]> git.donarmstrong.com Git - lib.git/blob - emacs_el/configuration/don-configuration.org
rework org-mode keybindings and move outline mode to its own section
[lib.git] / emacs_el / configuration / don-configuration.org
1 #+PROPERTY: header-args:emacs-lisp :tangle don-configuration.el
2 * Load debugger
3
4 # if for some reason, things get pear-shaped, we want to be able to
5 # enter the debugger by sending -USR2 to emacs
6
7 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
8 (setq debug-on-event 'siguser2)
9 #+END_SRC
10 * Initial startup stuff
11 ** Disable startup screen
12 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
13   (setq inhibit-startup-screen t)
14 #+END_SRC
15 ** Disable cluter
16 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
17   ; (if (fboundp 'menu-bar-mode) (menu-bar-mode -1))
18   (if (fboundp 'tool-bar-mode) (tool-bar-mode -1))
19   (if (fboundp 'scroll-bar-mode) (scroll-bar-mode -1))
20 #+END_SRC
21 ** Fullscreen
22 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
23   (setq frame-resize-pixelwise t)
24   (add-to-list 'default-frame-alist '(fullscreen . maximixed))
25 #+END_SRC
26 * Package management
27 ** package repositories and package manager
28 Borrowed from https://github.com/nilcons/emacs-use-package-fast/ to
29 load  [[https://github.com/jwiegley/use-package/][use-package]] even faster
30 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
31   (setq package-enable-at-startup nil)
32   (setq package--init-file-ensured t)
33   (setq package-archives '(("gnu" . "https://elpa.gnu.org/packages/")
34                            ("melpa" . "https://melpa.org/packages/")
35                            ("org" . "http://orgmode.org/elpa/") ))
36   (eval-and-compile
37     (setq use-package-verbose (not (bound-and-true-p byte-compile-current-file))))
38   (mapc #'(lambda (add) (add-to-list 'load-path add))
39     (eval-when-compile
40       (package-initialize)
41       (unless (package-installed-p 'use-package)
42         (package-refresh-contents)
43         (package-install 'use-package))
44       (let ((package-user-dir-real (file-truename package-user-dir)))
45         ;; The reverse is necessary, because outside we mapc
46         ;; add-to-list element-by-element, which reverses.
47         (nreverse (apply #'nconc
48                  ;; Only keep package.el provided loadpaths.
49                  (mapcar #'(lambda (path)
50                      (if (string-prefix-p package-user-dir-real path)
51                          (list path)
52                        nil))
53                      load-path))))))
54
55   (require 'use-package)
56   (require 'diminish)
57   (require 'bind-key)
58 #+END_SRC
59 ** Paradox
60 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
61   (use-package paradox
62     :ensure paradox
63     :commands (paradox-upgrade-packages paradox-list-packages)
64     :config (setq paradox-execute-asynchronously t)
65     )
66 #+END_SRC
67 * Add library paths
68
69 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
70   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/")
71   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/magit-annex")
72 #+END_SRC
73 * Disable custom-vars
74 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
75   ;; Set the custom file to /dev/null and don't bother to load it
76   (setq custom-file "/dev/null")
77 #+END_SRC
78 * Misc functions
79 ** with-library
80 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
81 ;; From http://www.emacswiki.org/emacs/LoadingLispFiles
82 ;; execute conditional code when loading libraries
83 (defmacro with-library (symbol &rest body)
84   `(when (require ,symbol nil t)
85      ,@body))
86 (put 'with-library 'lisp-indent-function 1)
87 #+END_SRC
88
89 * Variables
90 ** Safe Local Variables
91 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
92   (setq safe-local-variable-values 
93         (quote ((auto-save-default)
94                 (make-backup-files)
95                 (cperl-indent-level . 4)
96                 (indent-level . 4)
97                 (indent-tabs-mode . f)
98                 )))
99 #+END_SRC
100 * Memory
101 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
102   (setq global-mark-ring-max 128
103         mark-ring-max 128
104         kill-ring-max 128)
105
106   (defun don/minibuffer-setup-hook ()
107     (setq gc-cons-threshold most-positive-fixnum))
108
109   (defun don/minibuffer-exit-hook ()
110     (setq gc-cons-threshold 1048576))
111
112   (add-hook 'minibuffer-setup-hook #'don/minibuffer-setup-hook)
113   (add-hook 'minibuffer-exit-hook #'don/minibuffer-exit-hook)
114 #+END_SRC
115 * Modules
116 ** Hippie Expand
117 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
118   (use-package hippie-expand
119     :bind* (("M-<SPC>" . hippie-expand))
120     )
121 #+END_SRC
122 ** Flyspell 🐝 
123 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
124   (use-package flyspell
125     :ensure t
126     :diminish flyspell-mode 🐝
127     :config
128     (add-hook 'text-mode-hook 'turn-on-flyspell)
129     (add-hook 'c-mode-common-hook 'flyspell-prog-mode)
130     (add-hook 'cperl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
131     (add-hook 'tcl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
132     :init
133     (setq ispell-program-name "ispell")
134     )
135
136 #+END_SRC
137 ** Flymake
138 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
139   (use-package flymake
140     :diminish "Φ")
141 #+end_src
142
143 ** Winnermode
144 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
145   (winner-mode 1)
146 #+END_SRC
147 ** Eyebrowse
148
149 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
150   (use-package eyebrowse
151     :ensure t
152     :diminish eyebrowse-mode
153     :init (setq eyebrowse-keymap-prefix (kbd "C-c e"))
154     :config (progn
155               (setq eyebrowse-wrap-around t)
156               (eyebrowse-mode t)
157
158               (defun my/eyebrowse-new-window-config ()
159                 (interactive)
160                 (let ((done nil))
161                   (dotimes (i 10)
162                     ;; start at 1 run till 0
163                     (let ((j (mod (+ i 1) 10)))
164                       (when (and (not done)
165                                  (not (eyebrowse--window-config-present-p j)))
166                         (eyebrowse-switch-to-window-config j)
167                         (call-interactively 'eyebrowse-rename-window-config2 j)
168                         (setq done t)
169                         ))
170                     )))
171
172               ;; I don't use latex-preview-pane
173               ;; (require 'latex-preview-pane)
174               ;; (defun my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch ()
175               ;;   ;; latex-preview-pane uses window-parameters which are
176               ;;   ;; not preserved by eyebrowse, so we close the preview
177               ;;   ;; pane before switching, it will be regenerated when we
178               ;;   ;; edit the TeX file.
179               ;;   (when (lpp/window-containing-preview)
180               ;;     (delete-window (lpp/window-containing-preview))))
181
182               ;; (add-to-list 'eyebrowse-pre-window-switch-hook
183               ;;              #'my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch)
184
185               ;; (my/set-menu-key "["  #'my/eyebrowse-new-window-config)
186               ;; (my/set-menu-key ";"  #'eyebrowse-prev-window-config)
187               ;; (my/set-menu-key "'"  #'eyebrowse-next-window-config)
188               ;; (my/set-menu-key "]"  #'eyebrowse-close-window-config)
189               ;; (my/set-menu-key "\\" #'eyebrowse-rename-window-config)
190               )
191     )
192 #+END_SRC
193
194 ** Window handling
195
196 *** Splitting
197 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
198   (defun my/vsplit-last-buffer ()
199     "Split the window vertically and display the previous buffer."
200     (interactive)
201     (split-window-vertically)
202     (other-window 1 nil)
203     (switch-to-next-buffer))
204
205   (defun my/hsplit-last-buffer ()
206     "Split the window horizontally and display the previous buffer."
207     (interactive)
208     (split-window-horizontally)
209     (other-window 1 nil)
210     (switch-to-next-buffer))
211
212   (bind-key "C-x 2" 'my/vsplit-last-buffer)
213   (bind-key "C-x 3" 'my/hsplit-last-buffer)
214
215   (setq split-width-threshold  100)
216   (setq split-height-threshold 60)
217
218   (defun my/split-window-prefer-vertically (window)
219     "If there's only one window (excluding any possibly active
220            minibuffer), then split the current window horizontally."
221     (if (and (one-window-p t)
222              (not (active-minibuffer-window))
223              ( < (frame-width) (frame-height))
224              )
225         (let ((split-width-threshold nil))
226           (split-window-sensibly window))
227       (split-window-sensibly window)))
228
229   (setq split-window-preferred-function #'my/split-window-prefer-vertically)
230   (setq window-combination-resize t)
231 #+END_SRC
232
233 *** Compilation window
234
235 If there is no compilation window, open one at the bottom, spanning
236 the complete width of the frame. Otherwise, reuse existing window. In
237 the former case, if there was no error the window closes
238 automatically.
239
240 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
241   (add-to-list 'display-buffer-alist
242                `(,(rx bos "*compilation*" eos)
243                  (display-buffer-reuse-window
244                   display-buffer-in-side-window)
245                  (reusable-frames . visible)
246                  (side            . bottom)
247                  (window-height   . 0.4)))
248 #+END_SRC
249
250 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
251   (defun my/compilation-exit-autoclose (status code msg)
252     ;; If M-x compile exists with a 0
253     (when (and (eq status 'exit) (zerop code))
254       ;; and delete the *compilation* window
255       (let ((compilation-window (get-buffer-window (get-buffer "*compilation*"))))
256         (when (and (not (window-at-side-p compilation-window 'top))
257                    (window-at-side-p compilation-window 'left)
258                    (window-at-side-p compilation-window 'right))
259           (delete-window compilation-window))))
260     ;; Always return the anticipated result of compilation-exit-message-function
261     (cons msg code))
262
263   ;; Specify my function (maybe I should have done a lambda function)
264   (setq compilation-exit-message-function #'my/compilation-exit-autoclose)
265 #+END_SRC
266
267 If you change the variable ~compilation-scroll-output~ to a ~non-nil~
268 value, the compilation buffer scrolls automatically to follow the
269 output. If the value is ~first-error~, scrolling stops when the first
270 error appears, leaving point at that error. For any other non-nil
271 value, scrolling continues until there is no more output.
272
273 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
274   (setq compilation-scroll-output 'first-error)
275 #+END_SRC
276
277 ** Mode line cleaning
278 *** Diminish
279 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
280   (use-package diminish
281     :ensure t)
282 #+END_SRC
283
284 *** Delight 
285 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
286   (use-package delight
287     :ensure t)
288 #+END_SRC
289
290 ** Jumping
291 *** Avy
292 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
293   (use-package avy
294     :ensure t
295     :bind (("C-c C-<SPC>" . avy-goto-word-or-subword-1)
296            ("C-c j j" . avy-goto-word-or-subword-1)
297            ("M-g g" . avy-goto-line))
298     :config (progn (setq avy-background t))
299     )
300 #+END_SRC
301 *** Ace-link (jumping to links)
302 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
303   (use-package ace-link
304     :ensure t
305     ; bind o in most modes
306     :config (ace-link-setup-default))
307 #+END_SRC
308 *** Jumping through edit points (goto-chg)
309 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
310   (use-package goto-chg
311     :ensure t
312     :bind (("C-c j ," . goto-last-change)
313            ("C-c j ." . goto-last-change-reverse))
314     )
315 #+END_SRC
316 *** Jumping to bookmarks (visible bookmarks, bm)
317 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
318   (use-package bm
319     :ensure t
320     :bind (("C-c j b ." . bm-next)
321            ("C-c j b ," . bm-previous)
322            ("C-c j b SPC" . bm-toggle)))
323 #+END_SRC
324
325 ** Snippets
326 *** Yasnippet
327 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
328   (use-package yasnippet
329     :ensure t
330     :diminish yas-minor-mode
331     :config (progn
332               (yas-global-mode)
333               (setq yas-verbosity 1)
334               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<tab>") nil)
335               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "TAB") nil)
336               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<backtab>") 'yas-expand)
337               (setq yas-snippet-dirs '("~/lib/emacs_el/snippets/"
338                                        "~/lib/emacs_el/yasnippet-snippets/snippets/"))
339               (add-to-list 'hippie-expand-try-functions-list
340                                'yas-hippie-try-expand)
341               )
342     )
343 #+END_SRC
344 *** Auto-YASnippet
345 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
346   (use-package auto-yasnippet
347     :bind (("H-w" . aya-create)
348            ("H-y" . aya-expand)
349            )
350     )
351 #+END_SRC
352 ** Tinyprocmail
353
354 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
355   ;; load tinyprocmail
356   (use-package tinyprocmail
357     :load-path "~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/tiny"
358     :mode (".procmailrc" . turn-on-tinyprocmail-mode)
359     )
360 #+END_SRC
361
362 ** Magit
363 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
364   (use-package magit
365     :ensure t
366     :bind (("C-x g" . magit-status)
367            ("C-x C-g" . magit-status))
368     :config
369     ;; refine diffs always (hilight words)
370     (setq magit-diff-refine-hunk nil)
371     )
372   (use-package magit-annex
373     :ensure t
374     :load-path "~/lib/emacs_el/magit-annex/"
375     )
376   (use-package magit-vcsh
377     :ensure f ; currently not in melpa, so don't try to install
378     :load-path "~/lib/emacs_el/magit-vcsh/"
379     )
380 #+END_SRC
381
382 ** Perl
383 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
384   (use-package cperl-mode
385     :config
386     (progn
387       ;; Use c-mode for perl .xs files
388       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.xs\\'" . c-mode))
389       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\([pP][Llm]\\|al\\)\\'" . cperl-mode))
390       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl" . cperl-mode))
391       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl5" . cperl-mode))
392       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("miniperl" . cperl-mode))
393       (setq cperl-hairy t
394             cperl-indent-level 4
395             cperl-auto-newline nil
396             cperl-auto-newline-after-colon nil
397             cperl-continued-statement-offset 4
398             cperl-brace-offset -1
399             cperl-continued-brace-offset 0
400             cperl-label-offset -4
401             cperl-highlight-variables-indiscriminately t
402             cperl-electric-lbrace-space nil
403             cperl-indent-parens-as-block nil
404             cperl-close-paren-offset -1
405             cperl-tab-always-indent t)
406       ;;(add-hook 'cperl-mode-hook (lambda () (cperl-set-style "PerlStyle")))
407   ))
408 #+END_SRC
409
410 ** Markdown mode
411 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
412   (use-package markdown-mode
413     :ensure t
414     :mode (("\\.md\\'" . markdown-mode)
415            ("\\.mdwn\\'" . markdown-mode)
416            ("README\\.md\\'" . gfm-mode)
417            )
418     :config
419     (setq markdown-enable-math t)
420     (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
421     (bind-key "M-." #'markdown-jump markdown-mode-map)
422     (add-hook 'markdown-mode-hook #'flyspell-mode)
423     (add-hook 'markdown-mode-hook #'outline-minor-mode)
424     (bind-key "C-<tab>" #'outline-cycle markdown-mode-map)
425   )
426
427 #+END_SRC
428 ** SQL mode
429 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
430   ; load sql-indent when sql is loaded
431 (use-package sql
432   :mode (("\\.sql\\'" . sql-mode))
433   :config
434   (require sql-indent))
435 #+END_SRC
436 ** Ediff
437 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
438   (use-package ediff
439     :commands ediff ediff3
440     :ensure f
441     :config
442     ;; ediff configuration
443     ;; don't use the multi-window configuration
444     (setq ediff-window-setup-function 'ediff-setup-windows-plain)
445   )
446 #+END_SRC
447 ** VCL --editing varnish configuration files
448 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
449   (use-package vcl-mode
450     :ensure t
451     :mode "\\.vcl\\'"
452     )
453   
454 #+END_SRC
455 ** Helm
456 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
457   (defun malb/helm-omni (&rest arg)
458     ;; just in case someone decides to pass an argument, helm-omni won't fail.
459     (interactive)
460     (unless helm-source-buffers-list
461       (setq helm-source-buffers-list
462             (helm-make-source "Buffers" 'helm-source-buffers)))
463     (helm-other-buffer
464      (append
465
466      (if (projectile-project-p)
467           '(helm-source-projectile-buffers-list
468             helm-source-buffers-list)
469         '(helm-source-buffers-list)) ;; list of all open buffers
470
471       `(((name . "Virtual Workspace")
472          (candidates . ,(--map (cons (eyebrowse-format-slot it) (car it))
473                                (eyebrowse--get 'window-configs)))
474          (action . (lambda (candidate)
475                      (eyebrowse-switch-to-window-config candidate)))))
476
477       (if (projectile-project-p)
478           '(helm-source-projectile-recentf-list
479             helm-source-recentf)
480         '(helm-source-recentf)) ;; all recent files
481
482       ;; always make some common files easily accessible
483       ;;'(((name . "Common Files")
484        ;;  (candidates . malb/common-file-targets)
485         ;; (action . (("Open" . (lambda (x) (find-file (eval x))))))))
486
487       '(helm-source-files-in-current-dir
488         helm-source-locate
489         helm-source-bookmarks
490         helm-source-buffer-not-found ;; ask to create a buffer otherwise
491         ))
492      "*Helm all the things*"))
493   (use-package helm
494     :ensure helm
495     :diminish helm-mode
496     :bind (("M-x" . helm-M-x)
497            ("C-x C-f" . helm-find-files)
498            ("C-x b" . helm-buffers-list) ; malb/helm-omni)
499            ("C-x C-b" . helm-buffers-list) ; malb/helm-omni)
500            ("C-c <SPC>" . helm-all-mark-rings))
501     :config
502     (require 'helm-config)
503     (require 'helm-for-files)
504     (require 'helm-bookmark)
505
506     (helm-mode 1)
507     (define-key global-map [remap find-file] 'helm-find-files)
508     (define-key global-map [remap occur] 'helm-occur)
509     (define-key global-map [remap list-buffers] 'helm-buffers-list)
510     (define-key global-map [remap dabbrev-expand] 'helm-dabbrev)
511     (unless (boundp 'completion-in-region-function)
512       (define-key lisp-interaction-mode-map [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point)
513       (define-key emacs-lisp-mode-map       [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point))
514     (add-hook 'kill-emacs-hook #'(lambda () (and (file-exists-p "$TMP") (delete-file "$TMP"))))
515   )
516 #+END_SRC
517 *** Helm Flx
518
519  [[https://github.com/PythonNut/helm-flx][helm-flx]] implements intelligent helm fuzzy sorting, provided by [[https://github.com/lewang/flx][flx]].
520
521  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
522  (use-package helm-flx
523    :ensure t
524    :config (progn
525              ;; these are helm configs, but they kind of fit here nicely
526              (setq helm-M-x-fuzzy-match                  t
527                    helm-bookmark-show-location           t
528                    helm-buffers-fuzzy-matching           t
529                    helm-completion-in-region-fuzzy-match t
530                    helm-file-cache-fuzzy-match           t
531                    helm-imenu-fuzzy-match                t
532                    helm-mode-fuzzy-match                 t
533                    helm-locate-fuzzy-match               nil
534                    helm-quick-update                     t
535                    helm-recentf-fuzzy-match              nil
536                    helm-semantic-fuzzy-match             t)
537              (helm-flx-mode +1)))
538  #+END_SRC
539 *** Helm Swoop
540 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
541
542   ;;; stolen from https://github.com/malb/emacs.d/blob/master/malb.org
543   (defun malb/helm-swoop-pre-fill ()
544     (thing-at-point 'symbol))
545     (defvar malb/helm-swoop-ignore-major-mode "List of major modes to ignore for helm-swoop")
546     (setq malb/helm-swoop-ignore-major-mode '(dired-mode
547           paradox-menu-mode doc-view-mode pdf-view-mode
548           mu4e-headers-mode org-mode markdown-mode latex-mode
549           ein:notebook-multilang-mode))
550
551     (defun malb/swoop-or-search ()
552       (interactive)
553       (if (or (> (buffer-size) 1048576) ;; helm-swoop can be slow on big buffers
554               (memq major-mode malb/helm-swoop-ignore-major-mode))
555           (isearch-forward)
556         (helm-swoop)))
557
558     (use-package helm-swoop
559       :ensure t
560       :commands helm-swoop
561       :bind (("C-c o" . helm-multi-swoop-org)
562              ("C-s" . malb/swoop-or-search)
563              ("C-M-s" . helm-multi-swoop-all))
564       :config (progn
565
566                 (setq helm-swoop-pre-input-function  #'malb/helm-swoop-pre-fill
567                       helm-swoop-split-with-multiple-windows nil
568                       helm-swoop-split-direction #'split-window-horizontally
569                       helm-swoop-split-window-function 'helm-default-display-buffer
570                       helm-swoop-speed-or-color t)
571
572                 ;; https://emacs.stackexchange.com/questions/28790/helm-swoop-how-to-make-it-behave-more-like-isearch
573                 (defun malb/helm-swoop-C-s ()
574                   (interactive)
575                   (if (boundp 'helm-swoop-pattern)
576                       (if (equal helm-swoop-pattern "")
577                           (previous-history-element 1)
578                         (helm-next-line))
579                     (helm-next-line)))
580
581                 (bind-key "C-S-s" #'helm-swoop-from-isearch isearch-mode-map)
582                 (bind-key "C-S-s" #'helm-multi-swoop-all-from-helm-swoop helm-swoop-map)
583                 (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-swoop-map)
584                 (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-swoop-map)
585                 (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-multi-swoop-map)
586                 (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-multi-swoop-map))
587       )
588
589 #+END_SRC
590 *** Helm Ag
591 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
592 (use-package helm-ag
593   :ensure t
594   :config (setq helm-ag-base-command "ag --nocolor --nogroup"
595                 helm-ag-command-option "--all-text"
596                 helm-ag-insert-at-point 'symbol
597                 helm-ag-fuzzy-match t
598                 helm-ag-use-temp-buffer t
599                 helm-ag-use-grep-ignore-list t
600                 helm-ag-use-agignore t))
601 #+END_SRC
602 *** Helm Descbinds
603 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
604   (use-package helm-descbinds
605     :ensure t
606     :bind ("C-h b" . helm-descbinds)
607     :init (fset 'describe-bindings 'helm-descbinds))
608 #+END_SRC
609
610 *** Helm YaSnippet
611 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
612   (use-package helm-c-yasnippet
613     :ensure t
614     :bind ("C-c h y" .  helm-yas-complete)
615     :config (progn
616               (setq helm-yas-space-match-any-greedy t)))
617 #+END_SRC
618 *** Helm Org Rifle
619 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
620   (use-package helm-org-rifle
621     :ensure t
622     :config (progn
623               (defun malb/helm-org-rifle-agenda-files (arg)
624                 (interactive "p")
625                 (let ((current-prefix-arg nil))
626                   (cond
627                    ((equal arg 4) (call-interactively #'helm-org-rifle-agenda-files nil))
628                    ((equal arg 16) (helm-org-rifle-occur-agenda-files))
629                    (t (helm-org-agenda-files-headings)))))))
630 #+END_SRC
631 *** Helm Google
632 This can be used to link things pretty quickly if necessary
633 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
634   (use-package helm-google
635     :ensure t
636     :bind ("C-c h g" . helm-google)
637     :config
638     (progn (add-to-list 'helm-google-actions
639                         '("Copy URL" . (lambda (candidate)
640                                          (let ((url
641                                                 (replace-regexp-in-string
642                                                  "https://.*q=\\(.*\\)\&sa=.*"
643                                                  "\\1" candidate)))
644                                            (kill-new url))))
645                         t
646                         )
647          
648            (add-to-list 'helm-google-actions
649                         '("Org Store Link" . (lambda (candidate)
650                                                (let ((title (car (split-string candidate "[\n]+")))
651                                                      (url
652                                                       (replace-regexp-in-string
653                                                        "https://.*q=\\(.*\\)\&sa=.*"
654                                                        "\\1" candidate)))
655                                                  (push (list url title) org-stored-links))))
656                         t)
657            ))
658 #+END_SRC
659
660 ** Projectile -- Project management
661 #+begin_src emacs-lisp
662   (use-package projectile
663     :ensure t
664     :bind (("<f5>" . projectile-compile-project)
665            ("<f6>" . next-error))
666     :config (progn
667               (use-package magit :ensure t)
668               (require 'helm-projectile)
669               (helm-projectile-on)
670
671               (setq projectile-make-test-cmd "make check"
672                     projectile-switch-project-action 'helm-projectile
673                     projectile-mode-line  '(:eval (format "»{%s}" (projectile-project-name))))
674
675               (projectile-global-mode)))
676 #+end_src
677
678 *** helm integration
679 #+begin_src emacs-lisp
680   (use-package helm-projectile
681     :ensure t
682     :config (progn
683               (defvar malb/helm-source-file-not-found
684                 (helm-build-dummy-source
685                     "Create file"
686                   :action 'find-file))
687
688               (add-to-list
689                'helm-projectile-sources-list
690                malb/helm-source-file-not-found t)
691
692               (helm-delete-action-from-source
693                "Grep in projects `C-s'"
694                helm-source-projectile-projects)
695
696               (helm-add-action-to-source
697                "Grep in projects `C-s'"
698                'helm-do-ag helm-source-projectile-projects 4)))
699 #+end_src
700 ** Zap to char
701 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
702   (use-package avy-zap
703     :ensure t
704     :bind ("M-z" . avy-zap-up-to-char-dwim))
705 #+END_SRC
706 ** Hydra
707 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
708   (use-package hydra
709     :bind (("C-c 2" . my/hydra-orgmodes/body)
710            ("C-c @" . my/hydra-orgmodes/body)
711            ("C-c #" . my/hydra-outline/body)
712            ("C-c 3" . my/hydra-outline/body)
713            )
714     :config
715     (defhydra my/hydra-orgmodes (:color blue :hint nil)
716     "
717   _n_: notes _c_: chaim _w_: wildman _o_: ool
718   _u_: uddin _s_: steve _r_: refile  _f_: fh    
719   _p_: read papers      _R_: paper notes
720   _h_: hpcbio
721   _q_: quit
722   _z_: quit
723   "
724     ("n" (find-file "~/projects/org-notes/notes.org"))
725     ("c" (find-file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
726     ("w" (find-file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
727     ("u" (find-file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
728     ("o" (find-file "~/projects/org-notes/ool.org"))
729     ("f" (find-file "~/projects/org-notes/fh.org"))
730     ("s" (find-file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
731     ("r" (find-file "~/projects/org-notes/refile.org"))
732     ("p" (find-file "~/projects/research/papers_to_read.org"))
733     ("R" (find-file "~/projects/research/paper_notes.org"))
734     ("h" (find-file "~/projects/org-notes/hpcbio.org"))
735     ("q" nil "quit")
736     ("z" nil "quit")
737     )
738
739     ;; from https://github.com/abo-abo/hydra/wiki/Emacs
740     (defhydra my/hydra-outline (:color pink :hint nil)
741     "
742   ^Hide^             ^Show^           ^Move
743   ^^^^^^------------------------------------------------------
744   _q_: sublevels     _a_: all         _u_: up
745   _t_: body          _e_: entry       _n_: next visible
746   _o_: other         _i_: children    _p_: previous visible
747   _c_: entry         _k_: branches    _f_: forward same level
748   _l_: leaves        _s_: subtree     _b_: backward same level
749   _d_: subtree
750
751   "
752     ;; Hide
753     ("q" outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
754     ("t" outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
755     ("o" outline-hide-other)        ; Hide other branches
756     ("c" outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
757     ("l" outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
758     ("d" outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
759     ;; Show
760     ("a" outline-show-all)          ; Show (expand) everything
761     ("e" outline-show-entry)        ; Show this heading's body
762     ("i" outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
763     ("k" outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
764     ("s" outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
765     ;; Move
766     ("u" outline-up-heading)                ; Up
767     ("n" outline-next-visible-heading)      ; Next
768     ("p" outline-previous-visible-heading)  ; Previous
769     ("f" outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
770     ("b" outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
771     ("z" nil "leave"))
772   )
773 #+END_SRC
774
775 ** Tramp
776 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
777   (use-package tramp
778     :config
779     (add-to-list 'tramp-methods '("vcsh"
780                                   (tramp-login-program "vcsh")
781                                   (tramp-login-args
782                                    (("enter")
783                                     ("%h")))
784                                   (tramp-remote-shell "/bin/sh")
785                                   (tramp-remote-shell-args
786                                    ("-c")))))
787 #+END_SRC
788 ** Reftex
789 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
790   (use-package reftex
791     :ensure t
792     :config
793     (setq-default reftex-default-bibliography
794                     '("~/projects/research/references.bib")))
795 #+END_SRC
796 ** BibTex
797 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
798   (use-package bibtex
799     :config (setq bibtex-user-optional-fields
800                   (quote (("annote" "Personal annotation (ignored)")
801                           ("abstract" "")
802                   ("pmid" "")
803                   ("doi" ""))))
804     )
805
806 #+END_SRC
807 ** LaTeX
808 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
809   (use-package tex
810     :defer t
811     :ensure auctex
812     :config
813     ; (add-to-list 'TeX-style-path '"/home/don/lib/emacs_el/auctex/style")
814     ;; REFTEX (much enhanced management of cross-ref, labels, etc)
815     ;; http://www.strw.leidenuniv.nl/~dominik/Tools/reftex/
816     ; (autoload 'reftex-mode     "reftex" "RefTeX Minor Mode" t)
817     ; (autoload 'turn-on-reftex  "reftex" "RefTeX Minor Mode" nil)
818     ; (autoload 'reftex-citation "reftex-cite" "Make citation" nil)
819     ; (autoload 'reftex-index-phrase-mode "reftex-index" "Phrase mode" t)
820     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with AUCTeX LaTeX mode
821     (add-hook 'latex-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with Emacs latex mode
822     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with AUCTeX LaTeX mode
823     (add-hook 'latex-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with Emacs latex mode
824
825     (setq-default reftex-plug-into-AUCTeX t)
826     ;; support fake section headers
827     (setq TeX-outline-extra
828           '(("%chapter" 1)
829             ("%section" 2)
830             ("%subsection" 3)
831             ("%subsubsection" 4)
832             ("%paragraph" 5)))
833     ;; add font locking to the headers
834     (font-lock-add-keywords
835      'latex-mode
836      '(("^%\\(chapter\\|\\(sub\\|subsub\\)?section\\|paragraph\\)"
837         0 'font-lock-keyword-face t)
838        ("^%chapter{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-1-face t)
839        ("^%section{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-2-face t)
840        ("^%subsection{\\(.*\\)}"    1 'font-latex-sectioning-3-face t)
841        ("^%subsubsection{\\(.*\\)}" 1 'font-latex-sectioning-4-face t)
842        ("^%paragraph{\\(.*\\)}"     1 'font-latex-sectioning-5-face t)))
843
844     ;; use smart quotes by default instead of `` and ''
845     ;; taken from http://kieranhealy.org/esk/kjhealy.html
846     (setq TeX-open-quote "“")
847     (setq TeX-close-quote "”")
848
849     ;; (TeX-add-style-hook
850     ;;  "latex"
851     ;;  (lambda ()
852     ;;    (TeX-add-symbols
853     ;;     '("DLA" 1))))
854     ;; (custom-set-variables
855     ;;  '(font-latex-user-keyword-classes 
856     ;;    '(("fixme" 
857     ;;       ("DLA" "RZ")
858     ;;       font-lock-function-name-face 2 (command 1 t))))
859     ;; ) 
860     (setq-default TeX-parse-self t)
861     (setq-default TeX-auto-save t)
862     (setq-default TeX-master nil)
863     (eval-after-load
864         "latex"
865       '(TeX-add-style-hook
866         "cleveref"
867         (lambda ()
868           (if (boundp 'reftex-ref-style-alist)
869               (add-to-list
870                'reftex-ref-style-alist
871                '("Cleveref" "cleveref"
872                  (("\\cref" ?c) ("\\Cref" ?C) ("\\cpageref" ?d) ("\\Cpageref" ?D)))))
873           (reftex-ref-style-activate "Cleveref")
874           (TeX-add-symbols
875            '("cref" TeX-arg-ref)
876            '("Cref" TeX-arg-ref)
877            '("cpageref" TeX-arg-ref)
878            '("Cpageref" TeX-arg-ref)))))
879     (eval-after-load
880         "latex"
881       '(add-to-list 'LaTeX-fill-excluded-macros
882                     '("Sexpr")))
883
884     (use-package font-latex
885       :config
886       (setq font-latex-match-reference-keywords
887             '(
888               ("fref" "{")
889               ("Fref" "{")
890               ("citep" "{")
891               ("citet" "{")
892               ("acs" "{")
893               ("acsp" "{")
894               ("ac" "{")
895               ("acp" "{")
896               ("acl" "{")
897               ("aclp" "{")
898               ("acsu" "{")
899               ("aclu" "{")
900               ("acused" "{")
901               ("DLA" "{")
902               ("RZ" "{")
903               ("OM" "{")
904               ("DL" "{")
905               ("fixme" "{"))
906             )
907       )
908     (setq font-latex-fontify-script nil)
909     (setq font-latex-fontify-sectioning (quote color))
910     (setq font-latex-script-display (quote (nil)))
911   )
912
913 #+END_SRC
914 ** ESS
915 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
916   (use-package ess
917     :ensure t
918     :commands R
919     :mode ("\\.R\\'" . ess-r-mode)
920     :bind (:map ess-mode-map
921                 ("C-c C-R" . dla/ess-region-remote-eval))
922     :init
923     (autoload 'ess-r-mode "ess-site" nil t)
924     (autoload 'R "ess-site" nil t)
925     :config
926     ; actually load the rest of ess
927     (require 'ess-site)
928     (defun ess-change-directory (path)
929       "Set the current working directory to PATH for both *R* and Emacs."
930       (interactive "Directory to change to: ")
931     
932       (when (file-exists-p path)
933         (ess-command (concat "setwd(\"" path "\")\n"))
934         ;; use file-name-as-directory to ensure it has trailing /
935         (setq default-directory (file-name-as-directory path))))
936     (add-hook 'ess-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
937     ;; outlining support for ess modes
938     (add-hook
939      'ess-mode-hook
940      '(lambda ()
941         (outline-minor-mode)
942         (setq outline-regexp "\\(^#\\{4,5\\} \\)\\|\\(^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function\\)")
943         (defun outline-level ()
944           (cond ((looking-at "^##### ") 1)
945                 ((looking-at "^#### ") 2)
946                 ((looking-at "^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function(.*{") 3)
947                 (t 1000)))
948         ))
949     (defun dla/ess-region-remote-eval (start end)
950       "Evaluate region in a remote ESS instance"
951       (interactive "r")
952       (shell-command-on-region start end "eval_r" (get-buffer-create "***essregionremoteeval***"))
953       kill-buffer "***essregionremoteeval***")
954     ;; Don't restore history or save workspace image
955     '(inferior-R-args "--no-restore-history --no-save")
956     )
957 #+END_SRC
958
959 ** Rainbowmode
960 From http://julien.danjou.info/projects/emacs-packages#rainbow-mode, this colorizes color strings
961
962 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
963   (use-package rainbow-mode
964     ;; add ess to the x major mode
965     :config (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[S])
966     (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[R])
967   )
968 #+END_SRC
969
970 ** Polymode
971 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
972   (use-package polymode
973     :config
974     (use-package poly-R)
975     (use-package poly-noweb)
976     (use-package poly-markdown)
977     :mode ("\\.Snw" . poly-noweb+r-mode)
978     :mode ("\\.Rnw" . poly-noweb+r-mode)
979     :mode ("\\.Rmd" . poly-markdown+r-mode)
980     )
981 #+END_SRC
982
983 ** Outlining
984 *** Outline magic
985 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
986   (use-package outline-magic)
987 #+END_SRC
988 *** Outline mode
989 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
990 ;; change the outline mode prefix from C-c @ to C-c C-2
991 (setq outline-minor-mode-prefix "C-c C-2")
992 ;;(add-hook 'outline-minor-mode-hook
993 ;;          (lambda () (local-set-key (kbd "C-c C-2")
994 ;;                                    outline-mode-prefix-map)))
995
996 #+END_SRC
997 ** Writeroom Mode
998 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
999   (use-package writeroom-mode
1000     :config
1001     (defun my/writing-mode ()
1002       "Start my writing mode; enable visual-line-mode and auto-fill-mode"
1003       (interactive)
1004       (if writeroom-mode
1005           (progn
1006             (writeroom-mode -1)
1007             (visual-line-mode -1)
1008             (auto-fill-mode -1)
1009             (visual-fill-column-mode -1)
1010             )
1011         (visual-line-mode 1)
1012         (auto-fill-mode 1)
1013         (visual-fill-column-mode 1)
1014         (writeroom-mode 1))
1015       )
1016     )
1017 #+END_SRC
1018 ** GhostText/Atomic Chrome
1019 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1020   (use-package atomic-chrome
1021     :config
1022     (ignore-errors (atomic-chrome-start-server))
1023     (setq atomic-chrome-buffer-open-style 'full)
1024     )
1025 #+END_SRC
1026 ** Multiple Cursors
1027    :PROPERTIES:
1028    :ID:       6fcf218b-a762-4c37-9339-a8202ddeb544
1029    :END:
1030 [[https://github.com/magnars/multiple-cursors.el][Multiple Cursors]]
1031 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1032   (use-package multiple-cursors
1033     :bind* (("C-;" . mc/mark-all-dwim)
1034             ("C-<" . mc/mark-previous-like-this)
1035             ("C->" . mc/mark-next-like-this)
1036             ("C-S-c C-S-c" . mc/edit-lines))
1037     )
1038 #+END_SRC
1039 ** Web Mode
1040 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1041   (use-package web-mode
1042     :config
1043     (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.tmpl\\'" . web-mode))
1044     (setq web-mode-enable-engine-detection t)
1045     (setq web-mode-engines-alist
1046           '(("template-toolkit" . "\\.tmpl\\'")))
1047     )
1048 #+END_SRC
1049 ** Spamassassin Mode
1050 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1051   (use-package spamassassin-mode
1052     :commands spamassassin-mode
1053     :ensure f
1054     )
1055 #+END_SRC
1056 ** Password Store
1057 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1058   (use-package password-store
1059     :ensure f
1060     :commands password-store-edit password-store-create
1061     )
1062 #+END_SRC
1063 ** CSS mode
1064 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1065   (use-package css
1066     :mode "\\.css'"
1067     :config
1068     ;; fix up css mode to not be silly
1069     ;; from http://www.stokebloke.com/wordpress/2008/03/21/css-mode-indent-buffer-fix/
1070     (setq cssm-indent-level 4)
1071     (setq cssm-newline-before-closing-bracket t)
1072     (setq cssm-indent-function #'cssm-c-style-indenter)
1073     (setq cssm-mirror-mode nil))
1074 #+END_SRC
1075 ** Abbrev Mode
1076 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1077   (use-package abbrev
1078     :diminish abbrev-mode
1079     :config
1080     ;; load abbreviations from 
1081     (setq abbrev-file-name       
1082           "~/.emacs_abbrev_def")
1083
1084     ;; read the abbrev file if it exists
1085     (if (file-exists-p abbrev-file-name)
1086         (quietly-read-abbrev-file))
1087
1088     ;; for now, use abbrev mode everywhere
1089     (setq default-abbrev-mode t))
1090 #+END_SRC
1091
1092 * Email
1093 ** Mutt
1094 *** Message-mode
1095 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1096   (use-package message
1097     :ensure f
1098     :diminish (message "✉")
1099     :mode ("muttng-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1100     :mode ("mutt-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1101     :hook 'my/message-mode-settings
1102     :hook 'turn-on-flyspell
1103     :bind (:map message-mode-map
1104         ("C-c C-a" . my/post-attach-file))
1105     :delight (message-mode "✉")
1106     :config
1107     (defun my/message-mode-settings ()
1108       (font-lock-add-keywords nil
1109                   '(("^[ \t]*>[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1110                  (0 'message-multiply-quoted-text-face))
1111                 ("^[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1112                  (0 'message-double-quoted-text-face))))
1113       )
1114
1115     (defun my/post-attach-file ()
1116       "Prompt for an attachment."
1117       (interactive)
1118       (let ((file (read-file-name "Attach file: " nil nil t nil)))
1119         (my/header-attach-file file "")))
1120
1121     (defun my/header-attach-file (file description)
1122       "Attach a FILE to the current message (works with Mutt).
1123     Argument DESCRIPTION MIME description."
1124       (interactive "fAttach file: \nsDescription: ")
1125       (when (> (length file) 0)
1126     (save-excursion
1127       (save-match-data
1128         (save-restriction
1129           (widen)
1130           (goto-char (point-min))
1131           (search-forward-regexp "^$")
1132           (insert (concat "Attach: " (replace-regexp-in-string "\\([[:space:]\\]\\)" "\\\\\\1" (file-truename file)) " "
1133                   description "\n"))
1134           (message (concat "Attached '" file "'."))
1135           (setq post-has-attachment t))))))
1136
1137     (setq mail-yank-prefix "> ")
1138   )
1139 #+END_SRC
1140 *** Muttrc mode
1141 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1142   (use-package muttrc-mode
1143     :mode "muttngrc"
1144     :mode "muttrc"
1145   )
1146
1147 #+END_SRC
1148 * Base emacs
1149 ** Reverting buffers
1150 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1151   (use-package autorevert
1152     :diminish auto-revert-mode
1153     :config
1154     (setq global-auto-revert-non-file-buffers t
1155           global-auto-revert-ignore-modes '(pdf-view-mode)
1156           auto-revert-verbose nil)
1157     (global-auto-revert-mode 1))
1158 #+END_SRC
1159 * Org Mode
1160 ** Use-package and load things
1161 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1162
1163   (use-package org
1164     :delight (org-mode "ø")
1165     :config 
1166
1167 #+END_SRC
1168 ** Agenda Configuration
1169 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1170   :mode ("\\.\\(org\\|org_archive\\|txt\\)\\'" . org-mode)
1171   :bind (("C-c l"  . org-store-link)
1172          ("C-c a"  . org-agenda)
1173          ("C-c b"  . org-iswitchb))
1174   :config
1175   (setq-default org-log-done 'time)
1176   (setq-default org-agenda-ndays 5)
1177
1178   ;; agenda configuration
1179   ;; Do not dim blocked tasks
1180   (setq org-agenda-dim-blocked-tasks nil)
1181   (setq org-agenda-inhibit-startup t)
1182   (setq org-agenda-use-tag-inheritance nil)
1183
1184   ;; Compact the block agenda view
1185   (setq org-agenda-compact-blocks t)
1186
1187   ;; Custom agenda command definitions
1188   (setq org-agenda-custom-commands
1189         (quote (("N" "Notes" tags "NOTE"
1190                  ((org-agenda-overriding-header "Notes")
1191                   (org-tags-match-list-sublevels t)))
1192                 ("h" "Habits" tags-todo "STYLE=\"habit\""
1193                  ((org-agenda-overriding-header "Habits")
1194                   (org-agenda-sorting-strategy
1195                    '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1196                 (" " "Agenda"
1197                  ((agenda "" nil)
1198                   (tags "REFILE"
1199                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Refile")
1200                          (org-tags-match-list-sublevels nil)))
1201                   (tags-todo "-CANCELLED/!"
1202                              ((org-agenda-overriding-header "Stuck Projects")
1203                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-stuck-projects)
1204                               (org-agenda-sorting-strategy
1205                                '(category-keep))))
1206                   (tags-todo "-HOLD-CANCELLED/!"
1207                              ((org-agenda-overriding-header "Projects")
1208                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-projects)
1209                               (org-tags-match-list-sublevels 'indented)
1210                               (org-agenda-sorting-strategy
1211                                '(category-keep))))
1212                   (tags-todo "-CANCELLED/!NEXT"
1213                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Next Tasks"
1214                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1215                                                                         ""
1216                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1217                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-projects-and-habits-and-single-tasks)
1218                               (org-tags-match-list-sublevels t)
1219                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1220                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1221                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1222                               (org-agenda-sorting-strategy
1223                                '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1224                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1225                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Subtasks"
1226                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1227                                                                         ""
1228                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1229                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-project-tasks)
1230                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1231                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1232                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1233                               (org-agenda-sorting-strategy
1234                                '(category-keep))))
1235                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1236                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Standalone Tasks"
1237                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1238                                                                         ""
1239                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1240                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-project-tasks)
1241                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1242                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1243                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1244                               (org-agenda-sorting-strategy
1245                                '(category-keep))))
1246                   (tags-todo "-CANCELLED+WAITING|HOLD/!"
1247                              ((org-agenda-overriding-header "Waiting and Postponed Tasks")
1248                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-stuck-projects)
1249                               (org-tags-match-list-sublevels nil)
1250                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled t)
1251                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines t)))
1252                   (tags "-REFILE/"
1253                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Archive")
1254                          (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-archivable-tasks)
1255                          (org-tags-match-list-sublevels nil))))
1256                  nil))))
1257
1258   ; org mode agenda files
1259   (setq org-agenda-files
1260         (quote ("~/projects/org-notes/debbugs.org"
1261             "~/projects/org-notes/notes.org"
1262             "~/projects/org-notes/holidays.org"
1263             "~/projects/org-notes/refile.org"
1264             "~/projects/org-notes/diary.org"
1265             "~/projects/org-notes/ool.org"
1266             "~/projects/org-notes/sndservers.org"
1267             "~/projects/org-notes/chaim.org"
1268             "~/projects/org-notes/wildman.org"
1269             "~/projects/org-notes/uddin.org"
1270             "~/projects/org-notes/reviews.org"
1271             "~/org-mode/from-mobile.org"
1272             "~/projects/org-notes/fh.org")))
1273
1274   (set-register ?n (cons 'file "~/projects/org-notes/notes.org"))
1275   (set-register ?r (cons 'file "~/projects/org-notes/refile.org"))
1276   (set-register ?o (cons 'file "~/projects/org-notes/ool.org"))
1277   (set-register ?s (cons 'file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
1278   (set-register ?c (cons 'file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
1279   (set-register ?w (cons 'file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
1280   (set-register ?u (cons 'file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
1281   (set-register ?R (cons 'file "~/projects/reviews/reviews.org"))
1282   (set-register ?d (cons 'file "~/projects/org-notes/diary.org"))
1283   ; from https://emacs.stackexchange.com/questions/909/how-can-i-have-an-agenda-timeline-view-of-multiple-files
1284   (defun org-agenda-timeline-all (&optional arg)
1285     (interactive "P")
1286     (with-temp-buffer
1287       (dolist (org-agenda-file org-agenda-files)
1288         (insert-file-contents org-agenda-file nil)
1289         (goto-char (point-max))
1290         (newline))
1291       (write-file "/tmp/timeline.org")
1292       (org-agenda arg "L")))
1293   (define-key org-mode-map (kbd "C-c t") 'org-agenda-timeline-all)
1294
1295 #+END_SRC
1296 ** General config
1297 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1298   (setq org-global-properties '(("Effort_ALL 0 0:10 0:30 1:00 2:00 3:00 4:00 5:00 6:00 7:00")))
1299   (setq org-columns-default-format "%40ITEM(Task) %6Effort{:} %CLOCKSUM %PRIORITY %TODO %13SCHEDULED %13DEADLINE %TAGS")
1300
1301   (setq org-default-notes-file "~/projects/org-notes/notes.org")
1302   (setq org-id-link-to-org-use-id 'use-existing)
1303 #+END_SRC
1304 ** Capture Templates
1305 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1306   (setq org-capture-templates  ;; mail-specific note template, identified by "m"
1307         '(("m" "Mail" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1308            "* %?\n\n  Source: %u, [[%:link][%:description]]\n  %:initial")
1309           ("t" "todo" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1310            "* TODO %?\n  :PROPERTIES:\n  :END:\n  :LOGBOOK:\n  :END:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1311           ("r" "respond" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1312            "* NEXT Respond to %:from on %:subject\nSCHEDULED: %t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t :immediate-finish t)
1313           ("n" "note" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1314            "* %? :NOTE:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1315           ("s" "schedule" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1316            "* %? :cal:\n%^{scheduled:}t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1317           ("j" "Journal" entry (file+datetree "~/projects/org-notes/diary.org")
1318            "* %?\n%U\n" :clock-in t :clock-resume t)
1319           ("w" "org-protocol" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1320            "* TODO Review %c\n%U\n" :immediate-finish t)
1321           ("M" "Meeting" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1322            "* MEETING with %? :MEETING:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1323           ("S" "Seminar" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1324            "* SEMINAR notes %? :SEMINAR:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1325           ("P" "Paper to read" entry (file+headline "~/projects/research/papers_to_read.org" "Refile")
1326            "* TODO Get/Read %? \n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1327           ("p" "Phone call" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1328            "* PHONE %? :PHONE:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1329           ("J" "job" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1330            "* TODO Apply for %a%? :job:\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d 17:00-17:30>\")\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1331           ("h" "Habit" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1332            "* NEXT %?\n%U\n%a\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d .+1d/3d>\")\n:PROPERTIES:\n:STYLE: habit\n:REPEAT_TO_STATE: NEXT\n:END:\n%a\n")
1333           )
1334         )
1335
1336   ;; Remove empty LOGBOOK drawers on clock out
1337   (defun bh/remove-empty-drawer-on-clock-out ()
1338     (interactive)
1339     (save-excursion
1340       (beginning-of-line 0)
1341       (org-remove-empty-drawer-at (point))))
1342
1343   (defun my/org-add-id ()
1344     (interactive)
1345     (save-excursion
1346       (if (org-current-level)
1347           ()
1348         (forward-char 1)
1349         )
1350       (org-id-get-create)
1351       )
1352   )
1353
1354 #+END_SRC
1355 ** Org mode key bindings
1356 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1357   ;; org mode configuration from http://doc.norang.ca/org-mode.html
1358   ;; Custom Key Bindings
1359   :bind* (("<f9> a" . org-agenda)
1360           ("<f9> I" . bh/punch-in)
1361           ("<f9> O" . bh/punch-out)
1362           ("<f9> SPC" . bh/clock-in-last-task)
1363           ("<f12>" . org-agenda)
1364           ;; ("<f5>" . bh/org-todo)
1365           ("<S-f5>" . bh/widen)
1366           ("<f7>" . bh/set-truncate-lines)
1367           ("<f8>" . org-cycle-agenda-files)
1368           ("<f9> <f9>" . bh/show-org-agenda)
1369           ("<f9> b" . bbdb)
1370           ("<f9> c" . calendar)
1371           ("<f9> f" . boxquote-insert-file)
1372           ("<f9> h" . bh/hide-other)
1373           ("<f9> n" . bh/toggle-next-task-display)
1374           ("<f9> w" . widen)
1375
1376           ("<f9> o" . bh/make-org-scratch)
1377
1378           ("<f9> r" . boxquote-region)
1379           ("<f9> s" . bh/switch-to-scratch)
1380
1381           ("<f9> t" . bh/insert-inactive-timestamp)
1382           ("<f9> T" . bh/toggle-insert-inactive-timestamp)
1383
1384           ("<f9> v" . visible-mode)
1385           ("<f9> l" . org-toggle-link-display)
1386           ("<f9> SPC" . bh/clock-in-last-task)
1387           ("C-<f9>" . previous-buffer)
1388           ("M-<f9>" . org-toggle-inline-images)
1389           ("C-x n r" . narrow-to-region)
1390           ("C-<f10>" . next-buffer)
1391           ("<f11>" . org-clock-goto)
1392           ("C-<f11>" . org-clock-in)
1393           ("C-s-<f12>" . bh/save-then-publish)
1394           ("C-c c" . org-capture))
1395   :config
1396 #+END_SRC
1397 ** Utility Functions
1398 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1399   (defun bh/hide-other ()
1400     (interactive)
1401     (save-excursion
1402       (org-back-to-heading 'invisible-ok)
1403       (hide-other)
1404       (org-cycle)
1405       (org-cycle)
1406       (org-cycle)))
1407
1408   (defun bh/set-truncate-lines ()
1409     "Toggle value of truncate-lines and refresh window display."
1410     (interactive)
1411     (setq truncate-lines (not truncate-lines))
1412     ;; now refresh window display (an idiom from simple.el):
1413     (save-excursion
1414       (set-window-start (selected-window)
1415                         (window-start (selected-window)))))
1416
1417   (defun bh/make-org-scratch ()
1418     (interactive)
1419     (find-file "/tmp/publish/scratch.org")
1420     (gnus-make-directory "/tmp/publish"))
1421
1422   (defun bh/switch-to-scratch ()
1423     (interactive)
1424     (switch-to-buffer "*scratch*"))
1425
1426   (setq org-use-fast-todo-selection t)
1427   (setq org-treat-S-cursor-todo-selection-as-state-change nil)
1428
1429   ; create function to create headlines in file. This comes from
1430   ; http://stackoverflow.com/questions/13340616/assign-ids-to-every-entry-in-org-mode
1431   (defun my/org-add-ids-to-headlines-in-file ()
1432     "Add ID properties to all headlines in the current file which
1433   do not already have one."
1434     (interactive)
1435     (org-map-entries 'org-id-get-create))
1436   ; if we wanted to do this to every buffer, do the following:
1437   ; (add-hook 'org-mode-hook
1438   ;           (lambda ()
1439   ;             (add-hook 'before-save-hook 'my/org-add-ids-to-headlines-in-file nil 'local)))
1440 #+END_SRC
1441 ** Keywords (TODO)
1442 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1443   (setq org-todo-keywords
1444         (quote ((sequence "TODO(t)" "NEXT(n)" "|" "DONE(d)")
1445                 (sequence "WAITING(w@/!)" "HOLD(h@/!)" "|" "CANCELLED(c@/!)" "PHONE" "MEETING"))))
1446
1447   (setq org-todo-keyword-faces
1448         (quote (("TODO" :foreground "red" :weight bold)
1449                 ("NEXT" :foreground "blue" :weight bold)
1450                 ("DONE" :foreground "forest green" :weight bold)
1451                 ("WAITING" :foreground "orange" :weight bold)
1452                 ("HOLD" :foreground "magenta" :weight bold)
1453                 ("CANCELLED" :foreground "forest green" :weight bold)
1454                 ("MEETING" :foreground "forest green" :weight bold)
1455                 ("PHONE" :foreground "forest green" :weight bold))))
1456
1457   (setq org-todo-state-tags-triggers
1458         (quote (("CANCELLED" ("CANCELLED" . t))
1459                 ("WAITING" ("WAITING" . t))
1460                 ("HOLD" ("WAITING") ("HOLD" . t))
1461                 (done ("WAITING") ("HOLD"))
1462                 ("TODO" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1463                 ("NEXT" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1464                 ("DONE" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD")))))
1465
1466
1467
1468   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/remove-empty-drawer-on-clock-out 'append)
1469   ; add ids on creation of nodes
1470   (add-hook 'org-capture-prepare-finalize-hook 'my/org-add-id)
1471
1472
1473   ; resolve clocks after 10 minutes of idle; use xprintidle
1474   ; (setq org-clock-idle-time 10)
1475   ; (setq org-clock-x11idle-program-name "xprintidle")
1476
1477   ; this is from http://doc.norang.ca/org-mode.html#Capture
1478   ; use C-M-r for org mode capture
1479   (global-set-key (kbd "C-M-r") 'org-capture)
1480
1481   ; Targets include this file and any file contributing to the agenda - up to 9 levels deep
1482   (setq org-refile-targets (quote ((nil :maxlevel . 9)
1483                                    (org-agenda-files :maxlevel . 9))))
1484
1485   ; Use full outline paths for refile targets - we file directly with IDO
1486   (setq org-refile-use-outline-path t)
1487
1488   ; Targets complete directly with IDO
1489   (setq org-outline-path-complete-in-steps nil)
1490
1491   ; Allow refile to create parent tasks with confirmation
1492   (setq org-refile-allow-creating-parent-nodes (quote confirm))
1493
1494   ; ; Use IDO for both buffer and file completion and ido-everywhere to t
1495   ; (setq org-completion-use-ido t)
1496   ; (setq ido-everywhere t)
1497   ; (setq ido-max-directory-size 100000)
1498   ; (ido-mode (quote both))
1499   ; ; Use the current window when visiting files and buffers with ido
1500   ; (setq ido-default-file-method 'selected-window)
1501   ; (setq ido-default-buffer-method 'selected-window)
1502   ; ; Use the current window for indirect buffer display
1503   ; (setq org-indirect-buffer-display 'current-window)
1504
1505
1506   ;;;; Refile settings
1507   ; Exclude DONE state tasks from refile targets
1508   (defun bh/verify-refile-target ()
1509     "Exclude todo keywords with a done state from refile targets"
1510     (not (member (nth 2 (org-heading-components)) org-done-keywords)))
1511
1512   (setq org-refile-target-verify-function 'bh/verify-refile-target)
1513
1514   ;; ensure that emacsclient will show just the note to be edited when invoked
1515   ;; from Mutt, and that it will shut down emacsclient once finished;
1516   ;; fallback to legacy behavior when not invoked via org-protocol.
1517   (require 'org-protocol)
1518   ; (add-hook 'org-capture-mode-hook 'delete-other-windows)
1519   (setq my-org-protocol-flag nil)
1520   (defadvice org-capture-finalize (after delete-frame-at-end activate)
1521     "Delete frame at remember finalization"
1522     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1523            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1524   (defadvice org-capture-refile (around delete-frame-after-refile activate)
1525     "Delete frame at remember refile"
1526     (if my-org-protocol-flag
1527         (progn
1528           (setq my-org-protocol-flag nil)
1529           ad-do-it
1530           (delete-frame))
1531       ad-do-it)
1532     )
1533   (defadvice org-capture-kill (after delete-frame-at-end activate)
1534     "Delete frame at remember abort"
1535     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1536            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1537   (defadvice org-protocol-capture (before set-org-protocol-flag activate)
1538     (setq my-org-protocol-flag t))
1539
1540   (defadvice org-insert-todo-heading (after dla/create-id activate)
1541     (org-id-get-create)
1542     )
1543
1544   ;; org modules
1545   (add-to-list 'org-modules 'org-habit)
1546
1547   ; this comes from http://upsilon.cc/~zack/blog/posts/2010/02/integrating_Mutt_with_Org-mode/
1548   (defun open-mail-in-mutt (message)
1549     "Open a mail message in Mutt, using an external terminal.
1550
1551   Message can be specified either by a path pointing inside a
1552   Maildir, or by Message-ID."
1553     (interactive "MPath or Message-ID: ")
1554     (shell-command
1555      (format "faf xterm -e \"%s %s\""
1556          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/mutt_open") message)))
1557
1558   ;; add support for "mutt:ID" links
1559   (org-add-link-type "mutt" 'open-mail-in-mutt)
1560
1561   (defun my-org-mode-setup ()
1562     ; (load-library "reftex")
1563     (and (buffer-file-name)
1564          (file-exists-p (buffer-file-name))
1565          (progn
1566            ; (reftex-parse-all)
1567            (reftex-set-cite-format
1568             '((?b . "[[bib:%l][%l-bib]]")
1569               (?n . "[[notes:%l][%l-notes]]")
1570               (?c . "\\cite{%l}")
1571               (?h . "*** %t\n:PROPERTIES:\n:Custom_ID: %l\n:END:\n[[papers:%l][%l xoj]] [[papers-pdf:%l][pdf]]")))
1572            ))
1573     (define-key org-mode-map (kbd "C-c )") 'reftex-citation)
1574     (define-key org-mode-map (kbd "C-c [") 'reftex-citation)
1575     (define-key org-mode-map (kbd "C-c (") 'org-mode-reftex-search)
1576     (define-key org-mode-map (kbd "C-c 0") 'reftex-view-crossref)
1577     )
1578   (add-hook 'org-mode-hook 'my-org-mode-setup)
1579
1580   (defun org-mode-reftex-search ()
1581     (interactive)
1582     (org-open-link-from-string (format "[[notes:%s]]" (first (reftex-citation t)))))
1583
1584   (defun open-research-paper (bibtexkey)
1585     "Open a paper by bibtex key"
1586     (interactive "bibtex key: ")
1587     (shell-command
1588      (format "%s %s"
1589          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1590   (org-add-link-type "papers" 'open-research-paper)
1591   (defun open-research-paper-pdf (bibtexkey)
1592     "Open a paper pdf by bibtex key"
1593     (interactive "bibtex key: ")
1594     (shell-command
1595      (format "%s -p evince_annot %s"
1596          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1597   (org-add-link-type "papers-pdf" 'open-research-paper-pdf)
1598
1599   (add-to-list 'org-link-abbrev-alist
1600                '("notes" .
1601                  "~/projects/research/paper_notes.org::#%s"))
1602
1603   ; I pretty much always want hiearchical checkboxes
1604   (setq org-hierachical-checkbox-statistics nil)
1605
1606   ;; Add \begin{equation}\end{equation} templates to the org mode easy templates
1607   (add-to-list 'org-structure-template-alist
1608                '("E" "\\begin{equation}\n?\n\\end{equation}"))
1609
1610    ;; stolen from
1611   ;; http://www-public.it-sudparis.eu/~berger_o/weblog/2012/03/23/how-to-manage-and-export-bibliographic-notesrefs-in-org-mode/
1612   (defun my-rtcite-export-handler (path desc format)
1613     (message "my-rtcite-export-handler is called : path = %s, desc = %s, format = %s" path desc format)
1614     (let* ((search (when (string-match "::#?\\(.+\\)\\'" path)
1615                      (match-string 1 path)))
1616            (path (substring path 0 (match-beginning 0))))
1617       (cond ((eq format 'latex)
1618              (if (or (not desc) 
1619                      (equal 0 (search "rtcite:" desc)))
1620                  (format "\\cite{%s}" search)
1621                (format "\\cite[%s]{%s}" desc search))))))
1622
1623   (org-add-link-type "rtcite" 
1624                      'org-bibtex-open
1625                      'my-rtcite-export-handler)
1626
1627
1628 #+END_SRC
1629 ** Org Mobile Configuration
1630 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1631   (setq-default org-mobile-directory "/linnode.donarmstrong.com:/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/")
1632   (when (string= system-name "linnode")
1633     (setq-default org-mobile-directory "/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/"))
1634   (setq-default org-directory "/home/don/org-mode/")
1635   (setq-default org-mobile-inbox-for-pull "/home/don/org-mode/from-mobile.org")
1636
1637 #+END_SRC
1638 ** Org iCal Support
1639 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1640   ;; org mode ical export
1641   (setq org-icalendar-timezone "America/Los_Angeles")
1642   (setq org-icalendar-use-scheduled '(todo-start event-if-todo))
1643   ;; we already add the id manually
1644   (setq org-icalendar-store-UID t)
1645
1646 #+END_SRC
1647 ** General Org Babel Configuration
1648 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1649   ;; org babel support
1650   (org-babel-do-load-languages
1651    'org-babel-load-languages
1652    '((emacs-lisp . t )
1653      (R . t)
1654      (latex . t)
1655      (ditaa . t)
1656      (dot . t)
1657      ))
1658   ;; use graphviz-dot for dot things
1659   (add-to-list 'org-src-lang-modes '("dot" . graphviz-dot))
1660   ;; org-babel-by-backend
1661   (defmacro org-babel-by-backend (&rest body)
1662      `(case (if (boundp 'backend) 
1663                 (org-export-backend-name backend)
1664               nil) ,@body))
1665
1666   (defun my/fix-inline-images ()
1667     (when org-inline-image-overlays
1668       (org-redisplay-inline-images)))
1669
1670   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook
1671              'my/fix-inline-images)
1672
1673 #+END_SRC
1674 ** LaTeX configuration
1675    :PROPERTIES:
1676    :ID:       7135ba17-6a50-4eed-84ca-b90afa5b12f8
1677    :END:
1678 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1679   (require 'ox-latex)
1680   (add-to-list 'org-latex-classes
1681            '("memarticle"
1682          "\\documentclass[11pt,oneside,article]{memoir}\n"
1683          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1684          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1685          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1686          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1687          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1688
1689   (setq org-beamer-outline-frame-options "")
1690   (add-to-list 'org-latex-classes
1691            '("beamer"
1692          "\\documentclass[ignorenonframetext]{beamer}
1693   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1694   [PACKAGES]
1695   [EXTRA]"
1696          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1697          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1698          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1699          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1700          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1701
1702   (add-to-list 'org-latex-classes
1703            '("membook"
1704          "\\documentclass[11pt,oneside]{memoir}\n"
1705          ("\\chapter{%s}" . "\\chapter*{%s}")
1706          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1707          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1708          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")))
1709
1710   (add-to-list 'org-latex-classes
1711            '("letter"
1712          "\\documentclass[11pt]{letter}
1713   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1714   [PACKAGES]
1715   [EXTRA]"
1716      ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1717          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1718          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1719          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1720          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1721
1722   (add-to-list 'org-latex-classes
1723            '("dlacv"
1724          "\\documentclass{dlacv}
1725   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1726   [NO-PACKAGES]
1727   [NO-EXTRA]"
1728          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1729          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1730          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1731          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1732          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1733
1734
1735   (add-to-list 'org-latex-classes
1736            '("dlaresume"
1737          "\\documentclass{dlaresume}
1738   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1739   [NO-PACKAGES]
1740   [NO-EXTRA]"
1741          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1742          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1743          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1744          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1745          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1746
1747
1748   ;; Originally taken from Bruno Tavernier: http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/31150/focus=31432
1749   ;; but adapted to use latexmk 4.22 or higher.  
1750   (setq org-latex-pdf-process '("latexmk -f -pdflatex=xelatex -bibtex -use-make -pdf %f"))
1751
1752   ;; Default packages included in /every/ tex file, latex, pdflatex or xelatex
1753   (setq org-latex-default-packages-alist
1754     '(("" "amsmath" t)
1755       ("" "unicode-math" t)
1756       ))
1757   (setq org-latex-packages-alist
1758     '(("" "graphicx" t)
1759       ("" "fontspec" t)
1760       ("" "xunicode" t)
1761       ("" "hyperref" t)
1762       ("" "url" t)
1763       ("" "rotating" t)
1764       ("" "longtable" nil)
1765       ("" "float" )))
1766
1767   ;; make equations larger
1768   (setq org-format-latex-options (plist-put org-format-latex-options :scale 2.0))
1769
1770   (defun org-create-formula--latex-header ()
1771     "Return LaTeX header appropriate for previewing a LaTeX snippet."
1772     (let ((info (org-combine-plists (org-export--get-global-options
1773              (org-export-get-backend 'latex))
1774             (org-export--get-inbuffer-options
1775              (org-export-get-backend 'latex)))))
1776       (org-latex-guess-babel-language
1777        (org-latex-guess-inputenc
1778     (org-splice-latex-header
1779      org-format-latex-header
1780      org-latex-default-packages-alist
1781      nil t
1782      (plist-get info :latex-header)))
1783        info)))
1784
1785
1786   ; support ignoring headers in org mode export to latex
1787   ; from http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/67692
1788   (defadvice org-latex-headline (around my-latex-skip-headlines
1789                     (headline contents info) activate)
1790     (if (member "ignoreheading" (org-element-property :tags headline))
1791     (setq ad-return-value contents)
1792       ad-do-it))
1793
1794   ;; keep latex logfiles
1795
1796   (setq org-latex-remove-logfiles nil)
1797
1798   ;; Resume clocking task when emacs is restarted
1799   (org-clock-persistence-insinuate)
1800   ;;
1801   ;; Show lot of clocking history so it's easy to pick items off the C-F11 list
1802   (setq org-clock-history-length 23)
1803   ;; Resume clocking task on clock-in if the clock is open
1804   (setq org-clock-in-resume t)
1805   ;; Change tasks to NEXT when clocking in; this avoids clocking in when
1806   ;; there are things like PHONE calls
1807   (setq org-clock-in-switch-to-state 'bh/clock-in-to-next)
1808   ;; Separate drawers for clocking and logs
1809   (setq org-drawers (quote ("PROPERTIES" "LOGBOOK")))
1810   ;; Save clock data and state changes and notes in the LOGBOOK drawer
1811   (setq org-clock-into-drawer t)
1812   (setq org-log-into-drawer t)
1813   ;; Sometimes I change tasks I'm clocking quickly - this removes clocked tasks with 0:00 duration
1814   (setq org-clock-out-remove-zero-time-clocks t)
1815   ;; Clock out when moving task to a done state
1816   (setq org-clock-out-when-done t)
1817   ;; Save the running clock and all clock history when exiting Emacs, load it on startup
1818   (setq org-clock-persist t)
1819   ;; Do not prompt to resume an active clock
1820   (setq org-clock-persist-query-resume nil)
1821   ;; Enable auto clock resolution for finding open clocks
1822   (setq org-clock-auto-clock-resolution (quote when-no-clock-is-running))
1823   ;; Include current clocking task in clock reports
1824   (setq org-clock-report-include-clocking-task t)
1825
1826   ;; the cache seems to be broken
1827   (setq org-element-use-cache nil)
1828
1829   (defvar bh/keep-clock-running nil)
1830
1831   (defun bh/is-task-p ()
1832     "Any task with a todo keyword and no subtask"
1833     (save-restriction
1834       (widen)
1835       (let ((has-subtask)
1836             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1837             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1838         (save-excursion
1839           (forward-line 1)
1840           (while (and (not has-subtask)
1841                       (< (point) subtree-end)
1842                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1843             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1844               (setq has-subtask t))))
1845         (and is-a-task (not has-subtask)))))
1846   (defun bh/is-project-p ()
1847     "Any task with a todo keyword subtask"
1848     (save-restriction
1849       (widen)
1850       (let ((has-subtask)
1851             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1852             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1853         (save-excursion
1854           (forward-line 1)
1855           (while (and (not has-subtask)
1856                       (< (point) subtree-end)
1857                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1858             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1859               (setq has-subtask t))))
1860         (and is-a-task has-subtask))))
1861
1862   (defun bh/is-subproject-p ()
1863     "Any task which is a subtask of another project"
1864     (let ((is-subproject)
1865           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1866       (save-excursion
1867         (while (and (not is-subproject) (org-up-heading-safe))
1868           (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1869             (setq is-subproject t))))
1870       (and is-a-task is-subproject)))
1871
1872
1873   (defun bh/clock-in-to-next (kw)
1874     "Switch a task from TODO to NEXT when clocking in.
1875   Skips capture tasks, projects, and subprojects.
1876   Switch projects and subprojects from NEXT back to TODO"
1877     (when (not (and (boundp 'org-capture-mode) org-capture-mode))
1878       (cond
1879        ((and (member (org-get-todo-state) (list "TODO"))
1880          (bh/is-task-p))
1881     "NEXT")
1882        ((and (member (org-get-todo-state) (list "NEXT"))
1883          (bh/is-project-p))
1884     "TODO"))))
1885
1886   (defun bh/punch-in (arg)
1887     "Start continuous clocking and set the default task to the
1888   selected task.  If no task is selected set the Organization task
1889   as the default task."
1890     (interactive "p")
1891     (setq bh/keep-clock-running t)
1892     (if (equal major-mode 'org-agenda-mode)
1893     ;;
1894     ;; We're in the agenda
1895     ;;
1896     (let* ((marker (org-get-at-bol 'org-hd-marker))
1897            (tags (org-with-point-at marker (org-get-tags-at))))
1898       (if (and (eq arg 4) tags)
1899           (org-agenda-clock-in '(16))
1900         (bh/clock-in-organization-task-as-default)))
1901       ;;
1902       ;; We are not in the agenda
1903       ;;
1904       (save-restriction
1905     (widen)
1906     ; Find the tags on the current task
1907     (if (and (equal major-mode 'org-mode) (not (org-before-first-heading-p)) (eq arg 4))
1908         (org-clock-in '(16))
1909       (bh/clock-in-organization-task-as-default)))))
1910
1911   (defun bh/punch-out ()
1912     (interactive)
1913     (setq bh/keep-clock-running nil)
1914     (when (org-clock-is-active)
1915       (org-clock-out))
1916     (org-agenda-remove-restriction-lock))
1917
1918   (defun bh/clock-in-default-task ()
1919     (save-excursion
1920       (org-with-point-at org-clock-default-task
1921     (org-clock-in))))
1922
1923   (defun bh/clock-in-parent-task ()
1924     "Move point to the parent (project) task if any and clock in"
1925     (let ((parent-task))
1926       (save-excursion
1927     (save-restriction
1928       (widen)
1929       (while (and (not parent-task) (org-up-heading-safe))
1930         (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1931           (setq parent-task (point))))
1932       (if parent-task
1933           (org-with-point-at parent-task
1934         (org-clock-in))
1935         (when bh/keep-clock-running
1936           (bh/clock-in-default-task)))))))
1937
1938   (defvar bh/organization-task-id "e22cb8bf-07c7-408b-8f60-ff3aadac95e4")
1939
1940   (defun bh/clock-in-organization-task-as-default ()
1941     (interactive)
1942     (org-with-point-at (org-id-find bh/organization-task-id 'marker)
1943       (org-clock-in '(16))))
1944
1945   (defun bh/clock-out-maybe ()
1946     (when (and bh/keep-clock-running
1947            (not org-clock-clocking-in)
1948            (marker-buffer org-clock-default-task)
1949            (not org-clock-resolving-clocks-due-to-idleness))
1950       (bh/clock-in-parent-task)))
1951
1952   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/clock-out-maybe 'append)
1953
1954   (require 'org-id)
1955   (defun bh/clock-in-task-by-id (id)
1956     "Clock in a task by id"
1957     (org-with-point-at (org-id-find id 'marker)
1958       (org-clock-in nil)))
1959
1960   (defun bh/clock-in-last-task (arg)
1961     "Clock in the interrupted task if there is one
1962   Skip the default task and get the next one.
1963   A prefix arg forces clock in of the default task."
1964     (interactive "p")
1965     (let ((clock-in-to-task
1966        (cond
1967         ((eq arg 4) org-clock-default-task)
1968         ((and (org-clock-is-active)
1969           (equal org-clock-default-task (cadr org-clock-history)))
1970          (caddr org-clock-history))
1971         ((org-clock-is-active) (cadr org-clock-history))
1972         ((equal org-clock-default-task (car org-clock-history)) (cadr org-clock-history))
1973         (t (car org-clock-history)))))
1974       (widen)
1975       (org-with-point-at clock-in-to-task
1976     (org-clock-in nil))))
1977
1978
1979   (defun org-export-to-ods ()
1980     (interactive)
1981     (let ((csv-file "data.csv"))
1982       (org-table-export csv-file "orgtbl-to-csv")
1983       (org-odt-convert csv-file "ods" 'open)))
1984
1985   ; allow for zero-width-space to be a break in regexp too
1986   ; (setcar org-emphasis-regexp-components "​ [:space:] \t('\"{")
1987   ; (setcar (nthcdr 1 org-emphasis-regexp-components) "​ [:space:]- \t.,:!?;'\")}\\")
1988   ; (org-set-emph-re 'org-emphasis-regexp-components org-emphasis-regexp-components)
1989
1990   ;; support inserting screen shots
1991   (defun my/org-insert-screenshot ()
1992     "Take a screenshot into a time stamped unique-named file in the
1993   same directory as the org-buffer and insert a link to this file."
1994     (interactive)
1995     (defvar my/org-insert-screenshot/filename)
1996     (setq my/org-insert-screenshot/filename
1997       (read-file-name
1998        "Screenshot to insert: "
1999        nil
2000        (concat (buffer-file-name) "_" (format-time-string "%Y%m%d_%H%M%S") ".png")
2001        )
2002       )
2003     (call-process "import" nil nil nil my/org-insert-screenshot/filename)
2004     (insert (concat "[[" my/org-insert-screenshot/filename "]]"))
2005     (org-display-inline-images))
2006
2007   (defun my/fix-inline-images ()
2008     (when org-inline-image-overlays
2009       (org-redisplay-inline-images)))
2010
2011   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook 'my/fix-inline-images)
2012
2013   ;; use xelatex to preview with imagemagick
2014   (add-to-list 'org-preview-latex-process-alist
2015            '(xelateximagemagick
2016         :programs ("xelatex" "convert")
2017         :description "pdf > png"
2018         :message "you need to install xelatex and imagemagick"
2019         :use-xcolor t
2020         :image-input-type "pdf"
2021         :image-output-type "png"
2022         :image-size-adjust (1.0 . 1.0)
2023         :latex-compiler ("xelatex -interaction nonstopmode -output-directory %o %f")
2024         :image-converter ("convert -density %D -trim -antialias %f -quality 100 %O"))
2025            )
2026   ;; use xelatex by default
2027   (setq org-preview-latex-default-process 'xelateximagemagick)
2028
2029   ; from http://orgmode.org/Changes.html
2030   (defun my/org-repair-property-drawers ()
2031     "Fix properties drawers in current buffer.
2032    Ignore non Org buffers."
2033     (interactive)
2034     (when (eq major-mode 'org-mode)
2035       (org-with-wide-buffer
2036        (goto-char (point-min))
2037        (let ((case-fold-search t)
2038          (inline-re (and (featurep 'org-inlinetask)
2039                  (concat (org-inlinetask-outline-regexp)
2040                      "END[ \t]*$"))))
2041      (org-map-entries
2042       (lambda ()
2043         (unless (and inline-re (org-looking-at-p inline-re))
2044           (save-excursion
2045         (let ((end (save-excursion (outline-next-heading) (point))))
2046           (forward-line)
2047           (when (org-looking-at-p org-planning-line-re) (forward-line))
2048           (when (and (< (point) end)
2049                  (not (org-looking-at-p org-property-drawer-re))
2050                  (save-excursion
2051                    (and (re-search-forward org-property-drawer-re end t)
2052                     (eq (org-element-type
2053                      (save-match-data (org-element-at-point)))
2054                     'drawer))))
2055             (insert (delete-and-extract-region
2056                  (match-beginning 0)
2057                  (min (1+ (match-end 0)) end)))
2058             (unless (bolp) (insert "\n"))))))))))))
2059
2060 #+END_SRC
2061 ** Org-Gcal
2062 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2063   (use-package calfw
2064     :ensure f
2065     )
2066   (use-package calfw-org
2067     :ensure f
2068     )
2069   (use-package org-gcal
2070     :ensure f
2071     :config '((if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
2072                   (load-file "~/.hide/org_gcal.el"))
2073               )
2074     )
2075 #+END_SRC
2076 ** appt integration
2077 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2078   (use-package appt
2079     :ensure f
2080     :config
2081     ;; Show notification 10 minutes before event
2082     (setq appt-message-warning-time 10)
2083     ;; Disable multiple reminders
2084     (setq appt-display-interval appt-message-warning-time)
2085     (setq appt-display-mode-line nil)
2086
2087     ;; add automatic reminders for appointments
2088     (defun my/org-agenda-to-appt ()
2089       (interactive)
2090       (setq appt-time-msg-list nil)
2091       (org-agenda-to-appt))
2092     ;; add reminders when starting emacs
2093     (my/org-agenda-to-appt)
2094     ;; when rebuilding the agenda
2095     (defadvice  org-agenda-redo (after org-agenda-redo-add-appts)
2096       "Pressing `r' on the agenda will also add appointments."
2097       (my/org-agenda-to-appt)
2098       )
2099     ;; when saving all org buffers
2100     (defadvice org-save-all-org-buffers (after org-save-all-org-buffers-add-appts)
2101       "Re-add appts after saving all org buffers"
2102       (my/org-agenda-to-appt))
2103     ;; Display appointments as a window manager notification
2104     (setq appt-disp-window-function 'my/appt-display)
2105     (setq appt-delete-window-function (lambda () t))
2106
2107     (setq my/appt-notification-app (concat (getenv "HOME") "/bin/appt_notification"))
2108
2109     (defun my/appt-display (min-to-app new-time msg)
2110       (if (atom min-to-app)
2111       (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app min-to-app msg)
2112     (dolist (i (number-sequence 0 (1- (length min-to-app))))
2113       (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app
2114                      (nth i min-to-app) (nth i msg))))
2115       )
2116     )
2117
2118
2119 #+END_SRC
2120 ** End use-package
2121 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2122   )
2123 #+END_SRC
2124 * Keybindings
2125 ** Goto line
2126 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2127   (global-unset-key "\M-g")
2128   (global-set-key (kbd "M-g l") 'goto-line)
2129 #+END_SRC
2130 * Debian
2131 ** debian-changelog
2132 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2133   (use-package debian-changelog
2134     :ensure f
2135     :mode "debian/changelog"
2136     :config
2137     (setq debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
2138     (setq debian-changelog-full-name "Don Armstrong"))
2139 #+END_SRC
2140 * Misc (uncharacterized)
2141 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2142   (setq calendar-latitude 38.6)
2143   (setq calendar-longitude -121.5)
2144   (setq case-fold-search t)
2145   (setq confirm-kill-emacs (quote y-or-n-p))
2146   (setq cperl-lazy-help-time nil)
2147   (display-time)
2148   (setq display-time-24hr-format t)
2149   (setq display-time-day-and-date t)
2150   (display-time-mode 1)
2151   (global-font-lock-mode 1)
2152   (icomplete-mode 1)
2153   (setq log-edit-keep-buffer t)
2154   (setq mail-user-agent (quote sendmail-user-agent))
2155   (setq markdown-enable-math t)
2156   (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
2157   (setq mutt-alias-file-list (quote ("~/.mutt/aliases" "~/.mail_aliases")))
2158   (setq ps-footer-font-size (quote (8 . 10)))
2159   (setq ps-header-font-size (quote (8 . 10)))
2160   (setq ps-header-title-font-size (quote (10 . 10)))
2161   (setq ps-line-number-color "blue")
2162   (setq ps-print-footer t)
2163   (setq ps-print-footer-frame nil)
2164   (setq ps-print-only-one-header t)
2165   (setq sentence-end "[.?!][]\"')]*\\($\\|   \\| \\)[    
2166   ]*")
2167   (setq sentence-end-double-space nil)
2168   ; enable matching parenthesis
2169   (show-paren-mode 1)
2170   (tool-bar-mode -1)
2171   (setq user-mail-address "don@donarmstrong.com")
2172   (setq vc-delete-logbuf-window nil)
2173   (setq vc-follow-symlinks t)
2174
2175   ;; use git before SVN; use CVS earlier, because I have CVS
2176   ;; repositories inside of git directories
2177   (setq vc-handled-backends (quote (CVS Git RCS SVN SCCS Bzr Hg Mtn Arch)))
2178
2179   ;; switch back to the old primary selection method
2180   (setq x-select-enable-clipboard nil)
2181   (setq x-select-enable-primary t)
2182   ; (setq mouse-drag-copy-region t)
2183
2184   (fset 'perl-mode 'cperl-mode)
2185   ;;(load-file "cperl-mode.el")
2186
2187   ;; tramp configuration
2188   (setq tramp-use-ssh-controlmaster-options nil)
2189
2190   (setq-default c-indent-level 4)
2191   (setq-default c-brace-imaginary-offset 0)
2192   (setq-default c-brace-offset -4)
2193   (setq-default c-argdecl-indent 4)
2194   (setq-default c-label-offset -4)
2195   (setq-default c-continued-statement-offset 4)
2196   ; tabs are annoying
2197   (setq-default indent-tabs-mode nil)
2198   (setq-default tab-width 4)
2199
2200
2201   ;; (autoload 'php-mode "php-mode" "PHP editing mode" t)
2202   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php3?\\'" . php-mode))
2203   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.phtml?\\'" . php-mode))
2204   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php?\\'" . php-mode))
2205   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php4?\\'" . php-mode))
2206
2207
2208   (defun insert-date ()
2209     "Insert date at point."
2210     (interactive)
2211     (insert (format-time-string "%A, %B %e, %Y %k:%M:%S %Z")))
2212   (global-set-key "\C-[d" 'insert-date)
2213
2214   (defun unfill-paragraph (arg)
2215     "Pull this whole paragraph up onto one line."
2216     (interactive "*p")
2217     (let ((fill-column 10000))
2218       (fill-paragraph arg))
2219     )
2220
2221   (column-number-mode t)
2222  
2223 #+END_SRC
2224 ** Desktop-save-mode
2225 If the envvar EMACS_SERVER_NAME is set, consider this a separate
2226 emacs, and use a different desktop file to restore history
2227 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2228   (use-package emacs
2229     :demand
2230     :config
2231     (setq desktop-base-file-name
2232           (convert-standard-filename
2233            (concat ".emacs"
2234                    (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2235                        "")
2236                    ".desktop")
2237            ))
2238     (setq desktop-base-lock-name
2239           (convert-standard-filename
2240            (concat desktop-base-file-name
2241                    ".lock")))
2242     (setq desktop-auto-save-timeout 60)
2243     (setq desktop-restore-eager 5)
2244     (setq desktop-lazy-verbose nil)
2245     (desktop-save-mode 1)
2246     ; (desktop-read)
2247   )
2248 #+END_SRC
2249 ** Misc (Uncharacterized)
2250 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2251   '(icomplete-mode on)
2252   (custom-set-faces
2253    ;; custom-set-faces was added by Custom.
2254    ;; If you edit it by hand, you could mess it up, so be careful.
2255    ;; Your init file should contain only one such instance.
2256    ;; If there is more than one, they won't work right.
2257    '(menu ((((type x-toolkit)) (:background "black" :foreground "grey90")))))
2258
2259
2260   (put 'upcase-region 'disabled nil)
2261   (put 'downcase-region 'disabled nil)
2262   (put 'narrow-to-region 'disabled nil)
2263
2264   ; (defun turn-on-flyspell ()
2265   ;    "Force flyspell-mode on using a positive arg.  For use in hooks."
2266   ;    (interactive)
2267   ;    (flyspell-mode 1))
2268
2269
2270    ; Outline-minor-mode key map
2271    (define-prefix-command 'cm-map nil "Outline-")
2272    ; HIDE
2273    (define-key cm-map "q" 'outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
2274    (define-key cm-map "t" 'outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
2275    (define-key cm-map "o" 'outline-hide-other)        ; Hide other branches
2276    (define-key cm-map "c" 'outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
2277    (define-key cm-map "l" 'outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
2278    (define-key cm-map "d" 'outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
2279    ; SHOW
2280    (define-key cm-map "a" 'outline-show-all)          ; Show (expand) everything
2281    (define-key cm-map "e" 'outline-show-entry)        ; Show this heading's body
2282    (define-key cm-map "i" 'outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
2283    (define-key cm-map "k" 'outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
2284    (define-key cm-map "s" 'outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
2285    ; MOVE
2286    (define-key cm-map "u" 'outline-up-heading)                ; Up
2287    (define-key cm-map "n" 'outline-next-visible-heading)      ; Next
2288    (define-key cm-map "p" 'outline-previous-visible-heading)  ; Previous
2289    (define-key cm-map "f" 'outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
2290    (define-key cm-map "b" 'outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
2291    (global-set-key "\M-o" cm-map)
2292   ; fix up tmux xterm keys
2293   ; stolen from http://unix.stackexchange.com/questions/24414/shift-arrow-not-working-in-emacs-within-tmux
2294   (defun fix-up-tmux-keys ()
2295       "Fix up tmux xterm keys"
2296       (if (getenv "TMUX")
2297           (progn
2298             (let ((x 2) (tkey ""))
2299               (while (<= x 8)
2300                 ;; shift
2301                 (if (= x 2)
2302                     (setq tkey "S-"))
2303                 ;; alt
2304                 (if (= x 3)
2305                     (setq tkey "M-"))
2306                 ;; alt + shift
2307                 (if (= x 4)
2308                     (setq tkey "M-S-"))
2309                 ;; ctrl
2310                 (if (= x 5)
2311                     (setq tkey "C-"))
2312                 ;; ctrl + shift
2313                 (if (= x 6)
2314                     (setq tkey "C-S-"))
2315                 ;; ctrl + alt
2316                 (if (= x 7)
2317                     (setq tkey "C-M-"))
2318                 ;; ctrl + alt + shift
2319                 (if (= x 8)
2320                     (setq tkey "C-M-S-"))
2321
2322                 ;; arrows
2323                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d A" x)) (kbd (format "%s<up>" tkey)))
2324                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d B" x)) (kbd (format "%s<down>" tkey)))
2325                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d C" x)) (kbd (format "%s<right>" tkey)))
2326                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d D" x)) (kbd (format "%s<left>" tkey)))
2327                 ;; home
2328                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d H" x)) (kbd (format "%s<home>" tkey)))
2329                 ;; end
2330                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d F" x)) (kbd (format "%s<end>" tkey)))
2331                 ;; page up
2332                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 5 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<prior>" tkey)))
2333                 ;; page down
2334                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 6 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<next>" tkey)))
2335                 ;; insert
2336                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 2 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2337                 ;; delete
2338                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 3 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2339                 ;; f1
2340                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d P" x)) (kbd (format "%s<f1>" tkey)))
2341                 ;; f2
2342                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d Q" x)) (kbd (format "%s<f2>" tkey)))
2343                 ;; f3
2344                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d R" x)) (kbd (format "%s<f3>" tkey)))
2345                 ;; f4
2346                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d S" x)) (kbd (format "%s<f4>" tkey)))
2347                 ;; f5
2348                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 15 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f5>" tkey)))
2349                 ;; f6
2350                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 17 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f6>" tkey)))
2351                 ;; f7
2352                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 18 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f7>" tkey)))
2353                 ;; f8
2354                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 19 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f8>" tkey)))
2355                 ;; f9
2356                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 20 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f9>" tkey)))
2357                 ;; f10
2358                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 21 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f10>" tkey)))
2359                 ;; f11
2360                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 23 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f11>" tkey)))
2361                 ;; f12
2362                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 24 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f12>" tkey)))
2363                 ;; f13
2364                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 25 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f13>" tkey)))
2365                 ;; f14
2366                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 26 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f14>" tkey)))
2367                 ;; f15
2368                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 28 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f15>" tkey)))
2369                 ;; f16
2370                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 29 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f16>" tkey)))
2371                 ;; f17
2372                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 31 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f17>" tkey)))
2373                 ;; f18
2374                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 32 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f18>" tkey)))
2375                 ;; f19
2376                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 33 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f19>" tkey)))
2377                 ;; f20
2378                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 34 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f20>" tkey)))
2379
2380                 (setq x (+ x 1))
2381                 ))
2382             )
2383         )
2384       )
2385   ; (add-hook 'tty-setup-hook 'fix-up-tmux-keys)
2386
2387   (defadvice ask-user-about-supersession-threat (around ask-user-about-supersession-threat-if-necessary)
2388     "Call ask-user-about-supersession-threat only if the buffer is actually obsolete."
2389     (if (or (buffer-modified-p)
2390             (verify-visited-file-modtime)
2391             (< (* 8 1024 1024) (buffer-size))
2392             (/= 0 (call-process-region 1 (+ 1 (buffer-size)) "diff" nil nil nil "-q" (buffer-file-name) "-")))
2393         ad-do-it
2394       (clear-visited-file-modtime)
2395       (not-modified)))
2396   (ad-activate 'ask-user-about-supersession-threat)
2397 #+END_SRC
2398
2399 * Start Server
2400 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2401   (use-package server
2402     :config
2403     (setq server-name
2404           (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2405               "server"))
2406     (unless (server-running-p)
2407       (global-set-key "\C-xp" 'server-edit)
2408       (server-start)))
2409 #+END_SRC
2410
2411
2412
2413 * END
2414 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2415   (provide 'don-configuration)
2416 #+END_SRC