schema/shared_schema/dbSNP_main_constraint_postgresql.sql

   1 ALTER TABLE Allele ADD CONSTRAINT pk_Allele  PRIMARY KEY   (allele_id ASC);
   2 ALTER TABLE AlleleFlagCode ADD CONSTRAINT pk_AlleleFlagCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
   3 ALTER TABLE AlleleMotif ADD CONSTRAINT pk_AlleleMotif  PRIMARY KEY   (allele_id ASC,motif_order ASC);
   4 ALTER TABLE AllocIds ADD CONSTRAINT pk_AllocIds  PRIMARY KEY   (name ASC);
   5 ALTER TABLE Author ADD CONSTRAINT pk_Author  PRIMARY KEY   (pub_id ASC,position ASC);
   6
   7
   8 ALTER TABLE CpGCode ADD CONSTRAINT pk_CpGCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
   9
  10
  11 ALTER TABLE GenomeBuildInfo ALTER COLUMN insert_time SET DEFAULT NOW();
  12 ALTER TABLE GenomeBuildInfo ALTER COLUMN is_major SET DEFAULT (1);
  13 ALTER TABLE GenomeBuildInfo ALTER COLUMN ncbi_genome_tax_id SET DEFAULT (0);
  14
  15 ALTER TABLE GtyAllele ADD CONSTRAINT pk_GtyAllele  PRIMARY KEY   (gty_id ASC,rev_flag ASC,chr_num ASC);
  16 ALTER TABLE IUPACna ADD CONSTRAINT pk_IUPACna  PRIMARY KEY   (allele ASC);
  17 ALTER TABLE LoadHistory ADD CONSTRAINT pk_LoadHistory  PRIMARY KEY   (build_id ASC);
  18 ALTER TABLE LocTypeCode ALTER COLUMN create_time SET DEFAULT NOW();
  19 ALTER TABLE LocTypeCode ADD CONSTRAINT pk_LocTypeCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
  20 ALTER TABLE MapLinkCode ADD CONSTRAINT pk_MapLinkCode  PRIMARY KEY   (which_code ASC,code ASC);
  21 ALTER TABLE Method ADD CONSTRAINT pk_Method_mid  PRIMARY KEY   (method_id ASC);
  22 ALTER TABLE MethodClass ADD CONSTRAINT pk_MethodClass  PRIMARY KEY   (meth_class_id ASC);
  23 ALTER TABLE MethodLine ADD CONSTRAINT pk_MethodLine  PRIMARY KEY   (method_id ASC,line_num ASC);
  24 ALTER TABLE Moltype ADD CONSTRAINT pk_Moltype  PRIMARY KEY   (code ASC);
  25 ALTER TABLE Motif ADD CONSTRAINT pk_Motif  PRIMARY KEY   (motif_id ASC);
  26 ALTER TABLE ObsGenotype ADD CONSTRAINT pk_ObsGenotype  PRIMARY KEY   (gty_id ASC);
  27 ALTER TABLE ObsVariation ALTER COLUMN create_time SET DEFAULT NOW();
  28 ALTER TABLE ObsVariation ALTER COLUMN last_updated_time SET DEFAULT NOW();
  29 ALTER TABLE ObsVariation ADD CONSTRAINT pk_ObsVariation  PRIMARY KEY   (var_id ASC);
  30 ALTER TABLE OrgDbStatus ADD CONSTRAINT pk_org_db_status  PRIMARY KEY   (database_name ASC);
  31 ALTER TABLE OrganismTax ADD CONSTRAINT pk_organism  PRIMARY KEY   (tax_id ASC);
  32 ALTER TABLE PopClass ADD CONSTRAINT pk_PopClass  PRIMARY KEY   (pop_id ASC,pop_class_id ASC);
  33 ALTER TABLE PopClassCode ADD CONSTRAINT PK__PopClassCode__270595B6  PRIMARY KEY   (pop_class_id ASC);
  34 ALTER TABLE Publication ADD CONSTRAINT pk_Publication  PRIMARY KEY   (pub_id ASC);
  35 ALTER TABLE SNPGlossary ALTER COLUMN last_updated SET DEFAULT NOW();
  36 ALTER TABLE SNPGlossary ADD CONSTRAINT pk_SNPGlossary  PRIMARY KEY   (term ASC);
  37 ALTER TABLE SNP_tax_id ALTER COLUMN status SET DEFAULT 'C';
  38 ALTER TABLE SNP_tax_id ADD CONSTRAINT pk_SNP_tax_id  PRIMARY KEY   (snp_id ASC);
  39 ALTER TABLE SnpChrCode ADD CONSTRAINT pk_SnpChrCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
  40 ALTER TABLE SnpClassCode ADD CONSTRAINT pk_SnpClassCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
  41 ALTER TABLE SnpFunctionCode ADD CONSTRAINT pk_SnpFunctionCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
  42 ALTER TABLE SnpValidationCode ADD CONSTRAINT pk_SnpValidationCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
  43 ALTER TABLE StrandCode ADD CONSTRAINT pk_StrandCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
  44
  45
  46 ALTER TABLE Submitter ALTER COLUMN create_time SET DEFAULT NOW();
  47 ALTER TABLE Submitter ADD CONSTRAINT pk_Submitter  PRIMARY KEY   (handle ASC);
  48 ALTER TABLE TemplateType ADD CONSTRAINT pk_TemplateType  PRIMARY KEY   (temp_type_id ASC);
  49 ALTER TABLE UniGty ADD CONSTRAINT pk_UniGty  PRIMARY KEY   (unigty_id ASC);
  50 ALTER TABLE UniVariAllele ADD CONSTRAINT pk_UniVariAllele  PRIMARY KEY   (univar_id ASC,allele_id ASC);
  51 ALTER TABLE UniVariation ADD CONSTRAINT pk_UniVariation  PRIMARY KEY   (univar_id ASC);
  52 ALTER TABLE UniVariationSrcCode ADD CONSTRAINT pk_UniVariationSrcCode  PRIMARY KEY   (code ASC);
  53 ALTER TABLE VariAllele ADD CONSTRAINT pk_VariAllele  PRIMARY KEY   (var_id ASC,allele_id ASC);
  54 ALTER TABLE db_ftp_table_list ALTER COLUMN create_time SET DEFAULT NOW();
  55 ALTER TABLE db_ftp_table_list ADD CONSTRAINT pk_db_ftp_table_list  PRIMARY KEY   (table_name ASC);
  56 ALTER TABLE db_map_table_name ALTER COLUMN inNonHuman SET DEFAULT 'N';
  57 ALTER TABLE db_map_table_name ADD CONSTRAINT pk_db_map_table_name  PRIMARY KEY   (table_name ASC);
  58 ALTER TABLE dn_Allele_rev ADD CONSTRAINT pk_dn_Allele_rev  PRIMARY KEY   (allele_id ASC,rev_flag ASC);
  59 ALTER TABLE dn_Motif_rev ADD CONSTRAINT pk_dn_Motif_rev  PRIMARY KEY   (motif_id ASC,rev_flag ASC);
  60 ALTER TABLE dn_UniGty_allele ADD CONSTRAINT pk_dn_UniGty_allele  PRIMARY KEY   (unigty_id ASC,chr_num ASC);
  61 ALTER TABLE dn_UniGty_rev ADD CONSTRAINT pk_dn_Gty_rev  PRIMARY KEY   (unigty_id ASC,rev_flag ASC);
  62 ALTER TABLE dn_UniVariation_rev ADD CONSTRAINT pk_dn_UniVariation_rev  PRIMARY KEY   (univar_id ASC,rev_flag ASC);
  63
  64
  65 ALTER TABLE dn_summary ALTER COLUMN create_time SET DEFAULT NOW();
  66 ALTER TABLE dn_summary ALTER COLUMN last_updated_time SET DEFAULT NOW();
  67 ALTER TABLE dn_summary ADD CONSTRAINT PK__dn_summary__3651FAE7  PRIMARY KEY   (tax_id ASC,build_id ASC,type ASC);