]> git.donarmstrong.com Git - rsem.git/blob - boost/random/poisson_distribution.hpp
Updated boost to v1.55.0
[rsem.git] / boost / random / poisson_distribution.hpp
1 /* boost random/poisson_distribution.hpp header file
2  *
3  * Copyright Jens Maurer 2002
4  * Copyright Steven Watanabe 2010
5  * Distributed under the Boost Software License, Version 1.0. (See
6  * accompanying file LICENSE_1_0.txt or copy at
7  * http://www.boost.org/LICENSE_1_0.txt)
8  *
9  * See http://www.boost.org for most recent version including documentation.
10  *
11  * $Id: poisson_distribution.hpp 71018 2011-04-05 21:27:52Z steven_watanabe $
12  *
13  */
14
15 #ifndef BOOST_RANDOM_POISSON_DISTRIBUTION_HPP
16 #define BOOST_RANDOM_POISSON_DISTRIBUTION_HPP
17
18 #include <boost/config/no_tr1/cmath.hpp>
19 #include <cstdlib>
20 #include <iosfwd>
21 #include <boost/assert.hpp>
22 #include <boost/limits.hpp>
23 #include <boost/random/uniform_01.hpp>
24 #include <boost/random/detail/config.hpp>
25
26 #include <boost/random/detail/disable_warnings.hpp>
27
28 namespace boost {
29 namespace random {
30
31 namespace detail {
32
33 template<class RealType>
34 struct poisson_table {
35     static RealType value[10];
36 };
37
38 template<class RealType>
39 RealType poisson_table<RealType>::value[10] = {
40     0.0,
41     0.0,
42     0.69314718055994529,
43     1.7917594692280550,
44     3.1780538303479458,
45     4.7874917427820458,
46     6.5792512120101012,
47     8.5251613610654147,
48     10.604602902745251,
49     12.801827480081469
50 };
51
52 }
53
54 /**
55  * An instantiation of the class template @c poisson_distribution is a
56  * model of \random_distribution.  The poisson distribution has
57  * \f$p(i) = \frac{e^{-\lambda}\lambda^i}{i!}\f$
58  *
59  * This implementation is based on the PTRD algorithm described
60  * 
61  *  @blockquote
62  *  "The transformed rejection method for generating Poisson random variables",
63  *  Wolfgang Hormann, Insurance: Mathematics and Economics
64  *  Volume 12, Issue 1, February 1993, Pages 39-45
65  *  @endblockquote
66  */
67 template<class IntType = int, class RealType = double>
68 class poisson_distribution {
69 public:
70     typedef IntType result_type;
71     typedef RealType input_type;
72
73     class param_type {
74     public:
75         typedef poisson_distribution distribution_type;
76         /**
77          * Construct a param_type object with the parameter "mean"
78          *
79          * Requires: mean > 0
80          */
81         explicit param_type(RealType mean_arg = RealType(1))
82           : _mean(mean_arg)
83         {
84             BOOST_ASSERT(_mean > 0);
85         }
86         /* Returns the "mean" parameter of the distribution. */
87         RealType mean() const { return _mean; }
88 #ifndef BOOST_RANDOM_NO_STREAM_OPERATORS
89         /** Writes the parameters of the distribution to a @c std::ostream. */
90         template<class CharT, class Traits>
91         friend std::basic_ostream<CharT, Traits>&
92         operator<<(std::basic_ostream<CharT, Traits>& os,
93                    const param_type& parm)
94         {
95             os << parm._mean;
96             return os;
97         }
98
99         /** Reads the parameters of the distribution from a @c std::istream. */
100         template<class CharT, class Traits>
101         friend std::basic_istream<CharT, Traits>&
102         operator>>(std::basic_istream<CharT, Traits>& is, param_type& parm)
103         {
104             is >> parm._mean;
105             return is;
106         }
107 #endif
108         /** Returns true if the parameters have the same values. */
109         friend bool operator==(const param_type& lhs, const param_type& rhs)
110         {
111             return lhs._mean == rhs._mean;
112         }
113         /** Returns true if the parameters have different values. */
114         friend bool operator!=(const param_type& lhs, const param_type& rhs)
115         {
116             return !(lhs == rhs);
117         }
118     private:
119         RealType _mean;
120     };
121     
122     /**
123      * Constructs a @c poisson_distribution with the parameter @c mean.
124      *
125      * Requires: mean > 0
126      */
127     explicit poisson_distribution(RealType mean_arg = RealType(1))
128       : _mean(mean_arg)
129     {
130         BOOST_ASSERT(_mean > 0);
131         init();
132     }
133     
134     /**
135      * Construct an @c poisson_distribution object from the
136      * parameters.
137      */
138     explicit poisson_distribution(const param_type& parm)
139       : _mean(parm.mean())
140     {
141         init();
142     }
143     
144     /**
145      * Returns a random variate distributed according to the
146      * poisson distribution.
147      */
148     template<class URNG>
149     IntType operator()(URNG& urng) const
150     {
151         if(use_inversion()) {
152             return invert(urng);
153         } else {
154             return generate(urng);
155         }
156     }
157
158     /**
159      * Returns a random variate distributed according to the
160      * poisson distribution with parameters specified by param.
161      */
162     template<class URNG>
163     IntType operator()(URNG& urng, const param_type& parm) const
164     {
165         return poisson_distribution(parm)(urng);
166     }
167
168     /** Returns the "mean" parameter of the distribution. */
169     RealType mean() const { return _mean; }
170     
171     /** Returns the smallest value that the distribution can produce. */
172     IntType min BOOST_PREVENT_MACRO_SUBSTITUTION() const { return 0; }
173     /** Returns the largest value that the distribution can produce. */
174     IntType max BOOST_PREVENT_MACRO_SUBSTITUTION() const
175     { return (std::numeric_limits<IntType>::max)(); }
176
177     /** Returns the parameters of the distribution. */
178     param_type param() const { return param_type(_mean); }
179     /** Sets parameters of the distribution. */
180     void param(const param_type& parm)
181     {
182         _mean = parm.mean();
183         init();
184     }
185
186     /**
187      * Effects: Subsequent uses of the distribution do not depend
188      * on values produced by any engine prior to invoking reset.
189      */
190     void reset() { }
191
192 #ifndef BOOST_RANDOM_NO_STREAM_OPERATORS
193     /** Writes the parameters of the distribution to a @c std::ostream. */
194     template<class CharT, class Traits>
195     friend std::basic_ostream<CharT,Traits>&
196     operator<<(std::basic_ostream<CharT,Traits>& os,
197                const poisson_distribution& pd)
198     {
199         os << pd.param();
200         return os;
201     }
202     
203     /** Reads the parameters of the distribution from a @c std::istream. */
204     template<class CharT, class Traits>
205     friend std::basic_istream<CharT,Traits>&
206     operator>>(std::basic_istream<CharT,Traits>& is, poisson_distribution& pd)
207     {
208         pd.read(is);
209         return is;
210     }
211 #endif
212     
213     /** Returns true if the two distributions will produce the same
214         sequence of values, given equal generators. */
215     friend bool operator==(const poisson_distribution& lhs,
216                            const poisson_distribution& rhs)
217     {
218         return lhs._mean == rhs._mean;
219     }
220     /** Returns true if the two distributions could produce different
221         sequences of values, given equal generators. */
222     friend bool operator!=(const poisson_distribution& lhs,
223                            const poisson_distribution& rhs)
224     {
225         return !(lhs == rhs);
226     }
227
228 private:
229
230     /// @cond show_private
231
232     template<class CharT, class Traits>
233     void read(std::basic_istream<CharT, Traits>& is) {
234         param_type parm;
235         if(is >> parm) {
236             param(parm);
237         }
238     }
239
240     bool use_inversion() const
241     {
242         return _mean < 10;
243     }
244
245     static RealType log_factorial(IntType k)
246     {
247         BOOST_ASSERT(k >= 0);
248         BOOST_ASSERT(k < 10);
249         return detail::poisson_table<RealType>::value[k];
250     }
251
252     void init()
253     {
254         using std::sqrt;
255         using std::exp;
256
257         if(use_inversion()) {
258             _exp_mean = exp(-_mean);
259         } else {
260             _ptrd.smu = sqrt(_mean);
261             _ptrd.b = 0.931 + 2.53 * _ptrd.smu;
262             _ptrd.a = -0.059 + 0.02483 * _ptrd.b;
263             _ptrd.inv_alpha = 1.1239 + 1.1328 / (_ptrd.b - 3.4);
264             _ptrd.v_r = 0.9277 - 3.6224 / (_ptrd.b - 2);
265         }
266     }
267     
268     template<class URNG>
269     IntType generate(URNG& urng) const
270     {
271         using std::floor;
272         using std::abs;
273         using std::log;
274
275         while(true) {
276             RealType u;
277             RealType v = uniform_01<RealType>()(urng);
278             if(v <= 0.86 * _ptrd.v_r) {
279                 u = v / _ptrd.v_r - 0.43;
280                 return static_cast<IntType>(floor(
281                     (2*_ptrd.a/(0.5-abs(u)) + _ptrd.b)*u + _mean + 0.445));
282             }
283
284             if(v >= _ptrd.v_r) {
285                 u = uniform_01<RealType>()(urng) - 0.5;
286             } else {
287                 u = v/_ptrd.v_r - 0.93;
288                 u = ((u < 0)? -0.5 : 0.5) - u;
289                 v = uniform_01<RealType>()(urng) * _ptrd.v_r;
290             }
291
292             RealType us = 0.5 - abs(u);
293             if(us < 0.013 && v > us) {
294                 continue;
295             }
296
297             RealType k = floor((2*_ptrd.a/us + _ptrd.b)*u+_mean+0.445);
298             v = v*_ptrd.inv_alpha/(_ptrd.a/(us*us) + _ptrd.b);
299
300             RealType log_sqrt_2pi = 0.91893853320467267;
301
302             if(k >= 10) {
303                 if(log(v*_ptrd.smu) <= (k + 0.5)*log(_mean/k)
304                                - _mean
305                                - log_sqrt_2pi
306                                + k
307                                - (1/12. - (1/360. - 1/(1260.*k*k))/(k*k))/k) {
308                     return static_cast<IntType>(k);
309                 }
310             } else if(k >= 0) {
311                 if(log(v) <= k*log(_mean)
312                            - _mean
313                            - log_factorial(static_cast<IntType>(k))) {
314                     return static_cast<IntType>(k);
315                 }
316             }
317         }
318     }
319
320     template<class URNG>
321     IntType invert(URNG& urng) const
322     {
323         RealType p = _exp_mean;
324         IntType x = 0;
325         RealType u = uniform_01<RealType>()(urng);
326         while(u > p) {
327             u = u - p;
328             ++x;
329             p = _mean * p / x;
330         }
331         return x;
332     }
333
334     RealType _mean;
335
336     union {
337         // for ptrd
338         struct {
339             RealType v_r;
340             RealType a;
341             RealType b;
342             RealType smu;
343             RealType inv_alpha;
344         } _ptrd;
345         // for inversion
346         RealType _exp_mean;
347     };
348
349     /// @endcond
350 };
351
352 } // namespace random
353
354 using random::poisson_distribution;
355
356 } // namespace boost
357
358 #include <boost/random/detail/enable_warnings.hpp>
359
360 #endif // BOOST_RANDOM_POISSON_DISTRIBUTION_HPP