treecalculator.h

   1 #ifndef TREECALCULATOR_H
   2 #define TREECALCULATOR_H
   3
   4 /*
   5  *  treecalculator.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by Sarah Westcott on 1/26/09.
   9  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12
  13 using namespace std;
  14
  15 #include "mothur.h"
  16 #include "tree.h"
  17
  18 /* The tree calculator class is the parent class for tree calculators in mothur. */
  19
  20 typedef vector<double> EstOutput;
  21
  22 /***********************************************************************/
  23
  24 class TreeCalculator {
  25
  26 public:
  27         TreeCalculator(){};
  28         TreeCalculator(string n) : name(n) {};
  29         ~TreeCalculator(){};
  30         virtual EstOutput getValues(Tree*) = 0;
  31         virtual EstOutput getValues(Tree*, string, string) = 0;
  32
  33         virtual string getName()                {       return name;    }
  34
  35 protected:
  36         EstOutput data;
  37         string name;
  38
  39 };
  40
  41 /***********************************************************************/
  42
  43 #endif