treecalculator.h

   1 #ifndef TREECALCULATOR_H
   2 #define TREECALCULATOR_H
   3
   4 /*
   5  *  treecalculator.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by Sarah Westcott on 1/26/09.
   9  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12
  13 using namespace std;
  14
  15 #include "mothur.h"
  16 #include "utilities.hpp"
  17 #include "tree.h"
  18
  19 /* The tree calculator class is the parent class for tree calculators in mothur. */
  20
  21 typedef vector<double> EstOutput;
  22
  23 /***********************************************************************/
  24
  25 class TreeCalculator {
  26
  27 public:
  28         TreeCalculator(){};
  29         TreeCalculator(string n) : name(n) {};
  30         ~TreeCalculator(){};
  31         virtual EstOutput getValues(Tree*) = 0;
  32         virtual EstOutput getValues(Tree*, string, string) = 0;
  33
  34         virtual string getName()                {       return name;    }
  35
  36 protected:
  37         EstOutput data;
  38         string name;
  39
  40 };
  41
  42 /***********************************************************************/
  43
  44 #endif