glf.h

   1 #ifndef GLF_H_
   2 #define GLF_H_
   3
   4 typedef struct {
   5         unsigned char ref_base:4, dummy:4; /** "XACMGRSVTWYHKDBN"[ref_base] gives the reference base */
   6         unsigned char max_mapQ; /** maximum mapping quality */
   7         unsigned char lk[10];   /** log likelihood ratio, capped at 255 */
   8         unsigned min_lk:8, depth:24; /** minimum lk capped at 255, and the number of mapped reads */
   9 } glf1_t;
  10
  11 #endif