emacs_el/configuration/don-configuration.org

   1 #+PROPERTY: header-args:emacs-lisp :tangle don-configuration.el
   2 * Load debugger
   3
   4 # if for some reason, things get pear-shaped, we want to be able to
   5 # enter the debugger by sending -USR2 to emacs
   6
   7 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
   8 (setq debug-on-event 'siguser2)
   9 #+END_SRC
  10 * Add library paths
  11
  12 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  13   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/")
  14   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/tiny")
  15   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/other")
  16   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/magit-annex")
  17 #+END_SRC
  18
  19 * Package management
  20 ** package repositories and package manager
  21 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  22   (require 'package)
  23   (setq package-archives '(("gnu" . "https://elpa.gnu.org/packages/")
  24                            ("melpa" . "https://melpa.org/packages/")
  25                            ("org" . "http://orgmode.org/elpa/") ))
  26 #+END_SRC
  27 ** [[https://github.com/jwiegley/use-package/][use-package]]
  28 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  29   (package-initialize)
  30   (require 'use-package)
  31 #+END_SRC
  32 ** Paradox
  33 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  34   (use-package paradox
  35     :ensure paradox
  36   )
  37 #+END_SRC
  38 * Disable custom-vars
  39 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  40   ;; Set the custom file to /dev/null and don't bother to load it
  41   (setq custom-file "/dev/null")
  42 #+END_SRC
  43 * Misc functions
  44 ** with-library
  45 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  46 ;; From http://www.emacswiki.org/emacs/LoadingLispFiles
  47 ;; execute conditional code when loading libraries
  48 (defmacro with-library (symbol &rest body)
  49   `(when (require ,symbol nil t)
  50      ,@body))
  51 (put 'with-library 'lisp-indent-function 1)
  52 #+END_SRC
  53
  54 * Variables
  55 ** Safe Local Variables
  56 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  57   (setq safe-local-variable-values
  58         (quote ((auto-save-default)
  59                 (make-backup-files)
  60                 (cperl-indent-level . 4)
  61                 (indent-level . 4)
  62                 (indent-tabs-mode . f)
  63                 )))
  64 #+END_SRC
  65 * Memory
  66 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  67   (setq global-mark-ring-max 128
  68         mark-ring-max 128
  69         kill-ring-max 128)
  70
  71   (defun don/minibuffer-setup-hook ()
  72     (setq gc-cons-threshold most-positive-fixnum))
  73
  74   (defun don/minibuffer-exit-hook ()
  75     (setq gc-cons-threshold 1048576))
  76
  77   (add-hook 'minibuffer-setup-hook #'don/minibuffer-setup-hook)
  78   (add-hook 'minibuffer-exit-hook #'don/minibuffer-exit-hook)
  79 #+END_SRC
  80 * Modules
  81 ** Flyspell 🐝
  82 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  83   (use-package flyspell
  84     :ensure t
  85     :diminish flyspell-mode 🐝
  86     :config
  87     (add-hook 'message-mode-hook 'turn-on-flyspell)
  88     (add-hook 'text-mode-hook 'turn-on-flyspell)
  89     (add-hook 'c-mode-common-hook 'flyspell-prog-mode)
  90     (add-hook 'cperl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
  91     (add-hook 'tcl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
  92     :init
  93     (setq ispell-program-name "ispell")
  94     )
  95
  96 #+END_SRC
  97 ** Winnermode
  98 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  99   (winner-mode 1)
 100 #+END_SRC
 101 ** Eyebrowse
 102
 103 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 104   ;; (use-package eyebrowse
 105   ;;   :ensure t
 106   ;;   :diminish eyebrowse-mode
 107   ;;   :init (setq eyebrowse-keymap-prefix (kbd "C-c C-\\"))
 108   ;;   :config (progn
 109   ;;             (setq eyebrowse-wrap-around t)
 110   ;;             (eyebrowse-mode t)
 111   ;;
 112   ;;             (defun my/eyebrowse-new-window-config ()
 113   ;;               (interactive)
 114   ;;               (let ((done nil))
 115   ;;                 (dotimes (i 10)
 116   ;;                   ;; start at 1 run till 0
 117   ;;                   (let ((j (mod (+ i 1) 10)))
 118   ;;                     (when (and (not done)
 119   ;;                                (not (eyebrowse--window-config-present-p j)))
 120   ;;                       (eyebrowse-switch-to-window-config j)
 121   ;;                       (call-interactively 'eyebrowse-rename-window-config2 j)
 122   ;;                       (setq done t)
 123   ;;                       ))
 124   ;;                   )))
 125   ;;
 126   ;;             ;; I don't use latex-preview-pane
 127   ;;             ;; (require 'latex-preview-pane)
 128   ;;             ;; (defun my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch ()
 129   ;;             ;;   ;; latex-preview-pane uses window-parameters which are
 130   ;;             ;;   ;; not preserved by eyebrowse, so we close the preview
 131   ;;             ;;   ;; pane before switching, it will be regenerated when we
 132   ;;             ;;   ;; edit the TeX file.
 133   ;;             ;;   (when (lpp/window-containing-preview)
 134   ;;             ;;     (delete-window (lpp/window-containing-preview))))
 135   ;;
 136   ;;             ;; (add-to-list 'eyebrowse-pre-window-switch-hook
 137   ;;             ;;              #'my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch)
 138   ;;
 139   ;;             ;; (my/set-menu-key "["  #'my/eyebrowse-new-window-config)
 140   ;;             ;; (my/set-menu-key ";"  #'eyebrowse-prev-window-config)
 141   ;;             ;; (my/set-menu-key "'"  #'eyebrowse-next-window-config)
 142   ;;             ;; (my/set-menu-key "]"  #'eyebrowse-close-window-config)
 143   ;;             ;; (my/set-menu-key "\\" #'eyebrowse-rename-window-config)
 144   ;;             )
 145   ;;   )
 146 #+END_SRC
 147
 148 ** Window handling
 149
 150 *** Splitting
 151 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 152   (defun my/vsplit-last-buffer ()
 153     "Split the window vertically and display the previous buffer."
 154     (interactive)
 155     (split-window-vertically)
 156     (other-window 1 nil)
 157     (switch-to-next-buffer))
 158
 159   (defun my/hsplit-last-buffer ()
 160     "Split the window horizontally and display the previous buffer."
 161     (interactive)
 162     (split-window-horizontally)
 163     (other-window 1 nil)
 164     (switch-to-next-buffer))
 165
 166   (bind-key "C-x 2" 'my/vsplit-last-buffer)
 167   (bind-key "C-x 3" 'my/hsplit-last-buffer)
 168
 169   (setq split-width-threshold  100)
 170   (setq split-height-threshold 60)
 171
 172   (defun my/split-window-prefer-vertically (window)
 173     "If there's only one window (excluding any possibly active
 174            minibuffer), then split the current window horizontally."
 175     (if (and (one-window-p t)
 176              (not (active-minibuffer-window))
 177              ( < (frame-width) (frame-height))
 178              )
 179         (let ((split-width-threshold nil))
 180           (split-window-sensibly window))
 181       (split-window-sensibly window)))
 182
 183   (setq split-window-preferred-function #'my/split-window-prefer-vertically)
 184   (setq window-combination-resize t)
 185 #+END_SRC
 186
 187 *** Compilation window
 188
 189 If there is no compilation window, open one at the bottom, spanning
 190 the complete width of the frame. Otherwise, reuse existing window. In
 191 the former case, if there was no error the window closes
 192 automatically.
 193
 194 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 195   (add-to-list 'display-buffer-alist
 196                `(,(rx bos "*compilation*" eos)
 197                  (display-buffer-reuse-window
 198                   display-buffer-in-side-window)
 199                  (reusable-frames . visible)
 200                  (side            . bottom)
 201                  (window-height   . 0.4)))
 202 #+END_SRC
 203
 204 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 205   (defun my/compilation-exit-autoclose (status code msg)
 206     ;; If M-x compile exists with a 0
 207     (when (and (eq status 'exit) (zerop code))
 208       ;; and delete the *compilation* window
 209       (let ((compilation-window (get-buffer-window (get-buffer "*compilation*"))))
 210         (when (and (not (window-at-side-p compilation-window 'top))
 211                    (window-at-side-p compilation-window 'left)
 212                    (window-at-side-p compilation-window 'right))
 213           (delete-window compilation-window))))
 214     ;; Always return the anticipated result of compilation-exit-message-function
 215     (cons msg code))
 216
 217   ;; Specify my function (maybe I should have done a lambda function)
 218   (setq compilation-exit-message-function #'my/compilation-exit-autoclose)
 219 #+END_SRC
 220
 221 If you change the variable ~compilation-scroll-output~ to a ~non-nil~
 222 value, the compilation buffer scrolls automatically to follow the
 223 output. If the value is ~first-error~, scrolling stops when the first
 224 error appears, leaving point at that error. For any other non-nil
 225 value, scrolling continues until there is no more output.
 226
 227 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 228   (setq compilation-scroll-output 'first-error)
 229 #+END_SRC
 230
 231 ** Mode line cleaning
 232 *** Diminish
 233 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 234   (use-package diminish
 235     :ensure t)
 236 #+END_SRC
 237
 238 *** Delight
 239 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 240   (use-package delight
 241     :ensure t)
 242 #+END_SRC
 243
 244 ** Jumping
 245 *** Avy
 246 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 247   (use-package avy
 248     :ensure t
 249     :bind (("C-c C-<SPC>" . avy-goto-word-or-subword-1)
 250            ("C-c j j" . avy-goto-word-or-subword-1)
 251            ("M-g g" . avy-goto-line))
 252     :config (progn (setq avy-background t))
 253     )
 254 #+END_SRC
 255 *** Ace-link (jumping to links)
 256 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 257   (use-package ace-link
 258     :ensure t
 259     ; bind o in most modes
 260     :config (ace-link-setup-default))
 261 #+END_SRC
 262 *** Jumping through edit points (goto-chg)
 263 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 264   (use-package goto-chg
 265     :ensure t
 266     :bind (("C-c j ," . goto-last-change)
 267            ("C-c j ." . goto-last-change-reverse))
 268     )
 269 #+END_SRC
 270 *** Jumping to bookmarks (visible bookmarks, bm)
 271 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 272   (use-package bm
 273     :ensure t
 274     :bind (("C-c j b ." . bm-next)
 275            ("C-c j b ," . bm-previous)
 276            ("C-c j b SPC" . bm-toggle)))
 277 #+END_SRC
 278
 279 ** Snippets
 280 *** Yasnippet
 281 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 282   (use-package yasnippet
 283     :ensure t
 284     :diminish yas-minor-mode
 285     :config (progn
 286               (yas-global-mode)
 287               (setq yas-verbosity 1)
 288               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<tab>") nil)
 289               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "TAB") nil)
 290               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<backtab>") 'yas-expand)
 291               (setq yas-snippet-dirs '("~/lib/emacs_el/snippets/"
 292                                        "~/lib/emacs_el/yasnippet-snippets/snippets/"))
 293               (add-to-list 'hippie-expand-try-functions-list
 294                                'yas-hippie-try-expand)
 295               )
 296     )
 297 #+END_SRC
 298 *** Auto-YASnippet
 299 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 300   (use-package auto-yasnippet
 301     :bind (("H-w" . aya-create)
 302            ("H-y" . aya-expand)
 303            )
 304     )
 305 #+END_SRC
 306 ** Tinyprocmail
 307
 308 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 309   ;; load tinyprocmail
 310   (use-package tinyprocmail
 311     :ensure f
 312     :config (with-library 'tinyprocmail
 313               ;; (setq tinyprocmail--procmail-version "v3.22")
 314               (add-hook 'tinyprocmail--load-hook 'tinyprocmail-install))
 315   )
 316 #+END_SRC
 317
 318 ** Magit
 319 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
 320   (use-package magit
 321     :ensure t
 322     :bind (("C-x g" . magit-status)
 323            ("C-x C-g" . magit-status))
 324     :config
 325     ;; don't verify where we are pushing
 326     (setq magit-push-always-verify nil)
 327     ;; refine diffs always (hilight words)
 328     (setq magit-diff-refine-hunk nil)
 329     ;; load magit-annex
 330     (setq load-path
 331           (append '("~/lib/emacs_el/magit-annex")
 332                   load-path))
 333     ;; load magit-vcsh
 334     (setq load-path
 335           (append '("~/lib/emacs_el/magit-vcsh")
 336                   load-path))
 337     )
 338   (use-package magit-annex
 339     :ensure t
 340   )
 341   (use-package magit-vcsh
 342     :ensure f ; currently not in melpa, so don't try to install
 343   )
 344 #+END_SRC
 345
 346 ** Perl
 347 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 348   (use-package cperl-mode
 349     :config
 350     (progn
 351       ;; Use c-mode for perl .xs files
 352       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.xs\\'" . c-mode))
 353       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\([pP][Llm]\\|al\\)\\'" . cperl-mode))
 354       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl" . cperl-mode))
 355       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl5" . cperl-mode))
 356       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("miniperl" . cperl-mode))
 357       (setq cperl-hairy t
 358             cperl-indent-level 4
 359             cperl-auto-newline nil
 360             cperl-auto-newline-after-colon nil
 361             cperl-continued-statement-offset 4
 362             cperl-brace-offset -1
 363             cperl-continued-brace-offset 0
 364             cperl-label-offset -4
 365             cperl-highlight-variables-indiscriminately t
 366             cperl-electric-lbrace-space nil
 367             cperl-indent-parens-as-block nil
 368             cperl-close-paren-offset -1
 369             cperl-tab-always-indent t)
 370       ;;(add-hook 'cperl-mode-hook (lambda () (cperl-set-style "PerlStyle")))
 371   ))
 372 #+END_SRC
 373
 374 ** Helm
 375 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 376   (use-package helm
 377     :ensure t
 378     :config
 379     (helm-mode 1)
 380     (define-key global-map [remap find-file] 'helm-find-files)
 381     (define-key global-map [remap occur] 'helm-occur)
 382     (define-key global-map [remap list-buffers] 'helm-buffers-list)
 383     (define-key global-map [remap dabbrev-expand] 'helm-dabbrev)
 384     (global-set-key (kbd "M-x") 'helm-M-x)
 385     (unless (boundp 'completion-in-region-function)
 386       (define-key lisp-interaction-mode-map [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point)
 387       (define-key emacs-lisp-mode-map       [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point))
 388     (add-hook 'kill-emacs-hook #'(lambda () (and (file-exists-p "$TMP") (delete-file "$TMP"))))
 389   )
 390 #+END_SRC
 391 *** Helm Flx
 392
 393  [[https://github.com/PythonNut/helm-flx][helm-flx]] implements intelligent helm fuzzy sorting, provided by [[https://github.com/lewang/flx][flx]].
 394
 395  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 396  (use-package helm-flx
 397    :ensure t
 398    :config (progn
 399              ;; these are helm configs, but they kind of fit here nicely
 400              (setq helm-M-x-fuzzy-match                  t
 401                    helm-bookmark-show-location           t
 402                    helm-buffers-fuzzy-matching           t
 403                    helm-completion-in-region-fuzzy-match t
 404                    helm-file-cache-fuzzy-match           t
 405                    helm-imenu-fuzzy-match                t
 406                    helm-mode-fuzzy-match                 t
 407                    helm-locate-fuzzy-match               nil
 408                    helm-quick-update                     t
 409                    helm-recentf-fuzzy-match              nil
 410                    helm-semantic-fuzzy-match             t)
 411              (helm-flx-mode +1)))
 412  #+END_SRC
 413 *** Helm Swoop
 414 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 415
 416   ;;; stolen from https://github.com/malb/emacs.d/blob/master/malb.org
 417   (defun malb/helm-swoop-pre-fill ()
 418     (thing-at-point 'symbol))
 419   (setq malb/helm-swoop-ignore-major-mode '(dired-mode
 420         paradox-menu-mode doc-view-mode pdf-view-mode
 421         mu4e-headers-mode org-mode markdown-mode latex-mode
 422         ein:notebook-multilang-mode))
 423
 424   (defun malb/swoop-or-search ()
 425     (interactive)
 426     (if (or (> (buffer-size) 1048576) ;; helm-swoop can be slow on big buffers
 427             (memq major-mode malb/helm-swoop-ignore-major-mode))
 428         (isearch-forward)
 429       (helm-swoop)))
 430
 431   (use-package helm-swoop
 432     :ensure t
 433     :bind (("C-c o" . helm-multi-swoop-org)
 434            ("C-s" . malb/swoop-or-search)
 435            ("C-M-s" . helm-multi-swoop-all))
 436     :config (progn
 437
 438               (setq helm-swoop-pre-input-function  #'malb/helm-swoop-pre-fill
 439                     helm-swoop-split-with-multiple-windows nil
 440                     helm-swoop-split-direction #'split-window-horizontally
 441                     helm-swoop-split-window-function 'helm-default-display-buffer
 442                     helm-swoop-speed-or-color t)
 443
 444               ;; https://emacs.stackexchange.com/questions/28790/helm-swoop-how-to-make-it-behave-more-like-isearch
 445               (defun malb/helm-swoop-C-s ()
 446                 (interactive)
 447                 (if (boundp 'helm-swoop-pattern)
 448                     (if (equal helm-swoop-pattern "")
 449                         (previous-history-element 1)
 450                       (helm-next-line))
 451                   (helm-next-line)))
 452
 453               (bind-key "C-S-s" #'helm-swoop-from-isearch isearch-mode-map)
 454               (bind-key "C-S-s" #'helm-multi-swoop-all-from-helm-swoop helm-swoop-map)
 455               (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-swoop-map)
 456               (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-swoop-map)
 457               (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-multi-swoop-map)
 458               (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-multi-swoop-map))
 459     )
 460
 461 #+END_SRC
 462 *** Helm Ag
 463 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 464 (use-package helm-ag
 465   :ensure t
 466   :config (setq helm-ag-base-command "ag --nocolor --nogroup"
 467                 helm-ag-command-option "--all-text"
 468                 helm-ag-insert-at-point 'symbol
 469                 helm-ag-fuzzy-match t
 470                 helm-ag-use-temp-buffer t
 471                 helm-ag-use-grep-ignore-list t
 472                 helm-ag-use-agignore t))
 473 #+END_SRC
 474 *** Helm Descbinds
 475 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 476   (use-package helm-descbinds
 477     :ensure t
 478     :bind ("C-h b" . helm-descbinds)
 479     :init (fset 'describe-bindings 'helm-descbinds))
 480 #+END_SRC
 481
 482 *** Helm YaSnippet
 483 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 484   (use-package helm-c-yasnippet
 485     :ensure t
 486     :bind ("C-c h y" .  helm-yas-complete)
 487     :config (progn
 488               (setq helm-yas-space-match-any-greedy t)))
 489 #+END_SRC
 490 *** Helm Org Rifle
 491 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 492   (use-package helm-org-rifle
 493     :ensure t
 494     :config (progn
 495               (defun malb/helm-org-rifle-agenda-files (arg)
 496                 (interactive "p")
 497                 (let ((current-prefix-arg nil))
 498                   (cond
 499                    ((equal arg 4) (call-interactively #'helm-org-rifle-agenda-files nil))
 500                    ((equal arg 16) (helm-org-rifle-occur-agenda-files))
 501                    (t (helm-org-agenda-files-headings)))))))
 502 #+END_SRC
 503
 504 ** Hydra
 505 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
 506 (require 'don-hydra)
 507 #+END_SRC
 508
 509 ** Tramp
 510 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 511   (add-to-list 'tramp-methods '("vcsh"
 512                                 (tramp-login-program "vcsh")
 513                                 (tramp-login-args
 514                                  (("enter")
 515                                   ("%h")))
 516                                 (tramp-remote-shell "/bin/sh")
 517                                 (tramp-remote-shell-args
 518                                  ("-c"))))
 519 #+END_SRC
 520 ** Reftex
 521 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 522   (use-package reftex
 523     :ensure t
 524     :config
 525     (setq-default reftex-default-bibliography
 526                     '("~/projects/research/references.bib")))
 527 #+END_SRC
 528 ** BibTex
 529 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 530   (use-package bibtex
 531     :config (setq bibtex-user-optional-fields
 532                   (quote (("annote" "Personal annotation (ignored)")
 533                           ("abstract" "")
 534                   ("pmid" "")
 535                   ("doi" ""))))
 536     )
 537
 538 #+END_SRC
 539 ** LaTeX
 540 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 541   (use-package tex
 542     :defer t
 543     :ensure auctex
 544     :config
 545     ; (add-to-list 'TeX-style-path '"/home/don/lib/emacs_el/auctex/style")
 546     ;; REFTEX (much enhanced management of cross-ref, labels, etc)
 547     ;; http://www.strw.leidenuniv.nl/~dominik/Tools/reftex/
 548     ; (autoload 'reftex-mode     "reftex" "RefTeX Minor Mode" t)
 549     ; (autoload 'turn-on-reftex  "reftex" "RefTeX Minor Mode" nil)
 550     ; (autoload 'reftex-citation "reftex-cite" "Make citation" nil)
 551     ; (autoload 'reftex-index-phrase-mode "reftex-index" "Phrase mode" t)
 552     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with AUCTeX LaTeX mode
 553     (add-hook 'latex-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with Emacs latex mode
 554     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with AUCTeX LaTeX mode
 555     (add-hook 'latex-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with Emacs latex mode
 556
 557     (setq-default reftex-plug-into-AUCTeX t)
 558     ;; support fake section headers
 559     (setq TeX-outline-extra
 560           '(("%chapter" 1)
 561             ("%section" 2)
 562             ("%subsection" 3)
 563             ("%subsubsection" 4)
 564             ("%paragraph" 5)))
 565     ;; add font locking to the headers
 566     (font-lock-add-keywords
 567      'latex-mode
 568      '(("^%\\(chapter\\|\\(sub\\|subsub\\)?section\\|paragraph\\)"
 569         0 'font-lock-keyword-face t)
 570        ("^%chapter{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-1-face t)
 571        ("^%section{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-2-face t)
 572        ("^%subsection{\\(.*\\)}"    1 'font-latex-sectioning-3-face t)
 573        ("^%subsubsection{\\(.*\\)}" 1 'font-latex-sectioning-4-face t)
 574        ("^%paragraph{\\(.*\\)}"     1 'font-latex-sectioning-5-face t)))
 575
 576     ;; use smart quotes by default instead of `` and ''
 577     ;; taken from http://kieranhealy.org/esk/kjhealy.html
 578     (setq TeX-open-quote "“")
 579     (setq TeX-close-quote "”")
 580
 581     ;; (TeX-add-style-hook
 582     ;;  "latex"
 583     ;;  (lambda ()
 584     ;;    (TeX-add-symbols
 585     ;;     '("DLA" 1))))
 586     ;; (custom-set-variables
 587     ;;  '(font-latex-user-keyword-classes
 588     ;;    '(("fixme"
 589     ;;       ("DLA" "RZ")
 590     ;;       font-lock-function-name-face 2 (command 1 t))))
 591     ;; )
 592     (setq-default TeX-parse-self t)
 593     (setq-default TeX-auto-save t)
 594     (setq-default TeX-master nil)
 595     (eval-after-load
 596         "latex"
 597       '(TeX-add-style-hook
 598         "cleveref"
 599         (lambda ()
 600           (if (boundp 'reftex-ref-style-alist)
 601               (add-to-list
 602                'reftex-ref-style-alist
 603                '("Cleveref" "cleveref"
 604                  (("\\cref" ?c) ("\\Cref" ?C) ("\\cpageref" ?d) ("\\Cpageref" ?D)))))
 605           (reftex-ref-style-activate "Cleveref")
 606           (TeX-add-symbols
 607            '("cref" TeX-arg-ref)
 608            '("Cref" TeX-arg-ref)
 609            '("cpageref" TeX-arg-ref)
 610            '("Cpageref" TeX-arg-ref)))))
 611     (eval-after-load
 612         "latex"
 613       '(add-to-list 'LaTeX-fill-excluded-macros
 614                     '("Sexpr")))
 615
 616     (use-package font-latex
 617       :config
 618       (setq font-latex-match-reference-keywords
 619             '(
 620               ("fref" "{")
 621               ("Fref" "{")
 622               ("citep" "{")
 623               ("citet" "{")
 624               ("acs" "{")
 625               ("acsp" "{")
 626               ("ac" "{")
 627               ("acp" "{")
 628               ("acl" "{")
 629               ("aclp" "{")
 630               ("acsu" "{")
 631               ("aclu" "{")
 632               ("acused" "{")
 633               ("DLA" "{")
 634               ("RZ" "{")
 635               ("OM" "{")
 636               ("DL" "{")
 637               ("fixme" "{"))
 638             )
 639       )
 640     (setq font-latex-fontify-script nil)
 641     (setq font-latex-fontify-sectioning (quote color))
 642     (setq font-latex-script-display (quote (nil)))
 643   )
 644
 645 #+END_SRC
 646 ** ESS
 647 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 648   (use-package ess
 649     :ensure t
 650     :config
 651     (defun ess-change-directory (path)
 652       "Set the current working directory to PATH for both *R* and Emacs."
 653       (interactive "DDirectory to change to: ")
 654
 655       (when (file-exists-p path)
 656         (ess-command (concat "setwd(\"" path "\")\n"))
 657         ;; use file-name-as-directory to ensure it has trailing /
 658         (setq default-directory (file-name-as-directory path))))
 659     (add-hook 'ess-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 660     ;; outlining support for ess modes
 661     (add-hook
 662      'ess-mode-hook
 663      '(lambda ()
 664         (outline-minor-mode)
 665         (setq outline-regexp "\\(^#\\{4,5\\} \\)\\|\\(^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function\\)")
 666         (defun outline-level ()
 667           (cond ((looking-at "^##### ") 1)
 668                 ((looking-at "^#### ") 2)
 669                 ((looking-at "^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function(.*{") 3)
 670                 (t 1000)))
 671         ))
 672     (add-hook 'ess-mode-hook
 673               '(lambda ()
 674                  (local-set-key (kbd "C-c C-R")
 675                                 'dla/ess-region-remote-eval)))
 676
 677     ;; Don't restore history or save workspace image
 678     '(inferior-R-args "--no-restore-history --no-save")
 679     )
 680 #+END_SRC
 681
 682 ** Rainbowmode
 683 From http://julien.danjou.info/projects/emacs-packages#rainbow-mode, this colorizes color strings
 684
 685 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 686   (use-package rainbow-mode
 687     ;; add ess to the x major mode
 688     :config (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[S])
 689     (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[R])
 690   )
 691 #+END_SRC
 692
 693 ** Polymode
 694 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 695   (use-package polymode
 696     :config
 697     (use-package poly-R)
 698     (use-package poly-noweb)
 699     (use-package poly-markdown)
 700     :mode ("\\.Snw" . poly-noweb+r-mode)
 701     :mode ("\\.Rnw" . poly-noweb+r-mode)
 702     :mode ("\\.Rmd" . poly-markdown+r-mode)
 703     )
 704 #+END_SRC
 705
 706 ** Outlining
 707 *** Outline magic
 708 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 709   (use-package outline-magic)
 710 #+END_SRC
 711 ** Writeroom Mode
 712 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 713   (use-package writeroom-mode
 714     :config
 715     (defun my/writing-mode ()
 716       "Start my writing mode; enable visual-line-mode and auto-fill-mode"
 717       (interactive)
 718       (if writeroom-mode
 719           (progn
 720             (writeroom-mode -1)
 721             (visual-line-mode -1)
 722             (auto-fill-mode -1)
 723             (visual-fill-column-mode -1)
 724             )
 725         (visual-line-mode 1)
 726         (auto-fill-mode 1)
 727         (visual-fill-column-mode 1)
 728         (writeroom-mode 1))
 729       )
 730     )
 731 #+END_SRC
 732 ** GhostText/Atomic Chrome
 733 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 734   (use-package atomic-chrome
 735     :config
 736     (ignore-errors (atomic-chrome-start-server))
 737     (setq atomic-chrome-buffer-open-style 'full)
 738     )
 739 #+END_SRC
 740 ** Multiple Cursors
 741    :PROPERTIES:
 742    :ID:       6fcf218b-a762-4c37-9339-a8202ddeb544
 743    :END:
 744 [[https://github.com/magnars/multiple-cursors.el][Multiple Cursors]]
 745 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 746   (use-package multiple-cursors
 747     :bind (("C-;" . mc/mark-all-dwim)
 748            ("C-<" . mc/mark-previous-like-this)
 749            ("C->" . mc/mark-next-like-this)
 750            ("C-S-c C-S-c" . mc/edit-lines))
 751     )
 752 #+END_SRC
 753 ** Web Mode
 754 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 755   (use-package web-mode
 756     :config
 757     (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.tmpl\\'" . web-mode))
 758     (setq web-mode-enable-engine-detection t)
 759     (setq web-mode-engines-alist
 760           '(("template-toolkit" . "\\.tmpl\\'")))
 761     )
 762 #+END_SRC
 763 * Email
 764 ** Message Mode
 765 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 766   (use-package post
 767     :config
 768     (setq post-email-address "don@donarmstrong.com")
 769     (setq post-kill-quoted-sig nil)
 770     (setq post-mail-message "mutt\\(ng\\|\\)-[a-z0-9]+-[0-9]+-.*")
 771     (setq post-uses-fill-mode nil)
 772     )
 773 #+END_SRC
 774 * Org Mode
 775 ** Use-package and load things
 776 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 777
 778   (use-package org
 779     :config
 780
 781 #+END_SRC
 782 ** Agenda Configuration
 783 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 784   ;; The following lines are always needed. Choose your own keys.
 785   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\(org\\|org_archive\\|txt\\)$" . org-mode))
 786   (global-set-key "\C-cl" 'org-store-link)
 787   (global-set-key "\C-ca" 'org-agenda)
 788   (global-set-key "\C-cb" 'org-iswitchb)
 789   (setq-default org-log-done 'time)
 790   (setq-default org-agenda-ndays 5)
 791
 792   ;; agenda configuration
 793   ;; Do not dim blocked tasks
 794   (setq org-agenda-dim-blocked-tasks nil)
 795   (setq org-agenda-inhibit-startup t)
 796   (setq org-agenda-use-tag-inheritance nil)
 797
 798   ;; Compact the block agenda view
 799   (setq org-agenda-compact-blocks t)
 800
 801   ;; Custom agenda command definitions
 802   (setq org-agenda-custom-commands
 803         (quote (("N" "Notes" tags "NOTE"
 804                  ((org-agenda-overriding-header "Notes")
 805                   (org-tags-match-list-sublevels t)))
 806                 ("h" "Habits" tags-todo "STYLE=\"habit\""
 807                  ((org-agenda-overriding-header "Habits")
 808                   (org-agenda-sorting-strategy
 809                    '(todo-state-down effort-up category-keep))))
 810                 (" " "Agenda"
 811                  ((agenda "" nil)
 812                   (tags "REFILE"
 813                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Refile")
 814                          (org-tags-match-list-sublevels nil)))
 815                   (tags-todo "-CANCELLED/!"
 816                              ((org-agenda-overriding-header "Stuck Projects")
 817                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-stuck-projects)
 818                               (org-agenda-sorting-strategy
 819                                '(category-keep))))
 820                   (tags-todo "-HOLD-CANCELLED/!"
 821                              ((org-agenda-overriding-header "Projects")
 822                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-projects)
 823                               (org-tags-match-list-sublevels 'indented)
 824                               (org-agenda-sorting-strategy
 825                                '(category-keep))))
 826                   (tags-todo "-CANCELLED/!NEXT"
 827                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Next Tasks"
 828                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
 829                                                                         ""
 830                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
 831                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-projects-and-habits-and-single-tasks)
 832                               (org-tags-match-list-sublevels t)
 833                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 834                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 835                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 836                               (org-agenda-sorting-strategy
 837                                '(todo-state-down effort-up category-keep))))
 838                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
 839                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Subtasks"
 840                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
 841                                                                         ""
 842                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
 843                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-project-tasks)
 844                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 845                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 846                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 847                               (org-agenda-sorting-strategy
 848                                '(category-keep))))
 849                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
 850                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Standalone Tasks"
 851                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
 852                                                                         ""
 853                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
 854                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-project-tasks)
 855                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 856                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 857                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 858                               (org-agenda-sorting-strategy
 859                                '(category-keep))))
 860                   (tags-todo "-CANCELLED+WAITING|HOLD/!"
 861                              ((org-agenda-overriding-header "Waiting and Postponed Tasks")
 862                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-stuck-projects)
 863                               (org-tags-match-list-sublevels nil)
 864                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled t)
 865                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines t)))
 866                   (tags "-REFILE/"
 867                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Archive")
 868                          (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-archivable-tasks)
 869                          (org-tags-match-list-sublevels nil))))
 870                  nil))))
 871
 872   ; org mode agenda files
 873   (setq org-agenda-files
 874         (quote ("~/projects/org-notes/debbugs.org"
 875             "~/projects/org-notes/notes.org"
 876             "~/projects/org-notes/holidays.org"
 877             "~/projects/org-notes/refile.org"
 878             "~/projects/org-notes/diary.org"
 879             "~/projects/org-notes/ool.org"
 880             "~/projects/org-notes/sndservers.org"
 881             "~/projects/org-notes/chaim.org"
 882             "~/projects/org-notes/wildman.org"
 883             "~/projects/org-notes/uddin.org"
 884             "~/projects/org-notes/reviews.org"
 885             "~/projects/org-notes/hpcbio.org"
 886             "~/org-mode/from-mobile.org"
 887             "~/projects/org-notes/fh.org")))
 888
 889   (set-register ?n (cons 'file "~/projects/org-notes/notes.org"))
 890   (set-register ?r (cons 'file "~/projects/org-notes/refile.org"))
 891   (set-register ?o (cons 'file "~/projects/org-notes/ool.org"))
 892   (set-register ?s (cons 'file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
 893   (set-register ?c (cons 'file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
 894   (set-register ?w (cons 'file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
 895   (set-register ?u (cons 'file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
 896   (set-register ?R (cons 'file "~/projects/reviews/reviews.org"))
 897   (set-register ?d (cons 'file "~/projects/org-notes/diary.org"))
 898   ; from https://emacs.stackexchange.com/questions/909/how-can-i-have-an-agenda-timeline-view-of-multiple-files
 899   (defun org-agenda-timeline-all (&optional arg)
 900     (interactive "P")
 901     (with-temp-buffer
 902       (dolist (org-agenda-file org-agenda-files)
 903         (insert-file-contents org-agenda-file nil)
 904         (end-of-buffer)
 905         (newline))
 906       (write-file "/tmp/timeline.org")
 907       (org-agenda arg "L")))
 908   (define-key org-mode-map (kbd "C-c t") 'org-agenda-timeline-all)
 909   ;; add automatic reminders for appointments
 910   (defadvice  org-agenda-redo (after org-agenda-redo-add-appts)
 911     "Pressing `r' on the agenda will also add appointments."
 912     (progn
 913       (setq appt-time-msg-list nil)
 914       (org-agenda-to-appt)))
 915
 916 #+END_SRC
 917 ** General config
 918 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 919   (setq org-global-properties '(("Effort_ALL 0 0:10 0:30 1:00 2:00 3:00 4:00 5:00 6:00 7:00")))
 920   (setq org-columns-default-format "%40ITEM(Task) %6Effort{:} %CLOCKSUM %PRIORITY %TODO %13SCHEDULED %13DEADLINE %TAGS")
 921
 922   (setq org-default-notes-file "~/projects/org-notes/notes.org")
 923   (setq org-id-link-to-org-use-id 'use-existing)
 924 #+END_SRC
 925 ** Capture Templates
 926 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 927   (setq org-capture-templates  ;; mail-specific note template, identified by "m"
 928         '(("m" "Mail" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 929            "* %?\n\n  Source: %u, [[%:link][%:description]]\n  %:initial")
 930           ("t" "todo" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 931            "* TODO %?\n  :PROPERTIES:\n  :END:\n  :LOGBOOK:\n  :END:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 932           ("r" "respond" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 933            "* NEXT Respond to %:from on %:subject\nSCHEDULED: %t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t :immediate-finish t)
 934           ("n" "note" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 935            "* %? :NOTE:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 936           ("s" "schedule" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 937            "* %? :cal:\n%^{scheduled:}t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 938           ("j" "Journal" entry (file+datetree "~/projects/org-notes/diary.org")
 939            "* %?\n%U\n" :clock-in t :clock-resume t)
 940           ("w" "org-protocol" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 941            "* TODO Review %c\n%U\n" :immediate-finish t)
 942           ("M" "Meeting" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 943            "* MEETING with %? :MEETING:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 944           ("S" "Seminar" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 945            "* SEMINAR notes %? :SEMINAR:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 946           ("P" "Paper to read" entry (file+headline "~/projects/research/papers_to_read.org" "Refile")
 947            "* TODO Get/Read %? \n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 948           ("p" "Phone call" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 949            "* PHONE %? :PHONE:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 950           ("J" "job" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 951            "* TODO Apply for %a%? :job:\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d 17:00-17:30>\")\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 952           ("h" "Habit" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 953            "* NEXT %?\n%U\n%a\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d .+1d/3d>\")\n:PROPERTIES:\n:STYLE: habit\n:REPEAT_TO_STATE: NEXT\n:END:\n%a\n")
 954           )
 955         )
 956
 957   ;; Remove empty LOGBOOK drawers on clock out
 958   (defun bh/remove-empty-drawer-on-clock-out ()
 959     (interactive)
 960     (save-excursion
 961       (beginning-of-line 0)
 962       (org-remove-empty-drawer-at (point))))
 963
 964   (defun my/org-add-id ()
 965     (interactive)
 966     (save-excursion
 967       (if (org-current-level)
 968           ()
 969         (forward-char 1)
 970         )
 971       (org-id-get-create)
 972       )
 973   )
 974
 975 #+END_SRC
 976 ** Org mode key bindings
 977 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 978   ; org mode configuration from http://doc.norang.ca/org-mode.html
 979   ;; Custom Key Bindings
 980   (global-set-key (kbd "<f12>") 'org-agenda)
 981   (global-set-key (kbd "<f5>") 'bh/org-todo)
 982   (global-set-key (kbd "<S-f5>") 'bh/widen)
 983   (global-set-key (kbd "<f7>") 'bh/set-truncate-lines)
 984   (global-set-key (kbd "<f8>") 'org-cycle-agenda-files)
 985   (global-set-key (kbd "<f9> <f9>") 'bh/show-org-agenda)
 986   (global-set-key (kbd "<f9> b") 'bbdb)
 987   (global-set-key (kbd "<f9> c") 'calendar)
 988   (global-set-key (kbd "<f9> f") 'boxquote-insert-file)
 989   (global-set-key (kbd "<f9> h") 'bh/hide-other)
 990   (global-set-key (kbd "<f9> n") 'bh/toggle-next-task-display)
 991   (global-set-key (kbd "<f9> w") 'widen)
 992
 993   ; change the outline mode prefix from C-c @ to C-c C-2
 994   (setq outline-minor-mode-prefix "C-c C-2")
 995   ;(add-hook 'outline-minor-mode-hook
 996   ;          (lambda () (local-set-key (kbd "C-c C-2")
 997   ;                                    outline-mode-prefix-map)))
 998
 999   (global-set-key (kbd "<f9> I") 'bh/punch-in)
1000   (global-set-key (kbd "<f9> O") 'bh/punch-out)
1001
1002   (global-set-key (kbd "<f9> o") 'bh/make-org-scratch)
1003
1004   (global-set-key (kbd "<f9> r") 'boxquote-region)
1005   (global-set-key (kbd "<f9> s") 'bh/switch-to-scratch)
1006
1007   (global-set-key (kbd "<f9> t") 'bh/insert-inactive-timestamp)
1008   (global-set-key (kbd "<f9> T") 'bh/toggle-insert-inactive-timestamp)
1009
1010   (global-set-key (kbd "<f9> v") 'visible-mode)
1011   (global-set-key (kbd "<f9> l") 'org-toggle-link-display)
1012   (global-set-key (kbd "<f9> SPC") 'bh/clock-in-last-task)
1013   (global-set-key (kbd "C-<f9>") 'previous-buffer)
1014   (global-set-key (kbd "M-<f9>") 'org-toggle-inline-images)
1015   (global-set-key (kbd "C-x n r") 'narrow-to-region)
1016   (global-set-key (kbd "C-<f10>") 'next-buffer)
1017   (global-set-key (kbd "<f11>") 'org-clock-goto)
1018   (global-set-key (kbd "C-<f11>") 'org-clock-in)
1019   (global-set-key (kbd "C-s-<f12>") 'bh/save-then-publish)
1020   (global-set-key (kbd "C-c c") 'org-capture)
1021
1022 #+END_SRC
1023 ** Utility Functions
1024 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1025   (defun bh/hide-other ()
1026     (interactive)
1027     (save-excursion
1028       (org-back-to-heading 'invisible-ok)
1029       (hide-other)
1030       (org-cycle)
1031       (org-cycle)
1032       (org-cycle)))
1033
1034   (defun bh/set-truncate-lines ()
1035     "Toggle value of truncate-lines and refresh window display."
1036     (interactive)
1037     (setq truncate-lines (not truncate-lines))
1038     ;; now refresh window display (an idiom from simple.el):
1039     (save-excursion
1040       (set-window-start (selected-window)
1041                         (window-start (selected-window)))))
1042
1043   (defun bh/make-org-scratch ()
1044     (interactive)
1045     (find-file "/tmp/publish/scratch.org")
1046     (gnus-make-directory "/tmp/publish"))
1047
1048   (defun bh/switch-to-scratch ()
1049     (interactive)
1050     (switch-to-buffer "*scratch*"))
1051
1052   (setq org-use-fast-todo-selection t)
1053   (setq org-treat-S-cursor-todo-selection-as-state-change nil)
1054
1055   ; create function to create headlines in file. This comes from
1056   ; http://stackoverflow.com/questions/13340616/assign-ids-to-every-entry-in-org-mode
1057   (defun my/org-add-ids-to-headlines-in-file ()
1058     "Add ID properties to all headlines in the current file which
1059   do not already have one."
1060     (interactive)
1061     (org-map-entries 'org-id-get-create))
1062   ; if we wanted to do this to every buffer, do the following:
1063   ; (add-hook 'org-mode-hook
1064   ;           (lambda ()
1065   ;             (add-hook 'before-save-hook 'my/org-add-ids-to-headlines-in-file nil 'local)))
1066 #+END_SRC
1067 ** Keywords (TODO)
1068 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1069   (setq org-todo-keywords
1070         (quote ((sequence "TODO(t)" "NEXT(n)" "|" "DONE(d)")
1071                 (sequence "WAITING(w@/!)" "HOLD(h@/!)" "|" "CANCELLED(c@/!)" "PHONE" "MEETING"))))
1072
1073   (setq org-todo-keyword-faces
1074         (quote (("TODO" :foreground "red" :weight bold)
1075                 ("NEXT" :foreground "blue" :weight bold)
1076                 ("DONE" :foreground "forest green" :weight bold)
1077                 ("WAITING" :foreground "orange" :weight bold)
1078                 ("HOLD" :foreground "magenta" :weight bold)
1079                 ("CANCELLED" :foreground "forest green" :weight bold)
1080                 ("MEETING" :foreground "forest green" :weight bold)
1081                 ("PHONE" :foreground "forest green" :weight bold))))
1082
1083   (setq org-todo-state-tags-triggers
1084         (quote (("CANCELLED" ("CANCELLED" . t))
1085                 ("WAITING" ("WAITING" . t))
1086                 ("HOLD" ("WAITING") ("HOLD" . t))
1087                 (done ("WAITING") ("HOLD"))
1088                 ("TODO" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1089                 ("NEXT" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1090                 ("DONE" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD")))))
1091
1092
1093
1094   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/remove-empty-drawer-on-clock-out 'append)
1095   ; add ids on creation of nodes
1096   (add-hook 'org-capture-prepare-finalize-hook 'my/org-add-id)
1097
1098
1099   ; resolve clocks after 10 minutes of idle; use xprintidle
1100   ; (setq org-clock-idle-time 10)
1101   ; (setq org-clock-x11idle-program-name "xprintidle")
1102
1103   ; this is from http://doc.norang.ca/org-mode.html#Capture
1104   ; use C-M-r for org mode capture
1105   (global-set-key (kbd "C-M-r") 'org-capture)
1106
1107   ; Targets include this file and any file contributing to the agenda - up to 9 levels deep
1108   (setq org-refile-targets (quote ((nil :maxlevel . 9)
1109                                    (org-agenda-files :maxlevel . 9))))
1110
1111   ; Use full outline paths for refile targets - we file directly with IDO
1112   (setq org-refile-use-outline-path t)
1113
1114   ; Targets complete directly with IDO
1115   (setq org-outline-path-complete-in-steps nil)
1116
1117   ; Allow refile to create parent tasks with confirmation
1118   (setq org-refile-allow-creating-parent-nodes (quote confirm))
1119
1120   ; ; Use IDO for both buffer and file completion and ido-everywhere to t
1121   ; (setq org-completion-use-ido t)
1122   ; (setq ido-everywhere t)
1123   ; (setq ido-max-directory-size 100000)
1124   ; (ido-mode (quote both))
1125   ; ; Use the current window when visiting files and buffers with ido
1126   ; (setq ido-default-file-method 'selected-window)
1127   ; (setq ido-default-buffer-method 'selected-window)
1128   ; ; Use the current window for indirect buffer display
1129   ; (setq org-indirect-buffer-display 'current-window)
1130
1131
1132   ;;;; Refile settings
1133   ; Exclude DONE state tasks from refile targets
1134   (defun bh/verify-refile-target ()
1135     "Exclude todo keywords with a done state from refile targets"
1136     (not (member (nth 2 (org-heading-components)) org-done-keywords)))
1137
1138   (setq org-refile-target-verify-function 'bh/verify-refile-target)
1139
1140   ;; ensure that emacsclient will show just the note to be edited when invoked
1141   ;; from Mutt, and that it will shut down emacsclient once finished;
1142   ;; fallback to legacy behavior when not invoked via org-protocol.
1143   (require 'org-protocol)
1144   ; (add-hook 'org-capture-mode-hook 'delete-other-windows)
1145   (setq my-org-protocol-flag nil)
1146   (defadvice org-capture-finalize (after delete-frame-at-end activate)
1147     "Delete frame at remember finalization"
1148     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1149            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1150   (defadvice org-capture-refile (around delete-frame-after-refile activate)
1151     "Delete frame at remember refile"
1152     (if my-org-protocol-flag
1153         (progn
1154           (setq my-org-protocol-flag nil)
1155           ad-do-it
1156           (delete-frame))
1157       ad-do-it)
1158     )
1159   (defadvice org-capture-kill (after delete-frame-at-end activate)
1160     "Delete frame at remember abort"
1161     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1162            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1163   (defadvice org-protocol-capture (before set-org-protocol-flag activate)
1164     (setq my-org-protocol-flag t))
1165
1166   (defadvice org-insert-todo-heading (after dla/create-id activate)
1167     (org-id-get-create)
1168     )
1169
1170   ;; org modules
1171   (add-to-list 'org-modules 'org-habit)
1172
1173   ; this comes from http://upsilon.cc/~zack/blog/posts/2010/02/integrating_Mutt_with_Org-mode/
1174   (defun open-mail-in-mutt (message)
1175     "Open a mail message in Mutt, using an external terminal.
1176
1177   Message can be specified either by a path pointing inside a
1178   Maildir, or by Message-ID."
1179     (interactive "MPath or Message-ID: ")
1180     (shell-command
1181      (format "faf xterm -e \"%s %s\""
1182          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/mutt_open") message)))
1183
1184   ;; add support for "mutt:ID" links
1185   (org-add-link-type "mutt" 'open-mail-in-mutt)
1186
1187   (defun my-org-mode-setup ()
1188     ; (load-library "reftex")
1189     (and (buffer-file-name)
1190          (file-exists-p (buffer-file-name))
1191          (progn
1192            ; (reftex-parse-all)
1193            (reftex-set-cite-format
1194             '((?b . "[[bib:%l][%l-bib]]")
1195               (?n . "[[notes:%l][%l-notes]]")
1196               (?c . "\\cite{%l}")
1197               (?h . "*** %t\n:PROPERTIES:\n:Custom_ID: %l\n:END:\n[[papers:%l][%l xoj]] [[papers-pdf:%l][pdf]]")))
1198            ))
1199     (define-key org-mode-map (kbd "C-c )") 'reftex-citation)
1200     (define-key org-mode-map (kbd "C-c [") 'reftex-citation)
1201     (define-key org-mode-map (kbd "C-c (") 'org-mode-reftex-search)
1202     (define-key org-mode-map (kbd "C-c 0") 'reftex-view-crossref)
1203     )
1204   (add-hook 'org-mode-hook 'my-org-mode-setup)
1205
1206   (defun org-mode-reftex-search ()
1207     (interactive)
1208     (org-open-link-from-string (format "[[notes:%s]]" (first (reftex-citation t)))))
1209
1210   (defun open-research-paper (bibtexkey)
1211     "Open a paper by bibtex key"
1212     (interactive "bibtex key: ")
1213     (shell-command
1214      (format "%s %s"
1215          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1216   (org-add-link-type "papers" 'open-research-paper)
1217   (defun open-research-paper-pdf (bibtexkey)
1218     "Open a paper pdf by bibtex key"
1219     (interactive "bibtex key: ")
1220     (shell-command
1221      (format "%s -p evince_annot %s"
1222          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1223   (org-add-link-type "papers-pdf" 'open-research-paper-pdf)
1224
1225   (add-to-list 'org-link-abbrev-alist
1226                '("notes" .
1227                  "~/projects/research/paper_notes.org::#%s"))
1228
1229   ; I pretty much always want hiearchical checkboxes
1230   (setq org-hierachical-checkbox-statistics nil)
1231
1232   ;; Add \begin{equation}\end{equation} templates to the org mode easy templates
1233   (add-to-list 'org-structure-template-alist
1234                '("E" "\\begin{equation}\n?\n\\end{equation}"))
1235
1236    ;; stolen from
1237   ;; http://www-public.it-sudparis.eu/~berger_o/weblog/2012/03/23/how-to-manage-and-export-bibliographic-notesrefs-in-org-mode/
1238   (defun my-rtcite-export-handler (path desc format)
1239     (message "my-rtcite-export-handler is called : path = %s, desc = %s, format = %s" path desc format)
1240     (let* ((search (when (string-match "::#?\\(.+\\)\\'" path)
1241                      (match-string 1 path)))
1242            (path (substring path 0 (match-beginning 0))))
1243       (cond ((eq format 'latex)
1244              (if (or (not desc)
1245                      (equal 0 (search "rtcite:" desc)))
1246                  (format "\\cite{%s}" search)
1247                (format "\\cite[%s]{%s}" desc search))))))
1248
1249   (org-add-link-type "rtcite"
1250                      'org-bibtex-open
1251                      'my-rtcite-export-handler)
1252
1253
1254 #+END_SRC
1255 ** Org Mobile Configuration
1256 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1257   (setq-default org-mobile-directory "/linnode.donarmstrong.com:/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/")
1258   (when (string= system-name "linnode")
1259     (setq-default org-mobile-directory "/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/"))
1260   (setq-default org-directory "/home/don/org-mode/")
1261   (setq-default org-mobile-inbox-for-pull "/home/don/org-mode/from-mobile.org")
1262
1263 #+END_SRC
1264 ** Org iCal Support
1265 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1266   ;; org mode ical export
1267   (setq org-icalendar-timezone "America/Los_Angeles")
1268   (setq org-icalendar-use-scheduled '(todo-start event-if-todo))
1269   ;; we already add the id manually
1270   (setq org-icalendar-store-UID t)
1271
1272 #+END_SRC
1273 ** General Org Babel Configuration
1274 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1275   ;; org babel support
1276   (org-babel-do-load-languages
1277    'org-babel-load-languages
1278    '((emacs-lisp . t )
1279      (R . t)
1280      (latex . t)
1281      (ditaa . t)
1282      (dot . t)
1283      ))
1284   ;; use graphviz-dot for dot things
1285   (add-to-list 'org-src-lang-modes '("dot" . graphviz-dot))
1286   ;; org-babel-by-backend
1287   (defmacro org-babel-by-backend (&rest body)
1288      `(case (if (boundp 'backend)
1289                 (org-export-backend-name backend)
1290               nil) ,@body))
1291
1292   (defun my/fix-inline-images ()
1293     (when org-inline-image-overlays
1294       (org-redisplay-inline-images)))
1295
1296   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook
1297              'my/fix-inline-images)
1298
1299 #+END_SRC
1300 ** LaTeX configuration
1301    :PROPERTIES:
1302    :ID:       7135ba17-6a50-4eed-84ca-b90afa5b12f8
1303    :END:
1304 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1305   (require 'ox-latex)
1306   (add-to-list 'org-latex-classes
1307            '("memarticle"
1308          "\\documentclass[11pt,oneside,article]{memoir}\n"
1309          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1310          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1311          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1312          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1313          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1314
1315   (setq org-beamer-outline-frame-options "")
1316   (add-to-list 'org-latex-classes
1317            '("beamer"
1318          "\\documentclass[ignorenonframetext]{beamer}
1319   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1320   [PACKAGES]
1321   [EXTRA]"
1322          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1323          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1324          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1325          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1326          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1327
1328   (add-to-list 'org-latex-classes
1329            '("membook"
1330          "\\documentclass[11pt,oneside]{memoir}\n"
1331          ("\\chapter{%s}" . "\\chapter*{%s}")
1332          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1333          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1334          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")))
1335
1336   (add-to-list 'org-latex-classes
1337            '("letter"
1338          "\\documentclass[11pt]{letter}
1339   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1340   [PACKAGES]
1341   [EXTRA]"
1342      ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1343          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1344          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1345          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1346          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1347
1348   (add-to-list 'org-latex-classes
1349            '("dlacv"
1350          "\\documentclass{dlacv}
1351   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1352   [NO-PACKAGES]
1353   [NO-EXTRA]"
1354          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1355          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1356          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1357          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1358          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1359
1360
1361   (add-to-list 'org-latex-classes
1362            '("dlaresume"
1363          "\\documentclass{dlaresume}
1364   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1365   [NO-PACKAGES]
1366   [NO-EXTRA]"
1367          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1368          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1369          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1370          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1371          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1372
1373
1374   ;; Originally taken from Bruno Tavernier: http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/31150/focus=31432
1375   ;; but adapted to use latexmk 4.22 or higher.
1376   (setq org-latex-pdf-process '("latexmk -f -pdflatex=xelatex -bibtex -use-make -pdf %f"))
1377
1378   ;; Default packages included in /every/ tex file, latex, pdflatex or xelatex
1379   (setq org-latex-default-packages-alist
1380     '(("" "amsmath" t)
1381       ("" "unicode-math" t)
1382       ))
1383   (setq org-latex-packages-alist
1384     '(("" "graphicx" t)
1385       ("" "fontspec" t)
1386       ("" "xunicode" t)
1387       ("" "hyperref" t)
1388       ("" "url" t)
1389       ("" "rotating" t)
1390       ("" "longtable" nil)
1391       ("" "float" )))
1392
1393   ;; make equations larger
1394   (setq org-format-latex-options (plist-put org-format-latex-options :scale 2.0))
1395
1396   (defun org-create-formula--latex-header ()
1397     "Return LaTeX header appropriate for previewing a LaTeX snippet."
1398     (let ((info (org-combine-plists (org-export--get-global-options
1399              (org-export-get-backend 'latex))
1400             (org-export--get-inbuffer-options
1401              (org-export-get-backend 'latex)))))
1402       (org-latex-guess-babel-language
1403        (org-latex-guess-inputenc
1404     (org-splice-latex-header
1405      org-format-latex-header
1406      org-latex-default-packages-alist
1407      nil t
1408      (plist-get info :latex-header)))
1409        info)))
1410
1411
1412   ; support ignoring headers in org mode export to latex
1413   ; from http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/67692
1414   (defadvice org-latex-headline (around my-latex-skip-headlines
1415                     (headline contents info) activate)
1416     (if (member "ignoreheading" (org-element-property :tags headline))
1417     (setq ad-return-value contents)
1418       ad-do-it))
1419
1420   ;; keep latex logfiles
1421
1422   (setq org-latex-remove-logfiles nil)
1423
1424   ;; Resume clocking task when emacs is restarted
1425   (org-clock-persistence-insinuate)
1426   ;;
1427   ;; Show lot of clocking history so it's easy to pick items off the C-F11 list
1428   (setq org-clock-history-length 23)
1429   ;; Resume clocking task on clock-in if the clock is open
1430   (setq org-clock-in-resume t)
1431   ;; Change tasks to NEXT when clocking in; this avoids clocking in when
1432   ;; there are things like PHONE calls
1433   (setq org-clock-in-switch-to-state 'bh/clock-in-to-next)
1434   ;; Separate drawers for clocking and logs
1435   (setq org-drawers (quote ("PROPERTIES" "LOGBOOK")))
1436   ;; Save clock data and state changes and notes in the LOGBOOK drawer
1437   (setq org-clock-into-drawer t)
1438   (setq org-log-into-drawer t)
1439   ;; Sometimes I change tasks I'm clocking quickly - this removes clocked tasks with 0:00 duration
1440   (setq org-clock-out-remove-zero-time-clocks t)
1441   ;; Clock out when moving task to a done state
1442   (setq org-clock-out-when-done t)
1443   ;; Save the running clock and all clock history when exiting Emacs, load it on startup
1444   (setq org-clock-persist t)
1445   ;; Do not prompt to resume an active clock
1446   (setq org-clock-persist-query-resume nil)
1447   ;; Enable auto clock resolution for finding open clocks
1448   (setq org-clock-auto-clock-resolution (quote when-no-clock-is-running))
1449   ;; Include current clocking task in clock reports
1450   (setq org-clock-report-include-clocking-task t)
1451
1452   ;; the cache seems to be broken
1453   (setq org-element-use-cache nil)
1454
1455   (defvar bh/keep-clock-running nil)
1456
1457   (defun bh/is-task-p ()
1458     "Any task with a todo keyword and no subtask"
1459     (save-restriction
1460       (widen)
1461       (let ((has-subtask)
1462             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1463             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1464         (save-excursion
1465           (forward-line 1)
1466           (while (and (not has-subtask)
1467                       (< (point) subtree-end)
1468                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1469             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1470               (setq has-subtask t))))
1471         (and is-a-task (not has-subtask)))))
1472   (defun bh/is-project-p ()
1473     "Any task with a todo keyword subtask"
1474     (save-restriction
1475       (widen)
1476       (let ((has-subtask)
1477             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1478             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1479         (save-excursion
1480           (forward-line 1)
1481           (while (and (not has-subtask)
1482                       (< (point) subtree-end)
1483                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1484             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1485               (setq has-subtask t))))
1486         (and is-a-task has-subtask))))
1487
1488   (defun bh/is-subproject-p ()
1489     "Any task which is a subtask of another project"
1490     (let ((is-subproject)
1491           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1492       (save-excursion
1493         (while (and (not is-subproject) (org-up-heading-safe))
1494           (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1495             (setq is-subproject t))))
1496       (and is-a-task is-subproject)))
1497
1498
1499   (defun bh/clock-in-to-next (kw)
1500     "Switch a task from TODO to NEXT when clocking in.
1501   Skips capture tasks, projects, and subprojects.
1502   Switch projects and subprojects from NEXT back to TODO"
1503     (when (not (and (boundp 'org-capture-mode) org-capture-mode))
1504       (cond
1505        ((and (member (org-get-todo-state) (list "TODO"))
1506          (bh/is-task-p))
1507     "NEXT")
1508        ((and (member (org-get-todo-state) (list "NEXT"))
1509          (bh/is-project-p))
1510     "TODO"))))
1511
1512   (defun bh/punch-in (arg)
1513     "Start continuous clocking and set the default task to the
1514   selected task.  If no task is selected set the Organization task
1515   as the default task."
1516     (interactive "p")
1517     (setq bh/keep-clock-running t)
1518     (if (equal major-mode 'org-agenda-mode)
1519     ;;
1520     ;; We're in the agenda
1521     ;;
1522     (let* ((marker (org-get-at-bol 'org-hd-marker))
1523            (tags (org-with-point-at marker (org-get-tags-at))))
1524       (if (and (eq arg 4) tags)
1525           (org-agenda-clock-in '(16))
1526         (bh/clock-in-organization-task-as-default)))
1527       ;;
1528       ;; We are not in the agenda
1529       ;;
1530       (save-restriction
1531     (widen)
1532     ; Find the tags on the current task
1533     (if (and (equal major-mode 'org-mode) (not (org-before-first-heading-p)) (eq arg 4))
1534         (org-clock-in '(16))
1535       (bh/clock-in-organization-task-as-default)))))
1536
1537   (defun bh/punch-out ()
1538     (interactive)
1539     (setq bh/keep-clock-running nil)
1540     (when (org-clock-is-active)
1541       (org-clock-out))
1542     (org-agenda-remove-restriction-lock))
1543
1544   (defun bh/clock-in-default-task ()
1545     (save-excursion
1546       (org-with-point-at org-clock-default-task
1547     (org-clock-in))))
1548
1549   (defun bh/clock-in-parent-task ()
1550     "Move point to the parent (project) task if any and clock in"
1551     (let ((parent-task))
1552       (save-excursion
1553     (save-restriction
1554       (widen)
1555       (while (and (not parent-task) (org-up-heading-safe))
1556         (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1557           (setq parent-task (point))))
1558       (if parent-task
1559           (org-with-point-at parent-task
1560         (org-clock-in))
1561         (when bh/keep-clock-running
1562           (bh/clock-in-default-task)))))))
1563
1564   (defvar bh/organization-task-id "e22cb8bf-07c7-408b-8f60-ff3aadac95e4")
1565
1566   (defun bh/clock-in-organization-task-as-default ()
1567     (interactive)
1568     (org-with-point-at (org-id-find bh/organization-task-id 'marker)
1569       (org-clock-in '(16))))
1570
1571   (defun bh/clock-out-maybe ()
1572     (when (and bh/keep-clock-running
1573            (not org-clock-clocking-in)
1574            (marker-buffer org-clock-default-task)
1575            (not org-clock-resolving-clocks-due-to-idleness))
1576       (bh/clock-in-parent-task)))
1577
1578   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/clock-out-maybe 'append)
1579
1580   (require 'org-id)
1581   (defun bh/clock-in-task-by-id (id)
1582     "Clock in a task by id"
1583     (org-with-point-at (org-id-find id 'marker)
1584       (org-clock-in nil)))
1585
1586   (defun bh/clock-in-last-task (arg)
1587     "Clock in the interrupted task if there is one
1588   Skip the default task and get the next one.
1589   A prefix arg forces clock in of the default task."
1590     (interactive "p")
1591     (let ((clock-in-to-task
1592        (cond
1593         ((eq arg 4) org-clock-default-task)
1594         ((and (org-clock-is-active)
1595           (equal org-clock-default-task (cadr org-clock-history)))
1596          (caddr org-clock-history))
1597         ((org-clock-is-active) (cadr org-clock-history))
1598         ((equal org-clock-default-task (car org-clock-history)) (cadr org-clock-history))
1599         (t (car org-clock-history)))))
1600       (widen)
1601       (org-with-point-at clock-in-to-task
1602     (org-clock-in nil))))
1603
1604
1605   (defun org-export-to-ods ()
1606     (interactive)
1607     (let ((csv-file "data.csv"))
1608       (org-table-export csv-file "orgtbl-to-csv")
1609       (org-odt-convert csv-file "ods" 'open)))
1610
1611   ; allow for zero-width-space to be a break in regexp too
1612   ; (setcar org-emphasis-regexp-components " [:space:] \t('\"{")
1613   ; (setcar (nthcdr 1 org-emphasis-regexp-components) " [:space:]- \t.,:!?;'\")}\\")
1614   ; (org-set-emph-re 'org-emphasis-regexp-components org-emphasis-regexp-components)
1615
1616   ;; support inserting screen shots
1617   (defun my/org-insert-screenshot ()
1618     "Take a screenshot into a time stamped unique-named file in the
1619   same directory as the org-buffer and insert a link to this file."
1620     (interactive)
1621     (defvar my/org-insert-screenshot/filename)
1622     (setq my/org-insert-screenshot/filename
1623       (read-file-name
1624        "Screenshot to insert: "
1625        nil
1626        (concat (buffer-file-name) "_" (format-time-string "%Y%m%d_%H%M%S") ".png")
1627        )
1628       )
1629     (call-process "import" nil nil nil my/org-insert-screenshot/filename)
1630     (insert (concat "[[" my/org-insert-screenshot/filename "]]"))
1631     (org-display-inline-images))
1632
1633   (defun my/fix-inline-images ()
1634     (when org-inline-image-overlays
1635       (org-redisplay-inline-images)))
1636
1637   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook 'my/fix-inline-images)
1638
1639   ;; use xelatex to preview with imagemagick
1640   (add-to-list 'org-preview-latex-process-alist
1641            '(xelateximagemagick
1642         :programs ("xelatex" "convert")
1643         :description "pdf > png"
1644         :message "you need to install xelatex and imagemagick"
1645         :use-xcolor t
1646         :image-input-type "pdf"
1647         :image-output-type "png"
1648         :image-size-adjust (1.0 . 1.0)
1649         :latex-compiler ("xelatex -interaction nonstopmode -output-directory %o %f")
1650         :image-converter ("convert -density %D -trim -antialias %f -quality 100 %O"))
1651            )
1652   ;; use xelatex by default
1653   (setq org-preview-latex-default-process 'xelateximagemagick)
1654
1655   ; from http://orgmode.org/Changes.html
1656   (defun my/org-repair-property-drawers ()
1657     "Fix properties drawers in current buffer.
1658    Ignore non Org buffers."
1659     (interactive)
1660     (when (eq major-mode 'org-mode)
1661       (org-with-wide-buffer
1662        (goto-char (point-min))
1663        (let ((case-fold-search t)
1664          (inline-re (and (featurep 'org-inlinetask)
1665                  (concat (org-inlinetask-outline-regexp)
1666                      "END[ \t]*$"))))
1667      (org-map-entries
1668       (lambda ()
1669         (unless (and inline-re (org-looking-at-p inline-re))
1670           (save-excursion
1671         (let ((end (save-excursion (outline-next-heading) (point))))
1672           (forward-line)
1673           (when (org-looking-at-p org-planning-line-re) (forward-line))
1674           (when (and (< (point) end)
1675                  (not (org-looking-at-p org-property-drawer-re))
1676                  (save-excursion
1677                    (and (re-search-forward org-property-drawer-re end t)
1678                     (eq (org-element-type
1679                      (save-match-data (org-element-at-point)))
1680                     'drawer))))
1681             (insert (delete-and-extract-region
1682                  (match-beginning 0)
1683                  (min (1+ (match-end 0)) end)))
1684             (unless (bolp) (insert "\n"))))))))))))
1685
1686 #+END_SRC
1687 ** Org-Gcal
1688 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1689   (use-package calfw
1690     :ensure f
1691     )
1692   (use-package calfw-org
1693     :ensure f
1694     )
1695   (use-package org-gcal
1696     :ensure f
1697     :config '((if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
1698                   (load-file "~/.hide/org_gcal.el"))
1699               )
1700     )
1701 #+END_SRC
1702 ** End use-package
1703 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1704   )
1705 #+END_SRC
1706 * Keybindings
1707 ** Override other things
1708 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1709   ; apparently things like to step on C-;, so we'll use a hack from
1710   ; http://stackoverflow.com/questions/683425/globally-override-key-binding-in-emacs/5340797#5340797 to fix this
1711
1712   (defvar my-keys-minor-mode-map (make-keymap) "my-keys-minor-mode keymap.")
1713
1714   ; use mc everywhere
1715   (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'mc/mark-all-dwim)
1716   ;; use outline mode keybindings everywhere
1717   ;; (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'my/mydra-outline/body)
1718
1719   (define-minor-mode my-keys-minor-mode
1720     "A minor mode so that my key settings override annoying major modes."
1721     t " my-keys" 'my-keys-minor-mode-map)
1722
1723   (my-keys-minor-mode 1)
1724   (defun my-minibuffer-setup-hook ()
1725     (my-keys-minor-mode 0))
1726
1727   (add-hook 'minibuffer-setup-hook 'my-minibuffer-setup-hook)
1728   (defadvice load (after give-my-keybindings-priority)
1729     "Try to ensure that my keybindings always have priority."
1730     (if (not (eq (car (car minor-mode-map-alist)) 'my-keys-minor-mode))
1731         (let ((mykeys (assq 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)))
1732           (assq-delete-all 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)
1733           (add-to-list 'minor-mode-map-alist mykeys))))
1734   (ad-activate 'load)
1735 #+END_SRC
1736 ** Goto line
1737 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1738   (global-unset-key "\M-g")
1739   (global-set-key (kbd "M-g l") 'goto-line)
1740 #+END_SRC
1741 * Misc (uncharacterized)
1742 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1743   (setq calendar-latitude 40.11)
1744   (setq calendar-longitude -88.24)
1745   (setq case-fold-search t)
1746   (setq confirm-kill-emacs (quote y-or-n-p))
1747   (setq cperl-lazy-help-time nil)
1748   (setq debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
1749   (display-time)
1750   (setq display-time-24hr-format t)
1751   (setq display-time-day-and-date t)
1752   (display-time-mode 1)
1753   (setq font-latex-fontify-script nil)
1754   (setq font-latex-fontify-sectioning (quote color))
1755   (setq font-latex-script-display (quote (nil)))
1756   (global-auto-revert-mode 1)
1757   (global-font-lock-mode 1)
1758   (icomplete-mode 1)
1759   (setq log-edit-keep-buffer t)
1760   (setq mail-user-agent (quote sendmail-user-agent))
1761   (setq markdown-enable-math t)
1762   (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
1763   (setq mutt-alias-file-list (quote ("~/.mutt/aliases" "~/.mail_aliases")))
1764   (setq ps-footer-font-size (quote (8 . 10)))
1765   (setq ps-header-font-size (quote (8 . 10)))
1766   (setq ps-header-title-font-size (quote (10 . 10)))
1767   (setq ps-line-number-color "blue")
1768   (setq ps-print-footer t)
1769   (setq ps-print-footer-frame nil)
1770   (setq ps-print-only-one-header t)
1771   (setq sentence-end "[.?!][]\"')]*\\($\\|   \\| \\)[
1772   ]*")
1773   (setq sentence-end-double-space nil)
1774   ; enable matching parenthesis
1775   (show-paren-mode 1)
1776   (tool-bar-mode -1)
1777   (setq user-mail-address "don@donarmstrong.com")
1778   (setq vc-delete-logbuf-window nil)
1779   (setq vc-follow-symlinks t)
1780
1781   ;; use git before SVN; use CVS earlier, because I have CVS
1782   ;; repositories inside of git directories
1783   (setq vc-handled-backends (quote (CVS Git RCS SVN SCCS Bzr Hg Mtn Arch)))
1784
1785   ;; switch back to the old primary selection method
1786   (setq x-select-enable-clipboard nil)
1787   (setq x-select-enable-primary t)
1788   ; (setq mouse-drag-copy-region t)
1789
1790   (fset 'perl-mode 'cperl-mode)
1791   ;;(load-file "cperl-mode.el")
1792
1793   (require 'vcl-mode)
1794
1795   (global-set-key "\C-xp" 'server-edit)
1796
1797   (setq-default auto-mode-alist (cons '("\.wml$" .
1798                     (lambda () (html-mode) (auto-fill-mode)))
1799                   auto-mode-alist))
1800
1801
1802   ; use markdown mode for mdwn files
1803   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.mdwn$" . markdown-mode))
1804   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.md$" . markdown-mode))
1805
1806
1807   ;; tramp configuration
1808   (setq tramp-use-ssh-controlmaster-options nil)
1809
1810   ; mail configuration
1811   (add-to-list 'auto-mode-alist '("muttng-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode))
1812   (add-to-list 'auto-mode-alist '("muttngrc" . muttrc-mode))
1813
1814   (add-to-list 'auto-mode-alist '("mutt-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode))
1815   (add-to-list 'auto-mode-alist '("muttrc" . muttrc-mode))
1816   (defun my-message-mode-settings ()
1817     (font-lock-add-keywords nil
1818                             '(("^[ \t]*>[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1819                                (0 'message-multiply-quoted-text-face))
1820                               ("^[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1821                                (0 'message-double-quoted-text-face))))
1822     (local-set-key (kbd "C-c C-a") 'my-post-attach-file)
1823     )
1824   (add-hook 'message-mode-hook 'my-message-mode-settings)
1825
1826   (defun my-post-attach-file ()
1827     "Prompt for an attachment."
1828     (interactive)
1829     (let ((file (read-file-name "Attach file: " nil nil t nil))
1830           (description (string-read "Description: ")))
1831       (my-header-attach-file file description)))
1832
1833   (symbol-function 'my-post-attach-file)
1834
1835   (defun my-header-attach-file (file description)
1836     "Attach a FILE to the current message (works with Mutt).
1837   Argument DESCRIPTION MIME description."
1838     (interactive "fAttach file: \nsDescription: ")
1839     (when (> (length file) 0)
1840       (save-excursion
1841         (save-match-data
1842           (save-restriction
1843             (widen)
1844             (goto-char (point-min))
1845             (search-forward-regexp "^$")
1846             (insert (concat "Attach: " (replace-regexp-in-string "\\([[:space:]\\]\\)" "\\\\\\1" (file-truename file)) " "
1847                             description "\n"))
1848             (message (concat "Attached '" file "'."))
1849             (setq post-has-attachment t))))))
1850
1851
1852
1853   (setq mail-yank-prefix "> ")
1854
1855   ;; self-insert-command hack.
1856   ;;   Without this, "if<SP>" expands to
1857   ;;   if ( -!-) {
1858   ;;   }
1859   ;;   which really should be,
1860   ;;   if (-!-) {
1861   ;;   }
1862
1863
1864
1865   ;(load-library "php-mode")
1866
1867   (setq-default c-indent-level 4)
1868   (setq-default c-brace-imaginary-offset 0)
1869   (setq-default c-brace-offset -4)
1870   (setq-default c-argdecl-indent 4)
1871   (setq-default c-label-offset -4)
1872   (setq-default c-continued-statement-offset 4)
1873   ; tabs are annoying
1874   (setq-default indent-tabs-mode nil)
1875   (setq-default tab-width 4)
1876
1877
1878   ;; (autoload 'php-mode "php-mode" "PHP editing mode" t)
1879   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php3?\\'" . php-mode))
1880   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.phtml?\\'" . php-mode))
1881   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php?\\'" . php-mode))
1882   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php4?\\'" . php-mode))
1883
1884
1885   (defun insert-date ()
1886     "Insert date at point."
1887     (interactive)
1888     (insert (format-time-string "%A, %B %e, %Y %k:%M:%S %Z")))
1889   (global-set-key "\C-[d" 'insert-date)
1890
1891   (defun unfill-paragraph (arg)
1892     "Pull this whole paragraph up onto one line."
1893     (interactive "*p")
1894     (let ((fill-column 10000))
1895       (fill-paragraph arg))
1896     )
1897
1898   (column-number-mode t)
1899
1900   ; (require 'mode-compile)
1901
1902   (defadvice server-process-filter (after post-mode-message first activate)
1903     "If the buffer is in post mode, overwrite the server-edit
1904       message with a post-save-current-buffer-and-exit message."
1905     (if (eq major-mode 'post-mode)
1906         (message
1907          (substitute-command-keys "Type \\[describe-mode] for help composing; \\[post-save-current-buffer-and-exit] when done."))))
1908                       ; This is also needed to see the magic message.  Set to a higher
1909                       ; number if you have a faster computer or read slower than me.
1910   '(font-lock-verbose 1000)
1911   ;(setq-default server-temp-file-regexp "mutt\(-\|ng-\)")
1912   ; (add-hook 'server-switch-hook
1913   ;     (function (lambda()
1914   ;             (cond ((string-match "Post" mode-name)
1915   ;                (post-goto-body)))
1916   ;             set-buffer-file-coding-system 'utf-8
1917   ;             )))
1918   ;
1919
1920   (add-hook 'post-mode-hook
1921         (auto-fill-mode nil)
1922         )
1923   ; abbrev mode settings
1924   ; load abbreviations from
1925   (setq abbrev-file-name
1926         "~/.emacs_abbrev_def")
1927
1928   ; read the abbrev file if it exists
1929   (if (file-exists-p abbrev-file-name)
1930       (quietly-read-abbrev-file))
1931
1932   ; for now, use abbrev mode everywhere
1933   (setq default-abbrev-mode t)
1934
1935
1936   (defun insert-function-documentation ()
1937     "Insert function documentation"
1938     (interactive)
1939     (insert-file-contents "/home/don/lib/templates/perl_function_documentation" nil))
1940   (global-set-key "\M-f" 'insert-function-documentation)
1941
1942   (eval-after-load "lilypond-mode"
1943     '(progn
1944        (load-library "lyqi-mode")
1945        (define-key LilyPond-mode-map "\C-cq" 'lyqi-mode)))
1946
1947   (autoload 'spamassassin-mode "spamassassin-mode" nil t)
1948
1949   (desktop-load-default)
1950   (desktop-read)
1951   '(icomplete-mode on)
1952   (custom-set-faces
1953    ;; custom-set-faces was added by Custom.
1954    ;; If you edit it by hand, you could mess it up, so be careful.
1955    ;; Your init file should contain only one such instance.
1956    ;; If there is more than one, they won't work right.
1957    '(menu ((((type x-toolkit)) (:background "black" :foreground "grey90")))))
1958
1959
1960   (put 'upcase-region 'disabled nil)
1961   (put 'downcase-region 'disabled nil)
1962   (put 'narrow-to-region 'disabled nil)
1963
1964   ; (defun turn-on-flyspell ()
1965   ;    "Force flyspell-mode on using a positive arg.  For use in hooks."
1966   ;    (interactive)
1967   ;    (flyspell-mode 1))
1968
1969
1970    ; Outline-minor-mode key map
1971    (define-prefix-command 'cm-map nil "Outline-")
1972    ; HIDE
1973    (define-key cm-map "q" 'hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
1974    (define-key cm-map "t" 'hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
1975    (define-key cm-map "o" 'hide-other)        ; Hide other branches
1976    (define-key cm-map "c" 'hide-entry)        ; Hide this entry's body
1977    (define-key cm-map "l" 'hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
1978    (define-key cm-map "d" 'hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
1979    ; SHOW
1980    (define-key cm-map "a" 'show-all)          ; Show (expand) everything
1981    (define-key cm-map "e" 'show-entry)        ; Show this heading's body
1982    (define-key cm-map "i" 'show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
1983    (define-key cm-map "k" 'show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
1984    (define-key cm-map "s" 'show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
1985    ; MOVE
1986    (define-key cm-map "u" 'outline-up-heading)                ; Up
1987    (define-key cm-map "n" 'outline-next-visible-heading)      ; Next
1988    (define-key cm-map "p" 'outline-previous-visible-heading)  ; Previous
1989    (define-key cm-map "f" 'outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
1990    (define-key cm-map "b" 'outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
1991    (global-set-key "\M-o" cm-map)
1992
1993
1994   ; debian stuff
1995   (setq-default debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
1996   (setq-default debian-changelog-full-name "Don Armstrong")
1997
1998   ; ediff configuration
1999   ; don't use the multi-window configuration
2000   (setq ediff-window-setup-function 'ediff-setup-windows-plain)
2001
2002   ; fix up css mode to not be silly
2003   ; from http://www.stokebloke.com/wordpress/2008/03/21/css-mode-indent-buffer-fix/
2004   (setq cssm-indent-level 4)
2005   (setq cssm-newline-before-closing-bracket t)
2006   (setq cssm-indent-function #'cssm-c-style-indenter)
2007   (setq cssm-mirror-mode nil)
2008
2009   (require 'multi-web-mode)
2010   (setq mweb-default-major-mode 'html-mode)
2011   (setq mweb-tags '((php-mode "<\\?php\\|<\\? \\|<\\?=" "\\?>")
2012                     (js-mode "<script +\\(type=\"text/javascript\"\\|language=\"javascript\"\\)[^>]*>" "</script>")
2013                     (css-mode "<style +type=\"text/css\"[^>]*>" "</style>")))
2014   (setq mweb-filename-extensions '("php" "htm" "html" "ctp" "phtml" "php4" "php5"))
2015   (multi-web-global-mode 1)
2016
2017   ;;; alias the new `flymake-report-status-slim' to
2018   ;;; `flymake-report-status'
2019   (defalias 'flymake-report-status 'flymake-report-status-slim)
2020   (defun flymake-report-status-slim (e-w &optional status)
2021     "Show \"slim\" flymake status in mode line."
2022     (when e-w
2023       (setq flymake-mode-line-e-w e-w))
2024     (when status
2025       (setq flymake-mode-line-status status))
2026     (let* ((mode-line " Φ"))
2027       (when (> (length flymake-mode-line-e-w) 0)
2028         (setq mode-line (concat mode-line ":" flymake-mode-line-e-w)))
2029       (setq mode-line (concat mode-line flymake-mode-line-status))
2030       (setq flymake-mode-line mode-line)
2031       (force-mode-line-update)))
2032
2033   ; load sql-indent when sql is loaded
2034   (eval-after-load "sql"
2035     '(load-library "sql-indent"))
2036
2037   ; fix up tmux xterm keys
2038   ; stolen from http://unix.stackexchange.com/questions/24414/shift-arrow-not-working-in-emacs-within-tmux
2039   (defun fix-up-tmux-keys ()
2040       "Fix up tmux xterm keys"
2041       (if (getenv "TMUX")
2042           (progn
2043             (let ((x 2) (tkey ""))
2044               (while (<= x 8)
2045                 ;; shift
2046                 (if (= x 2)
2047                     (setq tkey "S-"))
2048                 ;; alt
2049                 (if (= x 3)
2050                     (setq tkey "M-"))
2051                 ;; alt + shift
2052                 (if (= x 4)
2053                     (setq tkey "M-S-"))
2054                 ;; ctrl
2055                 (if (= x 5)
2056                     (setq tkey "C-"))
2057                 ;; ctrl + shift
2058                 (if (= x 6)
2059                     (setq tkey "C-S-"))
2060                 ;; ctrl + alt
2061                 (if (= x 7)
2062                     (setq tkey "C-M-"))
2063                 ;; ctrl + alt + shift
2064                 (if (= x 8)
2065                     (setq tkey "C-M-S-"))
2066
2067                 ;; arrows
2068                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d A" x)) (kbd (format "%s<up>" tkey)))
2069                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d B" x)) (kbd (format "%s<down>" tkey)))
2070                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d C" x)) (kbd (format "%s<right>" tkey)))
2071                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d D" x)) (kbd (format "%s<left>" tkey)))
2072                 ;; home
2073                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d H" x)) (kbd (format "%s<home>" tkey)))
2074                 ;; end
2075                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d F" x)) (kbd (format "%s<end>" tkey)))
2076                 ;; page up
2077                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 5 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<prior>" tkey)))
2078                 ;; page down
2079                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 6 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<next>" tkey)))
2080                 ;; insert
2081                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 2 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2082                 ;; delete
2083                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 3 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2084                 ;; f1
2085                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d P" x)) (kbd (format "%s<f1>" tkey)))
2086                 ;; f2
2087                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d Q" x)) (kbd (format "%s<f2>" tkey)))
2088                 ;; f3
2089                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d R" x)) (kbd (format "%s<f3>" tkey)))
2090                 ;; f4
2091                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d S" x)) (kbd (format "%s<f4>" tkey)))
2092                 ;; f5
2093                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 15 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f5>" tkey)))
2094                 ;; f6
2095                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 17 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f6>" tkey)))
2096                 ;; f7
2097                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 18 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f7>" tkey)))
2098                 ;; f8
2099                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 19 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f8>" tkey)))
2100                 ;; f9
2101                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 20 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f9>" tkey)))
2102                 ;; f10
2103                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 21 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f10>" tkey)))
2104                 ;; f11
2105                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 23 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f11>" tkey)))
2106                 ;; f12
2107                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 24 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f12>" tkey)))
2108                 ;; f13
2109                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 25 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f13>" tkey)))
2110                 ;; f14
2111                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 26 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f14>" tkey)))
2112                 ;; f15
2113                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 28 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f15>" tkey)))
2114                 ;; f16
2115                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 29 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f16>" tkey)))
2116                 ;; f17
2117                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 31 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f17>" tkey)))
2118                 ;; f18
2119                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 32 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f18>" tkey)))
2120                 ;; f19
2121                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 33 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f19>" tkey)))
2122                 ;; f20
2123                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 34 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f20>" tkey)))
2124
2125                 (setq x (+ x 1))
2126                 ))
2127             )
2128         )
2129       )
2130   ; (add-hook 'tty-setup-hook 'fix-up-tmux-keys)
2131
2132   ; procmailmode configuration
2133   (load "procmail_mode")
2134
2135   (load "mode-line-cleaner")
2136
2137   (defadvice ask-user-about-supersession-threat (around ask-user-about-supersession-threat-if-necessary)
2138     "Call ask-user-about-supersession-threat only if the buffer is actually obsolete."
2139     (if (or (buffer-modified-p)
2140             (verify-visited-file-modtime)
2141             (< (* 8 1024 1024) (buffer-size))
2142             (/= 0 (call-process-region 1 (+ 1 (buffer-size)) "diff" nil nil nil "-q" (buffer-file-name) "-")))
2143         ad-do-it
2144       (clear-visited-file-modtime)
2145       (not-modified)))
2146   (ad-activate 'ask-user-about-supersession-threat)
2147
2148   ; apparently things like to step on C-;, so we'll use a hack from
2149   ; http://stackoverflow.com/questions/683425/globally-override-key-binding-in-emacs/5340797#5340797 to fix this
2150
2151   (defvar my-keys-minor-mode-map (make-keymap) "my-keys-minor-mode keymap.")
2152
2153   ; use iedit everywhere
2154   (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'mc/mark-all-dwim)
2155
2156   (define-minor-mode my-keys-minor-mode
2157     "A minor mode so that my key settings override annoying major modes."
2158     t " my-keys" 'my-keys-minor-mode-map)
2159
2160   (my-keys-minor-mode 1)
2161   (defun my-minibuffer-setup-hook ()
2162     (my-keys-minor-mode 0))
2163
2164   (add-hook 'minibuffer-setup-hook 'my-minibuffer-setup-hook)
2165   (defadvice load (after give-my-keybindings-priority)
2166     "Try to ensure that my keybindings always have priority."
2167     (if (not (eq (car (car minor-mode-map-alist)) 'my-keys-minor-mode))
2168         (let ((mykeys (assq 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)))
2169           (assq-delete-all 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)
2170           (add-to-list 'minor-mode-map-alist mykeys))))
2171   (ad-activate 'load)
2172   (global-set-key "\M- " 'hippie-expand)
2173
2174 #+END_SRC
2175
2176 * Server
2177 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2178   (unless (server-running-p)
2179   (server-start))
2180 #+END_SRC
2181
2182
2183
2184 * END
2185 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2186   (provide 'don-configuration)
2187 #+END_SRC