]> git.donarmstrong.com Git - rsem.git/blob - boost/random/gamma_distribution.hpp
Updated boost to v1.55.0
[rsem.git] / boost / random / gamma_distribution.hpp
1 /* boost random/gamma_distribution.hpp header file
2  *
3  * Copyright Jens Maurer 2002
4  * Copyright Steven Watanabe 2010
5  * Distributed under the Boost Software License, Version 1.0. (See
6  * accompanying file LICENSE_1_0.txt or copy at
7  * http://www.boost.org/LICENSE_1_0.txt)
8  *
9  * See http://www.boost.org for most recent version including documentation.
10  *
11  * $Id: gamma_distribution.hpp 71018 2011-04-05 21:27:52Z steven_watanabe $
12  *
13  */
14
15 #ifndef BOOST_RANDOM_GAMMA_DISTRIBUTION_HPP
16 #define BOOST_RANDOM_GAMMA_DISTRIBUTION_HPP
17
18 #include <boost/config/no_tr1/cmath.hpp>
19 #include <istream>
20 #include <iosfwd>
21 #include <boost/assert.hpp>
22 #include <boost/limits.hpp>
23 #include <boost/static_assert.hpp>
24 #include <boost/random/detail/config.hpp>
25 #include <boost/random/exponential_distribution.hpp>
26
27 namespace boost {
28 namespace random {
29
30 // The algorithm is taken from Knuth
31
32 /**
33  * The gamma distribution is a continuous distribution with two
34  * parameters alpha and beta.  It produces values > 0.
35  *
36  * It has
37  * \f$\displaystyle p(x) = x^{\alpha-1}\frac{e^{-x/\beta}}{\beta^\alpha\Gamma(\alpha)}\f$.
38  */
39 template<class RealType = double>
40 class gamma_distribution
41 {
42 public:
43     typedef RealType input_type;
44     typedef RealType result_type;
45
46     class param_type
47     {
48     public:
49         typedef gamma_distribution distribution_type;
50
51         /**
52          * Constructs a @c param_type object from the "alpha" and "beta"
53          * parameters.
54          *
55          * Requires: alpha > 0 && beta > 0
56          */
57         param_type(const RealType& alpha_arg = RealType(1.0),
58                    const RealType& beta_arg = RealType(1.0))
59           : _alpha(alpha_arg), _beta(beta_arg)
60         {
61         }
62
63         /** Returns the "alpha" parameter of the distribution. */
64         RealType alpha() const { return _alpha; }
65         /** Returns the "beta" parameter of the distribution. */
66         RealType beta() const { return _beta; }
67
68 #ifndef BOOST_RANDOM_NO_STREAM_OPERATORS
69         /** Writes the parameters to a @c std::ostream. */
70         template<class CharT, class Traits>
71         friend std::basic_ostream<CharT, Traits>&
72         operator<<(std::basic_ostream<CharT, Traits>& os,
73                    const param_type& parm)
74         {
75             os << parm._alpha << ' ' << parm._beta;
76             return os;
77         }
78         
79         /** Reads the parameters from a @c std::istream. */
80         template<class CharT, class Traits>
81         friend std::basic_istream<CharT, Traits>&
82         operator>>(std::basic_istream<CharT, Traits>& is, param_type& parm)
83         {
84             is >> parm._alpha >> std::ws >> parm._beta;
85             return is;
86         }
87 #endif
88
89         /** Returns true if the two sets of parameters are the same. */
90         friend bool operator==(const param_type& lhs, const param_type& rhs)
91         {
92             return lhs._alpha == rhs._alpha && lhs._beta == rhs._beta;
93         }
94         /** Returns true if the two sets fo parameters are different. */
95         friend bool operator!=(const param_type& lhs, const param_type& rhs)
96         {
97             return !(lhs == rhs);
98         }
99     private:
100         RealType _alpha;
101         RealType _beta;
102     };
103
104 #ifndef BOOST_NO_LIMITS_COMPILE_TIME_CONSTANTS
105     BOOST_STATIC_ASSERT(!std::numeric_limits<RealType>::is_integer);
106 #endif
107
108     /**
109      * Creates a new gamma_distribution with parameters "alpha" and "beta".
110      *
111      * Requires: alpha > 0 && beta > 0
112      */
113     explicit gamma_distribution(const result_type& alpha_arg = result_type(1.0),
114                                 const result_type& beta_arg = result_type(1.0))
115       : _exp(result_type(1)), _alpha(alpha_arg), _beta(beta_arg)
116     {
117         BOOST_ASSERT(_alpha > result_type(0));
118         BOOST_ASSERT(_beta > result_type(0));
119         init();
120     }
121
122     /** Constructs a @c gamma_distribution from its parameters. */
123     explicit gamma_distribution(const param_type& parm)
124       : _exp(result_type(1)), _alpha(parm.alpha()), _beta(parm.beta())
125     {
126         init();
127     }
128
129     // compiler-generated copy ctor and assignment operator are fine
130
131     /** Returns the "alpha" paramter of the distribution. */
132     RealType alpha() const { return _alpha; }
133     /** Returns the "beta" parameter of the distribution. */
134     RealType beta() const { return _beta; }
135     /** Returns the smallest value that the distribution can produce. */
136     RealType min BOOST_PREVENT_MACRO_SUBSTITUTION () const { return 0; }
137     /* Returns the largest value that the distribution can produce. */
138     RealType max BOOST_PREVENT_MACRO_SUBSTITUTION () const
139     { return (std::numeric_limits<RealType>::infinity)(); }
140
141     /** Returns the parameters of the distribution. */
142     param_type param() const { return param_type(_alpha, _beta); }
143     /** Sets the parameters of the distribution. */
144     void param(const param_type& parm)
145     {
146         _alpha = parm.alpha();
147         _beta = parm.beta();
148         init();
149     }
150     
151     /**
152      * Effects: Subsequent uses of the distribution do not depend
153      * on values produced by any engine prior to invoking reset.
154      */
155     void reset() { _exp.reset(); }
156
157     /**
158      * Returns a random variate distributed according to
159      * the gamma distribution.
160      */
161     template<class Engine>
162     result_type operator()(Engine& eng)
163     {
164 #ifndef BOOST_NO_STDC_NAMESPACE
165         // allow for Koenig lookup
166         using std::tan; using std::sqrt; using std::exp; using std::log;
167         using std::pow;
168 #endif
169         if(_alpha == result_type(1)) {
170             return _exp(eng) * _beta;
171         } else if(_alpha > result_type(1)) {
172             // Can we have a boost::mathconst please?
173             const result_type pi = result_type(3.14159265358979323846);
174             for(;;) {
175                 result_type y = tan(pi * uniform_01<RealType>()(eng));
176                 result_type x = sqrt(result_type(2)*_alpha-result_type(1))*y
177                     + _alpha-result_type(1);
178                 if(x <= result_type(0))
179                     continue;
180                 if(uniform_01<RealType>()(eng) >
181                     (result_type(1)+y*y) * exp((_alpha-result_type(1))
182                                                *log(x/(_alpha-result_type(1)))
183                                                - sqrt(result_type(2)*_alpha
184                                                       -result_type(1))*y))
185                     continue;
186                 return x * _beta;
187             }
188         } else /* alpha < 1.0 */ {
189             for(;;) {
190                 result_type u = uniform_01<RealType>()(eng);
191                 result_type y = _exp(eng);
192                 result_type x, q;
193                 if(u < _p) {
194                     x = exp(-y/_alpha);
195                     q = _p*exp(-x);
196                 } else {
197                     x = result_type(1)+y;
198                     q = _p + (result_type(1)-_p) * pow(x,_alpha-result_type(1));
199                 }
200                 if(u >= q)
201                     continue;
202                 return x * _beta;
203             }
204         }
205     }
206
207     template<class URNG>
208     RealType operator()(URNG& urng, const param_type& parm) const
209     {
210         return gamma_distribution(parm)(urng);
211     }
212
213 #ifndef BOOST_RANDOM_NO_STREAM_OPERATORS
214     /** Writes a @c gamma_distribution to a @c std::ostream. */
215     template<class CharT, class Traits>
216     friend std::basic_ostream<CharT,Traits>&
217     operator<<(std::basic_ostream<CharT,Traits>& os,
218                const gamma_distribution& gd)
219     {
220         os << gd.param();
221         return os;
222     }
223     
224     /** Reads a @c gamma_distribution from a @c std::istream. */
225     template<class CharT, class Traits>
226     friend std::basic_istream<CharT,Traits>&
227     operator>>(std::basic_istream<CharT,Traits>& is, gamma_distribution& gd)
228     {
229         gd.read(is);
230         return is;
231     }
232 #endif
233
234     /**
235      * Returns true if the two distributions will produce identical
236      * sequences of random variates given equal generators.
237      */
238     friend bool operator==(const gamma_distribution& lhs,
239                            const gamma_distribution& rhs)
240     {
241         return lhs._alpha == rhs._alpha
242             && lhs._beta == rhs._beta
243             && lhs._exp == rhs._exp;
244     }
245
246     /**
247      * Returns true if the two distributions can produce different
248      * sequences of random variates, given equal generators.
249      */
250     friend bool operator!=(const gamma_distribution& lhs,
251                            const gamma_distribution& rhs)
252     {
253         return !(lhs == rhs);
254     }
255
256 private:
257     /// \cond hide_private_members
258
259     template<class CharT, class Traits>
260     void read(std::basic_istream<CharT, Traits>& is)
261     {
262         param_type parm;
263         if(is >> parm) {
264             param(parm);
265         }
266     }
267
268     void init()
269     {
270 #ifndef BOOST_NO_STDC_NAMESPACE
271         // allow for Koenig lookup
272         using std::exp;
273 #endif
274         _p = exp(result_type(1)) / (_alpha + exp(result_type(1)));
275     }
276     /// \endcond
277
278     exponential_distribution<RealType> _exp;
279     result_type _alpha;
280     result_type _beta;
281     // some data precomputed from the parameters
282     result_type _p;
283 };
284
285
286 } // namespace random
287
288 using random::gamma_distribution;
289
290 } // namespace boost
291
292 #endif // BOOST_RANDOM_GAMMA_DISTRIBUTION_HPP