sharedjackknife.h

   1 #ifndef SHAREDJACKKNIFE_H
   2 #define SHAREDJACKKNIFE_H
   3
   4 /*
   5  *  sharedjackknife.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by Thomas Ryabin on 3/30/09.
   9  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12
  13 #include "calculator.h"
  14
  15 /*This class implements the SharedJackknife estimator.
  16 It is a child of the calculator class.*/
  17
  18 /***********************************************************************/
  19
  20 class SharedJackknife : public Calculator  {
  21
  22 public:
  23         SharedJackknife() : numGroups(-1), callCount(0), count(0), currentCallDone(true), Calculator("sharedjackknife", 3, false) {};
  24         EstOutput getValues(SAbundVector*) {return data;};
  25         EstOutput getValues(vector<SharedRAbundVector*>);
  26         string getCitation() { return "http://www.mothur.org/wiki/Sharedjackknife"; }
  27
  28 private:
  29         int numGroups, callCount, count;
  30         bool currentCallDone;
  31         vector<SharedRAbundVector*> groups;
  32         double simpson(vector<int>, double, int);
  33         double* jackknife();
  34 };
  35
  36 /***********************************************************************/
  37
  38 #endif
  39