]> git.donarmstrong.com Git - samtools.git/commitdiff
Release samtools-0.1.3
authorHeng Li <lh3@live.co.uk>
Wed, 15 Apr 2009 21:02:53 +0000 (21:02 +0000)
committerHeng Li <lh3@live.co.uk>
Wed, 15 Apr 2009 21:02:53 +0000 (21:02 +0000)
NEWS
bamtk.c

diff --git a/NEWS b/NEWS
index 1956b6c33477f67be830554da520a7aa13a738ed..e3468f17f2a8454167eefee8c27173b0ee78f3ce 100644 (file)
--- a/NEWS
+++ b/NEWS
@@ -15,6 +15,8 @@ Notable changes in SAMtools:
  * Fixed a bug in alignment retrieval: alignments bridging n*16384bp are
    not correctly retrieved sometimes.
 
+ * Fixed a bug in rmdup: segfault if unmapped reads are present.
+
  * Move indel_filter.pl to samtools.pl and improved the filtering by
    checking the actual number of alignments containing indels. The indel
    pileup line is also changed a little to make this filtration easier.
@@ -37,7 +39,9 @@ Changes in other utilities:
 
  * Various converters: improved functionality in general.
 
-(0.1.3: 15 April 2009, rXXX)
+ * Updated the example SAM due to the previous bug in fixmate.
+
+(0.1.3: 15 April 2009, r227)
 
 
 
diff --git a/bamtk.c b/bamtk.c
index 2bdc00aba337ac45524dc3dd5ef76de5a2fb83be..67dec9ed14f49ff614fd9fe654092a85cb370229 100644 (file)
--- a/bamtk.c
+++ b/bamtk.c
@@ -3,7 +3,7 @@
 #include "bam.h"
 
 #ifndef PACKAGE_VERSION
-#define PACKAGE_VERSION "0.1.2-28"
+#define PACKAGE_VERSION "0.1.3"
 #endif
 
 int bam_taf2baf(int argc, char *argv[]);