]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/commitdiff
added missing cpus switch to uclust_seq
authormartinahansen <martinahansen@74ccb610-7750-0410-82ae-013aeee3265d>
Fri, 13 Sep 2013 13:07:50 +0000 (13:07 +0000)
committermartinahansen <martinahansen@74ccb610-7750-0410-82ae-013aeee3265d>
Fri, 13 Sep 2013 13:07:50 +0000 (13:07 +0000)
git-svn-id: http://biopieces.googlecode.com/svn/trunk@2195 74ccb610-7750-0410-82ae-013aeee3265d

bp_bin/uclust_seq

index 1f5202a42f75201866f6affee4e219de06295651..5a6d0ef901a1f9cb298b324106c568c721a50b1d 100755 (executable)
@@ -36,6 +36,7 @@ casts = []
 casts << {long: 'no_sort',  short: 'n', type: 'flag',  mandatory: false, default: nil, allowed: nil, disallowed: nil}
 casts << {long: 'comp',     short: 'c', type: 'flag',  mandatory: false, default: nil, allowed: nil, disallowed: nil}
 casts << {long: 'identity', short: 'i', type: 'float', mandatory: true,  default: 0.9, allowed: nil, disallowed: nil}
+casts << {long: 'cpus',     short: 'C', type: 'uint',  mandatory: false, default: 1,   allowed: nil, disallowed: "0"}
 
 options = Biopieces.options_parse(ARGV, casts)