otuhierarchycommand.h

   1 #ifndef OTUHIERARCHYCOMMAND_H
   2 #define OTUHIERARCHYCOMMAND_H
   3 /*
   4  *  otuhierarchycommand.h
   5  *  Mothur
   6  *
   7  *  Created by westcott on 1/19/10.
   8  *  Copyright 2010 Schloss Lab. All rights reserved.
   9  *
  10  */
  11
  12 #include "command.hpp"
  13 #include "listvector.hpp"
  14
  15 //**********************************************************************************************************************
  16
  17 class OtuHierarchyCommand : public Command {
  18
  19 public:
  20         OtuHierarchyCommand(string);
  21         ~OtuHierarchyCommand();
  22         int execute();
  23         void help();
  24
  25 private:
  26         bool abort;
  27         set<string> labels; //holds labels to be used
  28         string label, listFile, outputDir, output;
  29
  30         vector<ListVector> getListVectors();
  31
  32 };
  33
  34 //**********************************************************************************************************************
  35
  36 #endif
  37
  38