sharednseqs.h

   1 #ifndef SHAREDNSEQS_H
   2 #define SHAREDNSEQS_H
   3
   4 /*
   5  *  sharednseqs.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by Sarah Westcott on 3/16/09.
   9  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12
  13 #include "calculator.h"
  14
  15 /***********************************************************************/
  16 class SharedNSeqs : public Calculator {
  17
  18 public:
  19         SharedNSeqs() : Calculator("sharednseqs", 1, false) {};
  20         EstOutput getValues(SAbundVector* rank){ return data; };
  21         EstOutput getValues(vector<SharedRAbundVector*> shared) {
  22                 data.resize(1,0);
  23                 data[0] = (double)shared[0]->getNumSeqs() + (double)shared[1]->getNumSeqs();
  24                 return data;
  25         }
  26         string getCitation() { return "http://www.mothur.org/wiki/Sharednseqs"; }
  27 };
  28
  29 /***********************************************************************/
  30
  31 #endif