]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blob - shen.h
broke up globaldata and moved error checking and help into commands
[mothur.git] / shen.h
1 #ifndef SHEN_H
2 #define SHEN_H
3
4 /*
5  *  shen.h
6  *  Mothur
7  *
8  *  Created by Thomas Ryabin on 5/18/09.
9  *  Copyright 2009Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
10  *
11  */
12
13 #include "calculator.h"
14 #include "globaldata.hpp"
15
16 /* This class implements the shen calculator on single group. 
17  It is a child of the calculator class. */
18
19 /***********************************************************************/
20
21 class Shen : public Calculator  {
22         
23 public: 
24         Shen(int size, int n) : m(size), abund(n), Calculator("shen", 1, false) {};
25         EstOutput getValues(SAbundVector*);     
26         EstOutput getValues(vector<SharedRAbundVector*>) {return data;};
27 private:
28         int m;
29         int abund;
30         GlobalData* globaldata;
31 };
32
33
34 /***********************************************************************/
35
36 #endif