]> git.donarmstrong.com Git - rsem.git/blob - boost/math/special_functions/detail/ibeta_inverse.hpp
Added error detection for cases such as a read's two mates having different names...
[rsem.git] / boost / math / special_functions / detail / ibeta_inverse.hpp
1 //  Copyright John Maddock 2006.
2 //  Copyright Paul A. Bristow 2007
3 //  Use, modification and distribution are subject to the
4 //  Boost Software License, Version 1.0. (See accompanying file
5 //  LICENSE_1_0.txt or copy at http://www.boost.org/LICENSE_1_0.txt)
6
7 #ifndef BOOST_MATH_SPECIAL_FUNCTIONS_IBETA_INVERSE_HPP
8 #define BOOST_MATH_SPECIAL_FUNCTIONS_IBETA_INVERSE_HPP
9
10 #ifdef _MSC_VER
11 #pragma once
12 #endif
13
14 #include <boost/math/special_functions/beta.hpp>
15 #include <boost/math/special_functions/erf.hpp>
16 #include <boost/math/tools/roots.hpp>
17 #include <boost/math/special_functions/detail/t_distribution_inv.hpp>
18
19 namespace boost{ namespace math{ namespace detail{
20
21 //
22 // Helper object used by root finding
23 // code to convert eta to x.
24 //
25 template <class T>
26 struct temme_root_finder
27 {
28    temme_root_finder(const T t_, const T a_) : t(t_), a(a_) {}
29
30    boost::math::tuple<T, T> operator()(T x)
31    {
32       BOOST_MATH_STD_USING // ADL of std names
33
34       T y = 1 - x;
35       if(y == 0)
36       {
37          T big = tools::max_value<T>() / 4;
38          return boost::math::make_tuple(static_cast<T>(-big), static_cast<T>(-big));
39       }
40       if(x == 0)
41       {
42          T big = tools::max_value<T>() / 4;
43          return boost::math::make_tuple(static_cast<T>(-big), big);
44       }
45       T f = log(x) + a * log(y) + t;
46       T f1 = (1 / x) - (a / (y));
47       return boost::math::make_tuple(f, f1);
48    }
49 private:
50    T t, a;
51 };
52 //
53 // See:
54 // "Asymptotic Inversion of the Incomplete Beta Function"
55 // N.M. Temme
56 // Journal of Computation and Applied Mathematics 41 (1992) 145-157.
57 // Section 2.
58 //
59 template <class T, class Policy>
60 T temme_method_1_ibeta_inverse(T a, T b, T z, const Policy& pol)
61 {
62    BOOST_MATH_STD_USING // ADL of std names
63
64    const T r2 = sqrt(T(2));
65    //
66    // get the first approximation for eta from the inverse
67    // error function (Eq: 2.9 and 2.10).
68    //
69    T eta0 = boost::math::erfc_inv(2 * z, pol);
70    eta0 /= -sqrt(a / 2);
71
72    T terms[4] = { eta0 };
73    T workspace[7];
74    //
75    // calculate powers:
76    //
77    T B = b - a;
78    T B_2 = B * B;
79    T B_3 = B_2 * B;
80    //
81    // Calculate correction terms:
82    //
83
84    // See eq following 2.15:
85    workspace[0] = -B * r2 / 2;
86    workspace[1] = (1 - 2 * B) / 8;
87    workspace[2] = -(B * r2 / 48);
88    workspace[3] = T(-1) / 192;
89    workspace[4] = -B * r2 / 3840;
90    terms[1] = tools::evaluate_polynomial(workspace, eta0, 5);
91    // Eq Following 2.17:
92    workspace[0] = B * r2 * (3 * B - 2) / 12;
93    workspace[1] = (20 * B_2 - 12 * B + 1) / 128;
94    workspace[2] = B * r2 * (20 * B - 1) / 960;
95    workspace[3] = (16 * B_2 + 30 * B - 15) / 4608;
96    workspace[4] = B * r2 * (21 * B + 32) / 53760;
97    workspace[5] = (-32 * B_2 + 63) / 368640;
98    workspace[6] = -B * r2 * (120 * B + 17) / 25804480;
99    terms[2] = tools::evaluate_polynomial(workspace, eta0, 7);
100    // Eq Following 2.17:
101    workspace[0] = B * r2 * (-75 * B_2 + 80 * B - 16) / 480;
102    workspace[1] = (-1080 * B_3 + 868 * B_2 - 90 * B - 45) / 9216;
103    workspace[2] = B * r2 * (-1190 * B_2 + 84 * B + 373) / 53760;
104    workspace[3] = (-2240 * B_3 - 2508 * B_2 + 2100 * B - 165) / 368640;
105    terms[3] = tools::evaluate_polynomial(workspace, eta0, 4);
106    //
107    // Bring them together to get a final estimate for eta:
108    //
109    T eta = tools::evaluate_polynomial(terms, T(1/a), 4);
110    //
111    // now we need to convert eta to x, by solving the appropriate
112    // quadratic equation:
113    //
114    T eta_2 = eta * eta;
115    T c = -exp(-eta_2 / 2);
116    T x;
117    if(eta_2 == 0)
118       x = 0.5;
119    else
120       x = (1 + eta * sqrt((1 + c) / eta_2)) / 2;
121
122    BOOST_ASSERT(x >= 0);
123    BOOST_ASSERT(x <= 1);
124    BOOST_ASSERT(eta * (x - 0.5) >= 0);
125 #ifdef BOOST_INSTRUMENT
126    std::cout << "Estimating x with Temme method 1: " << x << std::endl;
127 #endif
128    return x;
129 }
130 //
131 // See:
132 // "Asymptotic Inversion of the Incomplete Beta Function"
133 // N.M. Temme
134 // Journal of Computation and Applied Mathematics 41 (1992) 145-157.
135 // Section 3.
136 //
137 template <class T, class Policy>
138 T temme_method_2_ibeta_inverse(T /*a*/, T /*b*/, T z, T r, T theta, const Policy& pol)
139 {
140    BOOST_MATH_STD_USING // ADL of std names
141
142    //
143    // Get first estimate for eta, see Eq 3.9 and 3.10,
144    // but note there is a typo in Eq 3.10:
145    //
146    T eta0 = boost::math::erfc_inv(2 * z, pol);
147    eta0 /= -sqrt(r / 2);
148
149    T s = sin(theta);
150    T c = cos(theta);
151    //
152    // Now we need to purturb eta0 to get eta, which we do by
153    // evaluating the polynomial in 1/r at the bottom of page 151,
154    // to do this we first need the error terms e1, e2 e3
155    // which we'll fill into the array "terms".  Since these
156    // terms are themselves polynomials, we'll need another
157    // array "workspace" to calculate those...
158    //
159    T terms[4] = { eta0 };
160    T workspace[6];
161    //
162    // some powers of sin(theta)cos(theta) that we'll need later:
163    //
164    T sc = s * c;
165    T sc_2 = sc * sc;
166    T sc_3 = sc_2 * sc;
167    T sc_4 = sc_2 * sc_2;
168    T sc_5 = sc_2 * sc_3;
169    T sc_6 = sc_3 * sc_3;
170    T sc_7 = sc_4 * sc_3;
171    //
172    // Calculate e1 and put it in terms[1], see the middle of page 151:
173    //
174    workspace[0] = (2 * s * s - 1) / (3 * s * c);
175    static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co1[] = { -1, -5, 5 };
176    workspace[1] = -tools::evaluate_even_polynomial(co1, s, 3) / (36 * sc_2);
177    static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co2[] = { 1, 21, -69, 46 };
178    workspace[2] = tools::evaluate_even_polynomial(co2, s, 4) / (1620 * sc_3);
179    static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co3[] = { 7, -2, 33, -62, 31 };
180    workspace[3] = -tools::evaluate_even_polynomial(co3, s, 5) / (6480 * sc_4);
181    static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co4[] = { 25, -52, -17, 88, -115, 46 };
182    workspace[4] = tools::evaluate_even_polynomial(co4, s, 6) / (90720 * sc_5);
183    terms[1] = tools::evaluate_polynomial(workspace, eta0, 5);
184    //
185    // Now evaluate e2 and put it in terms[2]:
186    //
187    static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co5[] = { 7, 12, -78, 52 };
188    workspace[0] = -tools::evaluate_even_polynomial(co5, s, 4) / (405 * sc_3);
189    static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co6[] = { -7, 2, 183, -370, 185 };
190    workspace[1] = tools::evaluate_even_polynomial(co6, s, 5) / (2592 * sc_4);
191    static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co7[] = { -533, 776, -1835, 10240, -13525, 5410 };
192    workspace[2] = -tools::evaluate_even_polynomial(co7, s, 6) / (204120 * sc_5);
193    static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co8[] = { -1579, 3747, -3372, -15821, 45588, -45213, 15071 };
194    workspace[3] = -tools::evaluate_even_polynomial(co8, s, 7) / (2099520 * sc_6);
195    terms[2] = tools::evaluate_polynomial(workspace, eta0, 4);
196    //
197    // And e3, and put it in terms[3]:
198    //
199    static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co9[] = {449, -1259, -769, 6686, -9260, 3704 };
200    workspace[0] = tools::evaluate_even_polynomial(co9, s, 6) / (102060 * sc_5);
201    static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co10[] = { 63149, -151557, 140052, -727469, 2239932, -2251437, 750479 };
202    workspace[1] = -tools::evaluate_even_polynomial(co10, s, 7) / (20995200 * sc_6);
203    static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co11[] = { 29233, -78755, 105222, 146879, -1602610, 3195183, -2554139, 729754 };
204    workspace[2] = tools::evaluate_even_polynomial(co11, s, 8) / (36741600 * sc_7);
205    terms[3] = tools::evaluate_polynomial(workspace, eta0, 3);
206    //
207    // Bring the correction terms together to evaluate eta,
208    // this is the last equation on page 151:
209    //
210    T eta = tools::evaluate_polynomial(terms, T(1/r), 4);
211    //
212    // Now that we have eta we need to back solve for x,
213    // we seek the value of x that gives eta in Eq 3.2.
214    // The two methods used are described in section 5.
215    //
216    // Begin by defining a few variables we'll need later:
217    //
218    T x;
219    T s_2 = s * s;
220    T c_2 = c * c;
221    T alpha = c / s;
222    alpha *= alpha;
223    T lu = (-(eta * eta) / (2 * s_2) + log(s_2) + c_2 * log(c_2) / s_2);
224    //
225    // Temme doesn't specify what value to switch on here,
226    // but this seems to work pretty well:
227    //
228    if(fabs(eta) < 0.7)
229    {
230       //
231       // Small eta use the expansion Temme gives in the second equation
232       // of section 5, it's a polynomial in eta:
233       //
234       workspace[0] = s * s;
235       workspace[1] = s * c;
236       workspace[2] = (1 - 2 * workspace[0]) / 3;
237       static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co12[] = { 1, -13, 13 };
238       workspace[3] = tools::evaluate_polynomial(co12, workspace[0], 3) / (36 * s * c);
239       static const BOOST_MATH_INT_TABLE_TYPE(T, int) co13[] = { 1, 21, -69, 46 };
240       workspace[4] = tools::evaluate_polynomial(co13, workspace[0], 4) / (270 * workspace[0] * c * c);
241       x = tools::evaluate_polynomial(workspace, eta, 5);
242 #ifdef BOOST_INSTRUMENT
243       std::cout << "Estimating x with Temme method 2 (small eta): " << x << std::endl;
244 #endif
245    }
246    else
247    {
248       //
249       // If eta is large we need to solve Eq 3.2 more directly,
250       // begin by getting an initial approximation for x from
251       // the last equation on page 155, this is a polynomial in u:
252       //
253       T u = exp(lu);
254       workspace[0] = u;
255       workspace[1] = alpha;
256       workspace[2] = 0;
257       workspace[3] = 3 * alpha * (3 * alpha + 1) / 6;
258       workspace[4] = 4 * alpha * (4 * alpha + 1) * (4 * alpha + 2) / 24;
259       workspace[5] = 5 * alpha * (5 * alpha + 1) * (5 * alpha + 2) * (5 * alpha + 3) / 120;
260       x = tools::evaluate_polynomial(workspace, u, 6);
261       //
262       // At this point we may or may not have the right answer, Eq-3.2 has
263       // two solutions for x for any given eta, however the mapping in 3.2
264       // is 1:1 with the sign of eta and x-sin^2(theta) being the same.
265       // So we can check if we have the right root of 3.2, and if not
266       // switch x for 1-x.  This transformation is motivated by the fact
267       // that the distribution is *almost* symetric so 1-x will be in the right
268       // ball park for the solution:
269       //
270       if((x - s_2) * eta < 0)
271          x = 1 - x;
272 #ifdef BOOST_INSTRUMENT
273       std::cout << "Estimating x with Temme method 2 (large eta): " << x << std::endl;
274 #endif
275    }
276    //
277    // The final step is a few Newton-Raphson iterations to
278    // clean up our approximation for x, this is pretty cheap
279    // in general, and very cheap compared to an incomplete beta
280    // evaluation.  The limits set on x come from the observation
281    // that the sign of eta and x-sin^2(theta) are the same.
282    //
283    T lower, upper;
284    if(eta < 0)
285    {
286       lower = 0;
287       upper = s_2;
288    }
289    else
290    {
291       lower = s_2;
292       upper = 1;
293    }
294    //
295    // If our initial approximation is out of bounds then bisect:
296    //
297    if((x < lower) || (x > upper))
298       x = (lower+upper) / 2;
299    //
300    // And iterate:
301    //
302    x = tools::newton_raphson_iterate(
303       temme_root_finder<T>(-lu, alpha), x, lower, upper, policies::digits<T, Policy>() / 2);
304
305    return x;
306 }
307 //
308 // See:
309 // "Asymptotic Inversion of the Incomplete Beta Function"
310 // N.M. Temme
311 // Journal of Computation and Applied Mathematics 41 (1992) 145-157.
312 // Section 4.
313 //
314 template <class T, class Policy>
315 T temme_method_3_ibeta_inverse(T a, T b, T p, T q, const Policy& pol)
316 {
317    BOOST_MATH_STD_USING // ADL of std names
318
319    //
320    // Begin by getting an initial approximation for the quantity
321    // eta from the dominant part of the incomplete beta:
322    //
323    T eta0;
324    if(p < q)
325       eta0 = boost::math::gamma_q_inv(b, p, pol);
326    else
327       eta0 = boost::math::gamma_p_inv(b, q, pol);
328    eta0 /= a;
329    //
330    // Define the variables and powers we'll need later on:
331    //
332    T mu = b / a;
333    T w = sqrt(1 + mu);
334    T w_2 = w * w;
335    T w_3 = w_2 * w;
336    T w_4 = w_2 * w_2;
337    T w_5 = w_3 * w_2;
338    T w_6 = w_3 * w_3;
339    T w_7 = w_4 * w_3;
340    T w_8 = w_4 * w_4;
341    T w_9 = w_5 * w_4;
342    T w_10 = w_5 * w_5;
343    T d = eta0 - mu;
344    T d_2 = d * d;
345    T d_3 = d_2 * d;
346    T d_4 = d_2 * d_2;
347    T w1 = w + 1;
348    T w1_2 = w1 * w1;
349    T w1_3 = w1 * w1_2;
350    T w1_4 = w1_2 * w1_2;
351    //
352    // Now we need to compute the purturbation error terms that
353    // convert eta0 to eta, these are all polynomials of polynomials.
354    // Probably these should be re-written to use tabulated data
355    // (see examples above), but it's less of a win in this case as we
356    // need to calculate the individual powers for the denominator terms
357    // anyway, so we might as well use them for the numerator-polynomials
358    // as well....
359    //
360    // Refer to p154-p155 for the details of these expansions:
361    //
362    T e1 = (w + 2) * (w - 1) / (3 * w);
363    e1 += (w_3 + 9 * w_2 + 21 * w + 5) * d / (36 * w_2 * w1);
364    e1 -= (w_4 - 13 * w_3 + 69 * w_2 + 167 * w + 46) * d_2 / (1620 * w1_2 * w_3);
365    e1 -= (7 * w_5 + 21 * w_4 + 70 * w_3 + 26 * w_2 - 93 * w - 31) * d_3 / (6480 * w1_3 * w_4);
366    e1 -= (75 * w_6 + 202 * w_5 + 188 * w_4 - 888 * w_3 - 1345 * w_2 + 118 * w + 138) * d_4 / (272160 * w1_4 * w_5);
367
368    T e2 = (28 * w_4 + 131 * w_3 + 402 * w_2 + 581 * w + 208) * (w - 1) / (1620 * w1 * w_3);
369    e2 -= (35 * w_6 - 154 * w_5 - 623 * w_4 - 1636 * w_3 - 3983 * w_2 - 3514 * w - 925) * d / (12960 * w1_2 * w_4);
370    e2 -= (2132 * w_7 + 7915 * w_6 + 16821 * w_5 + 35066 * w_4 + 87490 * w_3 + 141183 * w_2 + 95993 * w + 21640) * d_2  / (816480 * w_5 * w1_3);
371    e2 -= (11053 * w_8 + 53308 * w_7 + 117010 * w_6 + 163924 * w_5 + 116188 * w_4 - 258428 * w_3 - 677042 * w_2 - 481940 * w - 105497) * d_3 / (14696640 * w1_4 * w_6);
372
373    T e3 = -((3592 * w_7 + 8375 * w_6 - 1323 * w_5 - 29198 * w_4 - 89578 * w_3 - 154413 * w_2 - 116063 * w - 29632) * (w - 1)) / (816480 * w_5 * w1_2);
374    e3 -= (442043 * w_9 + 2054169 * w_8 + 3803094 * w_7 + 3470754 * w_6 + 2141568 * w_5 - 2393568 * w_4 - 19904934 * w_3 - 34714674 * w_2 - 23128299 * w - 5253353) * d / (146966400 * w_6 * w1_3);
375    e3 -= (116932 * w_10 + 819281 * w_9 + 2378172 * w_8 + 4341330 * w_7 + 6806004 * w_6 + 10622748 * w_5 + 18739500 * w_4 + 30651894 * w_3 + 30869976 * w_2 + 15431867 * w + 2919016) * d_2 / (146966400 * w1_4 * w_7);
376    //
377    // Combine eta0 and the error terms to compute eta (Second eqaution p155):
378    //
379    T eta = eta0 + e1 / a + e2 / (a * a) + e3 / (a * a * a);
380    //
381    // Now we need to solve Eq 4.2 to obtain x.  For any given value of
382    // eta there are two solutions to this equation, and since the distribtion
383    // may be very skewed, these are not related by x ~ 1-x we used when
384    // implementing section 3 above.  However we know that:
385    //
386    //  cross < x <= 1       ; iff eta < mu
387    //          x == cross   ; iff eta == mu
388    //     0 <= x < cross    ; iff eta > mu
389    //
390    // Where cross == 1 / (1 + mu)
391    // Many thanks to Prof Temme for clarifying this point.
392    //
393    // Therefore we'll just jump straight into Newton iterations
394    // to solve Eq 4.2 using these bounds, and simple bisection
395    // as the first guess, in practice this converges pretty quickly
396    // and we only need a few digits correct anyway:
397    //
398    if(eta <= 0)
399       eta = tools::min_value<T>();
400    T u = eta - mu * log(eta) + (1 + mu) * log(1 + mu) - mu;
401    T cross = 1 / (1 + mu);
402    T lower = eta < mu ? cross : 0;
403    T upper = eta < mu ? 1 : cross;
404    T x = (lower + upper) / 2;
405    x = tools::newton_raphson_iterate(
406       temme_root_finder<T>(u, mu), x, lower, upper, policies::digits<T, Policy>() / 2);
407 #ifdef BOOST_INSTRUMENT
408    std::cout << "Estimating x with Temme method 3: " << x << std::endl;
409 #endif
410    return x;
411 }
412
413 template <class T, class Policy>
414 struct ibeta_roots
415 {
416    ibeta_roots(T _a, T _b, T t, bool inv = false)
417       : a(_a), b(_b), target(t), invert(inv) {}
418
419    boost::math::tuple<T, T, T> operator()(T x)
420    {
421       BOOST_MATH_STD_USING // ADL of std names
422
423       BOOST_FPU_EXCEPTION_GUARD
424       
425       T f1;
426       T y = 1 - x;
427       T f = ibeta_imp(a, b, x, Policy(), invert, true, &f1) - target;
428       if(invert)
429          f1 = -f1;
430       if(y == 0)
431          y = tools::min_value<T>() * 64;
432       if(x == 0)
433          x = tools::min_value<T>() * 64;
434
435       T f2 = f1 * (-y * a + (b - 2) * x + 1);
436       if(fabs(f2) < y * x * tools::max_value<T>())
437          f2 /= (y * x);
438       if(invert)
439          f2 = -f2;
440
441       // make sure we don't have a zero derivative:
442       if(f1 == 0)
443          f1 = (invert ? -1 : 1) * tools::min_value<T>() * 64;
444
445       return boost::math::make_tuple(f, f1, f2);
446    }
447 private:
448    T a, b, target;
449    bool invert;
450 };
451
452 template <class T, class Policy>
453 T ibeta_inv_imp(T a, T b, T p, T q, const Policy& pol, T* py)
454 {
455    BOOST_MATH_STD_USING  // For ADL of math functions.
456
457    //
458    // The flag invert is set to true if we swap a for b and p for q,
459    // in which case the result has to be subtracted from 1:
460    //
461    bool invert = false;
462    //
463    // Handle trivial cases first:
464    //
465    if(q == 0)
466    {
467       if(py) *py = 0;
468       return 1;
469    }
470    else if(p == 0)
471    {
472       if(py) *py = 1;
473       return 0;
474    }
475    else if(a == 1)
476    {
477       if(b == 1)
478       {
479          if(py) *py = 1 - p;
480          return p;
481       }
482       // Change things around so we can handle as b == 1 special case below:
483       std::swap(a, b);
484       std::swap(p, q);
485       invert = true;
486    }
487    //
488    // Depending upon which approximation method we use, we may end up
489    // calculating either x or y initially (where y = 1-x):
490    //
491    T x = 0; // Set to a safe zero to avoid a
492    // MSVC 2005 warning C4701: potentially uninitialized local variable 'x' used
493    // But code inspection appears to ensure that x IS assigned whatever the code path.
494    T y; 
495
496    // For some of the methods we can put tighter bounds
497    // on the result than simply [0,1]:
498    //
499    T lower = 0;
500    T upper = 1;
501    //
502    // Student's T with b = 0.5 gets handled as a special case, swap
503    // around if the arguments are in the "wrong" order:
504    //
505    if(a == 0.5f)
506    {
507       if(b == 0.5f)
508       {
509          x = sin(p * constants::half_pi<T>());
510          x *= x;
511          if(py)
512          {
513             *py = sin(q * constants::half_pi<T>());
514             *py *= *py;
515          }
516          return x;
517       }
518       else if(b > 0.5f)
519       {
520          std::swap(a, b);
521          std::swap(p, q);
522          invert = !invert;
523       }
524    }
525    //
526    // Select calculation method for the initial estimate:
527    //
528    if((b == 0.5f) && (a >= 0.5f) && (p != 1))
529    {
530       //
531       // We have a Student's T distribution:
532       x = find_ibeta_inv_from_t_dist(a, p, q, &y, pol);
533    }
534    else if(b == 1)
535    {
536       if(p < q)
537       {
538          if(a > 1)
539          {
540             x = pow(p, 1 / a);
541             y = -expm1(log(p) / a);
542          }
543          else
544          {
545             x = pow(p, 1 / a);
546             y = 1 - x;
547          }
548       }
549       else
550       {
551          x = exp(log1p(-q) / a);
552          y = -expm1(log1p(-q) / a);
553       }
554       if(invert)
555          std::swap(x, y);
556       if(py)
557          *py = y;
558       return x;
559    }
560    else if(a + b > 5)
561    {
562       //
563       // When a+b is large then we can use one of Prof Temme's
564       // asymptotic expansions, begin by swapping things around
565       // so that p < 0.5, we do this to avoid cancellations errors
566       // when p is large.
567       //
568       if(p > 0.5)
569       {
570          std::swap(a, b);
571          std::swap(p, q);
572          invert = !invert;
573       }
574       T minv = (std::min)(a, b);
575       T maxv = (std::max)(a, b);
576       if((sqrt(minv) > (maxv - minv)) && (minv > 5))
577       {
578          //
579          // When a and b differ by a small amount
580          // the curve is quite symmetrical and we can use an error
581          // function to approximate the inverse. This is the cheapest
582          // of the three Temme expantions, and the calculated value
583          // for x will never be much larger than p, so we don't have
584          // to worry about cancellation as long as p is small.
585          //
586          x = temme_method_1_ibeta_inverse(a, b, p, pol);
587          y = 1 - x;
588       }
589       else
590       {
591          T r = a + b;
592          T theta = asin(sqrt(a / r));
593          T lambda = minv / r;
594          if((lambda >= 0.2) && (lambda <= 0.8) && (r >= 10))
595          {
596             //
597             // The second error function case is the next cheapest
598             // to use, it brakes down when the result is likely to be
599             // very small, if a+b is also small, but we can use a
600             // cheaper expansion there in any case.  As before x won't
601             // be much larger than p, so as long as p is small we should
602             // be free of cancellation error.
603             //
604             T ppa = pow(p, 1/a);
605             if((ppa < 0.0025) && (a + b < 200))
606             {
607                x = ppa * pow(a * boost::math::beta(a, b, pol), 1/a);
608             }
609             else
610                x = temme_method_2_ibeta_inverse(a, b, p, r, theta, pol);
611             y = 1 - x;
612          }
613          else
614          {
615             //
616             // If we get here then a and b are very different in magnitude
617             // and we need to use the third of Temme's methods which
618             // involves inverting the incomplete gamma.  This is much more
619             // expensive than the other methods.  We also can only use this
620             // method when a > b, which can lead to cancellation errors
621             // if we really want y (as we will when x is close to 1), so
622             // a different expansion is used in that case.
623             //
624             if(a < b)
625             {
626                std::swap(a, b);
627                std::swap(p, q);
628                invert = !invert;
629             }
630             //
631             // Try and compute the easy way first:
632             //
633             T bet = 0;
634             if(b < 2)
635                bet = boost::math::beta(a, b, pol);
636             if(bet != 0)
637             {
638                y = pow(b * q * bet, 1/b);
639                x = 1 - y;
640             }
641             else 
642                y = 1;
643             if(y > 1e-5)
644             {
645                x = temme_method_3_ibeta_inverse(a, b, p, q, pol);
646                y = 1 - x;
647             }
648          }
649       }
650    }
651    else if((a < 1) && (b < 1))
652    {
653       //
654       // Both a and b less than 1,
655       // there is a point of inflection at xs:
656       //
657       T xs = (1 - a) / (2 - a - b);
658       //
659       // Now we need to ensure that we start our iteration from the
660       // right side of the inflection point:
661       //
662       T fs = boost::math::ibeta(a, b, xs, pol) - p;
663       if(fabs(fs) / p < tools::epsilon<T>() * 3)
664       {
665          // The result is at the point of inflection, best just return it:
666          *py = invert ? xs : 1 - xs;
667          return invert ? 1-xs : xs;
668       }
669       if(fs < 0)
670       {
671          std::swap(a, b);
672          std::swap(p, q);
673          invert = !invert;
674          xs = 1 - xs;
675       }
676       T xg = pow(a * p * boost::math::beta(a, b, pol), 1/a);
677       x = xg / (1 + xg);
678       y = 1 / (1 + xg);
679       //
680       // And finally we know that our result is below the inflection
681       // point, so set an upper limit on our search:
682       //
683       if(x > xs)
684          x = xs;
685       upper = xs;
686    }
687    else if((a > 1) && (b > 1))
688    {
689       //
690       // Small a and b, both greater than 1,
691       // there is a point of inflection at xs,
692       // and it's complement is xs2, we must always
693       // start our iteration from the right side of the
694       // point of inflection.
695       //
696       T xs = (a - 1) / (a + b - 2);
697       T xs2 = (b - 1) / (a + b - 2);
698       T ps = boost::math::ibeta(a, b, xs, pol) - p;
699
700       if(ps < 0)
701       {
702          std::swap(a, b);
703          std::swap(p, q);
704          std::swap(xs, xs2);
705          invert = !invert;
706       }
707       //
708       // Estimate x and y, using expm1 to get a good estimate
709       // for y when it's very small:
710       //
711       T lx = log(p * a * boost::math::beta(a, b, pol)) / a;
712       x = exp(lx);
713       y = x < 0.9 ? T(1 - x) : (T)(-boost::math::expm1(lx, pol));
714
715       if((b < a) && (x < 0.2))
716       {
717          //
718          // Under a limited range of circumstances we can improve
719          // our estimate for x, frankly it's clear if this has much effect!
720          //
721          T ap1 = a - 1;
722          T bm1 = b - 1;
723          T a_2 = a * a;
724          T a_3 = a * a_2;
725          T b_2 = b * b;
726          T terms[5] = { 0, 1 };
727          terms[2] = bm1 / ap1;
728          ap1 *= ap1;
729          terms[3] = bm1 * (3 * a * b + 5 * b + a_2 - a - 4) / (2 * (a + 2) * ap1);
730          ap1 *= (a + 1);
731          terms[4] = bm1 * (33 * a * b_2 + 31 * b_2 + 8 * a_2 * b_2 - 30 * a * b - 47 * b + 11 * a_2 * b + 6 * a_3 * b + 18 + 4 * a - a_3 + a_2 * a_2 - 10 * a_2)
732                     / (3 * (a + 3) * (a + 2) * ap1);
733          x = tools::evaluate_polynomial(terms, x, 5);
734       }
735       //
736       // And finally we know that our result is below the inflection
737       // point, so set an upper limit on our search:
738       //
739       if(x > xs)
740          x = xs;
741       upper = xs;
742    }
743    else /*if((a <= 1) != (b <= 1))*/
744    {
745       //
746       // If all else fails we get here, only one of a and b
747       // is above 1, and a+b is small.  Start by swapping
748       // things around so that we have a concave curve with b > a
749       // and no points of inflection in [0,1].  As long as we expect
750       // x to be small then we can use the simple (and cheap) power
751       // term to estimate x, but when we expect x to be large then
752       // this greatly underestimates x and leaves us trying to
753       // iterate "round the corner" which may take almost forever...
754       //
755       // We could use Temme's inverse gamma function case in that case,
756       // this works really rather well (albeit expensively) even though
757       // strictly speaking we're outside it's defined range.
758       //
759       // However it's expensive to compute, and an alternative approach
760       // which models the curve as a distorted quarter circle is much
761       // cheaper to compute, and still keeps the number of iterations
762       // required down to a reasonable level.  With thanks to Prof Temme
763       // for this suggestion.
764       //
765       if(b < a)
766       {
767          std::swap(a, b);
768          std::swap(p, q);
769          invert = !invert;
770       }
771       if(pow(p, 1/a) < 0.5)
772       {
773          x = pow(p * a * boost::math::beta(a, b, pol), 1 / a);
774          if(x == 0)
775             x = boost::math::tools::min_value<T>();
776          y = 1 - x;
777       }
778       else /*if(pow(q, 1/b) < 0.1)*/
779       {
780          // model a distorted quarter circle:
781          y = pow(1 - pow(p, b * boost::math::beta(a, b, pol)), 1/b);
782          if(y == 0)
783             y = boost::math::tools::min_value<T>();
784          x = 1 - y;
785       }
786    }
787
788    //
789    // Now we have a guess for x (and for y) we can set things up for
790    // iteration.  If x > 0.5 it pays to swap things round:
791    //
792    if(x > 0.5)
793    {
794       std::swap(a, b);
795       std::swap(p, q);
796       std::swap(x, y);
797       invert = !invert;
798       T l = 1 - upper;
799       T u = 1 - lower;
800       lower = l;
801       upper = u;
802    }
803    //
804    // lower bound for our search:
805    //
806    // We're not interested in denormalised answers as these tend to
807    // these tend to take up lots of iterations, given that we can't get
808    // accurate derivatives in this area (they tend to be infinite).
809    //
810    if(lower == 0)
811    {
812       if(invert && (py == 0))
813       {
814          //
815          // We're not interested in answers smaller than machine epsilon:
816          //
817          lower = boost::math::tools::epsilon<T>();
818          if(x < lower)
819             x = lower;
820       }
821       else
822          lower = boost::math::tools::min_value<T>();
823       if(x < lower)
824          x = lower;
825    }
826    //
827    // Figure out how many digits to iterate towards:
828    //
829    int digits = boost::math::policies::digits<T, Policy>() / 2;
830    if((x < 1e-50) && ((a < 1) || (b < 1)))
831    {
832       //
833       // If we're in a region where the first derivative is very
834       // large, then we have to take care that the root-finder
835       // doesn't terminate prematurely.  We'll bump the precision
836       // up to avoid this, but we have to take care not to set the
837       // precision too high or the last few iterations will just
838       // thrash around and convergence may be slow in this case.
839       // Try 3/4 of machine epsilon:
840       //
841       digits *= 3;  
842       digits /= 2;
843    }
844    //
845    // Now iterate, we can use either p or q as the target here
846    // depending on which is smaller:
847    //
848    boost::uintmax_t max_iter = policies::get_max_root_iterations<Policy>();
849    x = boost::math::tools::halley_iterate(
850       boost::math::detail::ibeta_roots<T, Policy>(a, b, (p < q ? p : q), (p < q ? false : true)), x, lower, upper, digits, max_iter);
851    policies::check_root_iterations<T>("boost::math::ibeta<%1%>(%1%, %1%, %1%)", max_iter, pol);
852    //
853    // We don't really want these asserts here, but they are useful for sanity
854    // checking that we have the limits right, uncomment if you suspect bugs *only*.
855    //
856    //BOOST_ASSERT(x != upper);
857    //BOOST_ASSERT((x != lower) || (x == boost::math::tools::min_value<T>()) || (x == boost::math::tools::epsilon<T>()));
858    //
859    // Tidy up, if we "lower" was too high then zero is the best answer we have:
860    //
861    if(x == lower)
862       x = 0;
863    if(py)
864       *py = invert ? x : 1 - x;
865    return invert ? 1-x : x;
866 }
867
868 } // namespace detail
869
870 template <class T1, class T2, class T3, class T4, class Policy>
871 inline typename tools::promote_args<T1, T2, T3, T4>::type  
872    ibeta_inv(T1 a, T2 b, T3 p, T4* py, const Policy& pol)
873 {
874    static const char* function = "boost::math::ibeta_inv<%1%>(%1%,%1%,%1%)";
875    BOOST_FPU_EXCEPTION_GUARD
876    typedef typename tools::promote_args<T1, T2, T3, T4>::type result_type;
877    typedef typename policies::evaluation<result_type, Policy>::type value_type;
878    typedef typename policies::normalise<
879       Policy, 
880       policies::promote_float<false>, 
881       policies::promote_double<false>, 
882       policies::discrete_quantile<>,
883       policies::assert_undefined<> >::type forwarding_policy;
884
885    if(a <= 0)
886       return policies::raise_domain_error<result_type>(function, "The argument a to the incomplete beta function inverse must be greater than zero (got a=%1%).", a, pol);
887    if(b <= 0)
888       return policies::raise_domain_error<result_type>(function, "The argument b to the incomplete beta function inverse must be greater than zero (got b=%1%).", b, pol);
889    if((p < 0) || (p > 1))
890       return policies::raise_domain_error<result_type>(function, "Argument p outside the range [0,1] in the incomplete beta function inverse (got p=%1%).", p, pol);
891
892    value_type rx, ry;
893
894    rx = detail::ibeta_inv_imp(
895          static_cast<value_type>(a),
896          static_cast<value_type>(b),
897          static_cast<value_type>(p),
898          static_cast<value_type>(1 - p),
899          forwarding_policy(), &ry);
900
901    if(py) *py = policies::checked_narrowing_cast<T4, forwarding_policy>(ry, function);
902    return policies::checked_narrowing_cast<result_type, forwarding_policy>(rx, function);
903 }
904
905 template <class T1, class T2, class T3, class T4>
906 inline typename tools::promote_args<T1, T2, T3, T4>::type  
907    ibeta_inv(T1 a, T2 b, T3 p, T4* py)
908 {
909    return ibeta_inv(a, b, p, py, policies::policy<>());
910 }
911
912 template <class T1, class T2, class T3>
913 inline typename tools::promote_args<T1, T2, T3>::type 
914    ibeta_inv(T1 a, T2 b, T3 p)
915 {
916    typedef typename tools::promote_args<T1, T2, T3>::type result_type;
917    return ibeta_inv(a, b, p, static_cast<result_type*>(0), policies::policy<>());
918 }
919
920 template <class T1, class T2, class T3, class Policy>
921 inline typename tools::promote_args<T1, T2, T3>::type 
922    ibeta_inv(T1 a, T2 b, T3 p, const Policy& pol)
923 {
924    typedef typename tools::promote_args<T1, T2, T3>::type result_type;
925    return ibeta_inv(a, b, p, static_cast<result_type*>(0), pol);
926 }
927
928 template <class T1, class T2, class T3, class T4, class Policy>
929 inline typename tools::promote_args<T1, T2, T3, T4>::type 
930    ibetac_inv(T1 a, T2 b, T3 q, T4* py, const Policy& pol)
931 {
932    static const char* function = "boost::math::ibetac_inv<%1%>(%1%,%1%,%1%)";
933    BOOST_FPU_EXCEPTION_GUARD
934    typedef typename tools::promote_args<T1, T2, T3, T4>::type result_type;
935    typedef typename policies::evaluation<result_type, Policy>::type value_type;
936    typedef typename policies::normalise<
937       Policy, 
938       policies::promote_float<false>, 
939       policies::promote_double<false>, 
940       policies::discrete_quantile<>,
941       policies::assert_undefined<> >::type forwarding_policy;
942
943    if(a <= 0)
944       policies::raise_domain_error<result_type>(function, "The argument a to the incomplete beta function inverse must be greater than zero (got a=%1%).", a, pol);
945    if(b <= 0)
946       policies::raise_domain_error<result_type>(function, "The argument b to the incomplete beta function inverse must be greater than zero (got b=%1%).", b, pol);
947    if((q < 0) || (q > 1))
948       policies::raise_domain_error<result_type>(function, "Argument q outside the range [0,1] in the incomplete beta function inverse (got q=%1%).", q, pol);
949
950    value_type rx, ry;
951
952    rx = detail::ibeta_inv_imp(
953          static_cast<value_type>(a),
954          static_cast<value_type>(b),
955          static_cast<value_type>(1 - q),
956          static_cast<value_type>(q),
957          forwarding_policy(), &ry);
958
959    if(py) *py = policies::checked_narrowing_cast<T4, forwarding_policy>(ry, function);
960    return policies::checked_narrowing_cast<result_type, forwarding_policy>(rx, function);
961 }
962
963 template <class T1, class T2, class T3, class T4>
964 inline typename tools::promote_args<T1, T2, T3, T4>::type 
965    ibetac_inv(T1 a, T2 b, T3 q, T4* py)
966 {
967    return ibetac_inv(a, b, q, py, policies::policy<>());
968 }
969
970 template <class RT1, class RT2, class RT3>
971 inline typename tools::promote_args<RT1, RT2, RT3>::type 
972    ibetac_inv(RT1 a, RT2 b, RT3 q)
973 {
974    typedef typename tools::promote_args<RT1, RT2, RT3>::type result_type;
975    return ibetac_inv(a, b, q, static_cast<result_type*>(0), policies::policy<>());
976 }
977
978 template <class RT1, class RT2, class RT3, class Policy>
979 inline typename tools::promote_args<RT1, RT2, RT3>::type
980    ibetac_inv(RT1 a, RT2 b, RT3 q, const Policy& pol)
981 {
982    typedef typename tools::promote_args<RT1, RT2, RT3>::type result_type;
983    return ibetac_inv(a, b, q, static_cast<result_type*>(0), pol);
984 }
985
986 } // namespace math
987 } // namespace boost
988
989 #endif // BOOST_MATH_SPECIAL_FUNCTIONS_IGAMMA_INVERSE_HPP
990
991
992
993