README.txt

   1 README.txt for PAML\r
   2 \r
   3 PAML (for Phylogentic Analysis by Maximum Likelihood) contains a few\r
   4 programs for model fitting and phylogenetic tree reconstruction using\r
   5 nucleotide or amino-acid sequence data.  ANSI C source codes as well\r
   6 as Win32 and MC OSX excutables are distributed.  Win32 executables are \r
   7 in the folder bin.  Type, say, \r
   8         bin\codeml\r
   9 to run the codeml program.  For UNIX and OS-X systems, go to the src/ \r
  10 folder to compile the programs: "cd src" and then "make".\r
  11 \r
  12 The documentation is in doc/pamlDOC.pdf.  The program web page is the \r
  13 following, where the archive can be downloaded:\r
  14 \r
  15         http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html\r
  16 \r
  17 PAML is distributed free of charge for academic use only.\r
  18 \r
  19 Ziheng Yang\r
  20 Department of Biology                   Phone: (+44) (0)20 7679 4379\r
  21 University College London               Fax:   (+44) (0)20 7679 7096\r
  22 Darwin Building                         Email: z.yang @ ucl.ac.uk\r
  23 Gower Street\r
  24 London WC1E 6BT\r
  25 England\r