mothurout.cpp

   1 /*
   2  *  m->mothurOut.cpp
   3  *  Mothur
   4  *
   5  *  Created by westcott on 2/25/10.
   6  *  Copyright 2010 Schloss Lab. All rights reserved.
   7  *
   8  */
   9
  10 #include "mothurout.h"
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  12 /******************************************************/
  13 MothurOut* MothurOut::getInstance() {
  14         if( _uniqueInstance == 0) {
  15                 _uniqueInstance = new MothurOut();
  16         }
  17         return _uniqueInstance;
  18 }
  19 /*********************************************************************************************/
  20 void MothurOut::setFileName(string filename)  {
  21         try {
  22                 logFileName = filename;
  23                 openOutputFile(filename, out);
  24         }
  25         catch(exception& e) {
  26                 errorOut(e, "MothurOut", "setFileName");
  27                 exit(1);
  28         }
  29 }
  30 /*********************************************************************************************/
  31 MothurOut::~MothurOut() {
  32         try {
  33                 _uniqueInstance = 0;
  34                 out.close();
  35         }
  36         catch(exception& e) {
  37                 errorOut(e, "MothurOut", "MothurOut");
  38                 exit(1);
  39         }
  40 }
  41
  42 /*********************************************************************************************/
  43 void MothurOut::mothurOut(string output) {
  44         try {
  45
  46                 cout << output;
  47                 out << output;
  48
  49         }
  50         catch(exception& e) {
  51                 errorOut(e, "MothurOut", "MothurOut");
  52                 exit(1);
  53         }
  54 }
  55 /*********************************************************************************************/
  56 void MothurOut::mothurOutEndLine() {
  57         try {
  58                 cout << endl;
  59                 out << endl;
  60         }
  61         catch(exception& e) {
  62                 errorOut(e, "MothurOut", "MothurOutEndLine");
  63                 exit(1);
  64         }
  65 }
  66 /*********************************************************************************************/
  67 void MothurOut::mothurOutJustToLog(string output) {
  68         try {
  69                 out << output;
  70         }
  71         catch(exception& e) {
  72                 errorOut(e, "MothurOut", "MothurOutJustToLog");
  73                 exit(1);
  74         }
  75 }
  76 /*********************************************************************************************/
  77 void MothurOut::errorOut(exception& e, string object, string function) {
  78         mothurOut("Error: ");
  79         mothurOut(toString(e.what()));
  80         mothurOut(" has occurred in the " + object + " class function " + function + ". Please contact Pat Schloss at mothur.bugs@gmail.com, and be sure to include the mothur.logFile with your inquiry.");
  81         mothurOutEndLine();
  82 }
  83 /*********************************************************************************************/
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