Add Genes and Immunity paper
[don.git] / resume / curriculum_vitae.mdwn
1 [[!meta title="Curriculum Vitæ"]]
2 Curriculum Vitæ
3 ===============
4
5 * [Don Armstrong](http://www.donarmstrong.com/)
6 * <don@donarmstrong.com>
7 * <http://www.donarmstrong.com>
8
9 Education
10 ----------
11 * Doctor of Philosophy
12   * 2001-2008 *Cell, Molecular and Developmental Biology*.
13    [University of California at Riverside](http://www.ucr.edu).
14    Dissertation: The Role of membrane Composition in the Activity of
15    Membrane-Associated Signal Transduction Proteins.
16 * Bachelor of Science
17   * 1997-2001 [Biology](http://bio.ucr.edu).
18     [University of California at Riverside](http://www.ucr.edu).
19     
20 Postdoctoral Experience
21 -------------------------
22
23 ### University of Southern California ###
24
25 * 2013--Present. Postdoctoral researcher under Chaim O. Jacob.
26   Identifying genes and causal alleles associated with Systemic Lupus
27   Erythematosus using genome-wide association, next-generation
28   sequencing, computational and biochemical approaches.
29 * 2009--2010. Postdoctoral researcher under Florence M. Hofman.
30   Identifying signaling pathways which are responsible for the
31   functional alteration of endothelial cells in glioblastoma
32   multiforme and arteriovenous malformations.
33
34 ### University of California at Riverside ###
35 * 2010--2012. Postdoctoral researcher under Raphael Zidovetzki.
36   Identifying genes which are associated with Systemic Lupus
37   Erythematosus using prior information and targeted trio-based
38   studies.
39
40 Teaching
41 --------
42 ### Teaching Assistant ###
43 * 2004--2007. University of California at Riverside. First and second
44   quarter introduction to biology for majors (BIO 5A and 5B).
45   Introduction to Genetics (BIO 102), Human Embryology (CBNS 169).
46
47 Work in Industry
48 ----------------
49 ### Non-Profit ###
50 * 2004--Present. [Debian Project](http://www.debian.org), Developer;
51   Technical Committee Member (2010--Present)
52
53 ### Employment Experience ###
54 * 2002-2003. *Socratech* in Rochester, NY. Bioinformatics researcher:
55   developed new microarray analysis methods for a start-up
56   biotechnology company working on developing treatments for
57   Alzheimer's disease
58
59 Publications
60 ------------
61 ## Refereed Publications ##
62 1. *Don L. Armstrong*, Raphael Zidovetzki, and Chaim O Jacob. Novel
63   lupus associated genes discovered in GWAS; two signals explain all
64   HLA SNPs in European Americans. /Genes Immun/, In press.
65
66 2. Chaim O Jacob, Miriam Eisenstein, Mary C Dinauer, Wenyu Ming,
67    Qiang Liu, Sutha John, Francesco P Quismorio, Andreas Reiff, Barry
68    L Myones, Kenneth M Kaufman, Deborah McCurdy, John B Harley, Earl
69    Silverman, Robert P Kimberly, Timothy J Vyse, Patrick M Gaffney,
70    Kathy L Moser, Marisa Klein-Gitelman, Linda Wagner-Weiner, Carl D
71    Langefeld, *Don L Armstrong*, and Raphael Zidovetzki.
72    Lupus-associated causal mutation in neutrophil cytosolic factor 2
73    (NCF2) brings unique insights to the structure and function of
74    NADPH oxidase. /Proc Natl Acad Sci USA/, 109(2):59--67, Jan 2012.
75 3. *Don L Armstrong*, Omer Markovitch, Raphael Zidovetzki, and Doron
76    Lancet. Replication of simulated prebiotic amphiphile vesicles
77    controlled by experimental lipid physicochemical properties. /Phys
78    Biol/, 8(6):066001, Dec 2011.
79
80 4. Christopher J Stapleton, *Don L Armstrong*, Raphael Zidovetzki,
81    Charles Y Liu, Steven L Giannotta, and Florence M Hofman.
82    Thrombospondin-1 modulates the angiogenic phenotype of human
83    cerebral arteriovenous malformation endothelial cells.
84    /Neurosurgery/, 68(5):1342--53, May 2011.
85
86 5. *D L Armstrong*, A Reiff, B L Myones, F P Quismorio, M
87    Klein-Gitelman, D McCurdy, L Wagner-Weiner, E Silverman, J O
88    Ojwang, K M Kaufman, J A Kelly, J T Merrill, J B Harley, S-C Bae, T
89    J Vyse, G S Gilkeson, P M Gaffney, K L Moser, C Putterman, J C
90    Edberg, E E Brown, J Ziegler, C D Langefeld, R Zidovetzki, and C O
91    Jacob. Identification of new SLE-associated genes with a two-step
92    Bayesian study design. /Genes Immun/, 10(5):446--56, Jul 2009.
93
94 6. Chaim O Jacob, Jiankun Zhu, *Don L Armstrong*, /et al./
95    Identification of IRAK1 as a risk gene with critical role in the
96    pathogenesis of systemic lupus erythematosus. /Proc Natl Acad Sci
97    USA/, 106(15):6256--61, Apr 2009.
98
99 7. Bahram Namjou, Andrea L Sestak, *Don L Armstrong*, Raphael
100    Zidovetzki, /et al./ High-density genotyping of STAT4 reveals
101    multiple haplotypic associations with systemic lupus erythematosus
102    in different racial groups. /Arthritis Rheum/, 60(4):1085--95, Apr 2009.
103
104 8. *Don Armstrong* and Raphael Zidovetzki. Amplification of
105    diacylglycerol activation of protein kinase c by cholesterol.
106    /Biophys J/, 94(12):4700--10, Jun 2008.
107
108 9. *Don L Armstrong*, Chaim O Jacob, and Raphael Zidovetzki.
109    Function2gene: a gene selection tool to increase the power of
110    genetic association studies by utilizing public databases and
111    expert knowledge. *BMC Bioinformatics*, 9:311, 2008.
112
113 10. Chaim O Jacob, Andreas Reiff, *Don L Armstrong*, Barry L Myones,
114     Earl Silverman, Marisa Klein-Gitelman, Deborah McCurdy, Linda
115     Wagner-Weiner, James J Nocton, Aaron Solomon, and Raphael
116     Zidovetzki. Identification of novel susceptibility genes in
117     childhood-onset systemic lupus erythematosus using a uniquely
118     designed candidate gene pathway platform. /Arthritis Rheum/,
119     56(12):4164--73, Dec 2007.
120
121 11. Raphael Zidovetzki, Burkhard Rost, /Don L Armstrong/, and Israel
122     Pecht. Transmembrane domains in the functions of fc receptors.
123     /Biophys Chem/, 100(1-3):555--75, 2003.
124
125 12. *Don L Armstrong*, Dan B Borchardt, and Raphael Zidovetzki.
126     Synergistic perturbation of phosphatidylcholine/sphingomyelin
127     bilayers by diacylglycerol and cholesterol. /Biochem Biophys Res
128     Commun/, 296(4):806--12, Aug 2002.
129
130 13. Zhenhua Wu, Huang Guo, Nienwen Chow, Jan Sallstrom, Robert D Bell, Rashid
131   Deane, Andrew I Brooks, Suhasini Kanagala, Anna Rubio, Abhay Sagare, Dong
132   Liu, Fang Li, *Don Armstrong*, Thomas Gasiewicz, Raphael Zidovetzki, Xiaomei
133   Song, Florence Hofman, and Berislav V Zlokovic. Role of the meox2 homeobox gene in neurovascular dysfunction in
134   alzheimer disease. /Nat Med/, 11(9):959--65, Sep 2005.
135
136 14. Rashid Deane, Shi Du Yan, Ram Kumar Submamaryan, Barbara LaRue,
137     Suzana Jovanovic, Elizabeth Hogg, Deborah Welch, Lawrence Manness,
138     Chang Lin, Jin Yu, Hong Zhu, Jorge Ghiso, Blas Frangione, Alan
139     Stern, Ann Marie Schmidt, \textbf{Don L Armstrong}, Bernd Arnold,
140     Birgit Liliensiek, Peter Nawroth, Florence Hofman, Mark Kindy,
141     David Stern, and Berislav Zlokovic. Rage mediates amyloid-beta peptide transport across the blood-brain
142   barrier and accumulation in brain. /Nat Med/, 9(7):907--13, Jul 2003.
143
144 Selected Presentations
145 ----------------------
146 ### Conference Presentations ###
147 * 2007-06-07. FOCIS 2007. Uniquely designed candidate gene
148   identification platform discovers novel genes in childhood-onset
149   SLE.
150
151 References
152 ----------
153 Please e-mail <don@donarmstrong.com> for references
154