]> git.donarmstrong.com Git - lib.git/blob - emacs_el/configuration/don-configuration.org
2c164f0504271bf484fa75a81e907a493051c0bf
[lib.git] / emacs_el / configuration / don-configuration.org
1 #+PROPERTY: header-args:emacs-lisp :tangle don-configuration.el
2 * Load debugger
3
4 # if for some reason, things get pear-shaped, we want to be able to
5 # enter the debugger by sending -USR2 to emacs
6
7 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
8 (setq debug-on-event 'siguser2)
9 #+END_SRC
10 * Add library paths
11
12 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
13   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/")
14   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/tiny")
15   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/other")
16   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/magit-annex")
17 #+END_SRC
18
19 * Package management
20 ** package repositories and package manager
21 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
22   (require 'package)
23   (setq package-archives '(("gnu" . "https://elpa.gnu.org/packages/")
24                            ("melpa" . "https://melpa.org/packages/")
25                            ("org" . "http://orgmode.org/elpa/") ))
26 #+END_SRC
27 ** [[https://github.com/jwiegley/use-package/][use-package]]
28 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
29   (package-initialize)
30   (require 'use-package)
31 #+END_SRC
32 ** Paradox
33 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
34   (use-package paradox
35     :ensure paradox
36   )
37 #+END_SRC
38 * Disable custom-vars
39 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
40   ;; Set the custom file to /dev/null and don't bother to load it
41   (setq custom-file "/dev/null")
42 #+END_SRC
43 * Misc functions
44 ** with-library
45 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
46 ;; From http://www.emacswiki.org/emacs/LoadingLispFiles
47 ;; execute conditional code when loading libraries
48 (defmacro with-library (symbol &rest body)
49   `(when (require ,symbol nil t)
50      ,@body))
51 (put 'with-library 'lisp-indent-function 1)
52 #+END_SRC
53
54 * Variables
55 ** Safe Local Variables
56 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
57   (setq safe-local-variable-values 
58         (quote ((auto-save-default)
59                 (make-backup-files)
60                 (cperl-indent-level . 4)
61                 (indent-level . 4)
62                 (indent-tabs-mode . f)
63                 )))
64 #+END_SRC
65 * Memory
66 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
67   (setq global-mark-ring-max 128
68         mark-ring-max 128
69         kill-ring-max 128)
70
71   (defun don/minibuffer-setup-hook ()
72     (setq gc-cons-threshold most-positive-fixnum))
73
74   (defun don/minibuffer-exit-hook ()
75     (setq gc-cons-threshold 1048576))
76
77   (add-hook 'minibuffer-setup-hook #'don/minibuffer-setup-hook)
78   (add-hook 'minibuffer-exit-hook #'don/minibuffer-exit-hook)
79 #+END_SRC
80 * Modules
81 ** Flyspell 🐝 
82 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
83   (use-package flyspell
84     :ensure t
85     :diminish flyspell-mode 🐝
86     :config
87     (add-hook 'message-mode-hook 'turn-on-flyspell)
88     (add-hook 'text-mode-hook 'turn-on-flyspell)
89     (add-hook 'c-mode-common-hook 'flyspell-prog-mode)
90     (add-hook 'cperl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
91     (add-hook 'tcl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
92     :init
93     (setq ispell-program-name "ispell")
94     )
95
96 #+END_SRC
97 ** Winnermode
98 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
99   (winner-mode 1)
100 #+END_SRC
101 ** Eyebrowse
102
103 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
104   ;; (use-package eyebrowse
105   ;;   :ensure t
106   ;;   :diminish eyebrowse-mode
107   ;;   :init (setq eyebrowse-keymap-prefix (kbd "C-c C-\\"))
108   ;;   :config (progn
109   ;;             (setq eyebrowse-wrap-around t)
110   ;;             (eyebrowse-mode t)
111   ;; 
112   ;;             (defun my/eyebrowse-new-window-config ()
113   ;;               (interactive)
114   ;;               (let ((done nil))
115   ;;                 (dotimes (i 10)
116   ;;                   ;; start at 1 run till 0
117   ;;                   (let ((j (mod (+ i 1) 10)))
118   ;;                     (when (and (not done)
119   ;;                                (not (eyebrowse--window-config-present-p j)))
120   ;;                       (eyebrowse-switch-to-window-config j)
121   ;;                       (call-interactively 'eyebrowse-rename-window-config2 j)
122   ;;                       (setq done t)
123   ;;                       ))
124   ;;                   )))
125   ;; 
126   ;;             ;; I don't use latex-preview-pane
127   ;;             ;; (require 'latex-preview-pane)
128   ;;             ;; (defun my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch ()
129   ;;             ;;   ;; latex-preview-pane uses window-parameters which are
130   ;;             ;;   ;; not preserved by eyebrowse, so we close the preview
131   ;;             ;;   ;; pane before switching, it will be regenerated when we
132   ;;             ;;   ;; edit the TeX file.
133   ;;             ;;   (when (lpp/window-containing-preview)
134   ;;             ;;     (delete-window (lpp/window-containing-preview))))
135   ;; 
136   ;;             ;; (add-to-list 'eyebrowse-pre-window-switch-hook
137   ;;             ;;              #'my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch)
138   ;; 
139   ;;             ;; (my/set-menu-key "["  #'my/eyebrowse-new-window-config)
140   ;;             ;; (my/set-menu-key ";"  #'eyebrowse-prev-window-config)
141   ;;             ;; (my/set-menu-key "'"  #'eyebrowse-next-window-config)
142   ;;             ;; (my/set-menu-key "]"  #'eyebrowse-close-window-config)
143   ;;             ;; (my/set-menu-key "\\" #'eyebrowse-rename-window-config)
144   ;;             )
145   ;;   )
146 #+END_SRC
147
148 ** Window handling
149
150 *** Splitting
151 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
152   (defun my/vsplit-last-buffer ()
153     "Split the window vertically and display the previous buffer."
154     (interactive)
155     (split-window-vertically)
156     (other-window 1 nil)
157     (switch-to-next-buffer))
158
159   (defun my/hsplit-last-buffer ()
160     "Split the window horizontally and display the previous buffer."
161     (interactive)
162     (split-window-horizontally)
163     (other-window 1 nil)
164     (switch-to-next-buffer))
165
166   (bind-key "C-x 2" 'my/vsplit-last-buffer)
167   (bind-key "C-x 3" 'my/hsplit-last-buffer)
168
169   (setq split-width-threshold  100)
170   (setq split-height-threshold 60)
171
172   (defun my/split-window-prefer-vertically (window)
173     "If there's only one window (excluding any possibly active
174            minibuffer), then split the current window horizontally."
175     (if (and (one-window-p t)
176              (not (active-minibuffer-window))
177              ( < (frame-width) (frame-height))
178              )
179         (let ((split-width-threshold nil))
180           (split-window-sensibly window))
181       (split-window-sensibly window)))
182
183   (setq split-window-preferred-function #'my/split-window-prefer-vertically)
184   (setq window-combination-resize t)
185 #+END_SRC
186
187 *** Compilation window
188
189 If there is no compilation window, open one at the bottom, spanning
190 the complete width of the frame. Otherwise, reuse existing window. In
191 the former case, if there was no error the window closes
192 automatically.
193
194 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
195   (add-to-list 'display-buffer-alist
196                `(,(rx bos "*compilation*" eos)
197                  (display-buffer-reuse-window
198                   display-buffer-in-side-window)
199                  (reusable-frames . visible)
200                  (side            . bottom)
201                  (window-height   . 0.4)))
202 #+END_SRC
203
204 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
205   (defun my/compilation-exit-autoclose (status code msg)
206     ;; If M-x compile exists with a 0
207     (when (and (eq status 'exit) (zerop code))
208       ;; and delete the *compilation* window
209       (let ((compilation-window (get-buffer-window (get-buffer "*compilation*"))))
210         (when (and (not (window-at-side-p compilation-window 'top))
211                    (window-at-side-p compilation-window 'left)
212                    (window-at-side-p compilation-window 'right))
213           (delete-window compilation-window))))
214     ;; Always return the anticipated result of compilation-exit-message-function
215     (cons msg code))
216
217   ;; Specify my function (maybe I should have done a lambda function)
218   (setq compilation-exit-message-function #'my/compilation-exit-autoclose)
219 #+END_SRC
220
221 If you change the variable ~compilation-scroll-output~ to a ~non-nil~
222 value, the compilation buffer scrolls automatically to follow the
223 output. If the value is ~first-error~, scrolling stops when the first
224 error appears, leaving point at that error. For any other non-nil
225 value, scrolling continues until there is no more output.
226
227 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
228   (setq compilation-scroll-output 'first-error)
229 #+END_SRC
230
231 ** Mode line cleaning
232 *** Diminish
233 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
234   (use-package diminish
235     :ensure t)
236 #+END_SRC
237
238 *** Delight 
239 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
240   (use-package delight
241     :ensure t)
242 #+END_SRC
243
244 ** Jumping
245 *** Avy
246 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
247   (use-package avy
248     :ensure t
249     :bind (("C-c C-<SPC>" . avy-goto-word-or-subword-1)
250            ("C-c j j" . avy-goto-word-or-subword-1)
251            ("M-g g" . avy-goto-line))
252     :config (progn (setq avy-background t))
253     )
254 #+END_SRC
255 *** Ace-link (jumping to links)
256 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
257   (use-package ace-link
258     :ensure t
259     ; bind o in most modes
260     :config (ace-link-setup-default))
261 #+END_SRC
262 *** Jumping through edit points (goto-chg)
263 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
264   (use-package goto-chg
265     :ensure t
266     :bind (("C-c j ," . goto-last-change)
267            ("C-c j ." . goto-last-change-reverse))
268     )
269 #+END_SRC
270 *** Jumping to bookmarks (visible bookmarks, bm)
271 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
272   (use-package bm
273     :ensure t
274     :bind (("C-c j b ." . bm-next)
275            ("C-c j b ," . bm-previous)
276            ("C-c j b SPC" . bm-toggle)))
277 #+END_SRC
278
279 ** Snippets
280 *** Yasnippet
281 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
282   (use-package yasnippet
283     :ensure t
284     :diminish yas-minor-mode
285     :config (progn
286               (yas-global-mode)
287               (setq yas-verbosity 1)
288               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<tab>") nil)
289               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "TAB") nil)
290               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<backtab>") 'yas-expand)
291               (setq yas-snippet-dirs '("~/lib/emacs_el/snippets/"
292                                        "~/lib/emacs_el/yasnippet-snippets/snippets/"))
293               (add-to-list 'hippie-expand-try-functions-list
294                                'yas-hippie-try-expand)
295               )
296     )
297 #+END_SRC
298 *** Auto-YASnippet
299 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
300   (use-package auto-yasnippet
301     :bind (("H-w" . aya-create)
302            ("H-y" . aya-expand)
303            )
304     )
305 #+END_SRC
306 ** Tinyprocmail
307
308 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
309   ;; load tinyprocmail
310   (use-package tinyprocmail
311     :ensure f
312     :config (with-library 'tinyprocmail
313               ;; (setq tinyprocmail--procmail-version "v3.22")
314               (add-hook 'tinyprocmail--load-hook 'tinyprocmail-install))
315   )
316 #+END_SRC
317
318 ** Magit
319 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
320   (use-package magit
321     :ensure t
322     :bind (("C-x g" . magit-status)
323            ("C-x C-g" . magit-status))
324     :config
325     ;; don't verify where we are pushing
326     (setq magit-push-always-verify nil)
327     ;; refine diffs always (hilight words)
328     (setq magit-diff-refine-hunk nil)
329     ;; load magit-annex
330     (setq load-path
331           (append '("~/lib/emacs_el/magit-annex")
332                   load-path))
333     ;; load magit-vcsh
334     (setq load-path
335           (append '("~/lib/emacs_el/magit-vcsh")
336                   load-path))
337     )
338   (use-package magit-annex
339     :ensure t
340   )
341   (use-package magit-vcsh
342     :ensure f ; currently not in melpa, so don't try to install
343   )
344 #+END_SRC
345
346 ** Perl
347 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
348   (use-package cperl-mode
349     :config
350     (progn
351       ;; Use c-mode for perl .xs files
352       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.xs\\'" . c-mode))
353       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\([pP][Llm]\\|al\\)\\'" . cperl-mode))
354       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl" . cperl-mode))
355       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl5" . cperl-mode))
356       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("miniperl" . cperl-mode))
357       (setq cperl-hairy t
358             cperl-indent-level 4
359             cperl-auto-newline nil
360             cperl-auto-newline-after-colon nil
361             cperl-continued-statement-offset 4
362             cperl-brace-offset -1
363             cperl-continued-brace-offset 0
364             cperl-label-offset -4
365             cperl-highlight-variables-indiscriminately t
366             cperl-electric-lbrace-space nil
367             cperl-indent-parens-as-block nil
368             cperl-close-paren-offset -1
369             cperl-tab-always-indent t)
370       ;;(add-hook 'cperl-mode-hook (lambda () (cperl-set-style "PerlStyle")))
371   ))
372 #+END_SRC
373
374 ** Helm
375 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
376   (use-package helm
377     :ensure t
378     :config
379     (helm-mode 1)
380     (define-key global-map [remap find-file] 'helm-find-files)
381     (define-key global-map [remap occur] 'helm-occur)
382     (define-key global-map [remap list-buffers] 'helm-buffers-list)
383     (define-key global-map [remap dabbrev-expand] 'helm-dabbrev)
384     (global-set-key (kbd "M-x") 'helm-M-x)
385     (unless (boundp 'completion-in-region-function)
386       (define-key lisp-interaction-mode-map [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point)
387       (define-key emacs-lisp-mode-map       [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point))
388     (add-hook 'kill-emacs-hook #'(lambda () (and (file-exists-p "$TMP") (delete-file "$TMP"))))
389   )
390 #+END_SRC
391 *** Helm Flx
392
393  [[https://github.com/PythonNut/helm-flx][helm-flx]] implements intelligent helm fuzzy sorting, provided by [[https://github.com/lewang/flx][flx]].
394
395  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
396  (use-package helm-flx
397    :ensure t
398    :config (progn
399              ;; these are helm configs, but they kind of fit here nicely
400              (setq helm-M-x-fuzzy-match                  t
401                    helm-bookmark-show-location           t
402                    helm-buffers-fuzzy-matching           t
403                    helm-completion-in-region-fuzzy-match t
404                    helm-file-cache-fuzzy-match           t
405                    helm-imenu-fuzzy-match                t
406                    helm-mode-fuzzy-match                 t
407                    helm-locate-fuzzy-match               nil
408                    helm-quick-update                     t
409                    helm-recentf-fuzzy-match              nil
410                    helm-semantic-fuzzy-match             t)
411              (helm-flx-mode +1)))
412  #+END_SRC
413 *** Helm Swoop
414 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
415
416   ;;; stolen from https://github.com/malb/emacs.d/blob/master/malb.org
417   (defun malb/helm-swoop-pre-fill ()
418     (thing-at-point 'symbol))
419   (setq malb/helm-swoop-ignore-major-mode '(dired-mode
420         paradox-menu-mode doc-view-mode pdf-view-mode
421         mu4e-headers-mode org-mode markdown-mode latex-mode
422         ein:notebook-multilang-mode))
423
424   (defun malb/swoop-or-search ()
425     (interactive)
426     (if (or (> (buffer-size) 1048576) ;; helm-swoop can be slow on big buffers
427             (memq major-mode malb/helm-swoop-ignore-major-mode))
428         (isearch-forward)
429       (helm-swoop)))
430
431   (use-package helm-swoop
432     :ensure t
433     :bind (("C-c o" . helm-multi-swoop-org)
434            ("C-s" . malb/swoop-or-search)
435            ("C-M-s" . helm-multi-swoop-all))
436     :config (progn
437             
438               (setq helm-swoop-pre-input-function  #'malb/helm-swoop-pre-fill
439                     helm-swoop-split-with-multiple-windows nil
440                     helm-swoop-split-direction #'split-window-horizontally
441                     helm-swoop-split-window-function 'helm-default-display-buffer
442                     helm-swoop-speed-or-color t)
443
444               ;; https://emacs.stackexchange.com/questions/28790/helm-swoop-how-to-make-it-behave-more-like-isearch
445               (defun malb/helm-swoop-C-s ()
446                 (interactive)
447                 (if (boundp 'helm-swoop-pattern)
448                     (if (equal helm-swoop-pattern "")
449                         (previous-history-element 1)
450                       (helm-next-line))
451                   (helm-next-line)))
452
453               (bind-key "C-S-s" #'helm-swoop-from-isearch isearch-mode-map)
454               (bind-key "C-S-s" #'helm-multi-swoop-all-from-helm-swoop helm-swoop-map)
455               (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-swoop-map)
456               (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-swoop-map)
457               (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-multi-swoop-map)
458               (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-multi-swoop-map))
459     )
460   
461 #+END_SRC
462 *** Helm Ag
463 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
464 (use-package helm-ag
465   :ensure t
466   :config (setq helm-ag-base-command "ag --nocolor --nogroup"
467                 helm-ag-command-option "--all-text"
468                 helm-ag-insert-at-point 'symbol
469                 helm-ag-fuzzy-match t
470                 helm-ag-use-temp-buffer t
471                 helm-ag-use-grep-ignore-list t
472                 helm-ag-use-agignore t))
473 #+END_SRC
474 *** Helm Descbinds
475 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
476   (use-package helm-descbinds
477     :ensure t
478     :bind ("C-h b" . helm-descbinds)
479     :init (fset 'describe-bindings 'helm-descbinds))
480 #+END_SRC
481
482 *** Helm YaSnippet
483 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
484   (use-package helm-c-yasnippet
485     :ensure t
486     :bind ("C-c h y" .  helm-yas-complete)
487     :config (progn
488               (setq helm-yas-space-match-any-greedy t)))
489 #+END_SRC
490 *** Helm Org Rifle
491 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
492   (use-package helm-org-rifle
493     :ensure t
494     :config (progn
495               (defun malb/helm-org-rifle-agenda-files (arg)
496                 (interactive "p")
497                 (let ((current-prefix-arg nil))
498                   (cond
499                    ((equal arg 4) (call-interactively #'helm-org-rifle-agenda-files nil))
500                    ((equal arg 16) (helm-org-rifle-occur-agenda-files))
501                    (t (helm-org-agenda-files-headings)))))))
502 #+END_SRC
503
504 ** Hydra
505 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
506 (require 'don-hydra)
507 #+END_SRC
508
509 ** Tramp
510 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
511   (add-to-list 'tramp-methods '("vcsh"
512                                 (tramp-login-program "vcsh")
513                                 (tramp-login-args
514                                  (("enter")
515                                   ("%h")))
516                                 (tramp-remote-shell "/bin/sh")
517                                 (tramp-remote-shell-args
518                                  ("-c"))))
519 #+END_SRC
520 ** Reftex
521 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
522   (use-package reftex
523     :ensure t
524     :config
525     (setq-default reftex-default-bibliography
526                     '("~/projects/research/references.bib")))
527 #+END_SRC
528 ** BibTex
529 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
530   (use-package bibtex
531     :config (setq bibtex-user-optional-fields
532                   (quote (("annote" "Personal annotation (ignored)")
533                           ("abstract" "")
534                   ("pmid" "")
535                   ("doi" ""))))
536     )
537
538 #+END_SRC
539 ** LaTeX
540 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
541   (use-package tex
542     :defer t
543     :ensure auctex
544     :config
545     ; (add-to-list 'TeX-style-path '"/home/don/lib/emacs_el/auctex/style")
546     ;; REFTEX (much enhanced management of cross-ref, labels, etc)
547     ;; http://www.strw.leidenuniv.nl/~dominik/Tools/reftex/
548     ; (autoload 'reftex-mode     "reftex" "RefTeX Minor Mode" t)
549     ; (autoload 'turn-on-reftex  "reftex" "RefTeX Minor Mode" nil)
550     ; (autoload 'reftex-citation "reftex-cite" "Make citation" nil)
551     ; (autoload 'reftex-index-phrase-mode "reftex-index" "Phrase mode" t)
552     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with AUCTeX LaTeX mode
553     (add-hook 'latex-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with Emacs latex mode
554     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with AUCTeX LaTeX mode
555     (add-hook 'latex-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with Emacs latex mode
556
557     (setq-default reftex-plug-into-AUCTeX t)
558     ;; support fake section headers
559     (setq TeX-outline-extra
560           '(("%chapter" 1)
561             ("%section" 2)
562             ("%subsection" 3)
563             ("%subsubsection" 4)
564             ("%paragraph" 5)))
565     ;; add font locking to the headers
566     (font-lock-add-keywords
567      'latex-mode
568      '(("^%\\(chapter\\|\\(sub\\|subsub\\)?section\\|paragraph\\)"
569         0 'font-lock-keyword-face t)
570        ("^%chapter{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-1-face t)
571        ("^%section{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-2-face t)
572        ("^%subsection{\\(.*\\)}"    1 'font-latex-sectioning-3-face t)
573        ("^%subsubsection{\\(.*\\)}" 1 'font-latex-sectioning-4-face t)
574        ("^%paragraph{\\(.*\\)}"     1 'font-latex-sectioning-5-face t)))
575
576     ;; use smart quotes by default instead of `` and ''
577     ;; taken from http://kieranhealy.org/esk/kjhealy.html
578     (setq TeX-open-quote "“")
579     (setq TeX-close-quote "”")
580
581     ;; (TeX-add-style-hook
582     ;;  "latex"
583     ;;  (lambda ()
584     ;;    (TeX-add-symbols
585     ;;     '("DLA" 1))))
586     ;; (custom-set-variables
587     ;;  '(font-latex-user-keyword-classes 
588     ;;    '(("fixme" 
589     ;;       ("DLA" "RZ")
590     ;;       font-lock-function-name-face 2 (command 1 t))))
591     ;; ) 
592     (setq-default TeX-parse-self t)
593     (setq-default TeX-auto-save t)
594     (setq-default TeX-master nil)
595     (eval-after-load
596         "latex"
597       '(TeX-add-style-hook
598         "cleveref"
599         (lambda ()
600           (if (boundp 'reftex-ref-style-alist)
601               (add-to-list
602                'reftex-ref-style-alist
603                '("Cleveref" "cleveref"
604                  (("\\cref" ?c) ("\\Cref" ?C) ("\\cpageref" ?d) ("\\Cpageref" ?D)))))
605           (reftex-ref-style-activate "Cleveref")
606           (TeX-add-symbols
607            '("cref" TeX-arg-ref)
608            '("Cref" TeX-arg-ref)
609            '("cpageref" TeX-arg-ref)
610            '("Cpageref" TeX-arg-ref)))))
611     (eval-after-load
612         "latex"
613       '(add-to-list 'LaTeX-fill-excluded-macros
614                     '("Sexpr")))
615
616     (use-package font-latex
617       :config
618       (setq font-latex-match-reference-keywords
619             '(
620               ("fref" "{")
621               ("Fref" "{")
622               ("citep" "{")
623               ("citet" "{")
624               ("acs" "{")
625               ("acsp" "{")
626               ("ac" "{")
627               ("acp" "{")
628               ("acl" "{")
629               ("aclp" "{")
630               ("acsu" "{")
631               ("aclu" "{")
632               ("acused" "{")
633               ("DLA" "{")
634               ("RZ" "{")
635               ("OM" "{")
636               ("DL" "{")
637               ("fixme" "{"))
638             )
639       )
640     (setq font-latex-fontify-script nil)
641     (setq font-latex-fontify-sectioning (quote color))
642     (setq font-latex-script-display (quote (nil)))
643   )
644
645 #+END_SRC
646 ** ESS
647 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
648   (use-package ess
649     :ensure t
650     :config
651     (defun ess-change-directory (path)
652       "Set the current working directory to PATH for both *R* and Emacs."
653       (interactive "DDirectory to change to: ")
654     
655       (when (file-exists-p path)
656         (ess-command (concat "setwd(\"" path "\")\n"))
657         ;; use file-name-as-directory to ensure it has trailing /
658         (setq default-directory (file-name-as-directory path))))
659     (add-hook 'ess-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
660     ;; outlining support for ess modes
661     (add-hook
662      'ess-mode-hook
663      '(lambda ()
664         (outline-minor-mode)
665         (setq outline-regexp "\\(^#\\{4,5\\} \\)\\|\\(^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function\\)")
666         (defun outline-level ()
667           (cond ((looking-at "^##### ") 1)
668                 ((looking-at "^#### ") 2)
669                 ((looking-at "^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function(.*{") 3)
670                 (t 1000)))
671         ))
672     (add-hook 'ess-mode-hook
673               '(lambda ()
674                  (local-set-key (kbd "C-c C-R")
675                                 'dla/ess-region-remote-eval)))
676
677     ;; Don't restore history or save workspace image
678     '(inferior-R-args "--no-restore-history --no-save")
679     )
680 #+END_SRC
681
682 ** Rainbowmode
683 From http://julien.danjou.info/projects/emacs-packages#rainbow-mode, this colorizes color strings
684
685 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
686   (use-package rainbow-mode
687     ;; add ess to the x major mode
688     :config (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[S])
689     (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[R])
690   )
691 #+END_SRC
692
693 ** Polymode
694 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
695   (use-package polymode
696     :config
697     (use-package poly-R)
698     (use-package poly-noweb)
699     (use-package poly-markdown)
700     :mode ("\\.Snw" . poly-noweb+r-mode)
701     :mode ("\\.Rnw" . poly-noweb+r-mode)
702     :mode ("\\.Rmd" . poly-markdown+r-mode)
703     )
704 #+END_SRC
705
706 ** Outlining
707 *** Outline magic
708 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
709   (use-package outline-magic)
710 #+END_SRC
711 ** Writeroom Mode
712 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
713   (use-package writeroom-mode
714     :config
715     (defun my/writing-mode ()
716       "Start my writing mode; enable visual-line-mode and auto-fill-mode"
717       (interactive)
718       (if writeroom-mode
719           (progn
720             (writeroom-mode -1)
721             (visual-line-mode -1)
722             (auto-fill-mode -1)
723             (visual-fill-column-mode -1)
724             )
725         (visual-line-mode 1)
726         (auto-fill-mode 1)
727         (visual-fill-column-mode 1)
728         (writeroom-mode 1))
729       )
730     )
731 #+END_SRC
732 ** GhostText/Atomic Chrome
733 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
734   (use-package atomic-chrome
735     :config
736     (ignore-errors (atomic-chrome-start-server))
737     (setq atomic-chrome-buffer-open-style 'full)
738     )
739 #+END_SRC
740 ** Multiple Cursors
741    :PROPERTIES:
742    :ID:       6fcf218b-a762-4c37-9339-a8202ddeb544
743    :END:
744 [[https://github.com/magnars/multiple-cursors.el][Multiple Cursors]]
745 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
746   (use-package multiple-cursors
747     :bind (("C-;" . mc/mark-all-dwim)
748            ("C-<" . mc/mark-previous-like-this)
749            ("C->" . mc/mark-next-like-this)
750            ("C-S-c C-S-c" . mc/edit-lines))
751     )
752 #+END_SRC
753 ** Web Mode
754 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
755   (use-package web-mode
756     :config
757     (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.tmpl\\'" . web-mode))
758     (setq web-mode-enable-engine-detection t)
759     (setq web-mode-engines-alist
760           '(("template-toolkit" . "\\.tmpl\\'")))
761     )
762 #+END_SRC
763 * Email
764 ** Message Mode
765 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
766   (use-package post
767     :config
768     (setq post-email-address "don@donarmstrong.com")
769     (setq post-kill-quoted-sig nil)
770     (setq post-mail-message "mutt\\(ng\\|\\)-[a-z0-9]+-[0-9]+-.*")
771     (setq post-uses-fill-mode nil)
772     )
773 #+END_SRC
774 ** Mutt
775 *** Message-mode
776 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
777   (use-package message-mode
778
779     :mode "muttng-[a-z0-9]+-[0-9]+-"
780     :mode "mutt-[a-z0-9]+-[0-9]+-"
781     :hook 'my-message-mode-settings
782     :config 
783     (defun my-message-mode-settings ()
784       (font-lock-add-keywords nil
785                               '(("^[ \t]*>[ \t]*>[ \t]*>.*$"
786                                  (0 'message-multiply-quoted-text-face))
787                                 ("^[ \t]*>[ \t]*>.*$"
788                                  (0 'message-double-quoted-text-face))))
789       (local-set-key (kbd "C-c C-a") 'my-post-attach-file)
790       )
791
792     (defun my-post-attach-file ()
793       "Prompt for an attachment."
794       (interactive)
795       (let ((file (read-file-name "Attach file: " nil nil t nil))
796             (description (string-read "Description: ")))
797         (my-header-attach-file file description)))
798
799     (symbol-function 'my-post-attach-file)
800
801     (defun my-header-attach-file (file description)
802       "Attach a FILE to the current message (works with Mutt).
803     Argument DESCRIPTION MIME description."
804       (interactive "fAttach file: \nsDescription: ")
805       (when (> (length file) 0)
806         (save-excursion
807           (save-match-data
808             (save-restriction
809               (widen)
810               (goto-char (point-min))
811               (search-forward-regexp "^$")
812               (insert (concat "Attach: " (replace-regexp-in-string "\\([[:space:]\\]\\)" "\\\\\\1" (file-truename file)) " "
813                               description "\n"))
814               (message (concat "Attached '" file "'."))
815               (setq post-has-attachment t))))))
816
817
818
819     (setq mail-yank-prefix "> ")
820   )
821 #+END_SRC
822 *** Muttrc mode
823 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
824   (use-package muttrc-mode
825     :mode "muttngrc"
826     :mode "muttrc"
827   )
828
829 #+END_SRC
830 * Org Mode
831 ** Use-package and load things
832 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
833
834   (use-package org
835     :config 
836
837 #+END_SRC
838 ** Agenda Configuration
839 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
840   ;; The following lines are always needed. Choose your own keys.
841   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\(org\\|org_archive\\|txt\\)$" . org-mode))
842   (global-set-key "\C-cl" 'org-store-link)
843   (global-set-key "\C-ca" 'org-agenda)
844   (global-set-key "\C-cb" 'org-iswitchb)
845   (setq-default org-log-done 'time)
846   (setq-default org-agenda-ndays 5)
847
848   ;; agenda configuration
849   ;; Do not dim blocked tasks
850   (setq org-agenda-dim-blocked-tasks nil)
851   (setq org-agenda-inhibit-startup t)
852   (setq org-agenda-use-tag-inheritance nil)
853
854   ;; Compact the block agenda view
855   (setq org-agenda-compact-blocks t)
856
857   ;; Custom agenda command definitions
858   (setq org-agenda-custom-commands
859         (quote (("N" "Notes" tags "NOTE"
860                  ((org-agenda-overriding-header "Notes")
861                   (org-tags-match-list-sublevels t)))
862                 ("h" "Habits" tags-todo "STYLE=\"habit\""
863                  ((org-agenda-overriding-header "Habits")
864                   (org-agenda-sorting-strategy
865                    '(todo-state-down effort-up category-keep))))
866                 (" " "Agenda"
867                  ((agenda "" nil)
868                   (tags "REFILE"
869                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Refile")
870                          (org-tags-match-list-sublevels nil)))
871                   (tags-todo "-CANCELLED/!"
872                              ((org-agenda-overriding-header "Stuck Projects")
873                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-stuck-projects)
874                               (org-agenda-sorting-strategy
875                                '(category-keep))))
876                   (tags-todo "-HOLD-CANCELLED/!"
877                              ((org-agenda-overriding-header "Projects")
878                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-projects)
879                               (org-tags-match-list-sublevels 'indented)
880                               (org-agenda-sorting-strategy
881                                '(category-keep))))
882                   (tags-todo "-CANCELLED/!NEXT"
883                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Next Tasks"
884                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
885                                                                         ""
886                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
887                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-projects-and-habits-and-single-tasks)
888                               (org-tags-match-list-sublevels t)
889                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
890                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
891                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
892                               (org-agenda-sorting-strategy
893                                '(todo-state-down effort-up category-keep))))
894                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
895                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Subtasks"
896                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
897                                                                         ""
898                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
899                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-project-tasks)
900                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
901                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
902                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
903                               (org-agenda-sorting-strategy
904                                '(category-keep))))
905                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
906                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Standalone Tasks"
907                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
908                                                                         ""
909                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
910                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-project-tasks)
911                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
912                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
913                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
914                               (org-agenda-sorting-strategy
915                                '(category-keep))))
916                   (tags-todo "-CANCELLED+WAITING|HOLD/!"
917                              ((org-agenda-overriding-header "Waiting and Postponed Tasks")
918                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-stuck-projects)
919                               (org-tags-match-list-sublevels nil)
920                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled t)
921                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines t)))
922                   (tags "-REFILE/"
923                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Archive")
924                          (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-archivable-tasks)
925                          (org-tags-match-list-sublevels nil))))
926                  nil))))
927
928   ; org mode agenda files
929   (setq org-agenda-files
930         (quote ("~/projects/org-notes/debbugs.org"
931             "~/projects/org-notes/notes.org"
932             "~/projects/org-notes/holidays.org"
933             "~/projects/org-notes/refile.org"
934             "~/projects/org-notes/diary.org"
935             "~/projects/org-notes/ool.org"
936             "~/projects/org-notes/sndservers.org"
937             "~/projects/org-notes/chaim.org"
938             "~/projects/org-notes/wildman.org"
939             "~/projects/org-notes/uddin.org"
940             "~/projects/org-notes/reviews.org"
941             "~/projects/org-notes/hpcbio.org"
942             "~/org-mode/from-mobile.org"
943             "~/projects/org-notes/fh.org")))
944
945   (set-register ?n (cons 'file "~/projects/org-notes/notes.org"))
946   (set-register ?r (cons 'file "~/projects/org-notes/refile.org"))
947   (set-register ?o (cons 'file "~/projects/org-notes/ool.org"))
948   (set-register ?s (cons 'file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
949   (set-register ?c (cons 'file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
950   (set-register ?w (cons 'file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
951   (set-register ?u (cons 'file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
952   (set-register ?R (cons 'file "~/projects/reviews/reviews.org"))
953   (set-register ?d (cons 'file "~/projects/org-notes/diary.org"))
954   ; from https://emacs.stackexchange.com/questions/909/how-can-i-have-an-agenda-timeline-view-of-multiple-files
955   (defun org-agenda-timeline-all (&optional arg)
956     (interactive "P")
957     (with-temp-buffer
958       (dolist (org-agenda-file org-agenda-files)
959         (insert-file-contents org-agenda-file nil)
960         (end-of-buffer)
961         (newline))
962       (write-file "/tmp/timeline.org")
963       (org-agenda arg "L")))
964   (define-key org-mode-map (kbd "C-c t") 'org-agenda-timeline-all)
965   ;; add automatic reminders for appointments
966   (defadvice  org-agenda-redo (after org-agenda-redo-add-appts)
967     "Pressing `r' on the agenda will also add appointments."
968     (progn 
969       (setq appt-time-msg-list nil)
970       (org-agenda-to-appt)))
971
972 #+END_SRC
973 ** General config
974 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
975   (setq org-global-properties '(("Effort_ALL 0 0:10 0:30 1:00 2:00 3:00 4:00 5:00 6:00 7:00")))
976   (setq org-columns-default-format "%40ITEM(Task) %6Effort{:} %CLOCKSUM %PRIORITY %TODO %13SCHEDULED %13DEADLINE %TAGS")
977
978   (setq org-default-notes-file "~/projects/org-notes/notes.org")
979   (setq org-id-link-to-org-use-id 'use-existing)
980 #+END_SRC
981 ** Capture Templates
982 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
983   (setq org-capture-templates  ;; mail-specific note template, identified by "m"
984         '(("m" "Mail" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
985            "* %?\n\n  Source: %u, [[%:link][%:description]]\n  %:initial")
986           ("t" "todo" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
987            "* TODO %?\n  :PROPERTIES:\n  :END:\n  :LOGBOOK:\n  :END:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
988           ("r" "respond" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
989            "* NEXT Respond to %:from on %:subject\nSCHEDULED: %t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t :immediate-finish t)
990           ("n" "note" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
991            "* %? :NOTE:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
992           ("s" "schedule" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
993            "* %? :cal:\n%^{scheduled:}t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
994           ("j" "Journal" entry (file+datetree "~/projects/org-notes/diary.org")
995            "* %?\n%U\n" :clock-in t :clock-resume t)
996           ("w" "org-protocol" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
997            "* TODO Review %c\n%U\n" :immediate-finish t)
998           ("M" "Meeting" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
999            "* MEETING with %? :MEETING:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1000           ("S" "Seminar" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1001            "* SEMINAR notes %? :SEMINAR:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1002           ("P" "Paper to read" entry (file+headline "~/projects/research/papers_to_read.org" "Refile")
1003            "* TODO Get/Read %? \n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1004           ("p" "Phone call" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1005            "* PHONE %? :PHONE:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1006           ("J" "job" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1007            "* TODO Apply for %a%? :job:\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d 17:00-17:30>\")\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1008           ("h" "Habit" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1009            "* NEXT %?\n%U\n%a\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d .+1d/3d>\")\n:PROPERTIES:\n:STYLE: habit\n:REPEAT_TO_STATE: NEXT\n:END:\n%a\n")
1010           )
1011         )
1012
1013   ;; Remove empty LOGBOOK drawers on clock out
1014   (defun bh/remove-empty-drawer-on-clock-out ()
1015     (interactive)
1016     (save-excursion
1017       (beginning-of-line 0)
1018       (org-remove-empty-drawer-at (point))))
1019
1020   (defun my/org-add-id ()
1021     (interactive)
1022     (save-excursion
1023       (if (org-current-level)
1024           ()
1025         (forward-char 1)
1026         )
1027       (org-id-get-create)
1028       )
1029   )
1030
1031 #+END_SRC
1032 ** Org mode key bindings
1033 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1034   ; org mode configuration from http://doc.norang.ca/org-mode.html
1035   ;; Custom Key Bindings
1036   (global-set-key (kbd "<f12>") 'org-agenda)
1037   (global-set-key (kbd "<f5>") 'bh/org-todo)
1038   (global-set-key (kbd "<S-f5>") 'bh/widen)
1039   (global-set-key (kbd "<f7>") 'bh/set-truncate-lines)
1040   (global-set-key (kbd "<f8>") 'org-cycle-agenda-files)
1041   (global-set-key (kbd "<f9> <f9>") 'bh/show-org-agenda)
1042   (global-set-key (kbd "<f9> b") 'bbdb)
1043   (global-set-key (kbd "<f9> c") 'calendar)
1044   (global-set-key (kbd "<f9> f") 'boxquote-insert-file)
1045   (global-set-key (kbd "<f9> h") 'bh/hide-other)
1046   (global-set-key (kbd "<f9> n") 'bh/toggle-next-task-display)
1047   (global-set-key (kbd "<f9> w") 'widen)
1048
1049   ; change the outline mode prefix from C-c @ to C-c C-2
1050   (setq outline-minor-mode-prefix "C-c C-2")
1051   ;(add-hook 'outline-minor-mode-hook
1052   ;          (lambda () (local-set-key (kbd "C-c C-2")
1053   ;                                    outline-mode-prefix-map)))
1054
1055   (global-set-key (kbd "<f9> I") 'bh/punch-in)
1056   (global-set-key (kbd "<f9> O") 'bh/punch-out)
1057
1058   (global-set-key (kbd "<f9> o") 'bh/make-org-scratch)
1059
1060   (global-set-key (kbd "<f9> r") 'boxquote-region)
1061   (global-set-key (kbd "<f9> s") 'bh/switch-to-scratch)
1062
1063   (global-set-key (kbd "<f9> t") 'bh/insert-inactive-timestamp)
1064   (global-set-key (kbd "<f9> T") 'bh/toggle-insert-inactive-timestamp)
1065
1066   (global-set-key (kbd "<f9> v") 'visible-mode)
1067   (global-set-key (kbd "<f9> l") 'org-toggle-link-display)
1068   (global-set-key (kbd "<f9> SPC") 'bh/clock-in-last-task)
1069   (global-set-key (kbd "C-<f9>") 'previous-buffer)
1070   (global-set-key (kbd "M-<f9>") 'org-toggle-inline-images)
1071   (global-set-key (kbd "C-x n r") 'narrow-to-region)
1072   (global-set-key (kbd "C-<f10>") 'next-buffer)
1073   (global-set-key (kbd "<f11>") 'org-clock-goto)
1074   (global-set-key (kbd "C-<f11>") 'org-clock-in)
1075   (global-set-key (kbd "C-s-<f12>") 'bh/save-then-publish)
1076   (global-set-key (kbd "C-c c") 'org-capture)
1077
1078 #+END_SRC
1079 ** Utility Functions
1080 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1081   (defun bh/hide-other ()
1082     (interactive)
1083     (save-excursion
1084       (org-back-to-heading 'invisible-ok)
1085       (hide-other)
1086       (org-cycle)
1087       (org-cycle)
1088       (org-cycle)))
1089
1090   (defun bh/set-truncate-lines ()
1091     "Toggle value of truncate-lines and refresh window display."
1092     (interactive)
1093     (setq truncate-lines (not truncate-lines))
1094     ;; now refresh window display (an idiom from simple.el):
1095     (save-excursion
1096       (set-window-start (selected-window)
1097                         (window-start (selected-window)))))
1098
1099   (defun bh/make-org-scratch ()
1100     (interactive)
1101     (find-file "/tmp/publish/scratch.org")
1102     (gnus-make-directory "/tmp/publish"))
1103
1104   (defun bh/switch-to-scratch ()
1105     (interactive)
1106     (switch-to-buffer "*scratch*"))
1107
1108   (setq org-use-fast-todo-selection t)
1109   (setq org-treat-S-cursor-todo-selection-as-state-change nil)
1110
1111   ; create function to create headlines in file. This comes from
1112   ; http://stackoverflow.com/questions/13340616/assign-ids-to-every-entry-in-org-mode
1113   (defun my/org-add-ids-to-headlines-in-file ()
1114     "Add ID properties to all headlines in the current file which
1115   do not already have one."
1116     (interactive)
1117     (org-map-entries 'org-id-get-create))
1118   ; if we wanted to do this to every buffer, do the following:
1119   ; (add-hook 'org-mode-hook
1120   ;           (lambda ()
1121   ;             (add-hook 'before-save-hook 'my/org-add-ids-to-headlines-in-file nil 'local)))
1122 #+END_SRC
1123 ** Keywords (TODO)
1124 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1125   (setq org-todo-keywords
1126         (quote ((sequence "TODO(t)" "NEXT(n)" "|" "DONE(d)")
1127                 (sequence "WAITING(w@/!)" "HOLD(h@/!)" "|" "CANCELLED(c@/!)" "PHONE" "MEETING"))))
1128
1129   (setq org-todo-keyword-faces
1130         (quote (("TODO" :foreground "red" :weight bold)
1131                 ("NEXT" :foreground "blue" :weight bold)
1132                 ("DONE" :foreground "forest green" :weight bold)
1133                 ("WAITING" :foreground "orange" :weight bold)
1134                 ("HOLD" :foreground "magenta" :weight bold)
1135                 ("CANCELLED" :foreground "forest green" :weight bold)
1136                 ("MEETING" :foreground "forest green" :weight bold)
1137                 ("PHONE" :foreground "forest green" :weight bold))))
1138
1139   (setq org-todo-state-tags-triggers
1140         (quote (("CANCELLED" ("CANCELLED" . t))
1141                 ("WAITING" ("WAITING" . t))
1142                 ("HOLD" ("WAITING") ("HOLD" . t))
1143                 (done ("WAITING") ("HOLD"))
1144                 ("TODO" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1145                 ("NEXT" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1146                 ("DONE" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD")))))
1147
1148
1149
1150   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/remove-empty-drawer-on-clock-out 'append)
1151   ; add ids on creation of nodes
1152   (add-hook 'org-capture-prepare-finalize-hook 'my/org-add-id)
1153
1154
1155   ; resolve clocks after 10 minutes of idle; use xprintidle
1156   ; (setq org-clock-idle-time 10)
1157   ; (setq org-clock-x11idle-program-name "xprintidle")
1158
1159   ; this is from http://doc.norang.ca/org-mode.html#Capture
1160   ; use C-M-r for org mode capture
1161   (global-set-key (kbd "C-M-r") 'org-capture)
1162
1163   ; Targets include this file and any file contributing to the agenda - up to 9 levels deep
1164   (setq org-refile-targets (quote ((nil :maxlevel . 9)
1165                                    (org-agenda-files :maxlevel . 9))))
1166
1167   ; Use full outline paths for refile targets - we file directly with IDO
1168   (setq org-refile-use-outline-path t)
1169
1170   ; Targets complete directly with IDO
1171   (setq org-outline-path-complete-in-steps nil)
1172
1173   ; Allow refile to create parent tasks with confirmation
1174   (setq org-refile-allow-creating-parent-nodes (quote confirm))
1175
1176   ; ; Use IDO for both buffer and file completion and ido-everywhere to t
1177   ; (setq org-completion-use-ido t)
1178   ; (setq ido-everywhere t)
1179   ; (setq ido-max-directory-size 100000)
1180   ; (ido-mode (quote both))
1181   ; ; Use the current window when visiting files and buffers with ido
1182   ; (setq ido-default-file-method 'selected-window)
1183   ; (setq ido-default-buffer-method 'selected-window)
1184   ; ; Use the current window for indirect buffer display
1185   ; (setq org-indirect-buffer-display 'current-window)
1186
1187
1188   ;;;; Refile settings
1189   ; Exclude DONE state tasks from refile targets
1190   (defun bh/verify-refile-target ()
1191     "Exclude todo keywords with a done state from refile targets"
1192     (not (member (nth 2 (org-heading-components)) org-done-keywords)))
1193
1194   (setq org-refile-target-verify-function 'bh/verify-refile-target)
1195
1196   ;; ensure that emacsclient will show just the note to be edited when invoked
1197   ;; from Mutt, and that it will shut down emacsclient once finished;
1198   ;; fallback to legacy behavior when not invoked via org-protocol.
1199   (require 'org-protocol)
1200   ; (add-hook 'org-capture-mode-hook 'delete-other-windows)
1201   (setq my-org-protocol-flag nil)
1202   (defadvice org-capture-finalize (after delete-frame-at-end activate)
1203     "Delete frame at remember finalization"
1204     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1205            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1206   (defadvice org-capture-refile (around delete-frame-after-refile activate)
1207     "Delete frame at remember refile"
1208     (if my-org-protocol-flag
1209         (progn
1210           (setq my-org-protocol-flag nil)
1211           ad-do-it
1212           (delete-frame))
1213       ad-do-it)
1214     )
1215   (defadvice org-capture-kill (after delete-frame-at-end activate)
1216     "Delete frame at remember abort"
1217     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1218            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1219   (defadvice org-protocol-capture (before set-org-protocol-flag activate)
1220     (setq my-org-protocol-flag t))
1221
1222   (defadvice org-insert-todo-heading (after dla/create-id activate)
1223     (org-id-get-create)
1224     )
1225
1226   ;; org modules
1227   (add-to-list 'org-modules 'org-habit)
1228
1229   ; this comes from http://upsilon.cc/~zack/blog/posts/2010/02/integrating_Mutt_with_Org-mode/
1230   (defun open-mail-in-mutt (message)
1231     "Open a mail message in Mutt, using an external terminal.
1232
1233   Message can be specified either by a path pointing inside a
1234   Maildir, or by Message-ID."
1235     (interactive "MPath or Message-ID: ")
1236     (shell-command
1237      (format "faf xterm -e \"%s %s\""
1238          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/mutt_open") message)))
1239
1240   ;; add support for "mutt:ID" links
1241   (org-add-link-type "mutt" 'open-mail-in-mutt)
1242
1243   (defun my-org-mode-setup ()
1244     ; (load-library "reftex")
1245     (and (buffer-file-name)
1246          (file-exists-p (buffer-file-name))
1247          (progn
1248            ; (reftex-parse-all)
1249            (reftex-set-cite-format
1250             '((?b . "[[bib:%l][%l-bib]]")
1251               (?n . "[[notes:%l][%l-notes]]")
1252               (?c . "\\cite{%l}")
1253               (?h . "*** %t\n:PROPERTIES:\n:Custom_ID: %l\n:END:\n[[papers:%l][%l xoj]] [[papers-pdf:%l][pdf]]")))
1254            ))
1255     (define-key org-mode-map (kbd "C-c )") 'reftex-citation)
1256     (define-key org-mode-map (kbd "C-c [") 'reftex-citation)
1257     (define-key org-mode-map (kbd "C-c (") 'org-mode-reftex-search)
1258     (define-key org-mode-map (kbd "C-c 0") 'reftex-view-crossref)
1259     )
1260   (add-hook 'org-mode-hook 'my-org-mode-setup)
1261
1262   (defun org-mode-reftex-search ()
1263     (interactive)
1264     (org-open-link-from-string (format "[[notes:%s]]" (first (reftex-citation t)))))
1265
1266   (defun open-research-paper (bibtexkey)
1267     "Open a paper by bibtex key"
1268     (interactive "bibtex key: ")
1269     (shell-command
1270      (format "%s %s"
1271          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1272   (org-add-link-type "papers" 'open-research-paper)
1273   (defun open-research-paper-pdf (bibtexkey)
1274     "Open a paper pdf by bibtex key"
1275     (interactive "bibtex key: ")
1276     (shell-command
1277      (format "%s -p evince_annot %s"
1278          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1279   (org-add-link-type "papers-pdf" 'open-research-paper-pdf)
1280
1281   (add-to-list 'org-link-abbrev-alist
1282                '("notes" .
1283                  "~/projects/research/paper_notes.org::#%s"))
1284
1285   ; I pretty much always want hiearchical checkboxes
1286   (setq org-hierachical-checkbox-statistics nil)
1287
1288   ;; Add \begin{equation}\end{equation} templates to the org mode easy templates
1289   (add-to-list 'org-structure-template-alist
1290                '("E" "\\begin{equation}\n?\n\\end{equation}"))
1291
1292    ;; stolen from
1293   ;; http://www-public.it-sudparis.eu/~berger_o/weblog/2012/03/23/how-to-manage-and-export-bibliographic-notesrefs-in-org-mode/
1294   (defun my-rtcite-export-handler (path desc format)
1295     (message "my-rtcite-export-handler is called : path = %s, desc = %s, format = %s" path desc format)
1296     (let* ((search (when (string-match "::#?\\(.+\\)\\'" path)
1297                      (match-string 1 path)))
1298            (path (substring path 0 (match-beginning 0))))
1299       (cond ((eq format 'latex)
1300              (if (or (not desc) 
1301                      (equal 0 (search "rtcite:" desc)))
1302                  (format "\\cite{%s}" search)
1303                (format "\\cite[%s]{%s}" desc search))))))
1304
1305   (org-add-link-type "rtcite" 
1306                      'org-bibtex-open
1307                      'my-rtcite-export-handler)
1308
1309
1310 #+END_SRC
1311 ** Org Mobile Configuration
1312 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1313   (setq-default org-mobile-directory "/linnode.donarmstrong.com:/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/")
1314   (when (string= system-name "linnode")
1315     (setq-default org-mobile-directory "/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/"))
1316   (setq-default org-directory "/home/don/org-mode/")
1317   (setq-default org-mobile-inbox-for-pull "/home/don/org-mode/from-mobile.org")
1318
1319 #+END_SRC
1320 ** Org iCal Support
1321 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1322   ;; org mode ical export
1323   (setq org-icalendar-timezone "America/Los_Angeles")
1324   (setq org-icalendar-use-scheduled '(todo-start event-if-todo))
1325   ;; we already add the id manually
1326   (setq org-icalendar-store-UID t)
1327
1328 #+END_SRC
1329 ** General Org Babel Configuration
1330 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1331   ;; org babel support
1332   (org-babel-do-load-languages
1333    'org-babel-load-languages
1334    '((emacs-lisp . t )
1335      (R . t)
1336      (latex . t)
1337      (ditaa . t)
1338      (dot . t)
1339      ))
1340   ;; use graphviz-dot for dot things
1341   (add-to-list 'org-src-lang-modes '("dot" . graphviz-dot))
1342   ;; org-babel-by-backend
1343   (defmacro org-babel-by-backend (&rest body)
1344      `(case (if (boundp 'backend) 
1345                 (org-export-backend-name backend)
1346               nil) ,@body))
1347
1348   (defun my/fix-inline-images ()
1349     (when org-inline-image-overlays
1350       (org-redisplay-inline-images)))
1351
1352   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook
1353              'my/fix-inline-images)
1354
1355 #+END_SRC
1356 ** LaTeX configuration
1357    :PROPERTIES:
1358    :ID:       7135ba17-6a50-4eed-84ca-b90afa5b12f8
1359    :END:
1360 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1361   (require 'ox-latex)
1362   (add-to-list 'org-latex-classes
1363            '("memarticle"
1364          "\\documentclass[11pt,oneside,article]{memoir}\n"
1365          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1366          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1367          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1368          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1369          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1370
1371   (setq org-beamer-outline-frame-options "")
1372   (add-to-list 'org-latex-classes
1373            '("beamer"
1374          "\\documentclass[ignorenonframetext]{beamer}
1375   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1376   [PACKAGES]
1377   [EXTRA]"
1378          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1379          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1380          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1381          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1382          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1383
1384   (add-to-list 'org-latex-classes
1385            '("membook"
1386          "\\documentclass[11pt,oneside]{memoir}\n"
1387          ("\\chapter{%s}" . "\\chapter*{%s}")
1388          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1389          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1390          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")))
1391
1392   (add-to-list 'org-latex-classes
1393            '("letter"
1394          "\\documentclass[11pt]{letter}
1395   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1396   [PACKAGES]
1397   [EXTRA]"
1398      ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1399          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1400          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1401          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1402          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1403
1404   (add-to-list 'org-latex-classes
1405            '("dlacv"
1406          "\\documentclass{dlacv}
1407   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1408   [NO-PACKAGES]
1409   [NO-EXTRA]"
1410          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1411          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1412          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1413          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1414          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1415
1416
1417   (add-to-list 'org-latex-classes
1418            '("dlaresume"
1419          "\\documentclass{dlaresume}
1420   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1421   [NO-PACKAGES]
1422   [NO-EXTRA]"
1423          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1424          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1425          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1426          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1427          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1428
1429
1430   ;; Originally taken from Bruno Tavernier: http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/31150/focus=31432
1431   ;; but adapted to use latexmk 4.22 or higher.  
1432   (setq org-latex-pdf-process '("latexmk -f -pdflatex=xelatex -bibtex -use-make -pdf %f"))
1433
1434   ;; Default packages included in /every/ tex file, latex, pdflatex or xelatex
1435   (setq org-latex-default-packages-alist
1436     '(("" "amsmath" t)
1437       ("" "unicode-math" t)
1438       ))
1439   (setq org-latex-packages-alist
1440     '(("" "graphicx" t)
1441       ("" "fontspec" t)
1442       ("" "xunicode" t)
1443       ("" "hyperref" t)
1444       ("" "url" t)
1445       ("" "rotating" t)
1446       ("" "longtable" nil)
1447       ("" "float" )))
1448
1449   ;; make equations larger
1450   (setq org-format-latex-options (plist-put org-format-latex-options :scale 2.0))
1451
1452   (defun org-create-formula--latex-header ()
1453     "Return LaTeX header appropriate for previewing a LaTeX snippet."
1454     (let ((info (org-combine-plists (org-export--get-global-options
1455              (org-export-get-backend 'latex))
1456             (org-export--get-inbuffer-options
1457              (org-export-get-backend 'latex)))))
1458       (org-latex-guess-babel-language
1459        (org-latex-guess-inputenc
1460     (org-splice-latex-header
1461      org-format-latex-header
1462      org-latex-default-packages-alist
1463      nil t
1464      (plist-get info :latex-header)))
1465        info)))
1466
1467
1468   ; support ignoring headers in org mode export to latex
1469   ; from http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/67692
1470   (defadvice org-latex-headline (around my-latex-skip-headlines
1471                     (headline contents info) activate)
1472     (if (member "ignoreheading" (org-element-property :tags headline))
1473     (setq ad-return-value contents)
1474       ad-do-it))
1475
1476   ;; keep latex logfiles
1477
1478   (setq org-latex-remove-logfiles nil)
1479
1480   ;; Resume clocking task when emacs is restarted
1481   (org-clock-persistence-insinuate)
1482   ;;
1483   ;; Show lot of clocking history so it's easy to pick items off the C-F11 list
1484   (setq org-clock-history-length 23)
1485   ;; Resume clocking task on clock-in if the clock is open
1486   (setq org-clock-in-resume t)
1487   ;; Change tasks to NEXT when clocking in; this avoids clocking in when
1488   ;; there are things like PHONE calls
1489   (setq org-clock-in-switch-to-state 'bh/clock-in-to-next)
1490   ;; Separate drawers for clocking and logs
1491   (setq org-drawers (quote ("PROPERTIES" "LOGBOOK")))
1492   ;; Save clock data and state changes and notes in the LOGBOOK drawer
1493   (setq org-clock-into-drawer t)
1494   (setq org-log-into-drawer t)
1495   ;; Sometimes I change tasks I'm clocking quickly - this removes clocked tasks with 0:00 duration
1496   (setq org-clock-out-remove-zero-time-clocks t)
1497   ;; Clock out when moving task to a done state
1498   (setq org-clock-out-when-done t)
1499   ;; Save the running clock and all clock history when exiting Emacs, load it on startup
1500   (setq org-clock-persist t)
1501   ;; Do not prompt to resume an active clock
1502   (setq org-clock-persist-query-resume nil)
1503   ;; Enable auto clock resolution for finding open clocks
1504   (setq org-clock-auto-clock-resolution (quote when-no-clock-is-running))
1505   ;; Include current clocking task in clock reports
1506   (setq org-clock-report-include-clocking-task t)
1507
1508   ;; the cache seems to be broken
1509   (setq org-element-use-cache nil)
1510
1511   (defvar bh/keep-clock-running nil)
1512
1513   (defun bh/is-task-p ()
1514     "Any task with a todo keyword and no subtask"
1515     (save-restriction
1516       (widen)
1517       (let ((has-subtask)
1518             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1519             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1520         (save-excursion
1521           (forward-line 1)
1522           (while (and (not has-subtask)
1523                       (< (point) subtree-end)
1524                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1525             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1526               (setq has-subtask t))))
1527         (and is-a-task (not has-subtask)))))
1528   (defun bh/is-project-p ()
1529     "Any task with a todo keyword subtask"
1530     (save-restriction
1531       (widen)
1532       (let ((has-subtask)
1533             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1534             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1535         (save-excursion
1536           (forward-line 1)
1537           (while (and (not has-subtask)
1538                       (< (point) subtree-end)
1539                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1540             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1541               (setq has-subtask t))))
1542         (and is-a-task has-subtask))))
1543
1544   (defun bh/is-subproject-p ()
1545     "Any task which is a subtask of another project"
1546     (let ((is-subproject)
1547           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1548       (save-excursion
1549         (while (and (not is-subproject) (org-up-heading-safe))
1550           (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1551             (setq is-subproject t))))
1552       (and is-a-task is-subproject)))
1553
1554
1555   (defun bh/clock-in-to-next (kw)
1556     "Switch a task from TODO to NEXT when clocking in.
1557   Skips capture tasks, projects, and subprojects.
1558   Switch projects and subprojects from NEXT back to TODO"
1559     (when (not (and (boundp 'org-capture-mode) org-capture-mode))
1560       (cond
1561        ((and (member (org-get-todo-state) (list "TODO"))
1562          (bh/is-task-p))
1563     "NEXT")
1564        ((and (member (org-get-todo-state) (list "NEXT"))
1565          (bh/is-project-p))
1566     "TODO"))))
1567
1568   (defun bh/punch-in (arg)
1569     "Start continuous clocking and set the default task to the
1570   selected task.  If no task is selected set the Organization task
1571   as the default task."
1572     (interactive "p")
1573     (setq bh/keep-clock-running t)
1574     (if (equal major-mode 'org-agenda-mode)
1575     ;;
1576     ;; We're in the agenda
1577     ;;
1578     (let* ((marker (org-get-at-bol 'org-hd-marker))
1579            (tags (org-with-point-at marker (org-get-tags-at))))
1580       (if (and (eq arg 4) tags)
1581           (org-agenda-clock-in '(16))
1582         (bh/clock-in-organization-task-as-default)))
1583       ;;
1584       ;; We are not in the agenda
1585       ;;
1586       (save-restriction
1587     (widen)
1588     ; Find the tags on the current task
1589     (if (and (equal major-mode 'org-mode) (not (org-before-first-heading-p)) (eq arg 4))
1590         (org-clock-in '(16))
1591       (bh/clock-in-organization-task-as-default)))))
1592
1593   (defun bh/punch-out ()
1594     (interactive)
1595     (setq bh/keep-clock-running nil)
1596     (when (org-clock-is-active)
1597       (org-clock-out))
1598     (org-agenda-remove-restriction-lock))
1599
1600   (defun bh/clock-in-default-task ()
1601     (save-excursion
1602       (org-with-point-at org-clock-default-task
1603     (org-clock-in))))
1604
1605   (defun bh/clock-in-parent-task ()
1606     "Move point to the parent (project) task if any and clock in"
1607     (let ((parent-task))
1608       (save-excursion
1609     (save-restriction
1610       (widen)
1611       (while (and (not parent-task) (org-up-heading-safe))
1612         (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1613           (setq parent-task (point))))
1614       (if parent-task
1615           (org-with-point-at parent-task
1616         (org-clock-in))
1617         (when bh/keep-clock-running
1618           (bh/clock-in-default-task)))))))
1619
1620   (defvar bh/organization-task-id "e22cb8bf-07c7-408b-8f60-ff3aadac95e4")
1621
1622   (defun bh/clock-in-organization-task-as-default ()
1623     (interactive)
1624     (org-with-point-at (org-id-find bh/organization-task-id 'marker)
1625       (org-clock-in '(16))))
1626
1627   (defun bh/clock-out-maybe ()
1628     (when (and bh/keep-clock-running
1629            (not org-clock-clocking-in)
1630            (marker-buffer org-clock-default-task)
1631            (not org-clock-resolving-clocks-due-to-idleness))
1632       (bh/clock-in-parent-task)))
1633
1634   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/clock-out-maybe 'append)
1635
1636   (require 'org-id)
1637   (defun bh/clock-in-task-by-id (id)
1638     "Clock in a task by id"
1639     (org-with-point-at (org-id-find id 'marker)
1640       (org-clock-in nil)))
1641
1642   (defun bh/clock-in-last-task (arg)
1643     "Clock in the interrupted task if there is one
1644   Skip the default task and get the next one.
1645   A prefix arg forces clock in of the default task."
1646     (interactive "p")
1647     (let ((clock-in-to-task
1648        (cond
1649         ((eq arg 4) org-clock-default-task)
1650         ((and (org-clock-is-active)
1651           (equal org-clock-default-task (cadr org-clock-history)))
1652          (caddr org-clock-history))
1653         ((org-clock-is-active) (cadr org-clock-history))
1654         ((equal org-clock-default-task (car org-clock-history)) (cadr org-clock-history))
1655         (t (car org-clock-history)))))
1656       (widen)
1657       (org-with-point-at clock-in-to-task
1658     (org-clock-in nil))))
1659
1660
1661   (defun org-export-to-ods ()
1662     (interactive)
1663     (let ((csv-file "data.csv"))
1664       (org-table-export csv-file "orgtbl-to-csv")
1665       (org-odt-convert csv-file "ods" 'open)))
1666
1667   ; allow for zero-width-space to be a break in regexp too
1668   ; (setcar org-emphasis-regexp-components "​ [:space:] \t('\"{")
1669   ; (setcar (nthcdr 1 org-emphasis-regexp-components) "​ [:space:]- \t.,:!?;'\")}\\")
1670   ; (org-set-emph-re 'org-emphasis-regexp-components org-emphasis-regexp-components)
1671
1672   ;; support inserting screen shots
1673   (defun my/org-insert-screenshot ()
1674     "Take a screenshot into a time stamped unique-named file in the
1675   same directory as the org-buffer and insert a link to this file."
1676     (interactive)
1677     (defvar my/org-insert-screenshot/filename)
1678     (setq my/org-insert-screenshot/filename
1679       (read-file-name
1680        "Screenshot to insert: "
1681        nil
1682        (concat (buffer-file-name) "_" (format-time-string "%Y%m%d_%H%M%S") ".png")
1683        )
1684       )
1685     (call-process "import" nil nil nil my/org-insert-screenshot/filename)
1686     (insert (concat "[[" my/org-insert-screenshot/filename "]]"))
1687     (org-display-inline-images))
1688
1689   (defun my/fix-inline-images ()
1690     (when org-inline-image-overlays
1691       (org-redisplay-inline-images)))
1692
1693   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook 'my/fix-inline-images)
1694
1695   ;; use xelatex to preview with imagemagick
1696   (add-to-list 'org-preview-latex-process-alist
1697            '(xelateximagemagick
1698         :programs ("xelatex" "convert")
1699         :description "pdf > png"
1700         :message "you need to install xelatex and imagemagick"
1701         :use-xcolor t
1702         :image-input-type "pdf"
1703         :image-output-type "png"
1704         :image-size-adjust (1.0 . 1.0)
1705         :latex-compiler ("xelatex -interaction nonstopmode -output-directory %o %f")
1706         :image-converter ("convert -density %D -trim -antialias %f -quality 100 %O"))
1707            )
1708   ;; use xelatex by default
1709   (setq org-preview-latex-default-process 'xelateximagemagick)
1710
1711   ; from http://orgmode.org/Changes.html
1712   (defun my/org-repair-property-drawers ()
1713     "Fix properties drawers in current buffer.
1714    Ignore non Org buffers."
1715     (interactive)
1716     (when (eq major-mode 'org-mode)
1717       (org-with-wide-buffer
1718        (goto-char (point-min))
1719        (let ((case-fold-search t)
1720          (inline-re (and (featurep 'org-inlinetask)
1721                  (concat (org-inlinetask-outline-regexp)
1722                      "END[ \t]*$"))))
1723      (org-map-entries
1724       (lambda ()
1725         (unless (and inline-re (org-looking-at-p inline-re))
1726           (save-excursion
1727         (let ((end (save-excursion (outline-next-heading) (point))))
1728           (forward-line)
1729           (when (org-looking-at-p org-planning-line-re) (forward-line))
1730           (when (and (< (point) end)
1731                  (not (org-looking-at-p org-property-drawer-re))
1732                  (save-excursion
1733                    (and (re-search-forward org-property-drawer-re end t)
1734                     (eq (org-element-type
1735                      (save-match-data (org-element-at-point)))
1736                     'drawer))))
1737             (insert (delete-and-extract-region
1738                  (match-beginning 0)
1739                  (min (1+ (match-end 0)) end)))
1740             (unless (bolp) (insert "\n"))))))))))))
1741
1742 #+END_SRC
1743 ** Org-Gcal
1744 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1745   (use-package calfw
1746     :ensure f
1747     )
1748   (use-package calfw-org
1749     :ensure f
1750     )
1751   (use-package org-gcal
1752     :ensure f
1753     :config '((if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
1754                   (load-file "~/.hide/org_gcal.el"))
1755               )
1756     )
1757 #+END_SRC
1758 ** End use-package
1759 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1760   )
1761 #+END_SRC
1762 * Keybindings
1763 ** Override other things
1764 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1765   ; apparently things like to step on C-;, so we'll use a hack from
1766   ; http://stackoverflow.com/questions/683425/globally-override-key-binding-in-emacs/5340797#5340797 to fix this
1767
1768   (defvar my-keys-minor-mode-map (make-keymap) "my-keys-minor-mode keymap.")
1769
1770   ; use mc everywhere
1771   (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'mc/mark-all-dwim)
1772   ;; use outline mode keybindings everywhere
1773   ;; (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'my/mydra-outline/body)
1774
1775   (define-minor-mode my-keys-minor-mode
1776     "A minor mode so that my key settings override annoying major modes."
1777     t " my-keys" 'my-keys-minor-mode-map)
1778
1779   (my-keys-minor-mode 1)
1780   (defun my-minibuffer-setup-hook ()
1781     (my-keys-minor-mode 0))
1782
1783   (add-hook 'minibuffer-setup-hook 'my-minibuffer-setup-hook)
1784   (defadvice load (after give-my-keybindings-priority)
1785     "Try to ensure that my keybindings always have priority."
1786     (if (not (eq (car (car minor-mode-map-alist)) 'my-keys-minor-mode))
1787         (let ((mykeys (assq 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)))
1788           (assq-delete-all 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)
1789           (add-to-list 'minor-mode-map-alist mykeys))))
1790   (ad-activate 'load)
1791 #+END_SRC
1792 ** Goto line
1793 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1794   (global-unset-key "\M-g")
1795   (global-set-key (kbd "M-g l") 'goto-line)
1796 #+END_SRC
1797 * Misc (uncharacterized)
1798 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1799   (setq calendar-latitude 40.11)
1800   (setq calendar-longitude -88.24)
1801   (setq case-fold-search t)
1802   (setq confirm-kill-emacs (quote y-or-n-p))
1803   (setq cperl-lazy-help-time nil)
1804   (setq debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
1805   (display-time)
1806   (setq display-time-24hr-format t)
1807   (setq display-time-day-and-date t)
1808   (display-time-mode 1)
1809   (global-auto-revert-mode 1)
1810   (global-font-lock-mode 1)
1811   (icomplete-mode 1)
1812   (setq log-edit-keep-buffer t)
1813   (setq mail-user-agent (quote sendmail-user-agent))
1814   (setq markdown-enable-math t)
1815   (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
1816   (setq mutt-alias-file-list (quote ("~/.mutt/aliases" "~/.mail_aliases")))
1817   (setq ps-footer-font-size (quote (8 . 10)))
1818   (setq ps-header-font-size (quote (8 . 10)))
1819   (setq ps-header-title-font-size (quote (10 . 10)))
1820   (setq ps-line-number-color "blue")
1821   (setq ps-print-footer t)
1822   (setq ps-print-footer-frame nil)
1823   (setq ps-print-only-one-header t)
1824   (setq sentence-end "[.?!][]\"')]*\\($\\|   \\| \\)[    
1825   ]*")
1826   (setq sentence-end-double-space nil)
1827   ; enable matching parenthesis
1828   (show-paren-mode 1)
1829   (tool-bar-mode -1)
1830   (setq user-mail-address "don@donarmstrong.com")
1831   (setq vc-delete-logbuf-window nil)
1832   (setq vc-follow-symlinks t)
1833
1834   ;; use git before SVN; use CVS earlier, because I have CVS
1835   ;; repositories inside of git directories
1836   (setq vc-handled-backends (quote (CVS Git RCS SVN SCCS Bzr Hg Mtn Arch)))
1837
1838   ;; switch back to the old primary selection method
1839   (setq x-select-enable-clipboard nil)
1840   (setq x-select-enable-primary t)
1841   ; (setq mouse-drag-copy-region t)
1842
1843   (fset 'perl-mode 'cperl-mode)
1844   ;;(load-file "cperl-mode.el")
1845
1846   (require 'vcl-mode)
1847
1848   (global-set-key "\C-xp" 'server-edit)
1849
1850   (setq-default auto-mode-alist (cons '("\.wml$" . 
1851                     (lambda () (html-mode) (auto-fill-mode)))
1852                   auto-mode-alist))
1853
1854
1855   ; use markdown mode for mdwn files
1856   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.mdwn$" . markdown-mode))
1857   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.md$" . markdown-mode))
1858
1859
1860   ;; tramp configuration
1861   (setq tramp-use-ssh-controlmaster-options nil)
1862
1863   ;; self-insert-command hack.
1864   ;;   Without this, "if<SP>" expands to
1865   ;;   if ( -!-) {
1866   ;;   }
1867   ;;   which really should be,
1868   ;;   if (-!-) {
1869   ;;   }
1870
1871
1872
1873   ;(load-library "php-mode")
1874
1875   (setq-default c-indent-level 4)
1876   (setq-default c-brace-imaginary-offset 0)
1877   (setq-default c-brace-offset -4)
1878   (setq-default c-argdecl-indent 4)
1879   (setq-default c-label-offset -4)
1880   (setq-default c-continued-statement-offset 4)
1881   ; tabs are annoying
1882   (setq-default indent-tabs-mode nil)
1883   (setq-default tab-width 4)
1884
1885
1886   ;; (autoload 'php-mode "php-mode" "PHP editing mode" t)
1887   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php3?\\'" . php-mode))
1888   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.phtml?\\'" . php-mode))
1889   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php?\\'" . php-mode))
1890   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php4?\\'" . php-mode))
1891
1892
1893   (defun insert-date ()
1894     "Insert date at point."
1895     (interactive)
1896     (insert (format-time-string "%A, %B %e, %Y %k:%M:%S %Z")))
1897   (global-set-key "\C-[d" 'insert-date)
1898
1899   (defun unfill-paragraph (arg)
1900     "Pull this whole paragraph up onto one line."
1901     (interactive "*p")
1902     (let ((fill-column 10000))
1903       (fill-paragraph arg))
1904     )
1905
1906   (column-number-mode t)
1907
1908   ; (require 'mode-compile)
1909
1910   (defadvice server-process-filter (after post-mode-message first activate)
1911     "If the buffer is in post mode, overwrite the server-edit
1912       message with a post-save-current-buffer-and-exit message."
1913     (if (eq major-mode 'post-mode)
1914         (message
1915          (substitute-command-keys "Type \\[describe-mode] for help composing; \\[post-save-current-buffer-and-exit] when done."))))
1916                       ; This is also needed to see the magic message.  Set to a higher
1917                       ; number if you have a faster computer or read slower than me.
1918   '(font-lock-verbose 1000)
1919   ;(setq-default server-temp-file-regexp "mutt\(-\|ng-\)")
1920   ; (add-hook 'server-switch-hook 
1921   ;     (function (lambda()
1922   ;             (cond ((string-match "Post" mode-name)
1923   ;                (post-goto-body)))
1924   ;             set-buffer-file-coding-system 'utf-8
1925   ;             )))
1926   ; 
1927
1928   (add-hook 'post-mode-hook
1929         (auto-fill-mode nil)
1930         )
1931   ; abbrev mode settings
1932   ; load abbreviations from 
1933   (setq abbrev-file-name       
1934         "~/.emacs_abbrev_def")
1935
1936   ; read the abbrev file if it exists
1937   (if (file-exists-p abbrev-file-name)
1938       (quietly-read-abbrev-file))
1939
1940   ; for now, use abbrev mode everywhere
1941   (setq default-abbrev-mode t)
1942
1943
1944   (defun insert-function-documentation ()
1945     "Insert function documentation"
1946     (interactive)
1947     (insert-file-contents "/home/don/lib/templates/perl_function_documentation" nil))
1948   (global-set-key "\M-f" 'insert-function-documentation)
1949
1950   (eval-after-load "lilypond-mode" 
1951     '(progn
1952        (load-library "lyqi-mode")
1953        (define-key LilyPond-mode-map "\C-cq" 'lyqi-mode)))
1954
1955   (autoload 'spamassassin-mode "spamassassin-mode" nil t)
1956
1957   (desktop-load-default)
1958   (desktop-read)
1959   '(icomplete-mode on)
1960   (custom-set-faces
1961    ;; custom-set-faces was added by Custom.
1962    ;; If you edit it by hand, you could mess it up, so be careful.
1963    ;; Your init file should contain only one such instance.
1964    ;; If there is more than one, they won't work right.
1965    '(menu ((((type x-toolkit)) (:background "black" :foreground "grey90")))))
1966
1967
1968   (put 'upcase-region 'disabled nil)
1969   (put 'downcase-region 'disabled nil)
1970   (put 'narrow-to-region 'disabled nil)
1971
1972   ; (defun turn-on-flyspell ()
1973   ;    "Force flyspell-mode on using a positive arg.  For use in hooks."
1974   ;    (interactive)
1975   ;    (flyspell-mode 1))
1976
1977
1978    ; Outline-minor-mode key map
1979    (define-prefix-command 'cm-map nil "Outline-")
1980    ; HIDE
1981    (define-key cm-map "q" 'hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
1982    (define-key cm-map "t" 'hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
1983    (define-key cm-map "o" 'hide-other)        ; Hide other branches
1984    (define-key cm-map "c" 'hide-entry)        ; Hide this entry's body
1985    (define-key cm-map "l" 'hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
1986    (define-key cm-map "d" 'hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
1987    ; SHOW
1988    (define-key cm-map "a" 'show-all)          ; Show (expand) everything
1989    (define-key cm-map "e" 'show-entry)        ; Show this heading's body
1990    (define-key cm-map "i" 'show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
1991    (define-key cm-map "k" 'show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
1992    (define-key cm-map "s" 'show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
1993    ; MOVE
1994    (define-key cm-map "u" 'outline-up-heading)                ; Up
1995    (define-key cm-map "n" 'outline-next-visible-heading)      ; Next
1996    (define-key cm-map "p" 'outline-previous-visible-heading)  ; Previous
1997    (define-key cm-map "f" 'outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
1998    (define-key cm-map "b" 'outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
1999    (global-set-key "\M-o" cm-map)
2000
2001
2002   ; debian stuff
2003   (setq-default debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
2004   (setq-default debian-changelog-full-name "Don Armstrong")
2005
2006   ; ediff configuration
2007   ; don't use the multi-window configuration
2008   (setq ediff-window-setup-function 'ediff-setup-windows-plain)
2009
2010   ; fix up css mode to not be silly
2011   ; from http://www.stokebloke.com/wordpress/2008/03/21/css-mode-indent-buffer-fix/
2012   (setq cssm-indent-level 4)
2013   (setq cssm-newline-before-closing-bracket t)
2014   (setq cssm-indent-function #'cssm-c-style-indenter)
2015   (setq cssm-mirror-mode nil)
2016
2017   (require 'multi-web-mode)
2018   (setq mweb-default-major-mode 'html-mode)
2019   (setq mweb-tags '((php-mode "<\\?php\\|<\\? \\|<\\?=" "\\?>")
2020                     (js-mode "<script +\\(type=\"text/javascript\"\\|language=\"javascript\"\\)[^>]*>" "</script>")
2021                     (css-mode "<style +type=\"text/css\"[^>]*>" "</style>")))
2022   (setq mweb-filename-extensions '("php" "htm" "html" "ctp" "phtml" "php4" "php5"))
2023   (multi-web-global-mode 1)
2024
2025   ;;; alias the new `flymake-report-status-slim' to
2026   ;;; `flymake-report-status'
2027   (defalias 'flymake-report-status 'flymake-report-status-slim)
2028   (defun flymake-report-status-slim (e-w &optional status)
2029     "Show \"slim\" flymake status in mode line."
2030     (when e-w
2031       (setq flymake-mode-line-e-w e-w))
2032     (when status
2033       (setq flymake-mode-line-status status))
2034     (let* ((mode-line " Φ"))
2035       (when (> (length flymake-mode-line-e-w) 0)
2036         (setq mode-line (concat mode-line ":" flymake-mode-line-e-w)))
2037       (setq mode-line (concat mode-line flymake-mode-line-status))
2038       (setq flymake-mode-line mode-line)
2039       (force-mode-line-update)))
2040
2041   ; load sql-indent when sql is loaded
2042   (eval-after-load "sql"
2043     '(load-library "sql-indent"))
2044
2045   ; fix up tmux xterm keys
2046   ; stolen from http://unix.stackexchange.com/questions/24414/shift-arrow-not-working-in-emacs-within-tmux
2047   (defun fix-up-tmux-keys ()
2048       "Fix up tmux xterm keys"
2049       (if (getenv "TMUX")
2050           (progn
2051             (let ((x 2) (tkey ""))
2052               (while (<= x 8)
2053                 ;; shift
2054                 (if (= x 2)
2055                     (setq tkey "S-"))
2056                 ;; alt
2057                 (if (= x 3)
2058                     (setq tkey "M-"))
2059                 ;; alt + shift
2060                 (if (= x 4)
2061                     (setq tkey "M-S-"))
2062                 ;; ctrl
2063                 (if (= x 5)
2064                     (setq tkey "C-"))
2065                 ;; ctrl + shift
2066                 (if (= x 6)
2067                     (setq tkey "C-S-"))
2068                 ;; ctrl + alt
2069                 (if (= x 7)
2070                     (setq tkey "C-M-"))
2071                 ;; ctrl + alt + shift
2072                 (if (= x 8)
2073                     (setq tkey "C-M-S-"))
2074
2075                 ;; arrows
2076                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d A" x)) (kbd (format "%s<up>" tkey)))
2077                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d B" x)) (kbd (format "%s<down>" tkey)))
2078                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d C" x)) (kbd (format "%s<right>" tkey)))
2079                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d D" x)) (kbd (format "%s<left>" tkey)))
2080                 ;; home
2081                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d H" x)) (kbd (format "%s<home>" tkey)))
2082                 ;; end
2083                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d F" x)) (kbd (format "%s<end>" tkey)))
2084                 ;; page up
2085                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 5 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<prior>" tkey)))
2086                 ;; page down
2087                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 6 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<next>" tkey)))
2088                 ;; insert
2089                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 2 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2090                 ;; delete
2091                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 3 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2092                 ;; f1
2093                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d P" x)) (kbd (format "%s<f1>" tkey)))
2094                 ;; f2
2095                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d Q" x)) (kbd (format "%s<f2>" tkey)))
2096                 ;; f3
2097                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d R" x)) (kbd (format "%s<f3>" tkey)))
2098                 ;; f4
2099                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d S" x)) (kbd (format "%s<f4>" tkey)))
2100                 ;; f5
2101                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 15 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f5>" tkey)))
2102                 ;; f6
2103                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 17 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f6>" tkey)))
2104                 ;; f7
2105                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 18 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f7>" tkey)))
2106                 ;; f8
2107                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 19 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f8>" tkey)))
2108                 ;; f9
2109                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 20 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f9>" tkey)))
2110                 ;; f10
2111                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 21 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f10>" tkey)))
2112                 ;; f11
2113                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 23 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f11>" tkey)))
2114                 ;; f12
2115                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 24 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f12>" tkey)))
2116                 ;; f13
2117                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 25 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f13>" tkey)))
2118                 ;; f14
2119                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 26 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f14>" tkey)))
2120                 ;; f15
2121                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 28 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f15>" tkey)))
2122                 ;; f16
2123                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 29 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f16>" tkey)))
2124                 ;; f17
2125                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 31 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f17>" tkey)))
2126                 ;; f18
2127                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 32 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f18>" tkey)))
2128                 ;; f19
2129                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 33 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f19>" tkey)))
2130                 ;; f20
2131                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 34 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f20>" tkey)))
2132
2133                 (setq x (+ x 1))
2134                 ))
2135             )
2136         )
2137       )
2138   ; (add-hook 'tty-setup-hook 'fix-up-tmux-keys)
2139
2140   ; procmailmode configuration
2141   (load "procmail_mode")
2142
2143   (load "mode-line-cleaner")
2144
2145   (defadvice ask-user-about-supersession-threat (around ask-user-about-supersession-threat-if-necessary)
2146     "Call ask-user-about-supersession-threat only if the buffer is actually obsolete."
2147     (if (or (buffer-modified-p)
2148             (verify-visited-file-modtime)
2149             (< (* 8 1024 1024) (buffer-size))
2150             (/= 0 (call-process-region 1 (+ 1 (buffer-size)) "diff" nil nil nil "-q" (buffer-file-name) "-")))
2151         ad-do-it
2152       (clear-visited-file-modtime)
2153       (not-modified)))
2154   (ad-activate 'ask-user-about-supersession-threat)
2155
2156   ; apparently things like to step on C-;, so we'll use a hack from
2157   ; http://stackoverflow.com/questions/683425/globally-override-key-binding-in-emacs/5340797#5340797 to fix this
2158
2159   (defvar my-keys-minor-mode-map (make-keymap) "my-keys-minor-mode keymap.")
2160
2161   ; use iedit everywhere
2162   (define-key my-keys-minor-mode-map (kbd "C-;") 'mc/mark-all-dwim)
2163
2164   (define-minor-mode my-keys-minor-mode
2165     "A minor mode so that my key settings override annoying major modes."
2166     t " my-keys" 'my-keys-minor-mode-map)
2167
2168   (my-keys-minor-mode 1)
2169   (defun my-minibuffer-setup-hook ()
2170     (my-keys-minor-mode 0))
2171
2172   (add-hook 'minibuffer-setup-hook 'my-minibuffer-setup-hook)
2173   (defadvice load (after give-my-keybindings-priority)
2174     "Try to ensure that my keybindings always have priority."
2175     (if (not (eq (car (car minor-mode-map-alist)) 'my-keys-minor-mode))
2176         (let ((mykeys (assq 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)))
2177           (assq-delete-all 'my-keys-minor-mode minor-mode-map-alist)
2178           (add-to-list 'minor-mode-map-alist mykeys))))
2179   (ad-activate 'load)
2180   (global-set-key "\M- " 'hippie-expand)
2181
2182 #+END_SRC
2183
2184 * Server
2185 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2186   (unless (server-running-p)
2187   (server-start))
2188 #+END_SRC
2189
2190
2191
2192 * END
2193 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2194   (provide 'don-configuration)
2195 #+END_SRC