]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blob - NAMESPACE
various updates + adding SPR+TBR in fastme.bal()
[ape.git] / NAMESPACE
1 useDynLib(ape)
2
3 export(as.DNAbin, as.phylo, base.freq, dist.dna, dist.nodes, drop.tip, ltt.plot, nj, rcoal, rtree, rmtree, read.dna, read.nexus, read.tree, vcv.phylo, write.dna, write.nexus, write.tree)
4
5 import(gee, nlme)
6 importFrom(lattice, xyplot, panel.lines, panel.points)
7
8 S3method(print, phylo)
9 S3method(plot, phylo)
10 S3method(as.hclust, phylo)
11 S3method(reorder, phylo)
12 S3method(print, multiPhylo)
13 S3method(plot, multiPhylo)
14 S3method("[", multiPhylo)
15 S3method("[[", multiPhylo)
16 S3method("$", multiPhylo)
17 S3method(unique, multiPhylo)
18 S3method(print, DNAbin)
19 S3method(cbind, DNAbin)
20 S3method(rbind, DNAbin)
21 S3method("[", DNAbin)
22 S3method(summary, DNAbin)
23 S3method(as.character, DNAbin)