]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/commitdiff
polish seq.rb
authormartinahansen <martinahansen@74ccb610-7750-0410-82ae-013aeee3265d>
Mon, 23 Jan 2012 14:30:52 +0000 (14:30 +0000)
committermartinahansen <martinahansen@74ccb610-7750-0410-82ae-013aeee3265d>
Mon, 23 Jan 2012 14:30:52 +0000 (14:30 +0000)
git-svn-id: http://biopieces.googlecode.com/svn/trunk@1732 74ccb610-7750-0410-82ae-013aeee3265d

code_ruby/lib/maasha/seq.rb

index f311bf60d3a04ee97009179a1ff2e3fd684992e8..d22bfd1c9a1628fe83c72f2566f5663a11ab8d68 100644 (file)
@@ -452,7 +452,7 @@ class Seq
   def mask_seq_hard!(cutoff)
     raise SeqError, "seq is nil"  if self.seq.nil?
     raise SeqError, "qual is nil" if self.qual.nil?
-    raise SeqError, "Bad cutoff value: #{cutoff}" unless (SCORE_MIN .. SCORE_MAX).include? cutoff
+    raise SeqError, "cufoff value: #{cutoff} out of range #{SCORE_MIN} .. #{SCORE_MAX}" unless (SCORE_MIN .. SCORE_MAX).include? cutoff
 
     na_seq  = NArray.to_na(self.seq, "byte")
     na_qual = NArray.to_na(self.qual, "byte")
@@ -470,7 +470,7 @@ class Seq
   def mask_seq_soft!(cutoff)
     raise SeqError, "seq is nil"  if self.seq.nil?
     raise SeqError, "qual is nil" if self.qual.nil?
-    raise SeqError, "Bad cutoff value: #{cutoff}" unless (SCORE_MIN .. SCORE_MAX).include? cutoff
+    raise SeqError, "cufoff value: #{cutoff} out of range #{SCORE_MIN} .. #{SCORE_MAX}" unless (SCORE_MIN .. SCORE_MAX).include? cutoff
 
     na_seq  = NArray.to_na(self.seq, "byte")
     na_qual = NArray.to_na(self.qual, "byte")