mothur.cpp

   1 /*
   2  *  interface.cpp
   3  *
   4  *
   5  *  Created by Pat Schloss on 8/14/08.
   6  *  Copyright 2008 Patrick D. Schloss. All rights reserved.
   7  *
   8  */
   9
  10 #include "mothur.h"
  11 #include "engine.hpp"
  12 #include "globaldata.hpp"
  13
  14 using namespace std;
  15
  16 GlobalData* GlobalData::_uniqueInstance = 0;
  17
  18 int main(int argc, char *argv[]){
  19         try {
  20         //      srand(54321);
  21                 srand( (unsigned)time( NULL ) );
  22
  23                 Engine* dotur;
  24                 bool bail = 0;
  25
  26                 if(argc>1){
  27                         dotur = new BatchEngine(argv[1]);
  28                 }
  29                 else{
  30                         dotur = new InteractEngine();
  31                 }
  32
  33                 while(bail == 0)                {       bail = dotur->getInput();                       }
  34
  35                 delete dotur;
  36
  37                 return 0;
  38         }
  39         catch(exception& e) {
  40                 cout << "Standard Error: " << e.what() << " has occurred in the dotur class Function main. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
  41                 exit(1);
  42         }
  43         catch(...) {
  44                 cout << "An unknown error has occurred in the dotur class function main. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
  45                 exit(1);
  46         }
  47 }
  48