bh/keep-clock-running
1551           (bh/clock-in-default-task)))))))
1552
1553   (defvar bh/organization-task-id "e22cb8bf-07c7-408b-8f60-ff3aadac95e4")
1554
1555   (defun bh/clock-in-organization-task-as-default ()
1556     (interactive)
1557     (org-with-point-at (org-id-find bh/organization-task-id 'marker)
1558       (org-clock-in '(16))))
1559
1560   (defun bh/clock-out-maybe ()
1561     (when (and bh/keep-clock-running
1562            (not org-clock-clocking-in)
1563            (marker-buffer org-clock-default-task)
1564            (not org-clock-resolving-clocks-due-to-idleness))
1565       (bh/clock-in-parent-task)))
1566
1567   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/clock-out-maybe 'append)
1568
1569   (require 'org-id)
1570   (defun bh/clock-in-task-by-id (id)
1571     "Clock in a task by id"
1572     (org-with-point-at (org-id-find id 'marker)
1573       (org-clock-in nil)))
1574
1575   (defun bh/clock-in-last-task (arg)
1576     "Clock in the interrupted task if there is one
1577   Skip the default task and get the next one.
1578   A prefix arg forces clock in of the default task."
1579     (interactive "p")
1580     (let ((clock-in-to-task
1581        (cond
1582         ((eq arg 4) org-clock-default-task)
1583         ((and (org-clock-is-active)
1584           (equal org-clock-default-task (cadr org-clock-history)))
1585          (caddr org-clock-history))
1586         ((org-clock-is-active) (cadr org-clock-history))
1587         ((equal org-clock-default-task (car org-clock-history)) (cadr org-clock-history))
1588         (t (car org-clock-history)))))
1589       (widen)
1590       (org-with-point-at clock-in-to-task
1591     (org-clock-in nil))))
1592
1593
1594   (defun org-export-to-ods ()
1595     (interactive)
1596     (let ((csv-file "data.csv"))
1597       (org-table-export csv-file "orgtbl-to-csv")
1598       (org-odt-convert csv-file "ods" 'open)))
1599
1600   ; allow for zero-width-space to be a break in regexp too
1601   ; (setcar org-emphasis-regexp-components " [:space:] \t('\"{")
1602   ; (setcar (nthcdr 1 org-emphasis-regexp-components) " [:space:]- \t.,:!?;'\")}\\")
1603   ; (org-set-emph-re 'org-emphasis-regexp-components org-emphasis-regexp-components)
1604
1605   ;; support inserting screen shots
1606   (defun my/org-insert-screenshot ()
1607     "Take a screenshot into a time stamped unique-named file in the
1608   same directory as the org-buffer and insert a link to this file."
1609     (interactive)
1610     (defvar my/org-insert-screenshot/filename)
1611     (setq my/org-insert-screenshot/filename
1612       (read-file-name
1613        "Screenshot to insert: "
1614        nil
1615        (concat (buffer-file-name) "_" (format-time-string "%Y%m%d_%H%M%S") ".png")
1616        )
1617       )
1618     (call-process "import" nil nil nil my/org-insert-screenshot/filename)
1619     (insert (concat "[[" my/org-insert-screenshot/filename "]]"))
1620     (org-display-inline-images))
1621
1622   (defun my/fix-inline-images ()
1623     (when org-inline-image-overlays
1624       (org-redisplay-inline-images)))
1625
1626   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook 'my/fix-inline-images)
1627
1628   ;; use xelatex to preview with imagemagick
1629   (add-to-list 'org-preview-latex-process-alist
1630            '(xelateximagemagick
1631         :programs ("xelatex" "convert")
1632         :description "pdf > png"
1633         :message "you need to install xelatex and imagemagick"
1634         :use-xcolor t
1635         :image-input-type "pdf"
1636         :image-output-type "png"
1637         :image-size-adjust (1.0 . 1.0)
1638         :latex-compiler ("xelatex -interaction nonstopmode -output-directory %o %f")
1639         :image-converter ("convert -density %D -trim -antialias %f -quality 100 %O"))
1640            )
1641   ;; use xelatex by default
1642   (setq org-preview-latex-default-process 'xelateximagemagick)
1643
1644   ; from http://orgmode.org/Changes.html
1645   (defun my/org-repair-property-drawers ()
1646     "Fix properties drawers in current buffer.
1647    Ignore non Org buffers."
1648     (interactive)
1649     (when (eq major-mode 'org-mode)
1650       (org-with-wide-buffer
1651        (goto-char (point-min))
1652        (let ((case-fold-search t)
1653          (inline-re (and (featurep 'org-inlinetask)
1654                  (concat (org-inlinetask-outline-regexp)
1655                      "END[ \t]*$"))))
1656      (org-map-entries
1657       (lambda ()
1658         (unless (and inline-re (org-looking-at-p inline-re))
1659           (save-excursion
1660         (let ((end (save-excursion (outline-next-heading) (point))))
1661           (forward-line)
1662           (when (org-looking-at-p org-planning-line-re) (forward-line))
1663           (when (and (< (point) end)
1664                  (not (org-looking-at-p org-property-drawer-re))
1665                  (save-excursion
1666                    (and (re-search-forward org-property-drawer-re end t)
1667                     (eq (org-element-type
1668                      (save-match-data (org-element-at-point)))
1669                     'drawer))))
1670             (insert (delete-and-extract-region
1671                  (match-beginning 0)
1672                  (min (1+ (match-end 0)) end)))
1673             (unless (bolp) (insert "\n"))))))))))))
1674
1675 #+END_SRC
1676 ** End use-package
1677 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1678   )
1679 #+END_SRC
1680 * Keybindings
1681 ** Override other things
1682 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1683   ; apparently things like to step on C-;, so we'll use a hack from
1684   ; http://stackoverflow.com/questions/683425/globally-override-key-binding-in-emacs/5340797#5340797 to fix this
1685
1686   (defvar my-keys-minor-mode-map (make-keymap) "my-keys-minor-mode keymap.")
1687
1688   ; use mc everywhere
1689   (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'mc/mark-all-dwim)
1690   ;; use outline mode keybindings everywhere
1691   ;; (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'my/mydra-outline/body)
1692
1693   (define-minor-mode my-keys-minor-mode
1694     "A minor mode so that my key settings override annoying major modes."
1695     t " my-keys" 'my-keys-minor-mode-map)
1696
1697   (my-keys-minor-mode 1)
1698   (defun my-minibuffer-setup-hook ()
1699     (my-keys-minor-mode 0))
1700
1701   (add-hook 'minibuffer-setup-hook 'my-minibuffer-setup-hook)
1702   (defadvice load (after give-my-keybindings-priority)
1703     "Try to ensure that my keybindings always have priority."
1704     (if (not (eq (car (car minor-mode-map-alist)) 'my-keys-minor-mode))
1705         (let ((mykeys (assq 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)))
1706           (assq-delete-all 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)
1707           (add-to-list 'minor-mode-map-alist mykeys))))
1708   (ad-activate 'load)
1709 #+END_SRC
1710 ** Goto line
1711 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1712   (global-unset-key "\M-g")
1713   (global-set-key (kbd "M-g l") 'goto-line)
1714 #+END_SRC
1715 * Misc (uncharacterized)
1716 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1717   (setq bibtex-user-optional-fields (quote (("annote" "Personal annotation (ignored)") ("abstract" "") ("pmid" "") ("doi" ""))))
1718   (setq calendar-latitude 40.11)
1719   (setq calendar-longitude -88.24)
1720   (setq case-fold-search t)
1721   (setq confirm-kill-emacs (quote y-or-n-p))
1722   (setq cperl-lazy-help-time nil)
1723   (setq debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
1724   (display-time)
1725   (setq display-time-24hr-format t)
1726   (setq display-time-day-and-date t)
1727   (display-time-mode 1)
1728   (setq font-latex-fontify-script nil)
1729   (setq font-latex-fontify-sectioning (quote color))
1730   (setq font-latex-script-display (quote (nil)))
1731   (global-auto-revert-mode 1)
1732   (global-font-lock-mode 1)
1733   (icomplete-mode 1)
1734   (setq log-edit-keep-buffer t)
1735   (setq mail-user-agent (quote sendmail-user-agent))
1736   (setq markdown-enable-math t)
1737   (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
1738   (setq mutt-alias-file-list (quote ("~/.mutt/aliases" "~/.mail_aliases")))
1739   (setq post-email-address "don@donarmstrong.com")
1740   (setq post-kill-quoted-sig nil)
1741   (setq post-mail-message "mutt\\(ng\\|\\)-[a-z0-9]+-[0-9]+-.*")
1742   (setq post-uses-fill-mode nil)
1743   (setq ps-footer-font-size (quote (8 . 10)))
1744   (setq ps-header-font-size (quote (8 . 10)))
1745   (setq ps-header-title-font-size (quote (10 . 10)))
1746   (setq ps-line-number-color "blue")
1747   (setq ps-print-footer t)
1748   (setq ps-print-footer-frame nil)
1749   (setq ps-print-only-one-header t)
1750   (setq sentence-end "[.?!][]\"')]*\\($\\|   \\| \\)[
1751   ]*")
1752   (setq sentence-end-double-space nil)
1753   ; enable matching parenthesis
1754   (show-paren-mode 1)
1755   (tool-bar-mode -1)
1756   (setq user-mail-address "don@donarmstrong.com")
1757   (setq vc-delete-logbuf-window nil)
1758   (setq vc-follow-symlinks t)
1759
1760   ;; use git before SVN; use CVS earlier, because I have CVS
1761   ;; repositories inside of git directories
1762   (setq vc-handled-backends (quote (CVS Git RCS SVN SCCS Bzr Hg Mtn Arch)))
1763
1764   ;; switch back to the old primary selection method
1765   (setq x-select-enable-clipboard nil)
1766   (setq x-select-enable-primary t)
1767   ; (setq mouse-drag-copy-region t)
1768
1769   (fset 'perl-mode 'cperl-mode)
1770   ;;(load-file "cperl-mode.el")
1771
1772   (require 'vcl-mode)
1773
1774   (require 'tex-site)
1775   ;;(require 'psvn)
1776   ;;(require 'ecasound)
1777   ;;(require 'emacs-wiki)
1778   (require 'bibtex)
1779   (require 'post)
1780   ;;(require 'fixme)
1781   ; (require 'google-weather)
1782   ; (require 'org-google-weather)
1783   ; (setq-default org-google-weather-format "%i %c, [%l,%h] %s %C")
1784
1785   (global-set-key "\C-xp" 'server-edit)
1786
1787   (setq-default auto-mode-alist (cons '("\.wml$" .
1788                     (lambda () (html-mode) (auto-fill-mode)))
1789                   auto-mode-alist))
1790
1791
1792   ; use markdown mode for mdwn files
1793   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.mdwn$" . markdown-mode))
1794   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.md$" . markdown-mode))
1795
1796
1797   ;; tramp configuration
1798   (setq tramp-use-ssh-controlmaster-options nil)
1799
1800   ; mail configuration
1801   (add-to-list 'auto-mode-alist '("muttng-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode))
1802   (add-to-list 'auto-mode-alist '("muttngrc" . muttrc-mode))
1803
1804   (add-to-list 'auto-mode-alist '("mutt-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode))
1805   (add-to-list 'auto-mode-alist '("muttrc" . muttrc-mode))
1806   (defun my-message-mode-settings ()
1807     (font-lock-add-keywords nil
1808                             '(("^[ \t]*>[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1809                                (0 'message-multiply-quoted-text-face))
1810                               ("^[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1811                                (0 'message-double-quoted-text-face))))
1812     (local-set-key (kbd "C-c C-a") 'my-post-attach-file)
1813     )
1814   (add-hook 'message-mode-hook 'my-message-mode-settings)
1815
1816   (defun my-post-attach-file ()
1817     "Prompt for an attachment."
1818     (interactive)
1819     (let ((file (read-file-name "Attach file: " nil nil t nil))
1820           (description (string-read "Description: ")))
1821       (my-header-attach-file file description)))
1822
1823   (symbol-function 'my-post-attach-file)
1824
1825   (defun my-header-attach-file (file description)
1826     "Attach a FILE to the current message (works with Mutt).
1827   Argument DESCRIPTION MIME description."
1828     (interactive "fAttach file: \nsDescription: ")
1829     (when (> (length file) 0)
1830       (save-excursion
1831         (save-match-data
1832           (save-restriction
1833             (widen)
1834             (goto-char (point-min))
1835             (search-forward-regexp "^$")
1836             (insert (concat "Attach: " (replace-regexp-in-string "\\([[:space:]\\]\\)" "\\\\\\1" (file-truename file)) " "
1837                             description "\n"))
1838             (message (concat "Attached '" file "'."))
1839             (setq post-has-attachment t))))))
1840
1841
1842
1843   (setq mail-yank-prefix "> ")
1844
1845   ;; self-insert-command hack.
1846   ;;   Without this, "if<SP>" expands to
1847   ;;   if ( -!-) {
1848   ;;   }
1849   ;;   which really should be,
1850   ;;   if (-!-) {
1851   ;;   }
1852
1853
1854
1855   ;(load-library "php-mode")
1856
1857   (setq-default c-indent-level 4)
1858   (setq-default c-brace-imaginary-offset 0)
1859   (setq-default c-brace-offset -4)
1860   (setq-default c-argdecl-indent 4)
1861   (setq-default c-label-offset -4)
1862   (setq-default c-continued-statement-offset 4)
1863   ; tabs are annoying
1864   (setq-default indent-tabs-mode nil)
1865   (setq-default tab-width 4)
1866
1867
1868   ;; (autoload 'php-mode "php-mode" "PHP editing mode" t)
1869   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php3?\\'" . php-mode))
1870   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.phtml?\\'" . php-mode))
1871   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php?\\'" . php-mode))
1872   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php4?\\'" . php-mode))
1873
1874
1875   (defun insert-date ()
1876     "Insert date at point."
1877     (interactive)
1878     (insert (format-time-string "%A, %B %e, %Y %k:%M:%S %Z")))
1879   (global-set-key "\C-[d" 'insert-date)
1880
1881   (defun unfill-paragraph (arg)
1882     "Pull this whole paragraph up onto one line."
1883     (interactive "*p")
1884     (let ((fill-column 10000))
1885       (fill-paragraph arg))
1886     )
1887
1888   (column-number-mode t)
1889
1890   (server-start)
1891
1892   ; (require 'mode-compile)
1893
1894   (defadvice server-process-filter (after post-mode-message first activate)
1895     "If the buffer is in post mode, overwrite the server-edit
1896       message with a post-save-current-buffer-and-exit message."
1897     (if (eq major-mode 'post-mode)
1898         (message
1899          (substitute-command-keys "Type \\[describe-mode] for help composing; \\[post-save-current-buffer-and-exit] when done."))))
1900                       ; This is also needed to see the magic message.  Set to a higher
1901                       ; number if you have a faster computer or read slower than me.
1902   '(font-lock-verbose 1000)
1903   ;(setq-default server-temp-file-regexp "mutt\(-\|ng-\)")
1904   ; (add-hook 'server-switch-hook
1905   ;     (function (lambda()
1906   ;             (cond ((string-match "Post" mode-name)
1907   ;                (post-goto-body)))
1908   ;             set-buffer-file-coding-system 'utf-8
1909   ;             )))
1910   ;
1911
1912   (add-hook 'post-mode-hook
1913         (auto-fill-mode nil)
1914         )
1915   ; abbrev mode settings
1916   ; load abbreviations from
1917   (setq abbrev-file-name
1918         "~/.emacs_abbrev_def")
1919
1920   ; read the abbrev file if it exists
1921   (if (file-exists-p abbrev-file-name)
1922       (quietly-read-abbrev-file))
1923
1924   ; for now, use abbrev mode everywhere
1925   (setq default-abbrev-mode t)
1926
1927
1928   (defun insert-function-documentation ()
1929     "Insert function documentation"
1930     (interactive)
1931     (insert-file-contents "/home/don/lib/templates/perl_function_documentation" nil))
1932   (global-set-key "\M-f" 'insert-function-documentation)
1933
1934   (eval-after-load "lilypond-mode"
1935     '(progn
1936        (load-library "lyqi-mode")
1937        (define-key LilyPond-mode-map "\C-cq" 'lyqi-mode)))
1938
1939   (autoload 'spamassassin-mode "spamassassin-mode" nil t)
1940
1941   (desktop-load-default)
1942   (desktop-read)
1943   '(icomplete-mode on)
1944   (custom-set-faces
1945    ;; custom-set-faces was added by Custom.
1946    ;; If you edit it by hand, you could mess it up, so be careful.
1947    ;; Your init file should contain only one such instance.
1948    ;; If there is more than one, they won't work right.
1949    '(menu ((((type x-toolkit)) (:background "black" :foreground "grey90")))))
1950
1951
1952   (put 'upcase-region 'disabled nil)
1953   (put 'downcase-region 'disabled nil)
1954   (put 'narrow-to-region 'disabled nil)
1955
1956   ; (defun turn-on-flyspell ()
1957   ;    "Force flyspell-mode on using a positive arg.  For use in hooks."
1958   ;    (interactive)
1959   ;    (flyspell-mode 1))
1960
1961
1962    ; Outline-minor-mode key map
1963    (define-prefix-command 'cm-map nil "Outline-")
1964    ; HIDE
1965    (define-key cm-map "q" 'hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
1966    (define-key cm-map "t" 'hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
1967    (define-key cm-map "o" 'hide-other)        ; Hide other branches
1968    (define-key cm-map "c" 'hide-entry)        ; Hide this entry's body
1969    (define-key cm-map "l" 'hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
1970    (define-key cm-map "d" 'hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
1971    ; SHOW
1972    (define-key cm-map "a" 'show-all)          ; Show (expand) everything
1973    (define-key cm-map "e" 'show-entry)        ; Show this heading's body
1974    (define-key cm-map "i" 'show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
1975    (define-key cm-map "k" 'show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
1976    (define-key cm-map "s" 'show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
1977    ; MOVE
1978    (define-key cm-map "u" 'outline-up-heading)                ; Up
1979    (define-key cm-map "n" 'outline-next-visible-heading)      ; Next
1980    (define-key cm-map "p" 'outline-previous-visible-heading)  ; Previous
1981    (define-key cm-map "f" 'outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
1982    (define-key cm-map "b" 'outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
1983    (global-set-key "\M-o" cm-map)
1984
1985
1986   ; debian stuff
1987   (setq-default debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
1988   (setq-default debian-changelog-full-name "Don Armstrong")
1989
1990   ; ediff configuration
1991   ; don't use the multi-window configuration
1992   (setq ediff-window-setup-function 'ediff-setup-windows-plain)
1993
1994   ; fix up css mode to not be silly
1995   ; from http://www.stokebloke.com/wordpress/2008/03/21/css-mode-indent-buffer-fix/
1996   (setq cssm-indent-level 4)
1997   (setq cssm-newline-before-closing-bracket t)
1998   (setq cssm-indent-function #'cssm-c-style-indenter)
1999   (setq cssm-mirror-mode nil)
2000
2001   (require 'multi-web-mode)
2002   (setq mweb-default-major-mode 'html-mode)
2003   (setq mweb-tags '((php-mode "<\\?php\\|<\\? \\|<\\?=" "\\?>")
2004                     (js-mode "<script +\\(type=\"text/javascript\"\\|language=\"javascript\"\\)[^>]*>" "</script>")
2005                     (css-mode "<style +type=\"text/css\"[^>]*>" "</style>")))
2006   (setq mweb-filename-extensions '("php" "htm" "html" "ctp" "phtml" "php4" "php5"))
2007   (multi-web-global-mode 1)
2008
2009   ;;; alias the new `flymake-report-status-slim' to
2010   ;;; `flymake-report-status'
2011   (defalias 'flymake-report-status 'flymake-report-status-slim)
2012   (defun flymake-report-status-slim (e-w &optional status)
2013     "Show \"slim\" flymake status in mode line."
2014     (when e-w
2015       (setq flymake-mode-line-e-w e-w))
2016     (when status
2017       (setq flymake-mode-line-status status))
2018     (let* ((mode-line " Φ"))
2019       (when (> (length flymake-mode-line-e-w) 0)
2020         (setq mode-line (concat mode-line ":" flymake-mode-line-e-w)))
2021       (setq mode-line (concat mode-line flymake-mode-line-status))
2022       (setq flymake-mode-line mode-line)
2023       (force-mode-line-update)))
2024
2025   ; load sql-indent when sql is loaded
2026   (eval-after-load "sql"
2027     '(load-library "sql-indent"))
2028
2029   ; fix up tmux xterm keys
2030   ; stolen from http://unix.stackexchange.com/questions/24414/shift-arrow-not-working-in-emacs-within-tmux
2031   (defun fix-up-tmux-keys ()
2032       "Fix up tmux xterm keys"
2033       (if (getenv "TMUX")
2034           (progn
2035             (let ((x 2) (tkey ""))
2036               (while (<= x 8)
2037                 ;; shift
2038                 (if (= x 2)
2039                     (setq tkey "S-"))
2040                 ;; alt
2041                 (if (= x 3)
2042                     (setq tkey "M-"))
2043                 ;; alt + shift
2044                 (if (= x 4)
2045                     (setq tkey "M-S-"))
2046                 ;; ctrl
2047                 (if (= x 5)
2048                     (setq tkey "C-"))
2049                 ;; ctrl + shift
2050                 (if (= x 6)
2051                     (setq tkey "C-S-"))
2052                 ;; ctrl + alt
2053                 (if (= x 7)
2054                     (setq tkey "C-M-"))
2055                 ;; ctrl + alt + shift
2056                 (if (= x 8)
2057                     (setq tkey "C-M-S-"))
2058
2059                 ;; arrows
2060                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d A" x)) (kbd (format "%s<up>" tkey)))
2061                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d B" x)) (kbd (format "%s<down>" tkey)))
2062                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d C" x)) (kbd (format "%s<right>" tkey)))
2063                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d D" x)) (kbd (format "%s<left>" tkey)))
2064                 ;; home
2065                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d H" x)) (kbd (format "%s<home>" tkey)))
2066                 ;; end
2067                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d F" x)) (kbd (format "%s<end>" tkey)))
2068                 ;; page up
2069                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 5 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<prior>" tkey)))
2070                 ;; page down
2071                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 6 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<next>" tkey)))
2072                 ;; insert
2073                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 2 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2074                 ;; delete
2075                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 3 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2076                 ;; f1
2077                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d P" x)) (kbd (format "%s<f1>" tkey)))
2078                 ;; f2
2079                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d Q" x)) (kbd (format "%s<f2>" tkey)))
2080                 ;; f3
2081                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d R" x)) (kbd (format "%s<f3>" tkey)))
2082                 ;; f4
2083                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d S" x)) (kbd (format "%s<f4>" tkey)))
2084                 ;; f5
2085                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 15 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f5>" tkey)))
2086                 ;; f6
2087                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 17 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f6>" tkey)))
2088                 ;; f7
2089                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 18 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f7>" tkey)))
2090                 ;; f8
2091                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 19 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f8>" tkey)))
2092                 ;; f9
2093                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 20 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f9>" tkey)))
2094                 ;; f10
2095                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 21 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f10>" tkey)))
2096                 ;; f11
2097                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 23 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f11>" tkey)))
2098                 ;; f12
2099                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 24 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f12>" tkey)))
2100                 ;; f13
2101                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 25 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f13>" tkey)))
2102                 ;; f14
2103                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 26 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f14>" tkey)))
2104                 ;; f15
2105                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 28 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f15>" tkey)))
2106                 ;; f16
2107                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 29 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f16>" tkey)))
2108                 ;; f17
2109                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 31 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f17>" tkey)))
2110                 ;; f18
2111                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 32 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f18>" tkey)))
2112                 ;; f19
2113                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 33 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f19>" tkey)))
2114                 ;; f20
2115                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 34 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f20>" tkey)))
2116
2117                 (setq x (+ x 1))
2118                 ))
2119             )
2120         )
2121       )
2122   ; (add-hook 'tty-setup-hook 'fix-up-tmux-keys)
2123
2124   ; procmailmode configuration
2125   (load "procmail_mode")
2126
2127   (load "mode-line-cleaner")
2128
2129   (defadvice ask-user-about-supersession-threat (around ask-user-about-supersession-threat-if-necessary)
2130     "Call ask-user-about-supersession-threat only if the buffer is actually obsolete."
2131     (if (or (buffer-modified-p)
2132             (verify-visited-file-modtime)
2133             (< (* 8 1024 1024) (buffer-size))
2134             (/= 0 (call-process-region 1 (+ 1 (buffer-size)) "diff" nil nil nil "-q" (buffer-file-name) "-")))
2135         ad-do-it
2136       (clear-visited-file-modtime)
2137       (not-modified)))
2138   (ad-activate 'ask-user-about-supersession-threat)
2139
2140   ; apparently things like to step on C-;, so we'll use a hack from
2141   ; http://stackoverflow.com/questions/683425/globally-override-key-binding-in-emacs/5340797#5340797 to fix this
2142
2143   (defvar my-keys-minor-mode-map (make-keymap) "my-keys-minor-mode keymap.")
2144
2145   ; use iedit everywhere
2146   (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'mc/mark-all-dwim)
2147
2148   (define-minor-mode my-keys-minor-mode
2149     "A minor mode so that my key settings override annoying major modes."
2150     t " my-keys" 'my-keys-minor-mode-map)
2151
2152   (my-keys-minor-mode 1)
2153   (defun my-minibuffer-setup-hook ()
2154     (my-keys-minor-mode 0))
2155
2156   (add-hook 'minibuffer-setup-hook 'my-minibuffer-setup-hook)
2157   (defadvice load (after give-my-keybindings-priority)
2158     "Try to ensure that my keybindings always have priority."
2159     (if (not (eq (car (car minor-mode-map-alist)) 'my-keys-minor-mode))
2160         (let ((mykeys (assq 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)))
2161           (assq-delete-all 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)
2162           (add-to-list 'minor-mode-map-alist mykeys))))
2163   (ad-activate 'load)
2164   (global-set-key "\M- " 'hippie-expand)
2165
2166 #+END_SRC
2167
2168 * END
2169 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2170   (provide 'don-configuration)
2171 #+END_SRC