emacs_el/configuration/don-configuration.org

   1 #+PROPERTY: header-args:emacs-lisp :tangle don-configuration.el
   2 * Load debugger
   3
   4 # if for some reason, things get pear-shaped, we want to be able to
   5 # enter the debugger by sending -USR2 to emacs
   6
   7 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
   8 (setq debug-on-event 'siguser2)
   9 #+END_SRC
  10 * Initial startup stuff
  11 ** Disable startup screen
  12 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  13   (setq inhibit-startup-screen t)
  14 #+END_SRC
  15 ** Disable cluter
  16 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  17   ; (if (fboundp 'menu-bar-mode) (menu-bar-mode -1))
  18   (if (fboundp 'tool-bar-mode) (tool-bar-mode -1))
  19   (if (fboundp 'scroll-bar-mode) (scroll-bar-mode -1))
  20 #+END_SRC
  21 ** Fullscreen
  22 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  23   (setq frame-resize-pixelwise t)
  24   (add-to-list 'default-frame-alist '(fullscreen . maximixed))
  25 #+END_SRC
  26 * Package management
  27 ** package repositories and package manager
  28 Borrowed from https://github.com/nilcons/emacs-use-package-fast/ to
  29 load  [[https://github.com/jwiegley/use-package/][use-package]] even faster
  30 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  31   (eval-and-compile
  32     ;; add /etc/ssl/ca-global/ca-certificates.crt so that we can
  33     ;; download packages when we're on Debian hosts which chop down the
  34     ;; list of available certificates
  35     (require 'gnutls)
  36     (add-to-list 'gnutls-trustfiles "/etc/ssl/ca-global/ca-certificates.crt")
  37     (setq package-enable-at-startup nil)
  38     (setq package--init-file-ensured t)
  39     (setq package-user-dir "~/var/emacs/elpa")
  40     (setq package-archives '(("gnu" . "https://elpa.gnu.org/packages/")
  41                              ("melpa" . "https://melpa.org/packages/")
  42                              ("org" . "http://orgmode.org/elpa/")))
  43     (setq use-package-verbose (not (bound-and-true-p byte-compile-current-file))))
  44   (mapc #'(lambda (add) (add-to-list 'load-path add))
  45     (eval-when-compile
  46       (package-initialize)
  47       (unless (package-installed-p 'use-package)
  48         (package-refresh-contents)
  49         (package-install 'use-package))
  50       (let ((package-user-dir-real (file-truename package-user-dir)))
  51         ;; The reverse is necessary, because outside we mapc
  52         ;; add-to-list element-by-element, which reverses.
  53         (nreverse (apply #'nconc
  54                  ;; Only keep package.el provided loadpaths.
  55                  (mapcar #'(lambda (path)
  56                      (if (string-prefix-p package-user-dir-real path)
  57                          (list path)
  58                        nil))
  59                      load-path))))))
  60
  61   ;;; fix up info paths for packages
  62   (with-eval-after-load "info"
  63     (info-initialize)
  64     (dolist (dir (directory-files package-user-dir))
  65       (let ((fdir (concat (file-name-as-directory package-user-dir) dir)))
  66         (unless (or (member dir '("." ".." "archives" "gnupg"))
  67                     (not (file-directory-p fdir))
  68                     (not (file-exists-p (concat (file-name-as-directory fdir) "dir"))))
  69           (add-to-list 'Info-directory-list fdir)))))
  70
  71
  72   (eval-when-compile
  73     (require 'use-package))
  74   (require 'bind-key)
  75   (require 'diminish)
  76 #+END_SRC
  77 ** Paradox
  78 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  79   (use-package paradox
  80     :ensure paradox
  81     :commands (paradox-upgrade-packages paradox-list-packages)
  82     :config
  83     (setq paradox-execute-asynchronously t)
  84     (setq paradox-github-token t) ; I don't want to be prompted about this integration
  85     )
  86 #+END_SRC
  87 * Paths
  88 ** Update PATH
  89 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  90   (add-to-list 'exec-path '"/usr/local/bin")
  91   (add-to-list 'exec-path '"~/bin/")
  92 #+END_SRC
  93 ** Add library paths
  94
  95 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  96   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/")
  97   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/magit-annex")
  98 #+END_SRC
  99 * Disable custom-vars
 100 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 101   ;; Set the custom file to /dev/null and don't bother to load it
 102   (setq custom-file "/dev/null")
 103 #+END_SRC
 104 * Misc functions
 105 ** with-library
 106 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 107 ;; From http://www.emacswiki.org/emacs/LoadingLispFiles
 108 ;; execute conditional code when loading libraries
 109 (defmacro with-library (symbol &rest body)
 110   `(when (require ,symbol nil t)
 111      ,@body))
 112 (put 'with-library 'lisp-indent-function 1)
 113 #+END_SRC
 114
 115 * Variables
 116 ** Safe Local Variables
 117 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 118 (setq safe-local-variable-values
 119       (quote ((auto-save-default)
 120               (make-backup-files)
 121               (cperl-indent-level . 4)
 122               (indent-level . 4)
 123               (indent-tabs-mode . f)
 124               (vcl-indent-level . 4)
 125               )))
 126 #+END_SRC
 127 * Memory
 128 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 129   (setq global-mark-ring-max 128
 130         mark-ring-max 128
 131         kill-ring-max 128)
 132
 133   (defun don/minibuffer-setup-hook ()
 134     (setq gc-cons-threshold most-positive-fixnum))
 135
 136   (defun don/minibuffer-exit-hook ()
 137     (setq gc-cons-threshold 1048576))
 138
 139   (add-hook 'minibuffer-setup-hook #'don/minibuffer-setup-hook)
 140   (add-hook 'minibuffer-exit-hook #'don/minibuffer-exit-hook)
 141 #+END_SRC
 142 * Modules
 143 ** Spacemacs theme
 144 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 145 (use-package spacemacs-common
 146   :ensure spacemacs-theme
 147   :config
 148   (load-theme 'spacemacs-dark t)
 149   )
 150 #+END_SRC
 151 ** Hippie Expand
 152 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 153   (use-package hippie-exp
 154     :bind* (("M-<SPC>" . hippie-expand))
 155     )
 156 #+END_SRC
 157 ** Flyspell 🐝
 158 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 159   (use-package flyspell
 160     :ensure t
 161     :diminish flyspell-mode 🐝
 162     :config
 163     (add-hook 'text-mode-hook 'turn-on-flyspell)
 164     (add-hook 'c-mode-common-hook 'flyspell-prog-mode)
 165     (add-hook 'cperl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 166     (add-hook 'tcl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 167     :init
 168     (setq ispell-program-name "ispell")
 169     )
 170
 171 #+END_SRC
 172 ** Flymake
 173 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
 174   (use-package flymake
 175     :diminish "Φ")
 176 #+end_src
 177
 178 ** Winnermode
 179 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 180   (winner-mode 1)
 181 #+END_SRC
 182 ** Eyebrowse
 183
 184 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 185   (use-package eyebrowse
 186     :ensure t
 187     :diminish eyebrowse-mode
 188     :init (setq eyebrowse-keymap-prefix (kbd "C-c e"))
 189     :config (progn
 190               (setq eyebrowse-wrap-around t)
 191               (eyebrowse-mode t)
 192
 193               (defun my/eyebrowse-new-window-config ()
 194                 (interactive)
 195                 (let ((done nil))
 196                   (dotimes (i 10)
 197                     ;; start at 1 run till 0
 198                     (let ((j (mod (+ i 1) 10)))
 199                       (when (and (not done)
 200                                  (not (eyebrowse--window-config-present-p j)))
 201                         (eyebrowse-switch-to-window-config j)
 202                         (call-interactively 'eyebrowse-rename-window-config2 j)
 203                         (setq done t)
 204                         ))
 205                     )))
 206
 207               ;; I don't use latex-preview-pane
 208               ;; (require 'latex-preview-pane)
 209               ;; (defun my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch ()
 210               ;;   ;; latex-preview-pane uses window-parameters which are
 211               ;;   ;; not preserved by eyebrowse, so we close the preview
 212               ;;   ;; pane before switching, it will be regenerated when we
 213               ;;   ;; edit the TeX file.
 214               ;;   (when (lpp/window-containing-preview)
 215               ;;     (delete-window (lpp/window-containing-preview))))
 216
 217               ;; (add-to-list 'eyebrowse-pre-window-switch-hook
 218               ;;              #'my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch)
 219
 220               ;; (my/set-menu-key "["  #'my/eyebrowse-new-window-config)
 221               ;; (my/set-menu-key ";"  #'eyebrowse-prev-window-config)
 222               ;; (my/set-menu-key "'"  #'eyebrowse-next-window-config)
 223               ;; (my/set-menu-key "]"  #'eyebrowse-close-window-config)
 224               ;; (my/set-menu-key "\\" #'eyebrowse-rename-window-config)
 225               )
 226     )
 227 #+END_SRC
 228
 229 ** Window handling
 230
 231 *** Splitting
 232 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 233   (defun my/vsplit-last-buffer ()
 234     "Split the window vertically and display the previous buffer."
 235     (interactive)
 236     (split-window-vertically)
 237     (other-window 1 nil)
 238     (switch-to-next-buffer))
 239
 240   (defun my/hsplit-last-buffer ()
 241     "Split the window horizontally and display the previous buffer."
 242     (interactive)
 243     (split-window-horizontally)
 244     (other-window 1 nil)
 245     (switch-to-next-buffer))
 246
 247   (bind-key "C-x 2" 'my/vsplit-last-buffer)
 248   (bind-key "C-x 3" 'my/hsplit-last-buffer)
 249
 250   (setq split-width-threshold  100)
 251   (setq split-height-threshold 60)
 252
 253   (defun my/split-window-prefer-vertically (window)
 254     "If there's only one window (excluding any possibly active
 255            minibuffer), then split the current window horizontally."
 256     (if (and (one-window-p t)
 257              (not (active-minibuffer-window))
 258              ( < (frame-width) (frame-height))
 259              )
 260         (let ((split-width-threshold nil))
 261           (split-window-sensibly window))
 262       (split-window-sensibly window)))
 263
 264   (setq split-window-preferred-function #'my/split-window-prefer-vertically)
 265   (setq window-combination-resize t)
 266 #+END_SRC
 267
 268 *** Compilation window
 269
 270 If there is no compilation window, open one at the bottom, spanning
 271 the complete width of the frame. Otherwise, reuse existing window. In
 272 the former case, if there was no error the window closes
 273 automatically.
 274
 275 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 276   (add-to-list 'display-buffer-alist
 277                `(,(rx bos "*compilation*" eos)
 278                  (display-buffer-reuse-window
 279                   display-buffer-in-side-window)
 280                  (reusable-frames . visible)
 281                  (side            . bottom)
 282                  (window-height   . 0.4)))
 283 #+END_SRC
 284
 285 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 286   (defun my/compilation-exit-autoclose (status code msg)
 287     ;; If M-x compile exists with a 0
 288     (when (and (eq status 'exit) (zerop code))
 289       ;; and delete the *compilation* window
 290       (let ((compilation-window (get-buffer-window (get-buffer "*compilation*"))))
 291         (when (and (not (window-at-side-p compilation-window 'top))
 292                    (window-at-side-p compilation-window 'left)
 293                    (window-at-side-p compilation-window 'right))
 294           (delete-window compilation-window))))
 295     ;; Always return the anticipated result of compilation-exit-message-function
 296     (cons msg code))
 297
 298   ;; Specify my function (maybe I should have done a lambda function)
 299   (setq compilation-exit-message-function #'my/compilation-exit-autoclose)
 300 #+END_SRC
 301
 302 If you change the variable ~compilation-scroll-output~ to a ~non-nil~
 303 value, the compilation buffer scrolls automatically to follow the
 304 output. If the value is ~first-error~, scrolling stops when the first
 305 error appears, leaving point at that error. For any other non-nil
 306 value, scrolling continues until there is no more output.
 307
 308 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 309   (setq compilation-scroll-output 'first-error)
 310 #+END_SRC
 311
 312 ** Mode line cleaning
 313 *** Diminish
 314 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 315   (use-package diminish
 316     :ensure t)
 317 #+END_SRC
 318
 319 *** Delight
 320 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 321   (use-package delight
 322     :ensure t)
 323 #+END_SRC
 324
 325 ** Jumping
 326 *** Avy
 327 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 328   (use-package avy
 329     :if (>= emacs-major-version 25)
 330     :ensure t
 331     :bind (("C-c C-<SPC>" . avy-goto-word-or-subword-1)
 332            ("C-c j j" . avy-goto-word-or-subword-1)
 333            ("M-g g" . avy-goto-line))
 334     :config (progn (setq avy-background t))
 335     )
 336 #+END_SRC
 337 *** Ace-link (jumping to links)
 338 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 339   (use-package ace-link
 340     :ensure t
 341     ; bind o in most modes
 342     :config (ace-link-setup-default))
 343 #+END_SRC
 344 *** Jumping through edit points (goto-chg)
 345 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 346   (use-package goto-chg
 347     :ensure t
 348     :bind (("C-c j ," . goto-last-change)
 349            ("C-c j ." . goto-last-change-reverse))
 350     )
 351 #+END_SRC
 352 *** Jumping to bookmarks (visible bookmarks, bm)
 353 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 354   (use-package bm
 355     :ensure t
 356     :bind (("C-c j b ." . bm-next)
 357            ("C-c j b ," . bm-previous)
 358            ("C-c j b SPC" . bm-toggle)))
 359 #+END_SRC
 360
 361 ** Snippets
 362 *** Yasnippet
 363 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 364 (use-package yasnippet
 365   :ensure t
 366   :diminish yas-minor-mode
 367   :config (progn
 368             (yas-global-mode)
 369             (setq yas-verbosity 1)
 370             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<tab>") nil)
 371             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "TAB") nil)
 372             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<backtab>") nil)
 373             (setq yas-snippet-dirs '("~/lib/emacs_el/snippets/"
 374                                      "~/lib/emacs_el/yasnippet-snippets/snippets/"))
 375             (add-to-list 'hippie-expand-try-functions-list
 376                              'yas-hippie-try-expand)
 377             (yas-reload-all)
 378             )
 379   )
 380 #+END_SRC
 381 *** Auto-YASnippet
 382 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 383   (use-package auto-yasnippet
 384     :ensure t
 385     :bind (("H-w" . aya-create)
 386            ("H-y" . aya-expand)
 387            )
 388     )
 389 #+END_SRC
 390 ** Company
 391 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 392 (use-package company
 393   :ensure t
 394   :bind (("M-/" . company-complete))
 395   :config
 396   (setq company-echo-delay 0     ; remove blinking
 397         company-show-numbers t   ; show numbers for easy selection
 398         company-selection-wrap-around t
 399         company-require-match nil
 400         company-dabbrev-ignore-case t
 401         company-dabbrev-ignore-invisible t
 402         company-dabbrev-other-buffers t
 403         company-dabbrev-downcase nil
 404         company-dabbrev-code-everywhere t
 405         company-tooltip-align-annotations t
 406         company-minimum-prefix-length 1
 407         company-global-modes '(not)
 408         company-lighter-base "(C)")
 409   (global-company-mode 1)
 410   :bind (:map company-active-map
 411               ("C-n" . company-select-next)
 412               ("C-p" . company-select-previous)
 413               ("M-?" . company-show-doc-buffer)
 414               ("M-." . company-show-location)
 415               )
 416   )
 417 #+END_SRC
 418 *** C/C++
 419 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 420   (use-package company-c-headers
 421     :ensure t
 422     :config (progn
 423               (defun malb/ede-object-system-include-path ()
 424                 "Return the system include path for the current buffer."
 425                 (when ede-object
 426                   (ede-system-include-path ede-object)))
 427
 428               (setq company-c-headers-path-system
 429                     #'malb/ede-object-system-include-path)
 430
 431               (add-to-list 'company-backends #'company-c-headers)))
 432 #+END_SRC
 433 *** Python
 434 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 435 (use-package company-anaconda
 436   :ensure t
 437   :config (add-to-list 'company-backends #'company-anaconda))
 438 #+END_SRC
 439 *** Perl
 440 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 441   (use-package company-plsense
 442     :ensure t
 443     )
 444 #+END_SRC
 445 *** LaTeX
 446 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 447   (use-package company-math
 448     :ensure t)
 449 #+END_SRC
 450 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 451   (use-package company-auctex
 452     :ensure t
 453     :config (progn
 454               (defun company-auctex-labels (command &optional arg &rest ignored)
 455                 "company-auctex-labels backend"
 456                 (interactive (list 'interactive))
 457                 (case command
 458                   (interactive (company-begin-backend 'company-auctex-labels))
 459                   (prefix (company-auctex-prefix "\\\\.*ref{\\([^}]*\\)\\="))
 460                   (candidates (company-auctex-label-candidates arg))))
 461
 462               (add-to-list 'company-backends
 463                            '(company-auctex-macros
 464                              company-auctex-environments
 465                              company-math-symbols-unicode
 466                              company-math-symbols-latex))
 467
 468               (add-to-list 'company-backends #'company-auctex-labels)
 469               (add-to-list 'company-backends #'company-auctex-bibs)
 470               )
 471     )
 472 #+END_SRC
 473 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 474   (use-package company-bibtex
 475     :ensure t
 476     )
 477 #+END_SRC
 478 *** Shell
 479
 480  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 481    (use-package company-shell
 482      :ensure t
 483      :config (progn
 484                (setq company-shell-modes '(sh-mode shell-mode))
 485                (add-to-list 'company-backends 'company-shell)))
 486  #+END_SRC
 487
 488 *** YaSnippet
 489
 490  Add YasSippet support for all company backends. ([[https://github.com/syl20bnr/spacemacs/pull/179][source]])
 491
 492  *Note:* Do this at the end of =company-mode= config.
 493
 494  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 495    (defvar malb/company-mode/enable-yas t
 496      "Enable yasnippet for all backends.")
 497
 498    (defun malb/company-mode/backend-with-yas (backend)
 499      (if (or (not malb/company-mode/enable-yas)
 500              (and (listp backend)
 501                   (member 'company-yasnippet backend)))
 502          backend
 503        (append (if (consp backend) backend (list backend))
 504                '(:with company-yasnippet))))
 505
 506    (setq company-backends
 507          (mapcar #'malb/company-mode/backend-with-yas company-backends))
 508  #+END_SRC
 509
 510 *** All the words
 511
 512  Enable/disable company completion from ispell dictionaries ([[https://github.com/redguardtoo/emacs.d/blob/master/lisp/init-company.el][source]])
 513
 514  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 515    (defun malb/toggle-company-ispell ()
 516      (interactive)
 517      (cond
 518       ((member '(company-ispell :with company-yasnippet) company-backends)
 519        (setq company-backends (delete '(company-ispell :with company-yasnippet) company-backends))
 520        (add-to-list 'company-backends '(company-dabbrev :with company-yasnippet) t)
 521        (message "company-ispell disabled"))
 522       (t
 523        (setq company-backends (delete '(company-dabbrev :with company-yasnippet) company-backends))
 524        (add-to-list 'company-backends '(company-ispell :with company-yasnippet) t)
 525        (message "company-ispell enabled!"))))
 526
 527    (defun malb/company-ispell-setup ()
 528      ;; @see https://github.com/company-mode/company-mode/issues/50
 529      (when (boundp 'company-backends)
 530        (make-local-variable 'company-backends)
 531        (setq company-backends (delete '(company-dabbrev :with company-yasnippet) company-backends))
 532        (add-to-list 'company-backends '(company-ispell :with company-yasnippet) t)
 533        ;; https://github.com/redguardtoo/emacs.d/issues/473
 534        (if (and (boundp 'ispell-alternate-dictionary)
 535                 ispell-alternate-dictionary)
 536            (setq company-ispell-dictionary ispell-alternate-dictionary))))
 537  #+END_SRC
 538
 539 *** Tab DWIM
 540
 541  1. =yas-expand= is run first and does what it has to, then it calls =malb/indent-fold-or-complete=.
 542
 543  2. This function then hopefully does what I want:
 544
 545     a. if a region is active, just indent
 546     b. if we’re looking at a space after a non-whitespace character, we try some company-expansion
 547     c. If =hs-minor-mode= or =outline-minor-mode= is active, try those next
 548     d. otherwise call whatever would have been called otherwise.
 549
 550  ([[http://emacs.stackexchange.com/q/21182/8930][source]], [[http://emacs.stackexchange.com/q/7908/8930][source]])
 551
 552 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 553 (defun malb/indent-fold-or-complete (&optional arg)
 554   (interactive "P")
 555   (cond
 556    ;; if a region is active, indent
 557    ((use-region-p)
 558     (indent-region (region-beginning)
 559                    (region-end)))
 560    ;; if the next char is space or eol, but prev char not whitespace
 561    ((and (not (active-minibuffer-window))
 562          (or (looking-at " ")
 563              (looking-at "$"))
 564          (looking-back "[^[:space:]]")
 565          (not (looking-back "^")))
 566
 567     (cond (company-mode (company-complete-common))
 568           (auto-complete-mode (auto-complete))))
 569
 570    ;; no whitespace anywhere
 571    ((and (not (active-minibuffer-window))
 572          (looking-at "[^[:space:]]")
 573          (looking-back "[^[:space:]]")
 574          (not (looking-back "^")))
 575     (cond
 576      ((bound-and-true-p hs-minor-mode)
 577       (save-excursion (end-of-line) (hs-toggle-hiding)))
 578      ((bound-and-true-p outline-minor-mode)
 579       (save-excursion (outline-cycle)))))
 580
 581    ;; by default just call whatever was bound
 582    (t
 583     (let ((fn (or (if (current-local-map) (lookup-key (current-local-map) (kbd "TAB")))
 584                   'indent-for-tab-command)))
 585       (if (not (called-interactively-p 'any))
 586           (fn arg)
 587         (setq this-command fn)
 588         (call-interactively fn))))))
 589
 590 (defun malb/toggle-fold ()
 591   (interactive)
 592   (cond ((eq major-mode 'org-mode)
 593          (org-force-cycle-archived))
 594         ((bound-and-true-p hs-minor-mode)
 595          (save-excursion
 596            (end-of-line)
 597            (hs-toggle-hiding)))
 598
 599         ((bound-and-true-p outline-minor-mode)
 600          (save-excursion
 601            (outline-cycle)))))
 602
 603 (bind-key "<tab>" #'malb/indent-fold-or-complete)
 604 (bind-key "C-<tab>" #'malb/toggle-fold)
 605 #+END_SRC
 606 ** Tinyprocmail
 607
 608 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 609   ;; load tinyprocmail
 610   (use-package tinyprocmail
 611     :load-path "~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/tiny"
 612     :mode (".procmailrc" . turn-on-tinyprocmail-mode)
 613     )
 614 #+END_SRC
 615
 616 ** Magit
 617 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
 618   (use-package magit
 619     :ensure t
 620     :bind (("C-x g" . magit-status)
 621            ("C-x C-g" . magit-status))
 622     :config
 623     ;; refine diffs always (hilight words)
 624     (setq magit-diff-refine-hunk nil)
 625     )
 626   (use-package magit-annex
 627     :ensure t
 628     :load-path "~/lib/emacs_el/magit-annex/"
 629     )
 630   (use-package magit-vcsh
 631     :ensure t
 632     )
 633 #+END_SRC
 634
 635 ** Perl
 636 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 637   (use-package cperl-mode
 638     :config
 639     (progn
 640       ;; Use c-mode for perl .xs files
 641       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.xs\\'" . c-mode))
 642       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\([pP][Llm]\\|al\\)\\'" . cperl-mode))
 643       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl" . cperl-mode))
 644       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl5" . cperl-mode))
 645       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("miniperl" . cperl-mode))
 646       (setq cperl-hairy t
 647             cperl-indent-level 4
 648             cperl-auto-newline nil
 649             cperl-auto-newline-after-colon nil
 650             cperl-continued-statement-offset 4
 651             cperl-brace-offset -1
 652             cperl-continued-brace-offset 0
 653             cperl-label-offset -4
 654             cperl-highlight-variables-indiscriminately t
 655             cperl-electric-lbrace-space nil
 656             cperl-indent-parens-as-block nil
 657             cperl-close-paren-offset -1
 658             cperl-tab-always-indent t)
 659       ;;(add-hook 'cperl-mode-hook (lambda () (cperl-set-style "PerlStyle")))
 660   ))
 661 #+END_SRC
 662
 663 ** Markdown mode
 664 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 665   (use-package markdown-mode
 666     :ensure t
 667     :mode (("\\.md\\'" . markdown-mode)
 668            ("\\.mdwn\\'" . markdown-mode)
 669            ("README\\.md\\'" . gfm-mode)
 670            )
 671     :config
 672     (setq markdown-enable-math t)
 673     (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
 674     (bind-key "M-." #'markdown-jump markdown-mode-map)
 675     (add-hook 'markdown-mode-hook #'flyspell-mode)
 676     (add-hook 'markdown-mode-hook #'outline-minor-mode)
 677     (bind-key "C-<tab>" #'outline-cycle markdown-mode-map)
 678   )
 679
 680 #+END_SRC
 681 ** SQL mode
 682 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 683   ; load sql-indent when sql is loaded
 684 (use-package sql-indent
 685   :hook sql-mode
 686   )
 687 (use-package sql
 688   :mode (("\\.sql\\'" . sql-mode))
 689   )
 690 #+END_SRC
 691 ** Ediff
 692 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 693   (use-package ediff
 694     :commands ediff ediff3
 695     :ensure f
 696     :config
 697     ;; ediff configuration
 698     ;; don't use the multi-window configuration
 699     (setq ediff-window-setup-function 'ediff-setup-windows-plain)
 700   )
 701 #+END_SRC
 702 ** Do the Right Thing Indenting
 703 Attempts to automatically identify the right indentation for a file
 704 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 705 (use-package dtrt-indent
 706   :ensure t
 707 )
 708 #+END_SRC
 709 ** VCL --editing varnish configuration files
 710 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 711   (use-package vcl-mode
 712     :ensure t
 713     :mode "\\.vcl\\'"
 714     )
 715
 716 #+END_SRC
 717 ** Helm
 718 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 719   (defun malb/helm-omni (&rest arg)
 720     ;; just in case someone decides to pass an argument, helm-omni won't fail.
 721     (interactive)
 722     (unless helm-source-buffers-list
 723       (setq helm-source-buffers-list
 724             (helm-make-source "Buffers" 'helm-source-buffers)))
 725     (helm-other-buffer
 726      (append
 727
 728      (if (projectile-project-p)
 729           '(helm-source-projectile-buffers-list
 730             helm-source-buffers-list)
 731         '(helm-source-buffers-list)) ;; list of all open buffers
 732
 733       `(((name . "Virtual Workspace")
 734          (candidates . ,(--map (cons (eyebrowse-format-slot it) (car it))
 735                                (eyebrowse--get 'window-configs)))
 736          (action . (lambda (candidate)
 737                      (eyebrowse-switch-to-window-config candidate)))))
 738
 739       (if (projectile-project-p)
 740           '(helm-source-projectile-recentf-list
 741             helm-source-recentf)
 742         '(helm-source-recentf)) ;; all recent files
 743
 744       ;; always make some common files easily accessible
 745       ;;'(((name . "Common Files")
 746        ;;  (candidates . malb/common-file-targets)
 747         ;; (action . (("Open" . (lambda (x) (find-file (eval x))))))))
 748
 749       '(helm-source-files-in-current-dir
 750         helm-source-locate
 751         helm-source-bookmarks
 752         helm-source-buffer-not-found ;; ask to create a buffer otherwise
 753         ))
 754      "*Helm all the things*"))
 755   (use-package helm
 756     :ensure helm
 757     :diminish helm-mode
 758     :bind (("M-x" . helm-M-x)
 759            ("C-x C-f" . helm-find-files)
 760            ("C-x b" . helm-buffers-list) ; malb/helm-omni)
 761            ("C-x C-b" . helm-buffers-list) ; malb/helm-omni)
 762            ("C-c <SPC>" . helm-all-mark-rings))
 763     :config
 764     (require 'helm-config)
 765     (require 'helm-for-files)
 766     (require 'helm-bookmark)
 767
 768     (helm-mode 1)
 769     (define-key global-map [remap find-file] 'helm-find-files)
 770     (define-key global-map [remap occur] 'helm-occur)
 771     (define-key global-map [remap list-buffers] 'helm-buffers-list)
 772     (define-key global-map [remap dabbrev-expand] 'helm-dabbrev)
 773     (unless (boundp 'completion-in-region-function)
 774       (define-key lisp-interaction-mode-map [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point)
 775       (define-key emacs-lisp-mode-map       [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point))
 776     (add-hook 'kill-emacs-hook #'(lambda () (and (file-exists-p "$TMP") (delete-file "$TMP"))))
 777   )
 778 #+END_SRC
 779 *** Helm Flx
 780
 781  [[https://github.com/PythonNut/helm-flx][helm-flx]] implements intelligent helm fuzzy sorting, provided by [[https://github.com/lewang/flx][flx]].
 782
 783  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 784  (use-package helm-flx
 785    :ensure t
 786    :config (progn
 787              ;; these are helm configs, but they kind of fit here nicely
 788              (setq helm-M-x-fuzzy-match                  t
 789                    helm-bookmark-show-location           t
 790                    helm-buffers-fuzzy-matching           t
 791                    helm-completion-in-region-fuzzy-match t
 792                    helm-file-cache-fuzzy-match           t
 793                    helm-imenu-fuzzy-match                t
 794                    helm-mode-fuzzy-match                 t
 795                    helm-locate-fuzzy-match               nil
 796                    helm-quick-update                     t
 797                    helm-recentf-fuzzy-match              nil
 798                    helm-semantic-fuzzy-match             t)
 799              (helm-flx-mode +1)))
 800  #+END_SRC
 801 *** Helm Swoop
 802 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 803
 804   ;;; stolen from https://github.com/malb/emacs.d/blob/master/malb.org
 805   (defun malb/helm-swoop-pre-fill ()
 806     (thing-at-point 'symbol))
 807     (defvar malb/helm-swoop-ignore-major-mode "List of major modes to ignore for helm-swoop")
 808     (setq malb/helm-swoop-ignore-major-mode '(dired-mode
 809           paradox-menu-mode doc-view-mode pdf-view-mode
 810           mu4e-headers-mode org-mode markdown-mode latex-mode
 811           ein:notebook-multilang-mode))
 812
 813     (defun malb/swoop-or-search ()
 814       (interactive)
 815       (if (or (> (buffer-size) 1048576) ;; helm-swoop can be slow on big buffers
 816               (memq major-mode malb/helm-swoop-ignore-major-mode))
 817           (isearch-forward)
 818         (helm-swoop)))
 819
 820     (use-package helm-swoop
 821       :ensure t
 822       :commands helm-swoop
 823       :bind (("C-c o" . helm-multi-swoop-org)
 824              ("C-s" . malb/swoop-or-search)
 825              ("C-M-s" . helm-multi-swoop-all))
 826       :config (progn
 827
 828                 (setq helm-swoop-pre-input-function  #'malb/helm-swoop-pre-fill
 829                       helm-swoop-split-with-multiple-windows nil
 830                       helm-swoop-split-direction #'split-window-horizontally
 831                       helm-swoop-split-window-function 'helm-default-display-buffer
 832                       helm-swoop-speed-or-color t)
 833
 834                 ;; https://emacs.stackexchange.com/questions/28790/helm-swoop-how-to-make-it-behave-more-like-isearch
 835                 (defun malb/helm-swoop-C-s ()
 836                   (interactive)
 837                   (if (boundp 'helm-swoop-pattern)
 838                       (if (equal helm-swoop-pattern "")
 839                           (previous-history-element 1)
 840                         (helm-next-line))
 841                     (helm-next-line)))
 842
 843                 (bind-key "C-S-s" #'helm-swoop-from-isearch isearch-mode-map)
 844                 (bind-key "C-S-s" #'helm-multi-swoop-all-from-helm-swoop helm-swoop-map)
 845                 (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-swoop-map)
 846                 (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-swoop-map)
 847                 (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-multi-swoop-map)
 848                 (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-multi-swoop-map))
 849       )
 850
 851 #+END_SRC
 852 *** Helm Ag
 853 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 854 (use-package helm-ag
 855   :ensure t
 856   :config (setq helm-ag-base-command "ag --nocolor --nogroup"
 857                 helm-ag-command-option "--all-text"
 858                 helm-ag-insert-at-point 'symbol
 859                 helm-ag-fuzzy-match t
 860                 helm-ag-use-temp-buffer t
 861                 helm-ag-use-grep-ignore-list t
 862                 helm-ag-use-agignore t))
 863 #+END_SRC
 864 *** Helm Descbinds
 865 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 866   (use-package helm-descbinds
 867     :ensure t
 868     :bind ("C-h b" . helm-descbinds)
 869     :init (fset 'describe-bindings 'helm-descbinds))
 870 #+END_SRC
 871
 872 *** Helm YaSnippet
 873 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 874   (use-package helm-c-yasnippet
 875     :ensure t
 876     :bind ("C-c h y" .  helm-yas-complete)
 877     :config (progn
 878               (setq helm-yas-space-match-any-greedy t)))
 879 #+END_SRC
 880 *** Helm Org Rifle
 881 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 882   (use-package helm-org-rifle
 883     :ensure t
 884     :config (progn
 885               (defun malb/helm-org-rifle-agenda-files (arg)
 886                 (interactive "p")
 887                 (let ((current-prefix-arg nil))
 888                   (cond
 889                    ((equal arg 4) (call-interactively #'helm-org-rifle-agenda-files nil))
 890                    ((equal arg 16) (helm-org-rifle-occur-agenda-files))
 891                    (t (helm-org-agenda-files-headings)))))))
 892 #+END_SRC
 893 *** Helm Google
 894 This can be used to link things pretty quickly if necessary
 895 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 896   (use-package helm-google
 897     :ensure t
 898     :bind ("C-c h g" . helm-google)
 899     :config
 900     (progn (add-to-list 'helm-google-actions
 901                         '("Copy URL" . (lambda (candidate)
 902                                          (let ((url
 903                                                 (replace-regexp-in-string
 904                                                  "https://.*q=\\(.*\\)\&sa=.*"
 905                                                  "\\1" candidate)))
 906                                            (kill-new url))))
 907                         t
 908                         )
 909
 910            (add-to-list 'helm-google-actions
 911                         '("Org Store Link" . (lambda (candidate)
 912                                                (let ((title (car (split-string candidate "[\n]+")))
 913                                                      (url
 914                                                       (replace-regexp-in-string
 915                                                        "https://.*q=\\(.*\\)\&sa=.*"
 916                                                        "\\1" candidate)))
 917                                                  (push (list url title) org-stored-links))))
 918                         t)
 919            ))
 920 #+END_SRC
 921
 922 ** Projectile -- Project management
 923 #+begin_src emacs-lisp
 924   (use-package projectile
 925     :ensure t
 926     :bind (("<f5>" . projectile-compile-project)
 927            ("<f6>" . next-error))
 928     :config (progn
 929               (use-package magit :ensure t)
 930               (require 'helm-projectile)
 931               (helm-projectile-on)
 932
 933               (setq projectile-make-test-cmd "make check"
 934                     projectile-switch-project-action 'helm-projectile
 935                     projectile-mode-line  '(:eval (format "»{%s}" (projectile-project-name))))
 936
 937               (projectile-global-mode)))
 938 #+end_src
 939
 940 *** helm integration
 941 #+begin_src emacs-lisp
 942   (use-package helm-projectile
 943     :ensure t
 944     :config (progn
 945               (defvar malb/helm-source-file-not-found
 946                 (helm-build-dummy-source
 947                     "Create file"
 948                   :action 'find-file))
 949
 950               (add-to-list
 951                'helm-projectile-sources-list
 952                malb/helm-source-file-not-found t)
 953
 954               (helm-delete-action-from-source
 955                "Grep in projects `C-s'"
 956                helm-source-projectile-projects)
 957
 958               (helm-add-action-to-source
 959                "Grep in projects `C-s'"
 960                'helm-do-ag helm-source-projectile-projects 4)))
 961 #+end_src
 962 ** Zap to char
 963 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 964   (use-package avy-zap
 965     :ensure t
 966     :bind ("M-z" . avy-zap-up-to-char-dwim))
 967 #+END_SRC
 968 ** Hydra
 969 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 970   (use-package hydra
 971     :bind (("C-c 2" . my/hydra-orgmodes/body)
 972            ("C-c @" . my/hydra-orgmodes/body)
 973            ("C-c #" . my/hydra-outline/body)
 974            ("C-c 3" . my/hydra-outline/body)
 975            )
 976     :config
 977     (defhydra my/hydra-orgmodes (:color blue :hint nil)
 978     "
 979   _n_: notes _c_: chaim _w_: wildman _o_: ool
 980   _u_: uddin _s_: steve _r_: refile  _f_: fh
 981   _p_: read papers      _R_: paper notes
 982   _h_: hpcbio
 983   _q_: quit
 984   _z_: quit
 985   "
 986     ("n" (find-file "~/projects/org-notes/notes.org"))
 987     ("c" (find-file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
 988     ("w" (find-file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
 989     ("u" (find-file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
 990     ("o" (find-file "~/projects/org-notes/ool.org"))
 991     ("f" (find-file "~/projects/org-notes/fh.org"))
 992     ("s" (find-file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
 993     ("r" (find-file my/org-refile-file))
 994     ("p" (find-file "~/projects/research/papers_to_read.org"))
 995     ("R" (find-file "~/projects/research/paper_notes.org"))
 996     ("h" (find-file "~/projects/org-notes/hpcbio.org"))
 997     ("q" nil "quit")
 998     ("z" nil "quit")
 999     )
1000
1001     ;; from https://github.com/abo-abo/hydra/wiki/Emacs
1002     (defhydra my/hydra-outline (:color pink :hint nil)
1003     "
1004   ^Hide^             ^Show^           ^Move
1005   ^^^^^^------------------------------------------------------
1006   _q_: sublevels     _a_: all         _u_: up
1007   _t_: body          _e_: entry       _n_: next visible
1008   _o_: other         _i_: children    _p_: previous visible
1009   _c_: entry         _k_: branches    _f_: forward same level
1010   _l_: leaves        _s_: subtree     _b_: backward same level
1011   _d_: subtree
1012
1013   "
1014     ;; Hide
1015     ("q" outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
1016     ("t" outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
1017     ("o" outline-hide-other)        ; Hide other branches
1018     ("c" outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
1019     ("l" outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
1020     ("d" outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
1021     ;; Show
1022     ("a" outline-show-all)          ; Show (expand) everything
1023     ("e" outline-show-entry)        ; Show this heading's body
1024     ("i" outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
1025     ("k" outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
1026     ("s" outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
1027     ;; Move
1028     ("u" outline-up-heading)                ; Up
1029     ("n" outline-next-visible-heading)      ; Next
1030     ("p" outline-previous-visible-heading)  ; Previous
1031     ("f" outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
1032     ("b" outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
1033     ("z" nil "leave"))
1034   )
1035 #+END_SRC
1036
1037 ** Tramp
1038 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1039   (use-package tramp
1040     :config
1041     (add-to-list 'tramp-methods '("vcsh"
1042                                   (tramp-login-program "vcsh")
1043                                   (tramp-login-args
1044                                    (("enter")
1045                                     ("%h")))
1046                                   (tramp-remote-shell "/bin/sh")
1047                                   (tramp-remote-shell-args
1048                                    ("-c")))))
1049 #+END_SRC
1050 ** Reftex
1051 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1052   (use-package reftex
1053     :ensure t
1054     :config
1055     (setq-default reftex-default-bibliography
1056                     '("~/projects/research/references.bib")))
1057 #+END_SRC
1058 ** BibTex
1059 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1060   (use-package bibtex
1061     :config (setq bibtex-user-optional-fields
1062                   (quote (("annote" "Personal annotation (ignored)")
1063                           ("abstract" "")
1064                   ("pmid" "")
1065                   ("doi" ""))))
1066     )
1067
1068 #+END_SRC
1069 ** LaTeX
1070 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1071 (use-package tex
1072   :defer t
1073   :ensure auctex
1074   :config
1075   ; (add-to-list 'TeX-style-path '"/home/don/lib/emacs_el/auctex/style")
1076   ;; REFTEX (much enhanced management of cross-ref, labels, etc)
1077   ;; http://www.strw.leidenuniv.nl/~dominik/Tools/reftex/
1078   ; (autoload 'reftex-mode     "reftex" "RefTeX Minor Mode" t)
1079   ; (autoload 'turn-on-reftex  "reftex" "RefTeX Minor Mode" nil)
1080   ; (autoload 'reftex-citation "reftex-cite" "Make citation" nil)
1081   ; (autoload 'reftex-index-phrase-mode "reftex-index" "Phrase mode" t)
1082   (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with AUCTeX LaTeX mode
1083   (add-hook 'latex-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with Emacs latex mode
1084   (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with AUCTeX LaTeX mode
1085   (add-hook 'latex-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with Emacs latex mode
1086
1087   (setq-default reftex-plug-into-AUCTeX t)
1088   ;; support fake section headers
1089   (setq TeX-outline-extra
1090         '(("%chapter" 1)
1091           ("%section" 2)
1092           ("%subsection" 3)
1093           ("%subsubsection" 4)
1094           ("%paragraph" 5)))
1095   ;; add font locking to the headers
1096   (font-lock-add-keywords
1097    'latex-mode
1098    '(("^%\\(chapter\\|\\(sub\\|subsub\\)?section\\|paragraph\\)"
1099       0 'font-lock-keyword-face t)
1100      ("^%chapter{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-1-face t)
1101      ("^%section{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-2-face t)
1102      ("^%subsection{\\(.*\\)}"    1 'font-latex-sectioning-3-face t)
1103      ("^%subsubsection{\\(.*\\)}" 1 'font-latex-sectioning-4-face t)
1104      ("^%paragraph{\\(.*\\)}"     1 'font-latex-sectioning-5-face t)))
1105
1106   ;; use smart quotes by default instead of `` and ''
1107   ;; taken from http://kieranhealy.org/esk/kjhealy.html
1108   (setq TeX-open-quote "“")
1109   (setq TeX-close-quote "”")
1110
1111   ;; (TeX-add-style-hook
1112   ;;  "latex"
1113   ;;  (lambda ()
1114   ;;    (TeX-add-symbols
1115   ;;     '("DLA" 1))))
1116   ;; (custom-set-variables
1117   ;;  '(font-latex-user-keyword-classes
1118   ;;    '(("fixme"
1119   ;;       ("DLA" "RZ")
1120   ;;       font-lock-function-name-face 2 (command 1 t))))
1121   ;; )
1122   (setq-default TeX-parse-self t)
1123   (setq-default TeX-auto-save t)
1124   (setq-default TeX-master nil)
1125   (add-to-list 'LaTeX-font-list
1126                '(?\C-a "\\alert{","}"))
1127   (eval-after-load
1128       "latex"
1129     '(TeX-add-style-hook
1130       "cleveref"
1131       (lambda ()
1132         (if (boundp 'reftex-ref-style-alist)
1133             (add-to-list
1134              'reftex-ref-style-alist
1135              '("Cleveref" "cleveref"
1136                (("\\cref" ?c) ("\\Cref" ?C) ("\\cpageref" ?d) ("\\Cpageref" ?D)))))
1137         (reftex-ref-style-activate "Cleveref")
1138         (TeX-add-symbols
1139          '("cref" TeX-arg-ref)
1140          '("Cref" TeX-arg-ref)
1141          '("cpageref" TeX-arg-ref)
1142          '("Cpageref" TeX-arg-ref)))))
1143   (eval-after-load
1144       "latex"
1145     '(add-to-list 'LaTeX-fill-excluded-macros
1146                   '("Sexpr")))
1147
1148   (use-package font-latex
1149     :config
1150     (setq font-latex-match-reference-keywords
1151           '(
1152             ("fref" "{")
1153             ("Fref" "{")
1154             ("citep" "{")
1155             ("citet" "{")
1156             ("acs" "{")
1157             ("acsp" "{")
1158             ("ac" "{")
1159             ("acp" "{")
1160             ("acl" "{")
1161             ("aclp" "{")
1162             ("acsu" "{")
1163             ("aclu" "{")
1164             ("acused" "{")
1165             ("DLA" "{")
1166             ("RZ" "{")
1167             ("OM" "{")
1168             ("DL" "{")
1169             ("fixme" "{"))
1170           )
1171     )
1172   (setq font-latex-fontify-script nil)
1173   (setq font-latex-fontify-sectioning (quote color))
1174   (setq font-latex-script-display (quote (nil)))
1175 )
1176
1177 #+END_SRC
1178 ** ESS
1179 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1180   (use-package ess
1181     :ensure t
1182     :commands R
1183     :mode ("\\.R\\'" . ess-r-mode)
1184     :bind (:map ess-mode-map
1185                 ("C-c C-R" . dla/ess-region-remote-eval))
1186     :init
1187     (autoload 'ess-r-mode "ess-site" nil t)
1188     (autoload 'R "ess-site" nil t)
1189     :config
1190     ; actually load the rest of ess
1191     (require 'ess-site)
1192     (defun ess-change-directory (path)
1193       "Set the current working directory to PATH for both *R* and Emacs."
1194       (interactive "Directory to change to: ")
1195
1196       (when (file-exists-p path)
1197         (ess-command (concat "setwd(\"" path "\")\n"))
1198         ;; use file-name-as-directory to ensure it has trailing /
1199         (setq default-directory (file-name-as-directory path))))
1200     (add-hook 'ess-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
1201     ;; outlining support for ess modes
1202     (add-hook
1203      'ess-mode-hook
1204      '(lambda ()
1205         (outline-minor-mode)
1206         (setq outline-regexp "\\(^#\\{4,5\\} \\)\\|\\(^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function\\)")
1207         (defun outline-level ()
1208           (cond ((looking-at "^##### ") 1)
1209                 ((looking-at "^#### ") 2)
1210                 ((looking-at "^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function(.*{") 3)
1211                 (t 1000)))
1212         ))
1213     (defun dla/ess-region-remote-eval (start end)
1214       "Evaluate region in a remote ESS instance"
1215       (interactive "r")
1216       (shell-command-on-region start end "eval_r" (get-buffer-create "***essregionremoteeval***") nil nil nil)
1217       (kill-buffer "***essregionremoteeval***"))
1218     ;; Don't restore history or save workspace image
1219     '(inferior-R-args "--no-restore-history --no-save")
1220     )
1221 #+END_SRC
1222
1223 ** Rainbowmode
1224 From http://julien.danjou.info/projects/emacs-packages#rainbow-mode, this colorizes color strings
1225
1226 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1227   (use-package rainbow-mode
1228     ;; add ess to the x major mode
1229     :config (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[S])
1230     (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[R])
1231   )
1232 #+END_SRC
1233
1234 ** YAML Mode
1235 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1236   (use-package yaml-mode
1237     ;; add ess to the x major mode
1238     :mode ("\\.\\(yaml|yml\\)\\'" . yaml-mode)
1239   )
1240 #+END_SRC
1241
1242 ** Polymode
1243 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1244 (use-package poly-noweb
1245   :ensure t
1246   :after polymode
1247
1248   )
1249 (use-package poly-markdown
1250   :ensure t
1251   :after polymode
1252   )
1253 (use-package poly-R
1254   :ensure t
1255   :after (:all polymode poly-markdown poly-noweb)
1256   ; :mode ("\\.Snw" . poly-noweb+r-mode)
1257   ; :mode ("\\.Rnw" . poly-noweb+r-mode)
1258   ; :mode ("\\.Rmd" . poly-markdown+r-mode)
1259   )
1260 (use-package polymode
1261   :ensure t
1262   )
1263
1264 #+END_SRC
1265
1266 ** Outlining
1267 *** Outline magic
1268 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1269   (use-package outline-magic)
1270 #+END_SRC
1271 *** Outline mode
1272 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1273 ;; change the outline mode prefix from C-c @ to C-c C-2
1274 (setq outline-minor-mode-prefix "C-c C-2")
1275 ;;(add-hook 'outline-minor-mode-hook
1276 ;;          (lambda () (local-set-key (kbd "C-c C-2")
1277 ;;                                    outline-mode-prefix-map)))
1278
1279 #+END_SRC
1280 ** Writeroom Mode
1281 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1282   (use-package writeroom-mode
1283     :config
1284     (defun my/writing-mode ()
1285       "Start my writing mode; enable visual-line-mode and auto-fill-mode"
1286       (interactive)
1287       (if writeroom-mode
1288           (progn
1289             (writeroom-mode -1)
1290             (visual-line-mode -1)
1291             (auto-fill-mode -1)
1292             (visual-fill-column-mode -1)
1293             )
1294         (visual-line-mode 1)
1295         (auto-fill-mode 1)
1296         (visual-fill-column-mode 1)
1297         (writeroom-mode 1))
1298       )
1299     )
1300 #+END_SRC
1301 ** GhostText/Atomic Chrome
1302 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1303   (use-package atomic-chrome
1304     :config
1305     (ignore-errors (atomic-chrome-start-server))
1306     (setq atomic-chrome-buffer-open-style 'full)
1307     )
1308 #+END_SRC
1309 ** Edit Server
1310 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1311   (use-package edit-server
1312     :ensure t
1313     :commands edit-server-start
1314     :init (if after-init-time
1315               (edit-server-start)
1316             (add-hook 'after-init-hook
1317                       #'(lambda() (edit-server-start))))
1318     :config (setq edit-server-new-frame-alist
1319                   '((name . "Edit with Emacs FRAME")
1320                     (top . 200)
1321                     (left . 200)
1322                     (width . 80)
1323                     (height . 25)
1324                     (minibuffer . t)
1325                     (menu-bar-lines . t)
1326                     (window-system . x)))
1327     )
1328 #+END_SRC
1329 ** Multiple Cursors
1330    :PROPERTIES:
1331    :ID:       6fcf218b-a762-4c37-9339-a8202ddeb544
1332    :END:
1333 [[https://github.com/magnars/multiple-cursors.el][Multiple Cursors]]
1334 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1335   (use-package multiple-cursors
1336     :bind* (("C-;" . mc/mark-all-dwim)
1337             ("C-<" . mc/mark-previous-like-this)
1338             ("C->" . mc/mark-next-like-this)
1339             ("C-S-c C-S-c" . mc/edit-lines))
1340     )
1341 #+END_SRC
1342 ** Web Mode
1343 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1344   (use-package web-mode
1345     :load-path "/home/don/projects/web-mode/"
1346     :mode ("\\.\\(tx|tmpl\\)\\'" . web-mode)
1347     :config
1348     (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.tmpl\\'" . web-mode))
1349     (setq web-mode-enable-engine-detection t)
1350     (setq web-mode-engines-alist
1351           '(("template-toolkit" . "\\.tmpl\\'")))
1352     )
1353 #+END_SRC
1354 ** Spamassassin Mode
1355 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1356   (use-package spamassassin-mode
1357     :commands spamassassin-mode
1358     :ensure f
1359     )
1360 #+END_SRC
1361 ** Password Store
1362 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1363   (use-package password-store
1364     :ensure f
1365     :commands password-store-edit password-store-generate
1366     )
1367 #+END_SRC
1368 ** CSS mode
1369 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1370   (use-package css
1371     :mode "\\.css'"
1372     :config
1373     ;; fix up css mode to not be silly
1374     ;; from http://www.stokebloke.com/wordpress/2008/03/21/css-mode-indent-buffer-fix/
1375     (setq cssm-indent-level 4)
1376     (setq cssm-newline-before-closing-bracket t)
1377     (setq cssm-indent-function #'cssm-c-style-indenter)
1378     (setq cssm-mirror-mode nil))
1379 #+END_SRC
1380 ** Abbrev Mode
1381 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1382   (use-package abbrev
1383     :diminish abbrev-mode
1384     :config
1385     ;; load abbreviations from
1386     (setq abbrev-file-name
1387           "~/.emacs_abbrev_def")
1388
1389     ;; read the abbrev file if it exists
1390     (if (file-exists-p abbrev-file-name)
1391         (quietly-read-abbrev-file))
1392
1393     ;; for now, use abbrev mode everywhere
1394     (setq default-abbrev-mode t))
1395 #+END_SRC
1396
1397 ** Python Programming
1398 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1399   (use-package python-mode
1400     :hook
1401     (python-mode . pyenv-mode)
1402     (python-mode . flycheck-mode)
1403     (python-mode . company-mode)
1404     (python-mode . blacken-mode)
1405     (python-mode . yas-minor-mode)
1406     )
1407   (use-package pyenv
1408     :ensure t
1409     )
1410   (use-package blacken
1411     :init
1412     (setq-default blacken-fast-unsafe t)
1413     (setq-default blacken-line-length 80)
1414     :ensure t)
1415
1416
1417   (use-package elpy
1418     :ensure t
1419     :init
1420     (elpy-enable)
1421     )
1422 #+END_SRC
1423 *** Jedi
1424 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1425   (use-package company-jedi
1426     :ensure t
1427     :hook (python-mode . (add-to-list 'company-backends 'company-jedi))
1428     :hook (python-mode  . 'jedi:setup)
1429     :config
1430     (setq jedi:complete-on-dot t)
1431     )
1432 #+END_SRC
1433 *** Black
1434 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
1435   (use-package python-black
1436     :demand t
1437     :after python)
1438 #+end_src
1439 *** Sphinx Documentation
1440 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
1441   (use-package numpydoc
1442     :ensure t
1443     :after python
1444     :bind (:map python-mode-map
1445                 ("C-c C-n" . numpydoc-generate)))
1446   (use-package sphinx-doc
1447     :ensure t
1448     :config
1449     (sphinx-doc-mode t)
1450     (setq sphinx-doc-include-types t)
1451     :after python)
1452 #+end_src
1453 ** Go language
1454 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1455 (use-package go-mode
1456              :diminish "go"
1457              :mode "\\.go"
1458              )
1459 #+END_SRC
1460
1461 ** Expand region
1462 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1463 (use-package expand-region
1464   :bind (("C-=" . 'er/expand-region))
1465   )
1466 #+END_SRC
1467
1468 ** Dockerfile
1469 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1470 (use-package dockerfile-mode
1471   :mode "Dockerfile"
1472   )
1473 #+END_SRC
1474
1475 ** Beancount
1476 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1477 (use-package beancount
1478   :load-path "~/lib/emacs_el/beancount-mode/"
1479   :ensure f
1480   :mode "\\.beancount\\'"
1481
1482   )
1483 #+END_SRC
1484 * Email
1485 ** Mutt
1486 *** Message-mode
1487 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1488 (use-package message
1489   :ensure f
1490   :diminish (message "✉")
1491   :mode ("muttng-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1492   :mode ("mutt-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1493   :hook 'my/message-mode-settings
1494   :hook 'turn-on-flyspell
1495   :bind (:map message-mode-map
1496       ("C-c C-a" . my/post-attach-file))
1497   :delight (message-mode "✉")
1498   :config
1499   (defun my/message-mode-settings ()
1500     (font-lock-add-keywords nil
1501                 '(("^[ \t]*>[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1502                (0 'message-multiply-quoted-text-face))
1503               ("^[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1504                (0 'message-double-quoted-text-face))))
1505     )
1506
1507   (defun my/post-attach-file ()
1508     "Prompt for an attachment."
1509     (interactive)
1510     (let ((file (read-file-name "Attach file: " nil nil t nil)))
1511       (my/header-attach-file file "")))
1512
1513   (defun my/header-attach-file (file description)
1514     "Attach a FILE to the current message (works with Mutt).
1515   Argument DESCRIPTION MIME description."
1516     (interactive "fAttach file: \nsDescription: ")
1517     (when (> (length file) 0)
1518   (save-excursion
1519     (save-match-data
1520       (save-restriction
1521         (widen)
1522         (goto-char (point-min))
1523         (search-forward-regexp "^$")
1524         (insert (concat "Attach: " (replace-regexp-in-string "\\([[:space:]\\]\\)" "\\\\\\1" (file-truename file)) " "
1525                 description "\n"))
1526         (message (concat "Attached '" file "'."))
1527         (setq post-has-attachment t))))))
1528
1529   (setq mail-yank-prefix "> ")
1530   (setq mail-header-separator "") ; fix broken header detection
1531 )
1532 #+END_SRC
1533 *** Muttrc mode
1534 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1535   (use-package muttrc-mode
1536     :mode "muttngrc"
1537     :mode "muttrc"
1538   )
1539
1540 #+END_SRC
1541 * Base emacs
1542 ** Reverting buffers
1543 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1544   (use-package autorevert
1545     :diminish auto-revert-mode
1546     :config
1547     (setq global-auto-revert-non-file-buffers t
1548           global-auto-revert-ignore-modes '(pdf-view-mode)
1549           auto-revert-verbose nil)
1550     (global-auto-revert-mode 1))
1551 #+END_SRC
1552 * Org Mode
1553 ** Use-package and load things
1554 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1555
1556   (use-package org
1557     :delight (org-mode "ø")
1558     :mode ("\\.\\(org\\|org_archive\\|txt\\)\\'" . org-mode)
1559     :bind (("C-c l"  . org-store-link)
1560            ("C-c a"  . org-agenda)
1561            ("C-c b"  . org-iswitchb))
1562 #+END_SRC
1563 ** Agenda Configuration
1564 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1565   :config
1566   (setq-default org-log-done 'time)
1567   (setq-default org-agenda-ndays 5)
1568
1569   (setq org-agenda-sticky t)
1570   (defun dla/show-org-agenda ()
1571     (interactive)
1572     (let (agendabuffer
1573           '(delq nil
1574                 (mapcar (lambda (x)
1575                           (and (string-match-p
1576                                 "\*Org Agenda.*\*"
1577                                 (buffer-name x))
1578                                x)
1579                           )
1580                         (buffer-list))))
1581       (if agendabuffer
1582           (switch-to-buffer
1583            (buffer-name agendabuffer))
1584         (org-agenda-list)))
1585       (delete-other-windows))
1586
1587   ;; agenda configuration
1588   ;; Do not dim blocked tasks
1589   (setq org-agenda-dim-blocked-tasks nil)
1590   (setq org-agenda-inhibit-startup t)
1591   (setq org-agenda-use-tag-inheritance nil)
1592
1593   ;; Compact the block agenda view
1594   (setq org-agenda-compact-blocks t)
1595
1596   ;; Custom agenda command definitions
1597   (setq org-agenda-custom-commands
1598         (quote (("N" "Notes" tags "NOTE"
1599                  ((org-agenda-overriding-header "Notes")
1600                   (org-tags-match-list-sublevels t)))
1601                 ("h" "Habits" tags-todo "STYLE=\"habit\""
1602                  ((org-agenda-overriding-header "Habits")
1603                   (org-agenda-sorting-strategy
1604                    '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1605                 (" " "Agenda"
1606                  ((agenda "" nil)
1607                   (tags "REFILE"
1608                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Refile")
1609                          (org-tags-match-list-sublevels nil)))
1610                   (tags-todo "-CANCELLED/!"
1611                              ((org-agenda-overriding-header "Stuck Projects")
1612                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-stuck-projects)
1613                               (org-agenda-sorting-strategy
1614                                '(category-keep))))
1615                   (tags-todo "-HOLD-CANCELLED/!"
1616                              ((org-agenda-overriding-header "Projects")
1617                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-projects)
1618                               (org-tags-match-list-sublevels 'indented)
1619                               (org-agenda-sorting-strategy
1620                                '(category-keep))))
1621                   (tags-todo "-CANCELLED/!NEXT"
1622                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Next Tasks"
1623                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1624                                                                         ""
1625                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1626                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-projects-and-habits-and-single-tasks)
1627                               (org-tags-match-list-sublevels t)
1628                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1629                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1630                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1631                               (org-agenda-sorting-strategy
1632                                '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1633                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1634                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Subtasks"
1635                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1636                                                                         ""
1637                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1638                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-project-tasks)
1639                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1640                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1641                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1642                               (org-agenda-sorting-strategy
1643                                '(category-keep))))
1644                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1645                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Standalone Tasks"
1646                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1647                                                                         ""
1648                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1649                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-project-tasks)
1650                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1651                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1652                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1653                               (org-agenda-sorting-strategy
1654                                '(category-keep))))
1655                   (tags-todo "-CANCELLED+WAITING|HOLD/!"
1656                              ((org-agenda-overriding-header "Waiting and Postponed Tasks")
1657                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-stuck-projects)
1658                               (org-tags-match-list-sublevels nil)
1659                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled t)
1660                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines t)))
1661                   (tags "-REFILE/"
1662                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Archive")
1663                          (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-archivable-tasks)
1664                          (org-tags-match-list-sublevels nil))))
1665                  nil))))
1666
1667   ; org mode agenda files
1668   (setq org-agenda-files
1669         (append
1670         (file-expand-wildcards "~/projects/org-notes/*.org")
1671         (file-expand-wildcards "~/org-mode/from-mobile.org")
1672         (file-expand-wildcards "~/org-notes-*/*.org")
1673         )
1674   )
1675   (setq my/org-refile-file
1676         (car (seq-filter
1677               (lambda (file) (string-match-p (regexp-quote "/refile.org") file))
1678               org-agenda-files)))
1679
1680   (set-register ?n (cons 'file "~/projects/org-notes/notes.org"))
1681   (set-register ?r (cons 'file my/org-refile-file))
1682   (set-register ?o (cons 'file "~/projects/org-notes/ool.org"))
1683   (set-register ?s (cons 'file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
1684   (set-register ?c (cons 'file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
1685   (set-register ?w (cons 'file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
1686   (set-register ?u (cons 'file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
1687   (set-register ?R (cons 'file "~/projects/reviews/reviews.org"))
1688   (set-register ?d (cons 'file "~/projects/org-notes/diary.org"))
1689   ; from https://emacs.stackexchange.com/questions/909/how-can-i-have-an-agenda-timeline-view-of-multiple-files
1690   (defun org-agenda-timeline-all (&optional arg)
1691     (interactive "P")
1692     (with-temp-buffer
1693       (dolist (org-agenda-file org-agenda-files)
1694         (insert-file-contents org-agenda-file nil)
1695         (goto-char (point-max))
1696         (newline))
1697       (write-file "/tmp/timeline.org")
1698       (org-agenda arg "L")))
1699   (define-key org-mode-map (kbd "C-c t") 'org-agenda-timeline-all)
1700
1701 #+END_SRC
1702 ** General config
1703 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1704   (setq org-global-properties '(("Effort_ALL 0 0:10 0:30 1:00 2:00 3:00 4:00 5:00 6:00 7:00")))
1705   (setq org-columns-default-format "%40ITEM(Task) %6Effort{:} %CLOCKSUM %PRIORITY %TODO %13SCHEDULED %13DEADLINE %TAGS")
1706
1707   (setq org-default-notes-file "~/projects/org-notes/notes.org")
1708   (setq org-id-link-to-org-use-id 'use-existing)
1709 #+END_SRC
1710 ** Capture Templates
1711 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1712   (setq org-capture-templates  ;; mail-specific note template, identified by "m"
1713         `(("m" "Mail" entry (file my/org-refile-file)
1714            "* %?\n\n  Source: %u, [[%:link][%:description]]\n  %:initial")
1715           ("t" "todo" entry (file my/org-refile-file)
1716            "* TODO %?\n  :PROPERTIES:\n  :END:\n  :LOGBOOK:\n  :END:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1717           ("r" "respond" entry (file my/org-refile-file)
1718            "* NEXT Respond to %:from on %:subject\nSCHEDULED: %t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t :immediate-finish t)
1719           ("n" "note" entry (file my/org-refile-file)
1720            "* %? :NOTE:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1721           ("s" "schedule" entry (file my/org-refile-file)
1722            "* %? :cal:\n%^{scheduled:}t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1723           ("j" "Journal" entry (file+datetree "~/projects/org-notes/diary.org")
1724            "* %?\n%U\n" :clock-in t :clock-resume t)
1725           ("w" "org-protocol" entry (file my/org-refile-file)
1726            "* TODO Review %c\n%U\n" :immediate-finish t)
1727           ("M" "Meeting" entry (file my/org-refile-file)
1728            "* MEETING with %? :MEETING:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1729           ("S" "Seminar" entry (file my/org-refile-file)
1730            "* SEMINAR notes %? :SEMINAR:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1731           ("P" "Paper to read" entry (file+headline "~/projects/research/papers_to_read.org" "Refile")
1732            "* TODO Get/Read %? \n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1733           ("p" "Phone call" entry (file my/org-refile-file)
1734            "* PHONE %? :PHONE:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1735            ("J" "job" entry (file+olp "~/projects/org-notes/notes.org"
1736                                        "Jobs"
1737                                        ,(format-time-string "Positions %Y"))
1738            "* TODO Apply for %? :job:\nSCHEDULED: <%<%Y-%m-%d>>\n%U\n%x\n" :clock-in t :clock-resume t)
1739           ("h" "Habit" entry (file my/org-refile-file)
1740            "* NEXT %?\n%U\n%a\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d .+1d/3d>\")\n:PROPERTIES:\n:STYLE: habit\n:REPEAT_TO_STATE: NEXT\n:END:\n%a\n")
1741           )
1742         )
1743
1744   ;; Remove empty LOGBOOK drawers on clock out
1745   (defun bh/remove-empty-drawer-on-clock-out ()
1746     (interactive)
1747     (save-excursion
1748       (beginning-of-line 0)
1749       (org-remove-empty-drawer-at (point))))
1750
1751   (defun my/org-add-id ()
1752     (interactive)
1753     (save-excursion
1754       (if (org-current-level)
1755           ()
1756         (forward-char 1)
1757         )
1758       (org-id-get-create)
1759       )
1760   )
1761
1762 #+END_SRC
1763 ** Org mode key bindings
1764 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1765   ;; org mode configuration from http://doc.norang.ca/org-mode.html
1766   ;; Custom Key Bindings
1767   :bind* (("<f9> a" . org-agenda)
1768           ("<f9> I" . bh/punch-in)
1769           ("<f9> O" . bh/punch-out)
1770           ("<f9> SPC" . bh/clock-in-last-task)
1771           ("<f12>" . dla/show-org-agenda)
1772           ;; ("<f5>" . bh/org-todo)
1773           ("<S-f5>" . bh/widen)
1774           ("<f7>" . bh/set-truncate-lines)
1775           ("<f8>" . org-cycle-agenda-files)
1776           ("<f9> <f9>" . dla/show-org-agenda)
1777           ("<f9> b" . bbdb)
1778           ("<f9> c" . calendar)
1779           ("<f9> f" . boxquote-insert-file)
1780           ("<f9> h" . bh/hide-other)
1781           ("<f9> n" . bh/toggle-next-task-display)
1782           ("<f9> w" . widen)
1783
1784           ("<f9> r" . boxquote-region)
1785           ("<f9> s" . bh/switch-to-scratch)
1786
1787           ("<f9> t" . bh/insert-inactive-timestamp)
1788           ("<f9> T" . bh/toggle-insert-inactive-timestamp)
1789
1790           ("<f9> v" . visible-mode)
1791           ("<f9> l" . org-toggle-link-display)
1792           ("<f9> SPC" . bh/clock-in-last-task)
1793           ("C-<f9>" . previous-buffer)
1794           ("M-<f9>" . org-toggle-inline-images)
1795           ("C-x n r" . narrow-to-region)
1796           ("C-<f10>" . next-buffer)
1797           ("<f11>" . org-clock-goto)
1798           ("C-<f11>" . org-clock-in)
1799           ("C-s-<f12>" . bh/save-then-publish)
1800           ("C-c c" . org-capture))
1801   :config
1802 #+END_SRC
1803 ** Utility Functions
1804 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1805   (defun bh/hide-other ()
1806     (interactive)
1807     (save-excursion
1808       (org-back-to-heading 'invisible-ok)
1809       (outline-hide-other)
1810       (org-cycle)
1811       (org-cycle)
1812       (org-cycle)))
1813
1814   (defun bh/set-truncate-lines ()
1815     "Toggle value of truncate-lines and refresh window display."
1816     (interactive)
1817     (setq truncate-lines (not truncate-lines))
1818     ;; now refresh window display (an idiom from simple.el):
1819     (save-excursion
1820       (set-window-start (selected-window)
1821                         (window-start (selected-window)))))
1822
1823   (defun bh/switch-to-scratch ()
1824     (interactive)
1825     (switch-to-buffer "*scratch*"))
1826
1827   (setq org-use-fast-todo-selection t)
1828   (setq org-treat-S-cursor-todo-selection-as-state-change nil)
1829
1830   ; create function to create headlines in file. This comes from
1831   ; http://stackoverflow.com/questions/13340616/assign-ids-to-every-entry-in-org-mode
1832   (defun my/org-add-ids-to-headlines-in-file ()
1833     "Add ID properties to all headlines in the current file which
1834   do not already have one."
1835     (interactive)
1836     (org-map-entries 'org-id-get-create))
1837   (defun dla/org-update-ids-to-headlines-in-file ()
1838     "Add or replace ID properties to all headlines in the current file
1839   (or narrowed region)."
1840     (interactive)
1841     (org-map-entries '(lambda () (org-id-get-create t))))
1842   ; if we wanted to do this to every buffer, do the following:
1843   ; (add-hook 'org-mode-hook
1844   ;           (lambda ()
1845   ;             (add-hook 'before-save-hook 'my/org-add-ids-to-headlines-in-file nil 'local)))
1846 #+END_SRC
1847 ** Org ID locations
1848 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1849 (use-package find-lisp
1850   :ensure t)
1851 (setq org-agenda-text-search-extra-files
1852       (append '(agenda-archives)
1853               (find-lisp-find-files "~/projects/org-notes" "\.org$")
1854               (find-lisp-find-files "~/projects/org-notes" "\.org_archive$")
1855               ))
1856 #+END_SRC
1857 ** Keywords (TODO)
1858 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1859 (setq org-todo-keywords
1860       (quote ((sequence "TODO(t)" "NEXT(n)" "|" "DONE(d)")
1861               (sequence "WAITING(w@/!)" "HOLD(h@/!)" "|" "CANCELLED(c@/!)" "PHONE" "MEETING"))))
1862
1863 (setq org-todo-keyword-faces
1864       (quote (("TODO" :foreground "red" :weight bold)
1865               ("NEXT" :foreground "blue" :weight bold)
1866               ("DONE" :foreground "forest green" :weight bold)
1867               ("WAITING" :foreground "orange" :weight bold)
1868               ("HOLD" :foreground "magenta" :weight bold)
1869               ("CANCELLED" :foreground "forest green" :weight bold)
1870               ("MEETING" :foreground "forest green" :weight bold)
1871               ("PHONE" :foreground "forest green" :weight bold))))
1872
1873 (setq org-todo-state-tags-triggers
1874       (quote (("CANCELLED" ("CANCELLED" . t))
1875               ("WAITING" ("WAITING" . t))
1876               ("HOLD" ("WAITING") ("HOLD" . t))
1877               (done ("WAITING") ("HOLD"))
1878               ("TODO" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1879               ("NEXT" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1880               ("DONE" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD")))))
1881
1882
1883
1884 ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/remove-empty-drawer-on-clock-out 'append)
1885 ; add ids on creation of nodes
1886 (add-hook 'org-capture-prepare-finalize-hook 'my/org-add-id)
1887
1888
1889 ; resolve clocks after 10 minutes of idle; use xprintidle
1890 ; (setq org-clock-idle-time 10)
1891 ; (setq org-clock-x11idle-program-name "xprintidle")
1892
1893 ; this is from http://doc.norang.ca/org-mode.html#Capture
1894 ; use C-M-r for org mode capture
1895 (global-set-key (kbd "C-M-r") 'org-capture)
1896
1897 ; Targets include this file and any file contributing to the agenda - up to 9 levels deep
1898 (setq org-refile-targets (quote ((nil :maxlevel . 9)
1899                                  (org-agenda-files :maxlevel . 9))))
1900
1901 ; Use full outline paths for refile targets - we file directly with IDO
1902 (setq org-refile-use-outline-path t)
1903
1904 ; Targets complete directly with IDO
1905 (setq org-outline-path-complete-in-steps nil)
1906
1907 ; Allow refile to create parent tasks with confirmation
1908 (setq org-refile-allow-creating-parent-nodes (quote confirm))
1909
1910 ; ; Use IDO for both buffer and file completion and ido-everywhere to t
1911 ; (setq org-completion-use-ido t)
1912 ; (setq ido-everywhere t)
1913 ; (setq ido-max-directory-size 100000)
1914 ; (ido-mode (quote both))
1915 ; ; Use the current window when visiting files and buffers with ido
1916 ; (setq ido-default-file-method 'selected-window)
1917 ; (setq ido-default-buffer-method 'selected-window)
1918 ; ; Use the current window for indirect buffer display
1919 ; (setq org-indirect-buffer-display 'current-window)
1920
1921
1922 ;;;; Refile settings
1923 ; Exclude DONE state tasks from refile targets
1924 (defun bh/verify-refile-target ()
1925   "Exclude todo keywords with a done state from refile targets"
1926   (not (member (nth 2 (org-heading-components)) org-done-keywords)))
1927
1928 (setq org-refile-target-verify-function 'bh/verify-refile-target)
1929
1930 ;; ensure that emacsclient will show just the note to be edited when invoked
1931 ;; from Mutt, and that it will shut down emacsclient once finished;
1932 ;; fallback to legacy behavior when not invoked via org-protocol.
1933 (require 'org-protocol)
1934 ; (add-hook 'org-capture-mode-hook 'delete-other-windows)
1935 (setq my-org-protocol-flag nil)
1936 (defadvice org-capture-finalize (after delete-frame-at-end activate)
1937   "Delete frame at remember finalization"
1938   (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1939          (setq my-org-protocol-flag nil)))
1940 (defadvice org-capture-refile (around delete-frame-after-refile activate)
1941   "Delete frame at remember refile"
1942   (if my-org-protocol-flag
1943       (progn
1944         (setq my-org-protocol-flag nil)
1945         ad-do-it
1946         (delete-frame))
1947     ad-do-it)
1948   )
1949 (defadvice org-capture-kill (after delete-frame-at-end activate)
1950   "Delete frame at remember abort"
1951   (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1952          (setq my-org-protocol-flag nil)))
1953 (defadvice org-protocol-capture (before set-org-protocol-flag activate)
1954   (setq my-org-protocol-flag t))
1955
1956 (defadvice org-insert-todo-heading (after dla/create-id activate)
1957   (unless (org-in-item-p)
1958     (org-id-get-create)
1959     )
1960   )
1961
1962 ;; org modules
1963 (add-to-list 'org-modules 'org-habit)
1964
1965 ; this comes from http://upsilon.cc/~zack/blog/posts/2010/02/integrating_Mutt_with_Org-mode/
1966 (defun open-mail-in-mutt (message)
1967   "Open a mail message in Mutt, using an external terminal.
1968
1969 Message can be specified either by a path pointing inside a
1970 Maildir, or by Message-ID."
1971   (interactive "MPath or Message-ID: ")
1972   (shell-command
1973    (format "faf xterm -e \"%s %s\""
1974        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/mutt_open") message)))
1975
1976 ;; add support for "mutt:ID" links
1977 (org-add-link-type "mutt" 'open-mail-in-mutt)
1978
1979 (defun my-org-mode-setup ()
1980   ; (load-library "reftex")
1981   (and (buffer-file-name)
1982        (file-exists-p (buffer-file-name))
1983        (progn
1984          ; (reftex-parse-all)
1985          (reftex-set-cite-format
1986           '((?b . "[[bib:%l][%l-bib]]")
1987             (?n . "[[notes:%l][%l-notes]]")
1988             (?c . "\\cite{%l}")
1989             (?h . "*** %t\n:PROPERTIES:\n:Custom_ID: %l\n:END:\n[[papers:%l][%l xoj]] [[papers-pdf:%l][pdf]]")))
1990          ))
1991   (define-key org-mode-map (kbd "C-c )") 'reftex-citation)
1992   (define-key org-mode-map (kbd "C-c [") 'reftex-citation)
1993   (define-key org-mode-map (kbd "C-c (") 'org-mode-reftex-search)
1994   (define-key org-mode-map (kbd "C-c 0") 'reftex-view-crossref)
1995   )
1996 (add-hook 'org-mode-hook 'my-org-mode-setup)
1997
1998 (defun org-mode-reftex-search ()
1999   (interactive)
2000   (org-open-link-from-string (format "[[notes:%s]]" (first (reftex-citation t)))))
2001
2002 (defun open-research-paper (bibtexkey)
2003   "Open a paper by bibtex key"
2004   (interactive "bibtex key: ")
2005   (shell-command
2006    (format "%s %s"
2007        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
2008 (org-add-link-type "papers" 'open-research-paper)
2009 (defun open-research-paper-pdf (bibtexkey)
2010   "Open a paper pdf by bibtex key"
2011   (interactive "bibtex key: ")
2012   (shell-command
2013    (format "%s -p evince_annot %s"
2014        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
2015 (org-add-link-type "papers-pdf" 'open-research-paper-pdf)
2016
2017 (add-to-list 'org-link-abbrev-alist
2018              '("notes" .
2019                "~/projects/research/paper_notes.org::#%s"))
2020
2021 ; I pretty much always want hiearchical checkboxes
2022 (setq org-hierachical-checkbox-statistics nil)
2023
2024 ;; Add \begin{equation}\end{equation} templates to the org mode easy templates
2025 (add-to-list 'org-structure-template-alist
2026              '("E" "\\begin{equation}\n?\n\\end{equation}"))
2027
2028  ;; stolen from
2029 ;; http://www-public.it-sudparis.eu/~berger_o/weblog/2012/03/23/how-to-manage-and-export-bibliographic-notesrefs-in-org-mode/
2030 (defun my-rtcite-export-handler (path desc format)
2031   (message "my-rtcite-export-handler is called : path = %s, desc = %s, format = %s" path desc format)
2032   (let* ((search (when (string-match "::#?\\(.+\\)\\'" path)
2033                    (match-string 1 path)))
2034          (path (substring path 0 (match-beginning 0))))
2035     (cond ((eq format 'latex)
2036            (if (or (not desc)
2037                    (equal 0 (search "rtcite:" desc)))
2038                (format "\\cite{%s}" search)
2039              (format "\\cite[%s]{%s}" desc search))))))
2040
2041 (org-add-link-type "rtcite"
2042                    'org-bibtex-open
2043                    'my-rtcite-export-handler)
2044
2045
2046 #+END_SRC
2047 ** Org Mobile Configuration
2048 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2049   (setq-default org-mobile-directory "/linnode.donarmstrong.com:/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/")
2050   (when (string= system-name "linnode")
2051     (setq-default org-mobile-directory "/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/"))
2052   (setq-default org-directory "/home/don/org-mode/")
2053   (setq-default org-mobile-inbox-for-pull "/home/don/org-mode/from-mobile.org")
2054
2055 #+END_SRC
2056 ** Org iCal Support
2057 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2058   ;; org mode ical export
2059   (setq org-icalendar-timezone "America/Los_Angeles")
2060   (setq org-icalendar-use-scheduled '(todo-start event-if-todo))
2061   ;; we already add the id manually
2062   (setq org-icalendar-store-UID t)
2063
2064 #+END_SRC
2065 ** General Org Babel Configuration
2066 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2067 ;; org babel support
2068 (org-babel-do-load-languages
2069  'org-babel-load-languages
2070  '((emacs-lisp . t )
2071    (R . t)
2072    (latex . t)
2073    (ditaa . t)
2074    (dot . t)
2075    ))
2076 ;; set the right path to ditaa.jar
2077 (setq org-ditaa-jar-path "/usr/share/ditaa/ditaa.jar")
2078 ;; use graphviz-dot for dot things
2079 (add-to-list 'org-src-lang-modes '("dot" . graphviz-dot))
2080 ;; do not indent begin_src blocks
2081 (setq org-edit-src-content-indentation 0)
2082 ;; org-babel-by-backend
2083 (defmacro org-babel-by-backend (&rest body)
2084    `(case (if (boundp 'backend)
2085               (org-export-backend-name backend)
2086             nil) ,@body))
2087
2088 (defun my/fix-inline-images ()
2089   (when org-inline-image-overlays
2090     (org-redisplay-inline-images)))
2091
2092 (add-hook 'org-babel-after-execute-hook
2093            'my/fix-inline-images)
2094
2095 #+END_SRC
2096 ** LaTeX configuration
2097    :PROPERTIES:
2098    :ID:       7135ba17-6a50-4eed-84ca-b90afa5b12f8
2099    :END:
2100 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2101 (use-package ox-extra
2102   :config
2103   (ox-extras-activate '(ignore-headlines)))
2104 (require 'ox-latex)
2105 (add-to-list 'org-latex-classes
2106          '("memarticle"
2107        "\\documentclass[11pt,oneside,article]{memoir}\n"
2108        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2109        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2110        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2111        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2112        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2113
2114 (setq org-beamer-outline-frame-options "")
2115 (add-to-list 'org-latex-classes
2116          '("beamer"
2117        "\\documentclass[ignorenonframetext]{beamer}
2118 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2119 [PACKAGES]
2120 [EXTRA]"
2121        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2122        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2123        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2124        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2125        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2126
2127 (add-to-list 'org-latex-classes
2128          '("membook"
2129        "\\documentclass[11pt,oneside]{memoir}\n"
2130        ("\\chapter{%s}" . "\\chapter*{%s}")
2131        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2132        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2133        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")))
2134
2135 (add-to-list 'org-latex-classes
2136          '("letter"
2137        "\\documentclass[11pt]{letter}
2138 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2139 [PACKAGES]
2140 [EXTRA]"
2141    ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2142        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2143        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2144        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2145        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2146
2147 (add-to-list 'org-latex-classes
2148          '("dlacv"
2149        "\\documentclass{dlacv}
2150 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2151 [NO-PACKAGES]
2152 [NO-EXTRA]"
2153        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2154        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2155        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2156        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2157        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2158
2159
2160 (add-to-list 'org-latex-classes
2161          '("dlaresume"
2162        "\\documentclass{dlaresume}
2163 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2164 [NO-PACKAGES]
2165 [NO-EXTRA]"
2166        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2167        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2168        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2169        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2170        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2171
2172
2173 ;; Originally taken from Bruno Tavernier: http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/31150/focus=31432
2174 ;; but adapted to use latexmk 4.22 or higher.
2175 (setq org-latex-pdf-process '("latexmk -f -pdflatex=xelatex -bibtex -use-make -pdf %f"))
2176
2177 ;; Default packages included in /every/ tex file, latex, pdflatex or xelatex
2178 (setq org-latex-default-packages-alist
2179   '(("" "amsmath" t)
2180     ("" "unicode-math" t)
2181     ))
2182 (setq org-latex-packages-alist
2183   '(("" "graphicx" t)
2184     ("" "fontspec" t)
2185     ("" "xunicode" t)
2186     ("" "hyperref" t)
2187     ("" "url" t)
2188     ("" "rotating" t)
2189     ("" "longtable" nil)
2190     ("" "float" )))
2191
2192 ;; make equations larger
2193 (setq org-format-latex-options (plist-put org-format-latex-options :scale 2.0))
2194
2195 (defun org-create-formula--latex-header ()
2196   "Return LaTeX header appropriate for previewing a LaTeX snippet."
2197   (let ((info (org-combine-plists (org-export--get-global-options
2198            (org-export-get-backend 'latex))
2199           (org-export--get-inbuffer-options
2200            (org-export-get-backend 'latex)))))
2201     (org-latex-guess-babel-language
2202      (org-latex-guess-inputenc
2203   (org-splice-latex-header
2204    org-format-latex-header
2205    org-latex-default-packages-alist
2206    nil t
2207    (plist-get info :latex-header)))
2208      info)))
2209
2210
2211 ; support ignoring headers in org mode export to latex
2212 ; from http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/67692
2213 (defadvice org-latex-headline (around my-latex-skip-headlines
2214                   (headline contents info) activate)
2215   (if (member "ignoreheading" (org-element-property :tags headline))
2216   (setq ad-return-value contents)
2217     ad-do-it))
2218
2219 ;; keep latex logfiles
2220
2221 (setq org-latex-remove-logfiles nil)
2222
2223 ;; Resume clocking task when emacs is restarted
2224 (org-clock-persistence-insinuate)
2225 ;;
2226 ;; Show lot of clocking history so it's easy to pick items off the C-F11 list
2227 (setq org-clock-history-length 23)
2228 ;; Resume clocking task on clock-in if the clock is open
2229 (setq org-clock-in-resume t)
2230 ;; Change tasks to NEXT when clocking in; this avoids clocking in when
2231 ;; there are things like PHONE calls
2232 (setq org-clock-in-switch-to-state 'bh/clock-in-to-next)
2233 ;; Separate drawers for clocking and logs
2234 (setq org-drawers (quote ("PROPERTIES" "LOGBOOK")))
2235 ;; Save clock data and state changes and notes in the LOGBOOK drawer
2236 (setq org-clock-into-drawer t)
2237 (setq org-log-into-drawer t)
2238 ;; Sometimes I change tasks I'm clocking quickly - this removes clocked tasks with 0:00 duration
2239 (setq org-clock-out-remove-zero-time-clocks t)
2240 ;; Clock out when moving task to a done state
2241 (setq org-clock-out-when-done t)
2242 ;; Save the running clock and all clock history when exiting Emacs, load it on startup
2243 (setq org-clock-persist t)
2244 ;; Do not prompt to resume an active clock
2245 (setq org-clock-persist-query-resume nil)
2246 ;; Enable auto clock resolution for finding open clocks
2247 (setq org-clock-auto-clock-resolution (quote when-no-clock-is-running))
2248 ;; Include current clocking task in clock reports
2249 (setq org-clock-report-include-clocking-task t)
2250
2251 ;; the cache seems to be broken
2252 (setq org-element-use-cache nil)
2253
2254 (defvar bh/keep-clock-running nil)
2255
2256 (defun bh/is-task-p ()
2257   "Any task with a todo keyword and no subtask"
2258   (save-restriction
2259     (widen)
2260     (let ((has-subtask)
2261           (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
2262           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2263       (save-excursion
2264         (forward-line 1)
2265         (while (and (not has-subtask)
2266                     (< (point) subtree-end)
2267                     (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
2268           (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
2269             (setq has-subtask t))))
2270       (and is-a-task (not has-subtask)))))
2271 (defun bh/is-project-p ()
2272   "Any task with a todo keyword subtask"
2273   (save-restriction
2274     (widen)
2275     (let ((has-subtask)
2276           (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
2277           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2278       (save-excursion
2279         (forward-line 1)
2280         (while (and (not has-subtask)
2281                     (< (point) subtree-end)
2282                     (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
2283           (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
2284             (setq has-subtask t))))
2285       (and is-a-task has-subtask))))
2286
2287 (defun bh/is-subproject-p ()
2288   "Any task which is a subtask of another project"
2289   (let ((is-subproject)
2290         (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2291     (save-excursion
2292       (while (and (not is-subproject) (org-up-heading-safe))
2293         (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
2294           (setq is-subproject t))))
2295     (and is-a-task is-subproject)))
2296
2297
2298 (defun bh/clock-in-to-next (kw)
2299   "Switch a task from TODO to NEXT when clocking in.
2300 Skips capture tasks, projects, and subprojects.
2301 Switch projects and subprojects from NEXT back to TODO"
2302   (when (not (and (boundp 'org-capture-mode) org-capture-mode))
2303     (cond
2304      ((and (member (org-get-todo-state) (list "TODO"))
2305        (bh/is-task-p))
2306   "NEXT")
2307      ((and (member (org-get-todo-state) (list "NEXT"))
2308        (bh/is-project-p))
2309   "TODO"))))
2310
2311 (defun bh/punch-in (arg)
2312   "Start continuous clocking and set the default task to the
2313 selected task.  If no task is selected set the Organization task
2314 as the default task."
2315   (interactive "p")
2316   (setq bh/keep-clock-running t)
2317   (if (equal major-mode 'org-agenda-mode)
2318   ;;
2319   ;; We're in the agenda
2320   ;;
2321   (let* ((marker (org-get-at-bol 'org-hd-marker))
2322          (tags (org-with-point-at marker (org-get-tags-at))))
2323     (if (and (eq arg 4) tags)
2324         (org-agenda-clock-in '(16))
2325       (bh/clock-in-organization-task-as-default)))
2326     ;;
2327     ;; We are not in the agenda
2328     ;;
2329     (save-restriction
2330   (widen)
2331   ; Find the tags on the current task
2332   (if (and (equal major-mode 'org-mode) (not (org-before-first-heading-p)) (eq arg 4))
2333       (org-clock-in '(16))
2334     (bh/clock-in-organization-task-as-default)))))
2335
2336 (defun bh/punch-out ()
2337   (interactive)
2338   (setq bh/keep-clock-running nil)
2339   (when (org-clock-is-active)
2340     (org-clock-out))
2341   (org-agenda-remove-restriction-lock))
2342
2343 (defun bh/clock-in-default-task ()
2344   (save-excursion
2345     (org-with-point-at org-clock-default-task
2346   (org-clock-in))))
2347
2348 (defun bh/clock-in-parent-task ()
2349   "Move point to the parent (project) task if any and clock in"
2350   (let ((parent-task))
2351     (save-excursion
2352   (save-restriction
2353     (widen)
2354     (while (and (not parent-task) (org-up-heading-safe))
2355       (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
2356         (setq parent-task (point))))
2357     (if parent-task
2358         (org-with-point-at parent-task
2359       (org-clock-in))
2360       (when bh/keep-clock-running
2361         (bh/clock-in-default-task)))))))
2362
2363 (defvar bh/organization-task-id "e22cb8bf-07c7-408b-8f60-ff3aadac95e4")
2364
2365 (defun bh/clock-in-organization-task-as-default ()
2366   (interactive)
2367   (org-with-point-at (org-id-find bh/organization-task-id 'marker)
2368     (org-clock-in '(16))))
2369
2370 (defun bh/clock-out-maybe ()
2371   (when (and bh/keep-clock-running
2372          (not org-clock-clocking-in)
2373          (marker-buffer org-clock-default-task)
2374          (not org-clock-resolving-clocks-due-to-idleness))
2375     (bh/clock-in-parent-task)))
2376
2377 ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/clock-out-maybe 'append)
2378
2379 (require 'org-id)
2380 (defun bh/clock-in-task-by-id (id)
2381   "Clock in a task by id"
2382   (org-with-point-at (org-id-find id 'marker)
2383     (org-clock-in nil)))
2384
2385 (defun bh/clock-in-last-task (arg)
2386   "Clock in the interrupted task if there is one
2387 Skip the default task and get the next one.
2388 A prefix arg forces clock in of the default task."
2389   (interactive "p")
2390   (let ((clock-in-to-task
2391      (cond
2392       ((eq arg 4) org-clock-default-task)
2393       ((and (org-clock-is-active)
2394         (equal org-clock-default-task (cadr org-clock-history)))
2395        (caddr org-clock-history))
2396       ((org-clock-is-active) (cadr org-clock-history))
2397       ((equal org-clock-default-task (car org-clock-history)) (cadr org-clock-history))
2398       (t (car org-clock-history)))))
2399     (widen)
2400     (org-with-point-at clock-in-to-task
2401   (org-clock-in nil))))
2402
2403
2404 (defun org-export-to-ods ()
2405   (interactive)
2406   (let ((csv-file "data.csv"))
2407     (org-table-export csv-file "orgtbl-to-csv")
2408     (org-odt-convert csv-file "ods" 'open)))
2409
2410 ; allow for zero-width-space to be a break in regexp too
2411 ; (setcar org-emphasis-regexp-components " [:space:] \t('\"{")
2412 ; (setcar (nthcdr 1 org-emphasis-regexp-components) " [:space:]- \t.,:!?;'\")}\\")
2413 ; (org-set-emph-re 'org-emphasis-regexp-components org-emphasis-regexp-components)
2414
2415 ;; support inserting screen shots
2416 (defun my/org-insert-screenshot ()
2417   "Take a screenshot into a time stamped unique-named file in the
2418 same directory as the org-buffer and insert a link to this file."
2419   (interactive)
2420   (defvar my/org-insert-screenshot/filename)
2421   (setq my/org-insert-screenshot/filename
2422     (read-file-name
2423      "Screenshot to insert: "
2424      nil
2425      (concat (buffer-file-name) "_" (format-time-string "%Y%m%d_%H%M%S") ".png")
2426      )
2427     )
2428   (call-process "import" nil nil nil my/org-insert-screenshot/filename)
2429   (insert (concat "[[" my/org-insert-screenshot/filename "]]"))
2430   (org-display-inline-images))
2431
2432 (defun my/fix-inline-images ()
2433   (when org-inline-image-overlays
2434     (org-redisplay-inline-images)))
2435
2436 (add-hook 'org-babel-after-execute-hook 'my/fix-inline-images)
2437
2438 ;; use xelatex to preview with imagemagick
2439 (add-to-list 'org-preview-latex-process-alist
2440          '(xelateximagemagick
2441       :programs ("xelatex" "convert")
2442       :description "pdf > png"
2443       :message "you need to install xelatex and imagemagick"
2444       :use-xcolor t
2445       :image-input-type "pdf"
2446       :image-output-type "png"
2447       :image-size-adjust (1.0 . 1.0)
2448       :latex-compiler ("xelatex -interaction nonstopmode -output-directory %o %f")
2449       :image-converter ("convert -density %D -trim -antialias %f -quality 100 %O"))
2450          )
2451 ;; use xelatex by default
2452 (setq org-preview-latex-default-process 'xelateximagemagick)
2453
2454 ; from http://orgmode.org/Changes.html
2455 (defun my/org-repair-property-drawers ()
2456   "Fix properties drawers in current buffer.
2457  Ignore non Org buffers."
2458   (interactive)
2459   (when (eq major-mode 'org-mode)
2460     (org-with-wide-buffer
2461      (goto-char (point-min))
2462      (let ((case-fold-search t)
2463        (inline-re (and (featurep 'org-inlinetask)
2464                (concat (org-inlinetask-outline-regexp)
2465                    "END[ \t]*$"))))
2466    (org-map-entries
2467     (lambda ()
2468       (unless (and inline-re (org-looking-at-p inline-re))
2469         (save-excursion
2470       (let ((end (save-excursion (outline-next-heading) (point))))
2471         (forward-line)
2472         (when (org-looking-at-p org-planning-line-re) (forward-line))
2473         (when (and (< (point) end)
2474                (not (org-looking-at-p org-property-drawer-re))
2475                (save-excursion
2476                  (and (re-search-forward org-property-drawer-re end t)
2477                   (eq (org-element-type
2478                    (save-match-data (org-element-at-point)))
2479                   'drawer))))
2480           (insert (delete-and-extract-region
2481                (match-beginning 0)
2482                (min (1+ (match-end 0)) end)))
2483           (unless (bolp) (insert "\n"))))))))))))
2484
2485 #+END_SRC
2486 ** Org-Gcal
2487 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2488 (use-package calfw
2489   :ensure f
2490   )
2491 (use-package calfw-org
2492   :ensure f
2493   )
2494 (use-package org-gcal
2495   :if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
2496   :ensure f
2497   :config '((if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
2498                 (load-file "~/.hide/org_gcal.el"))
2499             )
2500   )
2501 #+END_SRC
2502 ** appt integration
2503 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2504   (use-package appt
2505     :ensure f
2506     :config
2507     ;; Show notification 10 minutes before event
2508     (setq appt-message-warning-time 10)
2509     ;; Disable multiple reminders
2510     (setq appt-display-interval appt-message-warning-time)
2511     (setq appt-display-mode-line nil)
2512
2513     ;; add automatic reminders for appointments
2514     (defun my/org-agenda-to-appt ()
2515       (interactive)
2516       (setq appt-time-msg-list nil)
2517       (org-agenda-to-appt))
2518     ;; add reminders when starting emacs
2519     (my/org-agenda-to-appt)
2520     ;; when rebuilding the agenda
2521     (defadvice  org-agenda-redo (after org-agenda-redo-add-appts)
2522       "Pressing `r' on the agenda will also add appointments."
2523       (my/org-agenda-to-appt)
2524       )
2525     ;; when saving all org buffers
2526     (defadvice org-save-all-org-buffers (after org-save-all-org-buffers-add-appts)
2527       "Re-add appts after saving all org buffers"
2528       (my/org-agenda-to-appt))
2529     ;; Display appointments as a window manager notification
2530     (setq appt-disp-window-function 'my/appt-display)
2531     (setq appt-delete-window-function (lambda () t))
2532
2533     (setq my/appt-notification-app (concat (getenv "HOME") "/bin/appt_notification"))
2534
2535     (defun my/appt-display (min-to-app new-time msg)
2536       (if (atom min-to-app)
2537       (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app min-to-app msg)
2538     (dolist (i (number-sequence 0 (1- (length min-to-app))))
2539       (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app
2540                      (nth i min-to-app) (nth i msg))))
2541       )
2542     )
2543
2544
2545 #+END_SRC
2546 ** outshine (outlining) integration
2547 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2548 (use-package outshine
2549   :ensure t
2550   :hook (outline-minor-mode . outshine-hook-function)
2551 )
2552 #+END_SRC
2553 ** End use-package
2554 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2555   )
2556 #+END_SRC
2557 * Keybindings
2558 ** Home/End Begining/End of line
2559 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2560   (global-set-key [home] 'move-beginning-of-line)
2561   (global-set-key [end] 'move-end-of-line)
2562 #+END_SRC
2563 ** Goto line
2564 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2565   (global-unset-key "\M-g")
2566   (global-set-key (kbd "M-g l") 'goto-line)
2567 #+END_SRC
2568 * Debian
2569 ** debian-changelog
2570 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2571   (use-package debian-changelog-mode
2572     :mode "debian/changelog"
2573     :config
2574     (setq debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
2575     (setq debian-changelog-full-name "Don Armstrong"))
2576 #+END_SRC
2577 * Misc (uncharacterized)
2578 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2579   (setq calendar-latitude 38.6)
2580   (setq calendar-longitude -121.5)
2581   (setq case-fold-search t)
2582   (setq confirm-kill-emacs (quote y-or-n-p))
2583   (setq cperl-lazy-help-time nil)
2584 #+END_SRC
2585 ** Turn on fontlock and icomplete
2586 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2587   (global-font-lock-mode 1)
2588   (icomplete-mode 1)
2589   (setq log-edit-keep-buffer t)
2590 #+END_SRC
2591 ** Set mail User agent
2592 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2593   (setq mail-user-agent (quote sendmail-user-agent))
2594   (setq mutt-alias-file-list (quote ("~/.mutt/aliases" "~/.mail_aliases")))
2595 #+END_SRC
2596 ** PS Printing
2597 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2598   (setq ps-footer-font-size (quote (8 . 10)))
2599   (setq ps-header-font-size (quote (8 . 10)))
2600   (setq ps-header-title-font-size (quote (10 . 10)))
2601   (setq ps-line-number-color "blue")
2602   (setq ps-print-footer t)
2603   (setq ps-print-footer-frame nil)
2604   (setq ps-print-only-one-header t)
2605 #+END_SRC
2606 ** Only single spacing on sentences
2607 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2608   (setq sentence-end "[.?!][]\"')]*\\($\\|   \\| \\)[
2609   ]*")
2610   (setq sentence-end-double-space nil)
2611   ; enable matching parenthesis
2612 #+END_SRC
2613 ** Display paren mode
2614 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2615   (show-paren-mode 1)
2616   (setq show-paren-delay 0.2)
2617
2618 #+END_SRC
2619 ** My Username
2620 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2621   (setq user-mail-address "don@donarmstrong.com")
2622
2623 #+END_SRC
2624 ** Use primary selection on unix machines
2625 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2626   ;; switch back to the old primary selection method
2627   (if (or (string-equal system-type "darwin")
2628           (string-equal system-type "windows")
2629           )
2630       (progn
2631         (setq x-select-enable-clipboard t)
2632         (setq x-select-enable-primary nil)
2633         )
2634     (progn
2635       (setq x-select-enable-clipboard nil)
2636       (setq x-select-enable-primary t)
2637       ))
2638   ; (setq mouse-drag-copy-region t)
2639
2640   (fset 'perl-mode 'cperl-mode)
2641   ;;(load-file "cperl-mode.el")
2642
2643   ;; tramp configuration
2644   (setq tramp-use-ssh-controlmaster-options nil)
2645
2646   (setq-default c-indent-level 4)
2647   (setq-default c-brace-imaginary-offset 0)
2648   (setq-default c-brace-offset -4)
2649   (setq-default c-argdecl-indent 4)
2650   (setq-default c-label-offset -4)
2651   (setq-default c-continued-statement-offset 4)
2652   ; tabs are annoying
2653   (setq-default indent-tabs-mode nil)
2654   (setq-default tab-width 4)
2655
2656
2657   ;; (autoload 'php-mode "php-mode" "PHP editing mode" t)
2658   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php3?\\'" . php-mode))
2659   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.phtml?\\'" . php-mode))
2660   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php?\\'" . php-mode))
2661   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php4?\\'" . php-mode))
2662
2663
2664   (defun insert-date ()
2665     "Insert date at point."
2666     (interactive)
2667     (insert (format-time-string "%A, %B %e, %Y %k:%M:%S %Z")))
2668   (global-set-key "\C-[d" 'insert-date)
2669
2670   (defun unfill-paragraph (arg)
2671     "Pull this whole paragraph up onto one line."
2672     (interactive "*p")
2673     (let ((fill-column 10000))
2674       (fill-paragraph arg))
2675     )
2676
2677   (column-number-mode t)
2678
2679 #+END_SRC
2680 ** Desktop-save-mode
2681 If the envvar EMACS_SERVER_NAME is set, consider this a separate
2682 emacs, and use a different desktop file to restore history
2683 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2684   (use-package desktop
2685     :demand
2686     :config
2687     (setq desktop-base-file-name
2688           (convert-standard-filename
2689            (concat ".emacs"
2690                    (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2691                        "")
2692                    ".desktop")
2693            ))
2694     (setq desktop-base-lock-name
2695           (convert-standard-filename
2696            (concat desktop-base-file-name
2697                    ".lock")))
2698     (setq desktop-auto-save-timeout 60)
2699     (setq desktop-restore-eager 5)
2700     (setq desktop-lazy-verbose nil)
2701     (desktop-save-mode 1)
2702     ; (desktop-read)
2703   )
2704 #+END_SRC
2705 ** Misc (Uncharacterized)
2706 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2707   '(icomplete-mode on)
2708   (custom-set-faces
2709    ;; custom-set-faces was added by Custom.
2710    ;; If you edit it by hand, you could mess it up, so be careful.
2711    ;; Your init file should contain only one such instance.
2712    ;; If there is more than one, they won't work right.
2713    '(menu ((((type x-toolkit)) (:background "black" :foreground "grey90")))))
2714
2715
2716   (put 'upcase-region 'disabled nil)
2717   (put 'downcase-region 'disabled nil)
2718   (put 'narrow-to-region 'disabled nil)
2719
2720   ; (defun turn-on-flyspell ()
2721   ;    "Force flyspell-mode on using a positive arg.  For use in hooks."
2722   ;    (interactive)
2723   ;    (flyspell-mode 1))
2724
2725
2726    ; Outline-minor-mode key map
2727    (define-prefix-command 'cm-map nil "Outline-")
2728    ; HIDE
2729    (define-key cm-map "q" 'outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
2730    (define-key cm-map "t" 'outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
2731    (define-key cm-map "o" 'outline-hide-other)        ; Hide other branches
2732    (define-key cm-map "c" 'outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
2733    (define-key cm-map "l" 'outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
2734    (define-key cm-map "d" 'outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
2735    ; SHOW
2736    (define-key cm-map "a" 'outline-show-all)          ; Show (expand) everything
2737    (define-key cm-map "e" 'outline-show-entry)        ; Show this heading's body
2738    (define-key cm-map "i" 'outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
2739    (define-key cm-map "k" 'outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
2740    (define-key cm-map "s" 'outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
2741    ; MOVE
2742    (define-key cm-map "u" 'outline-up-heading)                ; Up
2743    (define-key cm-map "n" 'outline-next-visible-heading)      ; Next
2744    (define-key cm-map "p" 'outline-previous-visible-heading)  ; Previous
2745    (define-key cm-map "f" 'outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
2746    (define-key cm-map "b" 'outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
2747    (global-set-key "\M-o" cm-map)
2748   ; fix up tmux xterm keys
2749   ; stolen from http://unix.stackexchange.com/questions/24414/shift-arrow-not-working-in-emacs-within-tmux
2750   (defun fix-up-tmux-keys ()
2751       "Fix up tmux xterm keys"
2752       (if (getenv "TMUX")
2753           (progn
2754             (let ((x 2) (tkey ""))
2755               (while (<= x 8)
2756                 ;; shift
2757                 (if (= x 2)
2758                     (setq tkey "S-"))
2759                 ;; alt
2760                 (if (= x 3)
2761                     (setq tkey "M-"))
2762                 ;; alt + shift
2763                 (if (= x 4)
2764                     (setq tkey "M-S-"))
2765                 ;; ctrl
2766                 (if (= x 5)
2767                     (setq tkey "C-"))
2768                 ;; ctrl + shift
2769                 (if (= x 6)
2770                     (setq tkey "C-S-"))
2771                 ;; ctrl + alt
2772                 (if (= x 7)
2773                     (setq tkey "C-M-"))
2774                 ;; ctrl + alt + shift
2775                 (if (= x 8)
2776                     (setq tkey "C-M-S-"))
2777
2778                 ;; arrows
2779                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d A" x)) (kbd (format "%s<up>" tkey)))
2780                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d B" x)) (kbd (format "%s<down>" tkey)))
2781                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d C" x)) (kbd (format "%s<right>" tkey)))
2782                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d D" x)) (kbd (format "%s<left>" tkey)))
2783                 ;; home
2784                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d H" x)) (kbd (format "%s<home>" tkey)))
2785                 ;; end
2786                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d F" x)) (kbd (format "%s<end>" tkey)))
2787                 ;; page up
2788                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 5 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<prior>" tkey)))
2789                 ;; page down
2790                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 6 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<next>" tkey)))
2791                 ;; insert
2792                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 2 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2793                 ;; delete
2794                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 3 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2795                 ;; f1
2796                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d P" x)) (kbd (format "%s<f1>" tkey)))
2797                 ;; f2
2798                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d Q" x)) (kbd (format "%s<f2>" tkey)))
2799                 ;; f3
2800                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d R" x)) (kbd (format "%s<f3>" tkey)))
2801                 ;; f4
2802                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d S" x)) (kbd (format "%s<f4>" tkey)))
2803                 ;; f5
2804                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 15 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f5>" tkey)))
2805                 ;; f6
2806                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 17 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f6>" tkey)))
2807                 ;; f7
2808                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 18 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f7>" tkey)))
2809                 ;; f8
2810                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 19 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f8>" tkey)))
2811                 ;; f9
2812                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 20 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f9>" tkey)))
2813                 ;; f10
2814                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 21 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f10>" tkey)))
2815                 ;; f11
2816                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 23 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f11>" tkey)))
2817                 ;; f12
2818                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 24 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f12>" tkey)))
2819                 ;; f13
2820                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 25 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f13>" tkey)))
2821                 ;; f14
2822                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 26 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f14>" tkey)))
2823                 ;; f15
2824                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 28 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f15>" tkey)))
2825                 ;; f16
2826                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 29 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f16>" tkey)))
2827                 ;; f17
2828                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 31 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f17>" tkey)))
2829                 ;; f18
2830                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 32 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f18>" tkey)))
2831                 ;; f19
2832                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 33 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f19>" tkey)))
2833                 ;; f20
2834                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 34 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f20>" tkey)))
2835
2836                 (setq x (+ x 1))
2837                 ))
2838             )
2839         )
2840       )
2841   ; (add-hook 'tty-setup-hook 'fix-up-tmux-keys)
2842
2843   (defadvice ask-user-about-supersession-threat (around ask-user-about-supersession-threat-if-necessary)
2844     "Call ask-user-about-supersession-threat only if the buffer is actually obsolete."
2845     (if (or (buffer-modified-p)
2846             (verify-visited-file-modtime)
2847             (< (* 8 1024 1024) (buffer-size))
2848             (/= 0 (call-process-region 1 (+ 1 (buffer-size)) "diff" nil nil nil "-q" (buffer-file-name) "-")))
2849         ad-do-it
2850       (clear-visited-file-modtime)
2851       (not-modified)))
2852   (ad-activate 'ask-user-about-supersession-threat)
2853 #+END_SRC
2854
2855 * Start Server
2856 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2857   (use-package server
2858     :config
2859     (setq server-name
2860           (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2861               "server"))
2862     (unless (server-running-p)
2863       (global-set-key "\C-xp" 'server-edit)
2864       (server-start)))
2865 #+END_SRC
2866
2867
2868
2869 * END
2870 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2871   (provide 'don-configuration)
2872 #+END_SRC