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+ 2 , // [ 71] = G (Nucleotide)
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+ 3 , // [ 84] = T (Nucleotide)
+ 3 , // [ 85] = U (Nucleotide)
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+ 0 , // [ 97] = a (Nucleotide)
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+ 2 , // [103] = g (Nucleotide)
+ INVALID_LETTER, // [104] = 104
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+ 3 , // [116] = t (Nucleotide)
+ 3 , // [117] = u (Nucleotide)
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+ INVALID_LETTER, // [253] = 0xfd
+ INVALID_LETTER, // [254] = 0xfe
+ INVALID_LETTER, // [255] = 0xff
+ };
+
+unsigned char g_LetterToCharNucleo[256] =
+ {
+ 'A', // [0]
+ 'C', // [1]
+ 'G', // [2]
+ 'T', // [3]
+ INVALID_CHAR, // [4]
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+ INVALID_CHAR, // [255]
+ };
+
+unsigned g_CodonWordToAminoLetter[4*4*4] =
+ {
+ 8 , // [ 0] = AAA K (Lys)
+ 11, // [ 1] = AAC N (Asn)
+ 8 , // [ 2] = AAG K (Lys)
+ 11, // [ 3] = AAT N (Asn)
+ 16, // [ 4] = ACA T (Thr)
+ 16, // [ 5] = ACC T (Thr)
+ 16, // [ 6] = ACG T (Thr)
+ 16, // [ 7] = ACT T (Thr)
+ 14, // [ 8] = AGA R (Arg)
+ 15, // [ 9] = AGC S (Ser)
+ 14, // [10] = AGG R (Arg)
+ 15, // [11] = AGT S (Ser)
+ 7 , // [12] = ATA I (Ile)
+ 7 , // [13] = ATC I (Ile)
+ 10, // [14] = ATG M (Met)
+ 7 , // [15] = ATT I (Ile)
+ 13, // [16] = CAA Q (Gln)
+ 6 , // [17] = CAC H (His)
+ 13, // [18] = CAG Q (Gln)
+ 6 , // [19] = CAT H (His)
+ 12, // [20] = CCA P (Pro)
+ 12, // [21] = CCC P (Pro)
+ 12, // [22] = CCG P (Pro)
+ 12, // [23] = CCT P (Pro)
+ 14, // [24] = CGA R (Arg)
+ 14, // [25] = CGC R (Arg)
+ 14, // [26] = CGG R (Arg)
+ 14, // [27] = CGT R (Arg)
+ 9 , // [28] = CTA L (Leu)
+ 9 , // [29] = CTC L (Leu)
+ 9 , // [30] = CTG L (Leu)
+ 9 , // [31] = CTT L (Leu)
+ 3 , // [32] = GAA E (Glu)
+ 2 , // [33] = GAC D (Asp)
+ 3 , // [34] = GAG E (Glu)
+ 2 , // [35] = GAT D (Asp)
+ 0 , // [36] = GCA A (Ala)
+ 0 , // [37] = GCC A (Ala)
+ 0 , // [38] = GCG A (Ala)
+ 0 , // [39] = GCT A (Ala)
+ 5 , // [40] = GGA G (Gly)
+ 5 , // [41] = GGC G (Gly)
+ 5 , // [42] = GGG G (Gly)
+ 5 , // [43] = GGT G (Gly)
+ 17, // [44] = GTA V (Val)
+ 17, // [45] = GTC V (Val)
+ 17, // [46] = GTG V (Val)
+ 17, // [47] = GTT V (Val)
+ 20, // [48] = TAA * (STP)
+ 19, // [49] = TAC Y (Tyr)
+ 20, // [50] = TAG * (STP)
+ 19, // [51] = TAT Y (Tyr)
+ 15, // [52] = TCA S (Ser)
+ 15, // [53] = TCC S (Ser)
+ 15, // [54] = TCG S (Ser)
+ 15, // [55] = TCT S (Ser)
+ 20, // [56] = TGA * (STP)
+ 1 , // [57] = TGC C (Cys)
+ 18, // [58] = TGG W (Trp)
+ 1 , // [59] = TGT C (Cys)
+ 9 , // [60] = TTA L (Leu)
+ 4 , // [61] = TTC F (Phe)
+ 9 , // [62] = TTG L (Leu)
+ 4 , // [63] = TTT F (Phe)
+ };
+
+char g_CodonWordToAminoChar[4*4*4] =
+ {
+ 'K', // [ 0] = AAA (Lys)
+ 'N', // [ 1] = AAC (Asn)
+ 'K', // [ 2] = AAG (Lys)
+ 'N', // [ 3] = AAT (Asn)
+ 'T', // [ 4] = ACA (Thr)
+ 'T', // [ 5] = ACC (Thr)
+ 'T', // [ 6] = ACG (Thr)
+ 'T', // [ 7] = ACT (Thr)
+ 'R', // [ 8] = AGA (Arg)
+ 'S', // [ 9] = AGC (Ser)
+ 'R', // [10] = AGG (Arg)
+ 'S', // [11] = AGT (Ser)
+ 'I', // [12] = ATA (Ile)
+ 'I', // [13] = ATC (Ile)
+ 'M', // [14] = ATG (Met)
+ 'I', // [15] = ATT (Ile)
+ 'Q', // [16] = CAA (Gln)
+ 'H', // [17] = CAC (His)
+ 'Q', // [18] = CAG (Gln)
+ 'H', // [19] = CAT (His)
+ 'P', // [20] = CCA (Pro)
+ 'P', // [21] = CCC (Pro)
+ 'P', // [22] = CCG (Pro)
+ 'P', // [23] = CCT (Pro)
+ 'R', // [24] = CGA (Arg)
+ 'R', // [25] = CGC (Arg)
+ 'R', // [26] = CGG (Arg)
+ 'R', // [27] = CGT (Arg)
+ 'L', // [28] = CTA (Leu)
+ 'L', // [29] = CTC (Leu)
+ 'L', // [30] = CTG (Leu)
+ 'L', // [31] = CTT (Leu)
+ 'E', // [32] = GAA (Glu)
+ 'D', // [33] = GAC (Asp)
+ 'E', // [34] = GAG (Glu)
+ 'D', // [35] = GAT (Asp)
+ 'A', // [36] = GCA (Ala)
+ 'A', // [37] = GCC (Ala)
+ 'A', // [38] = GCG (Ala)
+ 'A', // [39] = GCT (Ala)
+ 'G', // [40] = GGA (Gly)
+ 'G', // [41] = GGC (Gly)
+ 'G', // [42] = GGG (Gly)
+ 'G', // [43] = GGT (Gly)
+ 'V', // [44] = GTA (Val)
+ 'V', // [45] = GTC (Val)
+ 'V', // [46] = GTG (Val)
+ 'V', // [47] = GTT (Val)
+ '*', // [48] = TAA (STP)
+ 'Y', // [49] = TAC (Tyr)
+ '*', // [50] = TAG (STP)
+ 'Y', // [51] = TAT (Tyr)
+ 'S', // [52] = TCA (Ser)
+ 'S', // [53] = TCC (Ser)
+ 'S', // [54] = TCG (Ser)
+ 'S', // [55] = TCT (Ser)
+ '*', // [56] = TGA (STP)
+ 'C', // [57] = TGC (Cys)
+ 'W', // [58] = TGG (Trp)
+ 'C', // [59] = TGT (Cys)
+ 'L', // [60] = TTA (Leu)
+ 'F', // [61] = TTC (Phe)
+ 'L', // [62] = TTG (Leu)
+ 'F', // [63] = TTT (Phe)
+ };
+
+unsigned char g_CharToCompChar[256] =
+ {
+ INVALID_CHAR, // [ 0]
+ INVALID_CHAR, // [ 1]
+ INVALID_CHAR, // [ 2]
+ INVALID_CHAR, // [ 3]
+ INVALID_CHAR, // [ 4]
+ INVALID_CHAR, // [ 5]
+ INVALID_CHAR, // [ 6]
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+ INVALID_CHAR, // [ 8]
+ INVALID_CHAR, // [ 9]
+ INVALID_CHAR, // [ 10]
+ INVALID_CHAR, // [ 11]
+ INVALID_CHAR, // [ 12]
+ INVALID_CHAR, // [ 13]
+ INVALID_CHAR, // [ 14]
+ INVALID_CHAR, // [ 15]
+ INVALID_CHAR, // [ 16]
+ INVALID_CHAR, // [ 17]
+ INVALID_CHAR, // [ 18]
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+ INVALID_CHAR, // [ 20]
+ INVALID_CHAR, // [ 21]
+ INVALID_CHAR, // [ 22]
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+ INVALID_CHAR, // [ 24]
+ INVALID_CHAR, // [ 25]
+ INVALID_CHAR, // [ 26]
+ INVALID_CHAR, // [ 27]
+ INVALID_CHAR, // [ 28]
+ INVALID_CHAR, // [ 29]
+ INVALID_CHAR, // [ 30]
+ INVALID_CHAR, // [ 31]
+ INVALID_CHAR, // [ 32]
+ INVALID_CHAR, // [ 33]
+ INVALID_CHAR, // [ 34]
+ INVALID_CHAR, // [ 35]
+ INVALID_CHAR, // [ 36]
+ INVALID_CHAR, // [ 37]
+ INVALID_CHAR, // [ 38]
+ INVALID_CHAR, // [ 39]
+ INVALID_CHAR, // [ 40]
+ INVALID_CHAR, // [ 41]
+ INVALID_CHAR, // [ 42]
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+ INVALID_CHAR, // [ 45]
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+ INVALID_CHAR, // [ 48]
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+ INVALID_CHAR, // [ 51]
+ INVALID_CHAR, // [ 52]
+ INVALID_CHAR, // [ 53]
+ INVALID_CHAR, // [ 54]
+ INVALID_CHAR, // [ 55]
+ INVALID_CHAR, // [ 56]
+ INVALID_CHAR, // [ 57]
+ INVALID_CHAR, // [ 58]
+ INVALID_CHAR, // [ 59]
+ INVALID_CHAR, // [ 60]
+ INVALID_CHAR, // [ 61]
+ INVALID_CHAR, // [ 62]
+ INVALID_CHAR, // [ 63]
+ INVALID_CHAR, // [ 64]
+ 'T', // [ 65] A -> T
+ INVALID_CHAR, // [ 66]
+ 'G', // [ 67] C -> G
+ INVALID_CHAR, // [ 68]
+ INVALID_CHAR, // [ 69]
+ INVALID_CHAR, // [ 70]
+ 'C', // [ 71] G -> C
+ INVALID_CHAR, // [ 72]
+ INVALID_CHAR, // [ 73]
+ INVALID_CHAR, // [ 74]
+ INVALID_CHAR, // [ 75]
+ INVALID_CHAR, // [ 76]
+ INVALID_CHAR, // [ 77]
+ INVALID_CHAR, // [ 78]
+ INVALID_CHAR, // [ 79]
+ INVALID_CHAR, // [ 80]
+ INVALID_CHAR, // [ 81]
+ INVALID_CHAR, // [ 82]
+ INVALID_CHAR, // [ 83]
+ 'A', // [ 84] T -> A
+ 'A', // [ 85] U -> A
+ INVALID_CHAR, // [ 86]
+ INVALID_CHAR, // [ 87]
+ INVALID_CHAR, // [ 88]
+ INVALID_CHAR, // [ 89]
+ INVALID_CHAR, // [ 90]
+ INVALID_CHAR, // [ 91]
+ INVALID_CHAR, // [ 92]
+ INVALID_CHAR, // [ 93]
+ INVALID_CHAR, // [ 94]
+ INVALID_CHAR, // [ 95]
+ INVALID_CHAR, // [ 96]
+ 'T', // [ 97] a -> T
+ INVALID_CHAR, // [ 98]
+ 'G', // [ 99] c -> G
+ INVALID_CHAR, // [100]
+ INVALID_CHAR, // [101]
+ INVALID_CHAR, // [102]
+ 'C', // [103] g -> C
+ INVALID_CHAR, // [104]
+ INVALID_CHAR, // [105]
+ INVALID_CHAR, // [106]
+ INVALID_CHAR, // [107]
+ INVALID_CHAR, // [108]
+ INVALID_CHAR, // [109]
+ INVALID_CHAR, // [110]
+ INVALID_CHAR, // [111]
+ INVALID_CHAR, // [112]
+ INVALID_CHAR, // [113]
+ INVALID_CHAR, // [114]
+ INVALID_CHAR, // [115]
+ 'A', // [116] t -> A
+ 'A', // [117] u -> A
+ INVALID_CHAR, // [118]
+ INVALID_CHAR, // [119]
+ INVALID_CHAR, // [120]
+ INVALID_CHAR, // [121]
+ INVALID_CHAR, // [122]
+ INVALID_CHAR, // [123]
+ INVALID_CHAR, // [124]
+ INVALID_CHAR, // [125]
+ INVALID_CHAR, // [126]
+ INVALID_CHAR, // [127]
+ INVALID_CHAR, // [128]
+ INVALID_CHAR, // [129]
+ INVALID_CHAR, // [130]
+ INVALID_CHAR, // [131]
+ INVALID_CHAR, // [132]
+ INVALID_CHAR, // [133]
+ INVALID_CHAR, // [134]
+ INVALID_CHAR, // [135]
+ INVALID_CHAR, // [136]
+ INVALID_CHAR, // [137]
+ INVALID_CHAR, // [138]
+ INVALID_CHAR, // [139]
+ INVALID_CHAR, // [140]
+ INVALID_CHAR, // [141]
+ INVALID_CHAR, // [142]
+ INVALID_CHAR, // [143]
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+ INVALID_CHAR, // [145]
+ INVALID_CHAR, // [146]
+ INVALID_CHAR, // [147]
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+ INVALID_CHAR, // [149]
+ INVALID_CHAR, // [150]
+ INVALID_CHAR, // [151]
+ INVALID_CHAR, // [152]
+ INVALID_CHAR, // [153]
+ INVALID_CHAR, // [154]
+ INVALID_CHAR, // [155]
+ INVALID_CHAR, // [156]
+ INVALID_CHAR, // [157]
+ INVALID_CHAR, // [158]
+ INVALID_CHAR, // [159]
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+
+unsigned g_CharToCompLetter[256] =
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+};
+
+bool g_IsAminoChar[256] =
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+ false, // [ 33] '!'
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+ false, // [126] '~'
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+bool g_IsNucleoChar[256] =
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