knetfile.c

   1 #include <stdio.h>
   2 #include <netdb.h>
   3 #include <ctype.h>
   4 #include <stdlib.h>
   5 #include <string.h>
   6 #include <unistd.h>
   7 #include <sys/types.h>
   8 #include <arpa/inet.h>
   9 #include <sys/socket.h>
  10 #include "knetfile.h"
  11
  12 static int kftp_get_response(knetFile *ftp)
  13 {
  14         unsigned char c;
  15         int n = 0;
  16         char *p;
  17         while (read(ftp->ctrl_fd, &c, 1)) { // FIXME: this is *VERY BAD* for unbuffered I/O
  18 //              fputc(c, stderr);
  19                 if (n >= ftp->max_response) {
  20                         ftp->max_response = ftp->max_response? ftp->max_response<<1 : 256;
  21                         ftp->response = realloc(ftp->response, ftp->max_response);
  22                 }
  23                 ftp->response[n++] = c;
  24                 if (c == '\n') {
  25                         if (n >= 4 && isdigit(ftp->response[0]) && isdigit(ftp->response[1]) && isdigit(ftp->response[2]) && ftp->response[3] != '-') break;
  26                         n = 0;
  27                         continue;
  28                 }
  29         }
  30         if (n < 2) return -1;
  31         ftp->response[n-2] = 0;
  32         return strtol(ftp->response, &p, 0);
  33 }
  34
  35 static int kftp_send_cmd(knetFile *ftp, const char *cmd, int is_get)
  36 {
  37         write(ftp->ctrl_fd, cmd, strlen(cmd));
  38         return is_get? kftp_get_response(ftp) : 0;
  39 }
  40
  41 static int kftp_pasv_prep(knetFile *ftp)
  42 {
  43         char *p;
  44         int v[6];
  45         kftp_send_cmd(ftp, "PASV\r\n", 1);
  46         for (p = ftp->response; *p && *p != '('; ++p);
  47         if (*p != '(') return -1;
  48         ++p;
  49         sscanf(p, "%d,%d,%d,%d,%d,%d", &v[0], &v[1], &v[2], &v[3], &v[4], &v[5]);
  50         memcpy(ftp->pasv_ip, v, 4 * sizeof(int));
  51         ftp->pasv_port = (v[4]<<8&0xff00) + v[5];
  52         return 0;
  53 }
  54
  55 static int kftp_pasv_connect(knetFile *ftp)
  56 {
  57 #define __err_pasv_connect(func) do { perror(func); freeaddrinfo(res); return -1; } while (0)
  58
  59         struct addrinfo hints, *res;
  60         struct linger lng = { 0, 0 };
  61         int on;
  62         char host[80], port[10];
  63
  64         if (ftp->pasv_port == 0) {
  65                 fprintf(stderr, "[kftp_pasv_connect] kftp_pasv_prep() is not called before hand.\n");
  66                 return -1;
  67         }
  68         memset(&hints, 0, sizeof(struct addrinfo));
  69         hints.ai_family = AF_UNSPEC;
  70         hints.ai_socktype = SOCK_STREAM;
  71         sprintf(host, "%d.%d.%d.%d", ftp->pasv_ip[0], ftp->pasv_ip[1], ftp->pasv_ip[2], ftp->pasv_ip[3]);
  72         sprintf(port, "%d", ftp->pasv_port);
  73         if (getaddrinfo(host, port, &hints, &res) != 0) { perror("getaddrinfo"); return -1; }
  74         if ((ftp->fd = socket(res->ai_family, res->ai_socktype, res->ai_protocol)) == -1) __err_pasv_connect("socket");
  75         if (setsockopt(ftp->fd, SOL_SOCKET, SO_REUSEADDR, &on, sizeof(on)) == -1) __err_pasv_connect("setsockopt");
  76         if (setsockopt(ftp->fd, SOL_SOCKET, SO_LINGER, &lng, sizeof(lng)) == -1) __err_pasv_connect("setsockopt");
  77         if (connect(ftp->fd, res->ai_addr, res->ai_addrlen) != 0) __err_pasv_connect("connect");
  78         freeaddrinfo(res);
  79         return 0;
  80 }
  81
  82 int kftp_connect(knetFile *ftp)
  83 {
  84 #define __err_connect(func) do { perror(func); return -1; } while (0)
  85
  86         int on;
  87         { // open socket
  88                 struct addrinfo hints, *res;
  89                 memset(&hints, 0, sizeof(struct addrinfo));
  90                 hints.ai_family = AF_UNSPEC;
  91                 hints.ai_socktype = SOCK_STREAM;
  92                 if (getaddrinfo(ftp->host, "21", &hints, &res) != 0) __err_connect("getaddrinfo");
  93                 if ((ftp->ctrl_fd = socket(res->ai_family, res->ai_socktype, res->ai_protocol)) == -1) __err_connect("socket");
  94                 if (setsockopt(ftp->ctrl_fd, SOL_SOCKET, SO_REUSEADDR, &on, sizeof(on)) == -1) __err_connect("setsockopt");
  95                 if (connect(ftp->ctrl_fd, res->ai_addr, res->ai_addrlen) != 0) __err_connect("connect");
  96                 freeaddrinfo(res);
  97                 kftp_get_response(ftp);
  98         }
  99         { // login
 100                 kftp_send_cmd(ftp, "USER anonymous\r\n", 1);
 101                 kftp_send_cmd(ftp, "PASS kftp@\r\n", 1);
 102                 kftp_send_cmd(ftp, "TYPE I\r\n", 1);
 103         }
 104         return 0;
 105 }
 106
 107 int kftp_reconnect(knetFile *ftp)
 108 {
 109         if (ftp->ctrl_fd) {
 110                 close(ftp->ctrl_fd);
 111                 ftp->ctrl_fd = 0;
 112         }
 113         close(ftp->fd);
 114         return kftp_connect(ftp);
 115 }
 116
 117 // initialize ->type, ->host and ->retr
 118 knetFile *kftp_prep(const char *fn, const char *mode)
 119 {
 120         knetFile *fp;
 121         char *p;
 122         int l;
 123         if (strstr(fn, "ftp://") != fn) return 0;
 124         for (p = (char*)fn + 6; *p && *p != '/'; ++p);
 125         if (*p != '/') return 0;
 126         l = p - fn - 6;
 127         fp = calloc(1, sizeof(knetFile));
 128         fp->type = KNF_TYPE_FTP;
 129         fp->host = calloc(l + 1, 1);
 130         if (strchr(mode, 'c')) fp->no_reconnect = 1;
 131         strncpy(fp->host, fn + 6, l);
 132         fp->retr = calloc(strlen(p) + 7, 1);
 133         sprintf(fp->retr, "RETR %s\r\n", p);
 134         return fp;
 135 }
 136 // place ->fd at offset off
 137 int kftp_connect_file(knetFile *fp, off_t off)
 138 {
 139         if (fp->fd) {
 140                 close(fp->fd);
 141                 if (fp->no_reconnect) kftp_get_response(fp);
 142         }
 143         kftp_pasv_prep(fp);
 144         if (off) {
 145                 char tmp[32];
 146                 sprintf(tmp, "REST %lld\r\n", (long long)off);
 147                 kftp_send_cmd(fp, tmp, 1);
 148         }
 149         kftp_send_cmd(fp, fp->retr, 0);
 150         kftp_pasv_connect(fp);
 151         kftp_get_response(fp);
 152         fp->offset = off;
 153         return 0;
 154 }
 155
 156 knetFile *knet_open(const char *fn, const char *mode)
 157 {
 158         knetFile *fp = 0;
 159         if (mode[0] != 'r') {
 160                 fprintf(stderr, "[kftp_open] only mode \"r\" is supported.\n");
 161                 return 0;
 162         }
 163         if (strstr(fn, "ftp://") == fn) {
 164                 fp = kftp_prep(fn, mode);
 165                 if (fp == 0) return 0;
 166                 if (kftp_connect(fp) == -1) {
 167                         knet_close(fp);
 168                         return 0;
 169                 }
 170                 kftp_connect_file(fp, 0);
 171         } else {
 172                 int fd = open(fn, O_RDONLY);
 173                 if (fd == -1) {
 174                         perror("open");
 175                         return 0;
 176                 }
 177                 fp = (knetFile*)calloc(1, sizeof(knetFile));
 178                 fp->type = KNF_TYPE_LOCAL;
 179                 fp->fd = fd;
 180         }
 181         return fp;
 182 }
 183
 184 off_t knet_read(knetFile *fp, void *buf, off_t len)
 185 {
 186         off_t l = read(fp->fd, buf, len);
 187         fp->offset += l;
 188         return l;
 189 }
 190
 191 off_t knet_seek(knetFile *fp, off_t off, int whence)
 192 {
 193         if (fp->type == KNF_TYPE_LOCAL) {
 194                 fp->offset = lseek(fp->fd, off, whence);
 195                 return fp->offset;
 196         }
 197         if (fp->type == KNF_TYPE_FTP) {
 198                 if (whence != SEEK_SET) {
 199                         fprintf(stderr, "[knet_seek] only SEEK_SET is supported for FTP. Offset is unchanged.\n");
 200                         return -1;
 201                 }
 202                 if (!fp->no_reconnect) kftp_reconnect(fp);
 203                 kftp_connect_file(fp, off);
 204                 return fp->offset;
 205         }
 206         return 0;
 207 }
 208
 209 int knet_close(knetFile *fp)
 210 {
 211         if (fp == 0) return 0;
 212         if (fp->ctrl_fd > 0) close(fp->ctrl_fd);
 213         if (fp->fd > 0) close(fp->fd);
 214         free(fp->response); free(fp->retr); free(fp->host);
 215         free(fp);
 216         return 0;
 217 }
 218
 219 #ifdef KNETFILE_MAIN
 220 int main(void)
 221 {
 222         char buf[256];
 223         knetFile *fp;
 224 //      fp = knet_open("ftp://ftp.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/data/NA12878/alignment/NA12878.chrom6.SLX.SRP000032.2009_06.bam", "r"); knet_seek(fp, 2500000000ll, SEEK_SET);
 225 //      fp = knet_open("ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub4/treefam/tmp/index.shtml", "r"); knet_seek(fp, 2000, SEEK_SET);
 226         fp = knet_open("knetfile.c", "r"); knet_seek(fp, 2000, SEEK_SET);
 227         knet_read(fp, buf, 255);
 228         buf[255] = 0;
 229         printf("%s\n", buf);
 230         knet_close(fp);
 231         return 0;
 232 }
 233 #endif