schema/human_9606_schema/human_9606_index_postgresql.sql

   1
   2 CREATE INDEX ON Batch (tax_id);
   3 CREATE INDEX ON Batch (submitted_time);
   4 CREATE INDEX ON Batch (handle,loc_batch_id);
   5 CREATE INDEX ON Batch (pop_id);
   6 CREATE INDEX ON Batch (success_rate_int);
   7 CREATE INDEX ON Batch (method_id);
   8 CREATE INDEX ON Batch (loc_batch_id_upp);
   9 CREATE INDEX ON Batch (last_updated_time);
  10 CREATE INDEX ON BatchCita (pub_id);
  11 CREATE INDEX ON BatchCultivar (line);
  12 CREATE INDEX ON BatchStrain (line);
  13 CREATE INDEX ON FreqSummaryBySsPop (subsnp_id,pop_id);
  14 CREATE INDEX ON Pedigree (curator,curator_ped_id);
  15 CREATE INDEX ON PedigreeIndividual (ind_id,ped_id);
  16 CREATE INDEX ON PopMandLine (pop_id,line_num);
  17 CREATE INDEX ON Population (handle,loc_pop_id_upp);
  18 CREATE INDEX ON Population (handle,loc_pop_id);
  19 CREATE INDEX ON RsMergeArch (rsLow);
  20 CREATE INDEX ON RsMergeArch (rsHigh);
  21 CREATE INDEX ON SNP (snp_id);
  22 CREATE INDEX ON SNP (exemplar_subsnp_id,snp_id);
  23 CREATE INDEX ON SNP3D (snp_id);
  24 CREATE INDEX ON SNPHistory (history_create_time);
  25 CREATE INDEX ON SNPPubmed (snp_id,subsnp_id,pubmed_id,type);
  26 CREATE INDEX ON SNPSubSNPLink (subsnp_id);
  27 CREATE INDEX ON SNPSubSNPLink (snp_id,subsnp_id,substrand_reversed_flag);
  28 CREATE INDEX ON SNPSubSNPLinkHistory (snp_id);
  29 CREATE INDEX ON SNPSubSNPLinkHistory (subsnp_id,snp_id);
  30 CREATE INDEX ON SNPSubSNPLinkHistory (build_id);
  31 CREATE INDEX ON SNPSubSNPLinkHistory (build_id_when_history_made);
  32 CREATE INDEX ON SNPVal (snp_id);
  33 CREATE INDEX ON SNP_HGVS (snp_id,hgvs_name);
  34 CREATE INDEX ON SNP_bitfield (link_prop_b2,snp_id);
  35 CREATE INDEX ON SubPop (subsnp_id);
  36 CREATE INDEX ON SubPop (pop_id,subsnp_id);
  37 CREATE INDEX ON SubPop (subpop_id);
  38 CREATE INDEX ON SubPopAllele (batch_id,subsnp_id,pop_id,allele,other,type);
  39 CREATE INDEX ON SubPopAllele (freq);
  40 CREATE INDEX ON SubPopAllele (freq_max);
  41 CREATE INDEX ON SubPopAllele (freq_min);
  42 CREATE INDEX ON SubPopAllele (subsnp_id);
  43 CREATE INDEX ON SubPopAllele (type);
  44 CREATE INDEX ON SubPopAllele (last_updated_time);
  45 CREATE INDEX ON SubPopAllele (allele_id);
  46 CREATE INDEX ON SubPopAllele (subpop_id);
  47 CREATE INDEX ON SubPopAllele (subpop_id,type,allele,other);
  48 CREATE INDEX ON SubPopGty (subpop_id);
  49 CREATE INDEX ON SubPopGty (gty_id);
  50 CREATE INDEX ON SubSNP (loc_snp_id_upp,subsnp_id);
  51 CREATE INDEX ON SubSNP (batch_id,subsnp_id);
  52 CREATE INDEX ON SubSNP (variation_id,subsnp_id);
  53 CREATE INDEX ON SubSNPAcc_ins (acc_part,acc_type_ind,subsnp_id);
  54 CREATE INDEX ON SubSNPMdFailLn (subsnp_id);
  55 CREATE INDEX ON SubSNPPubmed (pubmed_id);
  56 CREATE INDEX ON SubmittedIndividual (submitted_ind_id);
  57 CREATE INDEX ON SubmittedIndividual (ind_id);
  58 CREATE INDEX ON b135_ContigInfo_37_3 (asm_acc,asm_version,contig_start,contig_end,chr_gi);
  59 CREATE INDEX ON b135_ContigInfo_37_3 (asm_acc,asm_version,chr_gi,contig_start,contig_end);
  60 CREATE INDEX ON b135_ContigInfo_37_3 (contig_label);
  61 CREATE INDEX ON b135_ContigInfo_37_3 (placement_status,ctg_id);
  62 CREATE INDEX ON b135_MapLinkInfo_37_3 (gi);
  63 CREATE INDEX ON b135_MapLink_37_3 (snp_id,gi,offset);
  64 CREATE INDEX ON b135_MapLink_37_3 (source,snp_type,snp_id,gi,offset,asn_to);
  65 CREATE INDEX ON b135_ProteinInfo_37_3 (gi);
  66 CREATE INDEX ON b135_Remapped_37_3 (snp_id,src_gi,src_from,tgt_gi);
  67 CREATE INDEX ON b135_Remapped_37_3 (tgt_gi,snp_type,snp_id);
  68 CREATE INDEX ON b135_SNPChrPosOnRef_37_3 (snp_id);
  69 CREATE INDEX ON b135_SNPContigLoc_37_3 (snp_id,ctg_id,asn_from);
  70 CREATE INDEX ON b135_SNPContigLoc_37_3 (ctg_id);
  71 CREATE INDEX ON b135_SNPContigLoc_37_3 (snp_type,snp_id);
  72 CREATE INDEX ON b135_SNPContigLoc_37_3 (asn_from);
  73 CREATE INDEX ON b135_SNPContigLocusId_37_3 (snp_id,contig_acc,asn_from,locus_id,allele,mrna_start,mrna_gi);
  74 CREATE INDEX ON b135_SNPContigLocusId_37_3 (snp_id);
  75 CREATE INDEX ON b135_SNPContigProtein_37_3 (snp_id,contig_gi,contig_start);
  76 CREATE INDEX ON b135_SNPMapInfo_37_3 (snp_id,asm_acc);
  77 CREATE INDEX ON b135_SNPMapInfo_37_3 (asm_acc,asm_version);
  78 CREATE INDEX ON b135_SNPMapInfo_37_3 (asm_acc,weight,snp_id);
  79 CREATE INDEX ON b135_SNPMapLinkProtein_37_3 (snp_id,mrna_gi,mrna_start,mrna_stop);
  80 CREATE INDEX ON b135_SNPMapLinkProtein_37_3 (ctg_gi,mrna_gi,snp_id);
  81 CREATE INDEX ON dn_IND_batch_pop (pop_id);
  82 CREATE INDEX ON dn_table_rowcount (build_id DESC,reserved_KB_spaceused DESC);