]> git.donarmstrong.com Git - rsem.git/blob - EBSeq/man/crit_fun.Rd
Included EBSeq for downstream differential expression analysis
[rsem.git] / EBSeq / man / crit_fun.Rd
1 \name{crit_fun}
2 \alias{crit_fun}
3 %- Also NEED an '\alias' for EACH other topic documented here.
4 \title{
5 Calculate the adjusted FDR threshold 
6 }
7 \description{
8 Calculate the adjusted FDR threshold using the posterior probabilities at a target FDR
9 }
10 \usage{
11 crit_fun(PPEE, thre)
12 }
13 %- maybe also 'usage' for other objects documented here.
14 \arguments{
15   \item{PPEE}{
16 The posterior probabilities of being EE.
17 }
18   \item{thre}{
19 The target FDR.
20   }
21
22 }
23 \details{
24 %%  ~~ If necessary, more details than the description above ~~
25 }
26 \value{
27 The adjusted FDR threshold of target FDR.
28 }
29 \references{
30 }
31 \author{
32 Ning Leng
33 }
34
35 %% ~Make other sections like Warning with \section{Warning }{....} ~
36
37 \seealso{
38 }
39 \examples{
40 ##---- Should be DIRECTLY executable !! ----
41 ##-- ==>  Define data, use random,
42 ##--    or do  help(data=index)  for the standard data sets.
43
44 ## The function is currently defined as
45 }
46 % Add one or more standard keywords, see file 'KEYWORDS' in the
47 % R documentation directory.
48 \keyword{ FDR }