]> git.donarmstrong.com Git - samtools.git/blob - sam_header.h
r572: added "bedcov" command
[samtools.git] / sam_header.h
1 #ifndef __SAM_HEADER_H__
2 #define __SAM_HEADER_H__
3
4 #ifdef __cplusplus
5 extern "C" {
6 #endif
7
8         void *sam_header_parse2(const char *headerText);
9         void *sam_header_merge(int n, const void **dicts);
10         void sam_header_free(void *header);
11         char *sam_header_write(const void *headerDict);   // returns a newly allocated string
12
13         char **sam_header2list(const void *_dict, char type[2], char key_tag[2], int *_n);
14
15         void *sam_header2tbl(const void *dict, char type[2], char key_tag[2], char value_tag[2]);
16         const char *sam_tbl_get(void *h, const char *key);
17         int sam_tbl_size(void *h);
18         void sam_tbl_destroy(void *h);
19
20 #ifdef __cplusplus
21 }
22 #endif
23
24 #endif