EBSeq/man/PlotTopCts.Rd

   1 \name{PlotTopCts}
   2 \alias{PlotTopCts}
   3 %- Also NEED an '\alias' for EACH other topic documented here.
   4 \title{
   5 Plot 3 plots for simulation data
   6 }
   7 \description{
   8 %%  ~~ A concise (1-5 lines) description of what the function does. ~~
   9 }
  10 \usage{
  11 PlotTopCts(TopNum, FD, names)
  12 }
  13 %- maybe also 'usage' for other objects documented here.
  14 \arguments{
  15   \item{TopNum}{
  16 %%     ~~Describe \code{TopNum} here~~
  17 }
  18   \item{FD}{
  19 %%     ~~Describe \code{FD} here~~
  20 }
  21   \item{names}{
  22 %%     ~~Describe \code{names} here~~
  23 }
  24 }
  25 \details{
  26 %%  ~~ If necessary, more details than the description above ~~
  27 }
  28 \value{
  29 %%  ~Describe the value returned
  30 %%  If it is a LIST, use
  31 %%  \item{comp1 }{Description of 'comp1'}
  32 %%  \item{comp2 }{Description of 'comp2'}
  33 %% ...
  34 }
  35 \references{
  36 %% ~put references to the literature/web site here ~
  37 }
  38 \author{
  39 %%  ~~who you are~~
  40 }
  41 \note{
  42 %%  ~~further notes~~
  43 }
  44
  45 %% ~Make other sections like Warning with \section{Warning }{....} ~
  46
  47 \seealso{
  48 %% ~~objects to See Also as \code{\link{help}}, ~~~
  49 }
  50 \examples{
  51 ##---- Should be DIRECTLY executable !! ----
  52 ##-- ==>  Define data, use random,
  53 ##--    or do  help(data=index)  for the standard data sets.
  54
  55 ## The function is currently defined as
  56 function(TopNum, FD, names)
  57 {
  58     matplot(c(1:TopNum) , FD,type="l",xlab="Top DE selected", lwd=2, log="y", ylab="FD")
  59     legend("topleft",col=1:TopNum, lwd=2, lty=1:TopNum, names)
  60
  61   }
  62 }
  63 % Add one or more standard keywords, see file 'KEYWORDS' in the
  64 % R documentation directory.
  65 \keyword{ ~kwd1 }
  66 \keyword{ ~kwd2 }% __ONLY ONE__ keyword per line