emacs_el/configuration/don-configuration.org

   1 #+PROPERTY: header-args:emacs-lisp :tangle don-configuration.el
   2 * Load debugger
   3
   4 # if for some reason, things get pear-shaped, we want to be able to
   5 # enter the debugger by sending -USR2 to emacs
   6
   7 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
   8 (setq debug-on-event 'siguser2)
   9 #+END_SRC
  10 * Add library paths
  11
  12 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  13   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/")
  14   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/tiny")
  15   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/other")
  16   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/magit-annex")
  17 #+END_SRC
  18
  19 * Package management
  20 ** package repositories and package manager
  21 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  22   (require 'package)
  23   (setq package-archives '(("gnu" . "https://elpa.gnu.org/packages/")
  24                            ("melpa" . "https://melpa.org/packages/")
  25                            ("org" . "http://orgmode.org/elpa/") ))
  26 #+END_SRC
  27 ** [[https://github.com/jwiegley/use-package/][use-package]]
  28 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  29   (package-initialize)
  30   (require 'use-package)
  31 #+END_SRC
  32 ** Paradox
  33 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  34   (use-package paradox
  35     :ensure paradox
  36   )
  37 #+END_SRC
  38 * Disable custom-vars
  39 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  40   ;; Set the custom file to /dev/null and don't bother to load it
  41   (setq custom-file "/dev/null")
  42 #+END_SRC
  43 * Misc functions
  44 ** with-library
  45 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  46 ;; From http://www.emacswiki.org/emacs/LoadingLispFiles
  47 ;; execute conditional code when loading libraries
  48 (defmacro with-library (symbol &rest body)
  49   `(when (require ,symbol nil t)
  50      ,@body))
  51 (put 'with-library 'lisp-indent-function 1)
  52 #+END_SRC
  53
  54 * Variables
  55 ** Safe Local Variables
  56 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  57   (setq safe-local-variable-values
  58         (quote ((auto-save-default)
  59                 (make-backup-files)
  60                 (cperl-indent-level . 4)
  61                 (indent-level . 4)
  62                 (indent-tabs-mode . f)
  63                 )))
  64 #+END_SRC
  65 * Memory
  66 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  67   (setq global-mark-ring-max 128
  68         mark-ring-max 128
  69         kill-ring-max 128)
  70
  71   (defun don/minibuffer-setup-hook ()
  72     (setq gc-cons-threshold most-positive-fixnum))
  73
  74   (defun don/minibuffer-exit-hook ()
  75     (setq gc-cons-threshold 1048576))
  76
  77   (add-hook 'minibuffer-setup-hook #'don/minibuffer-setup-hook)
  78   (add-hook 'minibuffer-exit-hook #'don/minibuffer-exit-hook)
  79 #+END_SRC
  80 * Modules
  81 ** Flyspell 🐝
  82 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  83   (use-package flyspell
  84     :ensure t
  85     :diminish flyspell-mode 🐝
  86     :config
  87     (add-hook 'message-mode-hook 'turn-on-flyspell)
  88     (add-hook 'text-mode-hook 'turn-on-flyspell)
  89     (add-hook 'c-mode-common-hook 'flyspell-prog-mode)
  90     (add-hook 'cperl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
  91     (add-hook 'tcl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
  92     :init
  93     (setq ispell-program-name "ispell")
  94     )
  95
  96 #+END_SRC
  97 ** Winnermode
  98 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  99   (winner-mode 1)
 100 #+END_SRC
 101 ** Eyebrowse
 102
 103 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 104   ;; (use-package eyebrowse
 105   ;;   :ensure t
 106   ;;   :diminish eyebrowse-mode
 107   ;;   :init (setq eyebrowse-keymap-prefix (kbd "C-c C-\\"))
 108   ;;   :config (progn
 109   ;;             (setq eyebrowse-wrap-around t)
 110   ;;             (eyebrowse-mode t)
 111   ;;
 112   ;;             (defun my/eyebrowse-new-window-config ()
 113   ;;               (interactive)
 114   ;;               (let ((done nil))
 115   ;;                 (dotimes (i 10)
 116   ;;                   ;; start at 1 run till 0
 117   ;;                   (let ((j (mod (+ i 1) 10)))
 118   ;;                     (when (and (not done)
 119   ;;                                (not (eyebrowse--window-config-present-p j)))
 120   ;;                       (eyebrowse-switch-to-window-config j)
 121   ;;                       (call-interactively 'eyebrowse-rename-window-config2 j)
 122   ;;                       (setq done t)
 123   ;;                       ))
 124   ;;                   )))
 125   ;;
 126   ;;             ;; I don't use latex-preview-pane
 127   ;;             ;; (require 'latex-preview-pane)
 128   ;;             ;; (defun my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch ()
 129   ;;             ;;   ;; latex-preview-pane uses window-parameters which are
 130   ;;             ;;   ;; not preserved by eyebrowse, so we close the preview
 131   ;;             ;;   ;; pane before switching, it will be regenerated when we
 132   ;;             ;;   ;; edit the TeX file.
 133   ;;             ;;   (when (lpp/window-containing-preview)
 134   ;;             ;;     (delete-window (lpp/window-containing-preview))))
 135   ;;
 136   ;;             ;; (add-to-list 'eyebrowse-pre-window-switch-hook
 137   ;;             ;;              #'my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch)
 138   ;;
 139   ;;             ;; (my/set-menu-key "["  #'my/eyebrowse-new-window-config)
 140   ;;             ;; (my/set-menu-key ";"  #'eyebrowse-prev-window-config)
 141   ;;             ;; (my/set-menu-key "'"  #'eyebrowse-next-window-config)
 142   ;;             ;; (my/set-menu-key "]"  #'eyebrowse-close-window-config)
 143   ;;             ;; (my/set-menu-key "\\" #'eyebrowse-rename-window-config)
 144   ;;             )
 145   ;;   )
 146 #+END_SRC
 147
 148 ** Window handling
 149
 150 *** Splitting
 151 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 152   (defun my/vsplit-last-buffer ()
 153     "Split the window vertically and display the previous buffer."
 154     (interactive)
 155     (split-window-vertically)
 156     (other-window 1 nil)
 157     (switch-to-next-buffer))
 158
 159   (defun my/hsplit-last-buffer ()
 160     "Split the window horizontally and display the previous buffer."
 161     (interactive)
 162     (split-window-horizontally)
 163     (other-window 1 nil)
 164     (switch-to-next-buffer))
 165
 166   (bind-key "C-x 2" 'my/vsplit-last-buffer)
 167   (bind-key "C-x 3" 'my/hsplit-last-buffer)
 168
 169   (setq split-width-threshold  100)
 170   (setq split-height-threshold 60)
 171
 172   (defun my/split-window-prefer-vertically (window)
 173     "If there's only one window (excluding any possibly active
 174            minibuffer), then split the current window horizontally."
 175     (if (and (one-window-p t)
 176              (not (active-minibuffer-window))
 177              ( < (frame-width) (frame-height))
 178              )
 179         (let ((split-width-threshold nil))
 180           (split-window-sensibly window))
 181       (split-window-sensibly window)))
 182
 183   (setq split-window-preferred-function #'my/split-window-prefer-vertically)
 184   (setq window-combination-resize t)
 185 #+END_SRC
 186
 187 *** Compilation window
 188
 189 If there is no compilation window, open one at the bottom, spanning
 190 the complete width of the frame. Otherwise, reuse existing window. In
 191 the former case, if there was no error the window closes
 192 automatically.
 193
 194 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 195   (add-to-list 'display-buffer-alist
 196                `(,(rx bos "*compilation*" eos)
 197                  (display-buffer-reuse-window
 198                   display-buffer-in-side-window)
 199                  (reusable-frames . visible)
 200                  (side            . bottom)
 201                  (window-height   . 0.4)))
 202 #+END_SRC
 203
 204 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 205   (defun my/compilation-exit-autoclose (status code msg)
 206     ;; If M-x compile exists with a 0
 207     (when (and (eq status 'exit) (zerop code))
 208       ;; and delete the *compilation* window
 209       (let ((compilation-window (get-buffer-window (get-buffer "*compilation*"))))
 210         (when (and (not (window-at-side-p compilation-window 'top))
 211                    (window-at-side-p compilation-window 'left)
 212                    (window-at-side-p compilation-window 'right))
 213           (delete-window compilation-window))))
 214     ;; Always return the anticipated result of compilation-exit-message-function
 215     (cons msg code))
 216
 217   ;; Specify my function (maybe I should have done a lambda function)
 218   (setq compilation-exit-message-function #'my/compilation-exit-autoclose)
 219 #+END_SRC
 220
 221 If you change the variable ~compilation-scroll-output~ to a ~non-nil~
 222 value, the compilation buffer scrolls automatically to follow the
 223 output. If the value is ~first-error~, scrolling stops when the first
 224 error appears, leaving point at that error. For any other non-nil
 225 value, scrolling continues until there is no more output.
 226
 227 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 228   (setq compilation-scroll-output 'first-error)
 229 #+END_SRC
 230
 231 ** Mode line cleaning
 232 *** Diminish
 233 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 234   (use-package diminish
 235     :ensure t)
 236 #+END_SRC
 237
 238 *** Delight
 239 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 240   (use-package delight
 241     :ensure t)
 242 #+END_SRC
 243
 244 ** Jumping
 245 *** Avy
 246 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 247   (use-package avy
 248     :ensure t
 249     :bind (("C-c C-<SPC>" . avy-goto-word-or-subword-1)
 250            ("C-c j j" . avy-goto-word-or-subword-1)
 251            ("M-g g" . avy-goto-line))
 252     :config (progn (setq avy-background t))
 253     )
 254 #+END_SRC
 255 *** Ace-link (jumping to links)
 256 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 257   (use-package ace-link
 258     :ensure t
 259     ; bind o in most modes
 260     :config (ace-link-setup-default))
 261 #+END_SRC
 262 *** Jumping through edit points (goto-chg)
 263 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 264   (use-package goto-chg
 265     :ensure t
 266     :bind (("C-c j ," . goto-last-change)
 267            ("C-c j ." . goto-last-change-reverse))
 268     )
 269 #+END_SRC
 270 *** Jumping to bookmarks (visible bookmarks, bm)
 271 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 272   (use-package bm
 273     :ensure t
 274     :bind (("C-c j b ." . bm-next)
 275            ("C-c j b ," . bm-previous)
 276            ("C-c j b SPC" . bm-toggle)))
 277 #+END_SRC
 278
 279 ** Snippets
 280 *** Yasnippet
 281 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 282   (use-package yasnippet
 283     :ensure t
 284     :diminish yas-minor-mode
 285     :config (progn
 286               (yas-global-mode)
 287               (setq yas-verbosity 1)
 288               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<tab>") nil)
 289               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "TAB") nil)
 290               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<backtab>") 'yas-expand)
 291               (setq yas-snippet-dirs '("~/lib/emacs_el/snippets/"
 292                                        "~/lib/emacs_el/yasnippet-snippets/snippets/"))
 293               (add-to-list 'hippie-expand-try-functions-list
 294                                'yas-hippie-try-expand)
 295               )
 296     )
 297 #+END_SRC
 298 *** Auto-YASnippet
 299 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 300   (use-package auto-yasnippet
 301     :bind (("H-w" . aya-create)
 302            ("H-y" . aya-expand)
 303            )
 304     )
 305 #+END_SRC
 306 ** Tinyprocmail
 307
 308 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 309   ;; load tinyprocmail
 310   (use-package tinyprocmail
 311     :ensure f
 312     :config (with-library 'tinyprocmail
 313               ;; (setq tinyprocmail--procmail-version "v3.22")
 314               (add-hook 'tinyprocmail--load-hook 'tinyprocmail-install))
 315   )
 316 #+END_SRC
 317
 318 ** Magit
 319 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
 320   (use-package magit
 321     :ensure t
 322     :bind (("C-x g" . magit-status)
 323            ("C-x C-g" . magit-status))
 324     :config
 325     ;; don't verify where we are pushing
 326     (setq magit-push-always-verify nil)
 327     ;; refine diffs always (hilight words)
 328     (setq magit-diff-refine-hunk nil)
 329     ;; load magit-annex
 330     (setq load-path
 331           (append '("~/lib/emacs_el/magit-annex")
 332                   load-path))
 333     ;; load magit-vcsh
 334     (setq load-path
 335           (append '("~/lib/emacs_el/magit-vcsh")
 336                   load-path))
 337     )
 338   (use-package magit-annex
 339     :ensure t
 340   )
 341   (use-package magit-vcsh
 342     :ensure f ; currently not in melpa, so don't try to install
 343   )
 344 #+END_SRC
 345
 346 ** Perl
 347 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 348   (use-package cperl-mode
 349     :config
 350     (progn
 351       ;; Use c-mode for perl .xs files
 352       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.xs\\'" . c-mode))
 353       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\([pP][Llm]\\|al\\)\\'" . cperl-mode))
 354       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl" . cperl-mode))
 355       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl5" . cperl-mode))
 356       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("miniperl" . cperl-mode))
 357       (setq cperl-hairy t
 358             cperl-indent-level 4
 359             cperl-auto-newline nil
 360             cperl-auto-newline-after-colon nil
 361             cperl-continued-statement-offset 4
 362             cperl-brace-offset -1
 363             cperl-continued-brace-offset 0
 364             cperl-label-offset -4
 365             cperl-highlight-variables-indiscriminately t
 366             cperl-electric-lbrace-space nil
 367             cperl-indent-parens-as-block nil
 368             cperl-close-paren-offset -1
 369             cperl-tab-always-indent t)
 370       ;;(add-hook 'cperl-mode-hook (lambda () (cperl-set-style "PerlStyle")))
 371   ))
 372 #+END_SRC
 373
 374 ** Helm
 375 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 376   (use-package helm
 377     :ensure t
 378     :config
 379     (helm-mode 1)
 380     (define-key global-map [remap find-file] 'helm-find-files)
 381     (define-key global-map [remap occur] 'helm-occur)
 382     (define-key global-map [remap list-buffers] 'helm-buffers-list)
 383     (define-key global-map [remap dabbrev-expand] 'helm-dabbrev)
 384     (global-set-key (kbd "M-x") 'helm-M-x)
 385     (unless (boundp 'completion-in-region-function)
 386       (define-key lisp-interaction-mode-map [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point)
 387       (define-key emacs-lisp-mode-map       [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point))
 388     (add-hook 'kill-emacs-hook #'(lambda () (and (file-exists-p "$TMP") (delete-file "$TMP"))))
 389   )
 390 #+END_SRC
 391 *** Helm Flx
 392
 393  [[https://github.com/PythonNut/helm-flx][helm-flx]] implements intelligent helm fuzzy sorting, provided by [[https://github.com/lewang/flx][flx]].
 394
 395  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 396  (use-package helm-flx
 397    :ensure t
 398    :config (progn
 399              ;; these are helm configs, but they kind of fit here nicely
 400              (setq helm-M-x-fuzzy-match                  t
 401                    helm-bookmark-show-location           t
 402                    helm-buffers-fuzzy-matching           t
 403                    helm-completion-in-region-fuzzy-match t
 404                    helm-file-cache-fuzzy-match           t
 405                    helm-imenu-fuzzy-match                t
 406                    helm-mode-fuzzy-match                 t
 407                    helm-locate-fuzzy-match               nil
 408                    helm-quick-update                     t
 409                    helm-recentf-fuzzy-match              nil
 410                    helm-semantic-fuzzy-match             t)
 411              (helm-flx-mode +1)))
 412  #+END_SRC
 413 *** Helm Swoop
 414 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 415
 416   ;;; stolen from https://github.com/malb/emacs.d/blob/master/malb.org
 417   (defun malb/helm-swoop-pr2e-fill ()
 418     (thing-at-point 'symbol))
 419   (setq malb/helm-swoop-ignore-major-mode '(dired-mode
 420         paradox-menu-mode doc-view-mode pdf-view-mode
 421         mu4e-headers-mode org-mode markdown-mode latex-mode
 422         ein:notebook-multilang-mode))
 423
 424   (defun malb/swoop-or-search ()
 425     (interactive)
 426     (if (or (> (buffer-size) 1048576) ;; helm-swoop can be slow on big buffers
 427             (memq major-mode malb/helm-swoop-ignore-major-mode))
 428         (isearch-forward)
 429       (helm-swoop)))
 430
 431   (use-package helm-swoop
 432     :ensure t
 433     :bind (("C-c o" . helm-multi-swoop-org)
 434            ("C-s" . malb/swoop-or-search)
 435            ("C-M-s" . helm-multi-swoop-all))
 436     :config (progn
 437
 438               (setq helm-swoop-pre-input-function  #'malb/helm-swoop-pre-fill
 439                     helm-swoop-split-with-multiple-windows nil
 440                     helm-swoop-split-direction #'split-window-horizontally
 441                     helm-swoop-split-window-function 'helm-default-display-buffer
 442                     helm-swoop-speed-or-color t)
 443
 444               ;; https://emacs.stackexchange.com/questions/28790/helm-swoop-how-to-make-it-behave-more-like-isearch
 445               (defun malb/helm-swoop-C-s ()
 446                 (interactive)
 447                 (if (boundp 'helm-swoop-pattern)
 448                     (if (equal helm-swoop-pattern "")
 449                         (previous-history-element 1)
 450                       (helm-next-line))
 451                   (helm-next-line)))
 452
 453               (bind-key "C-S-s" #'helm-swoop-from-isearch isearch-mode-map)
 454               (bind-key "C-S-s" #'helm-multi-swoop-all-from-helm-swoop helm-swoop-map)
 455               (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-swoop-map)
 456               (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-swoop-map)
 457               (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-multi-swoop-map)
 458               (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-multi-swoop-map))
 459     )
 460
 461 #+END_SRC
 462 *** Helm Ag
 463 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 464 (use-package helm-ag
 465   :ensure t
 466   :config (setq helm-ag-base-command "ag --nocolor --nogroup"
 467                 helm-ag-command-option "--all-text"
 468                 helm-ag-insert-at-point 'symbol
 469                 helm-ag-fuzzy-match t
 470                 helm-ag-use-temp-buffer t
 471                 helm-ag-use-grep-ignore-list t
 472                 helm-ag-use-agignore t))
 473 #+END_SRC
 474 *** Helm Descbinds
 475 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 476   (use-package helm-descbinds
 477     :ensure t
 478     :bind ("C-h b" . helm-descbinds)
 479     :init (fset 'describe-bindings 'helm-descbinds))
 480 #+END_SRC
 481
 482 *** Helm YaSnippet
 483 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 484   (use-package helm-c-yasnippet
 485     :ensure t
 486     :bind ("C-c h y" .  helm-yas-complete)
 487     :config (progn
 488               (setq helm-yas-space-match-any-greedy t)))
 489 #+END_SRC
 490 *** Helm Org Rifle
 491 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 492   (use-package helm-org-rifle
 493     :ensure t
 494     :config (progn
 495               (defun malb/helm-org-rifle-agenda-files (arg)
 496                 (interactive "p")
 497                 (let ((current-prefix-arg nil))
 498                   (cond
 499                    ((equal arg 4) (call-interactively #'helm-org-rifle-agenda-files nil))
 500                    ((equal arg 16) (helm-org-rifle-occur-agenda-files))
 501                    (t (helm-org-agenda-files-headings)))))))
 502 #+END_SRC
 503
 504 ** Hydra
 505 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
 506 (require 'don-hydra)
 507 #+END_SRC
 508
 509 ** Tramp
 510 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 511   (add-to-list 'tramp-methods '("vcsh"
 512                                 (tramp-login-program "vcsh")
 513                                 (tramp-login-args
 514                                  (("enter")
 515                                   ("%h")))
 516                                 (tramp-remote-shell "/bin/sh")
 517                                 (tramp-remote-shell-args
 518                                  ("-c"))))
 519 #+END_SRC
 520 ** Reftex
 521 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 522   (use-package reftex
 523     :ensure t
 524     :config
 525     (setq-default reftex-default-bibliography
 526                     '("~/projects/research/references.bib")))
 527 #+END_SRC
 528 ** LaTeX
 529 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 530   (use-package tex
 531     :defer t
 532     :ensure auctex
 533     :config
 534     ; (add-to-list 'TeX-style-path '"/home/don/lib/emacs_el/auctex/style")
 535     ;; REFTEX (much enhanced management of cross-ref, labels, etc)
 536     ;; http://www.strw.leidenuniv.nl/~dominik/Tools/reftex/
 537     ; (autoload 'reftex-mode     "reftex" "RefTeX Minor Mode" t)
 538     ; (autoload 'turn-on-reftex  "reftex" "RefTeX Minor Mode" nil)
 539     ; (autoload 'reftex-citation "reftex-cite" "Make citation" nil)
 540     ; (autoload 'reftex-index-phrase-mode "reftex-index" "Phrase mode" t)
 541     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with AUCTeX LaTeX mode
 542     (add-hook 'latex-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with Emacs latex mode
 543     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with AUCTeX LaTeX mode
 544     (add-hook 'latex-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with Emacs latex mode
 545
 546     (setq-default reftex-plug-into-AUCTeX t)
 547     ;; support fake section headers
 548     (setq TeX-outline-extra
 549           '(("%chapter" 1)
 550             ("%section" 2)
 551             ("%subsection" 3)
 552             ("%subsubsection" 4)
 553             ("%paragraph" 5)))
 554     ;; add font locking to the headers
 555     (font-lock-add-keywords
 556      'latex-mode
 557      '(("^%\\(chapter\\|\\(sub\\|subsub\\)?section\\|paragraph\\)"
 558         0 'font-lock-keyword-face t)
 559        ("^%chapter{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-1-face t)
 560        ("^%section{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-2-face t)
 561        ("^%subsection{\\(.*\\)}"    1 'font-latex-sectioning-3-face t)
 562        ("^%subsubsection{\\(.*\\)}" 1 'font-latex-sectioning-4-face t)
 563        ("^%paragraph{\\(.*\\)}"     1 'font-latex-sectioning-5-face t)))
 564
 565     ;; use smart quotes by default instead of `` and ''
 566     ;; taken from http://kieranhealy.org/esk/kjhealy.html
 567     (setq TeX-open-quote "“")
 568     (setq TeX-close-quote "”")
 569
 570     ;; (TeX-add-style-hook
 571     ;;  "latex"
 572     ;;  (lambda ()
 573     ;;    (TeX-add-symbols
 574     ;;     '("DLA" 1))))
 575     ;; (custom-set-variables
 576     ;;  '(font-latex-user-keyword-classes
 577     ;;    '(("fixme"
 578     ;;       ("DLA" "RZ")
 579     ;;       font-lock-function-name-face 2 (command 1 t))))
 580     ;; )
 581     (setq-default TeX-parse-self t)
 582     (setq-default TeX-auto-save t)
 583     (setq-default TeX-master nil)
 584     (eval-after-load
 585         "latex"
 586       '(TeX-add-style-hook
 587         "cleveref"
 588         (lambda ()
 589           (if (boundp 'reftex-ref-style-alist)
 590               (add-to-list
 591                'reftex-ref-style-alist
 592                '("Cleveref" "cleveref"
 593                  (("\\cref" ?c) ("\\Cref" ?C) ("\\cpageref" ?d) ("\\Cpageref" ?D)))))
 594           (reftex-ref-style-activate "Cleveref")
 595           (TeX-add-symbols
 596            '("cref" TeX-arg-ref)
 597            '("Cref" TeX-arg-ref)
 598            '("cpageref" TeX-arg-ref)
 599            '("Cpageref" TeX-arg-ref)))))
 600     (eval-after-load
 601         "latex"
 602       '(add-to-list 'LaTeX-fill-excluded-macros
 603                     '("Sexpr")))
 604
 605     (use-package font-latex
 606       :config
 607       (setq font-latex-match-reference-keywords
 608             '(
 609               ("fref" "{")
 610               ("Fref" "{")
 611               ("citep" "{")
 612               ("citet" "{")
 613               ("acs" "{")
 614               ("acsp" "{")
 615               ("ac" "{")
 616               ("acp" "{")
 617               ("acl" "{")
 618               ("aclp" "{")
 619               ("acsu" "{")
 620               ("aclu" "{")
 621               ("acused" "{")
 622               ("DLA" "{")
 623               ("RZ" "{")
 624               ("OM" "{")
 625               ("DL" "{")
 626               ("fixme" "{"))
 627             )
 628       )
 629   )
 630
 631 #+END_SRC
 632 *** Org-Gcal
 633 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 634   (use-package calfw
 635     :ensure f
 636     )
 637   (use-package calfw-org
 638     :ensure f
 639     )
 640   (use-package org-gcal
 641     :ensure f
 642     :config '((if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
 643                   (load-file "~/.hide/org_gcal.el"))
 644               )
 645     )
 646 #+END_SRC
 647 ** ESS
 648 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 649   (use-package ess
 650     :ensure t
 651     :config
 652     (defun ess-change-directory (path)
 653       "Set the current working directory to PATH for both *R* and Emacs."
 654       (interactive "DDirectory to change to: ")
 655
 656       (when (file-exists-p path)
 657         (ess-command (concat "setwd(\"" path "\")\n"))
 658         ;; use file-name-as-directory to ensure it has trailing /
 659         (setq default-directory (file-name-as-directory path))))
 660     (add-hook 'ess-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 661     ;; outlining support for ess modes
 662     (add-hook
 663      'ess-mode-hook
 664      '(lambda ()
 665         (outline-minor-mode)
 666         (setq outline-regexp "\\(^#\\{4,5\\} \\)\\|\\(^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function\\)")
 667         (defun outline-level ()
 668           (cond ((looking-at "^##### ") 1)
 669                 ((looking-at "^#### ") 2)
 670                 ((looking-at "^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function(.*{") 3)
 671                 (t 1000)))
 672         ))
 673     (add-hook 'ess-mode-hook
 674               '(lambda ()
 675                  (local-set-key (kbd "C-c C-R")
 676                                 'dla/ess-region-remote-eval)))
 677
 678     ;; Don't restore history or save workspace image
 679     '(inferior-R-args "--no-restore-history --no-save")
 680     )
 681 #+END_SRC
 682
 683 ** Rainbowmode
 684 From http://julien.danjou.info/projects/emacs-packages#rainbow-mode, this colorizes color strings
 685
 686 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 687   (use-package rainbow-mode
 688     ;; add ess to the x major mode
 689     :config (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[S])
 690     (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[R])
 691   )
 692 #+END_SRC
 693
 694 ** Polymode
 695 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 696   (use-package polymode
 697     :config
 698     (use-package poly-R)
 699     (use-package poly-noweb)
 700     (use-package poly-markdown)
 701     :mode ("\\.Snw" . poly-noweb+r-mode)
 702     :mode ("\\.Rnw" . poly-noweb+r-mode)
 703     :mode ("\\.Rmd" . poly-markdown+r-mode)
 704     )
 705 #+END_SRC
 706
 707 ** Outlining
 708 *** Outline magic
 709 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 710   (use-package outline-magic)
 711 #+END_SRC
 712 ** Writeroom Mode
 713 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 714   (use-package writeroom-mode
 715     :config
 716     (defun my/writing-mode ()
 717       "Start my writing mode; enable visual-line-mode and auto-fill-mode"
 718       (interactive)
 719       (if writeroom-mode
 720           (progn
 721             (writeroom-mode -1)
 722             (visual-line-mode -1)
 723             (auto-fill-mode -1)
 724             (visual-fill-column-mode -1)
 725             )
 726         (visual-line-mode 1)
 727         (auto-fill-mode 1)
 728         (visual-fill-column-mode 1)
 729         (writeroom-mode 1))
 730       )
 731     )
 732 #+END_SRC
 733 ** GhostText/Atomic Chrome
 734 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 735   (use-package atomic-chrome
 736     :config (atomic-chrome-start-server)
 737     (setq atomic-chrome-buffer-open-style 'full)
 738     )
 739 #+END_SRC
 740 ** Multiple Cursors
 741    :PROPERTIES:
 742    :ID:       6fcf218b-a762-4c37-9339-a8202ddeb544
 743    :END:
 744 [[https://github.com/magnars/multiple-cursors.el][Multiple Cursors]]
 745 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 746   (use-package multiple-cursors
 747     :bind (("C-;" . mc/mark-all-dwim)
 748            ("C-<" . mc/mark-previous-like-this)
 749            ("C->" . mc/mark-next-like-this)
 750            ("C-S-c C-S-c" . mc/edit-lines))
 751     )
 752 #+END_SRC
 753 * Org Mode
 754 ** Use-package and load things
 755 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 756
 757   (use-package org
 758     :config
 759
 760 #+END_SRC
 761 ** Agenda Configuration
 762 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 763   ;; The following lines are always needed. Choose your own keys.
 764   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\(org\\|org_archive\\|txt\\)$" . org-mode))
 765   (global-set-key "\C-cl" 'org-store-link)
 766   (global-set-key "\C-ca" 'org-agenda)
 767   (global-set-key "\C-cb" 'org-iswitchb)
 768   (setq-default org-log-done 'time)
 769   (setq-default org-agenda-ndays 5)
 770
 771   ;; agenda configuration
 772   ;; Do not dim blocked tasks
 773   (setq org-agenda-dim-blocked-tasks nil)
 774   (setq org-agenda-inhibit-startup t)
 775   (setq org-agenda-use-tag-inheritance nil)
 776
 777   ;; Compact the block agenda view
 778   (setq org-agenda-compact-blocks t)
 779
 780   ;; Custom agenda command definitions
 781   (setq org-agenda-custom-commands
 782         (quote (("N" "Notes" tags "NOTE"
 783                  ((org-agenda-overriding-header "Notes")
 784                   (org-tags-match-list-sublevels t)))
 785                 ("h" "Habits" tags-todo "STYLE=\"habit\""
 786                  ((org-agenda-overriding-header "Habits")
 787                   (org-agenda-sorting-strategy
 788                    '(todo-state-down effort-up category-keep))))
 789                 (" " "Agenda"
 790                  ((agenda "" nil)
 791                   (tags "REFILE"
 792                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Refile")
 793                          (org-tags-match-list-sublevels nil)))
 794                   (tags-todo "-CANCELLED/!"
 795                              ((org-agenda-overriding-header "Stuck Projects")
 796                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-stuck-projects)
 797                               (org-agenda-sorting-strategy
 798                                '(category-keep))))
 799                   (tags-todo "-HOLD-CANCELLED/!"
 800                              ((org-agenda-overriding-header "Projects")
 801                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-projects)
 802                               (org-tags-match-list-sublevels 'indented)
 803                               (org-agenda-sorting-strategy
 804                                '(category-keep))))
 805                   (tags-todo "-CANCELLED/!NEXT"
 806                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Next Tasks"
 807                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
 808                                                                         ""
 809                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
 810                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-projects-and-habits-and-single-tasks)
 811                               (org-tags-match-list-sublevels t)
 812                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 813                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 814                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 815                               (org-agenda-sorting-strategy
 816                                '(todo-state-down effort-up category-keep))))
 817                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
 818                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Subtasks"
 819                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
 820                                                                         ""
 821                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
 822                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-project-tasks)
 823                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 824                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 825                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 826                               (org-agenda-sorting-strategy
 827                                '(category-keep))))
 828                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
 829                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Standalone Tasks"
 830                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
 831                                                                         ""
 832                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
 833                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-project-tasks)
 834                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 835                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 836                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
 837                               (org-agenda-sorting-strategy
 838                                '(category-keep))))
 839                   (tags-todo "-CANCELLED+WAITING|HOLD/!"
 840                              ((org-agenda-overriding-header "Waiting and Postponed Tasks")
 841                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-stuck-projects)
 842                               (org-tags-match-list-sublevels nil)
 843                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled t)
 844                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines t)))
 845                   (tags "-REFILE/"
 846                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Archive")
 847                          (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-archivable-tasks)
 848                          (org-tags-match-list-sublevels nil))))
 849                  nil))))
 850
 851   ; org mode agenda files
 852   (setq org-agenda-files
 853         (quote ("~/projects/org-notes/debbugs.org"
 854             "~/projects/org-notes/notes.org"
 855             "~/projects/org-notes/holidays.org"
 856             "~/projects/org-notes/refile.org"
 857             "~/projects/org-notes/diary.org"
 858             "~/projects/org-notes/ool.org"
 859             "~/projects/org-notes/sndservers.org"
 860             "~/projects/org-notes/chaim.org"
 861             "~/projects/org-notes/wildman.org"
 862             "~/projects/org-notes/uddin.org"
 863             "~/projects/org-notes/reviews.org"
 864             "~/projects/org-notes/hpcbio.org"
 865             "~/org-mode/from-mobile.org"
 866             "~/projects/org-notes/fh.org")))
 867
 868   (set-register ?n (cons 'file "~/projects/org-notes/notes.org"))
 869   (set-register ?r (cons 'file "~/projects/org-notes/refile.org"))
 870   (set-register ?o (cons 'file "~/projects/org-notes/ool.org"))
 871   (set-register ?s (cons 'file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
 872   (set-register ?c (cons 'file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
 873   (set-register ?w (cons 'file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
 874   (set-register ?u (cons 'file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
 875   (set-register ?R (cons 'file "~/projects/reviews/reviews.org"))
 876   (set-register ?d (cons 'file "~/projects/org-notes/diary.org"))
 877   ; from https://emacs.stackexchange.com/questions/909/how-can-i-have-an-agenda-timeline-view-of-multiple-files
 878   (defun org-agenda-timeline-all (&optional arg)
 879     (interactive "P")
 880     (with-temp-buffer
 881       (dolist (org-agenda-file org-agenda-files)
 882         (insert-file-contents org-agenda-file nil)
 883         (end-of-buffer)
 884         (newline))
 885       (write-file "/tmp/timeline.org")
 886       (org-agenda arg "L")))
 887   (define-key org-mode-map (kbd "C-c t") 'org-agenda-timeline-all)
 888   ;; add automatic reminders for appointments
 889   (defadvice  org-agenda-redo (after org-agenda-redo-add-appts)
 890     "Pressing `r' on the agenda will also add appointments."
 891     (progn
 892       (setq appt-time-msg-list nil)
 893       (org-agenda-to-appt)))
 894
 895 #+END_SRC
 896 ** General config
 897 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 898   (setq org-global-properties '(("Effort_ALL 0 0:10 0:30 1:00 2:00 3:00 4:00 5:00 6:00 7:00")))
 899   (setq org-columns-default-format "%40ITEM(Task) %6Effort{:} %CLOCKSUM %PRIORITY %TODO %13SCHEDULED %13DEADLINE %TAGS")
 900
 901   (setq org-default-notes-file "~/projects/org-notes/notes.org")
 902   (setq org-id-link-to-org-use-id t)
 903 #+END_SRC
 904 ** Capture Templates
 905 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 906   (setq org-capture-templates  ;; mail-specific note template, identified by "m"
 907         '(("m" "Mail" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 908            "* %?\n\n  Source: %u, [[%:link][%:description]]\n  %:initial")
 909           ("t" "todo" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 910            "* TODO %?\n  :PROPERTIES:\n  :END:\n  :LOGBOOK:\n  :END:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 911           ("r" "respond" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 912            "* NEXT Respond to %:from on %:subject\nSCHEDULED: %t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t :immediate-finish t)
 913           ("n" "note" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 914            "* %? :NOTE:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 915           ("s" "schedule" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 916            "* %? :cal:\n%^{scheduled:}t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 917           ("j" "Journal" entry (file+datetree "~/projects/org-notes/diary.org")
 918            "* %?\n%U\n" :clock-in t :clock-resume t)
 919           ("w" "org-protocol" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 920            "* TODO Review %c\n%U\n" :immediate-finish t)
 921           ("M" "Meeting" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 922            "* MEETING with %? :MEETING:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 923           ("S" "Seminar" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 924            "* SEMINAR notes %? :SEMINAR:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 925           ("P" "Paper to read" entry (file+headline "~/projects/research/papers_to_read.org" "Refile")
 926            "* TODO Get/Read %? \n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 927           ("p" "Phone call" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 928            "* PHONE %? :PHONE:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
 929           ("J" "job" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 930            "* TODO Apply for %a%? :job:\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d 17:00-17:30>\")\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
 931           ("h" "Habit" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
 932            "* NEXT %?\n%U\n%a\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d .+1d/3d>\")\n:PROPERTIES:\n:STYLE: habit\n:REPEAT_TO_STATE: NEXT\n:END:\n%a\n")
 933           )
 934         )
 935
 936   ;; Remove empty LOGBOOK drawers on clock out
 937   (defun bh/remove-empty-drawer-on-clock-out ()
 938     (interactive)
 939     (save-excursion
 940       (beginning-of-line 0)
 941       (org-remove-empty-drawer-at (point))))
 942
 943   (defun my/org-add-id ()
 944     (interactive)
 945     (save-excursion
 946       (if (org-current-level)
 947           ()
 948         (forward-char 1)
 949         )
 950       (org-id-get-create)
 951       )
 952   )
 953
 954 #+END_SRC
 955 ** Org mode key bindings
 956 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 957   ; org mode configuration from http://doc.norang.ca/org-mode.html
 958   ;; Custom Key Bindings
 959   (global-set-key (kbd "<f12>") 'org-agenda)
 960   (global-set-key (kbd "<f5>") 'bh/org-todo)
 961   (global-set-key (kbd "<S-f5>") 'bh/widen)
 962   (global-set-key (kbd "<f7>") 'bh/set-truncate-lines)
 963   (global-set-key (kbd "<f8>") 'org-cycle-agenda-files)
 964   (global-set-key (kbd "<f9> <f9>") 'bh/show-org-agenda)
 965   (global-set-key (kbd "<f9> b") 'bbdb)
 966   (global-set-key (kbd "<f9> c") 'calendar)
 967   (global-set-key (kbd "<f9> f") 'boxquote-insert-file)
 968   (global-set-key (kbd "<f9> h") 'bh/hide-other)
 969   (global-set-key (kbd "<f9> n") 'bh/toggle-next-task-display)
 970   (global-set-key (kbd "<f9> w") 'widen)
 971
 972   ; change the outline mode prefix from C-c @ to C-c C-2
 973   (setq outline-minor-mode-prefix "C-c C-2")
 974   ;(add-hook 'outline-minor-mode-hook
 975   ;          (lambda () (local-set-key (kbd "C-c C-2")
 976   ;                                    outline-mode-prefix-map)))
 977
 978   (global-set-key (kbd "<f9> I") 'bh/punch-in)
 979   (global-set-key (kbd "<f9> O") 'bh/punch-out)
 980
 981   (global-set-key (kbd "<f9> o") 'bh/make-org-scratch)
 982
 983   (global-set-key (kbd "<f9> r") 'boxquote-region)
 984   (global-set-key (kbd "<f9> s") 'bh/switch-to-scratch)
 985
 986   (global-set-key (kbd "<f9> t") 'bh/insert-inactive-timestamp)
 987   (global-set-key (kbd "<f9> T") 'bh/toggle-insert-inactive-timestamp)
 988
 989   (global-set-key (kbd "<f9> v") 'visible-mode)
 990   (global-set-key (kbd "<f9> l") 'org-toggle-link-display)
 991   (global-set-key (kbd "<f9> SPC") 'bh/clock-in-last-task)
 992   (global-set-key (kbd "C-<f9>") 'previous-buffer)
 993   (global-set-key (kbd "M-<f9>") 'org-toggle-inline-images)
 994   (global-set-key (kbd "C-x n r") 'narrow-to-region)
 995   (global-set-key (kbd "C-<f10>") 'next-buffer)
 996   (global-set-key (kbd "<f11>") 'org-clock-goto)
 997   (global-set-key (kbd "C-<f11>") 'org-clock-in)
 998   (global-set-key (kbd "C-s-<f12>") 'bh/save-then-publish)
 999   (global-set-key (kbd "C-c c") 'org-capture)
1000
1001 #+END_SRC
1002 ** Utility Functions
1003 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1004   (defun bh/hide-other ()
1005     (interactive)
1006     (save-excursion
1007       (org-back-to-heading 'invisible-ok)
1008       (hide-other)
1009       (org-cycle)
1010       (org-cycle)
1011       (org-cycle)))
1012
1013   (defun bh/set-truncate-lines ()
1014     "Toggle value of truncate-lines and refresh window display."
1015     (interactive)
1016     (setq truncate-lines (not truncate-lines))
1017     ;; now refresh window display (an idiom from simple.el):
1018     (save-excursion
1019       (set-window-start (selected-window)
1020                         (window-start (selected-window)))))
1021
1022   (defun bh/make-org-scratch ()
1023     (interactive)
1024     (find-file "/tmp/publish/scratch.org")
1025     (gnus-make-directory "/tmp/publish"))
1026
1027   (defun bh/switch-to-scratch ()
1028     (interactive)
1029     (switch-to-buffer "*scratch*"))
1030
1031   (setq org-use-fast-todo-selection t)
1032   (setq org-treat-S-cursor-todo-selection-as-state-change nil)
1033
1034   ; create function to create headlines in file. This comes from
1035   ; http://stackoverflow.com/questions/13340616/assign-ids-to-every-entry-in-org-mode
1036   (defun my/org-add-ids-to-headlines-in-file ()
1037     "Add ID properties to all headlines in the current file which
1038   do not already have one."
1039     (interactive)
1040     (org-map-entries 'org-id-get-create))
1041   ; if we wanted to do this to every buffer, do the following:
1042   ; (add-hook 'org-mode-hook
1043   ;           (lambda ()
1044   ;             (add-hook 'before-save-hook 'my/org-add-ids-to-headlines-in-file nil 'local)))
1045 #+END_SRC
1046 ** Keywords (TODO)
1047 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1048   (setq org-todo-keywords
1049         (quote ((sequence "TODO(t)" "NEXT(n)" "|" "DONE(d)")
1050                 (sequence "WAITING(w@/!)" "HOLD(h@/!)" "|" "CANCELLED(c@/!)" "PHONE" "MEETING"))))
1051
1052   (setq org-todo-keyword-faces
1053         (quote (("TODO" :foreground "red" :weight bold)
1054                 ("NEXT" :foreground "blue" :weight bold)
1055                 ("DONE" :foreground "forest green" :weight bold)
1056                 ("WAITING" :foreground "orange" :weight bold)
1057                 ("HOLD" :foreground "magenta" :weight bold)
1058                 ("CANCELLED" :foreground "forest green" :weight bold)
1059                 ("MEETING" :foreground "forest green" :weight bold)
1060                 ("PHONE" :foreground "forest green" :weight bold))))
1061
1062   (setq org-todo-state-tags-triggers
1063         (quote (("CANCELLED" ("CANCELLED" . t))
1064                 ("WAITING" ("WAITING" . t))
1065                 ("HOLD" ("WAITING") ("HOLD" . t))
1066                 (done ("WAITING") ("HOLD"))
1067                 ("TODO" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1068                 ("NEXT" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1069                 ("DONE" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD")))))
1070
1071
1072
1073   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/remove-empty-drawer-on-clock-out 'append)
1074   ; add ids on creation of nodes
1075   (add-hook 'org-capture-prepare-finalize-hook 'my/org-add-id)
1076
1077
1078   ; resolve clocks after 10 minutes of idle; use xprintidle
1079   ; (setq org-clock-idle-time 10)
1080   ; (setq org-clock-x11idle-program-name "xprintidle")
1081
1082   ; this is from http://doc.norang.ca/org-mode.html#Capture
1083   ; use C-M-r for org mode capture
1084   (global-set-key (kbd "C-M-r") 'org-capture)
1085
1086   ; Targets include this file and any file contributing to the agenda - up to 9 levels deep
1087   (setq org-refile-targets (quote ((nil :maxlevel . 9)
1088                                    (org-agenda-files :maxlevel . 9))))
1089
1090   ; Use full outline paths for refile targets - we file directly with IDO
1091   (setq org-refile-use-outline-path t)
1092
1093   ; Targets complete directly with IDO
1094   (setq org-outline-path-complete-in-steps nil)
1095
1096   ; Allow refile to create parent tasks with confirmation
1097   (setq org-refile-allow-creating-parent-nodes (quote confirm))
1098
1099   ; ; Use IDO for both buffer and file completion and ido-everywhere to t
1100   ; (setq org-completion-use-ido t)
1101   ; (setq ido-everywhere t)
1102   ; (setq ido-max-directory-size 100000)
1103   ; (ido-mode (quote both))
1104   ; ; Use the current window when visiting files and buffers with ido
1105   ; (setq ido-default-file-method 'selected-window)
1106   ; (setq ido-default-buffer-method 'selected-window)
1107   ; ; Use the current window for indirect buffer display
1108   ; (setq org-indirect-buffer-display 'current-window)
1109
1110
1111   ;;;; Refile settings
1112   ; Exclude DONE state tasks from refile targets
1113   (defun bh/verify-refile-target ()
1114     "Exclude todo keywords with a done state from refile targets"
1115     (not (member (nth 2 (org-heading-components)) org-done-keywords)))
1116
1117   (setq org-refile-target-verify-function 'bh/verify-refile-target)
1118
1119   ;; ensure that emacsclient will show just the note to be edited when invoked
1120   ;; from Mutt, and that it will shut down emacsclient once finished;
1121   ;; fallback to legacy behavior when not invoked via org-protocol.
1122   (require 'org-protocol)
1123   ; (add-hook 'org-capture-mode-hook 'delete-other-windows)
1124   (setq my-org-protocol-flag nil)
1125   (defadvice org-capture-finalize (after delete-frame-at-end activate)
1126     "Delete frame at remember finalization"
1127     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1128            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1129   (defadvice org-capture-refile (around delete-frame-after-refile activate)
1130     "Delete frame at remember refile"
1131     (if my-org-protocol-flag
1132         (progn
1133           (setq my-org-protocol-flag nil)
1134           ad-do-it
1135           (delete-frame))
1136       ad-do-it)
1137     )
1138   (defadvice org-capture-kill (after delete-frame-at-end activate)
1139     "Delete frame at remember abort"
1140     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1141            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1142   (defadvice org-protocol-capture (before set-org-protocol-flag activate)
1143     (setq my-org-protocol-flag t))
1144
1145   (defadvice org-insert-todo-heading (after dla/create-id activate)
1146     (org-id-get-create)
1147     )
1148
1149   ;; org modules
1150   (add-to-list 'org-modules 'org-habit)
1151
1152   ; this comes from http://upsilon.cc/~zack/blog/posts/2010/02/integrating_Mutt_with_Org-mode/
1153   (defun open-mail-in-mutt (message)
1154     "Open a mail message in Mutt, using an external terminal.
1155
1156   Message can be specified either by a path pointing inside a
1157   Maildir, or by Message-ID."
1158     (interactive "MPath or Message-ID: ")
1159     (shell-command
1160      (format "faf xterm -e \"%s %s\""
1161          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/mutt_open") message)))
1162
1163   ;; add support for "mutt:ID" links
1164   (org-add-link-type "mutt" 'open-mail-in-mutt)
1165
1166   (defun my-org-mode-setup ()
1167     (load-library "reftex")
1168     (and (buffer-file-name)
1169          (file-exists-p (buffer-file-name))
1170          (progn
1171            (reftex-parse-all)
1172            (reftex-set-cite-format
1173             '((?b . "[[bib:%l][%l-bib]]")
1174               (?n . "[[notes:%l][%l-notes]]")
1175               (?c . "\\cite{%l}")
1176               (?h . "*** %t\n:PROPERTIES:\n:Custom_ID: %l\n:END:\n[[papers:%l][%l xoj]] [[papers-pdf:%l][pdf]]")))
1177            ))
1178     (define-key org-mode-map (kbd "C-c )") 'reftex-citation)
1179     (define-key org-mode-map (kbd "C-c [") 'reftex-citation)
1180     (define-key org-mode-map (kbd "C-c (") 'org-mode-reftex-search)
1181     (define-key org-mode-map (kbd "C-c 0") 'reftex-view-crossref)
1182     )
1183   (add-hook 'org-mode-hook 'my-org-mode-setup)
1184
1185   (defun org-mode-reftex-search ()
1186     (interactive)
1187     (org-open-link-from-string (format "[[notes:%s]]" (first (reftex-citation t)))))
1188
1189   (defun open-research-paper (bibtexkey)
1190     "Open a paper by bibtex key"
1191     (interactive "bibtex key: ")
1192     (shell-command
1193      (format "%s %s"
1194          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1195   (org-add-link-type "papers" 'open-research-paper)
1196   (defun open-research-paper-pdf (bibtexkey)
1197     "Open a paper pdf by bibtex key"
1198     (interactive "bibtex key: ")
1199     (shell-command
1200      (format "%s -p evince_annot %s"
1201          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1202   (org-add-link-type "papers-pdf" 'open-research-paper-pdf)
1203
1204   (add-to-list 'org-link-abbrev-alist
1205                '("notes" .
1206                  "~/projects/research/paper_notes.org::#%s"))
1207
1208   ; I pretty much always want hiearchical checkboxes
1209   (setq org-hierachical-checkbox-statistics nil)
1210
1211   ;; Add \begin{equation}\end{equation} templates to the org mode easy templates
1212   (add-to-list 'org-structure-template-alist
1213                '("E" "\\begin{equation}\n?\n\\end{equation}"))
1214
1215    ;; stolen from
1216   ;; http://www-public.it-sudparis.eu/~berger_o/weblog/2012/03/23/how-to-manage-and-export-bibliographic-notesrefs-in-org-mode/
1217   (defun my-rtcite-export-handler (path desc format)
1218     (message "my-rtcite-export-handler is called : path = %s, desc = %s, format = %s" path desc format)
1219     (let* ((search (when (string-match "::#?\\(.+\\)\\'" path)
1220                      (match-string 1 path)))
1221            (path (substring path 0 (match-beginning 0))))
1222       (cond ((eq format 'latex)
1223              (if (or (not desc)
1224                      (equal 0 (search "rtcite:" desc)))
1225                  (format "\\cite{%s}" search)
1226                (format "\\cite[%s]{%s}" desc search))))))
1227
1228   (org-add-link-type "rtcite"
1229                      'org-bibtex-open
1230                      'my-rtcite-export-handler)
1231
1232
1233 #+END_SRC
1234 ** Org Mobile Configuration
1235 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1236   (setq-default org-mobile-directory "/linnode.donarmstrong.com:/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/")
1237   (when (string= system-name "linnode")
1238     (setq-default org-mobile-directory "/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/"))
1239   (setq-default org-directory "/home/don/org-mode/")
1240   (setq-default org-mobile-inbox-for-pull "/home/don/org-mode/from-mobile.org")
1241
1242 #+END_SRC
1243 ** Org iCal Support
1244 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1245   ;; org mode ical export
1246   (setq org-icalendar-timezone "America/Los_Angeles")
1247   (setq org-icalendar-use-scheduled '(todo-start event-if-todo))
1248   ;; we already add the id manually
1249   ;; (setq org-icalendar-store-UID t)
1250
1251 #+END_SRC
1252 ** General Org Babel Configuration
1253 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1254   ;; org babel support
1255   (org-babel-do-load-languages
1256    'org-babel-load-languages
1257    '((emacs-lisp . t )
1258      (R . t)
1259      (latex . t)
1260      (ditaa . t)
1261      (dot . t)
1262      ))
1263   ;; use graphviz-dot for dot things
1264   (add-to-list 'org-src-lang-modes '("dot" . graphviz-dot))
1265   ;; org-babel-by-backend
1266   (defmacro org-babel-by-backend (&rest body)
1267      `(case (if (boundp 'backend)
1268                 (org-export-backend-name backend)
1269               nil) ,@body))
1270
1271   (defun my/fix-inline-images ()
1272     (when org-inline-image-overlays
1273       (org-redisplay-inline-images)))
1274
1275   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook
1276              'my/fix-inline-images)
1277
1278 #+END_SRC
1279 ** LaTeX configuration
1280    :PROPERTIES:
1281    :ID:       7135ba17-6a50-4eed-84ca-b90afa5b12f8
1282    :END:
1283 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1284   (require 'ox-latex)
1285   (add-to-list 'org-latex-classes
1286            '("memarticle"
1287          "\\documentclass[11pt,oneside,article]{memoir}\n"
1288          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1289          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1290          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1291          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1292          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1293
1294   (setq org-beamer-outline-frame-options "")
1295   (add-to-list 'org-latex-classes
1296            '("beamer"
1297          "\\documentclass[ignorenonframetext]{beamer}
1298   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1299   [PACKAGES]
1300   [EXTRA]"
1301          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1302          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1303          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1304          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1305          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1306
1307   (add-to-list 'org-latex-classes
1308            '("membook"
1309          "\\documentclass[11pt,oneside]{memoir}\n"
1310          ("\\chapter{%s}" . "\\chapter*{%s}")
1311          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1312          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1313          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")))
1314
1315   (add-to-list 'org-latex-classes
1316            '("letter"
1317          "\\documentclass[11pt]{letter}
1318   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1319   [PACKAGES]
1320   [EXTRA]"
1321      ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1322          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1323          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1324          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1325          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1326
1327   (add-to-list 'org-latex-classes
1328            '("dlacv"
1329          "\\documentclass{dlacv}
1330   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1331   [NO-PACKAGES]
1332   [NO-EXTRA]"
1333          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1334          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1335          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1336          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1337          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1338
1339
1340   (add-to-list 'org-latex-classes
1341            '("dlaresume"
1342          "\\documentclass{dlaresume}
1343   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1344   [NO-PACKAGES]
1345   [NO-EXTRA]"
1346          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1347          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1348          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1349          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1350          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1351
1352
1353   ;; Originally taken from Bruno Tavernier: http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/31150/focus=31432
1354   ;; but adapted to use latexmk 4.22 or higher.
1355   (setq org-latex-pdf-process '("latexmk -f -pdflatex=xelatex -bibtex -use-make -pdf %f"))
1356
1357   ;; Default packages included in /every/ tex file, latex, pdflatex or xelatex
1358   (setq org-latex-default-packages-alist
1359     '(("" "amsmath" t)
1360       ("" "unicode-math" t)
1361       ))
1362   (setq org-latex-packages-alist
1363     '(("" "graphicx" t)
1364       ("" "fontspec" t)
1365       ("" "xunicode" t)
1366       ("" "hyperref" t)
1367       ("" "url" t)
1368       ("" "rotating" t)
1369       ("" "longtable" nil)
1370       ("" "float" )))
1371
1372   ;; make equations larger
1373   (setq org-format-latex-options (plist-put org-format-latex-options :scale 2.0))
1374
1375   (defun org-create-formula--latex-header ()
1376     "Return LaTeX header appropriate for previewing a LaTeX snippet."
1377     (let ((info (org-combine-plists (org-export--get-global-options
1378              (org-export-get-backend 'latex))
1379             (org-export--get-inbuffer-options
1380              (org-export-get-backend 'latex)))))
1381       (org-latex-guess-babel-language
1382        (org-latex-guess-inputenc
1383     (org-splice-latex-header
1384      org-format-latex-header
1385      org-latex-default-packages-alist
1386      nil t
1387      (plist-get info :latex-header)))
1388        info)))
1389
1390
1391   ; support ignoring headers in org mode export to latex
1392   ; from http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/67692
1393   (defadvice org-latex-headline (around my-latex-skip-headlines
1394                     (headline contents info) activate)
1395     (if (member "ignoreheading" (org-element-property :tags headline))
1396     (setq ad-return-value contents)
1397       ad-do-it))
1398
1399   ;; keep latex logfiles
1400
1401   (setq org-latex-remove-logfiles nil)
1402
1403   ;; Resume clocking task when emacs is restarted
1404   (org-clock-persistence-insinuate)
1405   ;;
1406   ;; Show lot of clocking history so it's easy to pick items off the C-F11 list
1407   (setq org-clock-history-length 23)
1408   ;; Resume clocking task on clock-in if the clock is open
1409   (setq org-clock-in-resume t)
1410   ;; Change tasks to NEXT when clocking in; this avoids clocking in when
1411   ;; there are things like PHONE calls
1412   (setq org-clock-in-switch-to-state 'bh/clock-in-to-next)
1413   ;; Separate drawers for clocking and logs
1414   (setq org-drawers (quote ("PROPERTIES" "LOGBOOK")))
1415   ;; Save clock data and state changes and notes in the LOGBOOK drawer
1416   (setq org-clock-into-drawer t)
1417   (setq org-log-into-drawer t)
1418   ;; Sometimes I change tasks I'm clocking quickly - this removes clocked tasks with 0:00 duration
1419   (setq org-clock-out-remove-zero-time-clocks t)
1420   ;; Clock out when moving task to a done state
1421   (setq org-clock-out-when-done t)
1422   ;; Save the running clock and all clock history when exiting Emacs, load it on startup
1423   (setq org-clock-persist t)
1424   ;; Do not prompt to resume an active clock
1425   (setq org-clock-persist-query-resume nil)
1426   ;; Enable auto clock resolution for finding open clocks
1427   (setq org-clock-auto-clock-resolution (quote when-no-clock-is-running))
1428   ;; Include current clocking task in clock reports
1429   (setq org-clock-report-include-clocking-task t)
1430
1431   ;; the cache seems to be broken
1432   (setq org-element-use-cache nil)
1433
1434   (defvar bh/keep-clock-running nil)
1435
1436   (defun bh/is-task-p ()
1437     "Any task with a todo keyword and no subtask"
1438     (save-restriction
1439       (widen)
1440       (let ((has-subtask)
1441             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1442             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1443         (save-excursion
1444           (forward-line 1)
1445           (while (and (not has-subtask)
1446                       (< (point) subtree-end)
1447                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1448             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1449               (setq has-subtask t))))
1450         (and is-a-task (not has-subtask)))))
1451   (defun bh/is-project-p ()
1452     "Any task with a todo keyword subtask"
1453     (save-restriction
1454       (widen)
1455       (let ((has-subtask)
1456             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1457             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1458         (save-excursion
1459           (forward-line 1)
1460           (while (and (not has-subtask)
1461                       (< (point) subtree-end)
1462                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1463             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1464               (setq has-subtask t))))
1465         (and is-a-task has-subtask))))
1466
1467   (defun bh/is-subproject-p ()
1468     "Any task which is a subtask of another project"
1469     (let ((is-subproject)
1470           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1471       (save-excursion
1472         (while (and (not is-subproject) (org-up-heading-safe))
1473           (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1474             (setq is-subproject t))))
1475       (and is-a-task is-subproject)))
1476
1477
1478   (defun bh/clock-in-to-next (kw)
1479     "Switch a task from TODO to NEXT when clocking in.
1480   Skips capture tasks, projects, and subprojects.
1481   Switch projects and subprojects from NEXT back to TODO"
1482     (when (not (and (boundp 'org-capture-mode) org-capture-mode))
1483       (cond
1484        ((and (member (org-get-todo-state) (list "TODO"))
1485          (bh/is-task-p))
1486     "NEXT")
1487        ((and (member (org-get-todo-state) (list "NEXT"))
1488          (bh/is-project-p))
1489     "TODO"))))
1490
1491   (defun bh/punch-in (arg)
1492     "Start continuous clocking and set the default task to the
1493   selected task.  If no task is selected set the Organization task
1494   as the default task."
1495     (interactive "p")
1496     (setq bh/keep-clock-running t)
1497     (if (equal major-mode 'org-agenda-mode)
1498     ;;
1499     ;; We're in the agenda
1500     ;;
1501     (let* ((marker (org-get-at-bol 'org-hd-marker))
1502            (tags (org-with-point-at marker (org-get-tags-at))))
1503       (if (and (eq arg 4) tags)
1504           (org-agenda-clock-in '(16))
1505         (bh/clock-in-organization-task-as-default)))
1506       ;;
1507       ;; We are not in the agenda
1508       ;;
1509       (save-restriction
1510     (widen)
1511     ; Find the tags on the current task
1512     (if (and (equal major-mode 'org-mode) (not (org-before-first-heading-p)) (eq arg 4))
1513         (org-clock-in '(16))
1514       (bh/clock-in-organization-task-as-default)))))
1515
1516   (defun bh/punch-out ()
1517     (interactive)
1518     (setq bh/keep-clock-running nil)
1519     (when (org-clock-is-active)
1520       (org-clock-out))
1521     (org-agenda-remove-restriction-lock))
1522
1523   (defun bh/clock-in-default-task ()
1524     (save-excursion
1525       (org-with-point-at org-clock-default-task
1526     (org-clock-in))))
1527
1528   (defun bh/clock-in-parent-task ()
1529     "Move point to the parent (project) task if any and clock in"
1530     (let ((parent-task))
1531       (save-excursion
1532     (save-restriction
1533       (widen)
1534       (while (and (not parent-task) (org-up-heading-safe))
1535         (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1536           (setq parent-task (point))))
1537       (if parent-task
1538           (org-with-point-at parent-task
1539         (org-clock-in))
1540         (when bh/keep-clock-running
1541           (bh/clock-in-default-task)))))))
1542
1543   (defvar bh/organization-task-id "e22cb8bf-07c7-408b-8f60-ff3aadac95e4")
1544
1545   (defun bh/clock-in-organization-task-as-default ()
1546     (interactive)
1547     (org-with-point-at (org-id-find bh/organization-task-id 'marker)
1548       (org-clock-in '(16))))
1549
1550   (defun bh/clock-out-maybe ()
1551     (when (and bh/keep-clock-running
1552            (not org-clock-clocking-in)
1553            (marker-buffer org-clock-default-task)
1554            (not org-clock-resolving-clocks-due-to-idleness))
1555       (bh/clock-in-parent-task)))
1556
1557   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/clock-out-maybe 'append)
1558
1559   (require 'org-id)
1560   (defun bh/clock-in-task-by-id (id)
1561     "Clock in a task by id"
1562     (org-with-point-at (org-id-find id 'marker)
1563       (org-clock-in nil)))
1564
1565   (defun bh/clock-in-last-task (arg)
1566     "Clock in the interrupted task if there is one
1567   Skip the default task and get the next one.
1568   A prefix arg forces clock in of the default task."
1569     (interactive "p")
1570     (let ((clock-in-to-task
1571        (cond
1572         ((eq arg 4) org-clock-default-task)
1573         ((and (org-clock-is-active)
1574           (equal org-clock-default-task (cadr org-clock-history)))
1575          (caddr org-clock-history))
1576         ((org-clock-is-active) (cadr org-clock-history))
1577         ((equal org-clock-default-task (car org-clock-history)) (cadr org-clock-history))
1578         (t (car org-clock-history)))))
1579       (widen)
1580       (org-with-point-at clock-in-to-task
1581     (org-clock-in nil))))
1582
1583
1584   (defun org-export-to-ods ()
1585     (interactive)
1586     (let ((csv-file "data.csv"))
1587       (org-table-export csv-file "orgtbl-to-csv")
1588       (org-odt-convert csv-file "ods" 'open)))
1589
1590   ; allow for zero-width-space to be a break in regexp too
1591   ; (setcar org-emphasis-regexp-components " [:space:] \t('\"{")
1592   ; (setcar (nthcdr 1 org-emphasis-regexp-components) " [:space:]- \t.,:!?;'\")}\\")
1593   ; (org-set-emph-re 'org-emphasis-regexp-components org-emphasis-regexp-components)
1594
1595   ;; support inserting screen shots
1596   (defun my/org-insert-screenshot ()
1597     "Take a screenshot into a time stamped unique-named file in the
1598   same directory as the org-buffer and insert a link to this file."
1599     (interactive)
1600     (defvar my/org-insert-screenshot/filename)
1601     (setq my/org-insert-screenshot/filename
1602       (read-file-name
1603        "Screenshot to insert: "
1604        nil
1605        (concat (buffer-file-name) "_" (format-time-string "%Y%m%d_%H%M%S") ".png")
1606        )
1607       )
1608     (call-process "import" nil nil nil my/org-insert-screenshot/filename)
1609     (insert (concat "[[" my/org-insert-screenshot/filename "]]"))
1610     (org-display-inline-images))
1611
1612   (defun my/fix-inline-images ()
1613     (when org-inline-image-overlays
1614       (org-redisplay-inline-images)))
1615
1616   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook 'my/fix-inline-images)
1617
1618   ;; use xelatex to preview with imagemagick
1619   (add-to-list 'org-preview-latex-process-alist
1620            '(xelateximagemagick
1621         :programs ("xelatex" "convert")
1622         :description "pdf > png"
1623         :message "you need to install xelatex and imagemagick"
1624         :use-xcolor t
1625         :image-input-type "pdf"
1626         :image-output-type "png"
1627         :image-size-adjust (1.0 . 1.0)
1628         :latex-compiler ("xelatex -interaction nonstopmode -output-directory %o %f")
1629         :image-converter ("convert -density %D -trim -antialias %f -quality 100 %O"))
1630            )
1631   ;; use xelatex by default
1632   (setq org-preview-latex-default-process 'xelateximagemagick)
1633
1634   ; from http://orgmode.org/Changes.html
1635   (defun my/org-repair-property-drawers ()
1636     "Fix properties drawers in current buffer.
1637    Ignore non Org buffers."
1638     (interactive)
1639     (when (eq major-mode 'org-mode)
1640       (org-with-wide-buffer
1641        (goto-char (point-min))
1642        (let ((case-fold-search t)
1643          (inline-re (and (featurep 'org-inlinetask)
1644                  (concat (org-inlinetask-outline-regexp)
1645                      "END[ \t]*$"))))
1646      (org-map-entries
1647       (lambda ()
1648         (unless (and inline-re (org-looking-at-p inline-re))
1649           (save-excursion
1650         (let ((end (save-excursion (outline-next-heading) (point))))
1651           (forward-line)
1652           (when (org-looking-at-p org-planning-line-re) (forward-line))
1653           (when (and (< (point) end)
1654                  (not (org-looking-at-p org-property-drawer-re))
1655                  (save-excursion
1656                    (and (re-search-forward org-property-drawer-re end t)
1657                     (eq (org-element-type
1658                      (save-match-data (org-element-at-point)))
1659                     'drawer))))
1660             (insert (delete-and-extract-region
1661                  (match-beginning 0)
1662                  (min (1+ (match-end 0)) end)))
1663             (unless (bolp) (insert "\n"))))))))))))
1664
1665 #+END_SRC
1666 ** End use-package
1667 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1668   )
1669 #+END_SRC
1670 * Keybindings
1671 ** Override other things
1672 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1673   ; apparently things like to step on C-;, so we'll use a hack from
1674   ; http://stackoverflow.com/questions/683425/globally-override-key-binding-in-emacs/5340797#5340797 to fix this
1675
1676   (defvar my-keys-minor-mode-map (make-keymap) "my-keys-minor-mode keymap.")
1677
1678   ; use mc everywhere
1679   (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'mc/mark-all-dwim)
1680   ;; use outline mode keybindings everywhere
1681   ;; (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'my/mydra-outline/body)
1682
1683   (define-minor-mode my-keys-minor-mode
1684     "A minor mode so that my key settings override annoying major modes."
1685     t " my-keys" 'my-keys-minor-mode-map)
1686
1687   (my-keys-minor-mode 1)
1688   (defun my-minibuffer-setup-hook ()
1689     (my-keys-minor-mode 0))
1690
1691   (add-hook 'minibuffer-setup-hook 'my-minibuffer-setup-hook)
1692   (defadvice load (after give-my-keybindings-priority)
1693     "Try to ensure that my keybindings always have priority."
1694     (if (not (eq (car (car minor-mode-map-alist)) 'my-keys-minor-mode))
1695         (let ((mykeys (assq 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)))
1696           (assq-delete-all 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)
1697           (add-to-list 'minor-mode-map-alist mykeys))))
1698   (ad-activate 'load)
1699 #+END_SRC
1700 ** Goto line
1701 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1702   (global-unset-key "\M-g")
1703   (global-set-key (kbd "M-g l") 'goto-line)
1704 #+END_SRC
1705 * Misc (uncharacterized)
1706 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1707   (setq bibtex-user-optional-fields (quote (("annote" "Personal annotation (ignored)") ("abstract" "") ("pmid" "") ("doi" ""))))
1708   (setq calendar-latitude 40.11)
1709   (setq calendar-longitude -88.24)
1710   (setq case-fold-search t)
1711   (setq confirm-kill-emacs (quote y-or-n-p))
1712   (setq cperl-lazy-help-time nil)
1713   (setq debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
1714   (display-time)
1715   (setq display-time-24hr-format t)
1716   (setq display-time-day-and-date t)
1717   (display-time-mode 1)
1718   (setq font-latex-fontify-script nil)
1719   (setq font-latex-fontify-sectioning (quote color))
1720   (setq font-latex-script-display (quote (nil)))
1721   (global-auto-revert-mode 1)
1722   (global-font-lock-mode 1)
1723   (icomplete-mode 1)
1724   (setq log-edit-keep-buffer t)
1725   (setq mail-user-agent (quote sendmail-user-agent))
1726   (setq markdown-enable-math t)
1727   (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
1728   (setq mutt-alias-file-list (quote ("~/.mutt/aliases" "~/.mail_aliases")))
1729   (setq post-email-address "don@donarmstrong.com")
1730   (setq post-kill-quoted-sig nil)
1731   (setq post-mail-message "mutt\\(ng\\|\\)-[a-z0-9]+-[0-9]+-.*")
1732   (setq post-uses-fill-mode nil)
1733   (setq ps-footer-font-size (quote (8 . 10)))
1734   (setq ps-header-font-size (quote (8 . 10)))
1735   (setq ps-header-title-font-size (quote (10 . 10)))
1736   (setq ps-line-number-color "blue")
1737   (setq ps-print-footer t)
1738   (setq ps-print-footer-frame nil)
1739   (setq ps-print-only-one-header t)
1740   (setq sentence-end "[.?!][]\"')]*\\($\\|   \\| \\)[
1741   ]*")
1742   (setq sentence-end-double-space nil)
1743   ; enable matching parenthesis
1744   (show-paren-mode 1)
1745   (tool-bar-mode -1)
1746   (setq user-mail-address "don@donarmstrong.com")
1747   (setq vc-delete-logbuf-window nil)
1748   (setq vc-follow-symlinks t)
1749
1750   ;; use git before SVN; use CVS earlier, because I have CVS
1751   ;; repositories inside of git directories
1752   (setq vc-handled-backends (quote (CVS Git RCS SVN SCCS Bzr Hg Mtn Arch)))
1753
1754   ;; switch back to the old primary selection method
1755   (setq x-select-enable-clipboard nil)
1756   (setq x-select-enable-primary t)
1757   ; (setq mouse-drag-copy-region t)
1758
1759   (fset 'perl-mode 'cperl-mode)
1760   ;;(load-file "cperl-mode.el")
1761
1762   (require 'vcl-mode)
1763
1764   (require 'tex-site)
1765   ;;(require 'psvn)
1766   ;;(require 'ecasound)
1767   ;;(require 'emacs-wiki)
1768   (require 'bibtex)
1769   (require 'post)
1770   ;;(require 'fixme)
1771   ; (require 'google-weather)
1772   ; (require 'org-google-weather)
1773   ; (setq-default org-google-weather-format "%i %c, [%l,%h] %s %C")
1774
1775   (global-set-key "\C-xp" 'server-edit)
1776
1777   (setq-default auto-mode-alist (cons '("\.wml$" .
1778                     (lambda () (html-mode) (auto-fill-mode)))
1779                   auto-mode-alist))
1780
1781
1782   ; use markdown mode for mdwn files
1783   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.mdwn$" . markdown-mode))
1784   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.md$" . markdown-mode))
1785
1786
1787   ;; tramp configuration
1788   (setq tramp-use-ssh-controlmaster-options nil)
1789
1790   ; mail configuration
1791   (add-to-list 'auto-mode-alist '("muttng-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode))
1792   (add-to-list 'auto-mode-alist '("muttngrc" . muttrc-mode))
1793
1794   (add-to-list 'auto-mode-alist '("mutt-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode))
1795   (add-to-list 'auto-mode-alist '("muttrc" . muttrc-mode))
1796   (defun my-message-mode-settings ()
1797     (font-lock-add-keywords nil
1798                             '(("^[ \t]*>[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1799                                (0 'message-multiply-quoted-text-face))
1800                               ("^[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1801                                (0 'message-double-quoted-text-face))))
1802     (local-set-key (kbd "C-c C-a") 'my-post-attach-file)
1803     )
1804   (add-hook 'message-mode-hook 'my-message-mode-settings)
1805
1806   (defun my-post-attach-file ()
1807     "Prompt for an attachment."
1808     (interactive)
1809     (let ((file (read-file-name "Attach file: " nil nil t nil))
1810           (description (string-read "Description: ")))
1811       (my-header-attach-file file description)))
1812
1813   (symbol-function 'my-post-attach-file)
1814
1815   (defun my-header-attach-file (file description)
1816     "Attach a FILE to the current message (works with Mutt).
1817   Argument DESCRIPTION MIME description."
1818     (interactive "fAttach file: \nsDescription: ")
1819     (when (> (length file) 0)
1820       (save-excursion
1821         (save-match-data
1822           (save-restriction
1823             (widen)
1824             (goto-char (point-min))
1825             (search-forward-regexp "^$")
1826             (insert (concat "Attach: " (replace-regexp-in-string "\\([[:space:]\\]\\)" "\\\\\\1" (file-truename file)) " "
1827                             description "\n"))
1828             (message (concat "Attached '" file "'."))
1829             (setq post-has-attachment t))))))
1830
1831
1832
1833   (setq mail-yank-prefix "> ")
1834
1835   ;; self-insert-command hack.
1836   ;;   Without this, "if<SP>" expands to
1837   ;;   if ( -!-) {
1838   ;;   }
1839   ;;   which really should be,
1840   ;;   if (-!-) {
1841   ;;   }
1842
1843
1844
1845   ;(load-library "php-mode")
1846
1847   (setq-default c-indent-level 4)
1848   (setq-default c-brace-imaginary-offset 0)
1849   (setq-default c-brace-offset -4)
1850   (setq-default c-argdecl-indent 4)
1851   (setq-default c-label-offset -4)
1852   (setq-default c-continued-statement-offset 4)
1853   ; tabs are annoying
1854   (setq-default indent-tabs-mode nil)
1855   (setq-default tab-width 4)
1856
1857
1858   ;; (autoload 'php-mode "php-mode" "PHP editing mode" t)
1859   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php3?\\'" . php-mode))
1860   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.phtml?\\'" . php-mode))
1861   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php?\\'" . php-mode))
1862   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php4?\\'" . php-mode))
1863
1864
1865   (defun insert-date ()
1866     "Insert date at point."
1867     (interactive)
1868     (insert (format-time-string "%A, %B %e, %Y %k:%M:%S %Z")))
1869   (global-set-key "\C-[d" 'insert-date)
1870
1871   (defun unfill-paragraph (arg)
1872     "Pull this whole paragraph up onto one line."
1873     (interactive "*p")
1874     (let ((fill-column 10000))
1875       (fill-paragraph arg))
1876     )
1877
1878   (column-number-mode t)
1879
1880   (server-start)
1881
1882   ; (require 'mode-compile)
1883
1884   (defadvice server-process-filter (after post-mode-message first activate)
1885     "If the buffer is in post mode, overwrite the server-edit
1886       message with a post-save-current-buffer-and-exit message."
1887     (if (eq major-mode 'post-mode)
1888         (message
1889          (substitute-command-keys "Type \\[describe-mode] for help composing; \\[post-save-current-buffer-and-exit] when done."))))
1890                       ; This is also needed to see the magic message.  Set to a higher
1891                       ; number if you have a faster computer or read slower than me.
1892   '(font-lock-verbose 1000)
1893   ;(setq-default server-temp-file-regexp "mutt\(-\|ng-\)")
1894   ; (add-hook 'server-switch-hook
1895   ;     (function (lambda()
1896   ;             (cond ((string-match "Post" mode-name)
1897   ;                (post-goto-body)))
1898   ;             set-buffer-file-coding-system 'utf-8
1899   ;             )))
1900   ;
1901
1902   (add-hook 'post-mode-hook
1903         (auto-fill-mode nil)
1904         )
1905   ; abbrev mode settings
1906   ; load abbreviations from
1907   (setq abbrev-file-name
1908         "~/.emacs_abbrev_def")
1909
1910   ; read the abbrev file if it exists
1911   (if (file-exists-p abbrev-file-name)
1912       (quietly-read-abbrev-file))
1913
1914   ; for now, use abbrev mode everywhere
1915   (setq default-abbrev-mode t)
1916
1917
1918   (defun insert-function-documentation ()
1919     "Insert function documentation"
1920     (interactive)
1921     (insert-file-contents "/home/don/lib/templates/perl_function_documentation" nil))
1922   (global-set-key "\M-f" 'insert-function-documentation)
1923
1924   (eval-after-load "lilypond-mode"
1925     '(progn
1926        (load-library "lyqi-mode")
1927        (define-key LilyPond-mode-map "\C-cq" 'lyqi-mode)))
1928
1929   (autoload 'spamassassin-mode "spamassassin-mode" nil t)
1930
1931   (desktop-load-default)
1932   (desktop-read)
1933   '(icomplete-mode on)
1934   (custom-set-faces
1935    ;; custom-set-faces was added by Custom.
1936    ;; If you edit it by hand, you could mess it up, so be careful.
1937    ;; Your init file should contain only one such instance.
1938    ;; If there is more than one, they won't work right.
1939    '(menu ((((type x-toolkit)) (:background "black" :foreground "grey90")))))
1940
1941
1942   (put 'upcase-region 'disabled nil)
1943   (put 'downcase-region 'disabled nil)
1944   (put 'narrow-to-region 'disabled nil)
1945
1946   ; (defun turn-on-flyspell ()
1947   ;    "Force flyspell-mode on using a positive arg.  For use in hooks."
1948   ;    (interactive)
1949   ;    (flyspell-mode 1))
1950
1951
1952    ; Outline-minor-mode key map
1953    (define-prefix-command 'cm-map nil "Outline-")
1954    ; HIDE
1955    (define-key cm-map "q" 'hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
1956    (define-key cm-map "t" 'hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
1957    (define-key cm-map "o" 'hide-other)        ; Hide other branches
1958    (define-key cm-map "c" 'hide-entry)        ; Hide this entry's body
1959    (define-key cm-map "l" 'hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
1960    (define-key cm-map "d" 'hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
1961    ; SHOW
1962    (define-key cm-map "a" 'show-all)          ; Show (expand) everything
1963    (define-key cm-map "e" 'show-entry)        ; Show this heading's body
1964    (define-key cm-map "i" 'show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
1965    (define-key cm-map "k" 'show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
1966    (define-key cm-map "s" 'show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
1967    ; MOVE
1968    (define-key cm-map "u" 'outline-up-heading)                ; Up
1969    (define-key cm-map "n" 'outline-next-visible-heading)      ; Next
1970    (define-key cm-map "p" 'outline-previous-visible-heading)  ; Previous
1971    (define-key cm-map "f" 'outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
1972    (define-key cm-map "b" 'outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
1973    (global-set-key "\M-o" cm-map)
1974
1975
1976   ; debian stuff
1977   (setq-default debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
1978   (setq-default debian-changelog-full-name "Don Armstrong")
1979
1980   ; ediff configuration
1981   ; don't use the multi-window configuration
1982   (setq ediff-window-setup-function 'ediff-setup-windows-plain)
1983
1984   ; fix up css mode to not be silly
1985   ; from http://www.stokebloke.com/wordpress/2008/03/21/css-mode-indent-buffer-fix/
1986   (setq cssm-indent-level 4)
1987   (setq cssm-newline-before-closing-bracket t)
1988   (setq cssm-indent-function #'cssm-c-style-indenter)
1989   (setq cssm-mirror-mode nil)
1990
1991   (require 'multi-web-mode)
1992   (setq mweb-default-major-mode 'html-mode)
1993   (setq mweb-tags '((php-mode "<\\?php\\|<\\? \\|<\\?=" "\\?>")
1994                     (js-mode "<script +\\(type=\"text/javascript\"\\|language=\"javascript\"\\)[^>]*>" "</script>")
1995                     (css-mode "<style +type=\"text/css\"[^>]*>" "</style>")))
1996   (setq mweb-filename-extensions '("php" "htm" "html" "ctp" "phtml" "php4" "php5"))
1997   (multi-web-global-mode 1)
1998
1999   ;;; alias the new `flymake-report-status-slim' to
2000   ;;; `flymake-report-status'
2001   (defalias 'flymake-report-status 'flymake-report-status-slim)
2002   (defun flymake-report-status-slim (e-w &optional status)
2003     "Show \"slim\" flymake status in mode line."
2004     (when e-w
2005       (setq flymake-mode-line-e-w e-w))
2006     (when status
2007       (setq flymake-mode-line-status status))
2008     (let* ((mode-line " Φ"))
2009       (when (> (length flymake-mode-line-e-w) 0)
2010         (setq mode-line (concat mode-line ":" flymake-mode-line-e-w)))
2011       (setq mode-line (concat mode-line flymake-mode-line-status))
2012       (setq flymake-mode-line mode-line)
2013       (force-mode-line-update)))
2014
2015   ; load sql-indent when sql is loaded
2016   (eval-after-load "sql"
2017     '(load-library "sql-indent"))
2018
2019   ; fix up tmux xterm keys
2020   ; stolen from http://unix.stackexchange.com/questions/24414/shift-arrow-not-working-in-emacs-within-tmux
2021   (defun fix-up-tmux-keys ()
2022       "Fix up tmux xterm keys"
2023       (if (getenv "TMUX")
2024           (progn
2025             (let ((x 2) (tkey ""))
2026               (while (<= x 8)
2027                 ;; shift
2028                 (if (= x 2)
2029                     (setq tkey "S-"))
2030                 ;; alt
2031                 (if (= x 3)
2032                     (setq tkey "M-"))
2033                 ;; alt + shift
2034                 (if (= x 4)
2035                     (setq tkey "M-S-"))
2036                 ;; ctrl
2037                 (if (= x 5)
2038                     (setq tkey "C-"))
2039                 ;; ctrl + shift
2040                 (if (= x 6)
2041                     (setq tkey "C-S-"))
2042                 ;; ctrl + alt
2043                 (if (= x 7)
2044                     (setq tkey "C-M-"))
2045                 ;; ctrl + alt + shift
2046                 (if (= x 8)
2047                     (setq tkey "C-M-S-"))
2048
2049                 ;; arrows
2050                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d A" x)) (kbd (format "%s<up>" tkey)))
2051                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d B" x)) (kbd (format "%s<down>" tkey)))
2052                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d C" x)) (kbd (format "%s<right>" tkey)))
2053                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d D" x)) (kbd (format "%s<left>" tkey)))
2054                 ;; home
2055                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d H" x)) (kbd (format "%s<home>" tkey)))
2056                 ;; end
2057                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d F" x)) (kbd (format "%s<end>" tkey)))
2058                 ;; page up
2059                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 5 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<prior>" tkey)))
2060                 ;; page down
2061                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 6 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<next>" tkey)))
2062                 ;; insert
2063                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 2 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2064                 ;; delete
2065                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 3 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2066                 ;; f1
2067                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d P" x)) (kbd (format "%s<f1>" tkey)))
2068                 ;; f2
2069                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d Q" x)) (kbd (format "%s<f2>" tkey)))
2070                 ;; f3
2071                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d R" x)) (kbd (format "%s<f3>" tkey)))
2072                 ;; f4
2073                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d S" x)) (kbd (format "%s<f4>" tkey)))
2074                 ;; f5
2075                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 15 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f5>" tkey)))
2076                 ;; f6
2077                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 17 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f6>" tkey)))
2078                 ;; f7
2079                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 18 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f7>" tkey)))
2080                 ;; f8
2081                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 19 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f8>" tkey)))
2082                 ;; f9
2083                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 20 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f9>" tkey)))
2084                 ;; f10
2085                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 21 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f10>" tkey)))
2086                 ;; f11
2087                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 23 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f11>" tkey)))
2088                 ;; f12
2089                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 24 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f12>" tkey)))
2090                 ;; f13
2091                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 25 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f13>" tkey)))
2092                 ;; f14
2093                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 26 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f14>" tkey)))
2094                 ;; f15
2095                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 28 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f15>" tkey)))
2096                 ;; f16
2097                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 29 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f16>" tkey)))
2098                 ;; f17
2099                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 31 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f17>" tkey)))
2100                 ;; f18
2101                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 32 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f18>" tkey)))
2102                 ;; f19
2103                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 33 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f19>" tkey)))
2104                 ;; f20
2105                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 34 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f20>" tkey)))
2106
2107                 (setq x (+ x 1))
2108                 ))
2109             )
2110         )
2111       )
2112   ; (add-hook 'tty-setup-hook 'fix-up-tmux-keys)
2113
2114   ; procmailmode configuration
2115   (load "procmail_mode")
2116
2117   (load "mode-line-cleaner")
2118
2119   (defadvice ask-user-about-supersession-threat (around ask-user-about-supersession-threat-if-necessary)
2120     "Call ask-user-about-supersession-threat only if the buffer is actually obsolete."
2121     (if (or (buffer-modified-p)
2122             (verify-visited-file-modtime)
2123             (< (* 8 1024 1024) (buffer-size))
2124             (/= 0 (call-process-region 1 (+ 1 (buffer-size)) "diff" nil nil nil "-q" (buffer-file-name) "-")))
2125         ad-do-it
2126       (clear-visited-file-modtime)
2127       (not-modified)))
2128   (ad-activate 'ask-user-about-supersession-threat)
2129
2130   ; apparently things like to step on C-;, so we'll use a hack from
2131   ; http://stackoverflow.com/questions/683425/globally-override-key-binding-in-emacs/5340797#5340797 to fix this
2132
2133   (defvar my-keys-minor-mode-map (make-keymap) "my-keys-minor-mode keymap.")
2134
2135   ; use iedit everywhere
2136   (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'mc/mark-all-dwim)
2137
2138   (define-minor-mode my-keys-minor-mode
2139     "A minor mode so that my key settings override annoying major modes."
2140     t " my-keys" 'my-keys-minor-mode-map)
2141
2142   (my-keys-minor-mode 1)
2143   (defun my-minibuffer-setup-hook ()
2144     (my-keys-minor-mode 0))
2145
2146   (add-hook 'minibuffer-setup-hook 'my-minibuffer-setup-hook)
2147   (defadvice load (after give-my-keybindings-priority)
2148     "Try to ensure that my keybindings always have priority."
2149     (if (not (eq (car (car minor-mode-map-alist)) 'my-keys-minor-mode))
2150         (let ((mykeys (assq 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)))
2151           (assq-delete-all 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)
2152           (add-to-list 'minor-mode-map-alist mykeys))))
2153   (ad-activate 'load)
2154   (global-set-key "\M- " 'hippie-expand)
2155
2156 #+END_SRC
2157
2158 * END
2159 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2160   (provide 'don-configuration)
2161 #+END_SRC