schema/extra_schema/encode_schema.sql

   1 DROP TABLE encdoe_track_info CASCADE;
   2 DROP TABLE encode_tf_binding_tracks CASCADE;
   3 DROP TABLE encode_tracks CASCADE;
   4 DROP TABLE encode_track_info_keys CASCADE;
   5
   6 CREATE TABLE encode_tracks (
   7        id SERIAL PRIMARY KEY,
   8        track_name TEXT UNIQUE
   9 );
  10
  11 CREATE TABLE encode_track_info_keys (
  12        id SERIAL PRIMARY KEY,
  13        info_key TEXT UNIQUE
  14 );
  15
  16 CREATE TABLE encode_track_info (
  17        id SERIAL PRIMARY KEY,
  18        track_id INT NOT NULL REFERENCES encode_tracks,
  19        info_key_id INT NOT NULL REFERENCES encode_track_info_keys,
  20        info_value TEXT NOT NULL
  21 );
  22
  23 CREATE UNIQUE INDEX ON encode_track_info(track_id,info_key_id);
  24 CREATE INDEX ON encode_track_info(info_key_id,info_value);
  25
  26 CREATE TABLE encode_tf_binding_tracks (
  27        id SERIAL PRIMARY KEY,
  28        track_id INT NOT NULL REFERENCES encode_tracks,
  29        chr TEXT NOT NULL,
  30        start INT,
  31        stop INT,
  32        name TEXT NOT NULL DEFAULT '',
  33        score INT NOT NULL,
  34        strand TEXT NOT NULL DEFAULT '.',
  35        signalValue FLOAT,
  36        pValue FLOAT,
  37        qValue FLOAT,
  38        peak INT
  39 );