]> git.donarmstrong.com Git - rsem.git/tree - sam/misc/
Updated samtools to 0.1.19
[rsem.git] / sam / misc /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 222 ._HmmGlocal.java
-rw-r--r-- 222 ._Makefile
-rw-r--r-- 222 ._ace2sam.c
-rw-r--r-- 222 ._bamcheck.c
-rwxr-xr-x 222 ._blast2sam.pl
-rwxr-xr-x 222 ._bowtie2sam.pl
-rwxr-xr-x 222 ._export2sam.pl
-rwxr-xr-x 222 ._interpolate_sam.pl
-rw-r--r-- 222 ._maq2sam.c
-rw-r--r-- 222 ._md5.c
-rw-r--r-- 222 ._md5.h
-rw-r--r-- 222 ._md5fa.c
-rwxr-xr-x 222 ._novo2sam.pl
-rwxr-xr-x 222 ._plot-bamcheck
-rwxr-xr-x 222 ._psl2sam.pl
-rwxr-xr-x 222 ._r2plot.lua
-rwxr-xr-x 222 ._sam2vcf.pl
-rwxr-xr-x 222 ._samtools.pl
-rwxr-xr-x 222 ._soap2sam.pl
-rwxr-xr-x 222 ._varfilter.py
-rwxr-xr-x 222 ._vcfutils.lua
-rw-r--r-- 222 ._wgsim.c
-rwxr-xr-x 222 ._wgsim_eval.pl
-rwxr-xr-x 222 ._zoom2sam.pl
-rw-r--r-- 6716 HmmGlocal.java
-rw-r--r-- 1609 Makefile
-rw-r--r-- 9953 ace2sam.c
-rw-r--r-- 59193 bamcheck.c
-rwxr-xr-x 2415 blast2sam.pl
-rwxr-xr-x 2112 bowtie2sam.pl
-rwxr-xr-x 18572 export2sam.pl
-rwxr-xr-x 4996 interpolate_sam.pl
-rw-r--r-- 4597 maq2sam.c
-rw-r--r-- 9075 md5.c
-rw-r--r-- 1701 md5.h
-rw-r--r-- 1550 md5fa.c
-rwxr-xr-x 5989 novo2sam.pl
-rwxr-xr-x 29649 plot-bamcheck
-rwxr-xr-x 2022 psl2sam.pl
-rwxr-xr-x 2685 r2plot.lua
-rwxr-xr-x 7881 sam2vcf.pl
-rwxr-xr-x 14299 samtools.pl
-rwxr-xr-x 2696 soap2sam.pl
-rwxr-xr-x 5783 varfilter.py
-rwxr-xr-x 21028 vcfutils.lua
-rw-r--r-- 14395 wgsim.c
-rwxr-xr-x 2729 wgsim_eval.pl
-rwxr-xr-x 2397 zoom2sam.pl