]> git.donarmstrong.com Git - don.git/blobdiff - resume.mdwn
move image location
[don.git] / resume.mdwn
index 78ce68490ae17d83a25bac52c23a540db65ddf8a..26f2117c4a9c5f41064c589a3bbf1424061e0ad9 100644 (file)
@@ -1,9 +1,10 @@
-[[!meta title="Curriculum Vitæ, Research Statement, and Teaching Statement"]]
+[[!meta title="Resumé"]]
 
 # Education
 ## UC Riverside
 + **PhD** in Cell, Molecular and Developmental Biology
 + **BS** in Biology
+
 # Skills
 ## Genomics and Epigenomics
 + Genomics and Epigenomics of complex human diseases including
 + Reproducible, scalable analysis using workflows on cloud- and
   cluster-based systems on terabyte-scale datasets
 + Using evolutionary genomics to identify causal human variants
+
 ## Statistics
 + Statistical modeling
 + Addressing confounders and batch effects
 + Reproducible research
+
 ## Big Data
 + Parallel and Cloud Computing
 + Inter-process communication: MPI, OpenMP, Hadoop
 + Filestorage: Gluster, CEFS, GPFS, Lustre
 + Cloud based-infrastructure: Azure, AWS, Docker, cloud-init
 + Debian GNU/Linux system administration
+
 ## Mentoring and Leadership
 + Mentored graduate students and Outreachy and Google Summer of Code
   interns
 + Chairperson of the Debian Technical Committee
 + Head developer behind https://bugs.debian.org
+
 ## Software Development
 + Languages: perl, R, C, C++, python, groovy, assembly, sh, make
 + Collaborative Development: git, travis, continuous integration,
   automated testing
 + Databases: Postgresql (PL/SQL), SQLite, Mysql
+
 ## Communication
 + Strong written communication skills as evidenced by publication
   record
 
 # Experience
 ## Research Scientist at UIUC
-+ 2015--Present. University of Illinois at Urbana-Champaign. Epigenetic
++ 2015Present. University of Illinois at Urbana-Champaign. Epigenetic
   modifications associated with PTSD, the genomic basis of the
   development of parturition in mammals, and detecting adverse
   pregnancy outcomes using urinary exosomes.
+
 ## Postdoctoral Researcher at USC
-+ 2013--2015. Identifying genes and causal alleles associated with
++ 20132015. Identifying genes and causal alleles associated with
   Systemic Lupus Erythematosus using genome-wide association,
   next-generation sequencing, computational and biochemical
   approaches.
+
 ## Postdoctoral Researcher at UCR
-+ 2010--2012. Identifying genes which are associated with Systemic
++ 20102012. Identifying genes which are associated with Systemic
   Lupus Erythematosus using prior information and targeted trio-based
   studies.
+
 ## Debian Developer
-+ 2004--Present. \emph{Debian Project}, Developer; Technical Committee
-  Member (2010--Present), Technical Committee Chair (2015--2016).
++ 2004–Present. *Debian Project*, Developer; Technical Committee
+  Member (2010–2016), Technical Committee Chair (2015–2016).
+
 # Authored Software
 + **[Debbugs](http://bugs.debian.org)**: Bug tracking software for the Debian GNU/Linux
-   distribution. [https://bugs.debian.org]
-+ **[CairoHacks](http://git.donarmstrong.com/r/CairoHacks.git)**:
+   distribution. <https://bugs.debian.org>
++ **[CairoHacks](https://git.donarmstrong.com/r/CairoHacks.git)**:
   Bookmarks and Raster images for large PDF plots in R.
 + **[Function2Gene](http://rzlab.ucr.edu/function2gene/)**: Gene
    selection tool based on literature mining which enables Bayesian
    approaches to significance testing.
 + **[Helical Wheel Projections](http://rzlab.ucr.edu/scripts/wheel/wheel.cgi?sequence=ABCDEFGHIJLKMNOP&submit=Submit)**:
    Web-based tool to draw helical wheel protein projections.
-   [http://rzlab.ucr.edu/scripts/wheel]
-* Publications and Presentations
+   <http://rzlab.ucr.edu/scripts/wheel>
+
+# Publications and Presentations
 + 20 peer-reviewed refereed publications cited over 1700 times:
-  [https://dla2.us/pubs]
+  <https://dla2.us/pubs>
 + Publication record in GWAS, expression analysis of microarrays,
   epigenetics, comparative evolution of mammals, and lipid membranes
 + H index of 11
 + Multiple presentations on EWAS of PTSD, genetics of SLE, and Open
-  Source: [https://dla2.us/pres]
+  Source: <https://dla2.us/pres>
 
 # Funding and Awards
 ## Grants
   RFA-HD-16-037) Role: Key Personnel
 + **NIAMS** R01-AR045650-04 **Genetics of Childhood Onset SLE** to Chaim O. Jacob.
   Role: Key Personnel
+
 ## Scholarships and Fellowships
 + 2001--2003: University of California, Riverside Doctoral Fellowship
 + 1997--2001: Regents of the University of California Scholarship.
 
-Academic Information
-------------
+#Academic Information
 
 You can also read my [Curriculum Vitæ](curriculum_vitae)
 ([pdf](dla-cv.pdf)), [Research Statement](research_statement)