EBSeq/man/PlotFDTP.Rd

   1 \name{PlotFDTP}
   2 \alias{PlotFDTP}
   3 %- Also NEED an '\alias' for EACH other topic documented here.
   4 \title{
   5 Plot the FDR vs TPR for each method in simulation data
   6 }
   7 \description{
   8 %%  ~~ A concise (1-5 lines) description of what the function does. ~~
   9 }
  10 \usage{
  11 PlotFDTP(TopNum, FDR, TPR, names)
  12 }
  13 %- maybe also 'usage' for other objects documented here.
  14 \arguments{
  15   \item{TopNum}{
  16 %%     ~~Describe \code{TopNum} here~~
  17 }
  18   \item{FDR}{
  19 %%     ~~Describe \code{FDR} here~~
  20 }
  21   \item{TPR}{
  22 %%     ~~Describe \code{TPR} here~~
  23 }
  24   \item{names}{
  25 %%     ~~Describe \code{names} here~~
  26 }
  27 }
  28 \details{
  29 %%  ~~ If necessary, more details than the description above ~~
  30 }
  31 \value{
  32 %%  ~Describe the value returned
  33 %%  If it is a LIST, use
  34 %%  \item{comp1 }{Description of 'comp1'}
  35 %%  \item{comp2 }{Description of 'comp2'}
  36 %% ...
  37 }
  38 \references{
  39 %% ~put references to the literature/web site here ~
  40 }
  41 \author{
  42 %%  ~~who you are~~
  43 }
  44 \note{
  45 %%  ~~further notes~~
  46 }
  47
  48 %% ~Make other sections like Warning with \section{Warning }{....} ~
  49
  50 \seealso{
  51 %% ~~objects to See Also as \code{\link{help}}, ~~~
  52 }
  53 \examples{
  54 ##---- Should be DIRECTLY executable !! ----
  55 ##-- ==>  Define data, use random,
  56 ##--    or do  help(data=index)  for the standard data sets.
  57
  58 ## The function is currently defined as
  59 function(TopNum, FDR, TPR,names)
  60 {
  61
  62   matplot(FDR, TPR, xlim=c(0,.5), ylim=c(0,1) ,type="l",lwd=2,xlab="FDR", ylab="TPR")
  63     legend("bottomright",col=1:TopNum, lwd=2, lty=1:TopNum, names)
  64
  65
  66   }
  67 }
  68 % Add one or more standard keywords, see file 'KEYWORDS' in the
  69 % R documentation directory.
  70 \keyword{ ~kwd1 }
  71 \keyword{ ~kwd2 }% __ONLY ONE__ keyword per line