emacs_el/configuration/don-configuration.org

   1 #+PROPERTY: header-args:emacs-lisp :tangle don-configuration.el
   2 * Load debugger
   3
   4 # if for some reason, things get pear-shaped, we want to be able to
   5 # enter the debugger by sending -USR2 to emacs
   6
   7 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
   8 (setq debug-on-event 'siguser2)
   9 #+END_SRC
  10 * Initial startup stuff
  11 ** Disable startup screen
  12 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  13   (setq inhibit-startup-screen t)
  14 #+END_SRC
  15 ** Disable cluter
  16 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  17   ; (if (fboundp 'menu-bar-mode) (menu-bar-mode -1))
  18   (if (fboundp 'tool-bar-mode) (tool-bar-mode -1))
  19   (if (fboundp 'scroll-bar-mode) (scroll-bar-mode -1))
  20 #+END_SRC
  21 ** Fullscreen
  22 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  23   (setq frame-resize-pixelwise t)
  24   (add-to-list 'default-frame-alist '(fullscreen . maximixed))
  25 #+END_SRC
  26 * Package management
  27 ** package repositories and package manager
  28 Borrowed from https://github.com/nilcons/emacs-use-package-fast/ to
  29 load  [[https://github.com/jwiegley/use-package/][use-package]] even faster
  30 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  31   (eval-and-compile
  32     ;; add /etc/ssl/ca-global/ca-certificates.crt so that we can
  33     ;; download packages when we're on Debian hosts which chop down the
  34     ;; list of available certificates
  35     (require 'gnutls)
  36     (add-to-list 'gnutls-trustfiles "/etc/ssl/ca-global/ca-certificates.crt")
  37     (setq package-enable-at-startup nil)
  38     (setq package--init-file-ensured t)
  39     (setq package-user-dir "~/var/emacs/elpa")
  40     (setq package-archives '(("gnu" . "https://elpa.gnu.org/packages/")
  41                              ("melpa" . "https://melpa.org/packages/")
  42                              ("org" . "http://orgmode.org/elpa/")))
  43     (setq use-package-verbose (not (bound-and-true-p byte-compile-current-file))))
  44   (mapc #'(lambda (add) (add-to-list 'load-path add))
  45     (eval-when-compile
  46       (package-initialize)
  47       (unless (package-installed-p 'use-package)
  48         (package-refresh-contents)
  49         (package-install 'use-package))
  50       (let ((package-user-dir-real (file-truename package-user-dir)))
  51         ;; The reverse is necessary, because outside we mapc
  52         ;; add-to-list element-by-element, which reverses.
  53         (nreverse (apply #'nconc
  54                  ;; Only keep package.el provided loadpaths.
  55                  (mapcar #'(lambda (path)
  56                      (if (string-prefix-p package-user-dir-real path)
  57                          (list path)
  58                        nil))
  59                      load-path))))))
  60
  61   ;;; fix up info paths for packages
  62   (with-eval-after-load "info"
  63     (info-initialize)
  64     (dolist (dir (directory-files package-user-dir))
  65       (let ((fdir (concat (file-name-as-directory package-user-dir) dir)))
  66         (unless (or (member dir '("." ".." "archives" "gnupg"))
  67                     (not (file-directory-p fdir))
  68                     (not (file-exists-p (concat (file-name-as-directory fdir) "dir"))))
  69           (add-to-list 'Info-directory-list fdir)))))
  70
  71
  72   (eval-when-compile
  73     (require 'use-package))
  74   (require 'bind-key)
  75   (require 'diminish)
  76 #+END_SRC
  77 ** Paradox
  78 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  79   (use-package paradox
  80     :ensure paradox
  81     :commands (paradox-upgrade-packages paradox-list-packages)
  82     :config
  83     (setq paradox-execute-asynchronously t)
  84     (setq paradox-github-token t) ; I don't want to be prompted about this integration
  85     )
  86 #+END_SRC
  87 * Paths
  88 ** Update PATH
  89 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  90   (add-to-list 'exec-path '"/usr/local/bin")
  91   (add-to-list 'exec-path '"~/bin/")
  92 #+END_SRC
  93 ** Add library paths
  94
  95 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  96   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/")
  97   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/magit-annex")
  98 #+END_SRC
  99 * Disable custom-vars
 100 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 101   ;; Set the custom file to /dev/null and don't bother to load it
 102   (setq custom-file "/dev/null")
 103 #+END_SRC
 104 * Misc functions
 105 ** with-library
 106 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 107 ;; From http://www.emacswiki.org/emacs/LoadingLispFiles
 108 ;; execute conditional code when loading libraries
 109 (defmacro with-library (symbol &rest body)
 110   `(when (require ,symbol nil t)
 111      ,@body))
 112 (put 'with-library 'lisp-indent-function 1)
 113 #+END_SRC
 114
 115 * Variables
 116 ** Safe Local Variables
 117 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 118 (setq safe-local-variable-values
 119       (quote ((auto-save-default)
 120               (make-backup-files)
 121               (cperl-indent-level . 4)
 122               (indent-level . 4)
 123               (indent-tabs-mode . f)
 124               (vcl-indent-level . 4)
 125               )))
 126 #+END_SRC
 127 * Memory
 128 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 129   (setq global-mark-ring-max 128
 130         mark-ring-max 128
 131         kill-ring-max 128)
 132
 133   (defun don/minibuffer-setup-hook ()
 134     (setq gc-cons-threshold most-positive-fixnum))
 135
 136   (defun don/minibuffer-exit-hook ()
 137     (setq gc-cons-threshold 1048576))
 138
 139   (add-hook 'minibuffer-setup-hook #'don/minibuffer-setup-hook)
 140   (add-hook 'minibuffer-exit-hook #'don/minibuffer-exit-hook)
 141 #+END_SRC
 142 * Modules
 143 ** Spacemacs theme
 144 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 145 (use-package spacemacs-common
 146   :ensure spacemacs-theme
 147   :config
 148   (load-theme 'spacemacs-dark t)
 149   )
 150 #+END_SRC
 151 ** Hippie Expand
 152 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 153   (use-package hippie-exp
 154     :bind* (("M-<SPC>" . hippie-expand))
 155     )
 156 #+END_SRC
 157 ** Flyspell 🐝
 158 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 159   (use-package flyspell
 160     :ensure t
 161     :diminish flyspell-mode 🐝
 162     :config
 163     (add-hook 'text-mode-hook 'turn-on-flyspell)
 164     (add-hook 'c-mode-common-hook 'flyspell-prog-mode)
 165     (add-hook 'cperl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 166     (add-hook 'tcl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 167     :init
 168     (setq ispell-program-name "ispell")
 169     )
 170
 171 #+END_SRC
 172 ** Flymake
 173 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
 174   (use-package flymake
 175     :diminish "Φ")
 176 #+end_src
 177
 178 ** Winnermode
 179 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 180   (winner-mode 1)
 181 #+END_SRC
 182 ** Eyebrowse
 183
 184 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 185   (use-package eyebrowse
 186     :ensure t
 187     :diminish eyebrowse-mode
 188     :init (setq eyebrowse-keymap-prefix (kbd "C-c e"))
 189     :config (progn
 190               (setq eyebrowse-wrap-around t)
 191               (eyebrowse-mode t)
 192
 193               (defun my/eyebrowse-new-window-config ()
 194                 (interactive)
 195                 (let ((done nil))
 196                   (dotimes (i 10)
 197                     ;; start at 1 run till 0
 198                     (let ((j (mod (+ i 1) 10)))
 199                       (when (and (not done)
 200                                  (not (eyebrowse--window-config-present-p j)))
 201                         (eyebrowse-switch-to-window-config j)
 202                         (call-interactively 'eyebrowse-rename-window-config2 j)
 203                         (setq done t)
 204                         ))
 205                     )))
 206
 207               ;; I don't use latex-preview-pane
 208               ;; (require 'latex-preview-pane)
 209               ;; (defun my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch ()
 210               ;;   ;; latex-preview-pane uses window-parameters which are
 211               ;;   ;; not preserved by eyebrowse, so we close the preview
 212               ;;   ;; pane before switching, it will be regenerated when we
 213               ;;   ;; edit the TeX file.
 214               ;;   (when (lpp/window-containing-preview)
 215               ;;     (delete-window (lpp/window-containing-preview))))
 216
 217               ;; (add-to-list 'eyebrowse-pre-window-switch-hook
 218               ;;              #'my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch)
 219
 220               ;; (my/set-menu-key "["  #'my/eyebrowse-new-window-config)
 221               ;; (my/set-menu-key ";"  #'eyebrowse-prev-window-config)
 222               ;; (my/set-menu-key "'"  #'eyebrowse-next-window-config)
 223               ;; (my/set-menu-key "]"  #'eyebrowse-close-window-config)
 224               ;; (my/set-menu-key "\\" #'eyebrowse-rename-window-config)
 225               )
 226     )
 227 #+END_SRC
 228
 229 ** Window handling
 230
 231 *** Splitting
 232 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 233   (defun my/vsplit-last-buffer ()
 234     "Split the window vertically and display the previous buffer."
 235     (interactive)
 236     (split-window-vertically)
 237     (other-window 1 nil)
 238     (switch-to-next-buffer))
 239
 240   (defun my/hsplit-last-buffer ()
 241     "Split the window horizontally and display the previous buffer."
 242     (interactive)
 243     (split-window-horizontally)
 244     (other-window 1 nil)
 245     (switch-to-next-buffer))
 246
 247   (bind-key "C-x 2" 'my/vsplit-last-buffer)
 248   (bind-key "C-x 3" 'my/hsplit-last-buffer)
 249
 250   (setq split-width-threshold  100)
 251   (setq split-height-threshold 60)
 252
 253   (defun my/split-window-prefer-vertically (window)
 254     "If there's only one window (excluding any possibly active
 255            minibuffer), then split the current window horizontally."
 256     (if (and (one-window-p t)
 257              (not (active-minibuffer-window))
 258              ( < (frame-width) (frame-height))
 259              )
 260         (let ((split-width-threshold nil))
 261           (split-window-sensibly window))
 262       (split-window-sensibly window)))
 263
 264   (setq split-window-preferred-function #'my/split-window-prefer-vertically)
 265   (setq window-combination-resize t)
 266 #+END_SRC
 267
 268 *** Compilation window
 269
 270 If there is no compilation window, open one at the bottom, spanning
 271 the complete width of the frame. Otherwise, reuse existing window. In
 272 the former case, if there was no error the window closes
 273 automatically.
 274
 275 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 276   (add-to-list 'display-buffer-alist
 277                `(,(rx bos "*compilation*" eos)
 278                  (display-buffer-reuse-window
 279                   display-buffer-in-side-window)
 280                  (reusable-frames . visible)
 281                  (side            . bottom)
 282                  (window-height   . 0.4)))
 283 #+END_SRC
 284
 285 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 286   (defun my/compilation-exit-autoclose (status code msg)
 287     ;; If M-x compile exists with a 0
 288     (when (and (eq status 'exit) (zerop code))
 289       ;; and delete the *compilation* window
 290       (let ((compilation-window (get-buffer-window (get-buffer "*compilation*"))))
 291         (when (and (not (window-at-side-p compilation-window 'top))
 292                    (window-at-side-p compilation-window 'left)
 293                    (window-at-side-p compilation-window 'right))
 294           (delete-window compilation-window))))
 295     ;; Always return the anticipated result of compilation-exit-message-function
 296     (cons msg code))
 297
 298   ;; Specify my function (maybe I should have done a lambda function)
 299   (setq compilation-exit-message-function #'my/compilation-exit-autoclose)
 300 #+END_SRC
 301
 302 If you change the variable ~compilation-scroll-output~ to a ~non-nil~
 303 value, the compilation buffer scrolls automatically to follow the
 304 output. If the value is ~first-error~, scrolling stops when the first
 305 error appears, leaving point at that error. For any other non-nil
 306 value, scrolling continues until there is no more output.
 307
 308 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 309   (setq compilation-scroll-output 'first-error)
 310 #+END_SRC
 311
 312 ** Mode line cleaning
 313 *** Diminish
 314 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 315   (use-package diminish
 316     :ensure t)
 317 #+END_SRC
 318
 319 *** Delight
 320 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 321   (use-package delight
 322     :ensure t)
 323 #+END_SRC
 324
 325 ** Jumping
 326 *** Avy
 327 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 328   (use-package avy
 329     :if (>= emacs-major-version 25)
 330     :ensure t
 331     :bind (("C-c C-<SPC>" . avy-goto-word-or-subword-1)
 332            ("C-c j j" . avy-goto-word-or-subword-1)
 333            ("M-g g" . avy-goto-line))
 334     :config (progn (setq avy-background t))
 335     )
 336 #+END_SRC
 337 *** Ace-link (jumping to links)
 338 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 339   (use-package ace-link
 340     :ensure t
 341     ; bind o in most modes
 342     :config (ace-link-setup-default))
 343 #+END_SRC
 344 *** Jumping through edit points (goto-chg)
 345 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 346   (use-package goto-chg
 347     :ensure t
 348     :bind (("C-c j ," . goto-last-change)
 349            ("C-c j ." . goto-last-change-reverse))
 350     )
 351 #+END_SRC
 352 *** Jumping to bookmarks (visible bookmarks, bm)
 353 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 354   (use-package bm
 355     :ensure t
 356     :bind (("C-c j b ." . bm-next)
 357            ("C-c j b ," . bm-previous)
 358            ("C-c j b SPC" . bm-toggle)))
 359 #+END_SRC
 360
 361 ** Snippets
 362 *** Yasnippet
 363 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 364 (use-package yasnippet
 365   :ensure t
 366   :diminish yas-minor-mode
 367   :config (progn
 368             (yas-global-mode)
 369             (setq yas-verbosity 1)
 370             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<tab>") nil)
 371             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "TAB") nil)
 372             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<backtab>") nil)
 373             (setq yas-snippet-dirs '("~/lib/emacs_el/snippets/"
 374                                      "~/lib/emacs_el/yasnippet-snippets/snippets/"))
 375             (add-to-list 'hippie-expand-try-functions-list
 376                              'yas-hippie-try-expand)
 377             (yas-reload-all)
 378             )
 379   )
 380 #+END_SRC
 381 *** Auto-YASnippet
 382 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 383   (use-package auto-yasnippet
 384     :ensure t
 385     :bind (("H-w" . aya-create)
 386            ("H-y" . aya-expand)
 387            )
 388     )
 389 #+END_SRC
 390 ** Company
 391 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 392 (use-package company
 393   :ensure t
 394   :bind (("M-/" . company-complete))
 395   :config
 396   (setq company-echo-delay 0     ; remove blinking
 397         company-show-numbers t   ; show numbers for easy selection
 398         company-selection-wrap-around t
 399         company-require-match nil
 400         company-dabbrev-ignore-case t
 401         company-dabbrev-ignore-invisible t
 402         company-dabbrev-other-buffers t
 403         company-dabbrev-downcase nil
 404         company-dabbrev-code-everywhere t
 405         company-tooltip-align-annotations t
 406         company-minimum-prefix-length 1
 407         company-global-modes '(not)
 408         company-lighter-base "(C)")
 409   (global-company-mode 1)
 410   :bind (:map company-active-map
 411               ("C-n" . company-select-next)
 412               ("C-p" . company-select-previous)
 413               ("M-?" . company-show-doc-buffer)
 414               ("M-." . company-show-location)
 415               )
 416   )
 417 #+END_SRC
 418 *** C/C++
 419 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 420   (use-package company-c-headers
 421     :ensure t
 422     :config (progn
 423               (defun malb/ede-object-system-include-path ()
 424                 "Return the system include path for the current buffer."
 425                 (when ede-object
 426                   (ede-system-include-path ede-object)))
 427
 428               (setq company-c-headers-path-system
 429                     #'malb/ede-object-system-include-path)
 430
 431               (add-to-list 'company-backends #'company-c-headers)))
 432 #+END_SRC
 433 *** Python
 434 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 435 (use-package company-anaconda
 436   :ensure t
 437   :config (add-to-list 'company-backends #'company-anaconda))
 438 #+END_SRC
 439 *** Perl
 440 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 441   (use-package company-plsense
 442     :ensure t
 443     )
 444 #+END_SRC
 445 *** LaTeX
 446 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 447   (use-package company-math
 448     :ensure t)
 449 #+END_SRC
 450 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 451   (use-package company-auctex
 452     :ensure t
 453     :config (progn
 454               (defun company-auctex-labels (command &optional arg &rest ignored)
 455                 "company-auctex-labels backend"
 456                 (interactive (list 'interactive))
 457                 (case command
 458                   (interactive (company-begin-backend 'company-auctex-labels))
 459                   (prefix (company-auctex-prefix "\\\\.*ref{\\([^}]*\\)\\="))
 460                   (candidates (company-auctex-label-candidates arg))))
 461
 462               (add-to-list 'company-backends
 463                            '(company-auctex-macros
 464                              company-auctex-environments
 465                              company-math-symbols-unicode
 466                              company-math-symbols-latex))
 467
 468               (add-to-list 'company-backends #'company-auctex-labels)
 469               (add-to-list 'company-backends #'company-auctex-bibs)
 470               )
 471     )
 472 #+END_SRC
 473 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 474   (use-package company-bibtex
 475     :ensure t
 476     )
 477 #+END_SRC
 478 *** Shell
 479
 480  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 481    (use-package company-shell
 482      :ensure t
 483      :config (progn
 484                (setq company-shell-modes '(sh-mode shell-mode))
 485                (add-to-list 'company-backends 'company-shell)))
 486  #+END_SRC
 487
 488 *** YaSnippet
 489
 490  Add YasSippet support for all company backends. ([[https://github.com/syl20bnr/spacemacs/pull/179][source]])
 491
 492  *Note:* Do this at the end of =company-mode= config.
 493
 494  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 495    (defvar malb/company-mode/enable-yas t
 496      "Enable yasnippet for all backends.")
 497
 498    (defun malb/company-mode/backend-with-yas (backend)
 499      (if (or (not malb/company-mode/enable-yas)
 500              (and (listp backend)
 501                   (member 'company-yasnippet backend)))
 502          backend
 503        (append (if (consp backend) backend (list backend))
 504                '(:with company-yasnippet))))
 505
 506    (setq company-backends
 507          (mapcar #'malb/company-mode/backend-with-yas company-backends))
 508  #+END_SRC
 509
 510 *** All the words
 511
 512  Enable/disable company completion from ispell dictionaries ([[https://github.com/redguardtoo/emacs.d/blob/master/lisp/init-company.el][source]])
 513
 514  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 515    (defun malb/toggle-company-ispell ()
 516      (interactive)
 517      (cond
 518       ((member '(company-ispell :with company-yasnippet) company-backends)
 519        (setq company-backends (delete '(company-ispell :with company-yasnippet) company-backends))
 520        (add-to-list 'company-backends '(company-dabbrev :with company-yasnippet) t)
 521        (message "company-ispell disabled"))
 522       (t
 523        (setq company-backends (delete '(company-dabbrev :with company-yasnippet) company-backends))
 524        (add-to-list 'company-backends '(company-ispell :with company-yasnippet) t)
 525        (message "company-ispell enabled!"))))
 526
 527    (defun malb/company-ispell-setup ()
 528      ;; @see https://github.com/company-mode/company-mode/issues/50
 529      (when (boundp 'company-backends)
 530        (make-local-variable 'company-backends)
 531        (setq company-backends (delete '(company-dabbrev :with company-yasnippet) company-backends))
 532        (add-to-list 'company-backends '(company-ispell :with company-yasnippet) t)
 533        ;; https://github.com/redguardtoo/emacs.d/issues/473
 534        (if (and (boundp 'ispell-alternate-dictionary)
 535                 ispell-alternate-dictionary)
 536            (setq company-ispell-dictionary ispell-alternate-dictionary))))
 537  #+END_SRC
 538
 539 *** Tab DWIM
 540
 541  1. =yas-expand= is run first and does what it has to, then it calls =malb/indent-fold-or-complete=.
 542
 543  2. This function then hopefully does what I want:
 544
 545     a. if a region is active, just indent
 546     b. if we’re looking at a space after a non-whitespace character, we try some company-expansion
 547     c. If =hs-minor-mode= or =outline-minor-mode= is active, try those next
 548     d. otherwise call whatever would have been called otherwise.
 549
 550  ([[http://emacs.stackexchange.com/q/21182/8930][source]], [[http://emacs.stackexchange.com/q/7908/8930][source]])
 551
 552 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 553 (defun malb/indent-fold-or-complete (&optional arg)
 554   (interactive "P")
 555   (cond
 556    ;; if a region is active, indent
 557    ((use-region-p)
 558     (indent-region (region-beginning)
 559                    (region-end)))
 560    ;; if the next char is space or eol, but prev char not whitespace
 561    ((and (not (active-minibuffer-window))
 562          (or (looking-at " ")
 563              (looking-at "$"))
 564          (looking-back "[^[:space:]]")
 565          (not (looking-back "^")))
 566
 567     (cond (company-mode (company-complete-common))
 568           (auto-complete-mode (auto-complete))))
 569
 570    ;; no whitespace anywhere
 571    ((and (not (active-minibuffer-window))
 572          (looking-at "[^[:space:]]")
 573          (looking-back "[^[:space:]]")
 574          (not (looking-back "^")))
 575     (cond
 576      ((bound-and-true-p hs-minor-mode)
 577       (save-excursion (end-of-line) (hs-toggle-hiding)))
 578      ((bound-and-true-p outline-minor-mode)
 579       (save-excursion (outline-cycle)))))
 580
 581    ;; by default just call whatever was bound
 582    (t
 583     (let ((fn (or (if (current-local-map) (lookup-key (current-local-map) (kbd "TAB")))
 584                   'indent-for-tab-command)))
 585       (if (not (called-interactively-p 'any))
 586           (fn arg)
 587         (setq this-command fn)
 588         (call-interactively fn))))))
 589
 590 (defun malb/toggle-fold ()
 591   (interactive)
 592   (cond ((eq major-mode 'org-mode)
 593          (org-force-cycle-archived))
 594         ((bound-and-true-p hs-minor-mode)
 595          (save-excursion
 596            (end-of-line)
 597            (hs-toggle-hiding)))
 598
 599         ((bound-and-true-p outline-minor-mode)
 600          (save-excursion
 601            (outline-cycle)))))
 602
 603 (bind-key "<tab>" #'malb/indent-fold-or-complete)
 604 (bind-key "C-<tab>" #'malb/toggle-fold)
 605 #+END_SRC
 606 ** Tinyprocmail
 607
 608 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 609   ;; load tinyprocmail
 610   (use-package tinyprocmail
 611     :load-path "~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/tiny"
 612     :mode (".procmailrc" . turn-on-tinyprocmail-mode)
 613     )
 614 #+END_SRC
 615
 616 ** Magit
 617 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
 618   (use-package magit
 619     :ensure t
 620     :bind (("C-x g" . magit-status)
 621            ("C-x C-g" . magit-status))
 622     :config
 623     ;; refine diffs always (hilight words)
 624     (setq magit-diff-refine-hunk nil)
 625     )
 626   (use-package magit-annex
 627     :ensure t
 628     :load-path "~/lib/emacs_el/magit-annex/"
 629     )
 630   (use-package magit-vcsh
 631     :ensure t
 632     )
 633 #+END_SRC
 634
 635 ** Perl
 636 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 637   (use-package cperl-mode
 638     :config
 639     (progn
 640       ;; Use c-mode for perl .xs files
 641       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.xs\\'" . c-mode))
 642       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\([pP][Llm]\\|al\\)\\'" . cperl-mode))
 643       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl" . cperl-mode))
 644       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl5" . cperl-mode))
 645       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("miniperl" . cperl-mode))
 646       (setq cperl-hairy t
 647             cperl-indent-level 4
 648             cperl-auto-newline nil
 649             cperl-auto-newline-after-colon nil
 650             cperl-continued-statement-offset 4
 651             cperl-brace-offset -1
 652             cperl-continued-brace-offset 0
 653             cperl-label-offset -4
 654             cperl-highlight-variables-indiscriminately t
 655             cperl-electric-lbrace-space nil
 656             cperl-indent-parens-as-block nil
 657             cperl-close-paren-offset -1
 658             cperl-tab-always-indent t)
 659       ;;(add-hook 'cperl-mode-hook (lambda () (cperl-set-style "PerlStyle")))
 660   ))
 661 #+END_SRC
 662
 663 ** Markdown mode
 664 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 665   (use-package markdown-mode
 666     :ensure t
 667     :mode (("\\.md\\'" . markdown-mode)
 668            ("\\.mdwn\\'" . markdown-mode)
 669            ("README\\.md\\'" . gfm-mode)
 670            )
 671     :config
 672     (setq markdown-enable-math t)
 673     (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
 674     (bind-key "M-." #'markdown-jump markdown-mode-map)
 675     (add-hook 'markdown-mode-hook #'flyspell-mode)
 676     (add-hook 'markdown-mode-hook #'outline-minor-mode)
 677     (bind-key "C-<tab>" #'outline-cycle markdown-mode-map)
 678   )
 679
 680 #+END_SRC
 681 ** SQL mode
 682 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 683   ; load sql-indent when sql is loaded
 684 (use-package sql-indent
 685   :hook sql-mode
 686   )
 687 (use-package sql
 688   :mode (("\\.sql\\'" . sql-mode))
 689   )
 690 #+END_SRC
 691 ** Ediff
 692 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 693   (use-package ediff
 694     :commands ediff ediff3
 695     :ensure f
 696     :config
 697     ;; ediff configuration
 698     ;; don't use the multi-window configuration
 699     (setq ediff-window-setup-function 'ediff-setup-windows-plain)
 700   )
 701 #+END_SRC
 702 ** Do the Right Thing Indenting
 703 Attempts to automatically identify the right indentation for a file
 704 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 705 (use-package dtrt-indent
 706   :ensure t
 707 )
 708 #+END_SRC
 709 ** VCL --editing varnish configuration files
 710 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 711   (use-package vcl-mode
 712     :ensure t
 713     :mode "\\.vcl\\'"
 714     )
 715
 716 #+END_SRC
 717 ** Helm
 718 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 719   (defun malb/helm-omni (&rest arg)
 720     ;; just in case someone decides to pass an argument, helm-omni won't fail.
 721     (interactive)
 722     (unless helm-source-buffers-list
 723       (setq helm-source-buffers-list
 724             (helm-make-source "Buffers" 'helm-source-buffers)))
 725     (helm-other-buffer
 726      (append
 727
 728      (if (projectile-project-p)
 729           '(helm-source-projectile-buffers-list
 730             helm-source-buffers-list)
 731         '(helm-source-buffers-list)) ;; list of all open buffers
 732
 733       `(((name . "Virtual Workspace")
 734          (candidates . ,(--map (cons (eyebrowse-format-slot it) (car it))
 735                                (eyebrowse--get 'window-configs)))
 736          (action . (lambda (candidate)
 737                      (eyebrowse-switch-to-window-config candidate)))))
 738
 739       (if (projectile-project-p)
 740           '(helm-source-projectile-recentf-list
 741             helm-source-recentf)
 742         '(helm-source-recentf)) ;; all recent files
 743
 744       ;; always make some common files easily accessible
 745       ;;'(((name . "Common Files")
 746        ;;  (candidates . malb/common-file-targets)
 747         ;; (action . (("Open" . (lambda (x) (find-file (eval x))))))))
 748
 749       '(helm-source-files-in-current-dir
 750         helm-source-locate
 751         helm-source-bookmarks
 752         helm-source-buffer-not-found ;; ask to create a buffer otherwise
 753         ))
 754      "*Helm all the things*"))
 755   (use-package helm
 756     :ensure helm
 757     :diminish helm-mode
 758     :bind (("M-x" . helm-M-x)
 759            ("C-x C-f" . helm-find-files)
 760            ("C-x b" . helm-buffers-list) ; malb/helm-omni)
 761            ("C-x C-b" . helm-buffers-list) ; malb/helm-omni)
 762            ("C-c <SPC>" . helm-all-mark-rings))
 763     :config
 764     (require 'helm-config)
 765     (require 'helm-for-files)
 766     (require 'helm-bookmark)
 767
 768     (helm-mode 1)
 769     (define-key global-map [remap find-file] 'helm-find-files)
 770     (define-key global-map [remap occur] 'helm-occur)
 771     (define-key global-map [remap list-buffers] 'helm-buffers-list)
 772     (define-key global-map [remap dabbrev-expand] 'helm-dabbrev)
 773     (unless (boundp 'completion-in-region-function)
 774       (define-key lisp-interaction-mode-map [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point)
 775       (define-key emacs-lisp-mode-map       [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point))
 776     (add-hook 'kill-emacs-hook #'(lambda () (and (file-exists-p "$TMP") (delete-file "$TMP"))))
 777   )
 778 #+END_SRC
 779 *** Helm Flx
 780
 781  [[https://github.com/PythonNut/helm-flx][helm-flx]] implements intelligent helm fuzzy sorting, provided by [[https://github.com/lewang/flx][flx]].
 782
 783  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 784  (use-package helm-flx
 785    :ensure t
 786    :config (progn
 787              ;; these are helm configs, but they kind of fit here nicely
 788              (setq helm-M-x-fuzzy-match                  t
 789                    helm-bookmark-show-location           t
 790                    helm-buffers-fuzzy-matching           t
 791                    helm-completion-in-region-fuzzy-match t
 792                    helm-file-cache-fuzzy-match           t
 793                    helm-imenu-fuzzy-match                t
 794                    helm-mode-fuzzy-match                 t
 795                    helm-locate-fuzzy-match               nil
 796                    helm-quick-update                     t
 797                    helm-recentf-fuzzy-match              nil
 798                    helm-semantic-fuzzy-match             t)
 799              (helm-flx-mode +1)))
 800  #+END_SRC
 801 *** Helm Swoop
 802 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 803
 804   ;;; stolen from https://github.com/malb/emacs.d/blob/master/malb.org
 805   (defun malb/helm-swoop-pre-fill ()
 806     (thing-at-point 'symbol))
 807     (defvar malb/helm-swoop-ignore-major-mode "List of major modes to ignore for helm-swoop")
 808     (setq malb/helm-swoop-ignore-major-mode '(dired-mode
 809           paradox-menu-mode doc-view-mode pdf-view-mode
 810           mu4e-headers-mode org-mode markdown-mode latex-mode
 811           ein:notebook-multilang-mode))
 812
 813     (defun malb/swoop-or-search ()
 814       (interactive)
 815       (if (or (> (buffer-size) 1048576) ;; helm-swoop can be slow on big buffers
 816               (memq major-mode malb/helm-swoop-ignore-major-mode))
 817           (isearch-forward)
 818         (helm-swoop)))
 819
 820     (use-package helm-swoop
 821       :ensure t
 822       :commands helm-swoop
 823       :bind (("C-c o" . helm-multi-swoop-org)
 824              ("C-s" . malb/swoop-or-search)
 825              ("C-M-s" . helm-multi-swoop-all))
 826       :config (progn
 827
 828                 (setq helm-swoop-pre-input-function  #'malb/helm-swoop-pre-fill
 829                       helm-swoop-split-with-multiple-windows nil
 830                       helm-swoop-split-direction #'split-window-horizontally
 831                       helm-swoop-split-window-function 'helm-default-display-buffer
 832                       helm-swoop-speed-or-color t)
 833
 834                 ;; https://emacs.stackexchange.com/questions/28790/helm-swoop-how-to-make-it-behave-more-like-isearch
 835                 (defun malb/helm-swoop-C-s ()
 836                   (interactive)
 837                   (if (boundp 'helm-swoop-pattern)
 838                       (if (equal helm-swoop-pattern "")
 839                           (previous-history-element 1)
 840                         (helm-next-line))
 841                     (helm-next-line)))
 842
 843                 (bind-key "C-S-s" #'helm-swoop-from-isearch isearch-mode-map)
 844                 (bind-key "C-S-s" #'helm-multi-swoop-all-from-helm-swoop helm-swoop-map)
 845                 (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-swoop-map)
 846                 (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-swoop-map)
 847                 (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-multi-swoop-map)
 848                 (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-multi-swoop-map))
 849       )
 850
 851 #+END_SRC
 852 *** Helm Ag
 853 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 854 (use-package helm-ag
 855   :ensure t
 856   :config (setq helm-ag-base-command "ag --nocolor --nogroup"
 857                 helm-ag-command-option "--all-text"
 858                 helm-ag-insert-at-point 'symbol
 859                 helm-ag-fuzzy-match t
 860                 helm-ag-use-temp-buffer t
 861                 helm-ag-use-grep-ignore-list t
 862                 helm-ag-use-agignore t))
 863 #+END_SRC
 864 *** Helm Descbinds
 865 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 866   (use-package helm-descbinds
 867     :ensure t
 868     :bind ("C-h b" . helm-descbinds)
 869     :init (fset 'describe-bindings 'helm-descbinds))
 870 #+END_SRC
 871
 872 *** Helm YaSnippet
 873 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 874   (use-package helm-c-yasnippet
 875     :ensure t
 876     :bind ("C-c h y" .  helm-yas-complete)
 877     :config (progn
 878               (setq helm-yas-space-match-any-greedy t)))
 879 #+END_SRC
 880 *** Helm Org Rifle
 881 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 882   (use-package helm-org-rifle
 883     :ensure t
 884     :config (progn
 885               (defun malb/helm-org-rifle-agenda-files (arg)
 886                 (interactive "p")
 887                 (let ((current-prefix-arg nil))
 888                   (cond
 889                    ((equal arg 4) (call-interactively #'helm-org-rifle-agenda-files nil))
 890                    ((equal arg 16) (helm-org-rifle-occur-agenda-files))
 891                    (t (helm-org-agenda-files-headings)))))))
 892 #+END_SRC
 893 *** Helm Google
 894 This can be used to link things pretty quickly if necessary
 895 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 896   (use-package helm-google
 897     :ensure t
 898     :bind ("C-c h g" . helm-google)
 899     :config
 900     (progn (add-to-list 'helm-google-actions
 901                         '("Copy URL" . (lambda (candidate)
 902                                          (let ((url
 903                                                 (replace-regexp-in-string
 904                                                  "https://.*q=\\(.*\\)\&sa=.*"
 905                                                  "\\1" candidate)))
 906                                            (kill-new url))))
 907                         t
 908                         )
 909
 910            (add-to-list 'helm-google-actions
 911                         '("Org Store Link" . (lambda (candidate)
 912                                                (let ((title (car (split-string candidate "[\n]+")))
 913                                                      (url
 914                                                       (replace-regexp-in-string
 915                                                        "https://.*q=\\(.*\\)\&sa=.*"
 916                                                        "\\1" candidate)))
 917                                                  (push (list url title) org-stored-links))))
 918                         t)
 919            ))
 920 #+END_SRC
 921
 922 ** Projectile -- Project management
 923 #+begin_src emacs-lisp
 924   (use-package projectile
 925     :ensure t
 926     :bind (("<f5>" . projectile-compile-project)
 927            ("<f6>" . next-error))
 928     :config (progn
 929               (use-package magit :ensure t)
 930               (require 'helm-projectile)
 931               (helm-projectile-on)
 932
 933               (setq projectile-make-test-cmd "make check"
 934                     projectile-switch-project-action 'helm-projectile
 935                     projectile-mode-line  '(:eval (format "»{%s}" (projectile-project-name))))
 936
 937               (projectile-global-mode)))
 938 #+end_src
 939
 940 *** helm integration
 941 #+begin_src emacs-lisp
 942   (use-package helm-projectile
 943     :ensure t
 944     :config (progn
 945               (defvar malb/helm-source-file-not-found
 946                 (helm-build-dummy-source
 947                     "Create file"
 948                   :action 'find-file))
 949
 950               (add-to-list
 951                'helm-projectile-sources-list
 952                malb/helm-source-file-not-found t)
 953
 954               (helm-delete-action-from-source
 955                "Grep in projects `C-s'"
 956                helm-source-projectile-projects)
 957
 958               (helm-add-action-to-source
 959                "Grep in projects `C-s'"
 960                'helm-do-ag helm-source-projectile-projects 4)))
 961 #+end_src
 962 ** Zap to char
 963 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 964   (use-package avy-zap
 965     :ensure t
 966     :bind ("M-z" . avy-zap-up-to-char-dwim))
 967 #+END_SRC
 968 ** Hydra
 969 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 970   (use-package hydra
 971     :bind (("C-c 2" . my/hydra-orgmodes/body)
 972            ("C-c @" . my/hydra-orgmodes/body)
 973            ("C-c #" . my/hydra-outline/body)
 974            ("C-c 3" . my/hydra-outline/body)
 975            )
 976     :config
 977     (defhydra my/hydra-orgmodes (:color blue :hint nil)
 978     "
 979   _n_: notes _c_: chaim _w_: wildman _o_: ool
 980   _u_: uddin _s_: steve _r_: refile  _f_: fh
 981   _p_: read papers      _R_: paper notes
 982   _h_: hpcbio
 983   _q_: quit
 984   _z_: quit
 985   "
 986     ("n" (find-file "~/projects/org-notes/notes.org"))
 987     ("c" (find-file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
 988     ("w" (find-file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
 989     ("u" (find-file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
 990     ("o" (find-file "~/projects/org-notes/ool.org"))
 991     ("f" (find-file "~/projects/org-notes/fh.org"))
 992     ("s" (find-file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
 993     ("r" (find-file my/org-refile-file))
 994     ("p" (find-file "~/projects/research/papers_to_read.org"))
 995     ("R" (find-file "~/projects/research/paper_notes.org"))
 996     ("h" (find-file "~/projects/org-notes/hpcbio.org"))
 997     ("q" nil "quit")
 998     ("z" nil "quit")
 999     )
1000
1001     ;; from https://github.com/abo-abo/hydra/wiki/Emacs
1002     (defhydra my/hydra-outline (:color pink :hint nil)
1003     "
1004   ^Hide^             ^Show^           ^Move
1005   ^^^^^^------------------------------------------------------
1006   _q_: sublevels     _a_: all         _u_: up
1007   _t_: body          _e_: entry       _n_: next visible
1008   _o_: other         _i_: children    _p_: previous visible
1009   _c_: entry         _k_: branches    _f_: forward same level
1010   _l_: leaves        _s_: subtree     _b_: backward same level
1011   _d_: subtree
1012
1013   "
1014     ;; Hide
1015     ("q" outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
1016     ("t" outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
1017     ("o" outline-hide-other)        ; Hide other branches
1018     ("c" outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
1019     ("l" outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
1020     ("d" outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
1021     ;; Show
1022     ("a" outline-show-all)          ; Show (expand) everything
1023     ("e" outline-show-entry)        ; Show this heading's body
1024     ("i" outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
1025     ("k" outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
1026     ("s" outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
1027     ;; Move
1028     ("u" outline-up-heading)                ; Up
1029     ("n" outline-next-visible-heading)      ; Next
1030     ("p" outline-previous-visible-heading)  ; Previous
1031     ("f" outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
1032     ("b" outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
1033     ("z" nil "leave"))
1034   )
1035 #+END_SRC
1036
1037 ** Tramp
1038 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1039   (use-package tramp
1040     :config
1041     (add-to-list 'tramp-methods '("vcsh"
1042                                   (tramp-login-program "vcsh")
1043                                   (tramp-login-args
1044                                    (("enter")
1045                                     ("%h")))
1046                                   (tramp-remote-shell "/bin/sh")
1047                                   (tramp-remote-shell-args
1048                                    ("-c")))))
1049 #+END_SRC
1050 ** Reftex
1051 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1052   (use-package reftex
1053     :ensure t
1054     :config
1055     (setq-default reftex-default-bibliography
1056                     '("~/projects/research/references.bib")))
1057 #+END_SRC
1058 ** BibTex
1059 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1060   (use-package bibtex
1061     :config (setq bibtex-user-optional-fields
1062                   (quote (("annote" "Personal annotation (ignored)")
1063                           ("abstract" "")
1064                   ("pmid" "")
1065                   ("doi" ""))))
1066     )
1067
1068 #+END_SRC
1069 ** LaTeX
1070 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1071 (use-package tex
1072   :defer t
1073   :ensure auctex
1074   :config
1075   ; (add-to-list 'TeX-style-path '"/home/don/lib/emacs_el/auctex/style")
1076   ;; REFTEX (much enhanced management of cross-ref, labels, etc)
1077   ;; http://www.strw.leidenuniv.nl/~dominik/Tools/reftex/
1078   ; (autoload 'reftex-mode     "reftex" "RefTeX Minor Mode" t)
1079   ; (autoload 'turn-on-reftex  "reftex" "RefTeX Minor Mode" nil)
1080   ; (autoload 'reftex-citation "reftex-cite" "Make citation" nil)
1081   ; (autoload 'reftex-index-phrase-mode "reftex-index" "Phrase mode" t)
1082   (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with AUCTeX LaTeX mode
1083   (add-hook 'latex-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with Emacs latex mode
1084   (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with AUCTeX LaTeX mode
1085   (add-hook 'latex-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with Emacs latex mode
1086
1087   (setq-default reftex-plug-into-AUCTeX t)
1088   ;; support fake section headers
1089   (setq TeX-outline-extra
1090         '(("%chapter" 1)
1091           ("%section" 2)
1092           ("%subsection" 3)
1093           ("%subsubsection" 4)
1094           ("%paragraph" 5)))
1095   ;; add font locking to the headers
1096   (font-lock-add-keywords
1097    'latex-mode
1098    '(("^%\\(chapter\\|\\(sub\\|subsub\\)?section\\|paragraph\\)"
1099       0 'font-lock-keyword-face t)
1100      ("^%chapter{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-1-face t)
1101      ("^%section{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-2-face t)
1102      ("^%subsection{\\(.*\\)}"    1 'font-latex-sectioning-3-face t)
1103      ("^%subsubsection{\\(.*\\)}" 1 'font-latex-sectioning-4-face t)
1104      ("^%paragraph{\\(.*\\)}"     1 'font-latex-sectioning-5-face t)))
1105
1106   ;; use smart quotes by default instead of `` and ''
1107   ;; taken from http://kieranhealy.org/esk/kjhealy.html
1108   (setq TeX-open-quote "“")
1109   (setq TeX-close-quote "”")
1110
1111   ;; (TeX-add-style-hook
1112   ;;  "latex"
1113   ;;  (lambda ()
1114   ;;    (TeX-add-symbols
1115   ;;     '("DLA" 1))))
1116   ;; (custom-set-variables
1117   ;;  '(font-latex-user-keyword-classes
1118   ;;    '(("fixme"
1119   ;;       ("DLA" "RZ")
1120   ;;       font-lock-function-name-face 2 (command 1 t))))
1121   ;; )
1122   (setq-default TeX-parse-self t)
1123   (setq-default TeX-auto-save t)
1124   (setq-default TeX-master nil)
1125   (add-to-list 'LaTeX-font-list
1126                '(?\C-a "\\alert{","}"))
1127   (eval-after-load
1128       "latex"
1129     '(TeX-add-style-hook
1130       "cleveref"
1131       (lambda ()
1132         (if (boundp 'reftex-ref-style-alist)
1133             (add-to-list
1134              'reftex-ref-style-alist
1135              '("Cleveref" "cleveref"
1136                (("\\cref" ?c) ("\\Cref" ?C) ("\\cpageref" ?d) ("\\Cpageref" ?D)))))
1137         (reftex-ref-style-activate "Cleveref")
1138         (TeX-add-symbols
1139          '("cref" TeX-arg-ref)
1140          '("Cref" TeX-arg-ref)
1141          '("cpageref" TeX-arg-ref)
1142          '("Cpageref" TeX-arg-ref)))))
1143   (eval-after-load
1144       "latex"
1145     '(add-to-list 'LaTeX-fill-excluded-macros
1146                   '("Sexpr")))
1147
1148   (use-package font-latex
1149     :config
1150     (setq font-latex-match-reference-keywords
1151           '(
1152             ("fref" "{")
1153             ("Fref" "{")
1154             ("citep" "{")
1155             ("citet" "{")
1156             ("acs" "{")
1157             ("acsp" "{")
1158             ("ac" "{")
1159             ("acp" "{")
1160             ("acl" "{")
1161             ("aclp" "{")
1162             ("acsu" "{")
1163             ("aclu" "{")
1164             ("acused" "{")
1165             ("DLA" "{")
1166             ("RZ" "{")
1167             ("OM" "{")
1168             ("DL" "{")
1169             ("fixme" "{"))
1170           )
1171     )
1172   (setq font-latex-fontify-script nil)
1173   (setq font-latex-fontify-sectioning (quote color))
1174   (setq font-latex-script-display (quote (nil)))
1175 )
1176
1177 #+END_SRC
1178 ** ESS
1179 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1180   (use-package ess
1181     :ensure t
1182     :commands R
1183     :mode ("\\.R\\'" . ess-r-mode)
1184     :bind (:map ess-mode-map
1185                 ("C-c C-R" . dla/ess-region-remote-eval))
1186     :init
1187     (autoload 'ess-r-mode "ess-site" nil t)
1188     (autoload 'R "ess-site" nil t)
1189     :config
1190     ; actually load the rest of ess
1191     (require 'ess-site)
1192     (defun ess-change-directory (path)
1193       "Set the current working directory to PATH for both *R* and Emacs."
1194       (interactive "Directory to change to: ")
1195
1196       (when (file-exists-p path)
1197         (ess-command (concat "setwd(\"" path "\")\n"))
1198         ;; use file-name-as-directory to ensure it has trailing /
1199         (setq default-directory (file-name-as-directory path))))
1200     (add-hook 'ess-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
1201     ;; outlining support for ess modes
1202     (add-hook
1203      'ess-mode-hook
1204      '(lambda ()
1205         (outline-minor-mode)
1206         (setq outline-regexp "\\(^#\\{4,5\\} \\)\\|\\(^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function\\)")
1207         (defun outline-level ()
1208           (cond ((looking-at "^##### ") 1)
1209                 ((looking-at "^#### ") 2)
1210                 ((looking-at "^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function(.*{") 3)
1211                 (t 1000)))
1212         ))
1213     (defun dla/ess-region-remote-eval (start end)
1214       "Evaluate region in a remote ESS instance"
1215       (interactive "r")
1216       (shell-command-on-region start end "eval_r" (get-buffer-create "***essregionremoteeval***") nil nil nil)
1217       (kill-buffer "***essregionremoteeval***"))
1218     ;; Don't restore history or save workspace image
1219     '(inferior-R-args "--no-restore-history --no-save")
1220     )
1221 #+END_SRC
1222
1223 ** Rainbowmode
1224 From http://julien.danjou.info/projects/emacs-packages#rainbow-mode, this colorizes color strings
1225
1226 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1227   (use-package rainbow-mode
1228     ;; add ess to the x major mode
1229     :config (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[S])
1230     (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[R])
1231   )
1232 #+END_SRC
1233
1234 ** YAML Mode
1235 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1236   (use-package yaml-mode
1237     ;; add ess to the x major mode
1238     :mode ("\\.\\(yaml|yml\\)\\'" . yaml-mode)
1239   )
1240 #+END_SRC
1241
1242 ** Polymode
1243 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1244 (use-package poly-noweb
1245   :ensure t
1246   :after polymode
1247
1248   )
1249 (use-package poly-markdown
1250   :ensure t
1251   :after polymode
1252   )
1253 (use-package poly-R
1254   :ensure t
1255   :after (:all polymode poly-markdown poly-noweb)
1256   ; :mode ("\\.Snw" . poly-noweb+r-mode)
1257   ; :mode ("\\.Rnw" . poly-noweb+r-mode)
1258   ; :mode ("\\.Rmd" . poly-markdown+r-mode)
1259   )
1260 (use-package polymode
1261   :ensure t
1262   )
1263
1264 #+END_SRC
1265
1266 ** Outlining
1267 *** Outline magic
1268 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1269   (use-package outline-magic)
1270 #+END_SRC
1271 *** Outline mode
1272 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1273 ;; change the outline mode prefix from C-c @ to C-c C-2
1274 (setq outline-minor-mode-prefix "C-c C-2")
1275 ;;(add-hook 'outline-minor-mode-hook
1276 ;;          (lambda () (local-set-key (kbd "C-c C-2")
1277 ;;                                    outline-mode-prefix-map)))
1278
1279 #+END_SRC
1280 ** Writeroom Mode
1281 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1282   (use-package writeroom-mode
1283     :config
1284     (defun my/writing-mode ()
1285       "Start my writing mode; enable visual-line-mode and auto-fill-mode"
1286       (interactive)
1287       (if writeroom-mode
1288           (progn
1289             (writeroom-mode -1)
1290             (visual-line-mode -1)
1291             (auto-fill-mode -1)
1292             (visual-fill-column-mode -1)
1293             )
1294         (visual-line-mode 1)
1295         (auto-fill-mode 1)
1296         (visual-fill-column-mode 1)
1297         (writeroom-mode 1))
1298       )
1299     )
1300 #+END_SRC
1301 ** GhostText/Atomic Chrome
1302 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1303   (use-package atomic-chrome
1304     :config
1305     (ignore-errors (atomic-chrome-start-server))
1306     (setq atomic-chrome-buffer-open-style 'full)
1307     )
1308 #+END_SRC
1309 ** Edit Server
1310 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1311   (use-package edit-server
1312     :ensure t
1313     :commands edit-server-start
1314     :init (if after-init-time
1315               (edit-server-start)
1316             (add-hook 'after-init-hook
1317                       #'(lambda() (edit-server-start))))
1318     :config (setq edit-server-new-frame-alist
1319                   '((name . "Edit with Emacs FRAME")
1320                     (top . 200)
1321                     (left . 200)
1322                     (width . 80)
1323                     (height . 25)
1324                     (minibuffer . t)
1325                     (menu-bar-lines . t)
1326                     (window-system . x)))
1327     )
1328 #+END_SRC
1329 ** Multiple Cursors
1330    :PROPERTIES:
1331    :ID:       6fcf218b-a762-4c37-9339-a8202ddeb544
1332    :END:
1333 [[https://github.com/magnars/multiple-cursors.el][Multiple Cursors]]
1334 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1335   (use-package multiple-cursors
1336     :bind* (("C-;" . mc/mark-all-dwim)
1337             ("C-<" . mc/mark-previous-like-this)
1338             ("C->" . mc/mark-next-like-this)
1339             ("C-S-c C-S-c" . mc/edit-lines))
1340     )
1341 #+END_SRC
1342 ** Web Mode
1343 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1344   (use-package web-mode
1345     :load-path "/home/don/projects/web-mode/"
1346     :mode ("\\.\\(tx|tmpl\\)\\'" . web-mode)
1347     :config
1348     (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.tmpl\\'" . web-mode))
1349     (setq web-mode-enable-engine-detection t)
1350     (setq web-mode-engines-alist
1351           '(("template-toolkit" . "\\.tmpl\\'")))
1352     )
1353 #+END_SRC
1354 ** Spamassassin Mode
1355 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1356   (use-package spamassassin-mode
1357     :commands spamassassin-mode
1358     :ensure f
1359     )
1360 #+END_SRC
1361 ** Password Store
1362 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1363   (use-package password-store
1364     :ensure f
1365     :commands password-store-edit password-store-generate
1366     )
1367 #+END_SRC
1368 ** CSS mode
1369 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1370   (use-package css
1371     :mode "\\.css'"
1372     :config
1373     ;; fix up css mode to not be silly
1374     ;; from http://www.stokebloke.com/wordpress/2008/03/21/css-mode-indent-buffer-fix/
1375     (setq cssm-indent-level 4)
1376     (setq cssm-newline-before-closing-bracket t)
1377     (setq cssm-indent-function #'cssm-c-style-indenter)
1378     (setq cssm-mirror-mode nil))
1379 #+END_SRC
1380 ** Abbrev Mode
1381 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1382   (use-package abbrev
1383     :diminish abbrev-mode
1384     :config
1385     ;; load abbreviations from
1386     (setq abbrev-file-name
1387           "~/.emacs_abbrev_def")
1388
1389     ;; read the abbrev file if it exists
1390     (if (file-exists-p abbrev-file-name)
1391         (quietly-read-abbrev-file))
1392
1393     ;; for now, use abbrev mode everywhere
1394     (setq default-abbrev-mode t))
1395 #+END_SRC
1396
1397 ** Python Programming
1398 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1399 (use-package python-mode
1400   :hook
1401   (python-mode . pyenv-mode)
1402   (python-mode . flycheck-mode)
1403   (python-mode . company-mode)
1404   (python-mode . blacken-mode)
1405   (python-mode . yas-minor-mode)
1406   (python-mode . anaconda-mode)
1407   )
1408 (use-package pyenv
1409   :ensure t
1410   )
1411 (use-package blacken
1412   :init
1413   (setq-default blacken-fast-unsafe t)
1414   (setq-default blacken-line-length 80)
1415   :ensure t)
1416 (use-package anaconda-mode
1417   :ensure t
1418   )
1419
1420 (use-package elpy
1421   :ensure t
1422   :init
1423   (elpy-enable)
1424   )
1425 #+END_SRC
1426 # *** Jedi
1427 # #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1428 #   (use-package company-jedi
1429 #     :ensure t
1430 #     :hook (python-mode . (add-to-list 'company-backends 'company-jedi))
1431 #     :hook (python-mode  . 'jedi:setup)
1432 #     :config
1433 #     (setq jedi:complete-on-dot t)
1434 #     )
1435 # #+END_SRC
1436 *** Black
1437 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
1438   (use-package python-black
1439     :demand t
1440     :after python)
1441 #+end_src
1442 *** Sphinx Documentation
1443 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
1444   (use-package numpydoc
1445     :ensure t
1446     :after python
1447     :bind (:map python-mode-map
1448                 ("C-c C-n" . numpydoc-generate)))
1449   (use-package sphinx-doc
1450     :ensure t
1451     :config
1452     (sphinx-doc-mode t)
1453     (setq sphinx-doc-include-types t)
1454     :after python)
1455 #+end_src
1456 ** Go language
1457 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1458 (use-package go-mode
1459              :diminish "go"
1460              :mode "\\.go"
1461              )
1462 #+END_SRC
1463
1464 ** Expand region
1465 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1466 (use-package expand-region
1467   :bind (("C-=" . 'er/expand-region))
1468   )
1469 #+END_SRC
1470
1471 ** Dockerfile
1472 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1473 (use-package dockerfile-mode
1474   :mode "Dockerfile"
1475   )
1476 #+END_SRC
1477
1478 ** Beancount
1479 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1480 (use-package beancount
1481   :load-path "~/lib/emacs_el/beancount-mode/"
1482   :ensure f
1483   :mode "\\.beancount\\'"
1484
1485   )
1486 #+END_SRC
1487 * Email
1488 ** Mutt
1489 *** Message-mode
1490 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1491 (use-package message
1492   :ensure f
1493   :diminish (message "✉")
1494   :mode ("muttng-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1495   :mode ("mutt-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1496   :hook 'my/message-mode-settings
1497   :hook 'turn-on-flyspell
1498   :bind (:map message-mode-map
1499       ("C-c C-a" . my/post-attach-file))
1500   :delight (message-mode "✉")
1501   :config
1502   (defun my/message-mode-settings ()
1503     (font-lock-add-keywords nil
1504                 '(("^[ \t]*>[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1505                (0 'message-multiply-quoted-text-face))
1506               ("^[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1507                (0 'message-double-quoted-text-face))))
1508     )
1509
1510   (defun my/post-attach-file ()
1511     "Prompt for an attachment."
1512     (interactive)
1513     (let ((file (read-file-name "Attach file: " nil nil t nil)))
1514       (my/header-attach-file file "")))
1515
1516   (defun my/header-attach-file (file description)
1517     "Attach a FILE to the current message (works with Mutt).
1518   Argument DESCRIPTION MIME description."
1519     (interactive "fAttach file: \nsDescription: ")
1520     (when (> (length file) 0)
1521   (save-excursion
1522     (save-match-data
1523       (save-restriction
1524         (widen)
1525         (goto-char (point-min))
1526         (search-forward-regexp "^$")
1527         (insert (concat "Attach: " (replace-regexp-in-string "\\([[:space:]\\]\\)" "\\\\\\1" (file-truename file)) " "
1528                 description "\n"))
1529         (message (concat "Attached '" file "'."))
1530         (setq post-has-attachment t))))))
1531
1532   (setq mail-yank-prefix "> ")
1533   (setq mail-header-separator "") ; fix broken header detection
1534 )
1535 #+END_SRC
1536 *** Muttrc mode
1537 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1538   (use-package muttrc-mode
1539     :mode "muttngrc"
1540     :mode "muttrc"
1541   )
1542
1543 #+END_SRC
1544 * Base emacs
1545 ** Reverting buffers
1546 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1547   (use-package autorevert
1548     :diminish auto-revert-mode
1549     :config
1550     (setq global-auto-revert-non-file-buffers t
1551           global-auto-revert-ignore-modes '(pdf-view-mode)
1552           auto-revert-verbose nil)
1553     (global-auto-revert-mode 1))
1554 #+END_SRC
1555 * Org Mode
1556 ** Use-package and load things
1557 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1558
1559   (use-package org
1560     :delight (org-mode "ø")
1561     :mode ("\\.\\(org\\|org_archive\\|txt\\)\\'" . org-mode)
1562     :bind (("C-c l"  . org-store-link)
1563            ("C-c a"  . org-agenda)
1564            ("C-c b"  . org-iswitchb))
1565 #+END_SRC
1566 ** Agenda Configuration
1567 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1568   :config
1569   (setq-default org-log-done 'time)
1570   (setq-default org-agenda-ndays 5)
1571
1572   (setq org-agenda-sticky t)
1573   (defun dla/show-org-agenda ()
1574     (interactive)
1575     (let (agendabuffer
1576           '(delq nil
1577                 (mapcar (lambda (x)
1578                           (and (string-match-p
1579                                 "\*Org Agenda.*\*"
1580                                 (buffer-name x))
1581                                x)
1582                           )
1583                         (buffer-list))))
1584       (if agendabuffer
1585           (switch-to-buffer
1586            (buffer-name agendabuffer))
1587         (org-agenda-list)))
1588       (delete-other-windows))
1589
1590   ;; agenda configuration
1591   ;; Do not dim blocked tasks
1592   (setq org-agenda-dim-blocked-tasks nil)
1593   (setq org-agenda-inhibit-startup t)
1594   (setq org-agenda-use-tag-inheritance nil)
1595
1596   ;; Compact the block agenda view
1597   (setq org-agenda-compact-blocks t)
1598
1599   ;; Custom agenda command definitions
1600   (setq org-agenda-custom-commands
1601         (quote (("N" "Notes" tags "NOTE"
1602                  ((org-agenda-overriding-header "Notes")
1603                   (org-tags-match-list-sublevels t)))
1604                 ("h" "Habits" tags-todo "STYLE=\"habit\""
1605                  ((org-agenda-overriding-header "Habits")
1606                   (org-agenda-sorting-strategy
1607                    '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1608                 (" " "Agenda"
1609                  ((agenda "" nil)
1610                   (tags "REFILE"
1611                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Refile")
1612                          (org-tags-match-list-sublevels nil)))
1613                   (tags-todo "-CANCELLED/!"
1614                              ((org-agenda-overriding-header "Stuck Projects")
1615                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-stuck-projects)
1616                               (org-agenda-sorting-strategy
1617                                '(category-keep))))
1618                   (tags-todo "-HOLD-CANCELLED/!"
1619                              ((org-agenda-overriding-header "Projects")
1620                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-projects)
1621                               (org-tags-match-list-sublevels 'indented)
1622                               (org-agenda-sorting-strategy
1623                                '(category-keep))))
1624                   (tags-todo "-CANCELLED/!NEXT"
1625                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Next Tasks"
1626                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1627                                                                         ""
1628                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1629                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-projects-and-habits-and-single-tasks)
1630                               (org-tags-match-list-sublevels t)
1631                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1632                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1633                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1634                               (org-agenda-sorting-strategy
1635                                '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1636                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1637                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Subtasks"
1638                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1639                                                                         ""
1640                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1641                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-project-tasks)
1642                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1643                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1644                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1645                               (org-agenda-sorting-strategy
1646                                '(category-keep))))
1647                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1648                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Standalone Tasks"
1649                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1650                                                                         ""
1651                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1652                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-project-tasks)
1653                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1654                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1655                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1656                               (org-agenda-sorting-strategy
1657                                '(category-keep))))
1658                   (tags-todo "-CANCELLED+WAITING|HOLD/!"
1659                              ((org-agenda-overriding-header "Waiting and Postponed Tasks")
1660                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-stuck-projects)
1661                               (org-tags-match-list-sublevels nil)
1662                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled t)
1663                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines t)))
1664                   (tags "-REFILE/"
1665                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Archive")
1666                          (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-archivable-tasks)
1667                          (org-tags-match-list-sublevels nil))))
1668                  nil))))
1669
1670   ; org mode agenda files
1671   (setq org-agenda-files
1672         (append
1673         (file-expand-wildcards "~/projects/org-notes/*.org")
1674         (file-expand-wildcards "~/org-mode/from-mobile.org")
1675         (file-expand-wildcards "~/org-notes-*/*.org")
1676         )
1677   )
1678   (setq my/org-refile-file
1679         (car (seq-filter
1680               (lambda (file) (string-match-p (regexp-quote "/refile.org") file))
1681               org-agenda-files)))
1682
1683   (set-register ?n (cons 'file "~/projects/org-notes/notes.org"))
1684   (set-register ?r (cons 'file my/org-refile-file))
1685   (set-register ?o (cons 'file "~/projects/org-notes/ool.org"))
1686   (set-register ?s (cons 'file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
1687   (set-register ?c (cons 'file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
1688   (set-register ?w (cons 'file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
1689   (set-register ?u (cons 'file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
1690   (set-register ?R (cons 'file "~/projects/reviews/reviews.org"))
1691   (set-register ?d (cons 'file "~/projects/org-notes/diary.org"))
1692   ; from https://emacs.stackexchange.com/questions/909/how-can-i-have-an-agenda-timeline-view-of-multiple-files
1693   (defun org-agenda-timeline-all (&optional arg)
1694     (interactive "P")
1695     (with-temp-buffer
1696       (dolist (org-agenda-file org-agenda-files)
1697         (insert-file-contents org-agenda-file nil)
1698         (goto-char (point-max))
1699         (newline))
1700       (write-file "/tmp/timeline.org")
1701       (org-agenda arg "L")))
1702   (define-key org-mode-map (kbd "C-c t") 'org-agenda-timeline-all)
1703
1704 #+END_SRC
1705 ** General config
1706 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1707   (setq org-global-properties '(("Effort_ALL 0 0:10 0:30 1:00 2:00 3:00 4:00 5:00 6:00 7:00")))
1708   (setq org-columns-default-format "%40ITEM(Task) %6Effort{:} %CLOCKSUM %PRIORITY %TODO %13SCHEDULED %13DEADLINE %TAGS")
1709
1710   (setq org-default-notes-file "~/projects/org-notes/notes.org")
1711   (setq org-id-link-to-org-use-id 'use-existing)
1712 #+END_SRC
1713 ** Capture Templates
1714 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1715   (setq org-capture-templates  ;; mail-specific note template, identified by "m"
1716         `(("m" "Mail" entry (file my/org-refile-file)
1717            "* %?\n\n  Source: %u, [[%:link][%:description]]\n  %:initial")
1718           ("t" "todo" entry (file my/org-refile-file)
1719            "* TODO %?\n  :PROPERTIES:\n  :END:\n  :LOGBOOK:\n  :END:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1720           ("r" "respond" entry (file my/org-refile-file)
1721            "* NEXT Respond to %:from on %:subject\nSCHEDULED: %t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t :immediate-finish t)
1722           ("n" "note" entry (file my/org-refile-file)
1723            "* %? :NOTE:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1724           ("s" "schedule" entry (file my/org-refile-file)
1725            "* %? :cal:\n%^{scheduled:}t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1726           ("j" "Journal" entry (file+datetree "~/projects/org-notes/diary.org")
1727            "* %?\n%U\n" :clock-in t :clock-resume t)
1728           ("w" "org-protocol" entry (file my/org-refile-file)
1729            "* TODO Review %c\n%U\n" :immediate-finish t)
1730           ("M" "Meeting" entry (file my/org-refile-file)
1731            "* MEETING with %? :MEETING:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1732           ("S" "Seminar" entry (file my/org-refile-file)
1733            "* SEMINAR notes %? :SEMINAR:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1734           ("P" "Paper to read" entry (file+headline "~/projects/research/papers_to_read.org" "Refile")
1735            "* TODO Get/Read %? \n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1736           ("p" "Phone call" entry (file my/org-refile-file)
1737            "* PHONE %? :PHONE:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1738            ("J" "job" entry (file+olp "~/projects/org-notes/notes.org"
1739                                        "Jobs"
1740                                        ,(format-time-string "Positions %Y"))
1741            "* TODO Apply for %? :job:\nSCHEDULED: <%<%Y-%m-%d>>\n%U\n%x\n" :clock-in t :clock-resume t)
1742           ("h" "Habit" entry (file my/org-refile-file)
1743            "* NEXT %?\n%U\n%a\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d .+1d/3d>\")\n:PROPERTIES:\n:STYLE: habit\n:REPEAT_TO_STATE: NEXT\n:END:\n%a\n")
1744           )
1745         )
1746
1747   ;; Remove empty LOGBOOK drawers on clock out
1748   (defun bh/remove-empty-drawer-on-clock-out ()
1749     (interactive)
1750     (save-excursion
1751       (beginning-of-line 0)
1752       (org-remove-empty-drawer-at (point))))
1753
1754   (defun my/org-add-id ()
1755     (interactive)
1756     (save-excursion
1757       (if (org-current-level)
1758           ()
1759         (forward-char 1)
1760         )
1761       (org-id-get-create)
1762       )
1763   )
1764
1765 #+END_SRC
1766 ** Org mode key bindings
1767 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1768   ;; org mode configuration from http://doc.norang.ca/org-mode.html
1769   ;; Custom Key Bindings
1770   :bind* (("<f9> a" . org-agenda)
1771           ("<f9> I" . bh/punch-in)
1772           ("<f9> O" . bh/punch-out)
1773           ("<f9> SPC" . bh/clock-in-last-task)
1774           ("<f12>" . dla/show-org-agenda)
1775           ;; ("<f5>" . bh/org-todo)
1776           ("<S-f5>" . bh/widen)
1777           ("<f7>" . bh/set-truncate-lines)
1778           ("<f8>" . org-cycle-agenda-files)
1779           ("<f9> <f9>" . dla/show-org-agenda)
1780           ("<f9> b" . bbdb)
1781           ("<f9> c" . calendar)
1782           ("<f9> f" . boxquote-insert-file)
1783           ("<f9> h" . bh/hide-other)
1784           ("<f9> n" . bh/toggle-next-task-display)
1785           ("<f9> w" . widen)
1786
1787           ("<f9> r" . boxquote-region)
1788           ("<f9> s" . bh/switch-to-scratch)
1789
1790           ("<f9> t" . bh/insert-inactive-timestamp)
1791           ("<f9> T" . bh/toggle-insert-inactive-timestamp)
1792
1793           ("<f9> v" . visible-mode)
1794           ("<f9> l" . org-toggle-link-display)
1795           ("<f9> SPC" . bh/clock-in-last-task)
1796           ("C-<f9>" . previous-buffer)
1797           ("M-<f9>" . org-toggle-inline-images)
1798           ("C-x n r" . narrow-to-region)
1799           ("C-<f10>" . next-buffer)
1800           ("<f11>" . org-clock-goto)
1801           ("C-<f11>" . org-clock-in)
1802           ("C-s-<f12>" . bh/save-then-publish)
1803           ("C-c c" . org-capture))
1804   :config
1805 #+END_SRC
1806 ** Utility Functions
1807 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1808   (defun bh/hide-other ()
1809     (interactive)
1810     (save-excursion
1811       (org-back-to-heading 'invisible-ok)
1812       (outline-hide-other)
1813       (org-cycle)
1814       (org-cycle)
1815       (org-cycle)))
1816
1817   (defun bh/set-truncate-lines ()
1818     "Toggle value of truncate-lines and refresh window display."
1819     (interactive)
1820     (setq truncate-lines (not truncate-lines))
1821     ;; now refresh window display (an idiom from simple.el):
1822     (save-excursion
1823       (set-window-start (selected-window)
1824                         (window-start (selected-window)))))
1825
1826   (defun bh/switch-to-scratch ()
1827     (interactive)
1828     (switch-to-buffer "*scratch*"))
1829
1830   (setq org-use-fast-todo-selection t)
1831   (setq org-treat-S-cursor-todo-selection-as-state-change nil)
1832
1833   ; create function to create headlines in file. This comes from
1834   ; http://stackoverflow.com/questions/13340616/assign-ids-to-every-entry-in-org-mode
1835   (defun my/org-add-ids-to-headlines-in-file ()
1836     "Add ID properties to all headlines in the current file which
1837   do not already have one."
1838     (interactive)
1839     (org-map-entries 'org-id-get-create))
1840   (defun dla/org-update-ids-to-headlines-in-file ()
1841     "Add or replace ID properties to all headlines in the current file
1842   (or narrowed region)."
1843     (interactive)
1844     (org-map-entries '(lambda () (org-id-get-create t))))
1845   ; if we wanted to do this to every buffer, do the following:
1846   ; (add-hook 'org-mode-hook
1847   ;           (lambda ()
1848   ;             (add-hook 'before-save-hook 'my/org-add-ids-to-headlines-in-file nil 'local)))
1849 #+END_SRC
1850 ** Org ID locations
1851 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1852 (use-package find-lisp
1853   :ensure t)
1854 (setq org-agenda-text-search-extra-files
1855       (append '(agenda-archives)
1856               (find-lisp-find-files "~/projects/org-notes" "\.org$")
1857               (find-lisp-find-files "~/projects/org-notes" "\.org_archive$")
1858               ))
1859 #+END_SRC
1860 ** Keywords (TODO)
1861 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1862 (setq org-todo-keywords
1863       (quote ((sequence "TODO(t)" "NEXT(n)" "|" "DONE(d)")
1864               (sequence "WAITING(w@/!)" "HOLD(h@/!)" "|" "CANCELLED(c@/!)" "PHONE" "MEETING"))))
1865
1866 (setq org-todo-keyword-faces
1867       (quote (("TODO" :foreground "red" :weight bold)
1868               ("NEXT" :foreground "blue" :weight bold)
1869               ("DONE" :foreground "forest green" :weight bold)
1870               ("WAITING" :foreground "orange" :weight bold)
1871               ("HOLD" :foreground "magenta" :weight bold)
1872               ("CANCELLED" :foreground "forest green" :weight bold)
1873               ("MEETING" :foreground "forest green" :weight bold)
1874               ("PHONE" :foreground "forest green" :weight bold))))
1875
1876 (setq org-todo-state-tags-triggers
1877       (quote (("CANCELLED" ("CANCELLED" . t))
1878               ("WAITING" ("WAITING" . t))
1879               ("HOLD" ("WAITING") ("HOLD" . t))
1880               (done ("WAITING") ("HOLD"))
1881               ("TODO" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1882               ("NEXT" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1883               ("DONE" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD")))))
1884
1885
1886
1887 ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/remove-empty-drawer-on-clock-out 'append)
1888 ; add ids on creation of nodes
1889 (add-hook 'org-capture-prepare-finalize-hook 'my/org-add-id)
1890
1891
1892 ; resolve clocks after 10 minutes of idle; use xprintidle
1893 ; (setq org-clock-idle-time 10)
1894 ; (setq org-clock-x11idle-program-name "xprintidle")
1895
1896 ; this is from http://doc.norang.ca/org-mode.html#Capture
1897 ; use C-M-r for org mode capture
1898 (global-set-key (kbd "C-M-r") 'org-capture)
1899
1900 ; Targets include this file and any file contributing to the agenda - up to 9 levels deep
1901 (setq org-refile-targets (quote ((nil :maxlevel . 9)
1902                                  (org-agenda-files :maxlevel . 9))))
1903
1904 ; Use full outline paths for refile targets - we file directly with IDO
1905 (setq org-refile-use-outline-path t)
1906
1907 ; Targets complete directly with IDO
1908 (setq org-outline-path-complete-in-steps nil)
1909
1910 ; Allow refile to create parent tasks with confirmation
1911 (setq org-refile-allow-creating-parent-nodes (quote confirm))
1912
1913 ; ; Use IDO for both buffer and file completion and ido-everywhere to t
1914 ; (setq org-completion-use-ido t)
1915 ; (setq ido-everywhere t)
1916 ; (setq ido-max-directory-size 100000)
1917 ; (ido-mode (quote both))
1918 ; ; Use the current window when visiting files and buffers with ido
1919 ; (setq ido-default-file-method 'selected-window)
1920 ; (setq ido-default-buffer-method 'selected-window)
1921 ; ; Use the current window for indirect buffer display
1922 ; (setq org-indirect-buffer-display 'current-window)
1923
1924
1925 ;;;; Refile settings
1926 ; Exclude DONE state tasks from refile targets
1927 (defun bh/verify-refile-target ()
1928   "Exclude todo keywords with a done state from refile targets"
1929   (not (member (nth 2 (org-heading-components)) org-done-keywords)))
1930
1931 (setq org-refile-target-verify-function 'bh/verify-refile-target)
1932
1933 ;; ensure that emacsclient will show just the note to be edited when invoked
1934 ;; from Mutt, and that it will shut down emacsclient once finished;
1935 ;; fallback to legacy behavior when not invoked via org-protocol.
1936 (require 'org-protocol)
1937 ; (add-hook 'org-capture-mode-hook 'delete-other-windows)
1938 (setq my-org-protocol-flag nil)
1939 (defadvice org-capture-finalize (after delete-frame-at-end activate)
1940   "Delete frame at remember finalization"
1941   (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1942          (setq my-org-protocol-flag nil)))
1943 (defadvice org-capture-refile (around delete-frame-after-refile activate)
1944   "Delete frame at remember refile"
1945   (if my-org-protocol-flag
1946       (progn
1947         (setq my-org-protocol-flag nil)
1948         ad-do-it
1949         (delete-frame))
1950     ad-do-it)
1951   )
1952 (defadvice org-capture-kill (after delete-frame-at-end activate)
1953   "Delete frame at remember abort"
1954   (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1955          (setq my-org-protocol-flag nil)))
1956 (defadvice org-protocol-capture (before set-org-protocol-flag activate)
1957   (setq my-org-protocol-flag t))
1958
1959 (defadvice org-insert-todo-heading (after dla/create-id activate)
1960   (unless (org-in-item-p)
1961     (org-id-get-create)
1962     )
1963   )
1964
1965 ;; org modules
1966 (add-to-list 'org-modules 'org-habit)
1967
1968 ; this comes from http://upsilon.cc/~zack/blog/posts/2010/02/integrating_Mutt_with_Org-mode/
1969 (defun open-mail-in-mutt (message)
1970   "Open a mail message in Mutt, using an external terminal.
1971
1972 Message can be specified either by a path pointing inside a
1973 Maildir, or by Message-ID."
1974   (interactive "MPath or Message-ID: ")
1975   (shell-command
1976    (format "faf xterm -e \"%s %s\""
1977        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/mutt_open") message)))
1978
1979 ;; add support for "mutt:ID" links
1980 (org-add-link-type "mutt" 'open-mail-in-mutt)
1981
1982 (defun my-org-mode-setup ()
1983   ; (load-library "reftex")
1984   (and (buffer-file-name)
1985        (file-exists-p (buffer-file-name))
1986        (progn
1987          ; (reftex-parse-all)
1988          (reftex-set-cite-format
1989           '((?b . "[[bib:%l][%l-bib]]")
1990             (?n . "[[notes:%l][%l-notes]]")
1991             (?c . "\\cite{%l}")
1992             (?h . "*** %t\n:PROPERTIES:\n:Custom_ID: %l\n:END:\n[[papers:%l][%l xoj]] [[papers-pdf:%l][pdf]]")))
1993          ))
1994   (define-key org-mode-map (kbd "C-c )") 'reftex-citation)
1995   (define-key org-mode-map (kbd "C-c [") 'reftex-citation)
1996   (define-key org-mode-map (kbd "C-c (") 'org-mode-reftex-search)
1997   (define-key org-mode-map (kbd "C-c 0") 'reftex-view-crossref)
1998   )
1999 (add-hook 'org-mode-hook 'my-org-mode-setup)
2000
2001 (defun org-mode-reftex-search ()
2002   (interactive)
2003   (org-open-link-from-string (format "[[notes:%s]]" (first (reftex-citation t)))))
2004
2005 (defun open-research-paper (bibtexkey)
2006   "Open a paper by bibtex key"
2007   (interactive "bibtex key: ")
2008   (shell-command
2009    (format "%s %s"
2010        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
2011 (org-add-link-type "papers" 'open-research-paper)
2012 (defun open-research-paper-pdf (bibtexkey)
2013   "Open a paper pdf by bibtex key"
2014   (interactive "bibtex key: ")
2015   (shell-command
2016    (format "%s -p evince_annot %s"
2017        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
2018 (org-add-link-type "papers-pdf" 'open-research-paper-pdf)
2019
2020 (add-to-list 'org-link-abbrev-alist
2021              '("notes" .
2022                "~/projects/research/paper_notes.org::#%s"))
2023
2024 ; I pretty much always want hiearchical checkboxes
2025 (setq org-hierachical-checkbox-statistics nil)
2026
2027 ;; Add \begin{equation}\end{equation} templates to the org mode easy templates
2028 (add-to-list 'org-structure-template-alist
2029              '("E" "\\begin{equation}\n?\n\\end{equation}"))
2030
2031  ;; stolen from
2032 ;; http://www-public.it-sudparis.eu/~berger_o/weblog/2012/03/23/how-to-manage-and-export-bibliographic-notesrefs-in-org-mode/
2033 (defun my-rtcite-export-handler (path desc format)
2034   (message "my-rtcite-export-handler is called : path = %s, desc = %s, format = %s" path desc format)
2035   (let* ((search (when (string-match "::#?\\(.+\\)\\'" path)
2036                    (match-string 1 path)))
2037          (path (substring path 0 (match-beginning 0))))
2038     (cond ((eq format 'latex)
2039            (if (or (not desc)
2040                    (equal 0 (search "rtcite:" desc)))
2041                (format "\\cite{%s}" search)
2042              (format "\\cite[%s]{%s}" desc search))))))
2043
2044 (org-add-link-type "rtcite"
2045                    'org-bibtex-open
2046                    'my-rtcite-export-handler)
2047
2048
2049 #+END_SRC
2050 ** Org Mobile Configuration
2051 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2052   (setq-default org-mobile-directory "/linnode.donarmstrong.com:/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/")
2053   (when (string= system-name "linnode")
2054     (setq-default org-mobile-directory "/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/"))
2055   (setq-default org-directory "/home/don/org-mode/")
2056   (setq-default org-mobile-inbox-for-pull "/home/don/org-mode/from-mobile.org")
2057
2058 #+END_SRC
2059 ** Org iCal Support
2060 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2061   ;; org mode ical export
2062   (setq org-icalendar-timezone "America/Los_Angeles")
2063   (setq org-icalendar-use-scheduled '(todo-start event-if-todo))
2064   ;; we already add the id manually
2065   (setq org-icalendar-store-UID t)
2066
2067 #+END_SRC
2068 ** General Org Babel Configuration
2069 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2070 ;; org babel support
2071 (org-babel-do-load-languages
2072  'org-babel-load-languages
2073  '((emacs-lisp . t )
2074    (R . t)
2075    (latex . t)
2076    (ditaa . t)
2077    (dot . t)
2078    ))
2079 ;; set the right path to ditaa.jar
2080 (setq org-ditaa-jar-path "/usr/share/ditaa/ditaa.jar")
2081 ;; use graphviz-dot for dot things
2082 (add-to-list 'org-src-lang-modes '("dot" . graphviz-dot))
2083 ;; do not indent begin_src blocks
2084 (setq org-edit-src-content-indentation 0)
2085 ;; org-babel-by-backend
2086 (defmacro org-babel-by-backend (&rest body)
2087    `(case (if (boundp 'backend)
2088               (org-export-backend-name backend)
2089             nil) ,@body))
2090
2091 (defun my/fix-inline-images ()
2092   (when org-inline-image-overlays
2093     (org-redisplay-inline-images)))
2094
2095 (add-hook 'org-babel-after-execute-hook
2096            'my/fix-inline-images)
2097
2098 #+END_SRC
2099 ** LaTeX configuration
2100    :PROPERTIES:
2101    :ID:       7135ba17-6a50-4eed-84ca-b90afa5b12f8
2102    :END:
2103 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2104 (use-package ox-extra
2105   :config
2106   (ox-extras-activate '(ignore-headlines)))
2107 (require 'ox-latex)
2108 (add-to-list 'org-latex-classes
2109          '("memarticle"
2110        "\\documentclass[11pt,oneside,article]{memoir}\n"
2111        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2112        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2113        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2114        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2115        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2116
2117 (setq org-beamer-outline-frame-options "")
2118 (add-to-list 'org-latex-classes
2119          '("beamer"
2120        "\\documentclass[ignorenonframetext]{beamer}
2121 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2122 [PACKAGES]
2123 [EXTRA]"
2124        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2125        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2126        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2127        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2128        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2129
2130 (add-to-list 'org-latex-classes
2131          '("membook"
2132        "\\documentclass[11pt,oneside]{memoir}\n"
2133        ("\\chapter{%s}" . "\\chapter*{%s}")
2134        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2135        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2136        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")))
2137
2138 (add-to-list 'org-latex-classes
2139          '("letter"
2140        "\\documentclass[11pt]{letter}
2141 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2142 [PACKAGES]
2143 [EXTRA]"
2144    ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2145        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2146        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2147        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2148        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2149
2150 (add-to-list 'org-latex-classes
2151          '("dlacv"
2152        "\\documentclass{dlacv}
2153 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2154 [NO-PACKAGES]
2155 [NO-EXTRA]"
2156        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2157        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2158        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2159        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2160        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2161
2162
2163 (add-to-list 'org-latex-classes
2164          '("dlaresume"
2165        "\\documentclass{dlaresume}
2166 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2167 [NO-PACKAGES]
2168 [NO-EXTRA]"
2169        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2170        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2171        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2172        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2173        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2174
2175
2176 ;; Originally taken from Bruno Tavernier: http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/31150/focus=31432
2177 ;; but adapted to use latexmk 4.22 or higher.
2178 (setq org-latex-pdf-process '("latexmk -f -pdflatex=xelatex -bibtex -use-make -pdf %f"))
2179
2180 ;; Default packages included in /every/ tex file, latex, pdflatex or xelatex
2181 (setq org-latex-default-packages-alist
2182   '(("" "amsmath" t)
2183     ("" "unicode-math" t)
2184     ))
2185 (setq org-latex-packages-alist
2186   '(("" "graphicx" t)
2187     ("" "fontspec" t)
2188     ("" "xunicode" t)
2189     ("" "hyperref" t)
2190     ("" "url" t)
2191     ("" "rotating" t)
2192     ("" "longtable" nil)
2193     ("" "float" )))
2194
2195 ;; make equations larger
2196 (setq org-format-latex-options (plist-put org-format-latex-options :scale 2.0))
2197
2198 (defun org-create-formula--latex-header ()
2199   "Return LaTeX header appropriate for previewing a LaTeX snippet."
2200   (let ((info (org-combine-plists (org-export--get-global-options
2201            (org-export-get-backend 'latex))
2202           (org-export--get-inbuffer-options
2203            (org-export-get-backend 'latex)))))
2204     (org-latex-guess-babel-language
2205      (org-latex-guess-inputenc
2206   (org-splice-latex-header
2207    org-format-latex-header
2208    org-latex-default-packages-alist
2209    nil t
2210    (plist-get info :latex-header)))
2211      info)))
2212
2213
2214 ; support ignoring headers in org mode export to latex
2215 ; from http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/67692
2216 (defadvice org-latex-headline (around my-latex-skip-headlines
2217                   (headline contents info) activate)
2218   (if (member "ignoreheading" (org-element-property :tags headline))
2219   (setq ad-return-value contents)
2220     ad-do-it))
2221
2222 ;; keep latex logfiles
2223
2224 (setq org-latex-remove-logfiles nil)
2225
2226 ;; Resume clocking task when emacs is restarted
2227 (org-clock-persistence-insinuate)
2228 ;;
2229 ;; Show lot of clocking history so it's easy to pick items off the C-F11 list
2230 (setq org-clock-history-length 23)
2231 ;; Resume clocking task on clock-in if the clock is open
2232 (setq org-clock-in-resume t)
2233 ;; Change tasks to NEXT when clocking in; this avoids clocking in when
2234 ;; there are things like PHONE calls
2235 (setq org-clock-in-switch-to-state 'bh/clock-in-to-next)
2236 ;; Separate drawers for clocking and logs
2237 (setq org-drawers (quote ("PROPERTIES" "LOGBOOK")))
2238 ;; Save clock data and state changes and notes in the LOGBOOK drawer
2239 (setq org-clock-into-drawer t)
2240 (setq org-log-into-drawer t)
2241 ;; Sometimes I change tasks I'm clocking quickly - this removes clocked tasks with 0:00 duration
2242 (setq org-clock-out-remove-zero-time-clocks t)
2243 ;; Clock out when moving task to a done state
2244 (setq org-clock-out-when-done t)
2245 ;; Save the running clock and all clock history when exiting Emacs, load it on startup
2246 (setq org-clock-persist t)
2247 ;; Do not prompt to resume an active clock
2248 (setq org-clock-persist-query-resume nil)
2249 ;; Enable auto clock resolution for finding open clocks
2250 (setq org-clock-auto-clock-resolution (quote when-no-clock-is-running))
2251 ;; Include current clocking task in clock reports
2252 (setq org-clock-report-include-clocking-task t)
2253
2254 ;; the cache seems to be broken
2255 (setq org-element-use-cache nil)
2256
2257 (defvar bh/keep-clock-running nil)
2258
2259 (defun bh/is-task-p ()
2260   "Any task with a todo keyword and no subtask"
2261   (save-restriction
2262     (widen)
2263     (let ((has-subtask)
2264           (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
2265           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2266       (save-excursion
2267         (forward-line 1)
2268         (while (and (not has-subtask)
2269                     (< (point) subtree-end)
2270                     (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
2271           (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
2272             (setq has-subtask t))))
2273       (and is-a-task (not has-subtask)))))
2274 (defun bh/is-project-p ()
2275   "Any task with a todo keyword subtask"
2276   (save-restriction
2277     (widen)
2278     (let ((has-subtask)
2279           (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
2280           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2281       (save-excursion
2282         (forward-line 1)
2283         (while (and (not has-subtask)
2284                     (< (point) subtree-end)
2285                     (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
2286           (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
2287             (setq has-subtask t))))
2288       (and is-a-task has-subtask))))
2289
2290 (defun bh/is-subproject-p ()
2291   "Any task which is a subtask of another project"
2292   (let ((is-subproject)
2293         (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2294     (save-excursion
2295       (while (and (not is-subproject) (org-up-heading-safe))
2296         (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
2297           (setq is-subproject t))))
2298     (and is-a-task is-subproject)))
2299
2300
2301 (defun bh/clock-in-to-next (kw)
2302   "Switch a task from TODO to NEXT when clocking in.
2303 Skips capture tasks, projects, and subprojects.
2304 Switch projects and subprojects from NEXT back to TODO"
2305   (when (not (and (boundp 'org-capture-mode) org-capture-mode))
2306     (cond
2307      ((and (member (org-get-todo-state) (list "TODO"))
2308        (bh/is-task-p))
2309   "NEXT")
2310      ((and (member (org-get-todo-state) (list "NEXT"))
2311        (bh/is-project-p))
2312   "TODO"))))
2313
2314 (defun bh/punch-in (arg)
2315   "Start continuous clocking and set the default task to the
2316 selected task.  If no task is selected set the Organization task
2317 as the default task."
2318   (interactive "p")
2319   (setq bh/keep-clock-running t)
2320   (if (equal major-mode 'org-agenda-mode)
2321   ;;
2322   ;; We're in the agenda
2323   ;;
2324   (let* ((marker (org-get-at-bol 'org-hd-marker))
2325          (tags (org-with-point-at marker (org-get-tags))))
2326     (if (and (eq arg 4) tags)
2327         (org-agenda-clock-in '(16))
2328       (bh/clock-in-organization-task-as-default)))
2329     ;;
2330     ;; We are not in the agenda
2331     ;;
2332     (save-restriction
2333   (widen)
2334   ; Find the tags on the current task
2335   (if (and (equal major-mode 'org-mode) (not (org-before-first-heading-p)) (eq arg 4))
2336       (org-clock-in '(16))
2337     (bh/clock-in-organization-task-as-default)))))
2338
2339 (defun bh/punch-out ()
2340   (interactive)
2341   (setq bh/keep-clock-running nil)
2342   (when (org-clock-is-active)
2343     (org-clock-out))
2344   (org-agenda-remove-restriction-lock))
2345
2346 (defun bh/clock-in-default-task ()
2347   (save-excursion
2348     (org-with-point-at org-clock-default-task
2349   (org-clock-in))))
2350
2351 (defun bh/clock-in-parent-task ()
2352   "Move point to the parent (project) task if any and clock in"
2353   (let ((parent-task))
2354     (save-excursion
2355   (save-restriction
2356     (widen)
2357     (while (and (not parent-task) (org-up-heading-safe))
2358       (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
2359         (setq parent-task (point))))
2360     (if parent-task
2361         (org-with-point-at parent-task
2362       (org-clock-in))
2363       (when bh/keep-clock-running
2364         (bh/clock-in-default-task)))))))
2365
2366 (defvar bh/organization-task-id "e22cb8bf-07c7-408b-8f60-ff3aadac95e4")
2367
2368 (defun bh/clock-in-organization-task-as-default ()
2369   (interactive)
2370   (org-with-point-at (org-id-find bh/organization-task-id 'marker)
2371     (org-clock-in '(16))))
2372
2373 (defun bh/clock-out-maybe ()
2374   (when (and bh/keep-clock-running
2375          (not org-clock-clocking-in)
2376          (marker-buffer org-clock-default-task)
2377          (not org-clock-resolving-clocks-due-to-idleness))
2378     (bh/clock-in-parent-task)))
2379
2380 ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/clock-out-maybe 'append)
2381
2382 (require 'org-id)
2383 (defun bh/clock-in-task-by-id (id)
2384   "Clock in a task by id"
2385   (org-with-point-at (org-id-find id 'marker)
2386     (org-clock-in nil)))
2387
2388 (defun bh/clock-in-last-task (arg)
2389   "Clock in the interrupted task if there is one
2390 Skip the default task and get the next one.
2391 A prefix arg forces clock in of the default task."
2392   (interactive "p")
2393   (let ((clock-in-to-task
2394      (cond
2395       ((eq arg 4) org-clock-default-task)
2396       ((and (org-clock-is-active)
2397         (equal org-clock-default-task (cadr org-clock-history)))
2398        (caddr org-clock-history))
2399       ((org-clock-is-active) (cadr org-clock-history))
2400       ((equal org-clock-default-task (car org-clock-history)) (cadr org-clock-history))
2401       (t (car org-clock-history)))))
2402     (widen)
2403     (org-with-point-at clock-in-to-task
2404   (org-clock-in nil))))
2405
2406
2407 (defun org-export-to-ods ()
2408   (interactive)
2409   (let ((csv-file "data.csv"))
2410     (org-table-export csv-file "orgtbl-to-csv")
2411     (org-odt-convert csv-file "ods" 'open)))
2412
2413 ; allow for zero-width-space to be a break in regexp too
2414 ; (setcar org-emphasis-regexp-components " [:space:] \t('\"{")
2415 ; (setcar (nthcdr 1 org-emphasis-regexp-components) " [:space:]- \t.,:!?;'\")}\\")
2416 ; (org-set-emph-re 'org-emphasis-regexp-components org-emphasis-regexp-components)
2417
2418 ;; support inserting screen shots
2419 (defun my/org-insert-screenshot ()
2420   "Take a screenshot into a time stamped unique-named file in the
2421 same directory as the org-buffer and insert a link to this file."
2422   (interactive)
2423   (defvar my/org-insert-screenshot/filename)
2424   (setq my/org-insert-screenshot/filename
2425     (read-file-name
2426      "Screenshot to insert: "
2427      nil
2428      (concat (buffer-file-name) "_" (format-time-string "%Y%m%d_%H%M%S") ".png")
2429      )
2430     )
2431   (call-process "import" nil nil nil my/org-insert-screenshot/filename)
2432   (insert (concat "[[" my/org-insert-screenshot/filename "]]"))
2433   (org-display-inline-images))
2434
2435 (defun my/fix-inline-images ()
2436   (when org-inline-image-overlays
2437     (org-redisplay-inline-images)))
2438
2439 (add-hook 'org-babel-after-execute-hook 'my/fix-inline-images)
2440
2441 ;; use xelatex to preview with imagemagick
2442 (add-to-list 'org-preview-latex-process-alist
2443          '(xelateximagemagick
2444       :programs ("xelatex" "convert")
2445       :description "pdf > png"
2446       :message "you need to install xelatex and imagemagick"
2447       :use-xcolor t
2448       :image-input-type "pdf"
2449       :image-output-type "png"
2450       :image-size-adjust (1.0 . 1.0)
2451       :latex-compiler ("xelatex -interaction nonstopmode -output-directory %o %f")
2452       :image-converter ("convert -density %D -trim -antialias %f -quality 100 %O"))
2453          )
2454 ;; use xelatex by default
2455 (setq org-preview-latex-default-process 'xelateximagemagick)
2456
2457 ; from http://orgmode.org/Changes.html
2458 (defun my/org-repair-property-drawers ()
2459   "Fix properties drawers in current buffer.
2460  Ignore non Org buffers."
2461   (interactive)
2462   (when (eq major-mode 'org-mode)
2463     (org-with-wide-buffer
2464      (goto-char (point-min))
2465      (let ((case-fold-search t)
2466        (inline-re (and (featurep 'org-inlinetask)
2467                (concat (org-inlinetask-outline-regexp)
2468                    "END[ \t]*$"))))
2469    (org-map-entries
2470     (lambda ()
2471       (unless (and inline-re (org-looking-at-p inline-re))
2472         (save-excursion
2473       (let ((end (save-excursion (outline-next-heading) (point))))
2474         (forward-line)
2475         (when (org-looking-at-p org-planning-line-re) (forward-line))
2476         (when (and (< (point) end)
2477                (not (org-looking-at-p org-property-drawer-re))
2478                (save-excursion
2479                  (and (re-search-forward org-property-drawer-re end t)
2480                   (eq (org-element-type
2481                    (save-match-data (org-element-at-point)))
2482                   'drawer))))
2483           (insert (delete-and-extract-region
2484                (match-beginning 0)
2485                (min (1+ (match-end 0)) end)))
2486           (unless (bolp) (insert "\n"))))))))))))
2487
2488 #+END_SRC
2489 ** Org-Gcal
2490 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2491 (use-package calfw
2492   :ensure f
2493   )
2494 (use-package calfw-org
2495   :ensure f
2496   )
2497 (use-package org-gcal
2498   :if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
2499   :ensure f
2500   :config '((if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
2501                 (load-file "~/.hide/org_gcal.el"))
2502             )
2503   )
2504 #+END_SRC
2505 ** appt integration
2506 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2507   (use-package appt
2508     :ensure f
2509     :config
2510     ;; Show notification 10 minutes before event
2511     (setq appt-message-warning-time 10)
2512     ;; Disable multiple reminders
2513     (setq appt-display-interval appt-message-warning-time)
2514     (setq appt-display-mode-line nil)
2515
2516     ;; add automatic reminders for appointments
2517     (defun my/org-agenda-to-appt ()
2518       (interactive)
2519       (setq appt-time-msg-list nil)
2520       (org-agenda-to-appt))
2521     ;; add reminders when starting emacs
2522     (my/org-agenda-to-appt)
2523     ;; when rebuilding the agenda
2524     (defadvice  org-agenda-redo (after org-agenda-redo-add-appts)
2525       "Pressing `r' on the agenda will also add appointments."
2526       (my/org-agenda-to-appt)
2527       )
2528     ;; when saving all org buffers
2529     (defadvice org-save-all-org-buffers (after org-save-all-org-buffers-add-appts)
2530       "Re-add appts after saving all org buffers"
2531       (my/org-agenda-to-appt))
2532     ;; Display appointments as a window manager notification
2533     (setq appt-disp-window-function 'my/appt-display)
2534     (setq appt-delete-window-function (lambda () t))
2535
2536     (setq my/appt-notification-app (concat (getenv "HOME") "/bin/appt_notification"))
2537
2538     (defun my/appt-display (min-to-app new-time msg)
2539       (if (atom min-to-app)
2540       (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app min-to-app msg)
2541     (dolist (i (number-sequence 0 (1- (length min-to-app))))
2542       (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app
2543                      (nth i min-to-app) (nth i msg))))
2544       )
2545     )
2546
2547
2548 #+END_SRC
2549 ** outshine (outlining) integration
2550 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2551 (use-package outshine
2552   :ensure t
2553   :hook (outline-minor-mode . outshine-hook-function)
2554 )
2555 #+END_SRC
2556 ** End use-package
2557 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2558   )
2559 #+END_SRC
2560 * Keybindings
2561 ** Home/End Begining/End of line
2562 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2563   (global-set-key [home] 'move-beginning-of-line)
2564   (global-set-key [end] 'move-end-of-line)
2565 #+END_SRC
2566 ** Goto line
2567 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2568   (global-unset-key "\M-g")
2569   (global-set-key (kbd "M-g l") 'goto-line)
2570 #+END_SRC
2571 * Debian
2572 ** debian-changelog
2573 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2574   (use-package debian-changelog-mode
2575     :mode "debian/changelog"
2576     :config
2577     (setq debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
2578     (setq debian-changelog-full-name "Don Armstrong"))
2579 #+END_SRC
2580 * Misc (uncharacterized)
2581 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2582   (setq calendar-latitude 38.6)
2583   (setq calendar-longitude -121.5)
2584   (setq case-fold-search t)
2585   (setq confirm-kill-emacs (quote y-or-n-p))
2586   (setq cperl-lazy-help-time nil)
2587 #+END_SRC
2588 ** Turn on fontlock and icomplete
2589 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2590   (global-font-lock-mode 1)
2591   (icomplete-mode 1)
2592   (setq log-edit-keep-buffer t)
2593 #+END_SRC
2594 ** Set mail User agent
2595 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2596   (setq mail-user-agent (quote sendmail-user-agent))
2597   (setq mutt-alias-file-list (quote ("~/.mutt/aliases" "~/.mail_aliases")))
2598 #+END_SRC
2599 ** PS Printing
2600 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2601   (setq ps-footer-font-size (quote (8 . 10)))
2602   (setq ps-header-font-size (quote (8 . 10)))
2603   (setq ps-header-title-font-size (quote (10 . 10)))
2604   (setq ps-line-number-color "blue")
2605   (setq ps-print-footer t)
2606   (setq ps-print-footer-frame nil)
2607   (setq ps-print-only-one-header t)
2608 #+END_SRC
2609 ** Only single spacing on sentences
2610 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2611   (setq sentence-end "[.?!][]\"')]*\\($\\|   \\| \\)[
2612   ]*")
2613   (setq sentence-end-double-space nil)
2614   ; enable matching parenthesis
2615 #+END_SRC
2616 ** Display paren mode
2617 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2618   (show-paren-mode 1)
2619   (setq show-paren-delay 0.2)
2620
2621 #+END_SRC
2622 ** My Username
2623 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2624   (setq user-mail-address "don@donarmstrong.com")
2625
2626 #+END_SRC
2627 ** Use primary selection on unix machines
2628 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2629   ;; switch back to the old primary selection method
2630   (if (or (string-equal system-type "darwin")
2631           (string-equal system-type "windows")
2632           )
2633       (progn
2634         (setq select-enable-clipboard t)
2635         (setq select-enable-primary nil)
2636         )
2637     (progn
2638       (setq select-enable-clipboard nil)
2639       (setq select-enable-primary t)
2640       ))
2641   ; (setq mouse-drag-copy-region t)
2642
2643   ;; tramp configuration
2644   (setq tramp-use-ssh-controlmaster-options nil)
2645
2646   (setq-default c-indent-level 4)
2647   (setq-default c-brace-imaginary-offset 0)
2648   (setq-default c-brace-offset -4)
2649   (setq-default c-argdecl-indent 4)
2650   (setq-default c-label-offset -4)
2651   (setq-default c-continued-statement-offset 4)
2652   ; tabs are annoying
2653   (setq-default indent-tabs-mode nil)
2654   (setq-default tab-width 4)
2655
2656
2657   ;; (autoload 'php-mode "php-mode" "PHP editing mode" t)
2658   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php3?\\'" . php-mode))
2659   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.phtml?\\'" . php-mode))
2660   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php?\\'" . php-mode))
2661   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php4?\\'" . php-mode))
2662
2663
2664   (defun insert-date ()
2665     "Insert date at point."
2666     (interactive)
2667     (insert (format-time-string "%A, %B %e, %Y %k:%M:%S %Z")))
2668   (global-set-key "\C-[d" 'insert-date)
2669
2670   (defun unfill-paragraph (arg)
2671     "Pull this whole paragraph up onto one line."
2672     (interactive "*p")
2673     (let ((fill-column 10000))
2674       (fill-paragraph arg))
2675     )
2676
2677   (column-number-mode t)
2678
2679 #+END_SRC
2680 ** Desktop-save-mode
2681 If the envvar EMACS_SERVER_NAME is set, consider this a separate
2682 emacs, and use a different desktop file to restore history
2683 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2684   (use-package desktop
2685     :demand
2686     :config
2687     (setq desktop-base-file-name
2688           (convert-standard-filename
2689            (concat ".emacs"
2690                    (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2691                        "")
2692                    ".desktop")
2693            ))
2694     (setq desktop-base-lock-name
2695           (convert-standard-filename
2696            (concat desktop-base-file-name
2697                    ".lock")))
2698     (setq desktop-auto-save-timeout 60)
2699     (setq desktop-restore-eager 5)
2700     (setq desktop-lazy-verbose nil)
2701     (desktop-save-mode 1)
2702     ; (desktop-read)
2703   )
2704 #+END_SRC
2705 ** Misc (Uncharacterized)
2706 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2707   '(icomplete-mode on)
2708   (custom-set-faces
2709    ;; custom-set-faces was added by Custom.
2710    ;; If you edit it by hand, you could mess it up, so be careful.
2711    ;; Your init file should contain only one such instance.
2712    ;; If there is more than one, they won't work right.
2713    '(menu ((((type x-toolkit)) (:background "black" :foreground "grey90")))))
2714
2715
2716   (put 'upcase-region 'disabled nil)
2717   (put 'downcase-region 'disabled nil)
2718   (put 'narrow-to-region 'disabled nil)
2719
2720   ; (defun turn-on-flyspell ()
2721   ;    "Force flyspell-mode on using a positive arg.  For use in hooks."
2722   ;    (interactive)
2723   ;    (flyspell-mode 1))
2724
2725
2726    ; Outline-minor-mode key map
2727    (define-prefix-command 'cm-map nil "Outline-")
2728    ; HIDE
2729    (define-key cm-map "q" 'outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
2730    (define-key cm-map "t" 'outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
2731    (define-key cm-map "o" 'outline-hide-other)        ; Hide other branches
2732    (define-key cm-map "c" 'outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
2733    (define-key cm-map "l" 'outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
2734    (define-key cm-map "d" 'outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
2735    ; SHOW
2736    (define-key cm-map "a" 'outline-show-all)          ; Show (expand) everything
2737    (define-key cm-map "e" 'outline-show-entry)        ; Show this heading's body
2738    (define-key cm-map "i" 'outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
2739    (define-key cm-map "k" 'outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
2740    (define-key cm-map "s" 'outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
2741    ; MOVE
2742    (define-key cm-map "u" 'outline-up-heading)                ; Up
2743    (define-key cm-map "n" 'outline-next-visible-heading)      ; Next
2744    (define-key cm-map "p" 'outline-previous-visible-heading)  ; Previous
2745    (define-key cm-map "f" 'outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
2746    (define-key cm-map "b" 'outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
2747    (global-set-key "\M-o" cm-map)
2748   ; fix up tmux xterm keys
2749   ; stolen from http://unix.stackexchange.com/questions/24414/shift-arrow-not-working-in-emacs-within-tmux
2750   (defun fix-up-tmux-keys ()
2751       "Fix up tmux xterm keys"
2752       (if (getenv "TMUX")
2753           (progn
2754             (let ((x 2) (tkey ""))
2755               (while (<= x 8)
2756                 ;; shift
2757                 (if (= x 2)
2758                     (setq tkey "S-"))
2759                 ;; alt
2760                 (if (= x 3)
2761                     (setq tkey "M-"))
2762                 ;; alt + shift
2763                 (if (= x 4)
2764                     (setq tkey "M-S-"))
2765                 ;; ctrl
2766                 (if (= x 5)
2767                     (setq tkey "C-"))
2768                 ;; ctrl + shift
2769                 (if (= x 6)
2770                     (setq tkey "C-S-"))
2771                 ;; ctrl + alt
2772                 (if (= x 7)
2773                     (setq tkey "C-M-"))
2774                 ;; ctrl + alt + shift
2775                 (if (= x 8)
2776                     (setq tkey "C-M-S-"))
2777
2778                 ;; arrows
2779                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d A" x)) (kbd (format "%s<up>" tkey)))
2780                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d B" x)) (kbd (format "%s<down>" tkey)))
2781                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d C" x)) (kbd (format "%s<right>" tkey)))
2782                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d D" x)) (kbd (format "%s<left>" tkey)))
2783                 ;; home
2784                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d H" x)) (kbd (format "%s<home>" tkey)))
2785                 ;; end
2786                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d F" x)) (kbd (format "%s<end>" tkey)))
2787                 ;; page up
2788                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 5 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<prior>" tkey)))
2789                 ;; page down
2790                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 6 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<next>" tkey)))
2791                 ;; insert
2792                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 2 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2793                 ;; delete
2794                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 3 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2795                 ;; f1
2796                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d P" x)) (kbd (format "%s<f1>" tkey)))
2797                 ;; f2
2798                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d Q" x)) (kbd (format "%s<f2>" tkey)))
2799                 ;; f3
2800                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d R" x)) (kbd (format "%s<f3>" tkey)))
2801                 ;; f4
2802                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d S" x)) (kbd (format "%s<f4>" tkey)))
2803                 ;; f5
2804                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 15 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f5>" tkey)))
2805                 ;; f6
2806                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 17 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f6>" tkey)))
2807                 ;; f7
2808                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 18 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f7>" tkey)))
2809                 ;; f8
2810                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 19 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f8>" tkey)))
2811                 ;; f9
2812                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 20 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f9>" tkey)))
2813                 ;; f10
2814                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 21 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f10>" tkey)))
2815                 ;; f11
2816                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 23 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f11>" tkey)))
2817                 ;; f12
2818                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 24 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f12>" tkey)))
2819                 ;; f13
2820                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 25 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f13>" tkey)))
2821                 ;; f14
2822                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 26 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f14>" tkey)))
2823                 ;; f15
2824                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 28 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f15>" tkey)))
2825                 ;; f16
2826                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 29 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f16>" tkey)))
2827                 ;; f17
2828                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 31 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f17>" tkey)))
2829                 ;; f18
2830                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 32 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f18>" tkey)))
2831                 ;; f19
2832                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 33 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f19>" tkey)))
2833                 ;; f20
2834                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 34 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f20>" tkey)))
2835
2836                 (setq x (+ x 1))
2837                 ))
2838             )
2839         )
2840       )
2841   ; (add-hook 'tty-setup-hook 'fix-up-tmux-keys)
2842
2843   (defadvice ask-user-about-supersession-threat (around ask-user-about-supersession-threat-if-necessary)
2844     "Call ask-user-about-supersession-threat only if the buffer is actually obsolete."
2845     (if (or (buffer-modified-p)
2846             (verify-visited-file-modtime)
2847             (< (* 8 1024 1024) (buffer-size))
2848             (/= 0 (call-process-region 1 (+ 1 (buffer-size)) "diff" nil nil nil "-q" (buffer-file-name) "-")))
2849         ad-do-it
2850       (clear-visited-file-modtime)
2851       (not-modified)))
2852   (ad-activate 'ask-user-about-supersession-threat)
2853 #+END_SRC
2854
2855 * Start Server
2856 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2857   (use-package server
2858     :config
2859     (setq server-name
2860           (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2861               "server"))
2862     (unless (server-running-p)
2863       (global-set-key "\C-xp" 'server-edit)
2864       (server-start)))
2865 #+END_SRC
2866
2867
2868
2869 * END
2870 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2871   (provide 'don-configuration)
2872 #+END_SRC