getgroupcommand.cpp

   1 /*
   2  *  getgroupcommand.cpp
   3  *  Mothur
   4  *
   5  *  Created by Thomas Ryabin on 2/2/09.
   6  *  Copyright 2009 __MyCompanyName__. All rights reserved.
   7  *
   8  */
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  10 #include "getgroupcommand.h"
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  13 GetgroupCommand::GetgroupCommand(){
  14         try {
  15                 globaldata = GlobalData::getInstance();
  16                 groupMap = globaldata->gGroupmap;
  17         }
  18         catch(exception& e) {
  19                 cout << "Standard Error: " << e.what() << " has occurred in the GetgroupCommand class Function GetgroupCommand. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
  20                 exit(1);
  21         }
  22         catch(...) {
  23                 cout << "An unknown error has occurred in the GetgroupCommand class function GetgroupCommand. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
  24                 exit(1);
  25         }
  26
  27 }
  28
  29 //**********************************************************************************************************************
  30
  31 GetgroupCommand::~GetgroupCommand(){
  32 }
  33
  34 //**********************************************************************************************************************
  35
  36 int GetgroupCommand::execute(){
  37         try {
  38                 vector<string> groupNames = groupMap->namesOfGroups;
  39                 for(int i = 0; i < groupNames.size(); i++)
  40                         cout << groupNames[i] << "\n";
  41                 return 0;
  42         }
  43
  44         catch(exception& e) {
  45                 cout << "Standard Error: " << e.what() << " has occurred in the GetgroupCommand class Function execute. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
  46                 exit(1);
  47         }
  48         catch(...) {
  49                 cout << "An unknown error has occurred in the GetgroupCommand class function execute. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
  50                 exit(1);
  51         }
  52 }
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