emacs_el/configuration/don-configuration.org

   1 #+PROPERTY: header-args:emacs-lisp :tangle don-configuration.el
   2 * Load debugger
   3
   4 # if for some reason, things get pear-shaped, we want to be able to
   5 # enter the debugger by sending -USR2 to emacs
   6
   7 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
   8 (setq debug-on-event 'siguser2)
   9 #+END_SRC
  10 * Initial startup stuff
  11 ** Disable startup screen
  12 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  13   (setq inhibit-startup-screen t)
  14 #+END_SRC
  15 ** Disable cluter
  16 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  17   ; (if (fboundp 'menu-bar-mode) (menu-bar-mode -1))
  18   (if (fboundp 'tool-bar-mode) (tool-bar-mode -1))
  19   (if (fboundp 'scroll-bar-mode) (scroll-bar-mode -1))
  20 #+END_SRC
  21 ** Fullscreen
  22 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  23   (setq frame-resize-pixelwise t)
  24   (add-to-list 'default-frame-alist '(fullscreen . maximixed))
  25 #+END_SRC
  26 * Package management
  27 ** package repositories and package manager
  28 Borrowed from https://github.com/nilcons/emacs-use-package-fast/ to
  29 load  [[https://github.com/jwiegley/use-package/][use-package]] even faster
  30 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  31   (eval-and-compile
  32     ;; add /etc/ssl/ca-global/ca-certificates.crt so that we can
  33     ;; download packages when we're on Debian hosts which chop down the
  34     ;; list of available certificates
  35     (require 'gnutls)
  36     (add-to-list 'gnutls-trustfiles "/etc/ssl/ca-global/ca-certificates.crt")
  37     (setq package-enable-at-startup nil)
  38     (setq package--init-file-ensured t)
  39     (setq package-user-dir "~/var/emacs/elpa")
  40     (setq package-archives '(("gnu" . "https://elpa.gnu.org/packages/")
  41                              ("melpa" . "https://melpa.org/packages/")
  42                              ("org" . "http://orgmode.org/elpa/")))
  43     (setq use-package-verbose (not (bound-and-true-p byte-compile-current-file))))
  44   (mapc #'(lambda (add) (add-to-list 'load-path add))
  45     (eval-when-compile
  46       (package-initialize)
  47       (unless (package-installed-p 'use-package)
  48         (package-refresh-contents)
  49         (package-install 'use-package))
  50       (let ((package-user-dir-real (file-truename package-user-dir)))
  51         ;; The reverse is necessary, because outside we mapc
  52         ;; add-to-list element-by-element, which reverses.
  53         (nreverse (apply #'nconc
  54                  ;; Only keep package.el provided loadpaths.
  55                  (mapcar #'(lambda (path)
  56                      (if (string-prefix-p package-user-dir-real path)
  57                          (list path)
  58                        nil))
  59                      load-path))))))
  60
  61   ;;; fix up info paths for packages
  62   (with-eval-after-load "info"
  63     (info-initialize)
  64     (dolist (dir (directory-files package-user-dir))
  65       (let ((fdir (concat (file-name-as-directory package-user-dir) dir)))
  66         (unless (or (member dir '("." ".." "archives" "gnupg"))
  67                     (not (file-directory-p fdir))
  68                     (not (file-exists-p (concat (file-name-as-directory fdir) "dir"))))
  69           (add-to-list 'Info-directory-list fdir)))))
  70
  71
  72   (eval-when-compile
  73     (require 'use-package))
  74   (require 'bind-key)
  75   (require 'diminish)
  76 #+END_SRC
  77 ** Paradox
  78 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  79   (use-package paradox
  80     :ensure paradox
  81     :commands (paradox-upgrade-packages paradox-list-packages)
  82     :config
  83     (setq paradox-execute-asynchronously t)
  84     (setq paradox-github-token t) ; I don't want to be prompted about this integration
  85     )
  86 #+END_SRC
  87 * Paths
  88 ** Update PATH
  89 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  90   (add-to-list 'exec-path '"/usr/local/bin")
  91   (add-to-list 'exec-path '"~/bin/")
  92 #+END_SRC
  93 ** Add library paths
  94
  95 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  96   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/")
  97   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/magit-annex")
  98 #+END_SRC
  99 * Disable custom-vars
 100 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 101   ;; Set the custom file to /dev/null and don't bother to load it
 102   (setq custom-file "/dev/null")
 103 #+END_SRC
 104 * Misc functions
 105 ** with-library
 106 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 107 ;; From http://www.emacswiki.org/emacs/LoadingLispFiles
 108 ;; execute conditional code when loading libraries
 109 (defmacro with-library (symbol &rest body)
 110   `(when (require ,symbol nil t)
 111      ,@body))
 112 (put 'with-library 'lisp-indent-function 1)
 113 #+END_SRC
 114
 115 * Variables
 116 ** Safe Local Variables
 117 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 118 (setq safe-local-variable-values
 119       (quote ((auto-save-default)
 120               (make-backup-files)
 121               (cperl-indent-level . 4)
 122               (indent-level . 4)
 123               (indent-tabs-mode . f)
 124               (vcl-indent-level . 4)
 125               )))
 126 #+END_SRC
 127 * Memory
 128 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 129   (setq global-mark-ring-max 128
 130         mark-ring-max 128
 131         kill-ring-max 128)
 132
 133   (defun don/minibuffer-setup-hook ()
 134     (setq gc-cons-threshold most-positive-fixnum))
 135
 136   (defun don/minibuffer-exit-hook ()
 137     (setq gc-cons-threshold 1048576))
 138
 139   (add-hook 'minibuffer-setup-hook #'don/minibuffer-setup-hook)
 140   (add-hook 'minibuffer-exit-hook #'don/minibuffer-exit-hook)
 141 #+END_SRC
 142 * Modules
 143 ** Spacemacs theme
 144 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 145 (use-package spacemacs-common
 146   :ensure spacemacs-theme
 147   :config
 148   (load-theme 'spacemacs-dark t)
 149   )
 150 #+END_SRC
 151 ** Hippie Expand
 152 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 153   (use-package hippie-exp
 154     :bind* (("M-<SPC>" . hippie-expand))
 155     )
 156 #+END_SRC
 157 ** Flyspell 🐝
 158 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 159   (use-package flyspell
 160     :ensure t
 161     :diminish flyspell-mode 🐝
 162     :config
 163     (add-hook 'text-mode-hook 'turn-on-flyspell)
 164     (add-hook 'c-mode-common-hook 'flyspell-prog-mode)
 165     (add-hook 'cperl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 166     (add-hook 'tcl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 167     :init
 168     (setq ispell-program-name "ispell")
 169     )
 170
 171 #+END_SRC
 172 ** Flymake
 173 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
 174   (use-package flymake
 175     :diminish "Φ")
 176 #+end_src
 177
 178 ** Winnermode
 179 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 180   (winner-mode 1)
 181 #+END_SRC
 182 ** Eyebrowse
 183
 184 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 185   (use-package eyebrowse
 186     :ensure t
 187     :diminish eyebrowse-mode
 188     :init (setq eyebrowse-keymap-prefix (kbd "C-c e"))
 189     :config (progn
 190               (setq eyebrowse-wrap-around t)
 191               (eyebrowse-mode t)
 192
 193               (defun my/eyebrowse-new-window-config ()
 194                 (interactive)
 195                 (let ((done nil))
 196                   (dotimes (i 10)
 197                     ;; start at 1 run till 0
 198                     (let ((j (mod (+ i 1) 10)))
 199                       (when (and (not done)
 200                                  (not (eyebrowse--window-config-present-p j)))
 201                         (eyebrowse-switch-to-window-config j)
 202                         (call-interactively 'eyebrowse-rename-window-config2 j)
 203                         (setq done t)
 204                         ))
 205                     )))
 206
 207               ;; I don't use latex-preview-pane
 208               ;; (require 'latex-preview-pane)
 209               ;; (defun my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch ()
 210               ;;   ;; latex-preview-pane uses window-parameters which are
 211               ;;   ;; not preserved by eyebrowse, so we close the preview
 212               ;;   ;; pane before switching, it will be regenerated when we
 213               ;;   ;; edit the TeX file.
 214               ;;   (when (lpp/window-containing-preview)
 215               ;;     (delete-window (lpp/window-containing-preview))))
 216
 217               ;; (add-to-list 'eyebrowse-pre-window-switch-hook
 218               ;;              #'my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch)
 219
 220               ;; (my/set-menu-key "["  #'my/eyebrowse-new-window-config)
 221               ;; (my/set-menu-key ";"  #'eyebrowse-prev-window-config)
 222               ;; (my/set-menu-key "'"  #'eyebrowse-next-window-config)
 223               ;; (my/set-menu-key "]"  #'eyebrowse-close-window-config)
 224               ;; (my/set-menu-key "\\" #'eyebrowse-rename-window-config)
 225               )
 226     )
 227 #+END_SRC
 228
 229 ** Window handling
 230
 231 *** Splitting
 232 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 233   (defun my/vsplit-last-buffer ()
 234     "Split the window vertically and display the previous buffer."
 235     (interactive)
 236     (split-window-vertically)
 237     (other-window 1 nil)
 238     (switch-to-next-buffer))
 239
 240   (defun my/hsplit-last-buffer ()
 241     "Split the window horizontally and display the previous buffer."
 242     (interactive)
 243     (split-window-horizontally)
 244     (other-window 1 nil)
 245     (switch-to-next-buffer))
 246
 247   (bind-key "C-x 2" 'my/vsplit-last-buffer)
 248   (bind-key "C-x 3" 'my/hsplit-last-buffer)
 249
 250   (setq split-width-threshold  100)
 251   (setq split-height-threshold 60)
 252
 253   (defun my/split-window-prefer-vertically (window)
 254     "If there's only one window (excluding any possibly active
 255            minibuffer), then split the current window horizontally."
 256     (if (and (one-window-p t)
 257              (not (active-minibuffer-window))
 258              ( < (frame-width) (frame-height))
 259              )
 260         (let ((split-width-threshold nil))
 261           (split-window-sensibly window))
 262       (split-window-sensibly window)))
 263
 264   (setq split-window-preferred-function #'my/split-window-prefer-vertically)
 265   (setq window-combination-resize t)
 266 #+END_SRC
 267
 268 *** Compilation window
 269
 270 If there is no compilation window, open one at the bottom, spanning
 271 the complete width of the frame. Otherwise, reuse existing window. In
 272 the former case, if there was no error the window closes
 273 automatically.
 274
 275 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 276   (add-to-list 'display-buffer-alist
 277                `(,(rx bos "*compilation*" eos)
 278                  (display-buffer-reuse-window
 279                   display-buffer-in-side-window)
 280                  (reusable-frames . visible)
 281                  (side            . bottom)
 282                  (window-height   . 0.4)))
 283 #+END_SRC
 284
 285 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 286   (defun my/compilation-exit-autoclose (status code msg)
 287     ;; If M-x compile exists with a 0
 288     (when (and (eq status 'exit) (zerop code))
 289       ;; and delete the *compilation* window
 290       (let ((compilation-window (get-buffer-window (get-buffer "*compilation*"))))
 291         (when (and (not (window-at-side-p compilation-window 'top))
 292                    (window-at-side-p compilation-window 'left)
 293                    (window-at-side-p compilation-window 'right))
 294           (delete-window compilation-window))))
 295     ;; Always return the anticipated result of compilation-exit-message-function
 296     (cons msg code))
 297
 298   ;; Specify my function (maybe I should have done a lambda function)
 299   (setq compilation-exit-message-function #'my/compilation-exit-autoclose)
 300 #+END_SRC
 301
 302 If you change the variable ~compilation-scroll-output~ to a ~non-nil~
 303 value, the compilation buffer scrolls automatically to follow the
 304 output. If the value is ~first-error~, scrolling stops when the first
 305 error appears, leaving point at that error. For any other non-nil
 306 value, scrolling continues until there is no more output.
 307
 308 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 309   (setq compilation-scroll-output 'first-error)
 310 #+END_SRC
 311
 312 ** Mode line cleaning
 313 *** Diminish
 314 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 315   (use-package diminish
 316     :ensure t)
 317 #+END_SRC
 318
 319 *** Delight
 320 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 321   (use-package delight
 322     :ensure t)
 323 #+END_SRC
 324
 325 ** Jumping
 326 *** Avy
 327 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 328   (use-package avy
 329     :if (>= emacs-major-version 25)
 330     :ensure t
 331     :bind (("C-c C-<SPC>" . avy-goto-word-or-subword-1)
 332            ("C-c j j" . avy-goto-word-or-subword-1)
 333            ("M-g g" . avy-goto-line))
 334     :config (progn (setq avy-background t))
 335     )
 336 #+END_SRC
 337 *** Ace-link (jumping to links)
 338 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 339   (use-package ace-link
 340     :ensure t
 341     ; bind o in most modes
 342     :config (ace-link-setup-default))
 343 #+END_SRC
 344 *** Jumping through edit points (goto-chg)
 345 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 346   (use-package goto-chg
 347     :ensure t
 348     :bind (("C-c j ," . goto-last-change)
 349            ("C-c j ." . goto-last-change-reverse))
 350     )
 351 #+END_SRC
 352 *** Jumping to bookmarks (visible bookmarks, bm)
 353 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 354   (use-package bm
 355     :ensure t
 356     :bind (("C-c j b ." . bm-next)
 357            ("C-c j b ," . bm-previous)
 358            ("C-c j b SPC" . bm-toggle)))
 359 #+END_SRC
 360
 361 ** Snippets
 362 *** Yasnippet
 363 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 364 (use-package yasnippet
 365   :ensure t
 366   :diminish yas-minor-mode
 367   :config (progn
 368             (yas-global-mode)
 369             (setq yas-verbosity 1)
 370             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<tab>") nil)
 371             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "TAB") nil)
 372             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<backtab>") nil)
 373             (setq yas-snippet-dirs '("~/lib/emacs_el/snippets/"
 374                                      "~/lib/emacs_el/yasnippet-snippets/snippets/"))
 375             (add-to-list 'hippie-expand-try-functions-list
 376                              'yas-hippie-try-expand)
 377             (yas-reload-all)
 378             )
 379   )
 380 #+END_SRC
 381 *** Auto-YASnippet
 382 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 383   (use-package auto-yasnippet
 384     :ensure t
 385     :bind (("H-w" . aya-create)
 386            ("H-y" . aya-expand)
 387            )
 388     )
 389 #+END_SRC
 390 ** Company
 391 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 392 (use-package company
 393   :ensure t
 394   :bind (("M-/" . company-complete))
 395   :config
 396   (setq company-echo-delay 0     ; remove blinking
 397         company-show-numbers t   ; show numbers for easy selection
 398         company-selection-wrap-around t
 399         company-require-match nil
 400         company-dabbrev-ignore-case t
 401         company-dabbrev-ignore-invisible t
 402         company-dabbrev-other-buffers t
 403         company-dabbrev-downcase nil
 404         company-dabbrev-code-everywhere t
 405         company-tooltip-align-annotations t
 406         company-minimum-prefix-length 1
 407         company-global-modes '(not)
 408         company-lighter-base "(C)")
 409   (global-company-mode 1)
 410   :bind (:map company-active-map
 411               ("C-n" . company-select-next)
 412               ("C-p" . company-select-previous)
 413               ("M-?" . company-show-doc-buffer)
 414               ("M-." . company-show-location)
 415               )
 416   )
 417 #+END_SRC
 418 *** C/C++
 419 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 420   (use-package company-c-headers
 421     :ensure t
 422     :config (progn
 423               (defun malb/ede-object-system-include-path ()
 424                 "Return the system include path for the current buffer."
 425                 (when ede-object
 426                   (ede-system-include-path ede-object)))
 427
 428               (setq company-c-headers-path-system
 429                     #'malb/ede-object-system-include-path)
 430
 431               (add-to-list 'company-backends #'company-c-headers)))
 432 #+END_SRC
 433 *** Python
 434 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 435 (use-package company-anaconda
 436   :ensure t
 437   :config (add-to-list 'company-backends #'company-anaconda))
 438 #+END_SRC
 439 *** Perl
 440 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 441   (use-package company-plsense
 442     :ensure t
 443     )
 444 #+END_SRC
 445 *** LaTeX
 446 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 447   (use-package company-math
 448     :ensure t)
 449 #+END_SRC
 450 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 451   (use-package company-auctex
 452     :ensure t
 453     :config (progn
 454               (defun company-auctex-labels (command &optional arg &rest ignored)
 455                 "company-auctex-labels backend"
 456                 (interactive (list 'interactive))
 457                 (case command
 458                   (interactive (company-begin-backend 'company-auctex-labels))
 459                   (prefix (company-auctex-prefix "\\\\.*ref{\\([^}]*\\)\\="))
 460                   (candidates (company-auctex-label-candidates arg))))
 461
 462               (add-to-list 'company-backends
 463                            '(company-auctex-macros
 464                              company-auctex-environments
 465                              company-math-symbols-unicode
 466                              company-math-symbols-latex))
 467
 468               (add-to-list 'company-backends #'company-auctex-labels)
 469               (add-to-list 'company-backends #'company-auctex-bibs)
 470               )
 471     )
 472 #+END_SRC
 473 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 474   (use-package company-bibtex
 475     :ensure t
 476     )
 477 #+END_SRC
 478 *** Shell
 479
 480  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 481    (use-package company-shell
 482      :ensure t
 483      :config (progn
 484                (setq company-shell-modes '(sh-mode shell-mode))
 485                (add-to-list 'company-backends 'company-shell)))
 486  #+END_SRC
 487
 488 *** YaSnippet
 489
 490  Add YasSippet support for all company backends. ([[https://github.com/syl20bnr/spacemacs/pull/179][source]])
 491
 492  *Note:* Do this at the end of =company-mode= config.
 493
 494  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 495    (defvar malb/company-mode/enable-yas t
 496      "Enable yasnippet for all backends.")
 497
 498    (defun malb/company-mode/backend-with-yas (backend)
 499      (if (or (not malb/company-mode/enable-yas)
 500              (and (listp backend)
 501                   (member 'company-yasnippet backend)))
 502          backend
 503        (append (if (consp backend) backend (list backend))
 504                '(:with company-yasnippet))))
 505
 506    (setq company-backends
 507          (mapcar #'malb/company-mode/backend-with-yas company-backends))
 508  #+END_SRC
 509
 510 *** All the words
 511
 512  Enable/disable company completion from ispell dictionaries ([[https://github.com/redguardtoo/emacs.d/blob/master/lisp/init-company.el][source]])
 513
 514  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 515    (defun malb/toggle-company-ispell ()
 516      (interactive)
 517      (cond
 518       ((member '(company-ispell :with company-yasnippet) company-backends)
 519        (setq company-backends (delete '(company-ispell :with company-yasnippet) company-backends))
 520        (add-to-list 'company-backends '(company-dabbrev :with company-yasnippet) t)
 521        (message "company-ispell disabled"))
 522       (t
 523        (setq company-backends (delete '(company-dabbrev :with company-yasnippet) company-backends))
 524        (add-to-list 'company-backends '(company-ispell :with company-yasnippet) t)
 525        (message "company-ispell enabled!"))))
 526
 527    (defun malb/company-ispell-setup ()
 528      ;; @see https://github.com/company-mode/company-mode/issues/50
 529      (when (boundp 'company-backends)
 530        (make-local-variable 'company-backends)
 531        (setq company-backends (delete '(company-dabbrev :with company-yasnippet) company-backends))
 532        (add-to-list 'company-backends '(company-ispell :with company-yasnippet) t)
 533        ;; https://github.com/redguardtoo/emacs.d/issues/473
 534        (if (and (boundp 'ispell-alternate-dictionary)
 535                 ispell-alternate-dictionary)
 536            (setq company-ispell-dictionary ispell-alternate-dictionary))))
 537  #+END_SRC
 538
 539 *** Tab DWIM
 540
 541  1. =yas-expand= is run first and does what it has to, then it calls =malb/indent-fold-or-complete=.
 542
 543  2. This function then hopefully does what I want:
 544
 545     a. if a region is active, just indent
 546     b. if we’re looking at a space after a non-whitespace character, we try some company-expansion
 547     c. If =hs-minor-mode= or =outline-minor-mode= is active, try those next
 548     d. otherwise call whatever would have been called otherwise.
 549
 550  ([[http://emacs.stackexchange.com/q/21182/8930][source]], [[http://emacs.stackexchange.com/q/7908/8930][source]])
 551
 552 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 553 (defun malb/indent-fold-or-complete (&optional arg)
 554   (interactive "P")
 555   (cond
 556    ;; if a region is active, indent
 557    ((use-region-p)
 558     (indent-region (region-beginning)
 559                    (region-end)))
 560    ;; if the next char is space or eol, but prev char not whitespace
 561    ((and (not (active-minibuffer-window))
 562          (or (looking-at " ")
 563              (looking-at "$"))
 564          (looking-back "[^[:space:]]")
 565          (not (looking-back "^")))
 566
 567     (cond (company-mode (company-complete-common))
 568           (auto-complete-mode (auto-complete))))
 569
 570    ;; no whitespace anywhere
 571    ((and (not (active-minibuffer-window))
 572          (looking-at "[^[:space:]]")
 573          (looking-back "[^[:space:]]")
 574          (not (looking-back "^")))
 575     (cond
 576      ((bound-and-true-p hs-minor-mode)
 577       (save-excursion (end-of-line) (hs-toggle-hiding)))
 578      ((bound-and-true-p outline-minor-mode)
 579       (save-excursion (outline-cycle)))))
 580
 581    ;; by default just call whatever was bound
 582    (t
 583     (let ((fn (or (if (current-local-map) (lookup-key (current-local-map) (kbd "TAB")))
 584                   'indent-for-tab-command)))
 585       (if (not (called-interactively-p 'any))
 586           (fn arg)
 587         (setq this-command fn)
 588         (call-interactively fn))))))
 589
 590 (defun malb/toggle-fold ()
 591   (interactive)
 592   (cond ((eq major-mode 'org-mode)
 593          (org-force-cycle-archived))
 594         ((bound-and-true-p hs-minor-mode)
 595          (save-excursion
 596            (end-of-line)
 597            (hs-toggle-hiding)))
 598
 599         ((bound-and-true-p outline-minor-mode)
 600          (save-excursion
 601            (outline-cycle)))))
 602
 603 (bind-key "<tab>" #'malb/indent-fold-or-complete)
 604 (bind-key "C-<tab>" #'malb/toggle-fold)
 605 #+END_SRC
 606 ** Tinyprocmail
 607
 608 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 609   ;; load tinyprocmail
 610   (use-package tinyprocmail
 611     :load-path "~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/tiny"
 612     :mode (".procmailrc" . turn-on-tinyprocmail-mode)
 613     )
 614 #+END_SRC
 615
 616 ** Magit
 617 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
 618   (use-package magit
 619     :ensure t
 620     :bind (("C-x g" . magit-status)
 621            ("C-x C-g" . magit-status))
 622     :config
 623     ;; refine diffs always (hilight words)
 624     (setq magit-diff-refine-hunk nil)
 625     )
 626   (use-package magit-annex
 627     :ensure t
 628     :load-path "~/lib/emacs_el/magit-annex/"
 629     )
 630   (use-package magit-vcsh
 631     :ensure t
 632     )
 633 #+END_SRC
 634
 635 ** Perl
 636 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 637   (use-package cperl-mode
 638     :config
 639     (progn
 640       ;; Use c-mode for perl .xs files
 641       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.xs\\'" . c-mode))
 642       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\([pP][Llm]\\|al\\)\\'" . cperl-mode))
 643       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl" . cperl-mode))
 644       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl5" . cperl-mode))
 645       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("miniperl" . cperl-mode))
 646       (setq cperl-hairy t
 647             cperl-indent-level 4
 648             cperl-auto-newline nil
 649             cperl-auto-newline-after-colon nil
 650             cperl-continued-statement-offset 4
 651             cperl-brace-offset -1
 652             cperl-continued-brace-offset 0
 653             cperl-label-offset -4
 654             cperl-highlight-variables-indiscriminately t
 655             cperl-electric-lbrace-space nil
 656             cperl-indent-parens-as-block nil
 657             cperl-close-paren-offset -1
 658             cperl-tab-always-indent t)
 659       ;;(add-hook 'cperl-mode-hook (lambda () (cperl-set-style "PerlStyle")))
 660   ))
 661 #+END_SRC
 662
 663 ** Markdown mode
 664 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 665   (use-package markdown-mode
 666     :ensure t
 667     :mode (("\\.md\\'" . markdown-mode)
 668            ("\\.mdwn\\'" . markdown-mode)
 669            ("README\\.md\\'" . gfm-mode)
 670            )
 671     :config
 672     (setq markdown-enable-math t)
 673     (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
 674     (bind-key "M-." #'markdown-jump markdown-mode-map)
 675     (add-hook 'markdown-mode-hook #'flyspell-mode)
 676     (add-hook 'markdown-mode-hook #'outline-minor-mode)
 677     (bind-key "C-<tab>" #'outline-cycle markdown-mode-map)
 678   )
 679
 680 #+END_SRC
 681 ** SQL mode
 682 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 683   ; load sql-indent when sql is loaded
 684 (use-package sql
 685   :mode (("\\.sql\\'" . sql-mode))
 686   :config
 687   (require sql-indent))
 688 #+END_SRC
 689 ** Ediff
 690 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 691   (use-package ediff
 692     :commands ediff ediff3
 693     :ensure f
 694     :config
 695     ;; ediff configuration
 696     ;; don't use the multi-window configuration
 697     (setq ediff-window-setup-function 'ediff-setup-windows-plain)
 698   )
 699 #+END_SRC
 700 ** Do the Right Thing Indenting
 701 Attempts to automatically identify the right indentation for a file
 702 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 703 (use-package dtrt-indent
 704   :ensure t
 705 )
 706 #+END_SRC
 707 ** VCL --editing varnish configuration files
 708 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 709   (use-package vcl-mode
 710     :ensure t
 711     :mode "\\.vcl\\'"
 712     )
 713
 714 #+END_SRC
 715 ** Helm
 716 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 717   (defun malb/helm-omni (&rest arg)
 718     ;; just in case someone decides to pass an argument, helm-omni won't fail.
 719     (interactive)
 720     (unless helm-source-buffers-list
 721       (setq helm-source-buffers-list
 722             (helm-make-source "Buffers" 'helm-source-buffers)))
 723     (helm-other-buffer
 724      (append
 725
 726      (if (projectile-project-p)
 727           '(helm-source-projectile-buffers-list
 728             helm-source-buffers-list)
 729         '(helm-source-buffers-list)) ;; list of all open buffers
 730
 731       `(((name . "Virtual Workspace")
 732          (candidates . ,(--map (cons (eyebrowse-format-slot it) (car it))
 733                                (eyebrowse--get 'window-configs)))
 734          (action . (lambda (candidate)
 735                      (eyebrowse-switch-to-window-config candidate)))))
 736
 737       (if (projectile-project-p)
 738           '(helm-source-projectile-recentf-list
 739             helm-source-recentf)
 740         '(helm-source-recentf)) ;; all recent files
 741
 742       ;; always make some common files easily accessible
 743       ;;'(((name . "Common Files")
 744        ;;  (candidates . malb/common-file-targets)
 745         ;; (action . (("Open" . (lambda (x) (find-file (eval x))))))))
 746
 747       '(helm-source-files-in-current-dir
 748         helm-source-locate
 749         helm-source-bookmarks
 750         helm-source-buffer-not-found ;; ask to create a buffer otherwise
 751         ))
 752      "*Helm all the things*"))
 753   (use-package helm
 754     :ensure helm
 755     :diminish helm-mode
 756     :bind (("M-x" . helm-M-x)
 757            ("C-x C-f" . helm-find-files)
 758            ("C-x b" . helm-buffers-list) ; malb/helm-omni)
 759            ("C-x C-b" . helm-buffers-list) ; malb/helm-omni)
 760            ("C-c <SPC>" . helm-all-mark-rings))
 761     :config
 762     (require 'helm-config)
 763     (require 'helm-for-files)
 764     (require 'helm-bookmark)
 765
 766     (helm-mode 1)
 767     (define-key global-map [remap find-file] 'helm-find-files)
 768     (define-key global-map [remap occur] 'helm-occur)
 769     (define-key global-map [remap list-buffers] 'helm-buffers-list)
 770     (define-key global-map [remap dabbrev-expand] 'helm-dabbrev)
 771     (unless (boundp 'completion-in-region-function)
 772       (define-key lisp-interaction-mode-map [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point)
 773       (define-key emacs-lisp-mode-map       [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point))
 774     (add-hook 'kill-emacs-hook #'(lambda () (and (file-exists-p "$TMP") (delete-file "$TMP"))))
 775   )
 776 #+END_SRC
 777 *** Helm Flx
 778
 779  [[https://github.com/PythonNut/helm-flx][helm-flx]] implements intelligent helm fuzzy sorting, provided by [[https://github.com/lewang/flx][flx]].
 780
 781  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 782  (use-package helm-flx
 783    :ensure t
 784    :config (progn
 785              ;; these are helm configs, but they kind of fit here nicely
 786              (setq helm-M-x-fuzzy-match                  t
 787                    helm-bookmark-show-location           t
 788                    helm-buffers-fuzzy-matching           t
 789                    helm-completion-in-region-fuzzy-match t
 790                    helm-file-cache-fuzzy-match           t
 791                    helm-imenu-fuzzy-match                t
 792                    helm-mode-fuzzy-match                 t
 793                    helm-locate-fuzzy-match               nil
 794                    helm-quick-update                     t
 795                    helm-recentf-fuzzy-match              nil
 796                    helm-semantic-fuzzy-match             t)
 797              (helm-flx-mode +1)))
 798  #+END_SRC
 799 *** Helm Swoop
 800 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 801
 802   ;;; stolen from https://github.com/malb/emacs.d/blob/master/malb.org
 803   (defun malb/helm-swoop-pre-fill ()
 804     (thing-at-point 'symbol))
 805     (defvar malb/helm-swoop-ignore-major-mode "List of major modes to ignore for helm-swoop")
 806     (setq malb/helm-swoop-ignore-major-mode '(dired-mode
 807           paradox-menu-mode doc-view-mode pdf-view-mode
 808           mu4e-headers-mode org-mode markdown-mode latex-mode
 809           ein:notebook-multilang-mode))
 810
 811     (defun malb/swoop-or-search ()
 812       (interactive)
 813       (if (or (> (buffer-size) 1048576) ;; helm-swoop can be slow on big buffers
 814               (memq major-mode malb/helm-swoop-ignore-major-mode))
 815           (isearch-forward)
 816         (helm-swoop)))
 817
 818     (use-package helm-swoop
 819       :ensure t
 820       :commands helm-swoop
 821       :bind (("C-c o" . helm-multi-swoop-org)
 822              ("C-s" . malb/swoop-or-search)
 823              ("C-M-s" . helm-multi-swoop-all))
 824       :config (progn
 825
 826                 (setq helm-swoop-pre-input-function  #'malb/helm-swoop-pre-fill
 827                       helm-swoop-split-with-multiple-windows nil
 828                       helm-swoop-split-direction #'split-window-horizontally
 829                       helm-swoop-split-window-function 'helm-default-display-buffer
 830                       helm-swoop-speed-or-color t)
 831
 832                 ;; https://emacs.stackexchange.com/questions/28790/helm-swoop-how-to-make-it-behave-more-like-isearch
 833                 (defun malb/helm-swoop-C-s ()
 834                   (interactive)
 835                   (if (boundp 'helm-swoop-pattern)
 836                       (if (equal helm-swoop-pattern "")
 837                           (previous-history-element 1)
 838                         (helm-next-line))
 839                     (helm-next-line)))
 840
 841                 (bind-key "C-S-s" #'helm-swoop-from-isearch isearch-mode-map)
 842                 (bind-key "C-S-s" #'helm-multi-swoop-all-from-helm-swoop helm-swoop-map)
 843                 (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-swoop-map)
 844                 (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-swoop-map)
 845                 (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-multi-swoop-map)
 846                 (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-multi-swoop-map))
 847       )
 848
 849 #+END_SRC
 850 *** Helm Ag
 851 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 852 (use-package helm-ag
 853   :ensure t
 854   :config (setq helm-ag-base-command "ag --nocolor --nogroup"
 855                 helm-ag-command-option "--all-text"
 856                 helm-ag-insert-at-point 'symbol
 857                 helm-ag-fuzzy-match t
 858                 helm-ag-use-temp-buffer t
 859                 helm-ag-use-grep-ignore-list t
 860                 helm-ag-use-agignore t))
 861 #+END_SRC
 862 *** Helm Descbinds
 863 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 864   (use-package helm-descbinds
 865     :ensure t
 866     :bind ("C-h b" . helm-descbinds)
 867     :init (fset 'describe-bindings 'helm-descbinds))
 868 #+END_SRC
 869
 870 *** Helm YaSnippet
 871 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 872   (use-package helm-c-yasnippet
 873     :ensure t
 874     :bind ("C-c h y" .  helm-yas-complete)
 875     :config (progn
 876               (setq helm-yas-space-match-any-greedy t)))
 877 #+END_SRC
 878 *** Helm Org Rifle
 879 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 880   (use-package helm-org-rifle
 881     :ensure t
 882     :config (progn
 883               (defun malb/helm-org-rifle-agenda-files (arg)
 884                 (interactive "p")
 885                 (let ((current-prefix-arg nil))
 886                   (cond
 887                    ((equal arg 4) (call-interactively #'helm-org-rifle-agenda-files nil))
 888                    ((equal arg 16) (helm-org-rifle-occur-agenda-files))
 889                    (t (helm-org-agenda-files-headings)))))))
 890 #+END_SRC
 891 *** Helm Google
 892 This can be used to link things pretty quickly if necessary
 893 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 894   (use-package helm-google
 895     :ensure t
 896     :bind ("C-c h g" . helm-google)
 897     :config
 898     (progn (add-to-list 'helm-google-actions
 899                         '("Copy URL" . (lambda (candidate)
 900                                          (let ((url
 901                                                 (replace-regexp-in-string
 902                                                  "https://.*q=\\(.*\\)\&sa=.*"
 903                                                  "\\1" candidate)))
 904                                            (kill-new url))))
 905                         t
 906                         )
 907
 908            (add-to-list 'helm-google-actions
 909                         '("Org Store Link" . (lambda (candidate)
 910                                                (let ((title (car (split-string candidate "[\n]+")))
 911                                                      (url
 912                                                       (replace-regexp-in-string
 913                                                        "https://.*q=\\(.*\\)\&sa=.*"
 914                                                        "\\1" candidate)))
 915                                                  (push (list url title) org-stored-links))))
 916                         t)
 917            ))
 918 #+END_SRC
 919
 920 ** Projectile -- Project management
 921 #+begin_src emacs-lisp
 922   (use-package projectile
 923     :ensure t
 924     :bind (("<f5>" . projectile-compile-project)
 925            ("<f6>" . next-error))
 926     :config (progn
 927               (use-package magit :ensure t)
 928               (require 'helm-projectile)
 929               (helm-projectile-on)
 930
 931               (setq projectile-make-test-cmd "make check"
 932                     projectile-switch-project-action 'helm-projectile
 933                     projectile-mode-line  '(:eval (format "»{%s}" (projectile-project-name))))
 934
 935               (projectile-global-mode)))
 936 #+end_src
 937
 938 *** helm integration
 939 #+begin_src emacs-lisp
 940   (use-package helm-projectile
 941     :ensure t
 942     :config (progn
 943               (defvar malb/helm-source-file-not-found
 944                 (helm-build-dummy-source
 945                     "Create file"
 946                   :action 'find-file))
 947
 948               (add-to-list
 949                'helm-projectile-sources-list
 950                malb/helm-source-file-not-found t)
 951
 952               (helm-delete-action-from-source
 953                "Grep in projects `C-s'"
 954                helm-source-projectile-projects)
 955
 956               (helm-add-action-to-source
 957                "Grep in projects `C-s'"
 958                'helm-do-ag helm-source-projectile-projects 4)))
 959 #+end_src
 960 ** Zap to char
 961 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 962   (use-package avy-zap
 963     :ensure t
 964     :bind ("M-z" . avy-zap-up-to-char-dwim))
 965 #+END_SRC
 966 ** Hydra
 967 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 968   (use-package hydra
 969     :bind (("C-c 2" . my/hydra-orgmodes/body)
 970            ("C-c @" . my/hydra-orgmodes/body)
 971            ("C-c #" . my/hydra-outline/body)
 972            ("C-c 3" . my/hydra-outline/body)
 973            )
 974     :config
 975     (defhydra my/hydra-orgmodes (:color blue :hint nil)
 976     "
 977   _n_: notes _c_: chaim _w_: wildman _o_: ool
 978   _u_: uddin _s_: steve _r_: refile  _f_: fh
 979   _p_: read papers      _R_: paper notes
 980   _h_: hpcbio
 981   _q_: quit
 982   _z_: quit
 983   "
 984     ("n" (find-file "~/projects/org-notes/notes.org"))
 985     ("c" (find-file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
 986     ("w" (find-file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
 987     ("u" (find-file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
 988     ("o" (find-file "~/projects/org-notes/ool.org"))
 989     ("f" (find-file "~/projects/org-notes/fh.org"))
 990     ("s" (find-file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
 991     ("r" (find-file my/org-refile-file))
 992     ("p" (find-file "~/projects/research/papers_to_read.org"))
 993     ("R" (find-file "~/projects/research/paper_notes.org"))
 994     ("h" (find-file "~/projects/org-notes/hpcbio.org"))
 995     ("q" nil "quit")
 996     ("z" nil "quit")
 997     )
 998
 999     ;; from https://github.com/abo-abo/hydra/wiki/Emacs
1000     (defhydra my/hydra-outline (:color pink :hint nil)
1001     "
1002   ^Hide^             ^Show^           ^Move
1003   ^^^^^^------------------------------------------------------
1004   _q_: sublevels     _a_: all         _u_: up
1005   _t_: body          _e_: entry       _n_: next visible
1006   _o_: other         _i_: children    _p_: previous visible
1007   _c_: entry         _k_: branches    _f_: forward same level
1008   _l_: leaves        _s_: subtree     _b_: backward same level
1009   _d_: subtree
1010
1011   "
1012     ;; Hide
1013     ("q" outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
1014     ("t" outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
1015     ("o" outline-hide-other)        ; Hide other branches
1016     ("c" outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
1017     ("l" outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
1018     ("d" outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
1019     ;; Show
1020     ("a" outline-show-all)          ; Show (expand) everything
1021     ("e" outline-show-entry)        ; Show this heading's body
1022     ("i" outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
1023     ("k" outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
1024     ("s" outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
1025     ;; Move
1026     ("u" outline-up-heading)                ; Up
1027     ("n" outline-next-visible-heading)      ; Next
1028     ("p" outline-previous-visible-heading)  ; Previous
1029     ("f" outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
1030     ("b" outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
1031     ("z" nil "leave"))
1032   )
1033 #+END_SRC
1034
1035 ** Tramp
1036 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1037   (use-package tramp
1038     :config
1039     (add-to-list 'tramp-methods '("vcsh"
1040                                   (tramp-login-program "vcsh")
1041                                   (tramp-login-args
1042                                    (("enter")
1043                                     ("%h")))
1044                                   (tramp-remote-shell "/bin/sh")
1045                                   (tramp-remote-shell-args
1046                                    ("-c")))))
1047 #+END_SRC
1048 ** Reftex
1049 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1050   (use-package reftex
1051     :ensure t
1052     :config
1053     (setq-default reftex-default-bibliography
1054                     '("~/projects/research/references.bib")))
1055 #+END_SRC
1056 ** BibTex
1057 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1058   (use-package bibtex
1059     :config (setq bibtex-user-optional-fields
1060                   (quote (("annote" "Personal annotation (ignored)")
1061                           ("abstract" "")
1062                   ("pmid" "")
1063                   ("doi" ""))))
1064     )
1065
1066 #+END_SRC
1067 ** LaTeX
1068 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1069 (use-package tex
1070   :defer t
1071   :ensure auctex
1072   :config
1073   ; (add-to-list 'TeX-style-path '"/home/don/lib/emacs_el/auctex/style")
1074   ;; REFTEX (much enhanced management of cross-ref, labels, etc)
1075   ;; http://www.strw.leidenuniv.nl/~dominik/Tools/reftex/
1076   ; (autoload 'reftex-mode     "reftex" "RefTeX Minor Mode" t)
1077   ; (autoload 'turn-on-reftex  "reftex" "RefTeX Minor Mode" nil)
1078   ; (autoload 'reftex-citation "reftex-cite" "Make citation" nil)
1079   ; (autoload 'reftex-index-phrase-mode "reftex-index" "Phrase mode" t)
1080   (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with AUCTeX LaTeX mode
1081   (add-hook 'latex-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with Emacs latex mode
1082   (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with AUCTeX LaTeX mode
1083   (add-hook 'latex-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with Emacs latex mode
1084
1085   (setq-default reftex-plug-into-AUCTeX t)
1086   ;; support fake section headers
1087   (setq TeX-outline-extra
1088         '(("%chapter" 1)
1089           ("%section" 2)
1090           ("%subsection" 3)
1091           ("%subsubsection" 4)
1092           ("%paragraph" 5)))
1093   ;; add font locking to the headers
1094   (font-lock-add-keywords
1095    'latex-mode
1096    '(("^%\\(chapter\\|\\(sub\\|subsub\\)?section\\|paragraph\\)"
1097       0 'font-lock-keyword-face t)
1098      ("^%chapter{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-1-face t)
1099      ("^%section{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-2-face t)
1100      ("^%subsection{\\(.*\\)}"    1 'font-latex-sectioning-3-face t)
1101      ("^%subsubsection{\\(.*\\)}" 1 'font-latex-sectioning-4-face t)
1102      ("^%paragraph{\\(.*\\)}"     1 'font-latex-sectioning-5-face t)))
1103
1104   ;; use smart quotes by default instead of `` and ''
1105   ;; taken from http://kieranhealy.org/esk/kjhealy.html
1106   (setq TeX-open-quote "“")
1107   (setq TeX-close-quote "”")
1108
1109   ;; (TeX-add-style-hook
1110   ;;  "latex"
1111   ;;  (lambda ()
1112   ;;    (TeX-add-symbols
1113   ;;     '("DLA" 1))))
1114   ;; (custom-set-variables
1115   ;;  '(font-latex-user-keyword-classes
1116   ;;    '(("fixme"
1117   ;;       ("DLA" "RZ")
1118   ;;       font-lock-function-name-face 2 (command 1 t))))
1119   ;; )
1120   (setq-default TeX-parse-self t)
1121   (setq-default TeX-auto-save t)
1122   (setq-default TeX-master nil)
1123   (add-to-list 'LaTeX-font-list
1124                '(?\C-a "\\alert{","}"))
1125   (eval-after-load
1126       "latex"
1127     '(TeX-add-style-hook
1128       "cleveref"
1129       (lambda ()
1130         (if (boundp 'reftex-ref-style-alist)
1131             (add-to-list
1132              'reftex-ref-style-alist
1133              '("Cleveref" "cleveref"
1134                (("\\cref" ?c) ("\\Cref" ?C) ("\\cpageref" ?d) ("\\Cpageref" ?D)))))
1135         (reftex-ref-style-activate "Cleveref")
1136         (TeX-add-symbols
1137          '("cref" TeX-arg-ref)
1138          '("Cref" TeX-arg-ref)
1139          '("cpageref" TeX-arg-ref)
1140          '("Cpageref" TeX-arg-ref)))))
1141   (eval-after-load
1142       "latex"
1143     '(add-to-list 'LaTeX-fill-excluded-macros
1144                   '("Sexpr")))
1145
1146   (use-package font-latex
1147     :config
1148     (setq font-latex-match-reference-keywords
1149           '(
1150             ("fref" "{")
1151             ("Fref" "{")
1152             ("citep" "{")
1153             ("citet" "{")
1154             ("acs" "{")
1155             ("acsp" "{")
1156             ("ac" "{")
1157             ("acp" "{")
1158             ("acl" "{")
1159             ("aclp" "{")
1160             ("acsu" "{")
1161             ("aclu" "{")
1162             ("acused" "{")
1163             ("DLA" "{")
1164             ("RZ" "{")
1165             ("OM" "{")
1166             ("DL" "{")
1167             ("fixme" "{"))
1168           )
1169     )
1170   (setq font-latex-fontify-script nil)
1171   (setq font-latex-fontify-sectioning (quote color))
1172   (setq font-latex-script-display (quote (nil)))
1173 )
1174
1175 #+END_SRC
1176 ** ESS
1177 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1178   (use-package ess
1179     :ensure t
1180     :commands R
1181     :mode ("\\.R\\'" . ess-r-mode)
1182     :bind (:map ess-mode-map
1183                 ("C-c C-R" . dla/ess-region-remote-eval))
1184     :init
1185     (autoload 'ess-r-mode "ess-site" nil t)
1186     (autoload 'R "ess-site" nil t)
1187     :config
1188     ; actually load the rest of ess
1189     (require 'ess-site)
1190     (defun ess-change-directory (path)
1191       "Set the current working directory to PATH for both *R* and Emacs."
1192       (interactive "Directory to change to: ")
1193
1194       (when (file-exists-p path)
1195         (ess-command (concat "setwd(\"" path "\")\n"))
1196         ;; use file-name-as-directory to ensure it has trailing /
1197         (setq default-directory (file-name-as-directory path))))
1198     (add-hook 'ess-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
1199     ;; outlining support for ess modes
1200     (add-hook
1201      'ess-mode-hook
1202      '(lambda ()
1203         (outline-minor-mode)
1204         (setq outline-regexp "\\(^#\\{4,5\\} \\)\\|\\(^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function\\)")
1205         (defun outline-level ()
1206           (cond ((looking-at "^##### ") 1)
1207                 ((looking-at "^#### ") 2)
1208                 ((looking-at "^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function(.*{") 3)
1209                 (t 1000)))
1210         ))
1211     (defun dla/ess-region-remote-eval (start end)
1212       "Evaluate region in a remote ESS instance"
1213       (interactive "r")
1214       (shell-command-on-region start end "eval_r" (get-buffer-create "***essregionremoteeval***") nil nil nil)
1215       (kill-buffer "***essregionremoteeval***"))
1216     ;; Don't restore history or save workspace image
1217     '(inferior-R-args "--no-restore-history --no-save")
1218     )
1219 #+END_SRC
1220
1221 ** Rainbowmode
1222 From http://julien.danjou.info/projects/emacs-packages#rainbow-mode, this colorizes color strings
1223
1224 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1225   (use-package rainbow-mode
1226     ;; add ess to the x major mode
1227     :config (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[S])
1228     (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[R])
1229   )
1230 #+END_SRC
1231
1232 ** YAML Mode
1233 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1234   (use-package yaml-mode
1235     ;; add ess to the x major mode
1236     :mode ("\\.\\(yaml|yml\\)\\'" . yaml-mode)
1237   )
1238 #+END_SRC
1239
1240 ** Polymode
1241 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1242 (use-package poly-noweb
1243   :ensure t
1244   :after polymode
1245
1246   )
1247 (use-package poly-markdown
1248   :ensure t
1249   :after polymode
1250   )
1251 (use-package poly-R
1252   :ensure t
1253   :after (:all polymode poly-markdown poly-noweb)
1254   ; :mode ("\\.Snw" . poly-noweb+r-mode)
1255   ; :mode ("\\.Rnw" . poly-noweb+r-mode)
1256   ; :mode ("\\.Rmd" . poly-markdown+r-mode)
1257   )
1258 (use-package polymode
1259   :ensure t
1260   )
1261
1262 #+END_SRC
1263
1264 ** Outlining
1265 *** Outline magic
1266 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1267   (use-package outline-magic)
1268 #+END_SRC
1269 *** Outline mode
1270 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1271 ;; change the outline mode prefix from C-c @ to C-c C-2
1272 (setq outline-minor-mode-prefix "C-c C-2")
1273 ;;(add-hook 'outline-minor-mode-hook
1274 ;;          (lambda () (local-set-key (kbd "C-c C-2")
1275 ;;                                    outline-mode-prefix-map)))
1276
1277 #+END_SRC
1278 ** Writeroom Mode
1279 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1280   (use-package writeroom-mode
1281     :config
1282     (defun my/writing-mode ()
1283       "Start my writing mode; enable visual-line-mode and auto-fill-mode"
1284       (interactive)
1285       (if writeroom-mode
1286           (progn
1287             (writeroom-mode -1)
1288             (visual-line-mode -1)
1289             (auto-fill-mode -1)
1290             (visual-fill-column-mode -1)
1291             )
1292         (visual-line-mode 1)
1293         (auto-fill-mode 1)
1294         (visual-fill-column-mode 1)
1295         (writeroom-mode 1))
1296       )
1297     )
1298 #+END_SRC
1299 ** GhostText/Atomic Chrome
1300 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1301   (use-package atomic-chrome
1302     :config
1303     (ignore-errors (atomic-chrome-start-server))
1304     (setq atomic-chrome-buffer-open-style 'full)
1305     )
1306 #+END_SRC
1307 ** Edit Server
1308 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1309   (use-package edit-server
1310     :ensure t
1311     :commands edit-server-start
1312     :init (if after-init-time
1313               (edit-server-start)
1314             (add-hook 'after-init-hook
1315                       #'(lambda() (edit-server-start))))
1316     :config (setq edit-server-new-frame-alist
1317                   '((name . "Edit with Emacs FRAME")
1318                     (top . 200)
1319                     (left . 200)
1320                     (width . 80)
1321                     (height . 25)
1322                     (minibuffer . t)
1323                     (menu-bar-lines . t)
1324                     (window-system . x)))
1325     )
1326 #+END_SRC
1327 ** Multiple Cursors
1328    :PROPERTIES:
1329    :ID:       6fcf218b-a762-4c37-9339-a8202ddeb544
1330    :END:
1331 [[https://github.com/magnars/multiple-cursors.el][Multiple Cursors]]
1332 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1333   (use-package multiple-cursors
1334     :bind* (("C-;" . mc/mark-all-dwim)
1335             ("C-<" . mc/mark-previous-like-this)
1336             ("C->" . mc/mark-next-like-this)
1337             ("C-S-c C-S-c" . mc/edit-lines))
1338     )
1339 #+END_SRC
1340 ** Web Mode
1341 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1342   (use-package web-mode
1343     :load-path "/home/don/projects/web-mode/"
1344     :mode ("\\.\\(tx|tmpl\\)\\'" . web-mode)
1345     :config
1346     (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.tmpl\\'" . web-mode))
1347     (setq web-mode-enable-engine-detection t)
1348     (setq web-mode-engines-alist
1349           '(("template-toolkit" . "\\.tmpl\\'")))
1350     )
1351 #+END_SRC
1352 ** Spamassassin Mode
1353 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1354   (use-package spamassassin-mode
1355     :commands spamassassin-mode
1356     :ensure f
1357     )
1358 #+END_SRC
1359 ** Password Store
1360 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1361   (use-package password-store
1362     :ensure f
1363     :commands password-store-edit password-store-generate
1364     )
1365 #+END_SRC
1366 ** CSS mode
1367 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1368   (use-package css
1369     :mode "\\.css'"
1370     :config
1371     ;; fix up css mode to not be silly
1372     ;; from http://www.stokebloke.com/wordpress/2008/03/21/css-mode-indent-buffer-fix/
1373     (setq cssm-indent-level 4)
1374     (setq cssm-newline-before-closing-bracket t)
1375     (setq cssm-indent-function #'cssm-c-style-indenter)
1376     (setq cssm-mirror-mode nil))
1377 #+END_SRC
1378 ** Abbrev Mode
1379 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1380   (use-package abbrev
1381     :diminish abbrev-mode
1382     :config
1383     ;; load abbreviations from
1384     (setq abbrev-file-name
1385           "~/.emacs_abbrev_def")
1386
1387     ;; read the abbrev file if it exists
1388     (if (file-exists-p abbrev-file-name)
1389         (quietly-read-abbrev-file))
1390
1391     ;; for now, use abbrev mode everywhere
1392     (setq default-abbrev-mode t))
1393 #+END_SRC
1394
1395 ** Python Programming
1396 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1397   (use-package elpy
1398     :ensure t
1399     :init
1400     (elpy-enable)
1401     )
1402 #+END_SRC
1403 *** Black
1404 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
1405   (use-package python-black
1406     :demand t
1407     :after python)
1408 #+end_src
1409 *** Sphinx Documentation
1410 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
1411   (use-package sphinx-doc
1412     :ensure t
1413     :config
1414     (sphinx-doc-mode t)
1415     :after python)
1416 #+end_src
1417 ** Go language
1418 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1419 (use-package go-mode
1420              :diminish "go"
1421              :mode "\\.go"
1422              )
1423 #+END_SRC
1424
1425 ** Expand region
1426 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1427 (use-package expand-region
1428   :bind (("C-=" . 'er/expand-region))
1429   )
1430 #+END_SRC
1431
1432 ** Dockerfile
1433 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1434 (use-package dockerfile-mode
1435   :mode "Dockerfile"
1436   )
1437 #+END_SRC
1438
1439 ** Beancount
1440 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1441 (use-package beancount
1442   :load-path "~/lib/emacs_el/beancount-mode/"
1443   :ensure f
1444   :mode "\\.beancount\\'"
1445
1446   )
1447 #+END_SRC
1448 * Email
1449 ** Mutt
1450 *** Message-mode
1451 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1452 (use-package message
1453   :ensure f
1454   :diminish (message "✉")
1455   :mode ("muttng-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1456   :mode ("mutt-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1457   :hook 'my/message-mode-settings
1458   :hook 'turn-on-flyspell
1459   :bind (:map message-mode-map
1460       ("C-c C-a" . my/post-attach-file))
1461   :delight (message-mode "✉")
1462   :config
1463   (defun my/message-mode-settings ()
1464     (font-lock-add-keywords nil
1465                 '(("^[ \t]*>[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1466                (0 'message-multiply-quoted-text-face))
1467               ("^[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1468                (0 'message-double-quoted-text-face))))
1469     )
1470
1471   (defun my/post-attach-file ()
1472     "Prompt for an attachment."
1473     (interactive)
1474     (let ((file (read-file-name "Attach file: " nil nil t nil)))
1475       (my/header-attach-file file "")))
1476
1477   (defun my/header-attach-file (file description)
1478     "Attach a FILE to the current message (works with Mutt).
1479   Argument DESCRIPTION MIME description."
1480     (interactive "fAttach file: \nsDescription: ")
1481     (when (> (length file) 0)
1482   (save-excursion
1483     (save-match-data
1484       (save-restriction
1485         (widen)
1486         (goto-char (point-min))
1487         (search-forward-regexp "^$")
1488         (insert (concat "Attach: " (replace-regexp-in-string "\\([[:space:]\\]\\)" "\\\\\\1" (file-truename file)) " "
1489                 description "\n"))
1490         (message (concat "Attached '" file "'."))
1491         (setq post-has-attachment t))))))
1492
1493   (setq mail-yank-prefix "> ")
1494   (setq mail-header-separator "") ; fix broken header detection
1495 )
1496 #+END_SRC
1497 *** Muttrc mode
1498 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1499   (use-package muttrc-mode
1500     :mode "muttngrc"
1501     :mode "muttrc"
1502   )
1503
1504 #+END_SRC
1505 * Base emacs
1506 ** Reverting buffers
1507 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1508   (use-package autorevert
1509     :diminish auto-revert-mode
1510     :config
1511     (setq global-auto-revert-non-file-buffers t
1512           global-auto-revert-ignore-modes '(pdf-view-mode)
1513           auto-revert-verbose nil)
1514     (global-auto-revert-mode 1))
1515 #+END_SRC
1516 * Org Mode
1517 ** Use-package and load things
1518 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1519
1520   (use-package org
1521     :delight (org-mode "ø")
1522     :mode ("\\.\\(org\\|org_archive\\|txt\\)\\'" . org-mode)
1523     :bind (("C-c l"  . org-store-link)
1524            ("C-c a"  . org-agenda)
1525            ("C-c b"  . org-iswitchb))
1526 #+END_SRC
1527 ** Agenda Configuration
1528 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1529   :config
1530   (setq-default org-log-done 'time)
1531   (setq-default org-agenda-ndays 5)
1532
1533   (setq org-agenda-sticky t)
1534   (defun dla/show-org-agenda ()
1535     (interactive)
1536     (let (agendabuffer
1537           '(delq nil
1538                 (mapcar (lambda (x)
1539                           (and (string-match-p
1540                                 "\*Org Agenda.*\*"
1541                                 (buffer-name x))
1542                                x)
1543                           )
1544                         (buffer-list))))
1545       (if agendabuffer
1546           (switch-to-buffer
1547            (buffer-name agendabuffer))
1548         (org-agenda-list)))
1549       (delete-other-windows))
1550
1551   ;; agenda configuration
1552   ;; Do not dim blocked tasks
1553   (setq org-agenda-dim-blocked-tasks nil)
1554   (setq org-agenda-inhibit-startup t)
1555   (setq org-agenda-use-tag-inheritance nil)
1556
1557   ;; Compact the block agenda view
1558   (setq org-agenda-compact-blocks t)
1559
1560   ;; Custom agenda command definitions
1561   (setq org-agenda-custom-commands
1562         (quote (("N" "Notes" tags "NOTE"
1563                  ((org-agenda-overriding-header "Notes")
1564                   (org-tags-match-list-sublevels t)))
1565                 ("h" "Habits" tags-todo "STYLE=\"habit\""
1566                  ((org-agenda-overriding-header "Habits")
1567                   (org-agenda-sorting-strategy
1568                    '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1569                 (" " "Agenda"
1570                  ((agenda "" nil)
1571                   (tags "REFILE"
1572                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Refile")
1573                          (org-tags-match-list-sublevels nil)))
1574                   (tags-todo "-CANCELLED/!"
1575                              ((org-agenda-overriding-header "Stuck Projects")
1576                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-stuck-projects)
1577                               (org-agenda-sorting-strategy
1578                                '(category-keep))))
1579                   (tags-todo "-HOLD-CANCELLED/!"
1580                              ((org-agenda-overriding-header "Projects")
1581                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-projects)
1582                               (org-tags-match-list-sublevels 'indented)
1583                               (org-agenda-sorting-strategy
1584                                '(category-keep))))
1585                   (tags-todo "-CANCELLED/!NEXT"
1586                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Next Tasks"
1587                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1588                                                                         ""
1589                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1590                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-projects-and-habits-and-single-tasks)
1591                               (org-tags-match-list-sublevels t)
1592                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1593                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1594                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1595                               (org-agenda-sorting-strategy
1596                                '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1597                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1598                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Subtasks"
1599                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1600                                                                         ""
1601                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1602                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-project-tasks)
1603                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1604                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1605                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1606                               (org-agenda-sorting-strategy
1607                                '(category-keep))))
1608                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1609                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Standalone Tasks"
1610                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1611                                                                         ""
1612                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1613                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-project-tasks)
1614                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1615                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1616                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1617                               (org-agenda-sorting-strategy
1618                                '(category-keep))))
1619                   (tags-todo "-CANCELLED+WAITING|HOLD/!"
1620                              ((org-agenda-overriding-header "Waiting and Postponed Tasks")
1621                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-stuck-projects)
1622                               (org-tags-match-list-sublevels nil)
1623                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled t)
1624                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines t)))
1625                   (tags "-REFILE/"
1626                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Archive")
1627                          (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-archivable-tasks)
1628                          (org-tags-match-list-sublevels nil))))
1629                  nil))))
1630
1631   ; org mode agenda files
1632   (setq org-agenda-files
1633         (append
1634         (file-expand-wildcards "~/projects/org-notes/*.org")
1635         (file-expand-wildcards "~/org-mode/from-mobile.org")
1636         (file-expand-wildcards "~/org-notes-*/*.org")
1637         )
1638   )
1639   (setq my/org-refile-file
1640         (car (seq-filter
1641               (lambda (file) (string-match-p (regexp-quote "/refile.org") file))
1642               org-agenda-files)))
1643
1644   (set-register ?n (cons 'file "~/projects/org-notes/notes.org"))
1645   (set-register ?r (cons 'file my/org-refile-file))
1646   (set-register ?o (cons 'file "~/projects/org-notes/ool.org"))
1647   (set-register ?s (cons 'file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
1648   (set-register ?c (cons 'file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
1649   (set-register ?w (cons 'file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
1650   (set-register ?u (cons 'file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
1651   (set-register ?R (cons 'file "~/projects/reviews/reviews.org"))
1652   (set-register ?d (cons 'file "~/projects/org-notes/diary.org"))
1653   ; from https://emacs.stackexchange.com/questions/909/how-can-i-have-an-agenda-timeline-view-of-multiple-files
1654   (defun org-agenda-timeline-all (&optional arg)
1655     (interactive "P")
1656     (with-temp-buffer
1657       (dolist (org-agenda-file org-agenda-files)
1658         (insert-file-contents org-agenda-file nil)
1659         (goto-char (point-max))
1660         (newline))
1661       (write-file "/tmp/timeline.org")
1662       (org-agenda arg "L")))
1663   (define-key org-mode-map (kbd "C-c t") 'org-agenda-timeline-all)
1664
1665 #+END_SRC
1666 ** General config
1667 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1668   (setq org-global-properties '(("Effort_ALL 0 0:10 0:30 1:00 2:00 3:00 4:00 5:00 6:00 7:00")))
1669   (setq org-columns-default-format "%40ITEM(Task) %6Effort{:} %CLOCKSUM %PRIORITY %TODO %13SCHEDULED %13DEADLINE %TAGS")
1670
1671   (setq org-default-notes-file "~/projects/org-notes/notes.org")
1672   (setq org-id-link-to-org-use-id 'use-existing)
1673 #+END_SRC
1674 ** Capture Templates
1675 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1676   (setq org-capture-templates  ;; mail-specific note template, identified by "m"
1677         `(("m" "Mail" entry (file my/org-refile-file)
1678            "* %?\n\n  Source: %u, [[%:link][%:description]]\n  %:initial")
1679           ("t" "todo" entry (file my/org-refile-file)
1680            "* TODO %?\n  :PROPERTIES:\n  :END:\n  :LOGBOOK:\n  :END:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1681           ("r" "respond" entry (file my/org-refile-file)
1682            "* NEXT Respond to %:from on %:subject\nSCHEDULED: %t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t :immediate-finish t)
1683           ("n" "note" entry (file my/org-refile-file)
1684            "* %? :NOTE:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1685           ("s" "schedule" entry (file my/org-refile-file)
1686            "* %? :cal:\n%^{scheduled:}t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1687           ("j" "Journal" entry (file+datetree "~/projects/org-notes/diary.org")
1688            "* %?\n%U\n" :clock-in t :clock-resume t)
1689           ("w" "org-protocol" entry (file my/org-refile-file)
1690            "* TODO Review %c\n%U\n" :immediate-finish t)
1691           ("M" "Meeting" entry (file my/org-refile-file)
1692            "* MEETING with %? :MEETING:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1693           ("S" "Seminar" entry (file my/org-refile-file)
1694            "* SEMINAR notes %? :SEMINAR:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1695           ("P" "Paper to read" entry (file+headline "~/projects/research/papers_to_read.org" "Refile")
1696            "* TODO Get/Read %? \n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1697           ("p" "Phone call" entry (file my/org-refile-file)
1698            "* PHONE %? :PHONE:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1699            ("J" "job" entry (file+olp "~/projects/org-notes/notes.org"
1700                                        "Jobs"
1701                                        ,(format-time-string "Positions %Y"))
1702            "* TODO Apply for %? :job:\nSCHEDULED: <%<%Y-%m-%d>>\n%U\n%x\n" :clock-in t :clock-resume t)
1703           ("h" "Habit" entry (file my/org-refile-file)
1704            "* NEXT %?\n%U\n%a\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d .+1d/3d>\")\n:PROPERTIES:\n:STYLE: habit\n:REPEAT_TO_STATE: NEXT\n:END:\n%a\n")
1705           )
1706         )
1707
1708   ;; Remove empty LOGBOOK drawers on clock out
1709   (defun bh/remove-empty-drawer-on-clock-out ()
1710     (interactive)
1711     (save-excursion
1712       (beginning-of-line 0)
1713       (org-remove-empty-drawer-at (point))))
1714
1715   (defun my/org-add-id ()
1716     (interactive)
1717     (save-excursion
1718       (if (org-current-level)
1719           ()
1720         (forward-char 1)
1721         )
1722       (org-id-get-create)
1723       )
1724   )
1725
1726 #+END_SRC
1727 ** Org mode key bindings
1728 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1729   ;; org mode configuration from http://doc.norang.ca/org-mode.html
1730   ;; Custom Key Bindings
1731   :bind* (("<f9> a" . org-agenda)
1732           ("<f9> I" . bh/punch-in)
1733           ("<f9> O" . bh/punch-out)
1734           ("<f9> SPC" . bh/clock-in-last-task)
1735           ("<f12>" . dla/show-org-agenda)
1736           ;; ("<f5>" . bh/org-todo)
1737           ("<S-f5>" . bh/widen)
1738           ("<f7>" . bh/set-truncate-lines)
1739           ("<f8>" . org-cycle-agenda-files)
1740           ("<f9> <f9>" . dla/show-org-agenda)
1741           ("<f9> b" . bbdb)
1742           ("<f9> c" . calendar)
1743           ("<f9> f" . boxquote-insert-file)
1744           ("<f9> h" . bh/hide-other)
1745           ("<f9> n" . bh/toggle-next-task-display)
1746           ("<f9> w" . widen)
1747
1748           ("<f9> r" . boxquote-region)
1749           ("<f9> s" . bh/switch-to-scratch)
1750
1751           ("<f9> t" . bh/insert-inactive-timestamp)
1752           ("<f9> T" . bh/toggle-insert-inactive-timestamp)
1753
1754           ("<f9> v" . visible-mode)
1755           ("<f9> l" . org-toggle-link-display)
1756           ("<f9> SPC" . bh/clock-in-last-task)
1757           ("C-<f9>" . previous-buffer)
1758           ("M-<f9>" . org-toggle-inline-images)
1759           ("C-x n r" . narrow-to-region)
1760           ("C-<f10>" . next-buffer)
1761           ("<f11>" . org-clock-goto)
1762           ("C-<f11>" . org-clock-in)
1763           ("C-s-<f12>" . bh/save-then-publish)
1764           ("C-c c" . org-capture))
1765   :config
1766 #+END_SRC
1767 ** Utility Functions
1768 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1769   (defun bh/hide-other ()
1770     (interactive)
1771     (save-excursion
1772       (org-back-to-heading 'invisible-ok)
1773       (outline-hide-other)
1774       (org-cycle)
1775       (org-cycle)
1776       (org-cycle)))
1777
1778   (defun bh/set-truncate-lines ()
1779     "Toggle value of truncate-lines and refresh window display."
1780     (interactive)
1781     (setq truncate-lines (not truncate-lines))
1782     ;; now refresh window display (an idiom from simple.el):
1783     (save-excursion
1784       (set-window-start (selected-window)
1785                         (window-start (selected-window)))))
1786
1787   (defun bh/switch-to-scratch ()
1788     (interactive)
1789     (switch-to-buffer "*scratch*"))
1790
1791   (setq org-use-fast-todo-selection t)
1792   (setq org-treat-S-cursor-todo-selection-as-state-change nil)
1793
1794   ; create function to create headlines in file. This comes from
1795   ; http://stackoverflow.com/questions/13340616/assign-ids-to-every-entry-in-org-mode
1796   (defun my/org-add-ids-to-headlines-in-file ()
1797     "Add ID properties to all headlines in the current file which
1798   do not already have one."
1799     (interactive)
1800     (org-map-entries 'org-id-get-create))
1801   (defun dla/org-update-ids-to-headlines-in-file ()
1802     "Add or replace ID properties to all headlines in the current file
1803   (or narrowed region)."
1804     (interactive)
1805     (org-map-entries '(lambda () (org-id-get-create t))))
1806   ; if we wanted to do this to every buffer, do the following:
1807   ; (add-hook 'org-mode-hook
1808   ;           (lambda ()
1809   ;             (add-hook 'before-save-hook 'my/org-add-ids-to-headlines-in-file nil 'local)))
1810 #+END_SRC
1811 ** Org ID locations
1812 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1813 (use-package find-lisp
1814   :ensure t)
1815 (setq org-agenda-text-search-extra-files
1816       (append '(agenda-archives)
1817               (find-lisp-find-files "~/projects/org-notes" "\.org$")
1818               (find-lisp-find-files "~/projects/org-notes" "\.org_archive$")
1819               ))
1820 #+END_SRC
1821 ** Keywords (TODO)
1822 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1823 (setq org-todo-keywords
1824       (quote ((sequence "TODO(t)" "NEXT(n)" "|" "DONE(d)")
1825               (sequence "WAITING(w@/!)" "HOLD(h@/!)" "|" "CANCELLED(c@/!)" "PHONE" "MEETING"))))
1826
1827 (setq org-todo-keyword-faces
1828       (quote (("TODO" :foreground "red" :weight bold)
1829               ("NEXT" :foreground "blue" :weight bold)
1830               ("DONE" :foreground "forest green" :weight bold)
1831               ("WAITING" :foreground "orange" :weight bold)
1832               ("HOLD" :foreground "magenta" :weight bold)
1833               ("CANCELLED" :foreground "forest green" :weight bold)
1834               ("MEETING" :foreground "forest green" :weight bold)
1835               ("PHONE" :foreground "forest green" :weight bold))))
1836
1837 (setq org-todo-state-tags-triggers
1838       (quote (("CANCELLED" ("CANCELLED" . t))
1839               ("WAITING" ("WAITING" . t))
1840               ("HOLD" ("WAITING") ("HOLD" . t))
1841               (done ("WAITING") ("HOLD"))
1842               ("TODO" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1843               ("NEXT" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1844               ("DONE" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD")))))
1845
1846
1847
1848 ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/remove-empty-drawer-on-clock-out 'append)
1849 ; add ids on creation of nodes
1850 (add-hook 'org-capture-prepare-finalize-hook 'my/org-add-id)
1851
1852
1853 ; resolve clocks after 10 minutes of idle; use xprintidle
1854 ; (setq org-clock-idle-time 10)
1855 ; (setq org-clock-x11idle-program-name "xprintidle")
1856
1857 ; this is from http://doc.norang.ca/org-mode.html#Capture
1858 ; use C-M-r for org mode capture
1859 (global-set-key (kbd "C-M-r") 'org-capture)
1860
1861 ; Targets include this file and any file contributing to the agenda - up to 9 levels deep
1862 (setq org-refile-targets (quote ((nil :maxlevel . 9)
1863                                  (org-agenda-files :maxlevel . 9))))
1864
1865 ; Use full outline paths for refile targets - we file directly with IDO
1866 (setq org-refile-use-outline-path t)
1867
1868 ; Targets complete directly with IDO
1869 (setq org-outline-path-complete-in-steps nil)
1870
1871 ; Allow refile to create parent tasks with confirmation
1872 (setq org-refile-allow-creating-parent-nodes (quote confirm))
1873
1874 ; ; Use IDO for both buffer and file completion and ido-everywhere to t
1875 ; (setq org-completion-use-ido t)
1876 ; (setq ido-everywhere t)
1877 ; (setq ido-max-directory-size 100000)
1878 ; (ido-mode (quote both))
1879 ; ; Use the current window when visiting files and buffers with ido
1880 ; (setq ido-default-file-method 'selected-window)
1881 ; (setq ido-default-buffer-method 'selected-window)
1882 ; ; Use the current window for indirect buffer display
1883 ; (setq org-indirect-buffer-display 'current-window)
1884
1885
1886 ;;;; Refile settings
1887 ; Exclude DONE state tasks from refile targets
1888 (defun bh/verify-refile-target ()
1889   "Exclude todo keywords with a done state from refile targets"
1890   (not (member (nth 2 (org-heading-components)) org-done-keywords)))
1891
1892 (setq org-refile-target-verify-function 'bh/verify-refile-target)
1893
1894 ;; ensure that emacsclient will show just the note to be edited when invoked
1895 ;; from Mutt, and that it will shut down emacsclient once finished;
1896 ;; fallback to legacy behavior when not invoked via org-protocol.
1897 (require 'org-protocol)
1898 ; (add-hook 'org-capture-mode-hook 'delete-other-windows)
1899 (setq my-org-protocol-flag nil)
1900 (defadvice org-capture-finalize (after delete-frame-at-end activate)
1901   "Delete frame at remember finalization"
1902   (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1903          (setq my-org-protocol-flag nil)))
1904 (defadvice org-capture-refile (around delete-frame-after-refile activate)
1905   "Delete frame at remember refile"
1906   (if my-org-protocol-flag
1907       (progn
1908         (setq my-org-protocol-flag nil)
1909         ad-do-it
1910         (delete-frame))
1911     ad-do-it)
1912   )
1913 (defadvice org-capture-kill (after delete-frame-at-end activate)
1914   "Delete frame at remember abort"
1915   (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1916          (setq my-org-protocol-flag nil)))
1917 (defadvice org-protocol-capture (before set-org-protocol-flag activate)
1918   (setq my-org-protocol-flag t))
1919
1920 (defadvice org-insert-todo-heading (after dla/create-id activate)
1921   (unless (org-in-item-p)
1922     (org-id-get-create)
1923     )
1924   )
1925
1926 ;; org modules
1927 (add-to-list 'org-modules 'org-habit)
1928
1929 ; this comes from http://upsilon.cc/~zack/blog/posts/2010/02/integrating_Mutt_with_Org-mode/
1930 (defun open-mail-in-mutt (message)
1931   "Open a mail message in Mutt, using an external terminal.
1932
1933 Message can be specified either by a path pointing inside a
1934 Maildir, or by Message-ID."
1935   (interactive "MPath or Message-ID: ")
1936   (shell-command
1937    (format "faf xterm -e \"%s %s\""
1938        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/mutt_open") message)))
1939
1940 ;; add support for "mutt:ID" links
1941 (org-add-link-type "mutt" 'open-mail-in-mutt)
1942
1943 (defun my-org-mode-setup ()
1944   ; (load-library "reftex")
1945   (and (buffer-file-name)
1946        (file-exists-p (buffer-file-name))
1947        (progn
1948          ; (reftex-parse-all)
1949          (reftex-set-cite-format
1950           '((?b . "[[bib:%l][%l-bib]]")
1951             (?n . "[[notes:%l][%l-notes]]")
1952             (?c . "\\cite{%l}")
1953             (?h . "*** %t\n:PROPERTIES:\n:Custom_ID: %l\n:END:\n[[papers:%l][%l xoj]] [[papers-pdf:%l][pdf]]")))
1954          ))
1955   (define-key org-mode-map (kbd "C-c )") 'reftex-citation)
1956   (define-key org-mode-map (kbd "C-c [") 'reftex-citation)
1957   (define-key org-mode-map (kbd "C-c (") 'org-mode-reftex-search)
1958   (define-key org-mode-map (kbd "C-c 0") 'reftex-view-crossref)
1959   )
1960 (add-hook 'org-mode-hook 'my-org-mode-setup)
1961
1962 (defun org-mode-reftex-search ()
1963   (interactive)
1964   (org-open-link-from-string (format "[[notes:%s]]" (first (reftex-citation t)))))
1965
1966 (defun open-research-paper (bibtexkey)
1967   "Open a paper by bibtex key"
1968   (interactive "bibtex key: ")
1969   (shell-command
1970    (format "%s %s"
1971        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1972 (org-add-link-type "papers" 'open-research-paper)
1973 (defun open-research-paper-pdf (bibtexkey)
1974   "Open a paper pdf by bibtex key"
1975   (interactive "bibtex key: ")
1976   (shell-command
1977    (format "%s -p evince_annot %s"
1978        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1979 (org-add-link-type "papers-pdf" 'open-research-paper-pdf)
1980
1981 (add-to-list 'org-link-abbrev-alist
1982              '("notes" .
1983                "~/projects/research/paper_notes.org::#%s"))
1984
1985 ; I pretty much always want hiearchical checkboxes
1986 (setq org-hierachical-checkbox-statistics nil)
1987
1988 ;; Add \begin{equation}\end{equation} templates to the org mode easy templates
1989 (add-to-list 'org-structure-template-alist
1990              '("E" "\\begin{equation}\n?\n\\end{equation}"))
1991
1992  ;; stolen from
1993 ;; http://www-public.it-sudparis.eu/~berger_o/weblog/2012/03/23/how-to-manage-and-export-bibliographic-notesrefs-in-org-mode/
1994 (defun my-rtcite-export-handler (path desc format)
1995   (message "my-rtcite-export-handler is called : path = %s, desc = %s, format = %s" path desc format)
1996   (let* ((search (when (string-match "::#?\\(.+\\)\\'" path)
1997                    (match-string 1 path)))
1998          (path (substring path 0 (match-beginning 0))))
1999     (cond ((eq format 'latex)
2000            (if (or (not desc)
2001                    (equal 0 (search "rtcite:" desc)))
2002                (format "\\cite{%s}" search)
2003              (format "\\cite[%s]{%s}" desc search))))))
2004
2005 (org-add-link-type "rtcite"
2006                    'org-bibtex-open
2007                    'my-rtcite-export-handler)
2008
2009
2010 #+END_SRC
2011 ** Org Mobile Configuration
2012 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2013   (setq-default org-mobile-directory "/linnode.donarmstrong.com:/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/")
2014   (when (string= system-name "linnode")
2015     (setq-default org-mobile-directory "/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/"))
2016   (setq-default org-directory "/home/don/org-mode/")
2017   (setq-default org-mobile-inbox-for-pull "/home/don/org-mode/from-mobile.org")
2018
2019 #+END_SRC
2020 ** Org iCal Support
2021 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2022   ;; org mode ical export
2023   (setq org-icalendar-timezone "America/Los_Angeles")
2024   (setq org-icalendar-use-scheduled '(todo-start event-if-todo))
2025   ;; we already add the id manually
2026   (setq org-icalendar-store-UID t)
2027
2028 #+END_SRC
2029 ** General Org Babel Configuration
2030 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2031 ;; org babel support
2032 (org-babel-do-load-languages
2033  'org-babel-load-languages
2034  '((emacs-lisp . t )
2035    (R . t)
2036    (latex . t)
2037    (ditaa . t)
2038    (dot . t)
2039    ))
2040 ;; set the right path to ditaa.jar
2041 (setq org-ditaa-jar-path "/usr/share/ditaa/ditaa.jar")
2042 ;; use graphviz-dot for dot things
2043 (add-to-list 'org-src-lang-modes '("dot" . graphviz-dot))
2044 ;; do not indent begin_src blocks
2045 (setq org-edit-src-content-indentation 0)
2046 ;; org-babel-by-backend
2047 (defmacro org-babel-by-backend (&rest body)
2048    `(case (if (boundp 'backend)
2049               (org-export-backend-name backend)
2050             nil) ,@body))
2051
2052 (defun my/fix-inline-images ()
2053   (when org-inline-image-overlays
2054     (org-redisplay-inline-images)))
2055
2056 (add-hook 'org-babel-after-execute-hook
2057            'my/fix-inline-images)
2058
2059 #+END_SRC
2060 ** LaTeX configuration
2061    :PROPERTIES:
2062    :ID:       7135ba17-6a50-4eed-84ca-b90afa5b12f8
2063    :END:
2064 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2065 (use-package ox-extra
2066   :config
2067   (ox-extras-activate '(ignore-headlines)))
2068 (require 'ox-latex)
2069 (add-to-list 'org-latex-classes
2070          '("memarticle"
2071        "\\documentclass[11pt,oneside,article]{memoir}\n"
2072        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2073        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2074        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2075        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2076        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2077
2078 (setq org-beamer-outline-frame-options "")
2079 (add-to-list 'org-latex-classes
2080          '("beamer"
2081        "\\documentclass[ignorenonframetext]{beamer}
2082 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2083 [PACKAGES]
2084 [EXTRA]"
2085        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2086        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2087        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2088        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2089        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2090
2091 (add-to-list 'org-latex-classes
2092          '("membook"
2093        "\\documentclass[11pt,oneside]{memoir}\n"
2094        ("\\chapter{%s}" . "\\chapter*{%s}")
2095        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2096        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2097        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")))
2098
2099 (add-to-list 'org-latex-classes
2100          '("letter"
2101        "\\documentclass[11pt]{letter}
2102 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2103 [PACKAGES]
2104 [EXTRA]"
2105    ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2106        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2107        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2108        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2109        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2110
2111 (add-to-list 'org-latex-classes
2112          '("dlacv"
2113        "\\documentclass{dlacv}
2114 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2115 [NO-PACKAGES]
2116 [NO-EXTRA]"
2117        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2118        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2119        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2120        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2121        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2122
2123
2124 (add-to-list 'org-latex-classes
2125          '("dlaresume"
2126        "\\documentclass{dlaresume}
2127 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2128 [NO-PACKAGES]
2129 [NO-EXTRA]"
2130        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2131        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2132        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2133        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2134        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2135
2136
2137 ;; Originally taken from Bruno Tavernier: http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/31150/focus=31432
2138 ;; but adapted to use latexmk 4.22 or higher.
2139 (setq org-latex-pdf-process '("latexmk -f -pdflatex=xelatex -bibtex -use-make -pdf %f"))
2140
2141 ;; Default packages included in /every/ tex file, latex, pdflatex or xelatex
2142 (setq org-latex-default-packages-alist
2143   '(("" "amsmath" t)
2144     ("" "unicode-math" t)
2145     ))
2146 (setq org-latex-packages-alist
2147   '(("" "graphicx" t)
2148     ("" "fontspec" t)
2149     ("" "xunicode" t)
2150     ("" "hyperref" t)
2151     ("" "url" t)
2152     ("" "rotating" t)
2153     ("" "longtable" nil)
2154     ("" "float" )))
2155
2156 ;; make equations larger
2157 (setq org-format-latex-options (plist-put org-format-latex-options :scale 2.0))
2158
2159 (defun org-create-formula--latex-header ()
2160   "Return LaTeX header appropriate for previewing a LaTeX snippet."
2161   (let ((info (org-combine-plists (org-export--get-global-options
2162            (org-export-get-backend 'latex))
2163           (org-export--get-inbuffer-options
2164            (org-export-get-backend 'latex)))))
2165     (org-latex-guess-babel-language
2166      (org-latex-guess-inputenc
2167   (org-splice-latex-header
2168    org-format-latex-header
2169    org-latex-default-packages-alist
2170    nil t
2171    (plist-get info :latex-header)))
2172      info)))
2173
2174
2175 ; support ignoring headers in org mode export to latex
2176 ; from http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/67692
2177 (defadvice org-latex-headline (around my-latex-skip-headlines
2178                   (headline contents info) activate)
2179   (if (member "ignoreheading" (org-element-property :tags headline))
2180   (setq ad-return-value contents)
2181     ad-do-it))
2182
2183 ;; keep latex logfiles
2184
2185 (setq org-latex-remove-logfiles nil)
2186
2187 ;; Resume clocking task when emacs is restarted
2188 (org-clock-persistence-insinuate)
2189 ;;
2190 ;; Show lot of clocking history so it's easy to pick items off the C-F11 list
2191 (setq org-clock-history-length 23)
2192 ;; Resume clocking task on clock-in if the clock is open
2193 (setq org-clock-in-resume t)
2194 ;; Change tasks to NEXT when clocking in; this avoids clocking in when
2195 ;; there are things like PHONE calls
2196 (setq org-clock-in-switch-to-state 'bh/clock-in-to-next)
2197 ;; Separate drawers for clocking and logs
2198 (setq org-drawers (quote ("PROPERTIES" "LOGBOOK")))
2199 ;; Save clock data and state changes and notes in the LOGBOOK drawer
2200 (setq org-clock-into-drawer t)
2201 (setq org-log-into-drawer t)
2202 ;; Sometimes I change tasks I'm clocking quickly - this removes clocked tasks with 0:00 duration
2203 (setq org-clock-out-remove-zero-time-clocks t)
2204 ;; Clock out when moving task to a done state
2205 (setq org-clock-out-when-done t)
2206 ;; Save the running clock and all clock history when exiting Emacs, load it on startup
2207 (setq org-clock-persist t)
2208 ;; Do not prompt to resume an active clock
2209 (setq org-clock-persist-query-resume nil)
2210 ;; Enable auto clock resolution for finding open clocks
2211 (setq org-clock-auto-clock-resolution (quote when-no-clock-is-running))
2212 ;; Include current clocking task in clock reports
2213 (setq org-clock-report-include-clocking-task t)
2214
2215 ;; the cache seems to be broken
2216 (setq org-element-use-cache nil)
2217
2218 (defvar bh/keep-clock-running nil)
2219
2220 (defun bh/is-task-p ()
2221   "Any task with a todo keyword and no subtask"
2222   (save-restriction
2223     (widen)
2224     (let ((has-subtask)
2225           (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
2226           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2227       (save-excursion
2228         (forward-line 1)
2229         (while (and (not has-subtask)
2230                     (< (point) subtree-end)
2231                     (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
2232           (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
2233             (setq has-subtask t))))
2234       (and is-a-task (not has-subtask)))))
2235 (defun bh/is-project-p ()
2236   "Any task with a todo keyword subtask"
2237   (save-restriction
2238     (widen)
2239     (let ((has-subtask)
2240           (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
2241           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2242       (save-excursion
2243         (forward-line 1)
2244         (while (and (not has-subtask)
2245                     (< (point) subtree-end)
2246                     (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
2247           (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
2248             (setq has-subtask t))))
2249       (and is-a-task has-subtask))))
2250
2251 (defun bh/is-subproject-p ()
2252   "Any task which is a subtask of another project"
2253   (let ((is-subproject)
2254         (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2255     (save-excursion
2256       (while (and (not is-subproject) (org-up-heading-safe))
2257         (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
2258           (setq is-subproject t))))
2259     (and is-a-task is-subproject)))
2260
2261
2262 (defun bh/clock-in-to-next (kw)
2263   "Switch a task from TODO to NEXT when clocking in.
2264 Skips capture tasks, projects, and subprojects.
2265 Switch projects and subprojects from NEXT back to TODO"
2266   (when (not (and (boundp 'org-capture-mode) org-capture-mode))
2267     (cond
2268      ((and (member (org-get-todo-state) (list "TODO"))
2269        (bh/is-task-p))
2270   "NEXT")
2271      ((and (member (org-get-todo-state) (list "NEXT"))
2272        (bh/is-project-p))
2273   "TODO"))))
2274
2275 (defun bh/punch-in (arg)
2276   "Start continuous clocking and set the default task to the
2277 selected task.  If no task is selected set the Organization task
2278 as the default task."
2279   (interactive "p")
2280   (setq bh/keep-clock-running t)
2281   (if (equal major-mode 'org-agenda-mode)
2282   ;;
2283   ;; We're in the agenda
2284   ;;
2285   (let* ((marker (org-get-at-bol 'org-hd-marker))
2286          (tags (org-with-point-at marker (org-get-tags-at))))
2287     (if (and (eq arg 4) tags)
2288         (org-agenda-clock-in '(16))
2289       (bh/clock-in-organization-task-as-default)))
2290     ;;
2291     ;; We are not in the agenda
2292     ;;
2293     (save-restriction
2294   (widen)
2295   ; Find the tags on the current task
2296   (if (and (equal major-mode 'org-mode) (not (org-before-first-heading-p)) (eq arg 4))
2297       (org-clock-in '(16))
2298     (bh/clock-in-organization-task-as-default)))))
2299
2300 (defun bh/punch-out ()
2301   (interactive)
2302   (setq bh/keep-clock-running nil)
2303   (when (org-clock-is-active)
2304     (org-clock-out))
2305   (org-agenda-remove-restriction-lock))
2306
2307 (defun bh/clock-in-default-task ()
2308   (save-excursion
2309     (org-with-point-at org-clock-default-task
2310   (org-clock-in))))
2311
2312 (defun bh/clock-in-parent-task ()
2313   "Move point to the parent (project) task if any and clock in"
2314   (let ((parent-task))
2315     (save-excursion
2316   (save-restriction
2317     (widen)
2318     (while (and (not parent-task) (org-up-heading-safe))
2319       (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
2320         (setq parent-task (point))))
2321     (if parent-task
2322         (org-with-point-at parent-task
2323       (org-clock-in))
2324       (when bh/keep-clock-running
2325         (bh/clock-in-default-task)))))))
2326
2327 (defvar bh/organization-task-id "e22cb8bf-07c7-408b-8f60-ff3aadac95e4")
2328
2329 (defun bh/clock-in-organization-task-as-default ()
2330   (interactive)
2331   (org-with-point-at (org-id-find bh/organization-task-id 'marker)
2332     (org-clock-in '(16))))
2333
2334 (defun bh/clock-out-maybe ()
2335   (when (and bh/keep-clock-running
2336          (not org-clock-clocking-in)
2337          (marker-buffer org-clock-default-task)
2338          (not org-clock-resolving-clocks-due-to-idleness))
2339     (bh/clock-in-parent-task)))
2340
2341 ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/clock-out-maybe 'append)
2342
2343 (require 'org-id)
2344 (defun bh/clock-in-task-by-id (id)
2345   "Clock in a task by id"
2346   (org-with-point-at (org-id-find id 'marker)
2347     (org-clock-in nil)))
2348
2349 (defun bh/clock-in-last-task (arg)
2350   "Clock in the interrupted task if there is one
2351 Skip the default task and get the next one.
2352 A prefix arg forces clock in of the default task."
2353   (interactive "p")
2354   (let ((clock-in-to-task
2355      (cond
2356       ((eq arg 4) org-clock-default-task)
2357       ((and (org-clock-is-active)
2358         (equal org-clock-default-task (cadr org-clock-history)))
2359        (caddr org-clock-history))
2360       ((org-clock-is-active) (cadr org-clock-history))
2361       ((equal org-clock-default-task (car org-clock-history)) (cadr org-clock-history))
2362       (t (car org-clock-history)))))
2363     (widen)
2364     (org-with-point-at clock-in-to-task
2365   (org-clock-in nil))))
2366
2367
2368 (defun org-export-to-ods ()
2369   (interactive)
2370   (let ((csv-file "data.csv"))
2371     (org-table-export csv-file "orgtbl-to-csv")
2372     (org-odt-convert csv-file "ods" 'open)))
2373
2374 ; allow for zero-width-space to be a break in regexp too
2375 ; (setcar org-emphasis-regexp-components " [:space:] \t('\"{")
2376 ; (setcar (nthcdr 1 org-emphasis-regexp-components) " [:space:]- \t.,:!?;'\")}\\")
2377 ; (org-set-emph-re 'org-emphasis-regexp-components org-emphasis-regexp-components)
2378
2379 ;; support inserting screen shots
2380 (defun my/org-insert-screenshot ()
2381   "Take a screenshot into a time stamped unique-named file in the
2382 same directory as the org-buffer and insert a link to this file."
2383   (interactive)
2384   (defvar my/org-insert-screenshot/filename)
2385   (setq my/org-insert-screenshot/filename
2386     (read-file-name
2387      "Screenshot to insert: "
2388      nil
2389      (concat (buffer-file-name) "_" (format-time-string "%Y%m%d_%H%M%S") ".png")
2390      )
2391     )
2392   (call-process "import" nil nil nil my/org-insert-screenshot/filename)
2393   (insert (concat "[[" my/org-insert-screenshot/filename "]]"))
2394   (org-display-inline-images))
2395
2396 (defun my/fix-inline-images ()
2397   (when org-inline-image-overlays
2398     (org-redisplay-inline-images)))
2399
2400 (add-hook 'org-babel-after-execute-hook 'my/fix-inline-images)
2401
2402 ;; use xelatex to preview with imagemagick
2403 (add-to-list 'org-preview-latex-process-alist
2404          '(xelateximagemagick
2405       :programs ("xelatex" "convert")
2406       :description "pdf > png"
2407       :message "you need to install xelatex and imagemagick"
2408       :use-xcolor t
2409       :image-input-type "pdf"
2410       :image-output-type "png"
2411       :image-size-adjust (1.0 . 1.0)
2412       :latex-compiler ("xelatex -interaction nonstopmode -output-directory %o %f")
2413       :image-converter ("convert -density %D -trim -antialias %f -quality 100 %O"))
2414          )
2415 ;; use xelatex by default
2416 (setq org-preview-latex-default-process 'xelateximagemagick)
2417
2418 ; from http://orgmode.org/Changes.html
2419 (defun my/org-repair-property-drawers ()
2420   "Fix properties drawers in current buffer.
2421  Ignore non Org buffers."
2422   (interactive)
2423   (when (eq major-mode 'org-mode)
2424     (org-with-wide-buffer
2425      (goto-char (point-min))
2426      (let ((case-fold-search t)
2427        (inline-re (and (featurep 'org-inlinetask)
2428                (concat (org-inlinetask-outline-regexp)
2429                    "END[ \t]*$"))))
2430    (org-map-entries
2431     (lambda ()
2432       (unless (and inline-re (org-looking-at-p inline-re))
2433         (save-excursion
2434       (let ((end (save-excursion (outline-next-heading) (point))))
2435         (forward-line)
2436         (when (org-looking-at-p org-planning-line-re) (forward-line))
2437         (when (and (< (point) end)
2438                (not (org-looking-at-p org-property-drawer-re))
2439                (save-excursion
2440                  (and (re-search-forward org-property-drawer-re end t)
2441                   (eq (org-element-type
2442                    (save-match-data (org-element-at-point)))
2443                   'drawer))))
2444           (insert (delete-and-extract-region
2445                (match-beginning 0)
2446                (min (1+ (match-end 0)) end)))
2447           (unless (bolp) (insert "\n"))))))))))))
2448
2449 #+END_SRC
2450 ** Org-Gcal
2451 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2452 (use-package calfw
2453   :ensure f
2454   )
2455 (use-package calfw-org
2456   :ensure f
2457   )
2458 (use-package org-gcal
2459   :if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
2460   :ensure f
2461   :config '((if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
2462                 (load-file "~/.hide/org_gcal.el"))
2463             )
2464   )
2465 #+END_SRC
2466 ** appt integration
2467 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2468   (use-package appt
2469     :ensure f
2470     :config
2471     ;; Show notification 10 minutes before event
2472     (setq appt-message-warning-time 10)
2473     ;; Disable multiple reminders
2474     (setq appt-display-interval appt-message-warning-time)
2475     (setq appt-display-mode-line nil)
2476
2477     ;; add automatic reminders for appointments
2478     (defun my/org-agenda-to-appt ()
2479       (interactive)
2480       (setq appt-time-msg-list nil)
2481       (org-agenda-to-appt))
2482     ;; add reminders when starting emacs
2483     (my/org-agenda-to-appt)
2484     ;; when rebuilding the agenda
2485     (defadvice  org-agenda-redo (after org-agenda-redo-add-appts)
2486       "Pressing `r' on the agenda will also add appointments."
2487       (my/org-agenda-to-appt)
2488       )
2489     ;; when saving all org buffers
2490     (defadvice org-save-all-org-buffers (after org-save-all-org-buffers-add-appts)
2491       "Re-add appts after saving all org buffers"
2492       (my/org-agenda-to-appt))
2493     ;; Display appointments as a window manager notification
2494     (setq appt-disp-window-function 'my/appt-display)
2495     (setq appt-delete-window-function (lambda () t))
2496
2497     (setq my/appt-notification-app (concat (getenv "HOME") "/bin/appt_notification"))
2498
2499     (defun my/appt-display (min-to-app new-time msg)
2500       (if (atom min-to-app)
2501       (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app min-to-app msg)
2502     (dolist (i (number-sequence 0 (1- (length min-to-app))))
2503       (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app
2504                      (nth i min-to-app) (nth i msg))))
2505       )
2506     )
2507
2508
2509 #+END_SRC
2510 ** outshine (outlining) integration
2511 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2512 (use-package outshine
2513   :ensure t
2514   :hook (outline-minor-mode . outshine-hook-function)
2515 )
2516 #+END_SRC
2517 ** End use-package
2518 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2519   )
2520 #+END_SRC
2521 * Keybindings
2522 ** Home/End Begining/End of line
2523 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2524   (global-set-key [home] 'move-beginning-of-line)
2525   (global-set-key [end] 'move-end-of-line)
2526 #+END_SRC
2527 ** Goto line
2528 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2529   (global-unset-key "\M-g")
2530   (global-set-key (kbd "M-g l") 'goto-line)
2531 #+END_SRC
2532 * Debian
2533 ** debian-changelog
2534 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2535   (use-package debian-changelog-mode
2536     :mode "debian/changelog"
2537     :config
2538     (setq debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
2539     (setq debian-changelog-full-name "Don Armstrong"))
2540 #+END_SRC
2541 * Misc (uncharacterized)
2542 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2543   (setq calendar-latitude 38.6)
2544   (setq calendar-longitude -121.5)
2545   (setq case-fold-search t)
2546   (setq confirm-kill-emacs (quote y-or-n-p))
2547   (setq cperl-lazy-help-time nil)
2548 #+END_SRC
2549 ** Turn on fontlock and icomplete
2550 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2551   (global-font-lock-mode 1)
2552   (icomplete-mode 1)
2553   (setq log-edit-keep-buffer t)
2554 #+END_SRC
2555 ** Set mail User agent
2556 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2557   (setq mail-user-agent (quote sendmail-user-agent))
2558   (setq mutt-alias-file-list (quote ("~/.mutt/aliases" "~/.mail_aliases")))
2559 #+END_SRC
2560 ** PS Printing
2561 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2562   (setq ps-footer-font-size (quote (8 . 10)))
2563   (setq ps-header-font-size (quote (8 . 10)))
2564   (setq ps-header-title-font-size (quote (10 . 10)))
2565   (setq ps-line-number-color "blue")
2566   (setq ps-print-footer t)
2567   (setq ps-print-footer-frame nil)
2568   (setq ps-print-only-one-header t)
2569 #+END_SRC
2570 ** Only single spacing on sentences
2571 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2572   (setq sentence-end "[.?!][]\"')]*\\($\\|   \\| \\)[
2573   ]*")
2574   (setq sentence-end-double-space nil)
2575   ; enable matching parenthesis
2576 #+END_SRC
2577 ** Display paren mode
2578 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2579   (show-paren-mode 1)
2580   (setq show-paren-delay 0.2)
2581
2582 #+END_SRC
2583 ** My Username
2584 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2585   (setq user-mail-address "don@donarmstrong.com")
2586
2587 #+END_SRC
2588 ** Use primary selection on unix machines
2589 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2590   ;; switch back to the old primary selection method
2591   (if (or (string-equal system-type "darwin")
2592           (string-equal system-type "windows")
2593           )
2594       (progn
2595         (setq x-select-enable-clipboard t)
2596         (setq x-select-enable-primary nil)
2597         )
2598     (progn
2599       (setq x-select-enable-clipboard nil)
2600       (setq x-select-enable-primary t)
2601       ))
2602   ; (setq mouse-drag-copy-region t)
2603
2604   (fset 'perl-mode 'cperl-mode)
2605   ;;(load-file "cperl-mode.el")
2606
2607   ;; tramp configuration
2608   (setq tramp-use-ssh-controlmaster-options nil)
2609
2610   (setq-default c-indent-level 4)
2611   (setq-default c-brace-imaginary-offset 0)
2612   (setq-default c-brace-offset -4)
2613   (setq-default c-argdecl-indent 4)
2614   (setq-default c-label-offset -4)
2615   (setq-default c-continued-statement-offset 4)
2616   ; tabs are annoying
2617   (setq-default indent-tabs-mode nil)
2618   (setq-default tab-width 4)
2619
2620
2621   ;; (autoload 'php-mode "php-mode" "PHP editing mode" t)
2622   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php3?\\'" . php-mode))
2623   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.phtml?\\'" . php-mode))
2624   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php?\\'" . php-mode))
2625   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php4?\\'" . php-mode))
2626
2627
2628   (defun insert-date ()
2629     "Insert date at point."
2630     (interactive)
2631     (insert (format-time-string "%A, %B %e, %Y %k:%M:%S %Z")))
2632   (global-set-key "\C-[d" 'insert-date)
2633
2634   (defun unfill-paragraph (arg)
2635     "Pull this whole paragraph up onto one line."
2636     (interactive "*p")
2637     (let ((fill-column 10000))
2638       (fill-paragraph arg))
2639     )
2640
2641   (column-number-mode t)
2642
2643 #+END_SRC
2644 ** Desktop-save-mode
2645 If the envvar EMACS_SERVER_NAME is set, consider this a separate
2646 emacs, and use a different desktop file to restore history
2647 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2648   (use-package desktop
2649     :demand
2650     :config
2651     (setq desktop-base-file-name
2652           (convert-standard-filename
2653            (concat ".emacs"
2654                    (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2655                        "")
2656                    ".desktop")
2657            ))
2658     (setq desktop-base-lock-name
2659           (convert-standard-filename
2660            (concat desktop-base-file-name
2661                    ".lock")))
2662     (setq desktop-auto-save-timeout 60)
2663     (setq desktop-restore-eager 5)
2664     (setq desktop-lazy-verbose nil)
2665     (desktop-save-mode 1)
2666     ; (desktop-read)
2667   )
2668 #+END_SRC
2669 ** Misc (Uncharacterized)
2670 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2671   '(icomplete-mode on)
2672   (custom-set-faces
2673    ;; custom-set-faces was added by Custom.
2674    ;; If you edit it by hand, you could mess it up, so be careful.
2675    ;; Your init file should contain only one such instance.
2676    ;; If there is more than one, they won't work right.
2677    '(menu ((((type x-toolkit)) (:background "black" :foreground "grey90")))))
2678
2679
2680   (put 'upcase-region 'disabled nil)
2681   (put 'downcase-region 'disabled nil)
2682   (put 'narrow-to-region 'disabled nil)
2683
2684   ; (defun turn-on-flyspell ()
2685   ;    "Force flyspell-mode on using a positive arg.  For use in hooks."
2686   ;    (interactive)
2687   ;    (flyspell-mode 1))
2688
2689
2690    ; Outline-minor-mode key map
2691    (define-prefix-command 'cm-map nil "Outline-")
2692    ; HIDE
2693    (define-key cm-map "q" 'outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
2694    (define-key cm-map "t" 'outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
2695    (define-key cm-map "o" 'outline-hide-other)        ; Hide other branches
2696    (define-key cm-map "c" 'outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
2697    (define-key cm-map "l" 'outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
2698    (define-key cm-map "d" 'outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
2699    ; SHOW
2700    (define-key cm-map "a" 'outline-show-all)          ; Show (expand) everything
2701    (define-key cm-map "e" 'outline-show-entry)        ; Show this heading's body
2702    (define-key cm-map "i" 'outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
2703    (define-key cm-map "k" 'outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
2704    (define-key cm-map "s" 'outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
2705    ; MOVE
2706    (define-key cm-map "u" 'outline-up-heading)                ; Up
2707    (define-key cm-map "n" 'outline-next-visible-heading)      ; Next
2708    (define-key cm-map "p" 'outline-previous-visible-heading)  ; Previous
2709    (define-key cm-map "f" 'outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
2710    (define-key cm-map "b" 'outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
2711    (global-set-key "\M-o" cm-map)
2712   ; fix up tmux xterm keys
2713   ; stolen from http://unix.stackexchange.com/questions/24414/shift-arrow-not-working-in-emacs-within-tmux
2714   (defun fix-up-tmux-keys ()
2715       "Fix up tmux xterm keys"
2716       (if (getenv "TMUX")
2717           (progn
2718             (let ((x 2) (tkey ""))
2719               (while (<= x 8)
2720                 ;; shift
2721                 (if (= x 2)
2722                     (setq tkey "S-"))
2723                 ;; alt
2724                 (if (= x 3)
2725                     (setq tkey "M-"))
2726                 ;; alt + shift
2727                 (if (= x 4)
2728                     (setq tkey "M-S-"))
2729                 ;; ctrl
2730                 (if (= x 5)
2731                     (setq tkey "C-"))
2732                 ;; ctrl + shift
2733                 (if (= x 6)
2734                     (setq tkey "C-S-"))
2735                 ;; ctrl + alt
2736                 (if (= x 7)
2737                     (setq tkey "C-M-"))
2738                 ;; ctrl + alt + shift
2739                 (if (= x 8)
2740                     (setq tkey "C-M-S-"))
2741
2742                 ;; arrows
2743                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d A" x)) (kbd (format "%s<up>" tkey)))
2744                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d B" x)) (kbd (format "%s<down>" tkey)))
2745                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d C" x)) (kbd (format "%s<right>" tkey)))
2746                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d D" x)) (kbd (format "%s<left>" tkey)))
2747                 ;; home
2748                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d H" x)) (kbd (format "%s<home>" tkey)))
2749                 ;; end
2750                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d F" x)) (kbd (format "%s<end>" tkey)))
2751                 ;; page up
2752                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 5 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<prior>" tkey)))
2753                 ;; page down
2754                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 6 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<next>" tkey)))
2755                 ;; insert
2756                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 2 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2757                 ;; delete
2758                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 3 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2759                 ;; f1
2760                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d P" x)) (kbd (format "%s<f1>" tkey)))
2761                 ;; f2
2762                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d Q" x)) (kbd (format "%s<f2>" tkey)))
2763                 ;; f3
2764                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d R" x)) (kbd (format "%s<f3>" tkey)))
2765                 ;; f4
2766                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d S" x)) (kbd (format "%s<f4>" tkey)))
2767                 ;; f5
2768                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 15 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f5>" tkey)))
2769                 ;; f6
2770                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 17 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f6>" tkey)))
2771                 ;; f7
2772                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 18 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f7>" tkey)))
2773                 ;; f8
2774                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 19 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f8>" tkey)))
2775                 ;; f9
2776                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 20 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f9>" tkey)))
2777                 ;; f10
2778                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 21 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f10>" tkey)))
2779                 ;; f11
2780                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 23 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f11>" tkey)))
2781                 ;; f12
2782                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 24 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f12>" tkey)))
2783                 ;; f13
2784                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 25 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f13>" tkey)))
2785                 ;; f14
2786                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 26 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f14>" tkey)))
2787                 ;; f15
2788                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 28 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f15>" tkey)))
2789                 ;; f16
2790                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 29 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f16>" tkey)))
2791                 ;; f17
2792                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 31 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f17>" tkey)))
2793                 ;; f18
2794                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 32 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f18>" tkey)))
2795                 ;; f19
2796                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 33 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f19>" tkey)))
2797                 ;; f20
2798                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 34 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f20>" tkey)))
2799
2800                 (setq x (+ x 1))
2801                 ))
2802             )
2803         )
2804       )
2805   ; (add-hook 'tty-setup-hook 'fix-up-tmux-keys)
2806
2807   (defadvice ask-user-about-supersession-threat (around ask-user-about-supersession-threat-if-necessary)
2808     "Call ask-user-about-supersession-threat only if the buffer is actually obsolete."
2809     (if (or (buffer-modified-p)
2810             (verify-visited-file-modtime)
2811             (< (* 8 1024 1024) (buffer-size))
2812             (/= 0 (call-process-region 1 (+ 1 (buffer-size)) "diff" nil nil nil "-q" (buffer-file-name) "-")))
2813         ad-do-it
2814       (clear-visited-file-modtime)
2815       (not-modified)))
2816   (ad-activate 'ask-user-about-supersession-threat)
2817 #+END_SRC
2818
2819 * Start Server
2820 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2821   (use-package server
2822     :config
2823     (setq server-name
2824           (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2825               "server"))
2826     (unless (server-running-p)
2827       (global-set-key "\C-xp" 'server-edit)
2828       (server-start)))
2829 #+END_SRC
2830
2831
2832
2833 * END
2834 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2835   (provide 'don-configuration)
2836 #+END_SRC