]> git.donarmstrong.com Git - rsem.git/blob - boost/random/negative_binomial_distribution.hpp
Updated boost to v1.55.0
[rsem.git] / boost / random / negative_binomial_distribution.hpp
1 /* boost random/negative_binomial_distribution.hpp header file
2  *
3  * Copyright Steven Watanabe 2010
4  * Distributed under the Boost Software License, Version 1.0. (See
5  * accompanying file LICENSE_1_0.txt or copy at
6  * http://www.boost.org/LICENSE_1_0.txt)
7  *
8  * See http://www.boost.org for most recent version including documentation.
9  *
10  * $Id: negative_binomial_distribution.hpp 71018 2011-04-05 21:27:52Z steven_watanabe $
11  */
12
13 #ifndef BOOST_RANDOM_NEGATIVE_BINOMIAL_DISTRIBUTION_HPP_INCLUDED
14 #define BOOST_RANDOM_NEGATIVE_BINOMIAL_DISTRIBUTION_HPP_INCLUDED
15
16 #include <iosfwd>
17
18 #include <boost/limits.hpp>
19 #include <boost/random/detail/config.hpp>
20 #include <boost/random/gamma_distribution.hpp>
21 #include <boost/random/poisson_distribution.hpp>
22
23 namespace boost {
24 namespace random {
25
26 /**
27  * The negative binomial distribution is an integer valued
28  * distribution with two parameters, @c k and @c p.  The
29  * distribution produces non-negative values.
30  *
31  * The distribution function is
32  * \f$\displaystyle P(i) = {k+i-1\choose i}p^k(1-p)^i\f$.
33  *
34  * This implementation uses a gamma-poisson mixture.
35  */
36 template<class IntType = int, class RealType = double>
37 class negative_binomial_distribution {
38 public:
39     typedef IntType result_type;
40     typedef RealType input_type;
41
42     class param_type {
43     public:
44         typedef negative_binomial_distribution distribution_type;
45         /**
46          * Construct a param_type object.  @c k and @c p
47          * are the parameters of the distribution.
48          *
49          * Requires: k >=0 && 0 <= p <= 1
50          */
51         explicit param_type(IntType k_arg = 1, RealType p_arg = RealType (0.5))
52           : _k(k_arg), _p(p_arg)
53         {}
54         /** Returns the @c k parameter of the distribution. */
55         IntType k() const { return _k; }
56         /** Returns the @c p parameter of the distribution. */
57         RealType p() const { return _p; }
58 #ifndef BOOST_RANDOM_NO_STREAM_OPERATORS
59         /** Writes the parameters of the distribution to a @c std::ostream. */
60         template<class CharT, class Traits>
61         friend std::basic_ostream<CharT,Traits>&
62         operator<<(std::basic_ostream<CharT,Traits>& os,
63                    const param_type& parm)
64         {
65             os << parm._p << " " << parm._k;
66             return os;
67         }
68     
69         /** Reads the parameters of the distribution from a @c std::istream. */
70         template<class CharT, class Traits>
71         friend std::basic_istream<CharT,Traits>&
72         operator>>(std::basic_istream<CharT,Traits>& is, param_type& parm)
73         {
74             is >> parm._p >> std::ws >> parm._k;
75             return is;
76         }
77 #endif
78         /** Returns true if the parameters have the same values. */
79         friend bool operator==(const param_type& lhs, const param_type& rhs)
80         {
81             return lhs._k == rhs._k && lhs._p == rhs._p;
82         }
83         /** Returns true if the parameters have different values. */
84         friend bool operator!=(const param_type& lhs, const param_type& rhs)
85         {
86             return !(lhs == rhs);
87         }
88     private:
89         IntType _k;
90         RealType _p;
91     };
92     
93     /**
94      * Construct a @c negative_binomial_distribution object. @c k and @c p
95      * are the parameters of the distribution.
96      *
97      * Requires: k >=0 && 0 <= p <= 1
98      */
99     explicit negative_binomial_distribution(IntType k_arg = 1,
100                                             RealType p_arg = RealType(0.5))
101       : _k(k_arg), _p(p_arg)
102     {}
103     
104     /**
105      * Construct an @c negative_binomial_distribution object from the
106      * parameters.
107      */
108     explicit negative_binomial_distribution(const param_type& parm)
109       : _k(parm.k()), _p(parm.p())
110     {}
111     
112     /**
113      * Returns a random variate distributed according to the
114      * negative binomial distribution.
115      */
116     template<class URNG>
117     IntType operator()(URNG& urng) const
118     {
119         gamma_distribution<RealType> gamma(_k, (1-_p)/_p);
120         poisson_distribution<IntType, RealType> poisson(gamma(urng));
121         return poisson(urng);
122     }
123     
124     /**
125      * Returns a random variate distributed according to the negative
126      * binomial distribution with parameters specified by @c param.
127      */
128     template<class URNG>
129     IntType operator()(URNG& urng, const param_type& parm) const
130     {
131         return negative_binomial_distribution(parm)(urng);
132     }
133
134     /** Returns the @c k parameter of the distribution. */
135     IntType k() const { return _k; }
136     /** Returns the @c p parameter of the distribution. */
137     RealType p() const { return _p; }
138
139     /** Returns the smallest value that the distribution can produce. */
140     IntType min BOOST_PREVENT_MACRO_SUBSTITUTION() const { return 0; }
141     /** Returns the largest value that the distribution can produce. */
142     IntType max BOOST_PREVENT_MACRO_SUBSTITUTION() const
143     { return (std::numeric_limits<IntType>::max)(); }
144
145     /** Returns the parameters of the distribution. */
146     param_type param() const { return param_type(_k, _p); }
147     /** Sets parameters of the distribution. */
148     void param(const param_type& parm)
149     {
150         _k = parm.k();
151         _p = parm.p();
152     }
153
154     /**
155      * Effects: Subsequent uses of the distribution do not depend
156      * on values produced by any engine prior to invoking reset.
157      */
158     void reset() { }
159
160 #ifndef BOOST_RANDOM_NO_STREAM_OPERATORS
161     /** Writes the parameters of the distribution to a @c std::ostream. */
162     template<class CharT, class Traits>
163     friend std::basic_ostream<CharT,Traits>&
164     operator<<(std::basic_ostream<CharT,Traits>& os,
165                const negative_binomial_distribution& bd)
166     {
167         os << bd.param();
168         return os;
169     }
170     
171     /** Reads the parameters of the distribution from a @c std::istream. */
172     template<class CharT, class Traits>
173     friend std::basic_istream<CharT,Traits>&
174     operator>>(std::basic_istream<CharT,Traits>& is,
175                negative_binomial_distribution& bd)
176     {
177         bd.read(is);
178         return is;
179     }
180 #endif
181
182     /** Returns true if the two distributions will produce the same
183         sequence of values, given equal generators. */
184     friend bool operator==(const negative_binomial_distribution& lhs,
185                            const negative_binomial_distribution& rhs)
186     {
187         return lhs._k == rhs._k && lhs._p == rhs._p;
188     }
189     /** Returns true if the two distributions could produce different
190         sequences of values, given equal generators. */
191     friend bool operator!=(const negative_binomial_distribution& lhs,
192                            const negative_binomial_distribution& rhs)
193     {
194         return !(lhs == rhs);
195     }
196
197 private:
198
199     /// @cond \show_private
200
201     template<class CharT, class Traits>
202     void read(std::basic_istream<CharT, Traits>& is) {
203         param_type parm;
204         if(is >> parm) {
205             param(parm);
206         }
207     }
208
209     // parameters
210     IntType _k;
211     RealType _p;
212
213     /// @endcond
214 };
215
216 }
217
218 }
219
220 #endif